Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	842726	18	17	0.3878	NA	NA	NA	0.000321587909373009	825199	926279
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	845171	1274141	140	131	0.6138	0.000321587909373009	825199	926279	3.33195121846363e-47	1179223	1494648
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1436682	32942157	11967	11589	0.4434	3.33195121846363e-47	1179223	1494648	1.14666832947118e-88	32928160	32964459
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32944977	33573694	275	262	0.7055	1.14666832947118e-88	32928160	32964459	1.70088387572158e-132	33552947	33581024
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	33575993	72525842	15488	15058	0.4141	1.70088387572158e-132	33552947	33581024	5.78288779481307e-08	72523186	72528790
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.0747	5.78288779481307e-08	72523186	72528790	2.42747773859989e-17	72537426	72537426
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.0382	2.42747773859989e-17	72537426	72537426	1.47370194369087e-38	72574479	72596993
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	1.47370194369087e-38	72574479	72596993	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	84085198	3319	3235	0.4045	NA	NA	NA	1.82170086950035e-14	84083751	84085198
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84087264	84091561	3	3	-0.4403	1.82170086950035e-14	84083751	84085198	2.83182125997568e-17	84091561	84091561
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84094284	84484082	165	157	0.437	2.83182125997568e-17	84091561	84091561	3.00779749216522e-20	84484082	84484082
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-0.7383	3.00779749216522e-20	84484082	84484082	3.73854183969672e-18	84487429	84487429
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	103932025	6628	6410	0.4205	3.73854183969672e-18	84487429	84487429	7.81532986254782e-11	103932025	103932025
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	103962495	2	2	-0.4846	7.81532986254782e-11	103932025	103932025	3.81387468613689e-11	103962495	103962495
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	108533257	1008	985	0.4003	3.81387468613689e-11	103962495	103962495	3.66857644209705e-08	108531247	108533257
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.2223	3.66857644209705e-08	108531247	108533257	3.43330433576108e-08	108538662	108541074
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110023268	572	556	0.446	3.43330433576108e-08	108538662	108541074	7.16597435719945e-30	110023268	110023268
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.8183	7.16597435719945e-30	110023268	110023268	1.30913991028344e-29	110039388	110039388
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147313991	4560	4401	0.4026	1.30913991028344e-29	110039388	110039388	1.26422736372330e-10	146290772	147346371
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147508217	31	30	0.6382	1.2642273637233e-10	146290772	147346371	1.32688699906836e-08	147471665	148125669
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147510532	150836481	1261	1216	0.4161	1.32688699906836e-08	147471665	148125669	1.39923983626929e-63	150836481	150836481
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836484	150851439	9	5	-1.0415	1.39923983626929e-63	150836481	150836481	5.12129149872938e-45	150851439	150851439
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	73	0.3871	5.12129149872938e-45	150851439	150851439	8.13907640295386e-25	151026228	151026228
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	1.3475	8.13907640295386e-25	151026228	151026228	2.03727720432681e-19	151036435	151036435
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	151040463	2	0	NA	2.03727720432681e-19	151036435	151036435	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151042365	157133150	2677	2592	0.4229	NA	NA	NA	2.02088190913003e-27	157133150	157133150
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.9693	2.02088190913003e-27	157133150	157133150	1.34918842350417e-32	157136342	157136342
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4007	0.3916	1.34918842350417e-32	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.1033	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6987	0.4028	0	167507898	167507898	7.11487751401695e-46	185979586	185979586
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.4854	7.11487751401695e-46	185979586	185979586	3.16953712614325e-49	185988138	185988138
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1455	0.392	3.16953712614325e-49	185988138	185988138	1.23328097239508e-11	192715640	192715640
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-0.4982	1.23328097239508e-11	192715640	192715640	2.23989938714291e-10	192719540	192719540
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	458	0.3803	2.23989938714291e-10	192719540	192719540	1.52833511754109e-14	194977713	195011344
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.1099	1.52833511754109e-14	194977713	195011344	5.72840247867173e-16	195048208	195091758
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	196570662	572	557	0.404	5.72840247867173e-16	195048208	195091758	2.67430133532194e-21	196570662	196570662
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	3	-0.6068	2.67430133532194e-21	196570662	196570662	1.85845776441038e-19	196576204	196576204
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	199589299	1088	1059	0.4092	1.85845776441038e-19	196576204	196576204	6.7462531043095e-06	199585193	199591855
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199591855	199596540	4	4	-0.0871	6.7462531043095e-06	199585193	199591855	2.44354481832886e-05	199595372	199603162
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199599327	200596027	490	475	0.4343	2.44354481832886e-05	199595372	199603162	3.83143964562328e-15	200589108	200612164
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200598243	1	0	NA	3.83143964562328e-15	200589108	200612164	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200665389	23	23	0.0646	NA	NA	NA	1.14581543180816e-15	200649025	200672373
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	241340181	15019	14561	0.3992	1.14581543180816e-15	200649025	200672373	4.70178479474674e-13	241026683	241360490
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241350083	241442091	35	33	0.1494	4.70178479474674e-13	241026683	241360490	3.56720322022294e-22	241421933	241455316
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241446026	246794552	2246	2179	0.4061	3.56720322022294e-22	241421933	241455316	5.53820696993287e-49	246769018	246806669
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246875016	29	29	-0.1248	5.53820696993287e-49	246769018	246806669	1.20747052961477e-22	246862029	246882156
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	91	0.3846	1.20747052961477e-22	246862029	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20444207	5979	5796	0.3936	NA	NA	NA	3.19975135600933e-10	20444207	20444207
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20445909	20448354	2	2	-0.5252	3.19975135600933e-10	20444207	20444207	4.26945806132093e-10	20448354	20448354
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20451267	33076512	4895	4764	0.4212	4.26945806132093e-10	20448354	20448354	1.55867325633234e-11	33076512	33076512
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.4287	1.55867325633234e-11	33076512	33076512	2.20725116502128e-16	33080437	33080437
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	633	0.4056	2.20725116502128e-16	33080437	33080437	4.1785800601596e-13	34539603	34561038
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	0.7311	4.1785800601596e-13	34539603	34561038	2.91953580468354e-10	34574224	34597294
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37789939	1364	1331	0.4124	2.91953580468354e-10	34574224	34597294	1.38794522925358e-32	37785655	37803744
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.0345	1.38794522925358e-32	37785655	37803744	2.18562082578331e-36	37848754	37859985
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	45554540	3127	3046	0.4296	2.18562082578331e-36	37848754	37859985	1.89522349225258e-77	45544663	45564095
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45556687	45936098	189	185	0.6913	1.89522349225258e-77	45544663	45564095	5.88369311964644e-95	45927092	45943912
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45939055	52600588	2485	2410	0.4093	5.88369311964644e-95	45927092	45943912	1.39612254978154e-13	52588009	52600588
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	1.0478	1.39612254978154e-13	52588009	52600588	2.13032695057220e-13	52635695	52639605
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	58186346	1766	1729	0.4249	2.1303269505722e-13	52635695	52639605	3.4128582333254e-114	58178006	58193069
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	58187508	59064346	275	263	0.6854	3.4128582333254e-114	58178006	58193069	1.57336789409637e-122	59048501	59080966
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	59068551	95722700	9816	9504	0.4155	1.57336789409637e-122	59048501	59080966	9.64079345959568e-13	95722700	95722700
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95796016	95974614	3	3	-0.4124	9.64079345959568e-13	95722700	95722700	1.94907496367614e-12	95974614	96103035
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96103035	108279974	3709	3605	0.3948	1.94907496367614e-12	95974614	96103035	2.97802907730323e-07	108277994	108279974
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	108282483	108285877	2	2	-0.3708	2.97802907730323e-07	108277994	108279974	2.18135628856313e-07	108285877	108287130
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	108287130	111587934	777	749	0.3981	2.18135628856313e-07	108285877	108287130	7.67422652424082e-08	111581911	111594161
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111589334	111589334	1	0	NA	7.67422652424082e-08	111581911	111594161	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111592522	111613503	10	10	0.0411	NA	NA	NA	2.36048913992267e-06	111603379	111619001
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111616051	112307418	69	68	0.3805	2.36048913992267e-06	111603379	111619001	1.97083961526427e-10	112299263	112308558
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112308558	112337951	3	3	1.1733	1.97083961526427e-10	112299263	112308558	3.56139595475074e-09	112333620	112342911
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112342911	113865444	572	552	0.4084	3.56139595475074e-09	112333620	112342911	1.32171362747552e-09	113861198	114099124
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113881283	114138923	5	5	-0.1989	1.32171362747552e-09	113861198	114099124	2.76099625814659e-10	114040902	114146308
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	114146308	132405798	4607	4480	0.3939	2.76099625814659e-10	114040902	114146308	2.92274331870583e-12	132397397	132405798
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132724793	132739926	6	6	-0.1936	2.92274331870583e-12	132397397	132405798	1.25656797268911e-13	132739926	132747227
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132747227	146571330	4716	4578	0.3819	1.25656797268911e-13	132739926	132747227	1.39713994899291e-12	146562545	146571330
