Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	63084274	24156	23574	0.009	NA	NA	NA	2.11607435036700e-12	63074345	63087685
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63085866	63123852	19	19	0.4988	2.116074350367e-12	63074345	63087685	1.28205682171377e-14	63118842	63132209
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63125693	72536231	3718	3626	-0.0073	1.28205682171377e-14	63118842	63132209	1.83010745089295e-12	72533804	72539143
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72579311	15	14	0.5387	1.83010745089295e-12	72533804	72539143	1.02204233599766e-11	72571158	72610316
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11390	-0.0015	1.02204233599766e-11	72571158	72610316	2.98142877879476e-23	109987341	109987341
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.983	2.98142877879476e-23	109987341	109987341	2.05541335141529e-20	109989998	109989998
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	111396840	565	551	-0.018	2.05541335141529e-20	109989998	109989998	4.14914339713798e-06	111390573	111396840
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111398104	111423823	3	2	-1.1154	4.14914339713798e-06	111390573	111396840	4.21708537693872e-07	111423823	111435786
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111435786	147313991	4008	3925	-0.0068	4.21708537693872e-07	111423823	111435786	1.46680340043942e-48	147311437	147315217
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147510532	32	31	0.7084	1.46680340043942e-48	147311437	147315217	5.92268820799721e-42	147497268	147847659
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1224	0.0163	5.92268820799721e-42	147497268	147847659	2.91389770141319e-17	150839754	150844444
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	4	-1.229	2.91389770141319e-17	150839754	150844444	1.11394447355765e-17	150844444	150851439
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151938534	451	442	-0.0152	1.11394447355765e-17	150844444	150851439	2.49188786228785e-08	151936219	151938534
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151939880	151946087	4	3	0.9227	2.49188786228785e-08	151936219	151938534	7.45323923815292e-07	151946087	151947357
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151947357	157133150	2306	2258	0.0127	7.45323923815292e-07	151946087	151947357	5.07738580143697e-15	157133150	157133150
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.6319	5.07738580143697e-15	157133150	157133150	2.56658023210331e-15	157136342	157136342
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	204482369	17090	16706	-0.0015	2.56658023210331e-15	157136342	157136342	3.45008219531742e-16	204478996	204483717
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204483717	204496105	7	7	-0.8981	3.45008219531742e-16	204478996	204483717	1.07556107004576e-16	204493645	204497846
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204497846	227872808	8328	8117	-0.0064	1.07556107004576e-16	204493645	204497846	3.32020012334566e-08	227871579	227872808
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227875096	227875096	1	0	NA	3.32020012334566e-08	227871579	227872808	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8499	NA	NA	NA	4.08191043950863e-08	227882805	227889619
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	247186514	7480	7314	8e-04	4.08191043950863e-08	227882805	227889619	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	11715	-0.0032	NA	NA	NA	1.39779948765601e-10	35821494	35821494
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.3474	1.39779948765601e-10	35821494	35821494	3.00675580142934e-10	35844884	35844884
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	203005216	51404	50194	-0.0034	3.00675580142934e-10	35844884	35844884	1.85803116238987e-14	203003512	203005216
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203008997	203019933	6	6	-0.9151	1.85803116238987e-14	203003512	203005216	1.53008036519851e-14	203019933	203021733
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203021733	242689978	14391	14037	0	1.53008036519851e-14	203019933	203021733	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10547	-0.0063	NA	NA	NA	1.2012662116633e-52	32074432	32074432
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.9059	1.2012662116633e-52	32074432	32074432	4.75092940653778e-51	32080848	32080848
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46769081	5127	5015	5e-04	4.75092940653778e-51	32080848	32080848	2.44748051947272e-19	46767765	46772869
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.904	2.44748051947272e-19	46767765	46772869	7.57787958796496e-19	46819069	46827727
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	164027724	37563	36617	-0.0036	7.57787958796496e-19	46819069	46827727	6.88441189529356e-16	164001657	164036648
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.5092	6.88441189529356e-16	164001657	164036648	1.43657303080198e-16	164105613	164126256
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9856	-0.0028	1.43657303080198e-16	164105613	164126256	0	194354505	194354505
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.7173	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	967	-0.0123	0	194366950	194366950	4.46814199714629e-07	196805434	196905767
