Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	15157302	5073	4941	0.0223	NA	NA	NA	2.01940991083191e-08	15155742	15157302
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15158665	15162189	3	3	-1.0094	2.01940991083191e-08	15155742	15157302	3.10208882950683e-08	15162189	15163929
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15163929	72537426	22818	22293	0.0062	3.10208882950683e-08	15162189	15163929	0	72537426	72537426
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.3965	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84484082	3488	3412	0.0038	0	72579311	72579311	1.13862374515103e-09	84484082	84484082
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.2644	1.13862374515103e-09	84484082	84484082	2.00593811612768e-09	84487429	84487429
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	108533257	7638	7464	0.0014	2.00593811612768e-09	84487429	84487429	9.55090293921194e-239	108533257	108535814
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-5.0939	9.55090293921194e-239	108533257	108535814	4.13836969103502e-167	108537259	108538662
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110023268	572	566	-0.003	4.13836969103502e-167	108537259	108538662	5.78498472294707e-31	110023268	110023268
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-1.6873	5.78498472294707e-31	110023268	110023268	4.9780423461546e-35	110041712	110041712
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147308557	4557	4440	-0.0105	4.9780423461546e-35	110041712	110041712	4.52543604974526e-11	146274661	147346371
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147311437	147510532	34	33	0.3238	4.52543604974526e-11	146274661	147346371	3.31844997312891e-09	147475854	148123789
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1235	0.0087	3.31844997312891e-09	147475854	148123789	8.2446917193761e-19	150839754	150839754
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	4	-1.259	8.2446917193761e-19	150839754	150839754	2.38217779186987e-19	150851439	150851439
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	78	-0.066	2.38217779186987e-19	150851439	150851439	1.60988436733177e-14	151026228	151026228
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9607	1.60988436733177e-14	151026228	151026228	3.49341640322827e-10	151036435	151038091
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2616	0.0085	3.49341640322827e-10	151036435	151038091	1.86012908136304e-108	157133150	157133150
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.275	1.86012908136304e-108	157133150	157133150	4.7405813791084e-115	157136342	157136342
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11061	-0.0097	4.7405813791084e-115	157136342	157136342	4.70226114535638e-14	185979586	185979586
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.5161	4.70226114535638e-14	185979586	185979586	1.4278633502962e-13	185988138	185988138
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	246769018	21458	20975	-4e-04	1.4278633502962e-13	185988138	185988138	2.19455765713919e-23	246753652	246806669
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246882156	32	31	-0.4997	2.19455765713919e-23	246753652	246806669	1.00253909963920e-15	246864725	246906110
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	91	0.0041	1.0025390996392e-15	246864725	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	11738	-0.0044	NA	NA	NA	2.89730479829032e-21	35821494	35821494
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.8628	2.89730479829032e-21	35821494	35821494	1.75216694959465e-23	35844884	35844884
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	857	-0.0407	1.75216694959465e-23	35844884	35844884	7.454486443494e-35	37800512	37815049
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37858379	23	23	-0.7393	7.454486443494e-35	37800512	37815049	2.64493501139865e-40	37852371	37859985
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	52600588	5800	5662	0.0019	2.64493501139865e-40	37852371	37859985	3.97252769006350e-274	52600588	52600588
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	3.9725276900635e-274	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-4.5846	NA	NA	NA	1.05526618168577e-271	52635695	52635695
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	153167113	28213	27529	-0.0026	1.05526618168577e-271	52635695	52635695	1.013948413564e-40	153167113	153167113
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	153168326	153169656	2	2	-2.5364	1.013948413564e-40	153167113	153167113	2.05355894575275e-39	153169656	153169656
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	153172033	179767214	9330	9099	-0.0024	2.05355894575275e-39	153169656	153169656	4.14571578583205e-09	179764819	179767214
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.0193	4.14571578583205e-09	179764819	179767214	4.47216407589595e-09	179778919	179791128
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242506262	21477	21005	-1e-04	4.47216407589595e-09	179778919	179791128	6.01437095509193e-09	242469111	242538557
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242666498	58	55	0.2368	6.01437095509193e-09	242469111	242538557	0.0100520088092766	242545993	242677011
