Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5657	0.0237	NA	NA	NA	1.54199655623956e-09	16816180	16917759
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	16888048	1	0	NA	1.54199655623956e-09	16816180	16917759	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16917759	17094475	10	10	-0.6231	NA	NA	NA	3.6353793598393e-09	17094326	17107476
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	72537426	22095	21649	0.0057	3.6353793598393e-09	17094326	17107476	0	72537426	72537426
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.5989	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11444	0.0014	0	72579311	72579311	4.46354867664975e-08	110015739	110023268
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.914	4.46354867664975e-08	110015739	110023268	9.809382416719e-08	110041712	110060587
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	146294654	4553	4462	-0.0124	9.809382416719e-08	110041712	110060587	1.86076122635093e-14	146273215	147311437
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147847659	40	40	-0.3974	1.86076122635093e-14	146273215	147311437	1.31168210023336e-15	147490608	148115321
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150839754	1260	1226	0.0136	1.31168210023336e-15	147490608	148115321	6.11022551874459e-36	150839754	150839754
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	6.11022551874459e-36	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-2.7134	NA	NA	NA	2.06651384646158e-36	150846148	150846148
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	2.06651384646158e-36	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2700	0.0113	NA	NA	NA	4.72212058528104e-63	157133150	157133150
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.5591	4.72212058528104e-63	157133150	157133150	2.82026568652093e-66	157136342	157136342
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11090	-0.0067	2.82026568652093e-66	157136342	157136342	3.48925798275161e-09	185979586	185979586
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.3614	3.48925798275161e-09	185979586	185979586	7.68616073017031e-09	185988138	186000612
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1933	0.0029	7.68616073017031e-09	185988138	186000612	1.03783172749665e-08	194972886	195014129
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195097118	12	12	-0.5498	1.03783172749665e-08	194972886	195014129	3.97931893459871e-09	195065867	195106051
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	200609726	2158	2122	0.0035	3.97931893459871e-09	195065867	195106051	4.87288683471876e-10	200589108	200613454
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200672373	24	23	-0.4146	4.87288683471876e-10	200589108	200613454	2.11598003933787e-09	200665389	200689399
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	247186514	17420	17091	-5e-04	2.11598003933787e-09	200665389	200689399	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35553983	11921	11689	-1e-04	NA	NA	NA	2.10994727585812e-23	35553983	35553983
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-2.1472	2.10994727585812e-23	35553983	35553983	2.49439370151205e-21	35562007	35562007
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	35821494	101	100	0.0248	2.49439370151205e-21	35562007	35562007	1.45212186614845e-14	35821494	35821494
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.8371	1.45212186614845e-14	35821494	35821494	5.53204358659471e-18	35844884	35844884
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	40002525	1886	1845	-0.0204	5.53204358659471e-18	35844884	35844884	1.48545534592642e-22	39988395	40011650
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40005883	40099310	37	37	0.4685	1.48545534592642e-22	39988395	40011650	1.09729703153451e-21	40083302	40110640
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40103358	52600588	4783	4693	-0.0043	1.09729703153451e-21	40083302	40110640	2.05254432983684e-09	52588009	52600588
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.853	2.05254432983684e-09	52588009	52600588	2.49749614833553e-09	52635695	52639605
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	57251850	1554	1529	-0.009	2.49749614833553e-09	52635695	52639605	4.72382229306585e-15	57244746	57251850
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57263450	57300299	5	5	1.0756	4.72382229306585e-15	57244746	57251850	9.35217643312471e-15	57300299	57307517
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57307517	89624945	10025	9803	4e-04	9.35217643312471e-15	57300299	57307517	2.02319198504804e-10	89382979	89669803
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89635398	89902365	35	34	0.3507	2.02319198504804e-10	89382979	89669803	1.46810008782426e-10	89877995	91158269
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	179767214	25926	25410	-0.0059	1.46810008782426e-10	89877995	91158269	8.35815802837923e-09	179764819	179767214
