Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	9768023	3207	2964	0.0171	NA	NA	NA	4.96477236357319e-14	9763394	9768023
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9769722	9776903	4	4	-0.9663	4.96477236357319e-14	9763394	9768023	2.33000081744891e-14	9776903	9779758
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9779758	59798905	19674	18089	0.0059	2.33000081744891e-14	9776903	9779758	1.91678233105069e-09	59795751	59805792
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59803337	59803337	1	0	NA	1.91678233105069e-09	59795751	59805792	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59805792	59812162	4	4	-0.7945	NA	NA	NA	2.90389228415347e-10	59810341	59813981
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59813981	72537426	5004	4625	-0.0072	2.90389228415347e-10	59810341	59813981	0	72537426	72537426
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.3331	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84484082	3488	3224	-0.0049	0	72579311	72579311	4.39517070003323e-17	84484082	84484082
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.4071	4.39517070003323e-17	84484082	84484082	4.5256130258037e-16	84487429	84487429
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	110023268	8213	7571	-0.003	4.5256130258037e-16	84487429	84487429	7.74838061419559e-26	110023268	110023268
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.2448	7.74838061419559e-26	110023268	110023268	1.41150263845274e-26	110041712	110041712
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147311437	4558	4189	-0.0024	1.41150263845274e-26	110041712	110041712	4.22556538136134e-13	146286735	147381641
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147313991	147313991	1	0	NA	4.22556538136134e-13	146286735	147381641	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	148084402	37	36	-0.2993	NA	NA	NA	6.64965178521563e-16	147490553	148119298
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148088285	149595844	722	664	0.0214	6.64965178521563e-16	147490553	148119298	1.46946720836849e-41	149589527	149601328
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149599748	149673624	35	33	0.5468	1.46946720836849e-41	149589527	149601328	1.8355335229576e-37	149668674	149678401
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149676965	150819879	496	460	-0.0049	1.8355335229576e-37	149668674	149678401	1.2205733818196e-39	150819879	150836481
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	-1.121	1.2205733818196e-39	150819879	150836481	9.34178404704772e-45	150847304	150851439
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2545	0.0051	9.34178404704772e-45	150847304	150851439	1.46780202103037e-180	157133150	157133150
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.7136	1.46780202103037e-180	157133150	157133150	3.72953698791079e-193	157136342	157136342
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3787	-0.0079	3.72953698791079e-193	157136342	157136342	4.33726410340839e-09	167479184	167493768
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	9	0.489	4.33726410340839e-09	167479184	167493768	5.01963219481162e-09	167507898	167529221
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	185979586	7208	6600	-0.0092	5.01963219481162e-09	167507898	167529221	5.17654025102886e-12	185979586	185979586
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.199	5.17654025102886e-12	185979586	185979586	3.47166236451613e-13	185988138	185988138
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	187591354	276	254	-0.0014	3.47166236451613e-13	185988138	185988138	8.08830786949607e-144	187591354	187591354
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187594597	187809085	40	40	-0.9632	8.08830786949607e-144	187591354	187591354	1.89093718719571e-155	187805973	187809085
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187812675	200613454	3825	3530	-0.0021	1.89093718719571e-155	187805973	187809085	5.51277592468682e-09	200585836	200638221
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200803726	37	35	-0.2564	5.51277592468682e-09	200585836	200638221	3.79187862103056e-09	200696309	200816497
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	227875096	9921	9095	-0.0013	3.79187862103056e-09	200696309	200816497	5.67384306966786e-136	227875096	227875096
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	2	-3.9631	5.67384306966786e-136	227875096	227875096	4.41943098991105e-138	227882805	227882805
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246794552	7356	6770	-0.0013	4.41943098991105e-138	227882805	227882805	2.49127933579087e-29	246769018	246806669
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	25	-0.5238	2.49127933579087e-29	246769018	246806669	2.47517822391124e-22	246857496	246864725
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247185356	97	91	-0.0293	2.47517822391124e-22	246857496	246864725	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247186514	247186514	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37810001	12909	11836	-0.0033	NA	NA	NA	4.73508247067533e-48	37803744	37818455
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37858379	23	22	-0.7115	4.73508247067533e-48	37803744	37818455	2.95442773776311e-43	37848754	37859985
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	42948369	2126	1953	-0.007	2.95442773776311e-43	37848754	37859985	4.76089504451581e-09	42948369	42948369
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42951427	42958935	2	2	1.061	4.76089504451581e-09	42948369	42948369	3.6286720805248e-09	42958935	42958935
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42976594	52600588	3672	3397	0.0026	3.6286720805248e-09	42958935	42958935	1.76818631057317e-13	52588009	52600588
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8071	1.76818631057317e-13	52588009	52600588	7.35976617155168e-14	52635695	52639605
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	113832926	17000	15668	-0.0016	7.35976617155168e-14	52635695	52639605	1.26667069595185e-102	113823096	113832926
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113853515	114208982	37	32	-0.8507	1.26667069595185e-102	113823096	113832926	1.91624520393253e-100	114208982	114211531
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	114211531	131914089	4555	4192	0.0094	1.91624520393253e-100	114208982	114211531	1.06325351498870e-09	131912031	131925519