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242666531	242689978	7	7	-0.0804	0.0100520088092766	242545993	242677011	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	10190905	3538	3450	-0.0032	NA	NA	NA	4.34089923841125e-08	10187587	10190905
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	10192864	10192864	1	0	NA	4.34089923841125e-08	10187587	10190905	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	10195369	10197328	2	2	-1.1217	NA	NA	NA	2.32784211894591e-07	10197328	10202829
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	10201053	10201053	1	0	NA	2.32784211894591e-07	10197328	10202829	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	10202829	32074432	7254	7065	-0.0084	NA	NA	NA	1.68436152176363e-46	32074432	32074432
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.6902	1.68436152176363e-46	32074432	32074432	6.84285812556397e-43	32080848	32080848
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1841	0.004	6.84285812556397e-43	32080848	32080848	8.3896584365095e-11	37949781	37953375
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7887	8.3896584365095e-11	37949781	37953375	5.22428400243123e-11	37961110	37963014
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3447	-0.002	5.22428400243123e-11	37961110	37963014	1.65790154649491e-39	47460892	47460892
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.5755	1.65790154649491e-39	47460892	47460892	2.50166837047628e-35	47466921	47466921
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	53001678	2442	2382	0.0296	2.50166837047628e-35	47466921	47466921	1.52960095471331e-09	52999601	53001678
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.8266	1.52960095471331e-09	52999601	53001678	4.60972929327193e-10	53011885	53014254
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	75479859	8209	7998	-0.0104	4.60972929327193e-10	53011885	53014254	6.45705788026686e-13	75461860	75791158
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76000715	19	19	-0.4821	6.45705788026686e-13	75461860	75791158	1.50153728940667e-13	75870144	76032165
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	99891210	5288	5150	0.0055	1.50153728940667e-13	75870144	76032165	5.15232302944241e-216	99891210	99891210
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.8484	5.15232302944241e-216	99891210	99891210	1.40594742864132e-215	99897201	99897201
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20802	-0.0031	1.40594742864132e-215	99897201	99897201	1.25954936160049e-303	163992903	163992903
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-5.6637	1.25954936160049e-303	163992903	163992903	3.92301209026697e-66	164005577	164005577
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	3	-1.4322	3.92301209026697e-66	164005577	164005577	4.45555690082258e-14	164027724	164036648
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-5.1279	4.45555690082258e-14	164027724	164036648	0	164107951	164107951
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8900	-0.0043	0	164107951	164107951	6.35870594699677e-226	191219222	191219222
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-5.9761	6.35870594699677e-226	191219222	191219222	4.65992472681219e-236	191222891	191222891
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	194354505	1006	984	-0.0024	4.65992472681219e-236	191222891	191222891	0	194354505	194354505
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.407	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196920748	1010	980	-0.0041	0	194366950	194366950	2.77665475075572e-08	196914122	196927528
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196924077	196961238	17	16	-0.428	2.77665475075572e-08	196914122	196927528	6.53156095181348e-09	196945209	196972067
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	935	0.0035	6.53156095181348e-09	196945209	196972067	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3309	0.0108	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.5326	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	20976426	3141	3063	-0.0181	0	9842644	9842644	2.38969222084799e-09	20974579	20976426
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20978464	20988104	5	5	-0.8054	2.38969222084799e-09	20974579	20976426	1.80799666369631e-09	20988104	20989307
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20989307	107156970	24570	23987	-6e-04	1.80799666369631e-09	20988104	20989307	4.87936547761728e-13	107156970	107156970
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107159916	107161814	2	2	-1.4744	4.87936547761728e-13	107156970	107156970	3.20735099823095e-13	107161814	107161814
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107163423	191153613	24046	23400	-6e-04	3.20735099823095e-13	107161814	107161814	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	41259482	11754	11465	-0.0052	NA	NA	NA	7.37790174855014e-10	41256311	41259482
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41267407	41278538	4	4	-0.9144	7.37790174855014e-10	41256311	41259482	1.33139230876374e-09	41278538	41280531
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41280531	150181399	32096	31329	-0.0042	1.33139230876374e-09	41278538	41280531	6.35369836453793e-17	150171154	150181399
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8978	6.35369836453793e-17	150171154	150181399	4.91988766852069e-17	150202601	150204134