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.0992	8.35815802837923e-09	179764819	179767214	9.97884250654203e-09	179778919	179791128
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242506262	21477	21085	-0.002	9.97884250654203e-09	179778919	179791128	4.9803858376768e-10	242482099	242532246
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242651363	53	53	0.2774	4.9803858376768e-10	242482099	242532246	0.0233300101979214	242535118	242655973
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242653323	242689978	12	12	-0.0046	0.0233300101979214	242535118	242655973	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10578	-0.0043	NA	NA	NA	8.51911099731074e-16	32074432	32074432
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.7316	8.51911099731074e-16	32074432	32074432	1.31682375705753e-14	32080848	32080848
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	133189686	32911	32282	-0.0013	1.31682375705753e-14	32080848	32080848	1.83656466457778e-13	133189686	133189686
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6646	1.83656466457778e-13	133189686	133189686	2.95231346916844e-14	133194685	133194685
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9583	-0.0034	2.95231346916844e-14	133194685	133194685	8.06988193221692e-86	164005577	164005577
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.5331	8.06988193221692e-86	164005577	164005577	2.18438927993439e-86	164027724	164027724
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	180409107	5161	5040	-0.0125	2.18438927993439e-86	164027724	164027724	2.61885097450858e-08	180407725	180410760
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	180410760	180419461	3	3	-1.0651	2.61885097450858e-08	180407725	180410760	1.87753196407506e-08	180411140	180419682
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	180419682	194354505	4986	4893	0.0017	1.87753196407506e-08	180411140	180419682	0	194354505	194354505
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.5728	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1938	0.0039	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	69075140	18435	18059	-0.0027	NA	NA	NA	1.49334765792146e-11	68901210	69088563
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69085386	69165814	12	11	-0.6509	1.49334765792146e-11	68901210	69088563	2.53299781897101e-11	69153675	69665979
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	95705936	9068	8885	-0.0019	2.53299781897101e-11	69153675	69665979	0	95703422	95708102
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95708102	96340884	288	284	-0.9049	0	95703422	95708102	0	96339669	96343268
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	96343268	173224400	21837	21394	-0.0054	0	96339669	96343268	1.80484214510494e-51	173224400	173224400
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.1051	1.80484214510494e-51	173224400	173224400	9.57340795480383e-58	173228860	173228860
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	184	0.0118	9.57340795480383e-58	173228860	173228860	1.02541918431214e-09	173660684	173660684
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.2802	1.02541918431214e-09	173660684	173660684	2.11977081491738e-08	173666072	173666072
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	190749363	5219	5113	0	2.11977081491738e-08	173666072	173666072	4.92270772947436e-17	190695751	190777444
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190752920	190913517	57	57	-0.3376	4.92270772947436e-17	190695751	190777444	2.64716887626909e-06	190885794	190945773
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190915643	191153613	48	47	-0.0125	2.64716887626909e-06	190885794	190945773	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21480789	6352	6235	-0.0043	NA	NA	NA	1.94758976836708e-11	21480789	21480789
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.4695	1.94758976836708e-11	21480789	21480789	1.40926288854240e-10	21487474	21487474
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	59519685	9848	9663	-0.0062	1.4092628885424e-10	21487474	21487474	2.9247399886694e-08	59517191	59519685
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59521690	59521690	1	0	NA	2.9247399886694e-08	59517191	59519685	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	3	-1.071	NA	NA	NA	4.28101289847019e-08	59531344	59535295
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	180644810	37560	36818	-0.0025	4.28101289847019e-08	59531344	59535295	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32548736	11676	11438	9e-04	NA	NA	NA	1.18387421952631e-277	32548736	32563252
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	18	-2.4404	1.18387421952631e-277	32548736	32563252	1.09543678274236e-21	32628420	32633691
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32709263	26	26	0.05	1.09543678274236e-21	32628420	32633691	0.00471401006830512	32693779	32739800
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32711957	32762061	23	22	0.4722	0.00471401006830512	32693779	32739800	4.33030034507358e-12	32732764	32775858
