Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5506	0.0026	NA	NA	NA	5.03784059081364e-31	16836160	16888048
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17094475	11	11	-0.8143	5.03784059081364e-31	16836160	16888048	5.20199526364971e-32	17086698	17102601
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	43131392	10391	9872	-5e-04	5.20199526364971e-32	17086698	17102601	5.34667168414598e-15	43131392	43131392
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43132077	43139091	2	2	-1.3211	5.34667168414598e-15	43131392	43131392	1.61834455303122e-15	43139091	43139091
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43142878	72543019	11706	11120	-0.0017	1.61834455303122e-15	43139091	43139091	1.39587074443775e-11	72541443	72545984
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72545984	72567555	6	6	0.6617	1.39587074443775e-11	72541443	72545984	5.58977917457675e-12	72559751	72568009
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72568009	147203277	16266	15509	0.0031	5.58977917457675e-12	72559751	72568009	7.60845898342912e-21	146286735	147313991
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	148081741	39	36	-0.347	7.60845898342912e-21	146286735	147313991	7.53440303444475e-20	147490608	148088434
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	151938534	1717	1613	-0.0013	7.53440303444475e-20	147490608	148088434	1.37852322855442e-11	151931017	151942632
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151939880	151966172	12	12	0.4561	1.37852322855442e-11	151931017	151942632	2.06598165316634e-10	151956812	151972622
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151968128	155801716	1753	1674	0.0117	2.06598165316634e-10	151956812	151972622	3.49543132512865e-09	155799659	155803618
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	155803618	155807283	3	3	0.8496	3.49543132512865e-09	155799659	155803618	1.31388701964635e-09	155805372	155807283
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	155811484	157133150	542	519	0.0084	1.31388701964635e-09	155805372	155807283	2.26987496174803e-124	157133150	157133150
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.5607	2.26987496174803e-124	157133150	157133150	1.11390795852978e-123	157136342	157136342
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10775	-0.0054	1.11390795852978e-123	157136342	157136342	4.65973970729339e-09	185979586	185979586
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	0.9933	4.65973970729339e-09	185979586	185979586	2.62214684856888e-08	185988138	186000612
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200613454	4141	3965	0.01	2.62214684856888e-08	185988138	186000612	1.60345711795004e-10	200598243	200618814
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200673525	23	21	-0.3296	1.60345711795004e-10	200598243	200618814	9.29454323993592e-10	200670407	200698665
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	227875096	9935	9457	-0.0037	9.29454323993592e-10	200670407	200698665	4.06226535534165e-111	227875096	227875096
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-2.8178	4.06226535534165e-111	227875096	227875096	7.16241830714495e-114	227882805	227882805
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246429285	7253	6934	-0.0035	7.16241830714495e-114	227882805	227882805	4.47674432776633e-12	246383544	246462479
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246430621	246633505	77	72	0.189	4.47674432776633e-12	246383544	246462479	0.00111284675724006	246604268	246695523
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246636010	246751473	21	21	-0.0258	0.00111284675724006	246604268	246695523	6.22620086131975e-05	246691241	246794552
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246862029	31	28	0.2763	6.22620086131975e-05	246691241	246794552	9.73711930205372e-08	246852126	246906110
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	96	-0.008	9.73711930205372e-08	246852126	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10354	-0.0083	NA	NA	NA	3.69804750543682e-16	33076512	33076512
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-1.3348	3.69804750543682e-16	33076512	33076512	4.57828424929293e-20	33080437	33080437
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	615	0.0047	4.57828424929293e-20	33080437	33080437	6.90175148143742e-38	34542224	34552935
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6079	6.90175148143742e-38	34542224	34552935	4.61121845177710e-37	34582272	34591681
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	464	0.0183	4.6112184517771e-37	34582272	34591681	2.9698422393553e-18	35821494	35821494
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.3208	2.9698422393553e-18	35821494	35821494	1.11351563192297e-17	35844884	35844884
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	838	-0.0166	1.11351563192297e-17	35844884	35844884	7.01533916755296e-11	37773896	37813211
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37858379	28	27	-0.3082	7.01533916755296e-11	37773896	37813211	2.76561802819795e-12	37847519	37872988
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	50776309	5199	4957	0.0024	2.76561802819795e-12	37847519	37872988	3.2267154946131e-119	50776309	50776309
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50779341	50837534	29	29	-0.9092	3.2267154946131e-119	50776309	50776309	1.11276486908847e-113	50837534	50837534