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9549	-3e-04	4.91988766852069e-17	150202601	150204134	2.32481701579654e-05	180186425	180346557
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.4912	2.32481701579654e-05	180186425	180346557	8.3732282367714e-06	180355807	180379352
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	-0.0229	8.3732282367714e-06	180355807	180379352	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	55	-0.0036	NA	NA	NA	5.31591299779115e-26	236535	246974
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	327962	46	46	-0.5713	5.31591299779115e-26	236535	246974	2.46740969890542e-47	323898	331014
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	32558677	11575	11285	2e-04	2.46740969890542e-47	323898	331014	1.07652537051798e-220	32558677	32558677
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	6	-3.39	1.07652537051798e-220	32558677	32558677	4.45016333104476e-25	32595402	32595402
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	-0.2688	4.45016333104476e-25	32595402	32595402	5.5362325292136e-25	32628420	32628420
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-3.5728	5.5362325292136e-25	32628420	32628420	3.14231466649148e-118	32633691	32633691
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	8096	3e-04	3.14231466649148e-118	32633691	32633691	8.84645326558493e-28	54035000	54035000
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.7496	8.84645326558493e-28	54035000	54035000	2.45117477921361e-29	54042734	54042734
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	66453686	2632	2564	-0.0033	2.45117477921361e-29	54042734	54042734	2.81707135305194e-35	66453686	66453686
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66456250	66460548	2	2	-2.3857	2.81707135305194e-35	66453686	66453686	7.98210820014017e-37	66460548	66460548
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66461980	79011979	3796	3704	0.0098	7.98210820014017e-37	66460548	66460548	3.37092973070981e-11	78990768	79024557
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	0.4972	3.37092973070981e-11	78990768	79024557	9.01751183580463e-11	79074911	79112799
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	715	-0.0064	9.01751183580463e-11	79074911	79112799	1.53125161390885e-243	81334248	81334248
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-5.2674	1.53125161390885e-243	81334248	81334248	3.97738297908858e-266	81348170	81348170
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	103841482	6031	5890	-0.0014	3.97738297908858e-266	81348170	81348170	6.44054987607787e-269	103841482	103841482
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.5847	6.44054987607787e-269	103841482	103841482	7.6938270907642e-262	103868154	103868154
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10262	0.0024	7.6938270907642e-262	103868154	103868154	0	134629897	134629897
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-5.1699	0	134629897	134629897	0	134635779	134635779
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10363	-0.0078	0	134635779	134635779	1.08421897906929e-288	165643653	165643653
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-5.4599	1.08421897906929e-288	165643653	165643653	3.14256248677248e-263	165649379	165649379
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1760	-0.0102	3.14256248677248e-263	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	39	0.0133	NA	NA	NA	4.92541456878588e-20	240576	244720
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-1.1302	4.92541456878588e-20	240576	244720	1.83626918105579e-19	254342	254342
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	16135701	5343	5206	0.0074	1.83626918105579e-19	254342	254342	2.43871812468923e-126	16135701	16135701
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.5075	2.43871812468923e-126	16135701	16135701	3.9183238582427e-125	16140018	16140018
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	118609124	33874	33079	0.0013	3.9183238582427e-125	16140018	16140018	4.14456722464446e-11	118607355	118609124
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118611324	118611324	1	0	NA	4.14456722464446e-11	118607355	118609124	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.1427	NA	NA	NA	1.58366985954679e-11	118620875	118622742
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141410894	10535	10284	1e-04	1.58366985954679e-11	118620875	118622742	1.03709155681753e-12	141408013	141414719
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.5987	1.03709155681753e-12	141408013	141414719	4.5018046026604e-07	141434131	141449014
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	113	0.0339	4.5018046026604e-07	141434131	141449014	7.63480525449612e-242	141690753	141690753
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-4.4403	7.63480525449612e-242	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	0	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142152205	166	162	0.0787	NA	NA	NA	1.29481792950225e-30	142152205	142152205
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-1.731	1.29481792950225e-30	142152205	142152205	3.19825119023221e-15	142166710	142166710
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-5.4706	3.19825119023221e-15	142166710	142166710	1.54755282386509e-177	142167908	142167908
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	149246022	3007	2941	0.0053	1.54755282386509e-177	142167908	142167908	2.66923843726391e-10	149205869	149308183
