Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72536231	27893	26589	0.0099	NA	NA	NA	0	72536231	72536231
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	0	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-3.8277	NA	NA	NA	0	72579311	72579311
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10853	-0.0047	0	72579311	72579311	7.91428230252426e-16	109373255	109373255
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.9415	7.91428230252426e-16	109373255	109373255	7.9051577400242e-14	109376249	109376249
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	111169548	778	740	0.0038	7.9051577400242e-14	109376249	109376249	2.05707188865719e-07	111130510	111193625
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111173447	111173447	1	0	NA	2.05707188865719e-07	111130510	111193625	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111177741	111213875	15	15	-0.5169	NA	NA	NA	4.69758706996505e-08	111200864	111223728
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111215891	143700072	3419	3268	-0.0074	4.69758706996505e-08	111200864	111223728	2.00679640936334e-23	143644120	143719710
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	144003068	77	77	-0.3654	2.00679640936334e-23	143644120	143719710	2.02237603950188e-20	143827741	144109866
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	150823073	1859	1773	0.0108	2.02237603950188e-20	143827741	144109866	4.29046479977989e-100	150823073	150836481
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.3795	4.29046479977989e-100	150823073	150836481	3.12808546967348e-103	150848509	150851439
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	150852858	1	0	NA	3.12808546967348e-103	150848509	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2604	0.0172	NA	NA	NA	1.01392451150124e-49	157133150	157133150
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.4495	1.01392451150124e-49	157133150	157133150	5.49713365275513e-59	157136342	157136342
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1549	-0.0162	5.49713365275513e-59	157136342	157136342	1.97782207230243e-17	161099582	161099582
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.9033	1.97782207230243e-17	161099582	161099582	7.0548476525494e-15	161104791	161104791
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	247186514	31286	29751	-0.0045	7.0548476525494e-15	161104791	161104791	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10925	-0.0017	NA	NA	NA	1.27843283384712e-16	34539603	34551222
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6642	1.27843283384712e-16	34539603	34551222	3.94765068132059e-16	34583814	34597294
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	44368336	4093	3880	-0.0099	3.94765068132059e-16	34583814	34597294	8.73149885612236e-25	44364285	44374340
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44371811	44398519	16	16	0.847	8.73149885612236e-25	44364285	44374340	9.61700999361323e-25	44393461	44401484
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44400034	242689978	62178	59217	-0.0048	9.61700999361323e-25	44393461	44401484	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10274	-0.0053	NA	NA	NA	1.30452461439505e-15	32074432	32074432
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8899	1.30452461439505e-15	32074432	32074432	3.96908294125052e-14	32080848	32080848
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	62932826	11947	11374	0.0048	3.96908294125052e-14	32080848	32080848	1.51047148453174e-17	62927055	62941319
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	62937440	62968537	11	11	-0.887	1.51047148453174e-17	62927055	62941319	6.27329692639939e-19	62960564	62970557
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	62970557	99891210	9427	8961	-0.0095	6.27329692639939e-19	62960564	62970557	3.24313685166319e-92	99891210	99891210
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.4804	3.24313685166319e-92	99891210	99891210	1.21239452007924e-86	99897201	99897201
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20259	-0.0054	1.21239452007924e-86	99897201	99897201	2.41464505746818e-54	164005577	164009321
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.2437	2.41464505746818e-54	164005577	164009321	4.25732704322069e-14	164023502	164027724
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	0.5978	4.25732704322069e-14	164023502	164027724	6.14204449313622e-16	164100804	164126256
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9641	-0.0099	6.14204449313622e-16	164100804	164126256	1.91589272026609e-273	194354505	194354505
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.5072	1.91589272026609e-273	194354505	194354505	2.93716487922185e-252	194366950	194366950
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194368145	1	0	NA	2.93716487922185e-252	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	196822133	995	958	-0.0053	NA	NA	NA	9.39778002391925e-44	196810503	196904349
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196943380	24	22	-0.9919	9.39778002391925e-44	196810503	196904349	4.59966161916151e-41	196940125	196945209
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	199329592	960	913	0.0038	4.59966161916151e-41	196940125	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	191153613	55161	52560	-0.0065	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	7222660	2173	2067	0.0065	NA	NA	NA	1.17805146457844e-10	7218599	7222660
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7232549	7246064	4	4	-1.1133	1.17805146457844e-10	7218599	7222660	3.29757481232534e-10	7246064	7253683
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7253683	104452261	26821	25458	-0.011	3.29757481232534e-10	7246064	7253683	1.61885023282367e-17	104443917	104461541
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104461541	104528444	12	12	-0.8294	1.61885023282367e-17	104443917	104461541	4.1100080571719e-17	104522467	104538161