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131921816	131933903	4	4	-0.7662	1.0632535149887e-09	131912031	131925519	0.000711843900962352	131925519	131982998
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131943628	132726091	21	21	-0.0475	0.000711843900962352	131925519	131982998	0.00108007465189524	132384767	132739926
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132735656	132763461	10	10	0.4325	0.00108007465189524	132384767	132739926	1.95721247922850e-08	132747227	132767020
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132765513	146562545	4709	4334	-0.0051	1.9572124792285e-08	132747227	132767020	0	146562545	146562545
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146571330	146571330	1	0	NA	0	146562545	146562545	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-6.1436	NA	NA	NA	0	146592775	146592775
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	30137	-0.0041	0	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	1657290	559	511	8e-04	NA	NA	NA	4.86661816920143e-22	1657290	1657290
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1659807	1664071	3	3	-1.1846	4.86661816920143e-22	1657290	1657290	7.24635482284822e-18	1664071	1664071
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1677867	32074432	10234	9406	-0.01	7.24635482284822e-18	1664071	1664071	5.41934806843756e-11	32074432	32074432
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.1531	5.41934806843756e-11	32074432	32074432	1.04956960108065e-10	32080848	32080848
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32094956	1	0	NA	1.04956960108065e-10	32080848	32080848	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32098215	47460892	5419	4985	0.0036	NA	NA	NA	2.08295848936497e-15	47460892	47460892
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.3774	2.08295848936497e-15	47460892	47460892	5.24733563853493e-16	47466921	47466921
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133187633	27488	25184	-0.0058	5.24733563853493e-16	47466921	47466921	7.17610934770306e-15	133187633	133187633
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133189686	133189686	1	0	NA	7.17610934770306e-15	133187633	133187633	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3303	NA	NA	NA	9.5817499095253e-15	133194685	133194685
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	9.5817499095253e-15	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	163992903	9776	8955	-0.0053	NA	NA	NA	0	163992903	163992903
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	20	-5.3827	0	163992903	163992903	0	164107951	164107951
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	166940439	655	578	-0.0267	0	164107951	164107951	2.70089777226208e-09	166935021	166954693
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166949160	166952754	2	0	NA	2.70089777226208e-09	166935021	166954693	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166954693	166961156	4	3	-0.8678	NA	NA	NA	2.65479263658068e-09	166956709	166962757
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166962757	194354505	9469	8746	-0.0065	2.65479263658068e-09	166956709	166962757	0	194354505	194354505
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.6571	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196904349	998	925	-0.0126	0	194366950	194366950	2.67106334296093e-15	196820428	196911010
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196905767	196929805	18	17	-0.4635	2.67106334296093e-15	196820428	196911010	1.31708144533813e-12	196925203	196946355
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929826	196929826	1	0	NA	1.31708144533813e-12	196925203	196946355	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	877	-0.004	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	29022690	8639	7975	0.0021	NA	NA	NA	1.36512271780634e-12	29022690	29028502
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	29028502	29042576	3	3	-1.0154	1.36512271780634e-12	29022690	29028502	4.22763928580209e-13	29035782	29042576
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	29047099	39708009	2599	2401	-0.0053	4.22763928580209e-13	29035782	29042576	6.08223946874029e-11	39708009	39710644
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39710644	39718442	3	3	-0.9318	6.08223946874029e-11	39708009	39710644	1.96009792568908e-11	39717038	39718442
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39720583	39720583	1	0	NA	1.96009792568908e-11	39717038	39718442	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39722345	53032336	3226	2947	-0.0056	NA	NA	NA	3.38424916724208e-12	53032336	53032336
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53034667	53038441	2	2	-1.1689	3.38424916724208e-12	53032336	53032336	4.64756008958715e-12	53038441	53038441
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53040464	56068648	1069	980	-0.0085	4.64756008958715e-12	53038441	53038441	1.62704174490058e-11	56068648	56068648
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	56070868	56072259	2	2	-1.1437	1.62704174490058e-11	56068648	56068648	5.8399430425585e-11	56072259	56072259
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	56079086	68905670	2889	2656	-0.0144	5.8399430425585e-11	56072259	56072259	0	68905670	68905670
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	11	-3.9502	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	94073863	8448	7762	-0.0042	0	69165814	69165814	3.57852160952685e-09	94070673	94073863
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94084961	3	3	-0.8427	3.57852160952685e-09	94070673	94073863	4.77898279537024e-09	94084961	94086315
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94086315	107156970	4215	3880	-0.0094	4.77898279537024e-09	94084961	94086315	4.03649141830908e-10	107155095	107156970
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107159916	107161814	2	2	-1.0853	4.03649141830908e-10	107155095	107156970	7.9335098741229e-10	107161814	107163423
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107163423	173224400	18525	17061	-0.0115	7.9335098741229e-10	107161814	107163423	7.13587449569619e-29	173224400	173224400
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.7797	7.13587449569619e-29	173224400	173224400	2.94177941181013e-29	173228860	173228860