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149247151	149533575	43	43	-0.2883	2.66923843726391e-10	149205869	149308183	1.73176942400705e-09	149492796	149619471
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149535432	151728811	921	894	-0.0023	1.73176942400705e-09	149492796	149619471	6.46833963213448e-08	151723833	151728811
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	9	-0.5651	6.46833963213448e-08	151723833	151728811	1.44974156707722e-07	151747905	151753700
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158821263	2598	2527	-0.0136	1.44974156707722e-07	151747905	151753700	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	579405	118	114	0.0016	NA	NA	NA	1.21256916879181e-100	579405	579405
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	581533	581533	1	0	NA	1.21256916879181e-100	579405	579405	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.5369	NA	NA	NA	4.33781396696388e-135	588865	588865
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2225	-0.0115	4.33781396696388e-135	588865	588865	3.89597067166155e-38	7226901	7226901
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-1.2304	3.89597067166155e-38	7226901	7226901	2.75109917894816e-35	7824059	7824059
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	11943616	1595	1558	-0.0051	2.75109917894816e-35	7824059	7824059	2.79991390782475e-15	11943616	12284724
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12284724	12511855	3	3	-1.3308	2.79991390782475e-15	11943616	12284724	2.14035342022225e-15	12448374	12511855
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12600375	25120552	4160	4058	-0.0043	2.14035342022225e-15	12448374	12511855	1.58517240465464e-33	25120552	25120552
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.58517240465464e-33	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.3613	NA	NA	NA	5.4850536335592e-35	25125700	25125700
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35539	-0.0013	5.4850536335592e-35	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5337	-0.0061	NA	NA	NA	8.42093549454502e-08	15801123	15802255
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.1205	8.42093549454502e-08	15801123	15802255	2.23525901885767e-07	15807123	15813356
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2484	-0.0081	2.23525901885767e-07	15807123	15813356	2.1208281635058e-234	23343915	23343915
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-5.0444	2.1208281635058e-234	23343915	23343915	8.07847196836653e-250	23365926	23365926
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4960	-0.0021	8.07847196836653e-250	23365926	23365926	8.90573050482426e-24	70926188	70926188
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.9243	8.90573050482426e-24	70926188	70926188	1.09324126206867e-22	70930528	70930528
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	112062107	13772	13453	-0.0106	1.09324126206867e-22	70930528	70930528	1.74567253281037e-160	112062107	112062107
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-5.0804	1.74567253281037e-160	112062107	112062107	1.48525314242198e-150	112069192	112069192
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	137352394	9991	9740	0.0063	1.48525314242198e-150	112069192	112069192	1.52603090835231e-23	137352394	137352394
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.045	1.52603090835231e-23	137352394	137352394	5.55946788164956e-20	137356880	137356880
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1073	-0.0034	5.55946788164956e-20	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	43776	-0.0054	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18896166	7372	7193	-0.002	NA	NA	NA	1.59785005580865e-09	18890351	18908541
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18932031	8	8	-0.6697	1.59785005580865e-09	18890351	18908541	2.05628175388077e-10	18917191	18938056
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18933855	55118214	9525	9296	-2e-04	2.05628175388077e-10	18917191	18938056	3.93114494659203e-21	55097753	55136234
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	40	-0.4207	3.93114494659203e-21	55097753	55136234	1.05818483501808e-22	55197848	55225136
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	58365114	1238	1208	-0.0075	1.05818483501808e-22	55197848	55225136	1.54204503936335e-08	58363571	58365114
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58367448	58368562	2	2	-1.1289	1.54204503936335e-08	58363571	58365114	1.34233243433496e-07	58368562	58368562
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58370027	134450318	27119	26463	-4e-04	1.34233243433496e-07	58368562	58368562	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3643	0.0033	NA	NA	NA	4.93343150890425e-110	9523923	9528590
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	1.5748	4.93343150890425e-110	9523923	9528590	1.03402675258659e-86	9607363	9610054
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	9626623	1	0	NA	1.03402675258659e-86	9607363	9610054	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	10465787	327	317	0.0021	NA	NA	NA	8.41584580670329e-06	10459455	10466791
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10466791	10485848	8	7	-0.5381	8.41584580670329e-06	10459455	10466791	5.29510083355692e-06	10484956	10498541