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104533570	180342860	24636	23423	-0.0015	4.1100080571719e-17	104522467	104538161	1.74054927816736e-134	180342860	180344964
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	6	-3.2158	1.74054927816736e-134	180342860	180344964	1.43188140945515e-72	180357210	180358977
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	0.0066	1.43188140945515e-72	180357210	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11129	0.0016	NA	NA	NA	1.98049922969257e-16	32543054	32590568
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	16	0.6998	1.98049922969257e-16	32543054	32590568	2.83655470641264e-16	32626619	32653710
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	54035000	8294	7906	-3e-04	2.83655470641264e-16	32626619	32653710	3.92397437568152e-73	54035000	54035000
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.3664	3.92397437568152e-73	54035000	54035000	1.59414762408057e-75	54042734	54042734
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	170753106	36125	34390	-0.0082	1.59414762408057e-75	54042734	54042734	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5108	0.0099	NA	NA	NA	7.8674270664714e-63	16135701	16135701
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.7466	7.8674270664714e-63	16135701	16135701	1.59350582753685e-59	16140018	16140018
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	133433384	40705	38799	-0.0038	1.59350582753685e-59	16140018	16140018	7.2494821979249e-209	133433384	133436265
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.4946	7.2494821979249e-209	133433384	133436265	5.81146388361194e-206	133447868	133448277
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	147702365	6352	6041	1e-04	5.81146388361194e-206	133447868	133448277	3.26131628176132e-11	147702365	147702365
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.6596	3.26131628176132e-11	147702365	147702365	1.72136518193098e-10	147707161	147707161
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4039	0.002	1.72136518193098e-10	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7226901	2393	2266	0.0038	NA	NA	NA	2.18898616430680e-10	7156900	7260442
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7790934	7	6	-0.8816	2.1889861643068e-10	7156900	7260442	1.70408135792529e-09	7729311	8137794
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7824059	7824059	1	0	NA	1.70408135792529e-09	7729311	8137794	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5458	0.0017	NA	NA	NA	7.74199256155858e-15	25120552	25120552
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	7.74199256155858e-15	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.8898	NA	NA	NA	1.06309368722976e-14	25125700	25125700
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	34717	-0.0025	1.06309368722976e-14	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12437	-0.0071	NA	NA	NA	2.65502937600897e-39	70926188	70926188
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.9937	2.65502937600897e-39	70926188	70926188	9.3064443399548e-39	70930528	70930528
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	96190950	8291	7859	-0.0143	9.3064443399548e-39	70930528	70930528	1.70881045180468e-12	96103522	96239645
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	96222319	96304822	31	30	0.4312	1.70881045180468e-12	96103522	96239645	3.85557949619782e-11	96296497	96324231
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	96311789	137352394	15443	14680	-0.0025	3.85557949619782e-11	96296497	96324231	2.49740250663476e-36	137352394	137352394
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.9554	2.49740250663476e-36	137352394	137352394	1.53186151711089e-31	137356880	137356880
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	139973847	1038	992	0.0114	1.53186151711089e-31	137356880	137356880	1.34795846924252e-05	139930156	139996940
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139980174	140036234	23	22	-0.3784	1.34795846924252e-05	139930156	139996940	0.0159367883338226	139990171	140068149
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140038752	140145683	42	40	-0.0935	0.0159367883338226	139990171	140068149	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31284926	11292	10770	-0.0022	NA	NA	NA	9.56794947965227e-171	31284926	31284926
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-5.0549	9.56794947965227e-171	31284926	31284926	1.79803182316293e-165	31291525	31291525
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	12612	-0.0053	1.79803182316293e-165	31291525	31291525	1.27011295742605e-42	77917893	77917893
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.1653	1.27011295742605e-42	77917893	77917893	1.94126740581439e-42	77928669	77928669
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19284	-4e-04	1.94126740581439e-42	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2021	0.0028	NA	NA	NA	2.23120190938077e-11	5730121	5738494
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5766615	17	17	-0.6118	2.23120190938077e-11	5730121	5738494	4.01625504995487e-13	5766615	5775970
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	55118214	14751	14019	7e-04	4.01625504995487e-13	5766615	5775970	0	55118214	55123719
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	-4.1433	0	55118214	55123719	0	55207305	55209626
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	70827725	6167	5850	0.0178	0	55207305	55209626	8.68921565216944e-10	70825613	70827725
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	70829533	70835436	4	4	-1.1284	8.68921565216944e-10	70825613	70827725	2.33456014437381e-10	70835436	70838612
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	70838612	107157031	12056	11460	-0.0048	2.33456014437381e-10	70835436	70838612	1.34825026786103e-19	107155002	107157031
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107160270	107176389	8	7	1.1444	1.34825026786103e-19	107155002	107157031	7.23383080558835e-20	107176389	107177546