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.2963	1.39713994899291e-12	146562545	146571330	5.49384954735463e-13	146592775	146597405
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10852	0.407	5.49384954735463e-13	146592775	146597405	8.1670081128184e-25	179767214	179767214
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.515	8.1670081128184e-25	179767214	179767214	3.37161703065107e-24	179778919	179778919
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	208057199	9107	8829	0.4078	3.37161703065107e-24	179778919	179778919	2.07984492324954e-85	208057199	208057199
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-2.1465	2.07984492324954e-85	208057199	208057199	8.58523209565542e-84	208066245	208066245
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	219546340	4306	4189	0.4065	8.58523209565542e-84	208066245	208066245	1.71776387636444e-13	219534537	219559326
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219547210	219587514	39	37	0.6437	1.71776387636444e-13	219534537	219559326	4.69627040514837e-12	219579457	219598705
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219588440	242501239	8021	7784	0.3989	4.69627040514837e-12	219579457	219598705	3.34252447970507e-14	242482099	242530542
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242653323	56	53	0.6206	3.34252447970507e-14	242482099	242530542	0.000431647249306143	242596873	242666498
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242655973	242689978	11	11	0.3478	0.000431647249306143	242596873	242666498	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	4725411	1785	1733	0.0554	NA	NA	NA	4.38580640206926e-229	4719618	4731542
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4726793	6016413	323	316	0.4004	4.38580640206926e-229	4719618	4731542	3.68800485222199e-217	5995444	6038048
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6023703	32074432	8687	8425	0.0737	3.68800485222199e-217	5995444	6038048	7.71740003768042e-83	32074432	32074432
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.4259	7.71740003768042e-83	32074432	32074432	7.66806614071232e-77	32080848	32080848
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	65160634	12712	12320	0.0866	7.66806614071232e-77	32080848	32080848	1.00299685811172e-23	65160634	65160634
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-1.325	1.00299685811172e-23	65160634	65160634	4.29429875809932e-26	65184180	65184180
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	75798154	3369	3270	0.0688	4.29429875809932e-26	65184180	65184180	5.62552102686133e-12	75783255	75845446
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	76034950	19	19	-0.2422	5.62552102686133e-12	75783255	75845446	0.000264211648479996	76013273	76045769
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76039417	76061067	8	8	0.0995	0.000264211648479996	76013273	76045769	0.00174592357733014	76047989	76064054
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76064054	76081578	9	9	-0.2343	0.00174592357733014	76047989	76064054	2.71756652665288e-05	76080028	76091014
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76083514	98007376	4501	4354	0.0644	2.71756652665288e-05	76080028	76091014	0	98003581	98013032
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	98010099	99026704	441	423	-0.3649	0	98003581	98013032	5.48291735962807e-227	99022329	99028416
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99028416	99891210	324	318	0.0775	5.48291735962807e-227	99022329	99028416	2.06607054027510e-272	99891210	99891210
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.0041	2.0660705402751e-272	99891210	99891210	1.72540469388774e-226	99897201	99897201
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	115986306	4975	4821	0.0831	1.72540469388774e-226	99897201	99897201	1.41860896731704e-206	115980543	115989515
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	115988201	116693869	250	242	0.4448	1.41860896731704e-206	115980543	115989515	3.92812548808884e-55	116676969	116715107
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116698452	117213181	203	194	0.6906	3.92812548808884e-55	116676969	116715107	8.49760434149e-60	117205591	117218804
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117214477	117545700	160	155	0.3871	8.49760434149e-60	117205591	117218804	1.43681574005902e-88	117538900	117554643
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117548401	133189686	5936	5769	0.0802	1.43681574005902e-88	117538900	117554643	7.3178342179052e-21	133189686	133189686
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3917	7.3178342179052e-21	133189686	133189686	5.81079324932094e-22	133194685	133194685
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	150748947	5510	5352	0.0734	5.81079324932094e-22	133194685	133194685	9.01769069340092e-09	150748947	150748947
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-0.7767	9.01769069340092e-09	150748947	150748947	5.29691199910222e-09	150752600	150752600
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	164005577	4268	4141	0.0828	5.29691199910222e-09	150752600	150752600	6.2898121475001e-156	164005577	164005577
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.282	6.2898121475001e-156	164005577	164005577	6.81809857539209e-32	164027724	164027724
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.6476	6.81809857539209e-32	164027724	164027724	6.85169631027013e-40	164105613	164112873
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	166291315	524	494	0.056	6.85169631027013e-40	164105613	164112873	8.54354323557383e-118	166288256	166293797
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166293797	166738844	103	101	-0.4115	8.54354323557383e-118	166288256	166293797	1.12447850927243e-163	166733403	166743681
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166743681	196822133	10505	10185	0.0822	1.12447850927243e-163	166733403	166743681	3.26523037477043e-24	196810503	196904349
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.3386	3.26523037477043e-24	196810503	196904349	5.99218936594536e-24	196929805	196942158
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199092730	863	839	0.1153	5.99218936594536e-24	196929805	196942158	4.61912181494263e-50	199085333	199102765
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199093953	199329592	100	98	0.4372	4.61912181494263e-50	199085333	199102765	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	117233	28	28	0.0611	NA	NA	NA	6.35934765326631e-15	107346	137619
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119753	3389565	1192	1153	-0.2953	6.35934765326631e-15	107346	137619	2.78994049749045e-16	3359375	3424469
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3392542	3601552	67	67	-0.0462	2.78994049749045e-16	3359375	3424469	7.62013419393943e-07	3554351	3626481
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3604618	4260102	95	94	-0.2679	7.62013419393943e-07	3554351	3626481	8.9440105284679e-05	4255537	4260102
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4268825	4289795	4	4	0.2451	8.9440105284679e-05	4255537	4260102	2.01133334319111e-11	4289795	4292991
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4291168	9815760	2007	1958	-0.337	2.01133334319111e-11	4289795	4292991	0	9815760	9815760
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7485	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	70150576	15167	14732	-0.388	0	9842644	9842644	4.41185843050871e-18	70150576	70190682
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70294312	5	5	-1.1636	4.41185843050871e-18	70150576	70190682	5.20776504115485e-19	70216707	70294312
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	86447673	5497	5325	-0.3735	5.20776504115485e-19	70216707	70294312	2.21165875903597e-13	86447673	86447673
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	86456418	86469138	3	3	-1.234	2.21165875903597e-13	86447673	86447673	3.60898759677143e-13	86469138	86469138
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	86475491	103486208	5948	5789	-0.374	3.60898759677143e-13	86469138	86469138	3.987774790494e-99	103481327	103489365
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	103487425	103742770	84	80	0.0759	3.987774790494e-99	103481327	103489365	2.71065769044339e-96	103737653	103747515
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	103744862	107275274	1051	1001	-0.3673	2.71065769044339e-96	103737653	103747515	7.56557987807875e-15	107274138	107275274
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107283257	5	5	0.3133	7.56557987807875e-15	107274138	107275274	4.97544369876626e-14	107283257	107284892
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107284892	112437138	1678	1631	-0.3651	4.97544369876626e-14	107283257	107284892	5.46790756220454e-06	112364160	112461977
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	112444702	112495617	13	13	-0.083	5.46790756220454e-06	112364160	112461977	7.0982156611628e-07	112466269	112529724
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	112498461	119550771	1988	1935	-0.3831	7.0982156611628e-07	112466269	112529724	2.64538579592402e-17	119530129	119639593
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119623202	119700930	22	21	-0.0144	2.64538579592402e-17	119530129	119639593	1.15481073896544e-17	119684734	119725170
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119720703	146925868	6744	6554	-0.3809	1.15481073896544e-17	119684734	119725170	1.02807849671302e-64	146922372	146930371
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	146928353	147043277	57	54	0.0511	1.02807849671302e-64	146922372	146930371	1.40535167863382e-63	147038335	147047204
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	147045890	173224400	7981	7731	-0.3786	1.40535167863382e-63	147038335	147047204	1.70650806375024e-14	173224400	173224400
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.7035	1.70650806375024e-14	173224400	173224400	1.50032183223384e-14	173228860	173228860
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	187	-0.3673	1.50032183223384e-14	173228860	173228860	7.38587502851803e-119	173660684	173660684
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.3991	7.38587502851803e-119	173660684	173660684	9.92303513639072e-127	173666072	173666072
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	173672958	1	0	NA	9.92303513639072e-127	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173674198	177352776	1204	1171	-0.3929	NA	NA	NA	1.14641725057791e-07	177350550	177352776
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	177354124	177359160	3	3	0.2277	1.14641725057791e-07	177350550	177352776	1.03610325385816e-06	177359160	177363185
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	177361394	186676034	2565	2483	-0.3847	1.03610325385816e-06	177359160	177363185	6.70895848763191e-137	186676034	186676034
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.8823	6.70895848763191e-137	186676034	186676034	9.42170039043233e-131	186680176	186680176
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1504	-0.402	9.42170039043233e-131	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	517362	136	134	0.1246	NA	NA	NA	2.34679028160445e-07	499056	533459
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	519600	586257	31	31	0.3791	2.34679028160445e-07	499056	533459	2.49927461122997e-13	571442	601086