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50838833	50838833	1	0	NA	1.11276486908847e-113	50837534	50837534	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50840866	52600588	571	540	0.0058	NA	NA	NA	2.24117298339417e-09	52588009	52600588
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	2.24117298339417e-09	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7158	NA	NA	NA	3.42617936697346e-09	52635695	52639605
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25102	-0.0011	3.42617936697346e-09	52635695	52639605	0	146571330	146571330
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.9577	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242501239	32682	31139	0.0016	0	146592775	146592775	2.19399328748879e-11	242478404	242532246
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242506262	2	0	NA	2.19399328748879e-11	242478404	242532246	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242656260	56	53	0.2197	NA	NA	NA	0.0502124904677947	242564224	242666498
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242665255	242689978	9	9	-0.0102	0.0502124904677947	242564224	242666498	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10325	-0.0083	NA	NA	NA	2.21075383705080e-27	32074432	32074432
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.667	2.2107538370508e-27	32074432	32074432	7.78364431131654e-27	32080848	32080848
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5166	-0.0075	7.78364431131654e-27	32080848	32080848	4.22813137839214e-10	47460892	47460892
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0387	4.22813137839214e-10	47460892	47460892	2.58947078935118e-09	47466921	47466921
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	65160634	7290	6894	-0.0017	2.58947078935118e-09	47466921	47466921	2.60876504999881e-09	65160634	65160634
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-1.0419	2.60876504999881e-09	65160634	65160634	9.82755311761042e-10	65184180	65195223
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	162252328	29651	28245	1e-04	9.82755311761042e-10	65184180	65195223	3.25130438083812e-09	162249947	162252328
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162255354	162256903	2	2	-1.0165	3.25130438083812e-09	162249947	162252328	1.26160330969280e-08	162256903	162261860
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162259312	162259312	1	0	NA	1.2616033096928e-08	162256903	162261860	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162261860	163992903	322	305	0.0142	NA	NA	NA	1.25092949671456e-11	163971038	164005577
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164093750	24	23	-0.3485	1.25092949671456e-11	163971038	164005577	2.55561381345508e-13	164081541	164112873
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164100804	194354505	10134	9662	0.0036	2.55561381345508e-13	164081541	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-4.5819	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	956	-0.0257	0	194366950	194366950	3.3728283520875e-19	196810503	196905767
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	18	-0.4917	3.3728283520875e-19	196810503	196905767	1.59031728116795e-18	196928503	196942158
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	908	0.005	1.59031728116795e-18	196928503	196942158	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3227	-0.0087	NA	NA	NA	1.13582729241321e-263	9815760	9815760
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	-4.3793	1.13582729241321e-263	9815760	9815760	1.49742577729861e-281	9842644	9842644
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	69069651	15037	14335	0.001	1.49742577729861e-281	9842644	9842644	4.10419059508264e-22	68905670	69075140
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69075140	69165814	13	12	-0.6233	4.10419059508264e-22	68905670	69075140	5.8581190931107e-17	69163312	69656183
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	110	-0.0076	5.8581190931107e-17	69163312	69656183	7.59515466810571e-09	70108511	70150576
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.7636	7.59515466810571e-09	70108511	70150576	8.49677051432808e-11	70216707	70336467
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	70294312	1	0	NA	8.49677051432808e-11	70216707	70336467	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	161260146	27702	26426	0.0054	NA	NA	NA	1.56702574546201e-17	161260146	161260146
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	161268543	161288702	3	3	-1.1077	1.56702574546201e-17	161260146	161260146	1.37635242113278e-17	161288702	161288702
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	161302611	173224400	3366	3201	0.0089	1.37635242113278e-17	161288702	161288702	2.12205693205488e-09	173224400	173224400
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.021	2.12205693205488e-09	173224400	173224400	3.65205341767463e-10	173228860	173228860
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5256	0.0048	3.65205341767463e-10	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	215	-0.0211	NA	NA	NA	2.02203136037643e-14	730853	737829
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.7894	2.02203136037643e-14	730853	737829	1.94162088622725e-64	829954	829954
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-1.0232	1.94162088622725e-64	829954	829954	8.62390039922862e-10	873365	905462