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5064	-2e-04	2.94177941181013e-29	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	114733958	31909	29379	-0.006	NA	NA	NA	3.44126640453608e-25	114733958	114733958
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114737626	114748876	6	6	-0.9868	3.44126640453608e-25	114733958	114733958	3.06098845389186e-26	114748876	114748876
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114751270	114751270	1	0	NA	3.06098845389186e-26	114748876	114748876	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114754385	127434789	3402	3115	-0.0113	NA	NA	NA	4.0807000876854e-55	127434789	127434789
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-2.5091	4.0807000876854e-55	127434789	127434789	3.01665259107034e-48	127438118	127438118
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	130666522	892	834	2e-04	3.01665259107034e-48	127438118	127438118	2.13762566312011e-12	130666522	130666522
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130668289	130677766	2	2	-1.1739	2.13762566312011e-12	130666522	130666522	6.86139922448263e-11	130677766	130677766
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130680467	140533456	4010	3716	0.0085	6.86139922448263e-11	130677766	130677766	1.12035136000148e-10	140533456	140533456
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.163	1.12035136000148e-10	140533456	140533456	3.67786279793350e-11	140538666	140538666
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180348365	13423	12303	0.0011	3.6778627979335e-11	140538666	140538666	9.63538995851999e-12	180346557	180348365
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	0.755	9.63538995851999e-12	180346557	180348365	3.83490510618768e-07	180358977	180365950
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	3.83490510618768e-07	180358977	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	103	0.0014	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	34	-0.004	NA	NA	NA	2.75241643804534e-53	200350	202063
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	271851	32	31	-0.7512	2.75241643804534e-53	200350	202063	3.76024497185396e-06	258187	283152
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	273710	326323	29	27	-1.0736	3.76024497185396e-06	258187	283152	2.02948398219421e-143	326323	326323
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	327962	1	0	NA	2.02948398219421e-143	326323	326323	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	26811016	9264	8527	-0.0043	NA	NA	NA	2.70054231134009e-18	26811016	26811016
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-1.012	2.70054231134009e-18	26811016	26811016	1.00780529401462e-18	26861184	26861184
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	31382291	1810	1666	0.009	1.00780529401462e-18	26861184	26861184	2.02226007976111e-07	31381060	31382291
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-0.9159	2.02226007976111e-07	31381060	31382291	7.5708704570392e-07	31385778	31389372
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31387708	1	0	NA	7.5708704570392e-07	31385778	31389372	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31389372	32543054	492	456	0.0204	NA	NA	NA	1.46539853081014e-137	32543054	32567462
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32548736	32558677	2	0	NA	1.46539853081014e-137	32543054	32567462	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	6	-3.0414	NA	NA	NA	2.33675018645265e-05	32567462	32593151
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32595402	1	0	NA	2.33675018645265e-05	32567462	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	0.2113	NA	NA	NA	6.65751355969822e-05	32628420	32633691
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32668835	12	11	-1.3694	6.65751355969822e-05	32628420	32633691	1.85561880679647e-08	32654861	32668835
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32672983	32711957	18	17	-0.1109	1.85561880679647e-08	32654861	32668835	4.66054992072096e-15	32709263	32713363
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	9	-1.0475	4.66054992072096e-15	32709263	32713363	0.00179241048853636	32728285	32739800
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32762061	13	13	-0.3788	0.00179241048853636	32728285	32739800	1.71998698044335e-07	32736223	32772859
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	65767409	10647	9778	2e-04	1.71998698044335e-07	32736223	32772859	2.46653263383577e-09	65765501	65767409
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.066	2.46653263383577e-09	65765501	65767409	7.09870203064673e-11	65771532	65778663
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	66453686	232	216	-0.0052	7.09870203064673e-11	65771532	65778663	3.36739497371057e-34	66453686	66453686
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66456250	66460548	2	2	-2.5178	3.36739497371057e-34	66453686	66453686	1.67480576944375e-54	66460548	66460548
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66461980	79018959	3798	3474	-0.0061	1.67480576944375e-54	66460548	66460548	5.46530408443355e-11	79008946	79018959
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79095415	14	12	0.454	5.46530408443355e-11	79008946	79018959	7.95077599555296e-11	79095415	79119694
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	108938131	8381	7685	-0.0046	7.95077599555296e-11	79095415	79119694	6.60840647648028e-12	108938131	108938131
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108939570	108940967	2	2	-1.1788	6.60840647648028e-12	108938131	108938131	1.16442037222439e-11	108940967	108940967
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108946617	126224141	5654	5197	-0.0045	1.16442037222439e-11	108940967	108940967	1.65777580128913e-12	126224141	126224141
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	126226097	126228177	2	2	-1.2209	1.65777580128913e-12	126224141	126224141	1.44032019008305e-12	126228177	126228177
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	126231585	134629897	3206	2952	-0.0057	1.44032019008305e-12	126228177	126228177	3.91908828174955e-10	134627341	134629897
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.7785	3.91908828174955e-10	134627341	134629897	3.72119780121593e-11	134635779	134639397
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	142327743	2425	2222	-0.0125	3.72119780121593e-11	134635779	134639397	1.56340349000866e-61	142327743	142327743