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	589249	1049542	119	113	0.076	2.49927461122997e-13	571442	601086	4.021887619532e-11	1022308	1093705
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1051760	1344915	113	109	0.2827	4.021887619532e-11	1022308	1093705	1.42148589829672e-05	1289684	1384934
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1346204	1531362	72	70	0.1069	1.42148589829672e-05	1289684	1384934	0.0764858686226573	1411006	1560489
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1532516	1569464	20	19	0.26	0.0764858686226573	1411006	1560489	4.74062187144287e-05	1546544	1597400
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1570745	12857302	3484	3388	0.051	4.74062187144287e-05	1546544	1597400	3.61601394624490e-301	12857302	12857302
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.6509	3.6160139462449e-301	12857302	12857302	4.07257539602481e-301	12873052	12873052
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	13263185	1	0	NA	4.07257539602481e-301	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13269140	56579735	11225	10877	0.0783	NA	NA	NA	1.60396957003377e-15	56579735	56579735
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56580969	56582581	2	2	1.1773	1.60396957003377e-15	56579735	56579735	6.01143091639906e-18	56582581	56582581
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56584732	58331366	444	427	0.0631	6.01143091639906e-18	56582581	56582581	6.56647045074482e-114	58325778	58335057
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58333023	58594403	130	127	-0.335	6.56647045074482e-114	58325778	58335057	2.25450983450378e-145	58591049	58598764
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58596114	68769752	3227	3138	0.0847	2.25450983450378e-145	58591049	58598764	9.00920874651852e-36	68764487	68773114
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68771552	68850823	37	35	0.4787	9.00920874651852e-36	68764487	68773114	1.69414445254348e-38	68848286	68855834
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68853929	98775747	8720	8458	0.0775	1.69414445254348e-38	68848286	68855834	9.54696106678707e-12	98767662	98775747
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98781278	98836557	6	6	-0.4675	9.54696106678707e-12	98767662	98775747	1.87344802303047e-08	98827048	98854843
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98849766	99408563	81	80	0.0543	1.87344802303047e-08	98827048	98854843	4.68037470470661e-09	99406689	99412268
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99410686	99418325	4	4	0.7354	4.68037470470661e-09	99406689	99412268	3.73993377939722e-11	99412268	99444081
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99444081	140203440	12226	11886	0.0756	3.73993377939722e-11	99412268	99444081	4.05042017524422e-15	140201609	140203440
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140215187	6	6	-0.546	4.05042017524422e-15	140201609	140203440	3.85797671595282e-18	140215187	140221835
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140216524	140219465	2	0	NA	3.85797671595282e-18	140215187	140221835	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	180194323	13557	13154	0.0769	NA	NA	NA	6.12102388861855e-20	180192214	180346557
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180342860	1	0	NA	6.12102388861855e-20	180192214	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.616	NA	NA	NA	1.98497924455114e-10	180355807	180365950
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	0.0777	1.98497924455114e-10	180355807	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	240119	55	53	-0.3833	NA	NA	NA	1.50933889508411e-37	236535	241674
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	44	-0.9141	1.50933889508411e-37	236535	241674	6.52517099029816e-74	322557	327962
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	4194102	1551	1510	-0.3725	6.52517099029816e-74	322557	327962	1.93412268774653e-253	4194102	4200782
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	4198529	4198529	1	0	NA	1.93412268774653e-253	4194102	4200782	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	4200782	4414530	62	59	-1.2477	NA	NA	NA	3.07031367583462e-286	4410243	4414530
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	4420101	26811016	7651	7419	-0.3807	3.07031367583462e-286	4410243	4414530	2.59839311478675e-17	26811016	26811016
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	3	-1.3391	2.59839311478675e-17	26811016	26811016	8.38777102422093e-17	26861184	26861184
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1174	-0.3724	8.38777102422093e-17	26861184	26861184	2.36521744815408e-29	29941766	29972382
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.9496	2.36521744815408e-29	29941766	29972382	1.50905530446376e-25	30004636	30021908
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32548736	1074	1046	-0.3387	1.50905530446376e-25	30004636	30021908	1.33082157348667e-32	32543054	32548736
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32558677	1	0	NA	1.33082157348667e-32	32543054	32548736	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	0.5408	NA	NA	NA	9.4997142398239e-10	32600962	32613538
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32745693	53	53	-0.2507	9.4997142398239e-10	32600962	32613538	0.000182750130047939	32739800	32745693
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32760574	3	3	-1.1583	0.000182750130047939	32739800	32745693	1.38126094310784e-21	32760574	32762061
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32762061	54035000	8247	7992	-0.363	1.38126094310784e-21	32760574	32762061	1.44096507313718e-224	54035000	54035000
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0429	1.44096507313718e-224	54035000	54035000	5.09716760878656e-266	54042734	54042734
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67078860	2773	2689	-0.3887	5.09716760878656e-266	54042734	54042734	2.32424005429643e-14	67078860	67078860
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67086412	67105238	4	4	-1.1306	2.32424005429643e-14	67078860	67078860	3.02773351314127e-13	67105238	67109079
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	79011979	3653	3547	-0.3805	3.02773351314127e-13	67105238	67109079	3.76777143072057e-15	78999263	79015901
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	0.0331	3.76777143072057e-15	78999263	79015901	1.33801891569461e-15	79079988	79105311
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	98696162	5301	5131	-0.3752	1.33801891569461e-15	79079988	79105311	1.99514532967659e-24	98696162	98696162
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98700043	98700043	1	0	NA	1.99514532967659e-24	98696162	98696162	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98703221	98729101	6	6	-1.177	NA	NA	NA	4.1720273565514e-24	98729101	98729101
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98734120	155259266	19130	18558	-0.3724	4.1720273565514e-24	98729101	98729101	1.87264610391500e-124	155253885	155264434
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155261405	155522125	96	92	0.0892	1.872646103915e-124	155253885	155264434	3.16508494747261e-121	155518613	155527911
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155523631	155523631	1	0	NA	3.16508494747261e-121	155518613	155527911	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155525618	165643653	3337	3228	-0.3834	NA	NA	NA	0	165643653	165643653
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-4.733	0	165643653	165643653	4.365053849682e-293	165649379	165649379
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1751	-0.3926	4.365053849682e-293	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26093050	8797	8535	0.0957	NA	NA	NA	5.08515639170352e-55	26093050	26093050
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26097755	26097755	1	0	NA	5.08515639170352e-55	26093050	26093050	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-2.0513	NA	NA	NA	6.52246529202322e-56	26108369	26108369
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	29635722	1579	1530	0.0752	6.52246529202322e-56	26108369	26108369	1.87409082937189e-13	29620956	29656586
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29641884	29747865	26	26	0.356	1.87409082937189e-13	29620956	29656586	7.7586581709596e-14	29737116	29769907
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29753057	38257171	3194	3101	0.0686	7.7586581709596e-14	29737116	29769907	2.98045421974089e-18	38247267	38270942
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38258332	38360187	47	46	0.3168	2.98045421974089e-18	38247267	38270942	6.16896526639029e-17	38340009	38384435
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38372692	44256496	2095	2049	0.0759	6.16896526639029e-17	38340009	38384435	4.09204456278697e-12	44250804	44256496
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	44258950	44268998	7	7	0.5424	4.09204456278697e-12	44250804	44256496	1.50462438480015e-07	44268998	44275491
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	44272125	48527156	1305	1267	0.084	1.50462438480015e-07	44268998	44275491	1.78901893193218e-11	48527156	48527156
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48528408	48530015	2	2	-0.9655	1.78901893193218e-11	48527156	48527156	5.24718400110336e-18	48530015	48530015
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48532031	109217320	17906	17381	0.0892	5.24718400110336e-18	48530015	48530015	4.3118503287967e-17	109217320	109217320
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-0.8153	4.3118503287967e-17	109217320	109217320	2.89100580155834e-16	109233214	109233214
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	118611324	4301	4166	0.0749	2.89100580155834e-16	109233214	109233214	2.59724885949619e-305	118611324	118611324
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	-4.5643	2.59724885949619e-305	118611324	118611324	1.20747853245415e-277	118619693	118619693
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118620875	1	0	NA	1.20747853245415e-277	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3091	0.0696	NA	NA	NA	1.17576286233764e-33	125831554	125831554
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3975	1.17576286233764e-33	125831554	125831554	1.00803853189242e-32	125837524	125837524
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7122	0.0844	1.00803853189242e-32	125837524	125837524	2.56441885997726e-57	141410894	141413352
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.7174	2.56441885997726e-57	141410894	141413352	1.11842799790318e-45	141438504	141440184
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141689547	115	113	0.0897	1.11842799790318e-45	141438504	141440184	1.49113429897283e-32	141687978	141689547
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	1.49113429897283e-32	141687978	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8613	NA	NA	NA	5.18555369908252e-27	141714168	141720303
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142152205	167	163	0.1792	5.18555369908252e-27	141714168	141720303	5.70508526495463e-14	142149857	142156165
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142167908	6	6	-0.4576	5.70508526495463e-14	142149857	142156165	1.79091906463538e-10	142166710	142176074
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	471	0.0763	1.79091906463538e-10	142166710	142176074	6.09354169767711e-15	143503317	143503317