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3582	-0.0127	8.62390039922862e-10	873365	905462	6.80536949355466e-09	12857302	12857302
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	0.9533	6.80536949355466e-09	12857302	12857302	6.83326562921542e-09	12873052	12873052
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	17760575	1547	1469	-0.0066	6.83326562921542e-09	12873052	12873052	3.19756167872062e-10	17757185	17760575
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17766484	17766484	1	0	NA	3.19756167872062e-10	17757185	17760575	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17770294	17780802	3	3	-0.8437	NA	NA	NA	1.53270300455956e-13	17780802	17780802
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17784431	19027816	205	198	0.0077	1.53270300455956e-13	17780802	17780802	5.4130023172315e-13	19027816	19027816
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	19032752	19050101	5	5	0.6586	5.4130023172315e-13	19027816	19027816	1.39647566207958e-09	19050101	19057977
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	19057977	180342860	47908	45645	2e-04	1.39647566207958e-09	19050101	19057977	2.40078310575686e-15	180194323	180344964
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6451	2.40078310575686e-15	180194323	180344964	1.12288363404247e-16	180357210	180362342
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	104	-0.0085	1.12288363404247e-16	180357210	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	32548736	11675	11125	-9e-04	NA	NA	NA	5.84212827964992e-99	32548736	32558677
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	9	1.4781	5.84212827964992e-99	32548736	32558677	2.48229430364949e-07	32595402	32626619
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32762061	57	54	0.4205	2.48229430364949e-07	32595402	32626619	6.29146498374022e-33	32723366	32767722
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	36515424	1631	1555	0.0082	6.29146498374022e-33	32723366	32767722	3.70082637180369e-07	36514036	36515424
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36518498	36521308	3	3	0.7761	3.70082637180369e-07	36514036	36515424	4.07742240089921e-08	36521308	36522639
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36522639	65767409	9013	8594	-0.0037	4.07742240089921e-08	36521308	36522639	5.57009673956935e-09	65765501	65767409
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.0041	5.57009673956935e-09	65765501	65767409	1.41760249987754e-10	65771532	65771532
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	74647491	2888	2751	0.0154	1.41760249987754e-10	65771532	65771532	6.12764561822985e-94	74647491	74647491
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-2.4587	6.12764561822985e-94	74647491	74647491	1.38639679687450e-78	74655219	74655219
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79018959	1141	1094	0.02	1.3863967968745e-78	74655219	74655219	0	79018959	79018959
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-4.0602	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	5982	0.0033	0	79091850	79091850	4.02902083096929e-10	102039635	102039635
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102041299	1	0	NA	4.02902083096929e-10	102039635	102039635	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102042870	102044331	2	2	-1.0495	NA	NA	NA	2.1671953391866e-10	102044331	102044331
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	151546355	16772	15997	0.0039	2.1671953391866e-10	102044331	102044331	7.08270703497587e-13	151546355	151546355
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151552684	3	3	-0.9466	7.08270703497587e-13	151546355	151546355	4.63901705430273e-12	151552684	151554478
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	170753106	6630	6328	-0.0125	4.63901705430273e-12	151552684	151554478	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5143	0.0025	NA	NA	NA	3.54958666097024e-128	16135701	16135701
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.7223	3.54958666097024e-128	16135701	16135701	1.07123334533937e-134	16140018	16140018
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	89356158	21632	20632	-0.0018	1.07123334533937e-134	16140018	16140018	1.77033934806476e-08	89348003	89356158
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89363277	89370542	2	2	-0.9806	1.77033934806476e-08	89348003	89356158	8.4790243853269e-09	89370542	89374465
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89374465	103863630	5519	5276	0.0068	8.4790243853269e-09	89370542	89374465	3.33465561721358e-09	103862413	103863630
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-1.0013	3.33465561721358e-09	103862413	103863630	3.28473283732494e-09	103868375	103868375
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	109217320	2416	2289	0.0117	3.28473283732494e-09	103868375	103868375	7.61416427979588e-09	109214735	109230336
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109244233	6	6	0.5861	7.61416427979588e-09	109214735	109230336	7.47312989783396e-09	109240210	109245944
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	125831554	7471	7103	0.0037	7.47312989783396e-09	109240210	109245944	1.08526161642200e-100	125831554	125831554
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-2.6828	1.085261616422e-100	125831554	125831554	3.70792246616618e-102	125837524	125837524
