Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	991862	65	62	0.3654	NA	NA	NA	4.15899381932038e-12	962722	1018562
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	993566	1274141	93	88	0.7935	4.15899381932038e-12	962722	1018562	4.67025498794318e-34	1223881	1475633
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1436682	16838573	5630	5423	0.3531	4.67025498794318e-34	1223881	1475633	3.79869018706515e-14	16814050	16888048
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17127039	19	17	-0.2963	3.79869018706515e-14	16814050	16888048	3.63039558437155e-14	17124554	17155989
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	21321	0.349	3.63039558437155e-14	17124554	17155989	0	72537426	72539143
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.2127	0	72537426	72539143	0	72574479	72579311
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	86159135	4219	4078	0.3578	0	72574479	72579311	1.14711315286825e-06	86156802	86159135
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86171390	86175273	3	3	-0.6536	1.14711315286825e-06	86156802	86159135	1.68427395029568e-09	86175273	86179068
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	144099302	11478	11071	0.3561	1.68427395029568e-09	86175273	86179068	1.67536211520536e-69	143971430	144109866
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099712	144542687	175	168	0.7886	1.67536211520536e-69	143971430	144109866	1.26073342200952e-51	144448427	144974334
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144544352	145862840	349	329	0.3496	1.26073342200952e-51	144448427	144974334	1.68892415531758e-19	145851085	146182738
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145870836	146297175	37	37	-0.1236	1.68892415531758e-19	145851085	146182738	1.06037636826475e-17	146290772	147326097
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	150819879	1295	1253	0.3686	1.06037636826475e-17	146290772	147326097	2.97463482153198e-158	150819879	150823073
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	3.2285	2.97463482153198e-158	150819879	150823073	3.80592847251791e-168	150848509	150851439
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2674	0.3529	3.80592847251791e-168	150848509	150851439	1.01865842538943e-15	157133150	157133150
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6325	1.01865842538943e-15	157133150	157133150	1.87393727117124e-17	157136342	157136342
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	178725906	8588	8300	0.3495	1.87393727117124e-17	157136342	157136342	1.04449180674884e-77	178719930	178729244
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	178727407	178942877	82	81	0.9977	1.04449180674884e-77	178719930	178729244	1.28878184447815e-78	178939441	178950000
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	178944531	194978218	4626	4455	0.3567	1.28878184447815e-78	178939441	178950000	6.12641400843146e-322	194978218	194978218
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	8	-3.7431	6.12641400843146e-322	194978218	194978218	7.95239956918846e-300	195065867	195065867
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	236012895	15429	14921	0.3538	7.95239956918846e-300	195065867	195065867	6.35891601900759e-15	236008424	236024013
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236015443	236015443	1	0	NA	6.35891601900759e-15	236008424	236024013	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236017661	236068051	25	22	0.9186	NA	NA	NA	1.88735214410930e-16	236060076	236081606
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236075599	246806669	4028	3912	0.3326	1.8873521441093e-16	236060076	236081606	3.92627125584363e-49	246805521	246811355
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246811355	246862029	24	23	-0.6447	3.92627125584363e-49	246805521	246811355	6.9762758974165e-32	246860551	246863179
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	0.2408	6.9762758974165e-32	246860551	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	142115740	43624	42081	0.3308	NA	NA	NA	3.55401839241487e-34	142103851	142121477
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142117035	142225679	53	53	-0.1579	3.55401839241487e-34	142103851	142121477	3.44745655723289e-31	142222153	142234817
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142228143	242655973	34140	33038	0.3505	3.44745655723289e-31	142222153	142234817	1.52913910746178e-10	242579273	242677220
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242656260	242689978	10	10	0.0065	1.52913910746178e-10	242579273	242677220	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	3844700	1431	1378	-0.1935	NA	NA	NA	4.57209813155290e-43	3843694	3852424
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	3852424	3916466	28	28	0.5872	4.5720981315529e-43	3843694	3852424	1.96506805060634e-36	3911554	3920789
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	3918405	7373793	1055	1029	-0.141	1.96506805060634e-36	3911554	3920789	3.35887259097194e-64	7373793	7373793
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7375107	7376517	2	2	-3.7179	3.35887259097194e-64	7373793	7373793	3.50258545044515e-58	7376517	7376517
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7378691	22200954	5261	5069	-0.1374	3.50258545044515e-58	7376517	7376517	2.00383144640293e-319	22200954	22200954
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	22204800	22294827	27	26	-2.4645	2.00383144640293e-319	22200954	22200954	2.33464070818688e-316	22294827	22294827
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	22299952	66994191	16269	15739	-0.1262	2.33464070818688e-316	22294827	22294827	0	66994191	66996521
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	66996521	75479859	2803	2706	1.1257	0	66994191	66996521	4.28229208150248e-25	75469606	75787094
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	18	0.3144	4.28229208150248e-25	75469606	75787094	1.54226701792605e-26	75870144	76006248
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	90369484	3945	3794	1.1406	1.54226701792605e-26	75870144	76006248	0	90340608	95054605
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	90374333	90391698	2	0	NA	0	90340608	95054605	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95016192	99891210	1342	1290	0.6976	NA	NA	NA	5.23865346829536e-112	99891210	99891210
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.3858	5.23865346829536e-112	99891210	99891210	1.59375827319165e-116	99897201	99897201
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	122471453	7009	6765	0.6983	1.59375827319165e-116	99897201	99897201	6.27573372507e-14	122471453	122471453