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196920748	14	14	0.4	4.46814199714629e-07	196805434	196905767	1.77593019229960e-05	196917657	196942158
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196924077	199329592	970	945	0.0146	1.7759301922996e-05	196917657	196942158	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3303	0.0116	NA	NA	NA	9.04629235774644e-283	9815760	9815760
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.8043	9.04629235774644e-283	9815760	9815760	5.1491634396808e-286	9842644	9842644
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	173224400	46243	45116	-0.0046	5.1491634396808e-286	9842644	9842644	2.08108482631768e-21	173224400	173224400
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.8942	2.08108482631768e-21	173224400	173224400	8.29888195072124e-23	173228860	173228860
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5374	-0.0013	8.29888195072124e-23	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3880	-0.0044	NA	NA	NA	3.12108020740615e-126	12857302	12857302
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.4567	3.12108020740615e-126	12857302	12857302	7.4809421549028e-119	12873052	12873052
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21480789	2375	2323	-0.0089	7.4809421549028e-119	12873052	12873052	2.35743274456086e-12	21480789	21480789
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.475	2.35743274456086e-12	21480789	21480789	1.04023164476464e-12	21487474	21487474
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	120444524	27075	26426	-0.0045	1.04023164476464e-12	21487474	21487474	9.42504566613644e-18	120439868	120444524
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120454795	120495666	6	6	-0.9975	9.42504566613644e-18	120439868	120444524	3.33474792381935e-19	120495666	120501968
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120501968	127434789	1883	1832	-0.0082	3.33474792381935e-19	120495666	120501968	5.2978219450676e-33	127434789	127434789
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-2.2687	5.2978219450676e-33	127434789	127434789	2.0751888415225e-30	127438118	127438118
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	150156233	8528	8325	-0.0012	2.0751888415225e-30	127438118	127438118	4.31017225067856e-13	150151948	150185190
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150202601	13	12	-0.6173	4.31017225067856e-13	150151948	150185190	1.42024011241479e-13	150191322	150207307
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9654	9e-04	1.42024011241479e-13	150191322	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	26811016	9365	9120	-0.0057	NA	NA	NA	3.8851051970545e-08	26801068	26811016
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26849722	1	0	NA	3.8851051970545e-08	26801068	26811016	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26853170	26861184	3	3	-0.9729	NA	NA	NA	3.97303581317318e-09	26861184	26863540
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1187	0.0145	3.97303581317318e-09	26861184	26863540	2.43692832873234e-24	29939288	29980445
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30030032	19	18	-0.6485	2.43692832873234e-24	29939288	29980445	1.25686499330437e-22	30010234	30033946
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30031367	32558677	1071	1048	0.0278	1.25686499330437e-22	30010234	30033946	9.41608477279843e-198	32558677	32567462
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.2183	9.41608477279843e-198	32558677	32567462	1.02547969536194e-256	32628420	32633691
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	165643653	42615	41614	-0.0039	1.02547969536194e-256	32628420	32633691	1.32377256684155e-106	165643653	165643653
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	-3.3978	1.32377256684155e-106	165643653	165643653	6.04065272126588e-103	165650610	165650610
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1766	-0.0126	6.04065272126588e-103	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5253	0.007	NA	NA	NA	2.91185913093131e-21	16135701	16135701
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-1.8856	2.91185913093131e-21	16135701	16135701	1.63121588816618e-20	16140018	16140018
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	109216032	29570	28845	0.001	1.63121588816618e-20	16140018	16140018	5.05410144485567e-07	109211040	109216032
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.6176	5.05410144485567e-07	109211040	109216032	1.71548912296613e-07	109244233	109248626
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	125831554	7471	7295	-0.0067	1.71548912296613e-07	109244233	109248626	6.88602172449034e-15	125831554	125831554
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3103	6.88602172449034e-15	125831554	125831554	3.78189607401279e-15	125837524	125837524
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7182	0.004	3.78189607401279e-15	125837524	125837524	8.25716009067663e-13	141408013	141417702
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5839	8.25716009067663e-13	141408013	141417702	2.57798654283038e-12	141431668	141443577
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	144546976	1168	1148	0.0018	2.57798654283038e-12	141431668	141443577	2.15100379158997e-15	144546976	144546976