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	8066	-7e-04	4.33030034507358e-12	32732764	32775858	1.43307157357134e-146	54035000	54035000
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.3315	1.43307157357134e-146	54035000	54035000	7.08061334210645e-150	54042734	54042734
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	33662	-0.0039	7.08061334210645e-150	54042734	54042734	5.05746569118869e-181	165643653	165643653
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.1216	5.05746569118869e-181	165643653	165643653	1.49881347860553e-170	165650610	165650610
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1766	-6e-04	1.49881347860553e-170	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5269	0.0081	NA	NA	NA	7.84633813408613e-23	16135701	16135701
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-2.1211	7.84633813408613e-23	16135701	16135701	6.30821838821183e-23	16140018	16140018
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	16141776	1	0	NA	6.30821838821183e-23	16140018	16140018	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16145480	25945672	3353	3289	-0.0088	NA	NA	NA	7.86121657449457e-11	25945469	25946290
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25946290	25949466	4	4	-1.0459	7.86121657449457e-11	25945469	25946290	2.70299204735108e-10	25948315	25950020
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25950020	118611324	30517	29880	8e-04	2.70299204735108e-10	25948315	25950020	8.85271331010123e-139	118611324	118611324
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.2516	8.85271331010123e-139	118611324	118611324	7.35657967138754e-138	118620875	118620875
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	158821263	17427	17120	7e-04	7.35657967138754e-138	118620875	118620875	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7226901	2393	2344	-1e-04	NA	NA	NA	1.06521109525959e-24	7156900	7260442
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	7	-1.1933	1.06521109525959e-24	7156900	7260442	2.28755399438253e-25	7729311	7824059
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5640	-0.0016	2.28755399438253e-25	7729311	7824059	8.46406310121522e-12	25120552	25120552
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	8.46406310121522e-12	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.5366	NA	NA	NA	2.574188987452e-12	25125700	25125700
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	40888127	5411	5303	1e-04	2.574188987452e-12	25125700	25125700	5.90203530129385e-125	40888127	40888127
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40892587	40892587	1	0	NA	5.90203530129385e-125	40888127	40888127	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.7806	NA	NA	NA	5.62709801417977e-121	40897469	40897469
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30355	-8e-04	5.62709801417977e-121	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12813	-0.0021	NA	NA	NA	6.22705081401672e-72	70926188	70926188
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.6788	6.22705081401672e-72	70926188	70926188	1.73309714977345e-69	70930528	70930528
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23317	-0.0035	1.73309714977345e-69	70930528	70930528	6.52133502280383e-17	137352394	137352394
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.8456	6.52133502280383e-17	137352394	137352394	2.0563299189617e-14	137356880	137356880
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1062	0.0027	2.0563299189617e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9546	-0.0053	NA	NA	NA	1.58819504366778e-78	27038538	27038538
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.8762	1.58819504366778e-78	27038538	27038538	8.56358645816828e-77	27041812	27041812
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	56315035	7380	7245	-0.0105	8.56358645816828e-77	27041812	27041812	1.66913681034458e-10	56315035	56315035
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56316969	56321197	3	3	-1.2097	1.66913681034458e-10	56315035	56315035	1.03452712603191e-10	56321197	56327004
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56325023	56325023	1	0	NA	1.03452712603191e-10	56321197	56327004	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56327004	114100979	19872	19461	0	NA	NA	NA	2.93439523516515e-72	114100979	114100979
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.7215	2.93439523516515e-72	114100979	114100979	2.37302065050331e-69	114106460	114106460
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7672	-0.0056	2.37302065050331e-69	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1728	-8e-04	NA	NA	NA	3.13146668864555e-293	4923300	4923300
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-5.0591	3.13146668864555e-293	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14824	-0.0015	0	4932214	4932214	1.27009802718367e-23	55097753	55124730
