Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72545984	27899	26969	0.0126	NA	NA	NA	8.74129473832934e-09	72541443	72545984
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72550248	72567555	5	4	0.8177	8.74129473832934e-09	72541443	72545984	9.77551279108191e-08	72567555	72568009
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72568009	109987341	11692	11292	-0.0028	9.7755127910819e-08	72567555	72568009	1.65364515180312e-17	109987341	109987341
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.6984	1.65364515180312e-17	109987341	109987341	1.8763834621602e-16	109989998	109989998
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	143700072	3931	3814	-0.0045	1.8763834621602e-16	109989998	109989998	4.37018487816289e-16	143648141	143710875
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	143789484	44	42	-0.3741	4.37018487816289e-16	143648141	143710875	3.88679864979231e-17	143780677	143800457
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	147308557	599	577	0.0064	3.88679864979231e-17	143780677	143800457	7.77578328869979e-10	146273223	147315217
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147311437	147471665	28	28	0.3537	7.77578328869979e-10	146273223	147315217	1.03738341256782e-09	147458669	148088285
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147475854	147475854	1	0	NA	1.03738341256782e-09	147458669	148088285	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147490553	150819879	1263	1216	0.0127	NA	NA	NA	5.03543464052656e-124	150819879	150819879
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.0358	5.03543464052656e-124	150819879	150819879	2.5404049177381e-68	150851439	150851439
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0215	2.5404049177381e-68	150851439	150851439	1.95106636365492e-07	151024118	151028700
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8642	1.95106636365492e-07	151024118	151028700	5.22921581038580e-08	151033188	151038091
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2593	0.0163	5.2292158103858e-08	151033188	151038091	4.60166507274912e-94	157133150	157133150
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.9667	4.60166507274912e-94	157133150	157133150	5.48340342084273e-98	157136342	157136342
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200598243	15463	14991	-0.0034	5.48340342084273e-98	157136342	157136342	3.06427362919398e-10	200582647	200618814
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	37	-0.3121	3.06427362919398e-10	200582647	200618814	3.04049389229192e-10	200678532	200812072
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16840	-8e-04	3.04049389229192e-10	200678532	200812072	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10529	-2e-04	NA	NA	NA	8.74934895929462e-07	33074522	33076512
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.1011	8.74934895929462e-07	33074522	33076512	2.28270582115775e-07	33080437	33081681
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	627	-0.0015	2.28270582115775e-07	33080437	33081681	2.78540064922041e-29	34539740	34543992
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.7258	2.78540064922041e-29	34539740	34543992	5.96289206454517e-28	34589997	34591681
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	41091579	2875	2784	-0.0119	5.96289206454517e-28	34589997	34591681	2.2196757740785e-08	41087172	41091579
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41092989	1	0	NA	2.2196757740785e-08	41087172	41091579	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41094296	41101640	4	4	-0.8579	NA	NA	NA	4.18464756660793e-08	41101640	41105253
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	242689978	63407	61361	-0.0012	4.18464756660793e-08	41101640	41105253	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10450	-0.0039	NA	NA	NA	6.34299553421691e-17	32074432	32074432
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.6379	6.34299553421691e-17	32074432	32074432	5.58219849586673e-16	32080848	32080848
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99891210	21385	20661	-0.0016	5.58219849586673e-16	32080848	32080848	7.1618728202961e-129	99891210	99891210
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.55	7.1618728202961e-129	99891210	99891210	3.92740978307948e-130	99897201	99897201
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20630	-0.0062	3.92740978307948e-130	99897201	99897201	1.03632645052591e-44	164005577	164009321
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	1.8907	1.03632645052591e-44	164005577	164009321	2.72045919809071e-44	164019640	164027724
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11745	-0.0064	2.72045919809071e-44	164019640	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3267	0.0231	NA	NA	NA	1.92666389858545e-256	9815760	9815760
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.6628	1.92666389858545e-256	9815760	9815760	7.13126547296587e-276	9842644	9842644
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5958	-0.0073	7.13126547296587e-276	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-4.4534	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	64376590	7781	7545	-0.0102	0	34491115	34491115	1.01170733886599e-162	64376590	64376590
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.0141	1.01170733886599e-162	64376590	64376590	6.04340559011968e-162	64390333	64390333
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1046	-0.0028	6.04340559011968e-162	64390333	64390333	6.81029698538443e-12	68897538	69075140