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	142339049	142397984	16	14	-0.9579	1.56340349000866e-61	142327743	142327743	5.7103688061538e-53	142397984	142397984
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	142403271	147131702	1733	1599	-0.0195	5.7103688061538e-53	142397984	142397984	8.8620981823414e-09	147127337	147131702
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	147133860	147136029	2	2	-1.0503	8.8620981823414e-09	147127337	147131702	6.36981714443526e-09	147136029	147138257
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	147138257	170753106	8254	7582	-0.0087	6.36981714443526e-09	147136029	147138257	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	6453445	2310	2135	0.0218	NA	NA	NA	8.6565522872868e-13	6452225	6453445
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6461504	6465087	4	4	-0.8708	8.6565522872868e-13	6452225	6453445	1.00852831721009e-12	6465087	6467786
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6467786	11276953	1421	1303	-0.0077	1.00852831721009e-12	6465087	6467786	1.88474317899923e-71	11276953	11276953
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	11279767	11315568	15	15	-1.0567	1.88474317899923e-71	11276953	11276953	3.74214267786023e-75	11315568	11315568
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	11318493	29264438	6459	5915	-0.0075	3.74214267786023e-75	11315568	11315568	7.08969955663785e-10	29262164	29264438
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29267029	29268430	2	2	-1.0763	7.08969955663785e-10	29262164	29264438	3.77841955808116e-09	29268430	29268430
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29271121	71894353	11576	10663	0.0012	3.77841955808116e-09	29268430	29268430	1.11193226981351e-30	71894353	71894353
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.9239	1.11193226981351e-30	71894353	71894353	4.48476801999330e-31	71912065	71912065
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	100382347	9370	8599	-0.0026	4.4847680199933e-31	71912065	71912065	1.48105308637436e-05	100331997	100386361
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100384616	100409126	12	12	-0.288	1.48105308637436e-05	100331997	100386361	0.00134951606921152	100399493	100460139
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100411645	125831554	11267	10324	-0.0072	0.00134951606921152	100399493	100460139	1.55575825991087e-21	125831554	125831554
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125833251	1	0	NA	1.55575825991087e-21	125831554	125831554	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125836353	125837524	2	2	1.6011	NA	NA	NA	5.47448908183633e-21	125837524	125837524
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3318	-0.0042	5.47448908183633e-21	125837524	125837524	7.7755337834146e-17	133432281	133433384
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133436265	1	0	NA	7.7755337834146e-17	133432281	133433384	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133437464	133448277	7	7	0.7668	NA	NA	NA	1.01861498551545e-17	133448277	133455682
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133453811	1	0	NA	1.01861498551545e-17	133448277	133455682	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133455682	141410894	3699	3372	0.0038	NA	NA	NA	1.99599545312955e-09	141406414	141413352
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141431668	9	8	0.5316	1.99599545312955e-09	141406414	141413352	8.27172806474066e-08	141426846	141435643
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141432778	141690753	121	112	0.0181	8.27172806474066e-08	141426846	141435643	0	141690753	141690753
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141712786	9	9	-4.9079	0	141690753	141690753	0	141712786	141712786
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141714168	141720303	2	0	NA	0	141712786	141712786	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2319	-0.0043	NA	NA	NA	2.55200348686864e-10	147699576	147702365
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	3	-0.9483	2.55200348686864e-10	147699576	147702365	1.17768355676313e-09	147710037	147711471
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158821263	4236	3856	-0.0075	1.17768355676313e-09	147710037	147711471	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	9533226	2884	2655	0.0064	NA	NA	NA	1.03387185394272e-189	9533226	9533226
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-3.7575	1.03387185394272e-189	9533226	9533226	1.15439059640936e-189	9538031	9538031
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	9539424	1	0	NA	1.15439059640936e-189	9538031	9538031	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9540987	121122287	33662	30937	-0.0053	NA	NA	NA	3.05165423027049e-14	121120080	121124797
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121124797	121136179	5	5	-0.8267	3.05165423027049e-14	121120080	121124797	1.02797110958312e-13	121131965	121137499
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121137499	146253929	8010	7389	7e-04	1.02797110958312e-13	121131965	121137499	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70923005	13071	12004	-0.0057	NA	NA	NA	1.77307357883253e-33	70923005	70923005
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70926188	70926188	1	0	NA	1.77307357883253e-33	70923005	70923005	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.949	NA	NA	NA	6.20349766665015e-32	70930528	70930528
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	81214435	3707	3386	-0.0084	6.20349766665015e-32	70930528	70930528	0	81214435	81214435
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	81218527	81220608	2	2	-6.9253	0	81214435	81214435	0	81220608	81220608
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	81233111	100348045	6210	5687	-0.009	0	81220608	81220608	1.34339715056053e-10	100348045	100348045
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.1678	1.34339715056053e-10	100348045	100348045	8.26046099026435e-12	100350814	100350814
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	112062107	3851	3535	-0.0101	8.26046099026435e-12	100350814	100350814	1.05764886389148e-15	112062107	112062107
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-1.3381	1.05764886389148e-15	112062107	112062107	5.40463011104962e-16	112069192	112069192