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.8151	6.09354169767711e-15	143503317	143503317	1.89747187305088e-14	143584350	143584350
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1792	0.0728	1.89747187305088e-14	143584350	143584350	1.22717186694280e-41	147702365	147702365
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7938	1.2271718669428e-41	147702365	147702365	2.43128922377624e-38	147707161	147707161
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	147708382	1	0	NA	2.43128922377624e-38	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	151728811	1629	1581	0.0987	NA	NA	NA	7.14793540588773e-17	151726377	151728811
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.5216	7.14793540588773e-17	151726377	151728811	2.14174140237600e-16	151743145	151745100
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	156483966	1543	1498	0.0739	2.141741402376e-16	151743145	151745100	1.53573622416380e-17	156483966	156485711
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	1.0824	1.5357362241638e-17	156483966	156485711	8.92190679136407e-14	156488598	156490484
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1024	0.0924	8.92190679136407e-14	156488598	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0553	NA	NA	NA	2.45910112794388e-164	581533	581533
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.1965	2.45910112794388e-164	581533	581533	3.86283681483314e-211	588865	588865
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	1486408	284	271	0.0543	3.86283681483314e-211	588865	588865	1.07744532886457e-07	1474969	1494681
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1488402	1502327	7	7	0.5068	1.07744532886457e-07	1474969	1494681	8.38291532328947e-16	1496880	1510406
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1505971	25022606	7717	7510	0.0705	8.38291532328947e-16	1496880	1510406	4.71784731862924e-17	25017905	25022606
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-0.6014	4.71784731862924e-17	25017905	25022606	1.54627736524034e-08	25039370	25047250
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4771	0.0756	1.54627736524034e-08	25039370	25047250	2.46331361034731e-182	39350798	39350798
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39464577	42	39	0.9185	2.46331361034731e-182	39350798	39350798	2.45467181850787e-12	39464577	39464577
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39465285	39469515	2	2	-0.1482	2.45467181850787e-12	39464577	39464577	0	39469515	39469515
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39470226	39470303	2	2	-0.4022	0	39469515	39469515	1.56931216386997e-16	39470303	39470303
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39475979	39505256	13	13	0.923	1.56931216386997e-16	39470303	39470303	6.48655057238748e-53	39505256	39508035
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	48970399	1682	1629	0.0893	6.48655057238748e-53	39505256	39508035	1.00415300267403e-26	48959867	48973241
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	48971926	49055375	43	42	0.4214	1.00415300267403e-26	48959867	48973241	3.37983715855247e-32	49049754	49079208
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	49057606	50121828	224	218	0.0544	3.37983715855247e-32	49049754	49079208	5.55496533363444e-65	50094544	50129927
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	50127777	50947829	125	124	0.3904	5.55496533363444e-65	50094544	50129927	5.74042142316539e-84	50935682	50973676
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	50957486	85687135	10150	9861	0.076	5.74042142316539e-84	50935682	50973676	2.21608604943097e-12	85687135	85687135
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85690246	85696461	2	2	-0.894	2.21608604943097e-12	85687135	85687135	2.16524089566168e-12	85696461	85696461
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85698213	90492972	1359	1320	0.0685	2.16524089566168e-12	85696461	85696461	4.3454038496132e-154	90475671	90501812
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	90496647	91474355	224	220	0.4098	4.3454038496132e-154	90475671	90501812	6.43114031740146e-150	91451676	91489919
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	91481063	145351798	17332	16821	0.0803	6.43114031740146e-150	91451676	91489919	1.56132061417536e-87	145334573	145487034
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145356550	145731437	104	101	0.3151	1.56132061417536e-87	145334573	145487034	4.27677579149738e-11	145695608	145766017
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145733920	146264846	188	185	0.1202	4.27677579149738e-11	145695608	145766017	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	747	-0.3767	NA	NA	NA	2.28850775014427e-14	2135333	2135333
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.4763	2.28850775014427e-14	2135333	2135333	5.26108908005409e-16	2139868	2139868
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	6685358	1709	1660	-0.3689	5.26108908005409e-16	2139868	2139868	7.79556315478833e-10	6681606	6685358
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-1.0846	7.79556315478833e-10	6681606	6685358	1.96847128289639e-08	6698290	6701392
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	15802255	2984	2900	-0.3868	1.96847128289639e-08	6698290	6701392	7.22971874361034e-193	15802255	15802255
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-4.3474	7.22971874361034e-193	15802255	15802255	1.93931604304583e-199	15807123	15807123
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2311	-0.3672	1.93931604304583e-199	15807123	15807123	9.05673199675418e-07	22473542	22477358
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.3931	9.05673199675418e-07	22473542	22477358	5.29325146470302e-08	22492603	22499541
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	27098691	932	905	-0.3987	5.29325146470302e-08	22492603	22499541	1.21091735528176e-07	27096126	27098691
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27100164	27102551	2	2	0.3758	1.21091735528176e-07	27096126	27098691	1.24998957554485e-12	27102551	27103716
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27103716	37933887	3720	3602	-0.3664	1.24998957554485e-12	27102551	27103716	1.30289322693405e-13	37933887	37933887
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	37935555	37937126	2	2	0.4992	1.30289322693405e-13	37933887	37933887	6.82137586855083e-10	37937126	37938440
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	37938440	39048058	231	227	-0.3661	6.82137586855083e-10	37937126	37938440	1.02173024198674e-33	38758232	39088753
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	43776365	11	11	0.3789	1.02173024198674e-33	38758232	39088753	0.000144293381962906	39130211	47002187
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	44199401	70217543	23	23	-0.11	0.000144293381962906	39130211	47002187	3.43264268440899e-08	67927172	70229901
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70221479	70926188	312	302	-0.3836	3.43264268440899e-08	67927172	70229901	2.84905491073214e-67	70926188	70926188
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.8535	2.84905491073214e-67	70926188	70926188	1.45921545772184e-72	70930528	70930528
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	73133242	948	918	-0.3823	1.45921545772184e-72	70930528	70930528	7.88267817081025e-14	73133242	73133242
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73135012	73139210	3	3	-1.2765	7.88267817081025e-14	73133242	73133242	1.16609189854234e-15	73139210	73139210
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73140836	80383031	2584	2514	-0.3771	1.16609189854234e-15	73139210	73139210	0	80383031	80383031
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	80390481	80794659	89	87	0.6088	0	80383031	80383031	0	80794659	80794659
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	80798908	100348045	6295	6115	-0.3771	0	80794659	80794659	1.15855133284621e-25	100348045	100348045
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.907	1.15855133284621e-25	100348045	100348045	1.93382157577453e-28	100350814	100350814
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5379	-0.3785	1.93382157577453e-28	100350814	100350814	9.03938460193383e-12	116124007	116124007
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.371	9.03938460193383e-12	116124007	116124007	1.19721069538259e-42	116130333	116130333
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	130451027	5550	5372	-0.363	1.19721069538259e-42	116130333	116130333	1.37855416663529e-42	130446682	130452519
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130452519	130464445	7	7	0.1532	1.37855416663529e-42	130446682	130452519	1.85564833587288e-07	130459484	130473195
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130465664	134025748	1439	1392	-0.3002	1.85564833587288e-07	130459484	130473195	2.06480656070440e-33	134020066	134030277
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134026919	134105130	39	38	0.1312	2.0648065607044e-33	134020066	134030277	0.00106331233775309	134088348	134105130
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134107905	134121364	6	5	0.5619	0.00106331233775309	134088348	134105130	3.71594389795676e-11	134121364	134122620
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134122620	134312399	98	97	0.0748	3.71594389795676e-11	134121364	134122620	1.01148180653716e-40	134309864	134325180
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134315445	140145683	2261	2188	-0.2513	1.01148180653716e-40	134309864	134325180	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	20034777	7012	6815	0.0696	NA	NA	NA	1.79539550639908e-08	20034777	20034777
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	20037150	20039476	2	2	-0.7664	1.79539550639908e-08	20034777	20034777	2.59983899390214e-09	20039476	20039476
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	20041796	27038538	2715	2619	0.0839	2.59983899390214e-09	20039476	20039476	2.01162418749359e-279	27038538	27038538
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.4421	2.01162418749359e-279	27038538	27038538	2.97744248272723e-262	27041812	27041812
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	43881833	4285	4140	0.0785	2.97744248272723e-262	27041812	27041812	4.76475131560864e-10	43863130	43881833
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43900110	43949353	6	6	-0.4475	4.76475131560864e-10	43863130	43881833	1.03526938236629e-09	43949353	43970440
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43958486	63999299	5243	5076	0.0613	1.03526938236629e-09	43949353	43970440	6.34841029415665e-15	63991669	64000615
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	64000615	64027105	14	13	-0.3631	6.34841029415665e-15	63991669	64000615	9.4788445461427e-16	64023842	64032346
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	64030175	77917893	5313	5144	0.0947	9.4788445461427e-16	64023842	64032346	1.97104528545434e-205	77917893	77917893
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.2959	1.97104528545434e-205	77917893	77917893	3.53644120505095e-211	77928738	77928738
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	88206196	3022	2921	0.0663	3.53644120505095e-211	77928738	77928738	2.95580019164089e-23	88200527	88210097