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69656183	16	14	-0.5298	6.81029698538443e-12	68897538	69075140	3.16786526861427e-11	69163312	69684769
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69665979	173660684	31386	30377	-0.0091	3.16786526861427e-11	69163312	69684769	3.05478725464407e-26	173660684	173660684
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.0458	3.05478725464407e-26	173660684	173660684	1.19564111966306e-27	173666072	173666072
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5146	-0.0054	1.19564111966306e-27	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180342860	53646	51913	-0.0028	NA	NA	NA	1.84642273398743e-08	180192214	180346557
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6135	1.84642273398743e-08	180192214	180346557	2.03235420894172e-05	180355807	180365977
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	0.0208	2.03235420894172e-05	180355807	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0192	NA	NA	NA	4.12394568554575e-21	198124	200350
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	237952	15	13	-0.7021	4.12394568554575e-21	198124	200350	1.10419623683954e-19	237952	241674
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	17482872	6071	5863	0.0049	1.10419623683954e-19	237952	241674	4.98232159411471e-28	17482872	17482872
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-2.1483	4.98232159411471e-28	17482872	17482872	3.47713547628458e-28	17488010	17488010
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	31385778	5054	4882	-0.0035	3.47713547628458e-28	17488010	17488010	0	31385778	31387708
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-4.3337	0	31385778	31387708	0	31395330	31418006
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	54035000	8801	8517	0.0072	0	31395330	31418006	5.88426752180859e-166	54035000	54035000
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.2999	5.88426752180859e-166	54035000	54035000	1.69243083790589e-184	54042734	54042734
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2689	-0.0048	1.69243083790589e-184	54042734	54042734	3.42322650809298e-08	67048434	67068673
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.6644	3.42322650809298e-08	67048434	67068673	1.15038717947856e-07	67093216	67111812
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	103841482	10430	10087	-0.006	1.15038717947856e-07	67093216	67111812	4.84406646002054e-250	103841482	103841482
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.4227	4.84406646002054e-250	103841482	103841482	2.38076758535226e-251	103868154	103868154
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20420	-0.0085	2.38076758535226e-251	103868154	103868154	9.8970097696621e-18	165642393	165643653
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1884	9.8970097696621e-18	165642393	165643653	1.72225426338009e-16	165650610	165650610
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1758	-0.0128	1.72225426338009e-16	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	11	0.6023	NA	NA	NA	1.40333458782794e-11	163711	178408
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	71894353	21775	21078	-5e-04	1.40333458782794e-11	163711	178408	1.24700092172807e-33	71894353	71894353
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.3516	1.24700092172807e-33	71894353	71894353	1.00894088737819e-33	71912065	71912065
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	87505582	4656	4503	4e-04	1.00894088737819e-33	71912065	71912065	2.23486804120423e-08	87503487	87505582
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	87506979	87509914	3	3	-0.9817	2.23486804120423e-08	87503487	87505582	4.74163010025924e-08	87509914	87511121
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	87511121	133433384	19647	19006	-0.0027	4.74163010025924e-08	87509914	87511121	7.15674406849238e-14	133432281	133433384
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	0.8206	7.15674406849238e-14	133432281	133433384	7.136228958103e-14	133448277	133453811
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	147702365	6352	6148	0.001	7.136228958103e-14	133448277	133453811	1.15353265496587e-41	147702365	147702365
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.6159	1.15353265496587e-41	147702365	147702365	4.08061230188794e-39	147707161	147707161
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4095	-0.0014	4.08061230188794e-39	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	0.0372	NA	NA	NA	7.83591756804398e-21	581533	581533
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.0424	7.83591756804398e-21	581533	581533	2.61909797691854e-25	588865	588865
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7771	-0.0029	2.61909797691854e-25	588865	588865	3.13107536540534e-14	25120552	25120552
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.13107536540534e-14	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.546	NA	NA	NA	3.67259430895419e-14	25125700	25125700
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	137748793	33552	32489	-0.0021	3.67259430895419e-14	25125700	25125700	8.27254054137246e-94	137737806	137751905
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	31	-0.9832	8.27254054137246e-94	137737806	137751905	8.398579527661e-85	137919308	137931707
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	145328970	2518	2418	0.0071	8.398579527661e-85	137919308	137931707	6.71423665337489e-07	145327758	145328970