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7003	0.001	3.70792246616618e-102	125837524	125837524	1.12353290938113e-38	141410894	141413352
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141431668	9	9	0.9601	1.12353290938113e-38	141410894	141413352	7.43423929591983e-30	141429405	141431668
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141432778	141690753	121	116	0.0035	7.43423929591983e-30	141429405	141431668	6.8467495213668e-19	141689547	141690753
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.7989	6.8467495213668e-19	141689547	141690753	1.96344050988760e-22	141711513	141712786
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	158821263	6754	6420	-0.0089	1.9634405098876e-22	141711513	141712786	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.0059	NA	NA	NA	6.67687498286299e-11	581533	581533
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.195	6.67687498286299e-11	581533	581533	1.08100472482045e-12	588865	588865
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2166	-0.0168	1.08100472482045e-12	588865	588865	3.14834350047266e-32	7226901	7260442
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.9425	3.14834350047266e-32	7226901	7260442	7.71533125307955e-32	7790934	8137794
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	13965650	2038	1948	-0.007	7.71533125307955e-32	7790934	8137794	1.60543317724140e-09	13961196	13965650
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	13968620	13977505	3	3	-0.8563	1.6054331772414e-09	13961196	13965650	1.02690546138062e-09	13977505	13979482
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	13979482	32797545	6751	6429	-0.0033	1.02690546138062e-09	13977505	13979482	3.24766420382036e-13	32792898	32797545
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-0.9898	3.24766420382036e-13	32792898	32797545	8.10422038963908e-15	32808049	32808049
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1795	0.008	8.10422038963908e-15	32808049	32808049	4.68133012406719e-176	39345557	39352361
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.791	4.68133012406719e-176	39345557	39352361	2.34633961244015e-174	39504332	39505256
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	423	0.0075	2.34633961244015e-174	39504332	39505256	2.11431784429843e-14	40892587	40892587
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.131	2.11431784429843e-14	40892587	40892587	1.51013840129091e-11	40897469	40897469
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29523	-5e-04	1.51013840129091e-11	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2365	0.0032	NA	NA	NA	4.11156785933796e-09	6679968	6695783
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6710750	7	6	-0.561	4.11156785933796e-09	6679968	6695783	7.24222230006228e-09	6701392	6715356
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6713860	23338535	5521	5253	0.0026	7.24222230006228e-09	6701392	6715356	0.0551940888155664	23257733	23338535
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23353267	2	2	0.5088	0.0551940888155664	23257733	23338535	0	23353267	23353267
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23357805	23365926	2	2	0.99	0	23353267	23353267	1.13661090671016e-09	23365926	23365926
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	32069155	2164	2051	-0.0048	1.13661090671016e-09	23365926	23365926	5.10266692129698e-08	32066380	32069155
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32071499	32078846	3	3	0.7383	5.10266692129698e-08	32066380	32069155	7.25817151159806e-07	32078846	32080737
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32080737	70926188	2902	2775	0.0083	7.25817151159806e-07	32078846	32080737	6.30901339547117e-25	70926188	70926188
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.6679	6.30901339547117e-25	70926188	70926188	2.08480230195971e-27	70930528	70930528
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	2.08480230195971e-27	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	85753966	4933	4696	0.0015	NA	NA	NA	5.28392050753141e-12	85753966	85753966
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85755185	85756377	2	2	1.1196	5.28392050753141e-12	85753966	85753966	3.20542069714178e-11	85756377	85756377
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85756629	134540844	17783	16917	-0.0087	3.20542069714178e-11	85756377	85756377	4.88798396792667e-10	134540844	134540844
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134542664	134542664	1	0	NA	4.88798396792667e-10	134540844	134540844	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134544331	134545846	2	2	1.0631	NA	NA	NA	6.09946918270346e-09	134545846	134545846
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134548747	137352394	1043	998	-0.0046	6.09946918270346e-09	134545846	134545846	2.20732437273247e-53	137352394	137352394
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.5544	2.20732437273247e-53	137352394	137352394	6.48763749561896e-50	137356880	137356880
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1047	-0.0029	6.48763749561896e-50	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9303	-0.0062	NA	NA	NA	8.28011501978542e-192	27038538	27038538
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.4607	8.28011501978542e-192	27038538	27038538	4.35374101836975e-187	27041812	27041812
