Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27389	0.0111	NA	NA	NA	1.04043444067272e-64	72537426	72537426
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.4722	1.04043444067272e-64	72537426	72537426	3.08644498310093e-68	72579311	72579311
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	3.08644498310093e-68	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	150823073	17556	17269	-0.0043	NA	NA	NA	9.24211865590205e-114	150823073	150836481
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	8	2.5126	9.24211865590205e-114	150823073	150836481	3.36220243871141e-111	150848509	150851439
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2713	0.0134	3.36220243871141e-111	150848509	150851439	8.5516378258262e-64	157133150	157133150
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.761	8.5516378258262e-64	157133150	157133150	2.44904813684496e-63	157136342	157136342
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	183364013	10469	10299	-0.0101	2.44904813684496e-63	157136342	157136342	7.21365097309808e-11	183355007	183373195
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	183365926	183397592	18	18	0.5227	7.21365097309808e-11	183355007	183373195	1.84061967862573e-10	183390452	183405968
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	183401965	185979586	838	820	0.0053	1.84061967862573e-10	183390452	183405968	2.83184572828441e-13	185979586	185979586
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.7263	2.83184572828441e-13	185979586	185979586	1.55713045447234e-12	185988138	185988138
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1931	-0.006	1.55713045447234e-12	185988138	185988138	1.06987865312469e-07	194972886	195014129
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195095156	11	11	-0.5875	1.06987865312469e-07	194972886	195014129	9.62843507396926e-08	195062793	195108311
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195097118	195097118	1	0	NA	9.62843507396926e-08	195062793	195108311	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	200613454	2160	2129	0.002	NA	NA	NA	2.00948827197475e-08	200585836	200644068
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200804838	38	37	-0.3352	2.00948827197475e-08	200585836	200644068	9.78366748474219e-09	200689399	200818194
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	247186514	17404	17086	-1e-04	9.78366748474219e-09	200689399	200818194	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34556434	11526	11315	0.0018	NA	NA	NA	1.29947965050144e-11	34543992	34561038
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34558824	34582272	12	12	-0.6658	1.29947965050144e-11	34543992	34561038	2.63917293133769e-11	34579933	34589997
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	37789939	1366	1342	-0.0205	2.63917293133769e-11	34579933	34589997	2.87746589390699e-29	37785655	37810001
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.7204	2.87746589390699e-29	37785655	37810001	2.24520742541129e-31	37846240	37859985
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	146571330	32143	31602	-0.0023	2.24520742541129e-31	37846240	37859985	5.94872565465733e-292	146571330	146571330
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.6133	5.94872565465733e-292	146571330	146571330	1.75022305632596e-291	146592775	146592775
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242501239	32682	32117	-0.0065	1.75022305632596e-291	146592775	146592775	5.95695336840299e-49	242493814	242516492
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	64	-0.5859	5.95695336840299e-49	242493814	242516492	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10623	-0.0034	NA	NA	NA	4.47014496552955e-17	32074432	32074432
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.9225	4.47014496552955e-17	32074432	32074432	2.49243300508398e-16	32080848	32080848
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5326	0.0046	2.49243300508398e-16	32080848	32080848	4.66253027524121e-25	47460892	47460892
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.3784	4.66253027524121e-25	47460892	47460892	1.34261766160512e-24	47466921	47466921
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133189686	27489	27028	-0.0034	1.34261766160512e-24	47466921	47466921	1.91926831051164e-11	133187633	133189686
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6503	1.91926831051164e-11	133187633	133189686	4.714473513627e-12	133194685	133194685
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164001657	9779	9619	-0.0065	4.714473513627e-12	133194685	133194685	5.26585405892318e-48	164001657	164001657
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	5.26585405892318e-48	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.282	NA	NA	NA	2.93570170569289e-48	164027724	164027724
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11892	-0.0076	2.93570170569289e-48	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3335	0.0292	NA	NA	NA	5.27527485394937e-173	9815760	9815760
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.3848	5.27527485394937e-173	9815760	9815760	2.78168052672506e-177	9842644	9842644
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14772	-0.011	2.78168052672506e-177	9842644	9842644	3.03155630217705e-11	68897538	69085386
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.6198	3.03155630217705e-11	68897538	69085386	2.76657552271889e-11	69153675	69665979
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	161260146	27824	27368	-0.0084	2.76657552271889e-11	69153675	69665979	6.12334878116391e-08	161246114	161268543