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144548093	144551256	2	2	-1.6625	2.15100379158997e-15	144546976	144546976	1.87344072825146e-15	144551256	144551256
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144554448	147702365	1469	1441	-9e-04	1.87344072825146e-15	144551256	144551256	3.0905326449093e-39	147702365	147702365
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.5968	3.0905326449093e-39	147702365	147702365	2.42567174641582e-38	147707161	147707161
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4127	-0.0056	2.42567174641582e-38	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	0.0077	NA	NA	NA	8.0865473684325e-14	581533	581533
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.5887	8.0865473684325e-14	581533	581533	2.05574237776883e-15	588865	588865
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6926661	2270	2213	0.0042	2.05574237776883e-15	588865	588865	4.92881403309379e-23	6909487	7156900
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	-0.8598	4.92881403309379e-23	6909487	7156900	1.02923956815512e-21	7790934	8137794
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5611	-0.0027	1.02923956815512e-21	7790934	8137794	5.97811685662936e-39	25120552	25120552
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	5.97811685662936e-39	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.5441	NA	NA	NA	9.27742684731711e-40	25125700	25125700
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32797545	3031	2968	-0.0073	9.27742684731711e-40	25125700	25125700	1.26347006653071e-11	32792898	32797545
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.1533	1.26347006653071e-11	32792898	32797545	1.38602075694740e-12	32808049	32808049
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	40888127	2377	2326	0.0081	1.3860207569474e-12	32808049	32808049	5.43206229437562e-150	40888127	40888127
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40892587	40892587	1	0	NA	5.43206229437562e-150	40888127	40888127	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.8032	NA	NA	NA	9.19121581157426e-141	40897469	40897469
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30256	-0.0019	9.19121581157426e-141	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	70926188	13071	12784	-0.0033	NA	NA	NA	4.59632799426106e-09	70926188	70926188
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.2625	4.59632799426106e-09	70926188	70926188	1.37682022830180e-08	70930528	70930528
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24306	-0.0059	1.3768202283018e-08	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23991	-0.0029	NA	NA	NA	5.65302788367832e-75	77917893	77917893
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.8692	5.65302788367832e-75	77917893	77917893	1.60395368096936e-73	77928738	77928738
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12080	-0.0011	1.60395368096936e-73	77928738	77928738	1.66424822351809e-50	114100979	114100979
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.9161	1.66424822351809e-50	114100979	114100979	1.43168433203604e-50	114106460	114106460
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7595	-0.0083	1.43168433203604e-50	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2083	-0.0059	NA	NA	NA	7.22647254635613e-16	5732077	5741031
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5765438	16	16	-0.619	7.22647254635613e-16	5732077	5741031	1.06058154289876e-17	5763749	5769776
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55114405	14751	14391	-0.0013	1.06058154289876e-17	5763749	5769776	1.05182960294264e-12	55088012	55134486
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55217189	41	40	-0.3355	1.05182960294264e-12	55088012	55134486	1.35949513301997e-13	55197848	55231935
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4517	0.0142	1.35949513301997e-13	55197848	55231935	7.1256044688491e-27	66463477	66463477
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.1514	7.1256044688491e-27	66463477	66463477	6.09641413812121e-28	66469412	66469412
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23107	-0.0044	6.09641413812121e-28	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3649	0.0033	NA	NA	NA	5.56733157606744e-151	9523923	9523923
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.1581	5.56733157606744e-151	9523923	9523923	1.52044314793163e-130	9554149	9554149
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	11116883	582	563	-0.021	1.52044314793163e-130	9554149	9554149	8.50957677636785e-213	11116883	11116883
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.8446	8.50957677636785e-213	11116883	11116883	1.64537746362557e-95	11130871	11130871
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	69	-0.0149	1.64537746362557e-95	11130871	11130871	1.63214058560815e-157	11395862	11395862
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-4.67	1.63214058560815e-157	11395862	11395862	0	11435643	11435643
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31171313	6745	6557	-0.0017	0	11435643	11435643	2.77844631640944e-25	31098259	31173065