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	135285645	35077	33371	-0.0056	4.35374101836975e-187	27041812	27041812	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16092	-0.0027	NA	NA	NA	5.95468506557199e-29	55097806	55123719
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.4069	5.95468506557199e-29	55097806	55123719	3.40180245658043e-30	55207305	55221692
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	26994	-0.0037	3.40180245658043e-30	55207305	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3566	-0.0028	NA	NA	NA	1.28615947283619e-118	9523923	9531133
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	1.3324	1.28615947283619e-118	9523923	9531133	4.54987467064402e-124	9604633	9610054
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	31173065	7400	7039	0.0046	4.54987467064402e-124	9604633	9610054	1.29535635110894e-19	31169263	31180019
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31177645	31177645	1	0	NA	1.29535635110894e-19	31169263	31180019	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31180019	31237505	13	13	0.5752	NA	NA	NA	2.44263194145569e-19	31233136	31242528
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	33178741	749	709	0.0177	2.44263194145569e-19	31233136	31242528	2.74658222263515e-175	33178741	33178741
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	2.74658222263515e-175	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-4.2022	NA	NA	NA	1.46681751029423e-169	33198331	33198331
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	80662066	15417	14687	0.0097	1.46681751029423e-169	33198331	33198331	1.53528090785648e-20	80662066	80662066
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.4831	1.53528090785648e-20	80662066	80662066	5.63703227877041e-20	80666751	80666751
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130694393	17172	16391	-0.0024	5.63703227877041e-20	80666751	80666751	1.79559983142882e-08	130690343	130694393
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.8794	1.79559983142882e-08	130690343	130694393	2.19663278837618e-06	130701040	130718440
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	613	-0.0027	2.19663278837618e-06	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7004	-0.0023	NA	NA	NA	1.69860016442032e-11	37953582	37953582
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-1.1239	1.69860016442032e-11	37953582	37953582	4.55329513417965e-12	37957844	37957844
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	37959274	1	0	NA	4.55329513417965e-12	37957844	37957844	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37960876	51296396	5467	5207	0.0015	NA	NA	NA	1.38108364427368e-07	51294959	51296396
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-0.7353	1.38108364427368e-07	51294959	51296396	1.20666750533122e-07	51300398	51301682
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	89659397	9482	9053	0.0108	1.20666750533122e-07	51300398	51301682	2.58915155418004e-65	89659397	89659397
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.5568	2.58915155418004e-65	89659397	89659397	5.26719120214019e-63	89662326	89662326
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4572	-0.0032	5.26719120214019e-63	89662326	89662326	1.59562316971140e-61	100690991	100690991
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.5778	1.5956231697114e-61	100690991	100690991	2.92268728616016e-59	100693892	100693892
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4361	-0.0119	2.92268728616016e-59	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7273	0.0169	NA	NA	NA	4.45507991190488e-275	40676611	40676611
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	-2.6913	4.45507991190488e-275	40676611	40676611	3.6787961266968e-283	40726930	40726930
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	66113041	8521	8096	0.0058	3.6787961266968e-283	40726930	40726930	7.09578582950175e-73	66105776	66117716
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	66114231	66188909	27	26	-0.756	7.09578582950175e-73	66105776	66117716	2.52461777365220e-67	66183820	66189112
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	66189112	72595934	2980	2834	-0.0094	2.5246177736522e-67	66183820	66189112	5.0270678790951e-09	72594326	72595934
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72597009	72600731	3	3	-0.8275	5.0270678790951e-09	72594326	72595934	4.41793063071500e-09	72600731	72602517
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72602517	85351640	4792	4564	-0.0032	4.417930630715e-09	72600731	72602517	7.42715278981312e-17	85347927	85351640
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85356918	85381909	7	7	-0.7283	7.42715278981312e-17	85347927	85351640	1.39965324049553e-15	85381909	85390548
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85390548	105607572	7659	7308	-0.0136	1.39965324049553e-15	85381909	85390548	4.81628096204149e-10	105595302	105607572
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	9	0.4982	4.81628096204149e-10	105595302	105607572	4.20123878202641e-17	105632168	105673157
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	-0.041	4.20123878202641e-17	105632168	105673157	0.000442361557152392	105776293	105795807
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105805371	11	11	-0.3518	0.000442361557152392	105776293	105795807	6.29576018876645e-05	105799261	105823416