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	229	-0.0101	5.29510083355692e-06	10484956	10498541	5.90258587295418e-24	11112600	11116883
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.0341	5.90258587295418e-24	11112600	11116883	6.12691382152906e-23	11140421	11143592
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6672	0.0024	6.12691382152906e-23	11140421	11143592	3.0492550026371e-11	31081498	31173065
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	16	0.4873	3.0492550026371e-11	31081498	31173065	2.21965643913752e-10	31230579	31249495
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	33270966	764	741	0.0247	2.21965643913752e-10	31230579	31249495	4.33284579303951e-54	33270966	33270966
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-3.1969	4.33284579303951e-54	33270966	33270966	1.23226527900359e-62	33283825	33283825
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	130694393	32577	31810	0.0046	1.23226527900359e-62	33283825	33283825	2.55194071894575e-07	130690343	130694393
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.1619	2.55194071894575e-07	130690343	130694393	4.18286456928363e-07	130701040	130718440
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	630	0.0017	4.18286456928363e-07	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7168	-0.0016	NA	NA	NA	1.27892981775310e-43	37953582	37953582
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.6433	1.2789298177531e-43	37953582	37953582	1.42439200129111e-46	37957844	37957844
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	42494388	1842	1796	-0.0099	1.42439200129111e-46	37957844	37957844	3.28148239838887e-08	42491191	42494388
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42495671	42504585	6	6	0.6499	3.28148239838887e-08	42491191	42494388	7.85994826447287e-08	42504585	42510433
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42507464	49964838	3031	2965	0.0064	7.85994826447287e-08	42504585	42510433	4.47085959795811e-113	49964838	49964838
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-4.0938	4.47085959795811e-113	49964838	49964838	1.76163563706819e-96	49971732	49971732
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1766	-0.0028	1.76163563706819e-96	49971732	49971732	3.3587507590426e-17	56610886	56650373
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-0.6427	3.3587507590426e-17	56610886	56650373	4.42176855206309e-20	56685341	56688605
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	89659397	8253	8055	0.0029	4.42176855206309e-20	56685341	56688605	1.24004493122842e-09	89659397	89659397
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.2487	1.24004493122842e-09	89659397	89659397	2.22330510144402e-09	89662326	89662326
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9145	-0.0094	2.22330510144402e-09	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	56	-0.7862	NA	NA	NA	1.71081367714944e-110	19489920	19497023
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40670538	7587	7436	0.0098	1.71081367714944e-110	19489920	19497023	1.98907828450171e-09	40659171	40670538
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40676611	40676611	1	0	NA	1.98907828450171e-09	40659171	40670538	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40712006	6	6	-0.7195	NA	NA	NA	4.39787032548026e-09	40712006	40741934
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40722360	40722360	1	0	NA	4.39787032548026e-09	40712006	40741934	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73071404	11765	11476	-9e-04	NA	NA	NA	7.00994173534828e-185	73071404	73071404
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	-2.9044	7.00994173534828e-185	73071404	73071404	1.29830961918356e-64	73092112	73092112
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73307681	94	90	-4e-04	1.29830961918356e-64	73092112	73092112	6.59378903676255e-09	73306411	73307681
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73309616	73315317	4	4	-1.0383	6.59378903676255e-09	73306411	73307681	3.94256068063652e-12	73315317	73317195
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	106358491	12360	12064	-0.0012	3.94256068063652e-12	73315317	73317195	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3449	NA	NA	NA	1.06559838139319e-08	18452491	18741716
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19465359	93	93	-0.5857	1.06559838139319e-08	18452491	18741716	1.70405080251941e-42	19427350	19537035
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	57	-1.2986	1.70405080251941e-42	19427350	19537035	3.02448335943206e-228	20088256	20088256
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	22021181	324	313	-0.0343	3.02448335943206e-228	20088256	20088256	1.58621702040711e-11	21996787	22021181
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22038880	22250971	5	4	-1.0415	1.58621702040711e-11	21996787	22021181	1.84775336438059e-12	22250971	22351404
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	29415110	2139	2088	-0.0084	1.84775336438059e-12	22250971	22351404	2.01937820533532e-12	29413661	29415110
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29417651	29421554	4	4	-1.0402	2.01937820533532e-12	29413661	29415110	3.8791876190565e-12	29421554	29423113