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	88208818	88253003	23	23	-0.3393	2.95580019164089e-23	88200527	88210097	1.46924202299114e-24	88251225	88257128
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	88254732	88896882	222	214	0.1224	1.46924202299114e-24	88251225	88257128	1.94820012810528e-10	88845703	89256027
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	88905200	89311273	26	26	0.4124	1.94820012810528e-10	88845703	89256027	1.33487974622892e-17	89304168	89329135
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89313118	127563278	14202	13760	0.0802	1.33487974622892e-17	89304168	89329135	2.76330122598769e-19	127560827	127566573
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	10	-0.4789	2.76330122598769e-19	127560827	127566573	1.55179496104137e-25	127584068	127592138
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	134739406	2495	2432	0.0655	1.55179496104137e-25	127584068	127592138	1.02896768809359e-26	134739406	134739406
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	1.1731	1.02896768809359e-26	134739406	134739406	3.98271549734407e-07	134743423	134743423
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135045271	142	139	0.2456	3.98271549734407e-07	134743423	134743423	4.43386263639775e-09	135015673	135058235
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135047415	135285645	67	66	0.0398	4.43386263639775e-09	135015673	135058235	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	2110773	780	770	0.2032	NA	NA	NA	7.7925628816199e-05	2092532	2120019
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2112711	2138430	25	24	0.4475	7.7925628816199e-05	2092532	2120019	3.30775190868106e-21	2135730	2146439
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2141724	56853918	16779	16304	0.0782	3.30775190868106e-21	2135730	2146439	3.02695260252808e-158	56847811	56860917
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	56856591	56856591	1	0	NA	3.02695260252808e-158	56847811	56860917	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	56858515	57232708	206	203	0.4343	NA	NA	NA	1.57972897834286e-97	57224933	57242600
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57235800	65752459	3471	3361	0.1206	1.57972897834286e-97	57224933	57242600	1.12829222583178e-25	65729853	65779054
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65755101	65847130	44	44	0.3437	1.12829222583178e-25	65729853	65779054	7.01044843720382e-21	65819842	65860867
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65848334	84939605	6959	6754	0.0955	7.01044843720382e-21	65819842	65860867	3.76430765681392e-46	84939605	84939605
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84951675	6	6	-1.0612	3.76430765681392e-46	84939605	84939605	1.80549157264498e-52	84951675	84951675
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	99021938	4166	4049	0.0712	1.80549157264498e-52	84951675	84951675	8.0757731805413e-08	99001305	99027331
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99074552	23	22	0.3067	8.0757731805413e-08	99001305	99027331	1.54330055369337e-07	99064450	99086242
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	107284914	2769	2684	0.0792	1.54330055369337e-07	99064450	99086242	3.56642065972613e-20	107284914	107284914
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-1.1283	3.56642065972613e-20	107284914	107284914	5.17242891807469e-18	107292148	107292148
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	120434219	4821	4684	0.0808	5.17242891807469e-18	107292148	107292148	1.11156677908891e-131	120425779	120443156
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	120435956	121005037	228	221	0.393	1.11156677908891e-131	120425779	120443156	8.13157476412217e-132	121000606	121012098
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121006282	125324390	1667	1623	0.08	8.13157476412217e-132	121000606	121012098	6.45835294044931e-09	125322089	125324390
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	125327689	125330890	3	3	-0.5969	6.45835294044931e-09	125322089	125324390	3.3224594137291e-08	125330890	125333023
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	125333023	134450318	3354	3266	0.0558	3.3224594137291e-08	125330890	125333023	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3629	0.4256	NA	NA	NA	2.63292414751968e-83	9523923	9528590
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	1.5619	2.63292414751968e-83	9523923	9528590	6.17180080665331e-88	9582696	9589725
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	9590351	1	0	NA	6.17180080665331e-88	9582696	9589725	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	11104973	571	559	0.4376	NA	NA	NA	9.31111848633343e-54	11104973	11104973
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	1.2977	9.31111848633343e-54	11104973	11104973	1.09073214907838e-55	11140421	11140421
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	27538318	5783	5592	0.4277	1.09073214907838e-55	11140421	11140421	4.69656256697791e-18	27538318	27538318
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	27539643	27544931	4	4	-0.4028	4.69656256697791e-18	27538318	27538318	2.06831047299285e-17	27544931	27544931
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	27546507	110409014	27044	26248	0.4271	2.06831047299285e-17	27544931	27544931	9.31917005129063e-11	110409014	110409014
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110410827	110411410	2	2	-0.5107	9.31917005129063e-11	110409014	110409014	7.35096506560243e-11	110411410	110411410
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110423372	120805873	3898	3782	0.4267	7.35096506560243e-11	110411410	110411410	9.16742056377298e-10	120803536	120805873
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120806897	120810710	2	2	-0.4338	9.16742056377298e-10	120803536	120805873	1.36551407239987e-22	120810710	120810710
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120812093	130694393	3446	3337	0.416	1.36551407239987e-22	120810710	120810710	9.48152346732504e-23	130694393	130694393
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.3799	9.48152346732504e-23	130694393	130694393	5.68145147675496e-12	130701040	130701040
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	89	0.393	5.68145147675496e-12	130701040	130701040	1.58510106682772e-54	130943064	130943064
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.4883	1.58510106682772e-54	130943064	130943064	8.11406532527049e-37	130946248	130946248
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	130947790	1	0	NA	8.11406532527049e-37	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130950835	132289090	549	531	0.4955	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7120	-0.356	NA	NA	NA	1.02609668427001e-97	37953582	37953582
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.5595	1.02609668427001e-97	37953582	37953582	6.66077192206683e-106	37957844	37957844
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6485	-0.3534	6.66077192206683e-106	37957844	37957844	2.74897090537907e-38	56646284	56650373
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-1.0197	2.74897090537907e-38	56646284	56650373	1.38611610629721e-38	56681665	56686863
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	56685341	1	0	NA	1.38611610629721e-38	56681665	56686863	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	78639650	6110	5932	-0.3703	NA	NA	NA	1.73351568542833e-10	78639650	78639650
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	78643845	78643845	1	0	NA	1.73351568542833e-10	78639650	78639650	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	78648976	78653878	2	2	0.5448	NA	NA	NA	1.61630228545396e-19	78653878	78658378
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	78658378	113565415	11280	10967	-0.3632	1.61630228545396e-19	78653878	78658378	5.78468649202795e-28	113557467	113585241
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113567124	113613200	24	24	-0.0065	5.78468649202795e-28	113557467	113585241	3.02710035314583e-05	113590333	113642888
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113616260	113616260	1	0	NA	3.02710035314583e-05	113590333	113642888	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113618649	114123340	186	179	-0.2946	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.5814	NA	NA	NA	9.09482836033977e-145	19490630	19494416
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21549262	1002	970	0.069	9.09482836033977e-145	19490630	19494416	6.47863106219705e-88	21540156	21556721
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21551504	22047168	248	242	0.3355	6.47863106219705e-88	21540156	21556721	2.67973430701866e-42	22038206	22057437
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	22604105	259	247	0.1025	2.67973430701866e-42	22038206	22057437	5.07541247984111e-13	22597599	22608236
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22605959	22631052	16	16	0.4741	5.07541247984111e-13	22597599	22608236	4.57147636535275e-17	22627449	22633268
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22632174	34674458	4165	4058	0.0666	4.57147636535275e-17	22627449	22633268	3.62459108963844e-25	34674458	34674458
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.2015	3.62459108963844e-25	34674458	34674458	2.26312665110268e-25	34683810	34683810
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1845	0.063	2.26312665110268e-25	34683810	34683810	3.01008652702315e-13	40663660	40676611
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5732	3.01008652702315e-13	40663660	40676611	5.29168293356541e-14	40726930	40746865
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	56245503	4652	4512	0.0589	5.29168293356541e-14	40726930	40746865	3.66624029093562e-68	56245503	56245503
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56250873	56268037	5	5	-1.3494	3.66624029093562e-68	56245503	56245503	1.23062416872218e-63	56268037	56268037
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56272943	73071404	7107	6905	0.0603	1.23062416872218e-63	56268037	56268037	1.84035066511100e-81	73071404	73071404
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.840350665111e-81	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.3983	NA	NA	NA	9.6345375740049e-74	73092112	73092112
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105594189	12213	11840	0.0624	9.6345375740049e-74	73092112	73092112	1.51962656042433e-41	105588527	105606424
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105595302	105623070	11	11	0.4996	1.51962656042433e-41	105588527	105606424	8.18863292626896e-11	105618927	105632168
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105625010	106221696	184	178	0.0307	8.18863292626896e-11	105618927	105632168	2.74950722243497e-06	106207549	106223507
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106255190	15	14	0.3407	2.74950722243497e-06	106207549	106223507	0.000383397158982878	106251081	106284363
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	35	0.0666	0.000383397158982878	106251081	106284363	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1498	NA	NA	NA	3.2010865049769e-27	18452491	18452491
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18826924	7	7	-0.7759	3.2010865049769e-27	18452491	18452491	0.00692637485153894	18826924	18876677
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18831600	19537035	87	86	-0.514	0.00692637485153894	18826924	18876677	0.00126041908258566	19401331	19800789