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	116118907	1692	1554	0.0061	5.40463011104962e-16	112069192	112069192	2.04632299417828e-09	116116077	116118907
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116122595	1	0	NA	2.04632299417828e-09	116116077	116118907	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116124007	116132839	4	4	-0.7271	NA	NA	NA	8.17023703354343e-08	116132839	116137111
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	137347945	8293	7630	-0.0017	8.17023703354343e-08	116132839	116137111	6.74942742095973e-52	137347945	137347945
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137352394	137352394	1	0	NA	6.74942742095973e-52	137347945	137347945	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.5491	NA	NA	NA	5.08681342550901e-43	137356880	137356880
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1014	0.0011	5.08681342550901e-43	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	22537	-0.0037	NA	NA	NA	1.27611649478562e-38	77917893	77917893
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.733	1.27611649478562e-38	77917893	77917893	3.89976849709878e-38	77928738	77928738
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	95029927	5361	4925	-0.0068	3.89976849709878e-38	77928738	77928738	8.80280532979758e-10	95025147	95029927
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95032103	95034352	2	2	-1.1103	8.80280532979758e-10	95025147	95029927	1.00409821490260e-09	95034352	95036471
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95036471	135285645	14850	13695	-0.0043	1.0040982149026e-09	95034352	95036471	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1632	0.0057	NA	NA	NA	1.41310611902933e-09	4920907	4926583
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.7373	1.41310611902933e-09	4920907	4926583	2.36850255821517e-11	4931000	4934594
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	334	-0.003	2.36850255821517e-11	4931000	4934594	5.07207568298958e-23	5738494	5741031
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5760117	12	12	-0.6759	5.07207568298958e-23	5738494	5741031	5.70447488112924e-23	5760117	5765438
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5762182	5763749	2	0	NA	5.70447488112924e-23	5760117	5765438	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	55118214	14753	13578	-0.0026	NA	NA	NA	0	55118214	55118214
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55158078	11	11	-3.9749	0	55118214	55118214	2.3054550906052e-07	55142193	55162949
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55161177	55209626	28	25	-5.4722	2.3054550906052e-07	55142193	55162949	0	55209626	55209626
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66460753	4637	4259	0.0095	0	55209626	55209626	5.54955412602878e-08	66459299	66460753
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66463477	66463477	1	0	NA	5.54955412602878e-08	66459299	66460753	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0008	NA	NA	NA	5.39999861860725e-08	66469412	66473397
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	21880	-0.0049	5.39999861860725e-08	66469412	66473397	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3431	8e-04	NA	NA	NA	4.47811714721063e-42	9523923	9531133
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9604633	14	13	0.8713	4.47811714721063e-42	9523923	9531133	3.25527806823445e-43	9590351	9607363
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11104973	569	512	-0.0234	3.25527806823445e-43	9590351	9607363	4.40100183202234e-31	11104085	11104973
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	10	0.8253	4.40100183202234e-31	11104085	11104973	8.57481217399234e-24	11140421	11143592
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	12422129	466	432	0.0088	8.57481217399234e-24	11140421	11143592	9.96785967747901e-16	12419910	12422129
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	5	-0.9239	9.96785967747901e-16	12419910	12422129	1.11629368753778e-19	12433043	12435301
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	19880107	2523	2325	-0.0032	1.11629368753778e-19	12433043	12435301	7.81202719242712e-10	19880107	19880107
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19884528	19889270	2	2	-1.0452	7.81202719242712e-10	19880107	19880107	5.69060118772015e-09	19889270	19897674
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19894603	19894603	1	0	NA	5.69060118772015e-09	19889270	19897674	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19897674	54233281	11308	10378	6e-04	NA	NA	NA	1.85038449295420e-21	54230663	54236945
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54236945	54257430	8	8	-0.7904	1.8503844929542e-21	54230663	54236945	2.94908533260524e-21	54255317	54261210
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54261210	80662066	8692	7990	-0.0015	2.94908533260524e-21	54255317	54261210	5.14787780870177e-10	80658995	80662066
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.1025	5.14787780870177e-10	80658995	80662066	7.58512327659735e-10	80666751	80666751
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130694393	17172	15700	0.0021	7.58512327659735e-10	80666751	80666751	1.21125479465895e-07	130694393	130694393
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.9865	1.21125479465895e-07	130694393	130694393	3.91773709605285e-08	130701040	130701040
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	595	-0.0044	3.91773709605285e-08	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6730	-0.0103	NA	NA	NA	3.83666468001923e-71	37953582	37953582
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.8772	3.83666468001923e-71	37953582	37953582	1.44875506100331e-73	37957844	37957844
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4478	-0.0052	1.44875506100331e-73	37957844	37957844	1.17443063534952e-99	49964838	49964838
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.3552	1.17443063534952e-99	49964838	49964838	4.12508690740666e-102	49971732	49971732
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	89659397	10072	9230	-0.0075	4.12508690740666e-102	49971732	49971732	5.11274476205102e-204	89659397	89659397
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.7297	5.11274476205102e-204	89659397	89659397	1.36718246389958e-198	89662326	89662326