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29423113	95609756	26702	26027	6e-04	3.8791876190565e-12	29421554	29423113	1.2619286766013e-08	95602982	95609756
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95656272	7	6	-0.7269	1.2619286766013e-08	95602982	95609756	1.14484511352222e-08	95656272	95661854
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95658438	100298352	1985	1929	-0.009	1.14484511352222e-08	95656272	95661854	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	12318252	4686	4579	0.0038	NA	NA	NA	1.56629943203056e-19	12316183	12318252
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12319679	12335502	8	8	-0.946	1.56629943203056e-19	12316183	12318252	1.99194645577687e-24	12335502	12337857
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12337857	14876356	774	759	9e-04	1.99194645577687e-24	12335502	12337857	1.85283787093978e-37	14687636	14876356
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.8782	1.85283787093978e-37	14687636	14876356	3.07398351646968e-32	15029941	15034210
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	68693086	12817	12527	0.0079	3.07398351646968e-32	15029941	15034210	1.13767358089574e-26	68693014	68693086
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.9481	1.13767358089574e-26	68693014	68693086	5.90010715965008e-27	68753209	68838384
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72941901	1455	1414	-0.0124	5.90010715965008e-27	68753209	68838384	5.52152476895811e-11	72929786	72941901
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72963578	4	4	-0.9687	5.52152476895811e-11	72929786	72941901	1.32129608967253e-10	72963578	73022578
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72964783	72964783	1	0	NA	1.32129608967253e-10	72963578	73022578	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	739	0.0239	NA	NA	NA	1.40201949701571e-09	75092501	75093957
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1114	1.40201949701571e-09	75092501	75093957	2.87187991102069e-13	75100865	75100865
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	590	-0.0167	2.87187991102069e-13	75100865	75100865	4.42811414028076e-17	76923844	76929598
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	0.825	4.42811414028076e-17	76923844	76929598	1.04804869810660e-12	76938723	76942679
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4413	-0.0074	1.0480486981066e-12	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	827	0.043	NA	NA	NA	6.4924621790218e-16	1904451	1904451
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.477	6.4924621790218e-16	1904451	1904451	8.52570929337606e-19	1906391	1906391
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	3129423	546	537	0.0062	8.52570929337606e-19	1906391	1906391	6.95188126880282e-09	3126409	3129423
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	3130616	3141820	7	7	0.6704	6.95188126880282e-09	3126409	3129423	2.00803276678372e-08	3141820	3147797
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	3143652	31457889	10627	10361	0.0127	2.00803276678372e-08	3141820	3147797	3.63062984510144e-34	31451114	31462463
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	0.7928	3.63062984510144e-34	31451114	31462463	1.69813439029770e-31	31493990	31889566
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36672710	1814	1776	0.0163	1.6981343902977e-31	31493990	31889566	1.79148138204386e-14	36668730	36672710
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.8861	1.79148138204386e-14	36668730	36672710	9.73885870961476e-16	36684619	36686013
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1989	0.0261	9.73885870961476e-16	36684619	36686013	1.50082463535101e-33	41562786	41573295
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	48	-0.4556	1.50082463535101e-33	41562786	41573295	6.4185999057629e-30	41708551	42159958
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13344	0.0123	6.4185999057629e-30	41708551	42159958	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	36509250	10981	10728	-0.0042	NA	NA	NA	6.90145966196085e-45	36509250	36509250
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.6812	6.90145966196085e-45	36509250	36509250	8.15620166650303e-45	36519728	36519728
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	5081	-0.0121	8.15620166650303e-45	36519728	36519728	9.23605928492291e-88	53092949	53092949
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.6902	9.23605928492291e-88	53092949	53092949	5.40221941752479e-84	53099601	53099601
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	75240793	6435	6298	-0.013	5.40221941752479e-84	53099601	53099601	4.91020781127651e-07	75229407	75256228
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75243011	75282954	16	15	0.3923	4.91020781127651e-07	75229407	75256228	6.56046748995272e-06	75269342	75295688
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75284189	76116026	312	305	-0.013	6.56046748995272e-06	75269342	75295688	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	479	0.0406	NA	NA	NA	4.02530185531501e-06	1395246	1398325
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.2071	4.02530185531501e-06	1395246	1398325	1.76849616554522e-06	1400840	1405308
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	9146708	3574	3471	0.0339	1.76849616554522e-06	1400840	1405308	9.79989363015125e-17	9146708	9146708