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19835471	8	8	-0.7879	0.00126041908258566	19401331	19800789	8.0312378549101e-52	19835471	19835471
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-1.986	8.0312378549101e-52	19835471	19835471	1.46862446043644e-17	19844217	19844217
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20088256	47	46	-0.7492	1.46862446043644e-17	19844217	19844217	4.1267457404063e-183	20079935	20088256
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32523241	3675	3561	0.0634	4.1267457404063e-183	20079935	20088256	1.54797413535195e-11	32517839	32544263
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32525865	32572315	15	15	0.4285	1.54797413535195e-11	32517839	32544263	1.78345676010096e-09	32552457	32583146
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32576881	42208084	3910	3795	0.1022	1.78345676010096e-09	32552457	32583146	3.96891814601227e-116	42200971	42216316
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42210467	42210467	1	0	NA	3.96891814601227e-116	42200971	42216316	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42214757	42550484	147	142	0.4685	NA	NA	NA	1.65110706047566e-126	42544801	42559245
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42557342	74669752	13807	13402	0.0868	1.65110706047566e-126	42544801	42559245	5.57531412008456e-30	74669752	74669752
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.1995	5.57531412008456e-30	74669752	74669752	1.43492464530625e-23	74680439	74680439
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	162	0.1311	1.43492464530625e-23	74680439	74680439	6.31868760885427e-55	75115806	75115806
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.1434	6.31868760885427e-55	75115806	75115806	1.41119306913800e-59	75119713	75119713
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	87533846	4566	4436	0.0766	1.411193069138e-59	75119713	75119713	6.44806446835045e-131	87527741	87539835
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87537512	87897847	186	183	0.4277	6.44806446835045e-131	87527741	87539835	6.63690293008871e-138	87881195	87910499
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87901294	99632987	4409	4278	0.0732	6.63690293008871e-138	87881195	87910499	1.9651054616245e-38	99632987	99632987
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.8296	1.9651054616245e-38	99632987	99632987	2.09572032380249e-34	99635701	99635701
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	262	0.0588	2.09572032380249e-34	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	461	-0.7651	NA	NA	NA	1.48790950069755e-09	1296506	1296767
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	0.6806	1.48790950069755e-09	1296506	1296767	2.79319125696744e-10	1300341	1300341
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	1997948	309	300	-0.7972	2.79319125696744e-10	1300341	1300341	8.9953056423448e-09	1995829	1997948
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1999192	2000527	2	2	0.5691	8.9953056423448e-09	1995829	1997948	1.05195030588487e-07	2000527	2005613
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2005613	2238028	83	80	-0.6763	1.05195030588487e-07	2000527	2005613	1.49152069061760e-07	2199377	2263740
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2240704	2240704	1	0	NA	1.4915206906176e-07	2199377	2263740	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2242935	2425708	87	85	-0.9387	NA	NA	NA	6.08118206279404e-282	2425708	2425708
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2428026	2972337	191	190	0.1644	6.08118206279404e-282	2425708	2425708	3.31656727402793e-78	2972337	2979650
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2976490	2976490	1	0	NA	3.31656727402793e-78	2972337	2979650	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2979650	3058775	34	33	-0.6487	NA	NA	NA	1.72911385057959e-09	3031603	3088138
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3065145	4050208	429	414	-0.9743	1.72911385057959e-09	3031603	3088138	3.04148017602805e-200	4048558	4050208
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4054781	4185816	53	53	0.1695	3.04148017602805e-200	4048558	4050208	1.39916347564363e-157	4185816	4187745
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4187745	4833002	287	272	-0.882	1.39916347564363e-157	4185816	4187745	0	4830346	4833002
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4834286	7411360	1010	983	0.0495	0	4830346	4833002	0	7411360	7411360
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	7413283	9520568	590	570	-1.0702	0	7411360	7411360	3.24512307908198e-08	9515712	9520568
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9525382	9536153	3	3	-0.2146	3.24512307908198e-08	9515712	9520568	0.00258136925614516	9536153	9704767
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9538230	21258019	3700	3593	0.0896	0.00258136925614516	9536153	9704767	5.36538983969487e-12	21244385	21258019
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	9	-0.3901	5.36538983969487e-12	21244385	21258019	4.10336512877006e-16	21501073	21507188
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22338034	283	271	0.1282	4.10336512877006e-16	21501073	21507188	4.74166429815846e-17	22324719	22547406
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22617217	11	11	-0.3651	4.74166429815846e-17	22324719	22547406	2.50894819484790e-11	22598209	22647089
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	23929307	529	517	0.0981	2.5089481948479e-11	22598209	22647089	1.55847114910799e-144	23919902	23939022
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23930855	25380064	531	518	0.4139	1.55847114910799e-144	23919902	23939022	2.38047868085146e-243	25373866	25389691
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	25385030	26295570	306	299	0.8764	2.38047868085146e-243	25373866	25389691	0.00168181376725179	26278732	26295570
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	26298997	26302275	2	2	0.3989	0.00168181376725179	26278732	26295570	1.03669340727053e-16	26302275	26308987
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	26304723	30449186	1066	1031	-0.3079	1.03669340727053e-16	26302275	26308987	1.32068114788660e-18	30447037	30449186
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30453632	30453633	2	2	0.5622	1.3206811478866e-18	30447037	30449186	1.15220917828150e-23	30453633	30457985
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30457985	59277123	5358	5222	-0.3615	1.1522091782815e-23	30453633	30457985	0	59277123	59284347
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	59284347	63510155	816	794	-1.1275	0	59277123	59284347	0	63504403	63510155
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	63512665	68693086	2130	2081	-0.3161	0	63504403	63510155	1.07347585357041e-39	68693086	68693086
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68712507	2	0	NA	1.07347585357041e-39	68693086	68693086	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68732367	68753209	8	8	-1.3011	NA	NA	NA	1.72122059566038e-34	68753209	68753209
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	69401319	255	241	-0.2815	1.72122059566038e-34	68753209	68753209	1.18002373119302e-36	69381055	69414805
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69402880	69758635	161	158	-0.0146	1.18002373119302e-36	69381055	69414805	1.65990875320702e-117	69753919	69765453
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	72941901	1039	1006	-0.365	1.65990875320702e-117	69753919	69765453	3.46899175099519e-28	72941901	72941901
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	5	-1.288	3.46899175099519e-28	72941901	72941901	2.92978750633364e-29	72964783	72964783
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	73812685	326	317	-0.3301	2.92978750633364e-29	72964783	72964783	2.35384114386038e-07	73792179	73834973
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73815706	73873748	27	25	-0.1012	2.35384114386038e-07	73792179	73834973	3.14769518096307e-08	73852307	73893588
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73875769	75093957	401	390	-0.3612	3.14769518096307e-08	73852307	73893588	3.68990039170043e-27	75093957	75093957
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.9341	3.68990039170043e-27	75093957	75093957	1.41592840802924e-29	75100865	75100865
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.3819	1.41592840802924e-29	75100865	75100865	3.70351960201156e-21	76923844	76931247
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	0.3578	3.70351960201156e-21	76923844	76931247	4.09468590531142e-58	76935880	76942679
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4376	-0.3401	4.09468590531142e-58	76935880	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	406	-0.2749	NA	NA	NA	2.55739171759037e-21	1028979	1028979
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.2988	2.55739171759037e-21	1028979	1028979	1.45789068867809e-22	1030766	1030766
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1703117	330	325	-0.2631	1.45789068867809e-22	1030766	1030766	4.17822637753125e-06	1701788	1703117
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1706026	1712391	2	2	-1.0892	4.17822637753125e-06	1701788	1703117	4.1523591711647e-07	1712391	1713866
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1713866	1904451	103	101	-0.2498	4.1523591711647e-07	1712391	1713866	3.13661203535448e-10	1904451	1904451
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906352	2	2	0.7687	3.13661203535448e-10	1904451	1904451	1.78581322895605e-16	1906352	1906352
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906391	1906391	1	0	NA	1.78581322895605e-16	1906352	1906352	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	17641172	6175	5974	-0.3391	NA	NA	NA	1.75263332634163e-15	17637894	17641172
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	17642111	17646235	3	3	0.3397	1.75263332634163e-15	17637894	17641172	3.6792939683475e-19	17646235	17647325
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	17647325	31457889	5002	4832	-0.3407	3.6792939683475e-19	17646235	17647325	1.25099867237004e-15	31437168	31467971
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31893451	22	21	-0.0051	1.25099867237004e-15	31437168	31467971	4.22430835585019e-15	31889566	31905266
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31895551	32828797	362	349	-0.3549	4.22430835585019e-15	31889566	31905266	3.98118669574717e-13	32828797	32828797
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.6787	3.98118669574717e-13	32828797	32828797	2.2247975077867e-09	32832642	32833765
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1412	-0.3123	2.2247975077867e-09	32832642	32833765	0	36673853	36673853
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-4.0477	0	36673853	36673853	0	36683509	36683509
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	1972	-0.2959	0	36683509	36683509	2.02441964131635e-38	41562786	41573295
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41568539	1	0	NA	2.02441964131635e-38	41562786	41573295	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41710400	45	44	-0.7296	NA	NA	NA	1.86755496463143e-105	41704093	42147225
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13251	-0.3291	1.86755496463143e-105	41704093	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	14112426	4922	4765	-0.3738	NA	NA	NA	1.95754582957171e-11	14086728	14142555