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	161268543	161311021	5	5	-0.8814	6.12334878116391e-08	161246114	161268543	5.95469606776471e-08	161302611	161324990
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	161324990	173224400	3364	3293	-0.0154	5.95469606776471e-08	161302611	161324990	1.3584954704179e-44	173224400	173224400
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.1672	1.3584954704179e-44	173224400	173224400	2.88275351666743e-55	173228860	173228860
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	0.0248	2.88275351666743e-55	173228860	173228860	8.49222077829326e-67	173660684	173660684
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.476	8.49222077829326e-67	173660684	173660684	5.89691025737425e-61	173666072	173666072
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3707	-0.0026	5.89691025737425e-61	173666072	173666072	5.51780802913208e-09	186676034	186676034
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-1.3732	5.51780802913208e-09	186676034	186676034	6.27473861885918e-08	186680176	186681553
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191041481	1542	1515	-0.0068	6.27473861885918e-08	186680176	186681553	0.000819116909382716	190975721	191133096
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.3666	0.000819116909382716	190975721	191133096	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2556	0.0167	NA	NA	NA	4.16251227200718e-09	8734494	8750027
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.7945	4.16251227200718e-09	8734494	8750027	3.0696288537942e-08	8800001	8819532
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	12857302	1366	1345	-0.0043	3.0696288537942e-08	8800001	8819532	9.54613879544035e-82	12857302	12857302
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.2022	9.54613879544035e-82	12857302	12857302	1.24660787245768e-80	12873052	12873052
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180644810	49789	48933	-0.0065	1.24660787245768e-80	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10418	0.0012	NA	NA	NA	4.02762652857122e-13	29937319	29973024
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30030032	19	19	-0.558	4.02762652857122e-13	29937319	29973024	1.19878107233972e-13	30010234	30040901
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30031367	32558677	1071	1048	0.021	1.19878107233972e-13	30010234	30040901	9.71074305404617e-148	32558677	32588005
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	15	-2.2962	9.71074305404617e-148	32558677	32588005	7.85421540536472e-15	32626619	32633691
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32634977	1	0	NA	7.85421540536472e-15	32626619	32633691	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	32713363	27	25	-0.0141	NA	NA	NA	1.56134811402610e-11	32711957	32716255
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.3642	1.5613481140261e-11	32711957	32716255	1.52428167079405e-33	32728285	32731072
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	165643653	42579	41792	-0.006	1.52428167079405e-33	32728285	32731072	2.87862818656266e-16	165642393	165643653
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.3654	2.87862818656266e-16	165642393	165643653	6.23388859301662e-16	165650610	165650610
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1785	-6e-04	6.23388859301662e-16	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5290	0.0058	NA	NA	NA	2.22128988997477e-12	16135701	16135701
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-1.6659	2.22128988997477e-12	16135701	16135701	1.71446938432643e-11	16140018	16140018
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	141690753	44543	43795	-0.0022	1.71446938432643e-11	16140018	16140018	0	141690753	141690753
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.8756	0	141690753	141690753	8.54385047469992e-315	141714168	141714168
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2468	2e-04	8.54385047469992e-315	141714168	141714168	9.92869283827063e-13	147702365	147702365
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7651	9.92869283827063e-13	147702365	147702365	5.11794412476631e-13	147707161	147707161
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4178	0.0014	5.11794412476631e-13	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	8018	0.002	NA	NA	NA	5.46510155049751e-10	25120552	25120552
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	5.46510155049751e-10	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.5395	NA	NA	NA	7.47980935220103e-11	25125700	25125700
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4829	-0.0028	7.47980935220103e-11	25125700	25125700	1.90184909243001e-96	39341524	39354149
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8441	1.90184909243001e-96	39341524	39354149	7.98978557119999e-93	39500219	39508035
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30912	-0.0012	7.98978557119999e-93	39500219	39508035	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7701	-0.0051	NA	NA	NA	3.00540337470463e-53	22477358	22477358
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-3.3987	3.00540337470463e-53	22477358	22477358	3.4758537008841e-54	22492603	22492603
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	39146895	4892	4803	0.0021	3.4758537008841e-54	22492603	22492603	1.69857389531669e-72	39146895	43445839
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	-3.2456	1.69857389531669e-72	39146895	43445839	4.86423691086832e-49	43530076	43599449