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9147742	9150878	2	2	1.8748	9.79989363015125e-17	9146708	9146708	1.06087573356830e-18	9150878	9150878
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9152145	12024977	1312	1280	0.0261	1.0608757335683e-18	9150878	9150878	1.48491123014894e-07	12018876	12024977
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12026895	12036294	5	5	-0.7294	1.48491123014894e-07	12018876	12024977	2.70899234688014e-07	12036294	12042405
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12040581	46027905	9764	9555	0.0183	2.70899234688014e-07	12036294	12042405	1.65380987793339e-07	46017563	46054503
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46032427	46063357	7	7	-0.6225	1.65380987793339e-07	46017563	46054503	1.70631124943620e-07	46055869	46087549
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	47866827	786	767	0.0088	1.7063112494362e-07	46055869	46087549	1.40059370935876e-06	47852800	47889429
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	47869257	48381822	15	15	-0.3973	1.40059370935876e-06	47852800	47889429	2.96606575857368e-07	48205963	48527052
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48437928	56825794	3915	3809	0.0301	2.96606575857368e-07	48205963	48527052	8.66922757533424e-09	56822197	56825794
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.6529	8.66922757533424e-09	56822197	56825794	4.17401397580572e-08	56840346	56846683
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	57895740	508	493	0.0092	4.17401397580572e-08	56840346	56846683	1.20864198863806e-31	57885454	57917477
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57900675	57900675	1	0	NA	1.20864198863806e-31	57885454	57917477	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57902641	58174756	61	59	0.4764	NA	NA	NA	6.69447400358303e-31	58163925	58190177
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58176026	59414898	604	588	0.0117	6.69447400358303e-31	58163925	58190177	1.07011938919579e-18	59414645	59414898
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.8335	1.07011938919579e-18	59414645	59414898	5.21271240411008e-14	59434202	59440274
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	22	-0.1224	5.21271240411008e-14	59434202	59440274	2.08754457905239e-07	59491509	59491509
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-2.1847	2.08754457905239e-07	59491509	59491509	5.46462979787056e-25	59497049	59497049
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1925	0.0051	5.46462979787056e-25	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	578	-0.0136	NA	NA	NA	1.85553806918636e-26	1499034	1499421
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1506379	1	0	NA	1.85553806918636e-26	1499034	1499421	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	0.9897	NA	NA	NA	4.2324740440146e-26	1532433	1544485
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20464	-0.0036	4.2324740440146e-26	1532433	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	3000	0.0023	NA	NA	NA	2.50511110479983e-296	22573420	22573420
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-5.661	2.50511110479983e-296	22573420	22573420	3.05542534728305e-299	22585040	22585040
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	36408845	5267	5146	-0.0064	3.05542534728305e-299	22585040	22585040	2.48016438132724e-12	36406529	36408845
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36410153	36414523	4	4	-1.0214	2.48016438132724e-12	36406529	36408845	1.29826720572750e-11	36414523	36415735
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36415735	46922972	5104	4961	-0.0016	1.2982672057275e-11	36414523	36415735	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21571489	2521	2464	0.0202	NA	NA	NA	1.44399899651831e-09	21570227	21571489
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.15	1.44399899651831e-09	21570227	21571489	1.03587458131546e-09	21576859	21576859
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22644243	458	449	0.0321	1.03587458131546e-09	21576859	21576859	5.75108284212252e-08	22599899	22701205
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22725305	23	22	-0.3567	5.75108284212252e-08	22599899	22701205	7.15046082108139e-08	22708012	22748062
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6399	0.0067	7.15046082108139e-08	22708012	22748062	2.99976865883703e-85	35472378	35472378
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.8062	2.99976865883703e-85	35472378	35472378	9.56540830859496e-80	35476942	35476942
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1175	0.0339	9.56540830859496e-80	35476942	35476942	5.16184223788297e-35	37683516	37689058
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-0.9049	5.16184223788297e-35	37683516	37689058	1.23637333140166e-32	37709300	37718669
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5601	0.0112	1.23637333140166e-32	37709300	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427338	786	766	-0.0307	NA	NA	NA	1.14819747169892e-12	1425580	1431240
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1427392	1427392	1	0	NA	1.14819747169892e-12	1425580	1431240	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2328	NA	NA	NA	2.06546489520880e-14	1432891	1432953
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	62	-0.0161	2.0654648952088e-14	1432891	1432953	6.43849476618986e-06	1526804	1528282