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145330767	145330767	1	0	NA	6.71423665337489e-07	145327758	145328970	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-1.137	NA	NA	NA	5.001523386487e-07	145334573	145336073
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	286	0.0275	5.001523386487e-07	145334573	145336073	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	28650762	9406	9099	-0.0029	NA	NA	NA	1.80355404347947e-44	28649097	28656365
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28652799	28652799	1	0	NA	1.80355404347947e-44	28649097	28656365	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28656365	28696126	20	19	-0.8654	NA	NA	NA	1.01301227185670e-43	28688497	28699136
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28699136	100348045	13566	13123	-0.0049	1.0130122718567e-43	28688497	28699136	3.96336151046479e-19	100348045	100348045
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.7798	3.96336151046479e-19	100348045	100348045	2.20243859590967e-18	100350814	100350814
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	137352394	13844	13375	-0.0012	2.20243859590967e-18	100350814	100350814	6.65245427020529e-13	137352394	137352394
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5006	6.65245427020529e-13	137352394	137352394	8.10108523353123e-11	137356880	137356880
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1061	0	8.10108523353123e-11	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9401	-0.0025	NA	NA	NA	8.64611776823748e-68	27038538	27038538
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.3077	8.64611776823748e-68	27038538	27038538	4.68789688526416e-67	27041812	27041812
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14373	-0.0041	4.68789688526416e-67	27041812	27041812	1.11739739312111e-31	77917893	77917893
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.2914	1.11739739312111e-31	77917893	77917893	1.98605210993191e-30	77928669	77928669
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135126486	20170	19493	-0.001	1.98605210993191e-30	77928669	77928669	7.62716450310579e-29	135122727	135135745
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135129257	135229796	35	33	0.5486	7.62716450310579e-29	135122727	135135745	0.000302507015595617	135202362	135254461
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135252519	135285645	9	9	0.0972	0.000302507015595617	135202362	135254461	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1715	0.0061	NA	NA	NA	6.31792391329574e-245	4923300	4923300
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.2764	6.31792391329574e-245	4923300	4923300	4.27974912395951e-286	4932214	4932214
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55123719	15129	14596	6e-04	4.27974912395951e-286	4932214	4932214	3.95262903766109e-22	55097753	55127355
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	36	0.4514	3.95262903766109e-22	55097753	55127355	1.94645169687753e-21	55205278	55223056
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	107153485	18225	17646	0.002	1.94645169687753e-21	55205278	55223056	1.32791157656592e-08	107148977	107155002
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107155002	107177546	11	10	0.5414	1.32791157656592e-08	107148977	107155002	1.23421630768872e-08	107176389	107183398
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	134105421	10024	9694	0.001	1.23421630768872e-08	107176389	107183398	1.28427279211458e-12	134105421	134105421
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134109095	134111832	2	2	-1.4409	1.28427279211458e-12	134105421	134105421	4.70980067382923e-13	134111832	134111832
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134113671	134450318	98	96	0.0155	4.70980067382923e-13	134111832	134111832	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	889	0.0174	NA	NA	NA	7.62141344766051e-09	2105615	2115933
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.6124	7.62141344766051e-09	2105615	2115933	1.91567893572218e-07	2125504	2135894
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	2128807	1	0	NA	1.91567893572218e-07	2125504	2135894	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2130138	9523923	2814	2699	0.0069	NA	NA	NA	6.36070407890844e-35	9516067	9543817
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.9718	6.36070407890844e-35	9516067	9543817	2.43198703218924e-35	9582696	9604633
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11104973	570	541	-0.0235	2.43198703218924e-35	9582696	9604633	5.79591400509974e-18	11104085	11110735
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.7344	5.79591400509974e-18	11104085	11110735	1.83119770434491e-11	11128557	11151185
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	65	-0.0086	1.83119770434491e-11	11128557	11151185	8.4856230604221e-18	11393473	11395862
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.309	8.4856230604221e-18	11393473	11395862	1.86892851891968e-26	11435643	11435643
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31890222	7034	6797	-0.0026	1.86892851891968e-26	11435643	11435643	7.9827992404527e-12	31872587	31909285
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31899792	31949481	8	8	0.6985	7.9827992404527e-12	31872587	31909285	2.80371562584393e-12	31934793	31961505
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31954769	41303729	2209	2118	-0.0073	2.80371562584393e-12	31934793	31961505	5.18782565742157e-08	41303729	41303729
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41309802	2	2	-1.1558	5.18782565742157e-08	41303729	41303729	5.29472669774516e-08	41309802	41312478