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31173065	31298659	41	40	0.4621	2.77844631640944e-25	31098259	31173065	1.01804265338710e-24	31295667	31305068
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	131649535	33687	32851	0.0037	1.0180426533871e-24	31295667	31305068	1.40194393909425e-10	131638453	131653071
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131651641	131683955	16	16	0.4905	1.40194393909425e-10	131638453	131653071	6.02994168028829e-08	131677475	131695178
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131685349	132289090	260	257	0.0406	6.02994168028829e-08	131677475	131695178	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18194544	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18348833	36969571	7038	6857	-0.0076	NA	NA	NA	1.87205417346682e-116	36969571	36969571
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.4252	1.87205417346682e-116	36969571	36969571	2.82990468688321e-128	36982877	36982877
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	288	0.0162	2.82990468688321e-128	36982877	36982877	9.34669594414177e-87	37953582	37953582
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.6328	9.34669594414177e-87	37953582	37953582	8.6336798980214e-85	37957844	37957844
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4748	-1e-04	8.6336798980214e-85	37957844	37957844	6.74571695258456e-57	49964838	49964838
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.9826	6.74571695258456e-57	49964838	49964838	2.14522303694798e-52	49971732	49971732
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71375082	5442	5299	-0.005	2.14522303694798e-52	49971732	49971732	5.31144731272956e-113	71375082	71375082
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.3613	5.31144731272956e-113	71375082	71375082	2.50768097399895e-116	71377671	71377671
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13630	-0.0063	2.50768097399895e-116	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	-0.0485	NA	NA	NA	7.21096342474457e-07	18537177	19273289
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	53	-0.7043	7.21096342474457e-07	18537177	19273289	3.39130242669345e-80	19490630	19497023
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	46775775	8955	8745	0.0074	3.39130242669345e-80	19490630	19497023	4.55783958017693e-16	46774115	46775775
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46778735	46787389	5	5	-1.045	4.55783958017693e-16	46774115	46775775	7.33371105818013e-16	46787389	46787389
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46789074	73071404	10400	10142	-0.0013	7.33371105818013e-16	46787389	46787389	1.50586903899031e-26	73071404	73071404
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.50586903899031e-26	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	5	1.3369	NA	NA	NA	9.18143072874895e-26	73092112	73092112
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105607572	12218	11933	0	9.18143072874895e-26	73092112	73092112	1.52175868598001e-10	105602602	105607572
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105625010	7	7	0.7377	1.52175868598001e-10	105602602	105607572	5.33857871660529e-09	105625010	105632168
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105630089	106358491	233	222	0.0022	5.33857871660529e-09	105625010	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.1477	NA	NA	NA	4.60599367010933e-07	18452491	18818949
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19537035	93	91	-0.5706	4.60599367010933e-07	18452491	18818949	2.35916779814638e-32	19427350	19805960
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	56	-1.212	2.35916779814638e-32	19427350	19805960	3.89885458736019e-243	20079935	20088256
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	21032	-0.0017	3.89885458736019e-243	20079935	20088256	5.88307248667344e-143	74669752	74671626
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.4806	5.88307248667344e-143	74669752	74671626	6.85093953200111e-144	74680338	74680439
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9346	-0.0027	6.85093953200111e-144	74680338	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	20038	0.0066	NA	NA	NA	2.69074413188385e-76	75093957	75093957
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.9283	2.69074413188385e-76	75093957	75093957	2.61589949002278e-82	75100865	75100865
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	594	-0.0093	2.61589949002278e-82	75100865	75100865	1.13852612883836e-309	76925748	76925748
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.7727	1.13852612883836e-309	76925748	76925748	1.72423271627379e-315	76940218	76940218
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88354244	4364	4250	-0.0078	1.72423271627379e-315	76940218	76940218	3.14608428898303e-06	88342891	88358943
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88355436	88370376	8	8	0.5401	3.14608428898303e-06	88342891	88358943	2.97089264895051e-05	88363658	88380569
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88371616	88690571	141	139	0.001	2.97089264895051e-05	88363658	88380569	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13519	0.013	NA	NA	NA	7.44450602794813e-168	36673853	36673853
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.3771	7.44450602794813e-168	36673853	36673853	2.44042061282543e-174	36683509	36683509