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122473098	122479931	2	2	2.1066	6.27573372507e-14	122471453	122471453	3.74836064518097e-08	122479931	122479931
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122479985	133189686	4513	4387	0.6836	3.74836064518097e-08	122479931	122479931	8.62772858712054e-07	133187633	133189686
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.9906	8.62772858712054e-07	133187633	133189686	3.34108400850312e-08	133194685	133197276
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	198038358	21398	20697	0.7012	3.34108400850312e-08	133194685	133197276	1.58453363262885e-08	198036999	198038358
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.5986	1.58453363262885e-08	198036999	198038358	6.5161009272407e-07	198042681	198046895
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	198044259	1	0	NA	6.5161009272407e-07	198042681	198046895	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198046895	199329592	520	510	0.7223	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1685026	549	532	-0.1117	NA	NA	NA	4.41651688096152e-10	1657895	1696943
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1687515	1791001	38	35	0.2892	4.41651688096152e-10	1657895	1696943	3.63061147990922e-13	1782970	1815097
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1795979	9815760	2806	2700	-0.1377	3.63061147990922e-13	1782970	1815097	3.45114694125561e-112	9815760	9815760
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.7418	3.45114694125561e-112	9815760	9815760	8.21323847039839e-123	9842644	9842644
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	45822200	9712	9392	-0.1404	8.21323847039839e-123	9842644	9842644	1.99845747977209e-21	45819315	45824366
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45824366	45893705	14	14	0.6752	1.99845747977209e-21	45819315	45824366	5.20614995939471e-20	45887553	45913078
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45906417	173224400	36517	35337	-0.1126	5.20614995939471e-20	45887553	45913078	3.85946519163869e-17	173224400	173224400
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.8241	3.85946519163869e-17	173224400	173224400	2.01618196771394e-17	173228860	173228860
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	181	-0.1581	2.01618196771394e-17	173228860	173228860	1.69922347582732e-26	173660684	173660684
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.5955	1.69922347582732e-26	173660684	173660684	5.20930737382686e-28	173666072	173666072
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3630	-0.1588	5.20930737382686e-28	173666072	173666072	2.14563812473062e-63	186676034	186676034
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.4836	2.14563812473062e-63	186676034	186676034	2.60686797886598e-64	186680176	186680176
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190708316	1438	1386	-0.2022	2.60686797886598e-64	186680176	186680176	2.45648315119590e-20	190669216	190730982
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190710812	190921041	66	63	-0.5807	2.4564831511959e-20	190669216	190730982	3.37282048939531e-11	190907865	190945773
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	43	-0.1816	3.37282048939531e-11	190907865	190945773	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	220	-0.0667	NA	NA	NA	3.75795550389316e-30	829954	829954
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-2.8562	3.75795550389316e-30	829954	829954	1.32865658136360e-31	873365	873365
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3626	-0.1951	1.3286565813636e-31	873365	873365	7.15769760049731e-12	12857302	12857302
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.371	7.15769760049731e-12	12857302	12857302	5.23267631950677e-10	12873052	12873052
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	56151444	11074	10721	-0.1241	5.23267631950677e-10	12873052	12873052	0	56151444	56151444
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56152701	59742717	1221	1173	-2.4453	0	56151444	56151444	0	59742717	59742717
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59745401	59745401	1	0	NA	0	59742717	59742717	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59749078	127434789	19045	18350	-0.1176	NA	NA	NA	5.08302840678855e-21	127434789	127434789
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-2.2444	5.08302840678855e-21	127434789	127434789	3.37236884112384e-19	127438118	127438118
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	180194323	18325	17701	-0.123	3.37236884112384e-19	127438118	127438118	1.23319824706471e-149	180189516	180346557
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180644810	121	119	0.6343	1.23319824706471e-149	180189516	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	236535	54	53	0.166	NA	NA	NA	1.44497008249450e-34	234115	237952
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	43	-0.7263	1.4449700824945e-34	234115	237952	2.43877765194760e-96	323898	327962
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32558677	11576	11173	0.2951	2.4387776519476e-96	323898	327962	4.70816011183756e-122	32558677	32588005
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-1.5483	4.70816011183756e-122	32558677	32588005	3.49623574206258e-12	32613538	32633691
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	0.3297	3.49623574206258e-12	32613538	32633691	2.96557962914234e-12	32713363	32720656
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.3807	2.96557962914234e-12	32713363	32720656	9.4829663968481e-48	32723366	32728487
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7971	0.3023	9.4829663968481e-48	32723366	32728487	6.28799415599686e-100	54035000	54035000
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6447	6.28799415599686e-100	54035000	54035000	4.88226515127492e-111	54042734	54042734
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6222	0.305	4.88226515127492e-111	54042734	54042734	1.85114019735121e-259	79018959	79018959
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-2.7038	1.85114019735121e-259	79018959	79018959	8.94883775503208e-261	79091850	79091850
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6553	0.3019	8.94883775503208e-261	79091850	79091850	2.33890918805096e-07	103810611	103841482
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.2135	2.33890918805096e-07	103810611	103841482	2.15750121660121e-07	103868154	103873584
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	128473674	8093	7818	0.2951	2.15750121660121e-07	103868154	103873584	7.14080171596261e-46	128473674	128473674
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	128475294	128477759	2	2	-2.8227	7.14080171596261e-46	128473674	128473674	3.74518990927003e-45	128477759	128477759