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107177546	134450318	10125	9642	-0.0025	7.23383080558835e-20	107176389	107177546	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	285	0.0325	NA	NA	NA	6.69549448775861e-09	734832	736988
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.9868	6.69549448775861e-09	734832	736988	1.00203966912502e-07	743223	745410
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3283	0.0053	1.00203966912502e-07	743223	745410	6.4950561929991e-32	9516067	9531133
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	12	1.1442	6.4950561929991e-32	9516067	9531133	5.91237146659951e-33	9582696	9599999
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	132289090	41407	39433	0.0026	5.91237146659951e-33	9582696	9599999	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18194544	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18348833	114123340	31643	30157	-0.0061	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.0889	NA	NA	NA	0.00077603791800565	18527871	19295733
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	52	-0.7197	0.00077603791800565	18527871	19295733	2.31159407608303e-60	19490630	19538610
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	19497023	1	0	NA	2.31159407608303e-60	19490630	19538610	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	34674458	5689	5434	0.0121	NA	NA	NA	2.68137036197081e-114	34674458	34674458
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-4.1454	2.68137036197081e-114	34674458	34674458	3.0317031878043e-108	34683810	34683810
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	106358491	26132	24929	-0.0022	3.0317031878043e-108	34683810	34683810	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1228	NA	NA	NA	8.27724104386316e-08	18450562	18741716
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19845942	105	101	-0.9391	8.27724104386316e-08	18450562	18741716	1.92868323429459e-62	19845942	19845942
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-4.9491	1.92868323429459e-62	19845942	19845942	1.52805276612055e-65	19882711	19882711
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	43	-1.1622	1.52805276612055e-65	19882711	19882711	2.34059143023556e-121	20079935	20308014
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20479	0.0013	2.34059143023556e-121	20079935	20308014	1.3684688974898e-60	74669752	74671626
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.7044	1.3684688974898e-60	74669752	74671626	7.42861256976467e-61	74680338	74680439
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	74696127	1	0	NA	7.42861256976467e-61	74680338	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696702	100298352	9606	9156	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19513	0.0086	NA	NA	NA	1.95547259728828e-35	75093957	75093957
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.4262	1.95547259728828e-35	75093957	75093957	1.62653895298894e-33	75100865	75100865
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4885	-0.0027	1.62653895298894e-33	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	8147124	3542	3376	0.0313	NA	NA	NA	1.32669314814013e-08	8147124	8147124
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.5471	1.32669314814013e-08	8147124	8147124	4.94228767300558e-09	8149084	8155479
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	8154339	1	0	NA	4.94228767300558e-09	8149084	8155479	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8155479	36673853	10326	9828	0.0146	NA	NA	NA	1.85743361240664e-80	36673853	36673853
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.7809	1.85743361240664e-80	36673853	36673853	1.30324158044098e-82	36683509	36683509
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1910	0.0311	1.30324158044098e-82	36683509	36683509	3.65759532773821e-17	41501967	41539415
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41702238	63	61	0.4072	3.65759532773821e-17	41501967	41539415	3.07073808762098e-18	41636402	42148637
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41704093	78653545	13683	13055	0.0165	3.07073808762098e-18	41636402	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21902	-0.0076	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59414898	21055	19994	0.0227	NA	NA	NA	4.75401594385142e-15	59412581	59414898
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.8858	4.75401594385142e-15	59412581	59414898	7.94180089965123e-15	59434202	59440274
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1911	0.005	7.94180089965123e-15	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	553	-0.0058	NA	NA	NA	1.73307608012524e-72	1506379	1515948
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.0369	1.73307608012524e-72	1506379	1515948	8.6124260148697e-82	1525300	1531162
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3516	0.0013	8.6124260148697e-82	1525300	1531162	9.62897531879865e-11	12089020	12095485
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.5857	9.62897531879865e-11	12089020	12095485	1.15508463716494e-09	12113855	12113855
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16407	6e-04	1.15508463716494e-09	12113855	12113855	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10004854	8	8	-0.4777	NA	NA	NA	0.00458912159955721	9965872	13562263
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10013263	13882260	49	43	-0.1315	0.00458912159955721	9965872	13562263	0.000110428551831409	13869389	13897457
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	14092232	9	8	-0.6397	0.000110428551831409	13869389	13897457	2.86332641866395e-06	14047236	14296189
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14125179	46922972	13375	12776	0.002	2.86332641866395e-06	14047236	14296189	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696162	2990	2841	0.0262	NA	NA	NA	4.02723746558239e-11	22686690	22702398
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22720195	13	13	0.7184	4.02723746558239e-11	22686690	22702398	1.66563474456323e-12	22714979	22735036
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6225	0.014	1.66563474456323e-12	22714979	22735036	1.99072960563551e-31	35472378	35472378