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	8575	-0.0119	1.36718246389958e-198	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	71875017	18810	17250	1e-04	NA	NA	NA	1.50305214029628e-15	71875017	71875017
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	71876605	71880573	3	3	-1.1145	1.50305214029628e-15	71875017	71875017	2.78812245256216e-16	71880573	71880573
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	71881814	73071404	607	557	0.0087	2.78812245256216e-16	71880573	71880573	6.78941073974231e-95	73071404	73071404
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	6.78941073974231e-95	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.9442	NA	NA	NA	1.04194143518129e-82	73092112	73092112
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73101327	1	0	NA	1.04194143518129e-82	73092112	73092112	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	73306411	92	83	-0.0127	NA	NA	NA	8.23960251498402e-26	73306411	73306411
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73307681	73315317	5	5	-1.0134	8.23960251498402e-26	73306411	73306411	3.79907826676891e-20	73315317	73315317
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	106358491	12360	11317	-0.0013	3.79907826676891e-20	73315317	73315317	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1113	NA	NA	NA	0.000552030836711447	18452491	18810004
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	9	-0.4598	0.000552030836711447	18452491	18810004	8.82980316416143e-05	18826924	18837737
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	0.1826	8.82980316416143e-05	18826924	18837737	2.49621777707891e-05	18848213	18857376
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20321772	141	131	-0.459	2.49621777707891e-05	18848213	18857376	1.65978328506848e-113	20308014	20347935
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20330200	75115806	21725	19945	-0.0017	1.65978328506848e-113	20308014	20347935	7.37198946497569e-26	75115806	75115806
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.78	7.37198946497569e-26	75115806	75115806	2.03699276107218e-26	75119713	75119713
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	8675	-0.0056	2.03699276107218e-26	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	7600838	3058	2787	0.0115	NA	NA	NA	7.52383482966453e-11	7599178	7600838
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	7602978	7604679	2	2	-1.199	7.52383482966453e-11	7599178	7600838	2.31228399439731e-11	7604679	7604679
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	7606994	32379126	7513	6887	0.0088	2.31228399439731e-11	7604679	7604679	2.77072502171925e-42	31854794	32515876
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	41	-0.497	2.77072502171925e-42	31854794	32515876	1.53735408995374e-41	33536526	33842125
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	33830585	1	0	NA	1.53735408995374e-41	33536526	33842125	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	54339225	3072	2822	0.0022	NA	NA	NA	2.27908535186829e-10	54327401	54362111
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54340649	54390060	15	14	-0.4323	2.27908535186829e-10	54327401	54362111	3.65443390470752e-08	54390060	54390060
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54402057	3	3	1.2025	3.65443390470752e-08	54390060	54390060	1.06056192615121e-17	54400475	54402057
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57203733	1199	1107	-2e-04	1.06056192615121e-17	54400475	54402057	5.18822684346113e-11	57203733	57203733
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1621	5.18822684346113e-11	57203733	57203733	2.98451604813063e-13	57206772	57206772
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	61707785	990	902	-0.0061	2.98451604813063e-13	57206772	57206772	8.74559676934425e-31	61707785	61707785
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	61725815	61737958	5	5	-1.1224	8.74559676934425e-31	61707785	61707785	1.46050513403934e-27	61737958	61737958
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	61747344	62126630	69	58	-0.0019	1.46050513403934e-27	61737958	61737958	0.00071687424477877	62090078	62126630
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	62131455	62131455	1	0	NA	0.00071687424477877	62090078	62126630	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	62139786	62153900	4	4	0.4634	NA	NA	NA	1.20769243962636e-12	62153900	62153900
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	62159303	62268655	16	15	-0.0249	1.20769243962636e-12	62153900	62153900	2.36239830161066e-23	62268655	62268655
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	62273650	62282316	2	2	1.1107	2.36239830161066e-23	62268655	62268655	5.75697077738134e-10	62282316	62282316
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	62287614	75093957	4525	4161	0.0083	5.75697077738134e-10	62282316	62282316	4.76307120843995e-103	75093957	75093957
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75097331	1	0	NA	4.76307120843995e-103	75093957	75093957	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	-3.4407	NA	NA	NA	6.90544281857538e-99	75100865	75100865
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	569	-0.0186	6.90544281857538e-99	75100865	75100865	4.85695845443322e-23	76925748	76925748
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8176	4.85695845443322e-23	76925748	76925748	2.48017750592751e-19	76940218	76942679
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4166	-0.0022	2.48017750592751e-19	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	387	0.0373	NA	NA	NA	1.41669233444407e-09	1028979	1028979
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.1517	1.41669233444407e-09	1028979	1028979	1.30884357124595e-09	1030766	1030766
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1031233	1	0	NA	1.30884357124595e-09	1030766	1030766	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1032051	6253806	2227	2036	0.0166	NA	NA	NA	2.19062430717254e-08	6253806	6253806
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6256654	6258208	2	2	-1.0472	2.19062430717254e-08	6253806	6253806	1.12775571574433e-08	6258208	6258208
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6259871	32850723	9783	8955	0.0119	1.12775571574433e-08	6258208	6258208	1.49564727838144e-39	32850723	32850723
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-2.1944	1.49564727838144e-39	32850723	32850723	1.07474066199520e-37	32854956	32854956