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4911	1.27009802718367e-23	55097753	55124730	1.03411331610884e-22	55205278	55225136
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	107284914	18285	17910	0.0036	1.03411331610884e-22	55205278	55225136	1.74837932616771e-152	107284914	107284914
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-5.4839	1.74837932616771e-152	107284914	107284914	3.63022376826941e-163	107292148	107292148
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9866	-0.0044	3.63022376826941e-163	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2106791	919	896	0.0196	NA	NA	NA	4.25856371193145e-08	2101106	2109441
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2109441	2127537	8	8	-0.6363	4.25856371193145e-08	2101106	2109441	1.17610088893951e-07	2125504	2131554
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2761	2e-04	1.17610088893951e-07	2125504	2131554	1.68682499168376e-160	9523923	9523923
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.5672	1.68682499168376e-160	9523923	9523923	2.56049187043539e-155	9554149	9554149
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	11116883	582	564	-0.0117	2.56049187043539e-155	9554149	9554149	3.60028764433349e-21	11112600	11116883
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.1079	3.60028764433349e-21	11112600	11116883	3.75666067388026e-13	11140421	11147675
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	66	0.0302	3.75666067388026e-13	11140421	11147675	7.21338566827107e-17	11393473	11395862
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-1.2557	7.21338566827107e-17	11393473	11395862	7.33000810155802e-24	11435643	11435643
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	132289090	40749	39921	0.0039	7.33000810155802e-24	11435643	11435643	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	19310619	304	296	-0.0039	NA	NA	NA	4.27237481063052e-12	19303561	19313579
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19311820	19355808	16	16	0.6071	4.27237481063052e-12	19303561	19313579	4.91816397723709e-15	19343261	19380708
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19357527	37953582	7018	6881	-0.0024	4.91816397723709e-15	19343261	19380708	1.09976234071107e-44	37953582	37953582
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9237	1.09976234071107e-44	37953582	37953582	7.96126073741428e-48	37957844	37957844
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	40094913	849	834	-0.0231	7.96126073741428e-48	37957844	37957844	1.56494811514106e-06	40089896	40094913
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40096507	40103148	4	4	-0.8138	1.56494811514106e-06	40089896	40094913	1.85116001184210e-06	40103148	40108940
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40107140	49964838	4026	3937	0.0035	1.8511600118421e-06	40103148	40108940	4.19160594210742e-71	49964838	49964838
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.6846	4.19160594210742e-71	49964838	49964838	3.00119834898092e-66	49971732	49971732
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1781	-0.0042	3.00119834898092e-66	49971732	49971732	7.7248249467627e-13	56607869	56660235
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-0.6298	7.7248249467627e-13	56607869	56660235	3.18335264173176e-14	56677538	56686863
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	71375082	3624	3538	-0.0027	3.18335264173176e-14	56677538	56686863	1.40292123039831e-98	71375082	71375082
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2819	1.40292123039831e-98	71375082	71375082	8.64951641046993e-97	71377671	71377671
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13702	-0.0093	8.64951641046993e-97	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19453177	41	41	-0.3593	NA	NA	NA	1.08821507559951e-13	19433191	19465322
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19455232	34674458	5709	5584	0.0093	1.08821507559951e-13	19433191	19465322	4.69127341501424e-11	34666996	34674458
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.5099	4.69127341501424e-11	34666996	34674458	3.57450817506171e-11	34679959	34679959
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	73061942	13667	13374	-0.0023	3.57450817506171e-11	34679959	34679959	4.63612368937688e-69	73061942	73061942
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-1.9584	4.63612368937688e-69	73061942	73061942	4.23646304288843e-65	73092112	73092112
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	106218059	12406	12159	-8e-04	4.23646304288843e-65	73092112	73092112	2.15469731953564e-07	106207549	106223507
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106242757	12	12	-0.5269	2.15469731953564e-07	106207549	106223507	2.17234139638931e-08	106236795	106251081
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106249962	106358491	40	39	0.0891	2.17234139638931e-08	106236795	106251081	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2104	NA	NA	NA	0.00104979731184634	18427151	18842565