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.7281	6.43849476618986e-06	1526804	1528282	6.2648398995245e-05	1530474	1534998
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1870412	263	254	-0.0307	6.2648398995245e-05	1530474	1534998	5.22848683219155e-06	1868923	1870412
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1870855	1873302	3	3	-0.9212	5.22848683219155e-06	1868923	1870412	1.61424608622190e-06	1873302	1873761
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1873761	2302065	276	270	0.0131	1.6142460862219e-06	1873302	1873761	5.56431172115475e-14	2301365	2302065
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.191	5.56431172115475e-14	2301365	2302065	1.429098906434e-16	2304398	2304398
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2524308	220	216	-0.0322	1.429098906434e-16	2304398	2304398	1.20925557404089e-16	2524308	2524308
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2526074	2526103	2	2	-1.9398	1.20925557404089e-16	2524308	2524308	3.21889692577372e-11	2526103	2526103
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2532053	2708291	167	164	-0.0544	3.21889692577372e-11	2526103	2526103	0	2708113	2711273
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22352	1.0158	0	2708113	2711273	6.94945565665552e-17	76998610	76998610
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.806	6.94945565665552e-17	76998610	76998610	3.69479556406647e-17	77010018	77010018
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	151984603	21259	20738	1.0158	3.69479556406647e-17	77010018	77010018	5.71047292808468e-30	151973730	152021526
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152003904	152165149	54	53	1.4712	5.71047292808468e-30	151973730	152021526	1.12972767519899e-24	152156615	152216889
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152168728	154582414	880	859	0.9922	1.12972767519899e-24	152156615	152216889	0	154578922	154586690
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0326	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-4.6717	NA	NA	NA	4.10458139775198e-39	3223585	3733715
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	10	-0.6827	4.10458139775198e-39	3223585	3733715	3.24722278963653e-23	4431527	4597974
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7054924	181	173	-4.4194	3.24722278963653e-23	4431527	4597974	2.51804365298299e-07	7024303	7228333
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	114	-3.516	2.51804365298299e-07	7024303	7228333	1.59820481974609e-06	7341847	7572591
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7709619	73	71	-4.5719	1.59820481974609e-06	7341847	7572591	3.46445777014546e-05	7688250	7755522
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7997485	86	82	-3.7638	3.46445777014546e-05	7688250	7755522	7.66728190986786e-09	7870400	8086207
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10513747	370	358	-4.4737	7.66728190986786e-09	7870400	8086207	1.72834175571336e-44	10512616	10515697
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.959	1.72834175571336e-44	10512616	10515697	5.9140663593223e-10	10620136	11698871
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13119344	205	200	-3.644	5.9140663593223e-10	10620136	11698871	0.00477258606502407	13012038	13119344
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-1.1386	0.00477258606502407	13012038	13119344	0.000107877542105783	13128515	13133803
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13699223	216	210	-4.2805	0.000107877542105783	13128515	13133803	0.00292812156888247	13468655	13903405
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14342834	193	187	-4.6306	0.00292812156888247	13468655	13903405	2.90871127596281e-06	14225706	14404979
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	93	-4.0574	2.90871127596281e-06	14225706	14404979	6.11992875160029e-09	14506319	14528771
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14538156	6	6	-1.5517	6.11992875160029e-09	14506319	14528771	1.09771999618615e-10	14536962	14540351
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14539230	21036503	1268	1220	-4.409	1.09771999618615e-10	14536962	14540351	2.6611655020517e-08	21034708	21042490
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.8777	2.6611655020517e-08	21034708	21042490	2.97204708589405e-09	21047798	21057446
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	252	-4.4363	2.97204708589405e-09	21047798	21057446	3.25707767207066e-05	22049641	22165808
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.8452	3.25707767207066e-05	22049641	22165808	2.86275735548179e-07	22171771	22181855
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-4.6599	2.86275735548179e-07	22171771	22181855	7.82084816730278e-56	22926726	23283689
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945084	32	31	-1.505	7.82084816730278e-56	22926726	23283689	0.000374027950269152	26927707	26998633
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26945893	26945893	1	0	NA	0.000374027950269152	26927707	26998633	NA	NA	NA
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-3.1729	NA	NA	NA	2.40448659684073e-05	27007874	27069765
MSK_252152915063_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-1.1415	2.40448659684073e-05	27007874	27069765	NA	NA	NA