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41312478	46992235	1818	1767	-0.0101	5.29472669774516e-08	41309802	41312478	9.32359956551825e-60	46992235	46992235
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-3.0643	9.32359956551825e-60	46992235	46992235	3.19372891015693e-57	46996769	46996769
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	132289090	29676	28626	0.0044	3.19372891015693e-57	46996769	46996769	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7104	-0.0092	NA	NA	NA	5.93668231862886e-38	37953582	37953582
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.4868	5.93668231862886e-38	37953582	37953582	1.45741644799534e-40	37957844	37957844
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4709	-0.0097	1.45741644799534e-40	37957844	37957844	2.75824089306276e-71	49964838	49964838
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.3076	2.75824089306276e-71	49964838	49964838	1.64343960124548e-70	49971732	49971732
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71373779	5441	5241	5e-04	1.64343960124548e-70	49971732	49971732	1.65423436922461e-24	71373779	71373779
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71375082	71375082	1	0	NA	1.65423436922461e-24	71373779	71373779	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-1.9782	NA	NA	NA	3.52935788468312e-24	71377671	71377671
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	100690991	9415	9107	-0.0039	3.52935788468312e-24	71377671	71377671	1.49110329649051e-45	100690991	100690991
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.7056	1.49110329649051e-45	100690991	100690991	6.9311554892749e-44	100693892	100693892
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4420	-0.0136	6.9311554892749e-44	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	4	-0.1003	NA	NA	NA	0.00550937807488157	18508651	19295733
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	19494416	55	54	-0.6233	0.00550937807488157	18508651	19295733	1.66438743502608e-55	19489920	19535787
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	22323889	1359	1319	-0.0091	1.66438743502608e-55	19489920	19535787	5.51742760505519e-09	22322884	22323889
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22329518	22331258	3	3	-1.06	5.51742760505519e-09	22322884	22323889	2.03596981610781e-09	22331258	22334001
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22334001	105607572	30223	29196	-0.0017	2.03596981610781e-09	22331258	22334001	2.63628339955039e-08	105594189	105609466
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105673157	10	10	0.5464	2.63628339955039e-08	105594189	105609466	2.41462924254020e-07	105632168	105724133
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105681007	106231012	183	176	-0.0316	2.4146292425402e-07	105632168	105724133	1.17682268237757e-06	106223137	106231012
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106232699	106234009	2	2	-1.2649	1.17682268237757e-06	106223137	106231012	1.55150593476074e-07	106234009	106234009
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106235367	106358491	45	44	0.0142	1.55150593476074e-07	106234009	106234009	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0372	NA	NA	NA	1.50068402077569e-08	18450562	18452491
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18835660	9	8	-0.7903	1.50068402077569e-08	18450562	18452491	0.0115202277909155	18824622	18860281
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18837737	18867285	11	11	-1.2486	0.0115202277909155	18824622	18860281	1.26736559632312e-06	18857376	18884436
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18874259	20088256	131	126	-0.6984	1.26736559632312e-06	18857376	18884436	3.39501172382605e-182	20065525	20308014
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	59468560	14825	14378	-0.0052	3.39501172382605e-182	20065525	20308014	8.54822940225054e-13	59468560	59468560
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-1.2233	8.54822940225054e-13	59468560	59468560	7.35094257567992e-13	59483715	59483715
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	100298352	16338	15807	0.0017	7.35094257567992e-13	59483715	59483715	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31854794	10571	10236	0.0144	NA	NA	NA	1.10405541639565e-29	31841022	32481309
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33647856	48	48	-0.4538	1.10405541639565e-29	31841022	32481309	1.76998748750391e-30	33536526	33846647
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	75093957	9904	9564	0.0035	1.76998748750391e-30	33536526	33846647	4.10567558611864e-45	75093957	75093957
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.7059	4.10567558611864e-45	75093957	75093957	1.33397699077234e-40	75100865	75100865
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4969	-9e-04	1.33397699077234e-40	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	6068	0.0218	NA	NA	NA	4.23501302249115e-162	15727076	15727076
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.2641	4.23501302249115e-162	15727076	15727076	2.20899287346151e-170	15733964	15733964
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5525	0.009	2.20899287346151e-170	15733964	15733964	3.24549894061838e-07	31431640	31471890
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.3586	3.24549894061838e-07	31431640	31471890	2.64136256837788e-07	31483188	31898606
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	352	0.0047	2.64136256837788e-07	31483188	31898606	1.9383134743338e-157	32828797	32828797