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	36673853	1437	1310	0.0143	1.0747406619952e-37	32854956	32854956	1.88014667891394e-63	36673853	36673853
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36675987	1	0	NA	1.88014667891394e-63	36673853	36673853	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36684619	5	5	1.7553	NA	NA	NA	1.19920017032863e-58	36684619	36684619
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1889	0.022	1.19920017032863e-58	36684619	36684619	5.94134062559958e-34	41558893	41573295
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41568539	1	0	NA	5.94134062559958e-34	41558893	41573295	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42147225	48	45	-0.4253	NA	NA	NA	6.32913239879216e-34	41706870	42153189
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	78653545	13676	12583	0.0091	6.32913239879216e-34	41706870	42153189	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	64893432	19655	17958	-0.0071	NA	NA	NA	1.80490399824560e-09	64891380	64893432
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64898316	64905644	3	3	-0.8811	1.8049039982456e-09	64891380	64893432	3.72965737692964e-09	64905644	64913443
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64913443	76116026	3306	3072	-0.0101	3.72965737692964e-09	64905644	64913443	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	18222	0.0195	NA	NA	NA	5.16961540096673e-17	56822197	56823430
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	7	-0.7886	5.16961540096673e-17	56822197	56823430	1.8049521855906e-15	56840346	56842447
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1086	0.0106	1.8049521855906e-15	56840346	56842447	2.13795463987856e-15	59411618	59414898
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.6922	2.13795463987856e-15	59411618	59414898	4.44749585098028e-10	59433190	59440274
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	22	-0.0528	4.44749585098028e-10	59433190	59440274	1.45038872999093e-07	59491509	59491509
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-1.977	1.45038872999093e-07	59491509	59491509	1.38855891038215e-30	59497049	59497049
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1815	0.0026	1.38855891038215e-30	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	533	7e-04	NA	NA	NA	8.20606304049427e-152	1506379	1511632
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	-2.332	8.20606304049427e-152	1506379	1511632	5.74730430070178e-202	1531162	1532433
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	19294	-0.0024	5.74730430070178e-202	1531162	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12320	-0.005	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2712	0.015	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-3.7154	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32203183	5102	4668	0.007	0	22720195	22725305	3.29338360852132e-31	32201830	32203183
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32206246	32218938	9	9	-0.9252	3.29338360852132e-31	32201830	32203183	3.68550249948033e-31	32218938	32220503
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32220503	37685496	2649	2460	0.0216	3.68550249948033e-31	32218938	32220503	0	37685496	37689058
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-4.703	0	37685496	37689058	0	37709300	37715385
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5285	0.0086	0	37709300	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	4926	5	5	-0.1339	NA	NA	NA	4.04625236357687e-16	4926	4926
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	94062	94062	1	0	NA	4.04625236357687e-16	4926	4926	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6308	NA	NA	NA	2.17329672467811e-44	104732	104732
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2302065	1387	1258	-0.2627	2.17329672467811e-44	104732	104732	1.42427724633604e-08	2302065	2302065
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2303192	1	0	NA	1.42427724633604e-08	2302065	2302065	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	2	0.8816	NA	NA	NA	1.10857258444550e-08	2304398	2304398
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	355	-0.3102	1.1085725844455e-08	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	11190250	3010	2727	0.578	0	2708113	2711273	3.1750257170382e-66	11182370	11197598
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	11193952	11370146	101	93	1.0433	3.1750257170382e-66	11182370	11197598	4.63838794055936e-64	11366142	11378177
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	11373338	11373338	1	0	NA	4.63838794055936e-64	11366142	11378177	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	11375233	69646994	18099	16630	0.6075	NA	NA	NA	6.67436336084218e-17	69646994	69646994
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69649160	69650824	2	2	-0.9416	6.67436336084218e-17	69646994	69646994	8.36863371256466e-17	69650824	69650824
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69659613	154582414	23921	22009	0.6051	8.36863371256466e-17	69650824	69650824	0	154578922	154582414
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	187	-0.3068	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	112	-4.3608	NA	NA	NA	1.31093775016926e-23	3219200	3772482
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.31093775016926e-23	3219200	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	14	-0.9348	NA	NA	NA	6.47345271722088e-32	5531459	5593746
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6749115	16	15	-4.8877	6.47345271722088e-32	5531459	5593746	4.43453454313957e-07	6749047	6765103
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6756250	6825108	31	27	-3.0338	4.43453454313957e-07	6749047	6765103	7.83159376353879e-05	6801155	6851453
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6829322	6955902	73	70	-4.3489	7.83159376353879e-05	6801155	6851453	1.45247718335600e-05	6935203	7016814
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7495687	183	173	-3.3387	1.452477183356e-05	6935203	7016814	4.94701182493955e-07	7375948	7608619
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	67	-4.4713	4.94701182493955e-07	7375948	7608619	2.36861346331415e-13	7716001	7726921
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7784314	19	17	-2.1393	2.36861346331415e-13	7716001	7726921	1.94933613859668e-11	7782532	7806091