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	128480167	134629897	2385	2308	0.2817	3.74518990927003e-45	128477759	128477759	2.85132949046231e-89	134629897	134629897
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-2.8041	2.85132949046231e-89	134629897	134629897	2.49659159343952e-83	134635779	134635779
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	167752329	11507	11119	0.2799	2.49659159343952e-83	134635779	134635779	0	167752329	167752329
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168040442	168114265	36	35	-2.6317	0	167752329	167752329	8.33538247404029e-09	168111702	168120343
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168118314	168130666	5	5	-1.3972	8.33538247404029e-09	168111702	168120343	1.85970473745116e-05	168126692	168136158
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168132080	168229503	49	47	-2.5478	1.85970473745116e-05	168126692	168136158	0	168229503	168229503
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168230894	170753106	833	805	0.2111	0	168229503	168229503	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	246	-0.0919	NA	NA	NA	8.12089102543214e-13	1038517	1038517
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	-1.9338	8.12089102543214e-13	1038517	1038517	6.06689978325488e-12	1047707	1047707
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	5668611	1786	1733	-0.1295	6.06689978325488e-12	1047707	1047707	0	5662918	5673709
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5671375	8474425	961	936	0.6541	0	5662918	5673709	0	8470618	8476883
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8476883	10946842	586	564	-0.1419	0	8470618	8476883	0	10946842	10946842
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	10948504	11022679	33	31	-2.4702	0	10946842	10946842	0	11022679	11022679
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	11027060	16135701	1760	1708	-0.1356	0	11022679	11022679	6.83913658035798e-42	16135701	16135701
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.0792	6.83913658035798e-42	16135701	16135701	3.30933943306382e-39	16140018	16140018
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	57625302	13744	13290	-0.1429	3.30933943306382e-39	16140018	16140018	0	57625302	62090591
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	62090591	69864257	1886	1830	1.1053	0	57625302	62090591	0	69851474	69874983
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69866740	109103120	13898	13426	0.6798	0	69851474	69874983	3.47450937251965e-99	109099643	109106269
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109106269	109240210	48	47	-0.3161	3.47450937251965e-99	109099643	109106269	5.83540712118014e-24	109236813	109240210
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109292887	24	24	0.7494	5.83540712118014e-24	109236813	109240210	2.92403308232149e-23	109287494	109312035
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109294787	118611324	4275	4131	1.1888	2.92403308232149e-23	109287494	109312035	2.30325552352701e-17	118611324	118611324
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	2.8094	2.30325552352701e-17	118611324	118611324	3.22738109186046e-17	118620875	118620875
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	124671377	2675	2586	1.1789	3.22738109186046e-17	118620875	118620875	5.87456687477692e-28	124663200	124674039
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	124672707	124749949	34	32	0.5433	5.87456687477692e-28	124663200	124674039	3.49415418238391e-24	124744594	124757392
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	124751321	124751321	1	0	NA	3.49415418238391e-24	124744594	124757392	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	124752701	141410894	7825	7554	1.1723	NA	NA	NA	3.30894100384195e-26	141409512	141413352
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.1468	3.30894100384195e-26	141409512	141413352	4.05431431343126e-28	141435643	141440184
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	114	1.1502	4.05431431343126e-28	141435643	141440184	2.0333019625107e-12	141689547	141700432
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	1.9304	2.0333019625107e-12	141689547	141700432	2.49720284322576e-10	141709835	141721894
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	2.49720284322576e-10	141709835	141721894	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	141831090	51	49	1.1455	NA	NA	NA	1.51086501922202e-18	141825568	141831090
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141832707	141852693	7	7	0.0158	1.51086501922202e-18	141825568	141831090	6.97818685892054e-17	141852693	141853525
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141853525	151728811	4085	3942	1.1598	6.97818685892054e-17	141852693	141853525	9.9743217811525e-13	151724590	151728811
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	0.2254	9.9743217811525e-13	151724590	151728811	1.42505563152873e-11	151743145	151747905
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2515	1.1272	1.42505563152873e-11	151743145	151747905	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12618	-0.205	NA	NA	NA	0	39350798	39352361
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-3.4782	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	67150856	6821	6587	-0.1457	0	39504332	39505256	0	67149415	67152588
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	67152588	67874767	282	272	0.7228	0	67149415	67152588	0	67873367	67876528
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	67876528	75402524	2645	2565	-0.1265	0	67873367	67876528	0	75402524	75402524
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75406577	75509247	35	35	-2.4678	0	75402524	75402524	0	75509247	75509247
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75515892	110324470	10650	10317	-0.1191	0	75509247	75509247	0	110324470	110326126
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110326126	110413150	33	33	-2.4213	0	110324470	110326126	0	110411222	110413150
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110414748	115701209	1272	1227	-0.1263	0	110411222	110413150	1.80765124981638e-11	115701209	115701209
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-1.7262	1.80765124981638e-11	115701209	115701209	8.91698946475886e-11	115711730	115711730
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	142462378	8355	8044	-0.1507	8.91698946475886e-11	115711730	115711730	1.69745735967883e-09	142432729	142479610
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142464881	142535517	31	30	0.2219	1.69745735967883e-09	142432729	142479610	0.000215603430120898	142511694	142633579