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20316992	154	152	-0.3167	0.00104979731184634	18427151	18842565	4.73026265396839e-37	20022359	20388723
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	100298352	31163	30547	-0.0019	4.73026265396839e-37	20022359	20388723	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	20123	0.0093	NA	NA	NA	9.5306685669986e-14	75093957	75093957
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.3887	9.5306685669986e-14	75093957	75093957	1.80997433571071e-13	75100865	75100865
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5033	-0.0023	1.80997433571071e-13	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13593	0.013	NA	NA	NA	1.70006623351295e-21	36672710	36673853
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.2268	1.70006623351295e-21	36672710	36673853	5.71826645383773e-21	36684619	36686013
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1978	0.0332	5.71826645383773e-21	36684619	36686013	1.7908160273971e-32	41558893	41572001
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	50	-0.484	1.7908160273971e-32	41558893	41572001	1.46254551802557e-30	42143048	42159958
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13434	0.0154	1.46254551802557e-30	42143048	42159958	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	53092949	16198	15888	-0.0078	NA	NA	NA	1.39182944717603e-12	53092949	53092949
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.575	1.39182944717603e-12	53092949	53092949	5.16396604728414e-12	53099601	53099601
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6631	-0.0099	5.16396604728414e-12	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	19465	0.0262	NA	NA	NA	0	56823430	56823430
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-4.3695	0	56823430	56823430	0	56840346	56840346
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1143	0.0172	0	56840346	56840346	3.61236330811963e-19	59414645	59414898
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.9003	3.61236330811963e-19	59414645	59414898	7.0237231265632e-19	59434202	59440262
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1963	0.0074	7.0237231265632e-19	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	0.0042	NA	NA	NA	8.99087045470162e-206	1506379	1511632
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-3.0971	8.99087045470162e-206	1506379	1511632	4.40666819729676e-225	1528899	1531162
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3629	5e-04	4.40666819729676e-225	1528899	1531162	3.70610408539117e-11	12095485	12095485
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4867	3.70610408539117e-11	12095485	12095485	2.62948356284898e-10	12113855	12113855
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16940	-0.0011	2.62948356284898e-10	12113855	12113855	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13169	-0.0018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696162	2990	2939	0.0262	NA	NA	NA	9.64348376757454e-13	22686731	22701205
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22720195	13	12	0.7265	9.64348376757454e-13	22686731	22701205	9.5166424712276e-15	22714979	22725305
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6433	0.0113	9.5166424712276e-15	22714979	22725305	4.95556173797134e-13	35472378	35472378
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.6613	4.95556173797134e-13	35472378	35472378	7.5898206837518e-12	35476942	35476942
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49567768	7002	6841	0.0179	7.5898206837518e-12	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1846	NA	NA	NA	0.000123846731190823	3237	98390
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	110101	11	11	-0.5156	0.000123846731190823	3237	98390	2.08025885833652e-07	106242	110583
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110583	124528	12	12	0.0289	2.08025885833652e-07	106242	110583	5.30765897061029e-08	124528	127113
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.1621	5.30765897061029e-08	124528	127113	2.22849551913687e-11	129104	130528
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427338	752	733	-0.0128	2.22849551913687e-11	129104	130528	9.02647086771619e-17	1427338	1431240
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1427392	1427392	1	0	NA	9.02647086771619e-17	1427338	1431240	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.4009	NA	NA	NA	4.55729769724829e-15	1432891	1432953
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	59	-0.0331	4.55729769724829e-15	1432891	1432953	9.10197115058966e-06	1526617	1528282
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.771	9.10197115058966e-06	1526617	1528282	2.74540367645048e-05	1530474	1535069
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2302065	542	534	-0.0052	2.74540367645048e-05	1530474	1535069	1.51752249445186e-14	2301365	2302065
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.2441	1.51752249445186e-14	2301365	2302065	3.83582073515152e-15	2304398	2306110