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	70926188	338	332	-0.0491	4.86423691086832e-49	43530076	43599449	4.44072958093998e-20	70926188	70926188
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.1137	4.44072958093998e-20	70926188	70926188	4.42784028602708e-20	70930528	70930528
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	112062107	13772	13561	-0.0115	4.42784028602708e-20	70930528	70930528	6.97921085954081e-42	112062107	112062107
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-3.0505	6.97921085954081e-42	112062107	112062107	6.42384191757432e-40	112069192	112069192
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	137352394	9991	9823	0.0074	6.42384191757432e-40	112069192	112069192	1.24633858136939e-15	137352394	137352394
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.9474	1.24633858136939e-15	137352394	137352394	3.56109098696665e-13	137356880	137356880
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1090	0.0082	3.56109098696665e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9573	-0.004	NA	NA	NA	3.76610139819183e-79	27038538	27038538
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.1366	3.76610139819183e-79	27038538	27038538	2.44231128039039e-77	27041812	27041812
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	69736364	11367	11158	-0.0127	2.44231128039039e-77	27041812	27041812	1.46454673271231e-06	69734614	69736364
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69738782	69739927	2	2	-1.2755	1.46454673271231e-06	69734614	69736364	5.06040333780279e-07	69739927	69739927
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69743286	69834520	42	42	0.0606	5.06040333780279e-07	69739927	69739927	5.4530480474927e-05	69831673	69837432
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69835856	69841183	4	4	0.9489	5.4530480474927e-05	69831673	69837432	1.16859294553424e-07	69837432	69843195
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	77917893	3446	3393	0	1.16859294553424e-07	69837432	69843195	2.91455201143817e-59	77917893	77917893
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.9517	2.91455201143817e-59	77917893	77917893	5.13233507515662e-57	77928738	77928738
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135085997	20159	19815	-3e-04	5.13233507515662e-57	77928738	77928738	3.11680212245225e-66	135084777	135104029
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135102317	135227463	44	44	-0.831	3.11680212245225e-66	135084777	135104029	1.42676586927385e-14	135220726	135227463
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135229796	135285645	10	10	0.056	1.42676586927385e-14	135220726	135227463	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4920907	1771	1746	-0.0011	NA	NA	NA	1.69853724249498e-255	4920907	4920907
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4923300	4923300	1	0	NA	1.69853724249498e-255	4920907	4920907	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.9939	NA	NA	NA	3.41307234143174e-276	4932214	4932214
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14876	-0.0028	3.41307234143174e-276	4932214	4932214	2.18108017612732e-10	55076294	55142193
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	40	-0.3578	2.18108017612732e-10	55076294	55142193	5.71275458574914e-11	55196550	55235968
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27847	0.0029	5.71275458574914e-11	55196550	55235968	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3672	0.0158	NA	NA	NA	9.75140048919678e-29	9523923	9531133
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9573313	8	8	1.304	9.75140048919678e-29	9523923	9531133	4.65278712223287e-30	9555181	9578398
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9578398	132289090	41411	40665	6e-04	4.65278712223287e-30	9555181	9578398	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	31113	-0.0075	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	37	-0.3848	NA	NA	NA	1.55459523749496e-11	19415745	19457688
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	34674458	5713	5613	0.0035	1.55459523749496e-11	19415745	19457688	3.46772392053043e-10	34666996	34674458
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.5702	3.46772392053043e-10	34666996	34674458	2.40348470996674e-10	34679959	34683810
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	79174722	16589	16288	-0.0036	2.40348470996674e-10	34679959	34683810	6.69417057364951e-120	79174722	79174722
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.6655	6.69417057364951e-120	79174722	79174722	4.60328267376749e-119	79183154	79183154
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105945006	9379	9225	-0.0015	4.60328267376749e-119	79183154	79183154	2.40085433531851e-10	105916075	105951399
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	19	-0.5116	2.40085433531851e-10	105916075	105951399	1.27075145660774e-07	105994646	106028936
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	141	0.0208	1.27075145660774e-07	105994646	106028936	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.0427	NA	NA	NA	3.67051502307599e-05	18692865	18818949
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20308014	151	150	-0.6811	3.67051502307599e-05	18692865	18818949	4.97845182881396e-148	20079935	20316992
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	41638388	7353	7232	0.0012	4.97845182881396e-148	20079935	20316992	1.39831021396303e-09	41637456	41638388
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41682937	4	4	1.0888	1.39831021396303e-09	41637456	41638388	1.43830080053767e-09	41682937	41704248