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105812803	105945006	38	37	0.0375	6.29576018876645e-05	105799261	105823416	2.52316190542865e-18	105923686	105946993
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	16	-0.6231	2.52316190542865e-18	105923686	105946993	3.20983373511279e-23	105998412	106015449
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	136	0.0168	3.20983373511279e-23	105998412	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0949	NA	NA	NA	2.53335827180216e-11	18452491	18692865
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19465359	93	90	-0.8019	2.53335827180216e-11	18452491	18692865	1.33390203679355e-09	19397326	19833542
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	56	-1.1149	1.33390203679355e-09	19397326	19833542	1.60272748822337e-304	20088256	20088256
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32514939	3672	3503	-0.0118	1.60272748822337e-304	20088256	20088256	7.7373141427628e-42	32454294	32517839
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	24	-0.6353	7.7373141427628e-42	32454294	32517839	2.16259467196283e-44	32583146	32664506
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	2.16259467196283e-44	32583146	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	75115806	18032	17197	2e-04	NA	NA	NA	4.52484850659704e-38	75115806	75115806
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.0401	4.52484850659704e-38	75115806	75115806	2.46326405080448e-38	75119713	75119713
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	95609756	7443	7075	-0.0103	2.46326405080448e-38	75119713	75119713	2.28660615334704e-14	95606006	95616750
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.7386	2.28660615334704e-14	95606006	95616750	1.24932134961349e-13	95629886	95656272
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1887	-0.0143	1.24932134961349e-13	95629886	95656272	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5221	-0.009	NA	NA	NA	2.30236021314360e-32	14687636	14876356
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.7462	2.3023602131436e-32	14687636	14876356	5.38267907114511e-36	15029941	15034210
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	31862577	5090	4877	0.0075	5.38267907114511e-36	15029941	15034210	9.31964547536584e-56	31845232	32379126
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33647856	47	44	-0.5216	9.31964547536584e-56	31845232	32379126	9.03215977646874e-53	33559207	33842125
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	33830585	1	0	NA	9.03215977646874e-53	33559207	33842125	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	54348362	3075	2936	-0.0131	NA	NA	NA	9.17595677782894e-14	54340649	54363713
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.5398	9.17595677782894e-14	54340649	54363713	5.67834175085166e-13	54365385	54399890
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	57203733	1203	1151	-0.0151	5.67834175085166e-13	54365385	54399890	2.01888220091019e-10	57203733	57203733
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.0754	2.01888220091019e-10	57203733	57203733	2.47845197214835e-10	57206772	57206772
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5354	0.0069	2.47845197214835e-10	57206772	57206772	1.49967234687808e-57	75093957	75093957
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.0031	1.49967234687808e-57	75093957	75093957	2.74716406532522e-59	75100865	75100865
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	585	-0.01	2.74716406532522e-59	75100865	75100865	3.08701578250683e-31	76922411	76923844
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	3.08701578250683e-31	76922411	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8805	NA	NA	NA	3.95961056778361e-27	76940218	76940218
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4307	-0.0172	3.95961056778361e-27	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	400	0.0112	NA	NA	NA	2.32859676941905e-18	1028979	1028979
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4162	2.32859676941905e-18	1028979	1028979	2.18379457946069e-17	1030766	1030766
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31461588	11619	11067	0.0038	2.18379457946069e-17	1030766	1030766	7.30686302975727e-12	31443186	31468896
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	17	-0.4006	7.30686302975727e-12	31443186	31468896	8.67798282403812e-13	31490899	31891535
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1728	0.0099	8.67798282403812e-13	31490899	31891535	1.63518290958011e-17	36672710	36673853
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.8094	1.63518290958011e-17	36672710	36673853	1.08041858824578e-16	36684619	36686013
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1939	0.0072	1.08041858824578e-16	36684619	36686013	7.32871703122569e-32	41558893	41573295
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41708551	45	44	0.4195	7.32871703122569e-32	41558893	41573295	4.12794040144425e-33	41697532	42147225
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	4.12794040144425e-33	41697532	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13001	0.0057	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21953	-0.005	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	464	0.0272	NA	NA	NA	7.11157709087528e-10	1398325	1398325