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7785973	10513747	428	390	-4.1959	1.94933613859668e-11	7782532	7806091	1.82648920434087e-25	10512616	10515697
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.6407	1.82648920434087e-25	10512616	10515697	0.0910385230656401	10617908	11673476
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.1569	0.0910385230656401	10617908	11673476	3.97156515978758e-05	11660512	12452734
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	8	-5.1065	3.97156515978758e-05	11660512	12452734	0.000111785511744594	12536761	12556034
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	53	-2.556	0.000111785511744594	12536761	12556034	1.41766928530575e-05	12627138	12700767
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12857197	30	27	-4.2236	1.41766928530575e-05	12627138	12700767	3.30978227093637e-10	12843307	12871057
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12859309	13128515	105	95	-2.6366	3.30978227093637e-10	12843307	12871057	3.55377087758196e-07	13101234	13153920
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13129843	1	0	NA	3.55377087758196e-07	13101234	13153920	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13262997	45	44	-3.8287	NA	NA	NA	0.000393153402536413	13165652	13296819
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13433476	71	68	-4.6925	0.000393153402536413	13165652	13296819	2.87230508371478e-09	13427571	13433476
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13434942	13448037	9	8	-2.6291	2.87230508371478e-09	13427571	13433476	8.82137429876522e-07	13448037	13457504
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13450240	13606316	80	70	-4.6457	8.82137429876522e-07	13448037	13457504	1.16578996487062e-08	13597813	13606316
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13663517	4	4	-1.5826	1.16578996487062e-08	13597813	13606316	1.05803668643861e-08	13663517	13691261
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13670791	14321882	187	171	-4.5741	1.05803668643861e-08	13663517	13691261	8.37370774371919e-07	14143748	14384653
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14322984	14508021	108	100	-3.8062	8.37370774371919e-07	14143748	14384653	3.0098782870957e-05	14487022	14549297
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.0098782870957e-05	14487022	14549297	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	34	-2.5088	NA	NA	NA	0.00501923706500354	14547168	14684159
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14700040	13	13	-3.8284	0.00501923706500354	14547168	14684159	0.00172618078928449	14696387	14713609
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14875973	42	41	-4.8131	0.00172618078928449	14696387	14713609	0.00145767558876869	14812822	15039182
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	15139441	48	47	-3.9437	0.00145767558876869	14812822	15039182	7.92794473054118e-06	15118268	15144239
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15170627	19	15	-2.2856	7.92794473054118e-06	15118268	15144239	0.000110415578596335	15165211	15191780
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15171394	15299931	72	67	-3.8214	0.000110415578596335	15165211	15191780	1.37299754798006e-05	15275313	15315201
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15417398	76	68	-4.778	1.37299754798006e-05	15275313	15315201	0.000533255307271928	15397704	15499052
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15418992	16035717	180	159	-4.0179	0.000533255307271928	15397704	15499052	0.000466776710259818	16007396	16035717
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.6925	0.000466776710259818	16007396	16035717	0.00106117122840617	16037646	16059723
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16067790	9	8	-3.146	0.00106117122840617	16037646	16059723	0.0415257601175618	16065378	16212418
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16068838	21036503	775	707	-4.2462	0.0415257601175618	16065378	16212418	9.05410127121948e-06	21034708	21042490
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.7273	9.05410127121948e-06	21034708	21042490	1.60301893841980e-09	21048365	21057446
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21497583	140	127	-4.417	1.6030189384198e-09	21048365	21057446	1.11564521151050e-05	21478199	21497583
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-1.9017	1.1156452115105e-05	21478199	21497583	2.47121144759802e-05	21559551	21605421
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22165808	120	103	-4.4678	2.47121144759802e-05	21559551	21605421	2.43192909761361e-05	22055660	22166564
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22166564	22177335	6	6	-2.3805	2.43192909761361e-05	22055660	22166564	8.85519188001569e-20	22177335	22178964
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22308420	30	29	-5.037	8.85519188001569e-20	22177335	22178964	7.2271132476384e-12	22263267	22371003
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22400925	10	10	-3.1249	7.2271132476384e-12	22263267	22371003	0.000330371845215347	22387293	22789287
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22407622	25737663	55	47	-4.6961	0.000330371845215347	22387293	22789287	9.03934313084824e-63	22930737	26870361
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26989053	38	35	-1.1736	9.03934313084824e-63	22930737	26870361	0.00661367167014335	26945893	26989053
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	26990807	1	0	NA	0.00661367167014335	26945893	26989053	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	26998633	2	2	-2.984	NA	NA	NA	0	26998633	26998633
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27000085	27003308	2	2	-4.203	0	26998633	26998633	2.49301367372354e-20	27003308	27003308
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.6378	2.49301367372354e-20	27003308	27003308	1.48515607869174e-34	27019256	27019256
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27032300	3	3	-4.7744	1.48515607869174e-34	27019256	27019256	8.30258802538027e-07	27032300	27053237
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27039222	57437557	32	27	-0.8191	8.30258802538027e-07	27032300	27053237	NA	NA	NA
MSK_252152914944_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	57440809	57440809	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