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142546044	146264846	1307	1259	-0.0567	0.000215603430120898	142511694	142633579	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5291	0.3285	NA	NA	NA	3.57241451313281e-72	15802255	15802255
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.5646	3.57241451313281e-72	15802255	15802255	3.09274008746072e-67	15807123	15807123
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7340	0.3283	3.09274008746072e-67	15807123	15807123	2.04847246402253e-16	70926188	70926188
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.2974	2.04847246402253e-16	70926188	70926188	9.66579527699545e-10	70930528	70935055
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	91098699	6654	6435	0.2023	9.66579527699545e-10	70930528	70935055	2.11497697817141e-51	91051006	91122641
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	91103916	91844701	187	183	0.5581	2.11497697817141e-51	91051006	91122641	4.50611692251381e-40	91790858	91867370
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	91847454	93434678	444	432	0.1884	4.50611692251381e-40	91790858	91867370	4.91769379259033e-07	93432783	93434678
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	2	-1.0681	4.91769379259033e-07	93432783	93434678	8.79418365080702e-07	93439862	93443960
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	100348045	2631	2553	0.2107	8.79418365080702e-07	93439862	93443960	2.43794441723044e-12	100348045	100348045
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.4906	2.43794441723044e-12	100348045	100348045	7.65690683233651e-13	100350814	100350814
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5379	0.2145	7.65690683233651e-13	100350814	100350814	7.99855531959233e-07	116122595	116124007
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0516	7.99855531959233e-07	116122595	116124007	6.5156787575405e-36	116130333	116132839
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7995	0.2076	6.5156787575405e-36	116130333	116132839	1.79056820168174e-35	137352394	137352394
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.2501	1.79056820168174e-35	137352394	137352394	3.2857763987222e-13	137356880	137356880
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1067	0.2636	3.2857763987222e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	21246409	7468	7240	0.618	NA	NA	NA	6.2805410382556e-67	21236430	21262980
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	21247821	21608967	170	163	1.0659	6.2805410382556e-67	21236430	21262980	5.24221636760543e-61	21591774	21623379
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	21613382	77917893	16954	16364	0.6459	5.24221636760543e-61	21591774	21623379	3.92341682459943e-31	77917893	77917893
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.5672	3.92341682459943e-31	77917893	77917893	2.90555747834542e-30	77928738	77928738
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7522	0.6364	2.90555747834542e-30	77928738	77928738	4.34491050989124e-11	100670683	100678817
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100693036	5	5	-0.2196	4.34491050989124e-11	100670683	100678817	7.98386354163926e-07	100686787	100698855
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100695568	106641765	2655	2558	0.6444	7.98386354163926e-07	100686787	100698855	2.13830430221932e-33	106627304	106648727
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	106644008	106790552	73	71	1.143	2.13830430221932e-33	106627304	106648727	1.12178594024219e-39	106781113	106797315
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	106792859	106792859	1	0	NA	1.12178594024219e-39	106781113	106797315	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	106794207	127563278	6999	6765	0.631	NA	NA	NA	8.74458423589576e-11	127556450	127568592
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	12	-0.0294	8.74458423589576e-11	127556450	127568592	2.02335793670985e-08	127584068	127599309
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	135285645	2706	2628	0.5911	2.02335793670985e-08	127584068	127599309	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1715543	606	592	0.3834	NA	NA	NA	3.02306304008987e-05	1705618	1715543
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1717074	1728540	6	6	-0.3886	3.02306304008987e-05	1705618	1715543	3.18909624212936e-05	1728540	1729730
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1729730	1739097	6	6	0.3908	3.18909624212936e-05	1728540	1729730	0.00106338969606034	1731346	1739097
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1744182	1761166	8	7	-0.1845	0.00106338969606034	1731346	1739097	0.00305507965597597	1761166	1790083
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1763069	3191670	596	569	0.3529	0.00305507965597597	1761166	1790083	1.01430514174623e-14	3191670	3191670
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3194235	3194235	1	0	NA	1.01430514174623e-14	3191670	3191670	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3196874	3200134	2	2	-1.7285	NA	NA	NA	7.94129246410044e-18	3200134	3200134
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3202804	5741031	913	878	0.3344	7.94129246410044e-18	3200134	3200134	4.98300528313329e-33	5738494	5742476
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6865	4.98300528313329e-33	5738494	5742476	4.69446601567646e-27	5763749	5769776
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	6604372	364	346	0.2924	4.69446601567646e-27	5763749	5769776	9.05457511492983e-05	6589091	6609221
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6605568	6622216	10	10	-0.2226	9.05457511492983e-05	6589091	6609221	1.61174256444285e-06	6617339	6631481
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6623411	7771593	490	467	0.326	1.61174256444285e-06	6617339	6631481	5.00277031392014e-22	7762277	7771593
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7774067	7783492	7	6	-0.9475	5.00277031392014e-22	7762277	7771593	1.77022294088845e-21	7783492	7800021
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7797993	1	0	NA	1.77022294088845e-21	7783492	7800021	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	58856329	15305	14815	0.3403	NA	NA	NA	2.06960231834081e-36	58824540	58890306
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58862205	59132455	116	110	0.7303	2.06960231834081e-36	58824540	58890306	2.45339931933539e-28	59114093	59145642
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	59134330	59792292	261	250	0.33	2.45339931933539e-28	59114093	59145642	6.29227994985258e-13	59767371	59815004
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	59798646	59917448	56	55	0.6794	6.29227994985258e-13	59767371	59815004	1.35731592631901e-09	59897496	59954842