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	1985	0.0227	2.44042061282543e-174	36683509	36683509	5.43132978277598e-27	41555295	41573295
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	51	-0.4062	5.43132978277598e-27	41555295	41573295	4.87760139899646e-26	41710400	42161364
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	56471985	5213	5071	0.0126	4.87760139899646e-26	41710400	42161364	5.56457019717087e-08	56467056	56475121
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56473793	56480300	6	5	-0.7432	5.56457019717087e-08	56467056	56475121	2.23913178732797e-07	56476860	56486075
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56484552	78653545	8455	8233	0.0096	2.23913178732797e-07	56476860	56486075	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15816	-0.0058	NA	NA	NA	3.96793084229331e-11	53092949	53092949
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3882	3.96793084229331e-11	53092949	53092949	1.09894788351073e-10	53099601	53099601
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	60255652	2501	2432	-0.0109	1.09894788351073e-10	53099601	53099601	5.6039837319103e-21	60236310	60282237
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	60264836	60417746	23	23	0.5531	5.6039837319103e-21	60236310	60282237	5.27448191137717e-21	60408934	60433133
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	60422446	76116026	4239	4144	-0.0081	5.27448191137717e-21	60408934	60433133	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	479	0.0132	NA	NA	NA	1.29721066063940e-16	1398325	1398325
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.8364	1.2972106606394e-16	1398325	1398325	3.5381733274951e-18	1400840	1400840
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	56825794	19380	18897	0.0202	3.5381733274951e-18	1400840	1400840	7.95160447369875e-08	56819531	56825794
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.6365	7.95160447369875e-08	56819531	56825794	6.80998250569405e-08	56840346	56846683
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1142	0.0106	6.80998250569405e-08	56840346	56846683	2.4373995113053e-14	59412581	59414898
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7109	2.4373995113053e-14	59412581	59414898	6.91560434294742e-14	59434202	59440274
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63787171	1993	1944	0.0036	6.91560434294742e-14	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	566	-0.0044	NA	NA	NA	4.46318482130251e-21	1499421	1515948
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8365	4.46318482130251e-21	1499421	1515948	1.40116874050457e-21	1528899	1544485
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3602	-0.0032	1.40116874050457e-21	1528899	1544485	3.68827471683228e-12	12095485	12095485
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4179	3.68827471683228e-12	12095485	12095485	2.75693536849061e-11	12113855	12113855
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16859	-0.0036	2.75693536849061e-11	12113855	12113855	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13129	-0.0049	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22677959	2984	2918	0.021	NA	NA	NA	1.47937877018293e-11	22642519	22686731
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22720195	19	18	0.5176	1.47937877018293e-11	22642519	22686731	1.22007405178184e-12	22712211	22736990
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6369	0.0109	1.22007405178184e-12	22712211	22736990	5.06664594850939e-68	35472378	35472378
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4336	5.06664594850939e-68	35472378	35472378	6.63418749931824e-71	35476942	35476942
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36074159	339	330	0.0313	6.63418749931824e-71	35476942	35476942	4.47911558065264e-114	36074159	36074159
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36075796	36079268	3	3	-3.5619	4.47911558065264e-114	36074159	36074159	1.70841891293359e-104	36079268	36079268
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36080448	48446915	6158	5994	0.0081	1.70841891293359e-104	36079268	36079268	1.80150749317089e-14	48446915	48446915
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48448446	48448446	1	0	NA	1.80150749317089e-14	48446915	48446915	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	-1.6516	NA	NA	NA	6.25326946964564e-13	48452959	48452959
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	487	0.0183	6.25326946964564e-13	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.3224	NA	NA	NA	1.62042496057537e-24	94062	94062
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.5463	1.62042496057537e-24	94062	94062	2.55190177531717e-46	104732	104732
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427392	774	755	-0.0151	2.55190177531717e-46	104732	104732	2.21998599283735e-14	1427392	1431240
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1628	2.21998599283735e-14	1427392	1431240	1.27435355013724e-13	1432891	1432953
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	594	-0.0124	1.27435355013724e-13	1432891	1432953	2.00078565345741e-11	2301365	2302065
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0318	2.00078565345741e-11	2301365	2302065	9.48612976756647e-14	2304398	2306110