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14112462	14717149	25	25	-0.0962	1.95754582957171e-11	14086728	14142555	1.38359642286888e-14	14690729	14739822
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14719302	53092949	11252	10979	-0.3812	1.38359642286888e-14	14690729	14739822	1.22756934540797e-21	53092949	53092949
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.725	1.22756934540797e-21	53092949	53092949	2.47289043761707e-20	53099601	53099601
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	67576452	4147	4030	-0.3875	2.47289043761707e-20	53099601	53099601	1.63103793003819e-08	67570818	67585719
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	67580605	67597084	4	4	-1.0114	1.63103793003819e-08	67570818	67585719	2.53046840571933e-08	67585719	67608800
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	67608800	75222401	2276	2201	-0.4016	2.53046840571933e-08	67585719	67608800	1.18028914385680e-18	75208650	75235682
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75223901	75296893	31	31	-0.0837	1.1802891438568e-18	75208650	75235682	5.60208729736926e-12	75284189	75312411
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75299455	76116026	305	290	-0.339	5.60208729736926e-12	75284189	75312411	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	470	-0.1148	NA	NA	NA	4.47209586584044e-29	1398325	1398325
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.0844	4.47209586584044e-29	1398325	1398325	8.79740645334652e-44	1400840	1400840
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	7243635	2766	2673	-0.2277	8.79740645334652e-44	1400840	1400840	8.85432469040518e-23	7242096	7246012
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7246012	7254650	3	3	0.5182	8.85432469040518e-23	7242096	7246012	5.69483727107714e-09	7250473	7304352
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7304352	11448975	1909	1857	-0.2825	5.69483727107714e-09	7250473	7304352	3.26947953358191e-18	11448975	11448975
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.0916	3.26947953358191e-18	11448975	11448975	5.468272772533e-19	11452390	11452390
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	13820920	1015	991	-0.3026	5.468272772533e-19	11452390	11452390	4.81970895552441e-12	13819987	13822228
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13822228	13828355	3	3	0.6181	4.81970895552441e-12	13819987	13822228	1.21648684198764e-19	13822732	13828355
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13828564	56823430	13681	13249	-0.3115	1.21648684198764e-19	13822732	13828355	3.17603293442178e-19	56822197	56828073
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.9968	3.17603293442178e-19	56822197	56828073	7.40320036251407e-16	56834433	56842447
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59491509	1206	1153	-0.3418	7.40320036251407e-16	56834433	56842447	4.26829986140692e-09	59491509	59491509
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-1.3409	4.26829986140692e-09	59491509	59491509	2.09612970857968e-09	59497049	59497049
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63224461	1690	1644	-0.3478	2.09612970857968e-09	59497049	59497049	3.81273153287304e-09	63220431	63231416
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63226131	63234823	5	5	0.2225	3.81273153287304e-09	63220431	63231416	4.19986529932337e-06	63229087	63238286
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63235983	63787171	274	266	-0.3096	4.19986529932337e-06	63229087	63238286	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	564	0.0651	NA	NA	NA	2.07950572729853e-09	1499421	1499421
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1511632	2	2	-0.8437	2.07950572729853e-09	1499421	1499421	1.03439444128787e-09	1511632	1511632
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1525300	6	6	-3.547	1.03439444128787e-09	1511632	1511632	2.16543463202517e-14	1525300	1525300
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	1532433	3	3	-0.8195	2.16543463202517e-14	1525300	1525300	6.55696017085665e-15	1532433	1532433
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	26148060	8439	8191	0.0724	6.55696017085665e-15	1532433	1532433	1.44814827711486e-09	26145205	26148060
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	9	-0.3451	1.44814827711486e-09	26145205	26148060	2.36720763020549e-15	26161111	26168610
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	48057167	7359	7127	0.0924	2.36720763020549e-15	26161111	26168610	6.66999934711016e-16	48057167	48062677
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48059787	48070532	4	4	0.9286	6.66999934711016e-16	48057167	48062677	1.11144377895358e-17	48062677	48070532
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48076732	55394761	2294	2224	0.0814	1.11144377895358e-17	48062677	48070532	1.07805041751214e-11	55381755	55408354
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55395991	55452075	26	26	0.3549	1.07805041751214e-11	55381755	55408354	6.71849573023944e-69	55424045	55501367
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55455824	62419534	2852	2766	0.1137	6.71849573023944e-69	55424045	55501367	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9888812	3	3	-0.2038	NA	NA	NA	5.26079921360652e-05	9888812	9975302
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9905318	10167413	19	19	-0.8011	5.26079921360652e-05	9888812	9975302	4.38762518335988e-17	10167413	10167413
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	4.38762518335988e-17	10167413	10167413	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	13635227	6	6	0.228	NA	NA	NA	0.00412662218941666	13562263	13696483
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13676572	14307689	42	41	-0.1384	0.00412662218941666	13562263	13696483	3.07056144719991e-12	13894824	14335947
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14312687	34229849	7188	6994	0.0749	3.07056144719991e-12	13894824	14335947	1.37105482599226e-07	34217754	34236000
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	34231293	34254160	10	10	0.4188	1.37105482599226e-07	34217754	34236000	3.21633747467105e-07	34244242	34260856
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	34255961	36789648	1276	1241	0.0603	3.21633747467105e-07	34244242	34260856	9.65837476431015e-27	36789648	36789648
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.5624	9.65837476431015e-27	36789648	36789648	3.56036465801988e-23	36791668	36791668
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	45635531	4298	4179	0.0839	3.56036465801988e-23	36791668	36791668	2.21965341140198e-19	45628934	45641013
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45637314	45675288	18	18	0.4602	2.21965341140198e-19	45628934	45641013	1.62886580685166e-08	45664059	45686603
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45677390	46922972	578	557	0.1115	1.62886580685166e-08	45664059	45686603	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21571489	2521	2447	-0.9512	NA	NA	NA	1.00418980090436e-13	21570227	21571489
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.1168	1.00418980090436e-13	21570227	21571489	8.38161069310598e-08	21576859	21579649
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	446	-0.9122	8.38161069310598e-08	21576859	21579649	4.8859470788738e-175	22667608	22682428
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.4361	4.8859470788738e-175	22667608	22682428	6.88595047664968e-221	22718614	22725305
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	24075755	630	615	-0.9925	6.88595047664968e-221	22718614	22725305	2.0067594014349e-10	24059010	24090622
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24078724	24135148	24	24	-0.6178	2.0067594014349e-10	24059010	24090622	6.07380241037973e-16	24125364	24149976
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24136917	28421010	2464	2381	-1.0474	6.07380241037973e-16	24125364	24149976	1.15115294734365e-18	28410458	28435969
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28422388	28479825	33	33	-0.6855	1.15115294734365e-18	28410458	28435969	1.29400511152178e-20	28454113	28494376
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28481680	35472378	3396	3280	-1.015	1.29400511152178e-20	28454113	28494376	4.0088712144763e-46	35472378	35472378
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.5987	4.0088712144763e-46	35472378	35472378	3.04238436954056e-42	35476942	35476942
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	39941142	2381	2317	-0.9343	3.04238436954056e-42	35476942	35476942	5.16592688458163e-25	39879149	39966559
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39942371	40037798	56	55	-0.7515	5.16592688458163e-25	39879149	39966559	1.08937939509348e-06	40008711	40086040
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40043926	40609197	328	320	-0.9515	1.08937939509348e-06	40008711	40086040	6.3061770132111e-06	40595344	40626139
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40610429	40654106	42	41	-0.7299	6.3061770132111e-06	40595344	40626139	2.1810591231962e-06	40634179	40666888
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40655210	40858945	89	84	-0.9955	2.1810591231962e-06	40634179	40666888	0.000196415314074852	40843471	40858945
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40874538	40877759	3	3	-0.4116	0.000196415314074852	40843471	40858945	1.70864355723415e-13	40877759	40896691
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40881425	48949909	3837	3721	-0.9553	1.70864355723415e-13	40877759	40896691	2.30053159184851e-12	48945250	48949909
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48950671	48961669	6	5	-0.2879	2.30053159184851e-12	48945250	48949909	9.13515451785432e-07	48958287	48964550
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48963260	49014163	28	27	-0.8382	9.13515451785432e-07	48958287	48964550	0.000808173521474915	49002421	49047484
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49018338	49128004	45	43	-0.5811	0.000808173521474915	49002421	49047484	3.51505360886906e-06	49086704	49169381
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49132642	49567768	187	182	-0.8521	3.51505360886906e-06	49086704	49169381	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	151515	49	49	-0.5321	NA	NA	NA	4.57154125668144e-05	145305	153373
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153373	165816	11	11	-1.1175	4.57154125668144e-05	145305	153373	0.0169464550170840	159609	165816
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	170802	206524	4	4	-0.731	0.016946455017084	159609	165816	0.000428906444360497	206524	208682
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	207612	222004	17	17	-0.1741	0.000428906444360497	206524	208682	0.000421759429213244	216381	234511
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	222034	323296	90	88	-0.6037	0.000421759429213244	216381	234511	6.52617797901376e-08	281091	350457
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	323328	714353	308	294	-0.853	6.52617797901376e-08	281091	350457	5.74041914064602e-05	704996	719285
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	715717	727497	7	7	-0.2634	5.74041914064602e-05	704996	719285	4.50220222090988e-05	723814	735270