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	59920446	61551630	716	687	0.3654	1.35731592631901e-09	59897496	59954842	6.09725338142828e-20	61543796	61557996
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61557996	61625343	9	8	-0.783	6.09725338142828e-20	61543796	61557996	2.13424386564658e-20	61618306	61631260
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61631260	83662545	8222	7937	0.3517	2.13424386564658e-20	61618306	61631260	2.24299285308584e-14	83643267	83677299
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83663734	83769615	49	47	0.7481	2.24299285308584e-14	83643267	83677299	3.64943689757281e-17	83759415	83783213
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83771344	121712644	12770	12332	0.3339	3.64943689757281e-17	83759415	83783213	7.0518526717543e-25	121696976	121716801
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121714533	121899565	41	41	-0.1953	7.0518526717543e-25	121696976	121716801	6.68144477258337e-20	121889690	121961079
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121938805	134450318	4734	4557	0.2755	6.68144477258337e-20	121889690	121961079	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	8875350	3525	3396	1.1034	NA	NA	NA	4.62690493059816e-13	8866144	8879999
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8876717	8915491	22	21	0.5119	4.62690493059816e-13	8866144	8879999	3.0439535844671e-16	8912098	8926456
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8919756	9523923	195	184	1.1179	3.0439535844671e-16	8912098	8926456	5.49489110503614e-18	9516067	9543817
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	2.0321	5.49489110503614e-18	9516067	9543817	9.5876041202651e-18	9573313	9590351
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	26125063	5786	5591	1.1461	9.5876041202651e-18	9573313	9590351	3.3157976517103e-118	26117298	26133178
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	26130738	26488306	150	144	1.7731	3.3157976517103e-118	26117298	26133178	1.32216234501881e-82	26483380	26495847
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	26491401	28459184	756	729	1.2012	1.32216234501881e-82	26483380	26495847	1.79005358700966e-264	28450458	28463433
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28461256	31132762	710	691	0.6077	1.79005358700966e-264	28450458	28463433	2.90251627211145e-14	31098259	31173065
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31233136	16	16	1.2625	2.90251627211145e-14	31098259	31173065	5.06917701182057e-20	31230579	31245432
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31237505	60553780	9408	9093	0.6148	5.06917701182057e-20	31230579	31245432	1.56703066079809e-19	60552417	60553780
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60554987	60554987	1	0	NA	1.56703066079809e-19	60552417	60553780	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60556426	60561181	3	3	-0.6889	NA	NA	NA	2.81918207024025e-10	60561181	60562567
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60562567	79300125	6179	5972	0.5803	2.81918207024025e-10	60561181	60562567	3.04915339424153e-14	79290367	79304176
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79301641	79462239	30	28	1.066	3.04915339424153e-14	79290367	79304176	1.14890272088529e-23	79448018	79483924
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79469177	130943064	17817	17181	0.5425	1.14890272088529e-23	79448018	79483924	4.40396853063431e-22	130943064	130943064
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.1922	4.40396853063431e-22	130943064	130943064	9.58710091606753e-10	130946248	130946248
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	529	0.5542	9.58710091606753e-10	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6768	-0.7837	NA	NA	NA	2.67767432977742e-16	36969571	36969571
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-2.823	2.67767432977742e-16	36969571	36969571	2.00324724753997e-18	36982877	36982877
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	288	-0.7859	2.00324724753997e-18	36982877	36982877	2.33852281842414e-65	37953582	37953582
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.0288	2.33852281842414e-65	37953582	37953582	3.19789563425776e-59	37957844	37957844
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	42836698	1998	1932	-0.7815	3.19789563425776e-59	37957844	37957844	1.24942813877377e-59	42832084	42841393
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42839271	42979289	72	69	-0.1232	1.24942813877377e-59	42832084	42841393	2.14143384640273e-07	42977106	42983082
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42981487	42988310	6	6	-0.7741	2.14143384640273e-07	42977106	42983082	3.5447124940299e-05	42986811	42999825
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42990465	43868577	338	327	-0.1113	3.5447124940299e-05	42986811	42999825	2.32512836835940e-291	43866092	43872804
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	43869762	63593790	5838	5643	-0.7764	2.3251283683594e-291	43866092	43872804	2.00271492572346e-55	63593790	63593790
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63599848	63720679	16	16	-2.0591	2.00271492572346e-55	63593790	63593790	1.02763757980676e-54	63720679	63727591
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63727591	71703277	2162	2095	-0.7788	1.02763757980676e-54	63720679	63727591	2.02442936954601e-22	71703277	71703277
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-3.1106	2.02442936954601e-22	71703277	71703277	2.71454377153777e-23	71708737	71708737
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	89659397	4521	4369	-0.791	2.71454377153777e-23	71708737	71708737	7.89918769125235e-09	89659397	89659397
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	0.6658	7.89918769125235e-09	89659397	89659397	2.24872363024711e-08	89662326	89662326
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4616	-0.7847	2.24872363024711e-08	89662326	89662326	7.91014029045884e-14	100690991	100690991
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.624	7.91014029045884e-14	100690991	100690991	5.50393505417112e-18	100693892	100693892
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4397	-0.8057	5.50393505417112e-18	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34498340	5661	5478	-0.1019	NA	NA	NA	2.728573469399e-15	34498340	34498340
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34499884	34501839	2	2	-2.012	2.728573469399e-15	34498340	34498340	1.11452794814217e-16	34501839	34501839
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34505234	73071404	13757	13311	-0.0974	1.11452794814217e-16	34501839	34501839	7.5114074340037e-11	73061942	73082262