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	382	-0.0439	3.83582073515152e-15	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22456	1.046	0	2708113	2711273	6.73246927229512e-15	76998610	76998610
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.9334	6.73246927229512e-15	76998610	76998610	4.46677395123833e-15	77010018	77010018
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21743	1.0479	4.46677395123833e-15	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0198	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	128	-4.1342	NA	NA	NA	1.72896583175045e-12	3777766	4413507
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	4846477	7	7	-1.2426	1.72896583175045e-12	3777766	4413507	4.51157888349670e-08	4431527	5593746
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	7057026	180	175	-3.8746	4.5115788834967e-08	4431527	5593746	3.88742356310298e-07	7025866	7218364
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7568006	128	125	-3.0315	3.88742356310298e-07	7025866	7218364	0.0977082321238535	7248437	7584183
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7572591	7608619	12	11	-4.2597	0.0977082321238535	7248437	7584183	0.0176914934170775	7592063	7647060
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7659535	22	22	-3.1428	0.0176914934170775	7592063	7647060	8.5515332234056e-05	7640681	7668037
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7660965	7726921	41	41	-4.1866	8.5515332234056e-05	7640681	7668037	4.33065277539030e-08	7719658	7740117
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7782532	17	17	-2.6357	4.3306527753903e-08	7719658	7740117	0.000231367301546026	7751430	7799614
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7865557	31	31	-3.9883	0.000231367301546026	7751430	7799614	0.000151733901234662	7853950	7895945
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7866716	7914104	9	9	-2.2525	0.000151733901234662	7853950	7895945	3.74835164421956e-06	7897073	7928317
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	381	-3.9348	3.74835164421956e-06	7897073	7928317	1.09807672992182e-33	10512616	10515697
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	16	-1.0783	1.09807672992182e-33	10512616	10515697	0.000109072460247720	10646662	12532441
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12682301	67	65	-2.9057	0.00010907246024772	10646662	12532441	0.00156333773910246	12605673	12715696
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.2665	0.00156333773910246	12605673	12715696	6.83026268850273e-06	12792780	12863434
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13104920	103	102	-2.8884	6.83026268850273e-06	12792780	12863434	0.0341096390715108	12978637	13112411
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.6861	0.0341096390715108	12978637	13112411	4.88426473510016e-15	13128515	13136828
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14390028	435	422	-4.0317	4.88426473510016e-15	13128515	13136828	7.01015929009963e-15	14377844	14434912
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14391767	14644293	105	104	-3.1322	7.01015929009963e-15	14377844	14434912	1.69642438825666e-09	14540351	14705886
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15523178	318	308	-3.9668	1.69642438825666e-09	14540351	14705886	3.44973050758394e-08	15519963	15523178
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-1.1237	3.44973050758394e-08	15519963	15523178	2.22125881633788e-06	15531144	15537260
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15587741	30	30	-3.5587	2.22125881633788e-06	15531144	15537260	0.00440961318265466	15551462	15690301
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	54	-4.3318	0.00440961318265466	15551462	15690301	6.5399953890867e-05	15843146	15958396
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	42	-3.4166	6.5399953890867e-05	15843146	15958396	0.00126823381367563	16015301	16040789
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16062175	10	9	-1.9974	0.00126823381367563	16015301	16040789	3.89500734878528e-09	16059723	16066990
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16062961	21036503	780	757	-4.0372	3.89500734878528e-09	16059723	16066990	1.21324316679030e-06	21034708	21043581
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.878	1.2132431667903e-06	21034708	21043581	1.55961842216206e-05	21043581	21059229
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	25737663	365	355	-3.9667	1.55961842216206e-05	21043581	21059229	5.91218910182125e-48	22930737	26870361
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.2373	5.91218910182125e-48	22930737	26870361	0.000709491764041523	26938967	27003308
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.7146	0.000709491764041523	26938967	27003308	2.18300127926318e-05	27006628	27067889
MSK_252152915064_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.9036	2.18300127926318e-05	27006628	27067889	NA	NA	NA