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.9006	1.9383134743338e-157	32828797	32828797	5.84705920320072e-139	32832642	32832642
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1402	0.0247	5.84705920320072e-139	32832642	32832642	1.16894233111847e-122	36673853	36673853
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-2.6639	1.16894233111847e-122	36673853	36673853	3.36577759559022e-130	36684619	36684619
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1979	0.0315	3.36577759559022e-130	36684619	36684619	3.29406445882568e-29	41561017	41573295
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	47	-0.432	3.29406445882568e-29	41561017	41573295	3.01223389925996e-27	42142363	42159958
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	55301891	4784	4614	0.0168	3.01223389925996e-27	42142363	42159958	2.06593450745231e-10	55299462	55306486
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55305324	55326447	12	12	0.5731	2.06593450745231e-10	55299462	55306486	1.24539254251612e-10	55322991	55331910
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55328074	68326225	4611	4463	0.0095	1.24539254251612e-10	55322991	55331910	1.07003058438010e-08	68326225	68326225
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68329393	2	2	-1.2451	1.0700305843801e-08	68326225	68326225	1.20923461011200e-08	68329393	68329393
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68331629	68331629	1	0	NA	1.209234610112e-08	68329393	68329393	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4112	0.0141	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15660	-0.0049	NA	NA	NA	1.16797195318252e-10	53092949	53092949
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.3238	1.16797195318252e-10	53092949	53092949	2.57532260146593e-10	53099601	53101512
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6544	-0.0086	2.57532260146593e-10	53099601	53101512	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59414898	21055	20346	0.026	NA	NA	NA	1.18171829098116e-15	59412581	59421197
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7316	1.18171829098116e-15	59412581	59421197	1.85498525785858e-15	59434159	59440274
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1929	0.0106	1.85498525785858e-15	59434159	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	566	0.0033	NA	NA	NA	1.49653012701122e-87	1506379	1515948
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.9841	1.49653012701122e-87	1506379	1515948	8.61897397589889e-105	1525300	1531162
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20325	-0.001	8.6189739758989e-105	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13010	-0.001	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22590752	2973	2867	0.0181	NA	NA	NA	1.01344571696406e-08	22569191	22603439
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22592087	22725305	32	31	-0.317	1.01344571696406e-08	22569191	22603439	6.63184598363747e-09	22712211	22752728
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13099	0.0142	6.63184598363747e-09	22712211	22752728	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	759	0.0245	NA	NA	NA	1.59689259809746e-10	1427338	1431240
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9691	1.59689259809746e-10	1427338	1431240	3.12995589609606e-10	1432891	1434970
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	964	0.0144	3.12995589609606e-10	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6465033	1201	1172	0.9108	0	2708113	2711273	1.45131815443535e-50	6453710	6470492
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6468305	6843577	66	62	1.5171	1.45131815443535e-50	6453710	6470492	6.23913877629741e-53	6828667	6866899
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6854519	76998610	21672	20931	0.932	6.23913877629741e-53	6828667	6866899	3.01681166460328e-19	76998610	76998610
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.0588	3.01681166460328e-19	76998610	76998610	3.42472395190093e-19	77010018	77010018
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21392	0.9322	3.42472395190093e-19	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0037	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2751482	17	16	-4.2568	NA	NA	NA	6.79760188171511e-06	2746125	2760469
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2752027	2784560	18	17	-2.8718	6.79760188171511e-06	2746125	2760469	0.00173817815483705	2775895	2812116
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3223585	88	85	-3.8568	0.00173817815483705	2775895	2812116	7.3782399193236e-27	3219200	3772482
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	7.3782399193236e-27	3219200	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0836	NA	NA	NA	3.41624224427139e-11	5422507	6696721
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6970768	130	123	-3.4768	3.41624224427139e-11	5422507	6696721	9.70095791705093e-06	6912779	7031936
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6971636	7461576	166	165	-2.6698	9.70095791705093e-06	6912779	7031936	1.63966949572979e-07	7349064	7590569
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	79	-3.6882	1.63966949572979e-07	7349064	7590569	0.000111280259495339	7697921	7798534
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7996758	76	70	-2.7565	0.000111280259495339	7697921	7798534	1.90967986586468e-05	7897073	8016395
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	8178487	40	38	-3.8726	1.90967986586468e-05	7897073	8016395	7.87020275057444e-05	8161536	8179883
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-2.3771	7.87020275057444e-05	8161536	8179883	2.02676792132092e-05	8195174	8204414