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	7.5114074340037e-11	73061942	73082262	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.0003	NA	NA	NA	1.71078153005352e-12	73091980	73101327
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2816	-0.1047	1.71078153005352e-12	73091980	73101327	3.00134667032409e-52	79174722	79174722
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-2.4628	3.00134667032409e-52	79174722	79174722	8.87683431301103e-47	79183154	79183154
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8997	-0.1167	8.87683431301103e-47	79183154	79183154	7.68694733448926e-150	105597555	105597555
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.5312	7.68694733448926e-150	105597555	105597555	1.36872319215639e-96	105632168	105632168
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	222	-0.223	1.36872319215639e-96	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.0176	NA	NA	NA	7.47545655126996e-08	18452491	18741716
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19465359	93	89	-0.9902	7.47545655126996e-08	18452491	18741716	0.00119838664525479	19356869	19943587
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	56	-1.2608	0.00119838664525479	19356869	19943587	1.15679953796810e-158	20079935	20308014
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20834	-0.1262	1.1567995379681e-158	20079935	20308014	4.67140342617592e-75	74669752	74671626
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.0533	4.67140342617592e-75	74669752	74671626	1.08091510570551e-71	74680338	74680439
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	82332155	2794	2708	-0.1277	1.08091510570551e-71	74680338	74680439	4.25206362302426e-39	82332155	82332155
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-3.1567	4.25206362302426e-39	82332155	82332155	3.12092658680657e-39	82334704	82334704
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	99632987	6537	6317	-0.1602	3.12092658680657e-39	82334704	82334704	1.08031867697648e-10	99632987	99632987
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.4382	1.08031867697648e-10	99632987	99632987	7.82294569212358e-11	99635701	99636724
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	254	-0.193	7.82294569212358e-11	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	10233	-0.1257	NA	NA	NA	1.11531064150868e-63	31842335	32513457
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33559207	46	46	-0.6533	1.11531064150868e-63	31842335	32513457	8.95487448872056e-26	33528385	33842125
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	54352394	3078	2983	-0.1514	8.95487448872056e-26	33528385	33842125	7.91066276866945e-50	54352394	54363713
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	9	-1.7434	7.91066276866945e-50	54352394	54363713	5.65885458797726e-05	54365385	54379839
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.6649	5.65885458797726e-05	54365385	54379839	1.47074420334542e-07	54402057	54424734
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1151	-0.0867	1.47074420334542e-07	54402057	54424734	2.28502951343987e-08	57201427	57203733
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2732	2.28502951343987e-08	57201427	57203733	3.35638920221672e-31	57206772	57206772
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5433	-0.1111	3.35638920221672e-31	57206772	57206772	5.22288862903569e-51	75093957	75093957
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.9505	5.22288862903569e-51	75093957	75093957	2.61481215321400e-55	75100865	75100865
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	589	-0.1916	2.614812153214e-55	75100865	75100865	4.24588911457727e-44	76925748	76933534
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	8	-1.781	4.24588911457727e-44	76925748	76933534	6.01573283750227e-42	76937156	76942679
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4376	-0.1305	6.01573283750227e-42	76937156	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	822	-0.0797	NA	NA	NA	3.70133294374913e-08	1903358	1904451
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.1488	3.70133294374913e-08	1903358	1904451	2.26436358602873e-18	1906391	1909371
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15546643	5433	5252	-0.1432	2.26436358602873e-18	1906391	1909371	3.80934853698803e-37	15546643	15546643
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15549649	15552419	2	2	-3.1633	3.80934853698803e-37	15546643	15546643	4.60888005800954e-38	15552419	15552419
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15554719	36673853	7579	7300	-0.1008	4.60888005800954e-38	15552419	15552419	8.36291023954841e-24	36673853	36673853
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.3051	8.36291023954841e-24	36673853	36673853	1.50726183659296e-23	36684619	36684619
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1979	-0.0788	1.50726183659296e-23	36684619	36684619	4.94094682712396e-24	41555295	41573295
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	46	-0.5887	4.94094682712396e-24	41555295	41573295	2.14016803325063e-25	41704093	42148637
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	73363491	11527	11112	-0.0803	2.14016803325063e-25	41704093	42148637	1.63799203029147e-56	73363491	73363491
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73365566	73367969	2	2	-3.6814	1.63799203029147e-56	73363491	73363491	0	73367969	73367969
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73370930	73374567	2	2	-2.2049	0	73367969	73367969	1.37848222920952e-17	73374567	73374567
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73376747	78653545	2148	2075	-0.0275	1.37848222920952e-17	73374567	73374567	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	39304182	11658	11293	-0.0896	NA	NA	NA	1.32943210046763e-56	39287887	39322859
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	39312286	39664475	48	46	0.6457	1.32943210046763e-56	39287887	39322859	3.09096754120422e-65	39660089	39669376
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	39667774	76116026	11257	10887	-0.1464	3.09096754120422e-65	39660089	39669376	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	467	0.0117	NA	NA	NA	6.62279610459518e-08	1395246	1398325
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1405308	3	3	1.2759	6.62279610459518e-08	1395246	1398325	1.28502674164362e-09	1405308	1409386
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1409386	7974628	3086	2979	-0.0877	1.28502674164362e-09	1405308	1409386	2.32190049051992e-168	7966214	7987004
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7975822	8508092	229	224	0.5939	2.32190049051992e-168	7966214	7987004	1.80945253657930e-17	8493720	8518974