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.787	1.99072960563551e-31	35472378	35472378	6.02941128731583e-29	35476942	35476942
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6636	0.0185	6.02941128731583e-29	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.2807	NA	NA	NA	5.53742770640732e-26	94062	94062
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	6	-1.8027	5.53742770640732e-26	94062	94062	5.62971728694932e-35	104732	104732
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	15	-0.1599	5.62971728694932e-35	104732	104732	0.000856549385442667	122211	129544
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	132721	7	7	-0.811	0.000856549385442667	122211	129544	1.61579710944983e-07	129544	138278
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133501	1427392	751	708	-0.0424	1.61579710944983e-07	129544	138278	6.01710867974494e-09	1427338	1431240
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.143	6.01710867974494e-09	1427338	1431240	1.43912854792205e-08	1432891	1434970
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	958	-0.0392	1.43912854792205e-08	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	53525403	18101	17212	1.01	0	2708113	2711273	1.44021536544467e-30	53507035	53576457
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53525482	53647176	75	70	1.5067	1.44021536544467e-30	53507035	53576457	1.11364000446568e-29	53635388	53657123
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53649185	76998610	4763	4524	1.0023	1.11364000446568e-29	53635388	53657123	1.88444173351241e-12	76998610	76998610
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.9467	1.88444173351241e-12	76998610	76998610	9.13161919735988e-13	77010018	77010018
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21132	1.0123	9.13161919735988e-13	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	189	-0.0202	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-3.5896	NA	NA	NA	9.96193359895739e-09	3773948	4272867
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	10	-1.2314	9.96193359895739e-09	3773948	4272867	3.73888290875719e-05	4948824	6728131
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	167	-3.2922	3.73888290875719e-05	4948824	6728131	2.67183409834233e-09	7027599	7200061
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7485594	125	120	-2.2302	2.67183409834233e-09	7027599	7200061	2.03729926583882e-08	7386947	7605311
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7723783	77	71	-3.4892	2.03729926583882e-08	7386947	7605311	7.51349723887955e-06	7707621	7729757
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.831	7.51349723887955e-06	7707621	7729757	3.46897755701791e-05	7776265	7807668
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	412	-3.2868	3.46897755701791e-05	7776265	7807668	2.00082979794738e-20	10511255	10515697
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	18	-0.6437	2.00082979794738e-20	10511255	10515697	1.09523455634901e-06	10655750	12532441
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13104920	193	179	-2.377	1.09523455634901e-06	10655750	12532441	0.0165597238958697	12909643	13104920
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	7	-1.0714	0.0165597238958697	12909643	13104920	1.0419275078268e-07	13128515	13137597
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	12	-3.5552	1.0419275078268e-07	13128515	13137597	0.0483588880197689	13140274	13208776
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	26	-2.4111	0.0483588880197689	13140274	13208776	5.945685590130e-07	13232295	13300861
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14342834	367	346	-3.6286	5.94568559013e-07	13232295	13300861	9.90183288565617e-10	14244120	14383746
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	95	-2.789	9.90183288565617e-10	14244120	14383746	5.57356077075895e-05	14489801	14545228
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.57356077075895e-05	14489801	14545228	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.4742	NA	NA	NA	3.88335902349344e-09	14561228	14605090
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	16190541	531	508	-3.1321	3.88335902349344e-09	14561228	14605090	1.53279901815628e-06	16036892	16357759
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16191571	17487972	222	211	-3.6682	1.53279901815628e-06	16036892	16357759	6.41318061983869e-07	17451391	17496151
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17548302	11	11	-1.8039	6.41318061983869e-07	17451391	17496151	1.50778997966299e-05	17530333	17598928
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17557953	21036503	486	468	-3.4864	1.50778997966299e-05	17530333	17598928	8.48910565471638e-06	21028489	21042490
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.1609	8.48910565471638e-06	21028489	21042490	6.91192468760455e-07	21047798	21059229
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	6.91192468760455e-07	21047798	21059229	NA	NA	NA
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	241	-3.4968	NA	NA	NA	9.28199201391295e-06	22051284	22157319
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.7662	9.28199201391295e-06	22051284	22157319	3.3971895483764e-22	22177335	22177335
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22371003	32	30	-4.3325	3.3971895483764e-22	22177335	22177335	1.75428604049389e-05	22252446	22407622
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22373608	22930737	61	55	-3.4428	1.75428604049389e-05	22252446	22407622	2.03986496705035e-50	22926726	23283689
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-0.9373	2.03986496705035e-50	22926726	23283689	8.05222995482724e-06	26943701	26998633
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.2179	8.05222995482724e-06	26943701	26998633	6.76587179358336e-05	27003308	27067889
MSK_252152914801_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.8677	6.76587179358336e-05	27003308	27067889	NA	NA	NA