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8280065	20	18	-4.0287	2.02676792132092e-05	8195174	8204414	3.28010537270855e-12	8259766	8289709
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8316416	12	12	-2.0901	3.28010537270855e-12	8259766	8289709	6.78634390467154e-08	8308608	8324328
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	8370019	15	13	-3.5375	6.78634390467154e-08	8308608	8324328	0.0186029036649235	8341218	8442618
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8378918	8463583	14	12	-2.5319	0.0186029036649235	8341218	8442618	1.21294617299006e-05	8446542	8477958
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	8538835	18	18	-3.9776	1.21294617299006e-05	8446542	8477958	2.5904180922977e-06	8533866	8546737
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8689019	54	54	-2.694	2.5904180922977e-06	8533866	8546737	5.59552468002229e-08	8652693	8719458
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8690572	10513747	192	183	-3.6518	5.59552468002229e-08	8652693	8719458	7.35841508846434e-22	10511255	10537808
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	17	-0.9157	7.35841508846434e-22	10511255	10537808	5.80918457050599e-10	11249952	11698871
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-3.9496	5.80918457050599e-10	11249952	11698871	5.15681427272391e-10	12537944	12546917
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	50	-1.8366	5.15681427272391e-10	12537944	12546917	1.01372871092511e-10	12658135	12710000
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.7491	1.01372871092511e-10	12658135	12710000	3.37711067136463e-08	12804329	12859309
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	111	-2.1374	3.37711067136463e-08	12804329	12859309	8.25912371409977e-08	13114969	13136828
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13153117	12	12	-4.1171	8.25912371409977e-08	13114969	13136828	0.00136341738252081	13148290	13166582
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	29	-2.6933	0.00136341738252081	13148290	13166582	8.75204945452555e-08	13232295	13285595
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14352278	370	352	-3.8456	8.75204945452555e-08	13232295	13285595	3.66589155903402e-11	14320016	14382361
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	88	-2.9711	3.66589155903402e-11	14320016	14382361	2.40286273832055e-05	14491287	14538156
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.40286273832055e-05	14491287	14538156	NA	NA	NA
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14566592	22	22	-1.5822	NA	NA	NA	0.00285927628435344	14550971	14572190
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14569287	14598838	9	9	-3.2508	0.00285927628435344	14550971	14572190	1.78900671427017e-05	14596156	14598838
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-1.0276	1.78900671427017e-05	14596156	14598838	2.09142267526090e-08	14644293	14681738
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14697315	11	11	-2.8943	2.0914226752609e-08	14644293	14681738	0.000132613920917051	14695441	14705886
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14883615	45	42	-4.0306	0.000132613920917051	14695441	14705886	7.9717138410393e-07	14841337	14969835
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15284717	128	126	-3.0669	7.9717138410393e-07	14841337	14969835	2.59350400491746e-07	15252823	15309005
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	94	-3.8258	2.59350400491746e-07	15252823	15309005	8.21546312560454e-09	15431247	15433122
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.5522	8.21546312560454e-09	15431247	15433122	2.11458434133640e-22	15447091	15447091
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15473709	19	19	-4.0931	2.1145843413364e-22	15447091	15447091	4.80265948971539e-06	15471179	15475310
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15475310	15499052	5	5	-2.7597	4.80265948971539e-06	15471179	15475310	1.53554246229605e-06	15499052	15499052
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15501930	15523178	7	7	-4.266	1.53554246229605e-06	15499052	15499052	0.170276781225108	15521958	15862122
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	16387273	251	245	-3.1626	0.170276781225108	15521958	15862122	1.24299761918119e-07	16156464	16719600
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22139807	938	902	-3.6581	1.24299761918119e-07	16156464	16719600	9.38974501500268e-07	22049641	22139807
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.5173	9.38974501500268e-07	22049641	22139807	4.24934624418686e-28	22177335	22177335
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22308420	30	30	-4.4806	4.24934624418686e-28	22177335	22177335	1.45075784195077e-13	22268552	22367156
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22407622	11	10	-2.6696	1.45075784195077e-13	22268552	22367156	0.00396439305875344	22395796	22845338
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22767553	25737663	54	50	-3.9155	0.00396439305875344	22395796	22845338	3.14625733700968e-47	23283689	26870361
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-0.9904	3.14625733700968e-47	23283689	26870361	1.33123952012567e-22	26945084	26945893
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.8033	1.33123952012567e-22	26945084	26945893	0.000136424055657156	26965406	27003308
MSK_252152914946_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	45	-1.1059	0.000136424055657156	26965406	27003308	NA	NA	NA