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8510579	8760699	79	75	1.0649	1.8094525365793e-17	8493720	8518974	1.84895048013226e-36	8699463	8777519
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8762640	10842397	991	950	0.5217	1.84895048013226e-36	8699463	8777519	1.29878642700073e-26	10837359	10852391
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10844949	10911915	30	29	1.2555	1.29878642700073e-26	10837359	10852391	1.85276366355890e-26	10905172	10918900
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10914913	13858316	1308	1267	0.5092	1.8527636635589e-26	10905172	10918900	1.06376733819545e-274	13851055	13866636
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13858822	19505472	2714	2622	0.9617	1.06376733819545e-274	13851055	13866636	2.87291556482595e-21	19485885	19520584
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19506531	19694025	95	92	0.5583	2.87291556482595e-21	19485885	19520584	5.04119076377598e-65	19694025	19694025
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19699024	1	0	NA	5.04119076377598e-65	19694025	19694025	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699485	19700620	2	2	-3.8438	NA	NA	NA	1.91438878961714e-93	19700620	19700620
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	21533555	505	487	0.5514	1.91438878961714e-93	19700620	19700620	8.27420558813431e-06	21521399	21537835
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21537835	21549627	5	5	-0.1591	8.27420558813431e-06	21521399	21537835	2.52181161021007e-05	21546574	21562061
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21553424	22451209	199	196	0.5593	2.52181161021007e-05	21546574	21562061	1.05200783280876e-45	22435318	22471375
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22457334	32969482	430	416	0.9626	1.05200783280876e-45	22435318	22471375	3.15354908470757e-06	24152318	32985741
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32974850	33033208	12	12	0.4441	3.15354908470757e-06	24152318	32985741	1.24959002603556e-45	33022365	33058646
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33049763	43391856	3773	3636	1.2386	1.24959002603556e-45	33022365	33058646	4.89082035522874e-39	43385405	43395012
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43393637	43427371	16	15	0.5711	4.89082035522874e-39	43385405	43395012	6.03762199344908e-11	43418605	43435387
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43428670	45539890	946	911	1.2845	6.03762199344908e-11	43418605	43435387	0	45531455	45542925
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45541467	48531935	1050	1019	0.5046	0	45531455	45542925	2.29408548168848e-80	48494496	48556283
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48534223	49134559	281	267	0.9754	2.29408548168848e-80	48494496	48556283	0	49134436	49141455
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49141455	59414898	4808	4649	-0.1541	0	49134436	49141455	8.521570403377e-10	59411618	59421197
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.889	8.521570403377e-10	59411618	59421197	1.46454168303072e-08	59433190	59441741
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	60274117	316	304	-0.1847	1.46454168303072e-08	59433190	59441741	2.10479576095930e-261	60267184	60278408
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60275204	63788698	1678	1612	0.5434	2.1047957609593e-261	60267184	60278408	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	1.0996	NA	NA	NA	4.53081880797622e-143	1506379	1506379
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.1981	4.53081880797622e-143	1506379	1506379	1.03942488967648e-111	1531162	1531162
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	1860501	115	113	1.1144	1.03942488967648e-111	1531162	1531162	4.66101100509211e-06	1830364	1881236
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1863267	1984204	43	42	0.7844	4.66101100509211e-06	1830364	1881236	1.23591537801371e-08	1939219	2019557
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1985300	2703472	311	298	1.1297	1.23591537801371e-08	1939219	2019557	2.65069557769527e-149	2693635	2717902
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2709289	26173123	7984	7714	0.645	2.65069557769527e-149	2693635	2717902	1.42738758831987e-12	26170594	26173123
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	28247413	28266113	4	4	-0.3223	1.42738758831987e-12	26170594	26173123	3.3068061925458e-07	28266113	29306447
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	29766208	194	185	0.6777	3.3068061925458e-07	28266113	29306447	2.02814018822554e-10	29750304	29773185
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29767994	29821827	24	22	1.2143	2.02814018822554e-10	29750304	29773185	1.70927951673286e-16	29810783	29829040
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29824111	62419534	12309	11915	0.6445	1.70927951673286e-16	29810783	29829040	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10167413	22	22	-0.1855	NA	NA	NA	2.77891681135255e-08	10144881	13562263
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	2.77891681135255e-08	10144881	13562263	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	13882260	34	32	0.3897	NA	NA	NA	0.000218093418535317	13869389	13893162
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	13992109	6	6	-0.1994	0.000218093418535317	13869389	13893162	7.1084403005577e-10	13992109	14088878
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	22049013	2842	2751	0.6697	7.1084403005577e-10	13992109	14088878	0	22044431	22052334
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22052334	32359151	3505	3385	-0.1375	0	22044431	22052334	0	32356848	32365370
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32362731	34713519	1061	1031	0.694	0	32356848	32365370	0	34711563	34717015
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	34714805	46922972	5970	5789	-0.14	0	34711563	34717015	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2881	-0.0944	NA	NA	NA	4.82255141436064e-07	22592087	22686690
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	20	0.3444	4.82255141436064e-07	22592087	22686690	7.00339539108559e-16	22713972	22748062
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	22725305	1	0	NA	7.00339539108559e-16	22713972	22748062	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	30541943	4238	4096	-0.116	NA	NA	NA	0	30541943	30541943
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	30542902	30542902	1	0	NA	0	30541943	30541943	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	30544064	30608930	41	40	-2.4223	NA	NA	NA	0	30607453	30608930
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	30612295	36074159	2608	2527	-0.1543	0	30607453	30608930	3.36576150678380e-42	36074159	36074159