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	100298352	23808	23382	2e-04	1.43830080053767e-09	41682937	41704248	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5383	0.0106	NA	NA	NA	9.62284266218455e-26	14687636	14956177
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.9268	9.62284266218455e-26	14687636	14956177	3.15086612756419e-26	15028108	15034210
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	54352394	8214	8069	0.0142	3.15086612756419e-26	15028108	15034210	2.13318714326707e-11	54343465	54362111
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.7325	2.13318714326707e-11	54343465	54362111	2.16913268739883e-11	54368717	54399890
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	75093957	6817	6726	0.0033	2.16913268739883e-11	54368717	54399890	3.37995357359731e-11	75092501	75093957
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.3339	3.37995357359731e-11	75092501	75093957	5.4934419582905e-11	75100865	75102639
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5031	2e-04	5.4934419582905e-11	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	8147124	3542	3460	0.0271	NA	NA	NA	2.97696899470823e-07	8144634	8147124
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.3795	2.97696899470823e-07	8144634	8147124	1.38237364408423e-07	8149084	8154339
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	36673853	10327	10136	0.0107	1.38237364408423e-07	8149084	8154339	1.55239889787741e-11	36672710	36673853
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9705	1.55239889787741e-11	36672710	36673853	5.53189091405321e-12	36684619	36687917
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	2002	0.0285	5.53189091405321e-12	36684619	36687917	6.50319074926269e-27	41561017	41574775
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42147225	48	47	-0.4759	6.50319074926269e-27	41561017	41574775	3.59445968150967e-23	41706870	42158650
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	78653545	13676	13420	0.0149	3.59445968150967e-23	41706870	42158650	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22561	-0.0089	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	481	0.0295	NA	NA	NA	6.34761198010805e-09	1395246	1398325
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5461	6.34761198010805e-09	1395246	1398325	1.33907583441746e-08	1400840	1405308
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	19694025	8533	8390	0.0321	1.33907583441746e-08	1400840	1405308	2.56941703624739e-144	19694025	19694025
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.8501	2.56941703624739e-144	19694025	19694025	4.82390801113957e-147	19700620	19700620
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	40540618	3663	3609	0.0103	4.82390801113957e-147	19700620	19700620	1.53997998989151e-109	40540618	40540618
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.1783	1.53997998989151e-109	40540618	40540618	1.10863105961469e-113	40553315	40553315
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	59421197	8360	8217	0.0208	1.10863105961469e-113	40553315	40553315	6.96865114846697e-14	59414645	59421197
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59422642	59434202	9	9	-0.8454	6.96865114846697e-14	59414645	59421197	9.13008322258563e-13	59434202	59440274
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1953	0.0052	9.13008322258563e-13	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	0.0044	NA	NA	NA	6.15537516931997e-138	1506379	1506379
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1525300	7	7	-2.939	6.15537516931997e-138	1506379	1506379	6.18078229427333e-133	1525300	1525300
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	62419534	20986	20625	0.0019	6.18078229427333e-133	1525300	1525300	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13214	-0.0017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	400	0.0151	NA	NA	NA	3.14715296782845e-62	16521073	16521073
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-4.0177	3.14715296782845e-62	16521073	16521073	1.97287306217749e-66	16524408	16524408
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	49571068	16149	15860	0.0184	1.97287306217749e-66	16524408	16524408	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2941	NA	NA	NA	1.02112353326633e-19	94062	94062
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6011	1.02112353326633e-19	94062	94062	2.81454410245598e-38	104732	104732
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427392	774	760	-0.0329	2.81454410245598e-38	104732	104732	1.67712900965023e-14	1427392	1431240
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.3241	1.67712900965023e-14	1427392	1431240	1.33290233144221e-14	1432891	1432953
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	596	-0.0197	1.33290233144221e-14	1432891	1432953	1.50447798631751e-12	2301365	2302065
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.1866	1.50447798631751e-12	2301365	2302065	2.87511011946225e-13	2304398	2306110
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	382	-0.0502	2.87511011946225e-13	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	44338	1.0163	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0048	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-3.8327	NA	NA	NA	4.27304929639868e-26	3219200	3772482
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.7585	4.27304929639868e-26	3219200	3772482	5.35113943511547e-20	5531459	6652845
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6871143	69	68	-3.6866	5.35113943511547e-20	5531459	6652845	6.94219465325e-06	6864479	6871143