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	729499	1387177	266	258	-0.8609	4.50220222090988e-05	723814	735270	1.89175988549179e-11	1373567	1407999
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1387546	1514559	92	87	-0.5559	1.89175988549179e-11	1373567	1407999	7.65254538671942e-06	1478206	1534998
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1518376	1659473	123	118	-0.8235	7.65254538671942e-06	1478206	1534998	0.00499632759563282	1627849	1686157
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1661248	1661248	1	0	NA	0.00499632759563282	1627849	1686157	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1662271	1712236	56	51	-0.5934	NA	NA	NA	6.39366301942116e-12	1698603	1726100
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1715594	2426938	516	508	-0.9508	6.39366301942116e-12	1698603	1726100	8.3807168415544e-12	2426938	2426938
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	0.7289	8.3807168415544e-12	2426938	2426938	7.84321622931543e-10	2428307	2428307
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2708291	251	246	-0.9346	7.84321622931543e-10	2428307	2428307	0	2706218	2708291
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76052473	22857	22191	-0.0741	0	2706218	2708291	2.33035721907534e-241	76052473	76052885
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76052885	76060932	13	13	-2.097	2.33035721907534e-241	76052473	76052885	1.98761849781693e-239	76060109	76060932
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76067576	103129950	5576	5408	-0.0784	1.98761849781693e-239	76060109	76060932	4.43438484641847e-07	103085358	103154028
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103145335	103226637	22	22	-0.354	4.43438484641847e-07	103085358	103154028	1.49977094176384e-21	103183992	103244981
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103228308	154582414	16666	16199	-0.0734	1.49977094176384e-21	103183992	103244981	0	154582414	154586690
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154863234	184	176	-0.9923	0	154582414	154586690	1.66638274583630e-07	154851751	154880306
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154868285	154888224	17	16	-0.5417	1.6663827458363e-07	154851751	154880306	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	118	-4.0361	NA	NA	NA	1.02121547350099e-19	2969891	3034907
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	15	-1.4687	1.02121547350099e-19	2969891	3034907	2.16658393292002e-13	5593746	6692482
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	168	-3.8283	2.16658393292002e-13	5593746	6692482	9.27581041268517e-06	7022973	7177061
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7057026	1	0	NA	9.27581041268517e-06	7022973	7177061	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7249762	47	45	-2.8209	NA	NA	NA	0.000614448105497285	7241740	7249762
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7250951	7256919	4	3	-5.6161	0.000614448105497285	7241740	7249762	2.51297798998486e-08	7256919	7258171
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7304209	25	25	-2.4065	2.51297798998486e-08	7256919	7258171	1.17325814888577e-07	7296153	7330779
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7709619	117	114	-3.8887	1.17325814888577e-07	7296153	7330779	0.000251608923788613	7677056	7713973
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7788596	30	28	-2.8543	0.000251608923788613	7677056	7713973	4.47282606706799e-05	7756907	7821554
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7789562	7859390	26	26	-3.76	4.47282606706799e-05	7756907	7821554	0.00213144632477941	7848999	7936024
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7997485	30	30	-2.7802	0.00213144632477941	7848999	7936024	5.20684716007917e-11	7985527	8010446
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8178487	39	35	-4.4388	5.20684716007917e-11	7985527	8010446	8.52314765402818e-05	8149413	8178487
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8201959	8	8	-3.1285	8.52314765402818e-05	8149413	8178487	6.09278750112718e-07	8199414	8211300
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8204414	8289709	19	18	-4.2892	6.09278750112718e-07	8199414	8211300	1.17080251648949e-20	8280065	8292347
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-2.7328	1.17080251648949e-20	8280065	8292347	3.26280997567374e-05	8316416	8340407
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8532066	43	42	-4.03	3.26280997567374e-05	8316416	8340407	0.00722631253651804	8450784	8569769
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8533866	8683710	54	52	-3.3046	0.00722631253651804	8450784	8569769	0.000329053618167027	8570815	8712094
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8685946	8949553	81	79	-3.9965	0.000329053618167027	8570815	8712094	1.82144066918139e-05	8938284	8949553
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.7319	1.82144066918139e-05	8938284	8949553	4.51632878821711e-08	8956787	8956787
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9119912	24	23	-4.4694	4.51632878821711e-08	8956787	8956787	2.04924746890809e-05	9094974	9147381
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9126602	10032083	27	25	-3.3871	2.04924746890809e-05	9094974	9147381	0.00245154892332203	9990889	10372818
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10049346	10515697	61	58	-4.1562	0.00245154892332203	9990889	10372818	2.12747769077923e-42	10513747	10515697
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.6541	2.12747769077923e-42	10513747	10515697	1.31691152992861e-18	10645500	10655750
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12541506	18	17	-3.9467	1.31691152992861e-18	10645500	10655750	6.5185911304792e-05	12527445	12557151
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.5259	6.5185911304792e-05	12527445	12557151	2.52820402980033e-10	12651786	12696242
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.1596	2.52820402980033e-10	12651786	12696242	2.4453745849224e-11	12820920	12850287
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	108	-2.7304	2.4453745849224e-11	12820920	12850287	2.39500349304468e-11	13111594	13136828
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13162723	19	19	-4.3106	2.39500349304468e-11	13111594	13136828	0.00104310225136233	13153117	13232295
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13164641	13283695	33	33	-3.2522	0.00104310225136233	13153117	13232295	0.000429602442277629	13240240	13286708
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13285595	13329968	16	16	-4.4454	0.000429602442277629	13240240	13286708	5.19775643256979e-07	13327446	13329968
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13330707	13344526	7	6	-3.0037	5.19775643256979e-07	13327446	13329968	3.72275259893163e-05	13344526	13357259
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13347152	13414670	35	35	-4.4265	3.72275259893163e-05	13344526	13357259	4.72108844294301e-10	13411855	13422642
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13421917	13453843	18	18	-3.0741	4.72108844294301e-10	13411855	13422642	2.45447365766973e-05	13445263	13467820
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13454651	13553112	57	57	-4.2332	2.45447365766973e-05	13445263	13467820	9.9950526208837e-05	13530614	13568153
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13555650	13716331	36	31	-3.3081	9.9950526208837e-05	13530614	13568153	3.10627650039131e-07	13699223	13749720
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	13823928	26	25	-4.5278	3.10627650039131e-07	13699223	13749720	1.74755345635423e-09	13812697	13828384
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	7	-2.4775	1.74755345635423e-09	13812697	13828384	3.44999489699152e-08	13863616	13869106
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	115	-4.359	3.44999489699152e-08	13863616	13869106	2.36028430802211e-05	14115460	14122129
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14203911	5	5	-2.5787	2.36028430802211e-05	14115460	14122129	3.24729229780473e-06	14203911	14225706
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14210847	14343139	27	26	-4.4415	3.24729229780473e-06	14203911	14225706	4.57713364650527e-06	14338189	14368151
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14644293	131	125	-3.2406	4.57713364650527e-06	14338189	14368151	0.110713357298167	14390028	14694578
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14701706	14	14	-3.6459	0.110713357298167	14390028	14694578	3.49631894166772e-11	14698076	14702545
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14702545	14731122	16	16	-5.1045	3.49631894166772e-11	14698076	14702545	0.00438977768442114	14722593	14849277
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14734647	14883615	26	23	-4.2253	0.00438977768442114	14722593	14849277	8.0043294794037e-05	14868114	14894476
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14903285	3	3	-1.6779	8.0043294794037e-05	14868114	14894476	0.0289309506401017	14899294	15005207
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14909937	15291532	130	125	-3.5299	0.0289309506401017	14899294	15005207	0.0210667004278432	15273305	15291532
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15293299	15299931	5	4	-1.8976	0.0210667004278432	15273305	15291532	1.58389049991137e-05	15299931	15306225
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15433122	87	82	-4.1392	1.58389049991137e-05	15299931	15306225	2.85851799360325e-05	15429742	15433122
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15434486	1	0	NA	2.85851799360325e-05	15429742	15433122	NA	NA	NA
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15443458	15446156	4	4	-1.9457	NA	NA	NA	1.64695015421797e-08	15446156	15447091
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15447091	15469100	16	16	-4.3541	1.64695015421797e-08	15446156	15447091	0.0240439211158396	15464185	15557173
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15470132	15687088	68	62	-3.4461	0.0240439211158396	15464185	15557173	0.000709568778202077	15564959	15699459
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15848986	28	27	-4.3025	0.000709568778202077	15564959	15699459	2.66879555832858e-07	15829553	15862122
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15854496	15915466	9	9	-5.4095	2.66879555832858e-07	15829553	15862122	3.24230043938067e-06	15915466	15937162
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16228031	134	129	-3.5087	3.24230043938067e-06	15915466	15937162	0.0101862027694453	16035717	16354465
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16229149	16387273	28	28	-4.0218	0.0101862027694453	16035717	16354465	0.0187067948931621	16256821	16471053
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	37	-4.777	0.0187067948931621	16256821	16471053	2.43912833890166e-05	16586283	16713164
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	22930737	1002	952	-3.9676	2.43912833890166e-05	16586283	16713164	5.07774370834566e-84	22926726	22930737
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-0.5529	5.07774370834566e-84	22926726	22930737	2.55128034912509e-06	26941769	27009433
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27176933	42	39	-1.9858	2.55128034912509e-06	26941769	27009433	0.0399582524289208	26998633	27176933
MSK_252152914796_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.7218	0.0399582524289208	26998633	27176933	NA	NA	NA