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36075796	36079268	3	3	-2.7766	3.3657615067838e-42	36074159	36074159	1.24394423896841e-40	36079268	36079268
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36080448	49571068	6661	6415	-0.1009	1.24394423896841e-40	36079268	36079268	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.2967	NA	NA	NA	3.48671049249908e-15	94062	95819
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	293185	143	136	2.1952	3.48671049249908e-15	94062	95819	2.69201281577456e-59	281091	296820
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	294617	667386	293	279	1.1964	2.69201281577456e-59	281091	296820	2.93623678373291e-202	662876	669848
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	669545	2416516	1085	1054	0.3733	2.93623678373291e-202	662876	669848	0.000262120471775450	2355026	2417450
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2417450	2419541	5	5	-0.0449	0.00026212047177545	2355026	2417450	8.90410207536388e-07	2419541	2421371
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2421183	2428307	10	9	0.6754	8.90410207536388e-07	2419541	2421371	7.96683132194555e-07	2425776	2428307
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2436573	9	9	-0.0237	7.96683132194555e-07	2425776	2428307	2.68154159232965e-06	2435595	2438212
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2436637	2526103	75	73	0.5841	2.68154159232965e-06	2435595	2438212	0.00120207328634664	2514651	2533894
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2532053	2538197	7	7	0.042	0.00120207328634664	2514651	2533894	0.00473569743454406	2533894	2625260
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2539136	2708291	160	156	0.3671	0.00473569743454406	2533894	2625260	0	2708291	2711273
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	36991461	12753	12344	1.5207	0	2708291	2711273	5.74269157801544e-37	36990219	36991461
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	36992170	37007705	4	4	0.4103	5.74269157801544e-37	36990219	36991461	2.36634364355645e-09	37007705	37033702
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37033702	46242505	3143	3036	1.5468	2.36634364355645e-09	37007705	37033702	7.57276167315307e-14	46222619	46245731
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	46243930	46299473	25	25	2.0964	7.57276167315307e-14	46222619	46245731	6.87632476840657e-14	46295089	46310236
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	46302222	52909690	1957	1877	1.4901	6.87632476840657e-14	46295089	46310236	8.13233978537753e-10	52908484	52921839
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52921839	52971245	4	4	0.2076	8.13233978537753e-10	52908484	52921839	6.04723947722246e-11	52968251	52973772
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52973772	106272872	11767	11332	1.4645	6.04723947722246e-11	52968251	52973772	1.35249722880466e-237	106257470	106282647
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106275251	107720644	626	604	1.9377	1.35249722880466e-237	106257470	106282647	7.85726406259628e-285	107710349	107731232
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	107723215	148586108	12631	12179	1.4466	7.85726406259628e-285	107710349	107731232	2.53144095984008e-17	148581470	148586108
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148588181	148638391	11	11	0.5539	2.53144095984008e-17	148581470	148586108	6.10364648162065e-12	148638391	148650011
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148644236	154582414	2213	2130	1.4053	6.10364648162065e-12	148638391	148650011	2.99241234992759e-280	154570196	154586690
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	0.4058	2.99241234992759e-280	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-3.3502	NA	NA	NA	2.49808567639254e-21	3223585	3772482
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4425391	9	9	0.4734	2.49808567639254e-21	3223585	3772482	1.69486092137647e-16	4421500	4597974
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	4431527	1	0	NA	1.69486092137647e-16	4421500	4597974	NA	NA	NA
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7054924	181	172	-2.9712	NA	NA	NA	0.0117687853928308	6940618	7300600
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7645258	154	151	-2.4681	0.0117687853928308	6940618	7300600	3.16149580698132e-06	7603458	7652302
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7709619	40	40	-3.6701	3.16149580698132e-06	7603458	7652302	4.55596010776551e-06	7701303	7733351
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7997485	86	80	-2.5786	4.55596010776551e-06	7701303	7733351	3.94180372286528e-06	7853950	8114544
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10515697	371	360	-3.2989	3.94180372286528e-06	7853950	8114544	5.20443487453933e-18	10512616	10537808
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	18	-0.9718	5.20443487453933e-18	10512616	10537808	8.79397240763705e-20	11698871	12452734
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	10	-4.2195	8.79397240763705e-20	11698871	12452734	1.34865955473634e-06	12541506	12550566
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.7618	1.34865955473634e-06	12541506	12550566	2.39186406984802e-07	12649357	12687167
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	15	-3.923	2.39186406984802e-07	12649357	12687167	2.83202993952817e-06	12772155	12839975
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	118	-2.1561	2.83202993952817e-06	12772155	12839975	4.54602375332872e-22	13090026	13148290
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	397	-3.3375	4.54602375332872e-22	13090026	13148290	3.02129282015825e-11	14214157	14386474
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14700040	145	140	-2.5257	3.02129282015825e-11	14214157	14386474	5.65940528792274e-08	14644293	14705129
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14899294	45	44	-3.7945	5.65940528792274e-08	14644293	14705129	2.6678740148119e-05	14819097	15032971
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14903285	16217583	476	458	-2.9036	2.6678740148119e-05	14819097	15032971	2.81584604199485e-09	16042014	16635994
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	25737663	1077	1046	-3.317	2.81584604199485e-09	16042014	16635994	2.2010166047909e-38	22926726	25737663
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-0.6949	2.2010166047909e-38	22926726	25737663	6.7760483321962e-07	26945084	26995399
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.3025	6.7760483321962e-07	26945084	26995399	0.00096281737430852	26995399	27068911
MSK_252152915075_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.9651	0.00096281737430852	26995399	27068911	NA	NA	NA