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1956	7.11157709087528e-10	1398325	1398325	2.73872497114704e-11	1400840	1400840
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	56823430	19379	18417	0.0073	2.73872497114704e-11	1400840	1400840	6.031159643731e-12	56819531	56825794
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.6027	6.031159643731e-12	56819531	56825794	3.73743894223287e-11	56837593	56844304
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1132	-0.0126	3.73743894223287e-11	56837593	56844304	6.57086799210788e-17	59414645	59414898
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.6593	6.57086799210788e-17	59414645	59414898	1.06627658996629e-15	59434159	59440262
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	21	-0.0978	1.06627658996629e-15	59434159	59440262	7.31797360993625e-13	59491509	59491509
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.9982	7.31797360993625e-13	59491509	59491509	1.36745395166481e-07	59497049	59500575
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1874	-0.0061	1.36745395166481e-07	59497049	59500575	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	549	-0.0181	NA	NA	NA	6.95773724909052e-10	1499034	1499421
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1506379	1	0	NA	6.95773724909052e-10	1499034	1499421	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.8765	NA	NA	NA	0.0426098774029959	1516966	1525300
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.2059	0.0426098774029959	1516966	1525300	2.42533557916797e-136	1528899	1531162
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	52078884	17245	16478	-0.0094	2.42533557916797e-136	1528899	1531162	6.8396653639429e-278	52078884	52078884
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52080395	52080395	1	0	NA	6.8396653639429e-278	52078884	52078884	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-3.4369	NA	NA	NA	1.50055639712270e-248	52090393	52090393
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3561	-0.0194	1.5005563971227e-248	52090393	52090393	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12810	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22686731	2987	2851	-0.0025	NA	NA	NA	4.81192605424275e-14	22682428	22701123
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696038	22720195	15	14	0.4854	4.81192605424275e-14	22682428	22701123	5.65081308136638e-15	22713972	22725305
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6214	-0.0095	5.65081308136638e-15	22713972	22725305	5.33906144159264e-58	35472378	35472378
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.5427	5.33906144159264e-58	35472378	35472378	3.64267191422757e-56	35476942	35476942
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1132	0.0074	3.64267191422757e-56	35476942	35476942	4.8708018417493e-14	37621766	37621766
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-1.2958	4.8708018417493e-14	37621766	37621766	5.32972151695506e-06	37626069	37633961
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	21	0.0191	5.32972151695506e-06	37626069	37633961	6.74559860619181e-17	37681158	37685496
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37721849	18	15	-0.7093	6.74559860619181e-17	37681158	37685496	3.52857840882279e-31	37715385	37723010
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37723010	49571068	5774	5493	-0.0042	3.52857840882279e-31	37715385	37723010	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	754	-0.0296	NA	NA	NA	1.65253950456457e-10	1425580	1431240
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.8475	1.65253950456457e-10	1425580	1431240	2.35832321620023e-11	1432891	1434970
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	952	-0.0363	2.35832321620023e-11	1432891	1434970	0	2708291	2711273
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	42977	0.9088	0	2708291	2711273	0	154578922	154582414
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	187	0.0066	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	123	-3.1935	NA	NA	NA	2.63806422814091e-09	3773948	4413507
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	4272867	1	0	NA	2.63806422814091e-09	3773948	4413507	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4413507	5593746	10	9	-0.9308	NA	NA	NA	2.20629581363959e-08	5531459	6688691
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6871143	69	65	-3.1233	2.20629581363959e-08	5531459	6688691	0.00189472034891586	6829322	6959256
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6872263	7485594	232	223	-2.4417	0.00189472034891586	6829322	6959256	1	7204505	7649771
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7653082	33	32	-2.7479	1	7204505	7649771	0.000283010075612443	7619927	7660965
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-3.8792	0.000283010075612443	7619927	7660965	0.152377820416557	7685425	7719658
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7723783	9	9	-3.0156	0.152377820416557	7685425	7719658	0.0185968293827427	7713973	7733351
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.8059	0.0185968293827427	7713973	7733351	8.33462257828174e-05	7756907	7821580
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10515697	430	404	-2.9873	8.33462257828174e-05	7756907	7821580	7.9418113392374e-14	10511255	10596655