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6872263	6878602	5	4	-0.7291	6.94219465325e-06	6864479	6871143	2.35478690379029e-05	6878602	6894430
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6882965	7057026	102	98	-3.6108	2.35478690379029e-05	6878602	6894430	0.000106188135844659	7022973	7229089
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7461576	120	118	-2.7507	0.000106188135844659	7022973	7229089	3.50930590631513e-05	7338262	7578636
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7709619	73	72	-3.6974	3.50930590631513e-05	7338262	7578636	0.00227988188967314	7668917	7827650
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7996758	85	81	-2.9345	0.00227988188967314	7668917	7827650	4.03660482565801e-07	7859390	8090502
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10513747	371	361	-3.6849	4.03660482565801e-07	7859390	8090502	4.27120478197022e-27	10512616	10513747
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	4.27120478197022e-27	10512616	10513747	NA	NA	NA
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.4836	NA	NA	NA	0.000245419678209195	10645500	12530596
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	71	-2.4903	0.000245419678209195	10645500	12530596	0.00195608654814987	12594824	12696242
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.8189	0.00195608654814987	12594824	12696242	0.000249676820923707	12804329	12863434
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12905395	25	25	-2.631	0.000249676820923707	12804329	12863434	0.00811131274678993	12882767	12919413
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-4.1583	0.00811131274678993	12882767	12919413	2.28160593994675e-05	12924438	12953078
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13129843	80	79	-2.1976	2.28160593994675e-05	12924438	12953078	1.30174864313298e-09	13109337	13147329
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13241181	38	38	-3.6203	1.30174864313298e-09	13109337	13147329	0.00244885440908096	13230706	13241181
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13241682	13254711	3	3	-1.1512	0.00244885440908096	13230706	13241181	1.08062658635412e-05	13254711	13259414
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14358464	374	366	-3.8445	1.08062658635412e-05	13254711	13259414	5.73031986778191e-09	14323815	14413754
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14524829	91	90	-3.1237	5.73031986778191e-09	14323815	14413754	3.26004385510194e-07	14503927	14530134
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-1.0001	3.26004385510194e-07	14503927	14530134	0.0111757361032237	14539230	14572190
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14644293	23	22	-2.6916	0.0111757361032237	14539230	14572190	1.51797482008836e-05	14563486	14691724
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15139441	103	102	-3.8435	1.51797482008836e-05	14563486	14691724	0.000116596830834820	15099698	15200639
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	81	-3.1118	0.00011659683083482	15099698	15200639	0.000226888462631849	15240367	15312994
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	94	-3.8979	0.000226888462631849	15240367	15312994	3.01110511854777e-07	15427777	15434486
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.4342	3.01110511854777e-07	15427777	15434486	1.49910152751647e-11	15446156	15448670
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	31	-3.8375	1.49910152751647e-11	15446156	15448670	1.10189803767048e-16	15521958	15524675
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15541293	10	10	-1.4237	1.10189803767048e-16	15521958	15524675	1.7064861877595e-08	15538983	15546378
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15542314	15915466	79	79	-3.6151	1.7064861877595e-08	15538983	15546378	0.142643915978729	15614125	16115542
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16212418	124	121	-3.1749	0.142643915978729	15614125	16115542	1.50177602056098e-07	16169603	16279279
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16214032	17076673	141	141	-3.9609	1.50177602056098e-07	16169603	16279279	0.000111447509525880	16925062	17117516
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17083649	17167011	16	16	-2.6715	0.00011144750952588	16925062	17117516	2.64697119969185e-06	17122340	17188480
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17170574	17496151	57	56	-4.1628	2.64697119969185e-06	17122340	17188480	1.64644993349292e-10	17487972	17507174
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17503455	17557953	10	10	-2.0898	1.64644993349292e-10	17487972	17507174	2.17200371849892e-05	17533546	17605867
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036411	484	476	-3.7737	2.17200371849892e-05	17533546	17605867	1.05406240701939e-07	21028489	21041164
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.3845	1.05406240701939e-07	21028489	21041164	3.11908874636832e-07	21047798	21059229
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	253	-3.7738	3.11908874636832e-07	21047798	21059229	1.29821490729061e-06	22049641	22139807
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.778	1.29821490729061e-06	22049641	22139807	5.25412161157486e-11	22177335	22179794
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	93	-4.0713	5.25412161157486e-11	22177335	22179794	8.659607366665e-68	23283689	26871442
MSK_252152914793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	83	-1.3035	8.659607366665e-68	23283689	26871442	NA	NA	NA