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	379	-0.0367	9.48612976756647e-14	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76992219	22938	22389	0.9831	0	2708113	2711273	5.84446057008088e-13	76992219	76992219
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76998610	77010018	3	3	2.3656	5.84446057008088e-13	76992219	76992219	4.41823650935525e-13	77010018	77010018
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21640	0.9863	4.41823650935525e-13	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0161	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-3.8373	NA	NA	NA	1.60368298539576e-20	2973379	3772482
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.60368298539576e-20	2973379	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.1303	NA	NA	NA	1.19968282150516e-11	5531459	6692482
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.5007	1.19968282150516e-11	5531459	6692482	3.05169435014346e-05	7011055	7238863
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	127	-2.7117	3.05169435014346e-05	7011055	7238863	0.00289489916823169	7367173	7568006
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	12	-4.3587	0.00289489916823169	7367173	7568006	0.00331942420180615	7606496	7631265
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	18	-2.6338	0.00331942420180615	7606496	7631265	4.45957356687888e-05	7630477	7659535
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-4.0907	4.45957356687888e-05	7630477	7659535	1.41952958294788e-10	7719658	7726921
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7745143	9	8	-1.8412	1.41952958294788e-10	7719658	7726921	0.00476104305460122	7733351	7789562
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7905286	46	43	-3.1054	0.00476104305460122	7733351	7789562	0.00522015999761948	7865557	7905286
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.19	0.00522015999761948	7865557	7905286	0.00193869750242310	7914104	7930528
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	375	-3.6083	0.0019386975024231	7914104	7930528	7.98600348249059e-21	10511255	10550419
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.2109	7.98600348249059e-21	10511255	10550419	1.44711657916122e-09	11249952	12452734
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.3154	1.44711657916122e-09	11249952	12452734	3.49975529118635e-09	12541506	12546917
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.0805	3.49975529118635e-09	12541506	12546917	1.66559742541864e-12	12658135	12687167
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.0332	1.66559742541864e-12	12658135	12687167	4.33375657705729e-05	12804329	12857197
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12888523	19	18	-2.6328	4.33375657705729e-05	12804329	12857197	0.00929193180846562	12861657	12898852
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12890628	12926941	14	14	-3.6839	0.00929193180846562	12861657	12898852	8.4707818851991e-05	12925401	12964087
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13129843	80	79	-2.1293	8.4707818851991e-05	12925401	12964087	4.89830234302902e-38	13111594	13138841
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14358464	415	407	-3.7953	4.89830234302902e-38	13111594	13138841	2.35544640964028e-13	14321882	14413754
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14703568	141	136	-2.958	2.35544640964028e-13	14321882	14413754	0.000263905346435297	14572190	14712496
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14705129	14883615	40	39	-3.9466	0.000263905346435297	14572190	14712496	0.0363161889430469	14754064	15203221
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	16387273	513	500	-3.434	0.0363161889430469	14754064	15203221	0.000236795956482476	16158338	16664691
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17482749	173	169	-3.8935	0.000236795956482476	16158338	16664691	9.68282348857382e-12	17467755	17482749
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17548302	12	12	-1.8389	9.68282348857382e-12	17467755	17482749	7.76275628380821e-07	17544651	17615190
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17557953	21036503	486	475	-3.6896	7.76275628380821e-07	17544651	17615190	4.14873197226855e-07	21034708	21041164
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.026	4.14873197226855e-07	21034708	21041164	6.67732929869046e-09	21048365	21057446
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	256	-3.6834	6.67732929869046e-09	21048365	21057446	2.21473294251646e-05	22049641	22157319
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9883	2.21473294251646e-05	22049641	22157319	7.97600250737523e-10	22176501	22181855
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	91	-4.0173	7.97600250737523e-10	22176501	22181855	1.40924270227141e-63	22926726	22930737
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-1.1116	1.40924270227141e-63	22926726	22930737	0.000122909453129267	26943701	27003308
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.2226	0.000122909453129267	26943701	27003308	5.56205089735903e-08	27009433	27064654
MSK_252152914799_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	32	-0.6359	5.56205089735903e-08	27009433	27064654	NA	NA	NA