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	18	-1.0656	7.9418113392374e-14	10511255	10596655	4.66520812186821e-07	11249952	12452734
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-3.8217	4.66520812186821e-07	11249952	12452734	1.06393584572050e-09	12536761	12542979
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	54	-1.6969	1.0639358457205e-09	12536761	12542979	1.42961070249632e-11	12661168	12700767
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	18	-3.5798	1.42961070249632e-11	12661168	12700767	3.17412089775937e-11	12786515	12833424
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	13128515	116	111	-1.8563	3.17412089775937e-11	12786515	12833424	3.08990824789531e-06	13089124	13153920
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	44	-2.7825	3.08990824789531e-06	13089124	13153920	3.08349289717623e-05	13238502	13279098
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13329968	22	21	-4.0263	3.08349289717623e-05	13238502	13279098	5.01584821187044e-09	13327446	13329968
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13330707	13330707	1	0	NA	5.01584821187044e-09	13327446	13329968	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13331749	13344526	6	6	-1.8867	NA	NA	NA	0.00221848655099123	13344526	13360252
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13347152	13525650	91	87	-3.1014	0.00221848655099123	13344526	13360252	7.57701735135632e-05	13508638	13527753
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13526852	13537520	9	8	-4.3864	7.57701735135632e-05	13508638	13527753	1.24439195832960e-05	13533021	13541808
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13539170	13823928	72	64	-2.996	1.2443919583296e-05	13533021	13541808	0.00137344822835267	13775083	13836933
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.8906	0.00137344822835267	13775083	13836933	2.93530789039385e-07	13863616	13870089
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14342834	154	145	-3.4976	2.93530789039385e-07	13863616	13870089	1.05230306149171e-16	14330251	14376942
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14697315	143	135	-2.4823	1.05230306149171e-16	14330251	14376942	6.69532321450802e-06	14566592	14705129
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14883615	45	43	-3.4261	6.69532321450802e-06	14566592	14705129	5.91907176453832e-05	14841337	15078313
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15274383	119	115	-2.5683	5.91907176453832e-05	14841337	15078313	0.0181532915821532	15014767	15304956
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15275313	15311814	27	26	-2.9703	0.0181532915821532	15014767	15304956	0.000569994101639346	15296498	15317370
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15312994	15340715	19	18	-3.9899	0.000569994101639346	15296498	15317370	0.000891377396942492	15329893	15362520
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15342258	15433122	60	57	-3.121	0.000891377396942492	15329893	15362520	2.21705335156203e-08	15431247	15433122
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.0637	2.21705335156203e-08	15431247	15433122	4.14950706009952e-10	15447091	15450495
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-3.2126	4.14950706009952e-10	15447091	15450495	3.66628885504897e-07	15518749	15528826
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	12	-1.6724	3.66628885504897e-07	15518749	15528826	0.000223719559155977	15541293	15557173
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15915466	76	73	-3.197	0.000223719559155977	15541293	15557173	0.000225406628361816	15761232	16002819
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16228031	134	129	-2.4564	0.000225406628361816	15761232	16002819	0.0504165471305488	16091622	16318293
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16229149	16387273	28	28	-3.1037	0.0504165471305488	16091622	16318293	0.000541493388402734	16300643	16445577
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16659030	39	39	-4.0316	0.000541493388402734	16300643	16445577	2.81715851299947e-05	16622508	16716541
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16660742	21036503	632	607	-3.1464	2.81715851299947e-05	16622508	16716541	3.07157253801679e-05	21026715	21036503
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.9319	3.07157253801679e-05	21026715	21036503	4.28573354934254e-05	21048365	21060047
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	251	-3.0634	4.28573354934254e-05	21048365	21060047	3.67434537777066e-05	22049641	22139807
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.3153	3.67434537777066e-05	22049641	22139807	7.09292454110525e-07	22176501	22178964
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-2.7238	7.09292454110525e-07	22176501	22178964	8.39221141934618e-06	22182080	22202315
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22261337	22	22	-4.1224	8.39221141934618e-06	22182080	22202315	2.31736592415948e-05	22249988	22395796
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22263267	22930737	66	60	-3.0972	2.31736592415948e-05	22249988	22395796	1.96995310238637e-25	22924754	26873861
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	23283689	1	0	NA	1.96995310238637e-25	22924754	26873861	NA	NA	NA
MSK_252152914797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	25737663	57440809	85	82	-1.2161	NA	NA	NA	NA	NA	NA
