Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	15229644	5110	4921	0.026	NA	NA	NA	2.88117698410603e-46	15206905	15242540
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15233356	15651102	209	204	0.3311	2.88117698410603e-46	15206905	15242540	4.58458735176483e-33	15637305	15683448
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15652583	15657335	3	0	NA	4.58458735176483e-33	15637305	15683448	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15658740	16888048	467	447	0.0345	NA	NA	NA	2.35383177661106e-10	16836160	16888048
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16917759	17094475	10	9	-0.6689	2.35383177661106e-10	16836160	16888048	1.79904123582971e-10	17094475	17107476
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	17102601	1	0	NA	1.79904123582971e-10	17094475	17107476	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17104345	23480578	2667	2571	0.0163	NA	NA	NA	8.4954200727272e-16	23464146	23485500
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	23483036	23536795	26	24	-0.4961	8.4954200727272e-16	23464146	23485500	6.05269554063578e-17	23531294	23547307
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	23538911	52376855	11412	10994	0.0202	6.05269554063578e-17	23531294	23547307	1.60438515296447e-11	52376855	52376855
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52378388	52379645	2	2	1.3596	1.60438515296447e-11	52376855	52376855	1.64138366032814e-11	52379645	52379645
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52382011	72537426	7987	7701	-1e-04	1.64138366032814e-11	52379645	52379645	0	72537426	72537426
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.6179	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110014625	11701	11317	0.0299	0	72579311	72579311	5.67226564396115e-08	110010176	110015739
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110058441	7	7	-0.604	5.67226564396115e-08	110010176	110015739	1.53634424206842e-07	110041712	110065530
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110060587	111177741	480	471	0.021	1.53634424206842e-07	110041712	110065530	2.49182140815709e-06	111173447	111177741
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111188857	3	3	-0.8553	2.49182140815709e-06	111173447	111177741	1.21619782931445e-07	111188857	111190763
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	143706304	3432	3327	0.0092	1.21619782931445e-07	111188857	111190763	1.37168790150694e-27	143653780	143719710
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143706582	144113654	86	80	-0.3052	1.37168790150694e-27	143653780	143719710	6.89358249924482e-22	144003068	144131305
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144120542	146294654	551	530	0.0166	6.89358249924482e-22	144003068	144131305	4.26848706188689e-18	146274661	147308557
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147847659	40	40	-0.3858	4.26848706188689e-18	146274661	147308557	9.0226891393343e-19	147497268	148088434
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150839754	1260	1225	0.0303	9.0226891393343e-19	147497268	148088434	1.32733623251140e-10	150839754	150839754
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	2	-1.3589	1.3273362325114e-10	150839754	150839754	1.09486393003262e-10	150846148	150846148
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.09486393003262e-10	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2674	0.0351	NA	NA	NA	4.84284883109798e-86	157133150	157133150
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.8309	4.84284883109798e-86	157133150	157133150	7.84490437784729e-91	157136342	157136342
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10948	0.0184	7.84490437784729e-91	157136342	157136342	1.13813618067065e-07	185973975	185979586
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1861	1.13813618067065e-07	185973975	185979586	3.41010830867958e-07	185988138	186000612
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200609726	4139	4012	0.0474	3.41010830867958e-07	185988138	186000612	2.24167005086365e-13	200592050	200629099
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200787319	35	35	-0.3199	2.24167005086365e-13	200592050	200629099	1.56264249466359e-11	200676505	200808717
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	246668425	17265	16715	0.0251	1.56264249466359e-11	200676505	200808717	7.61485553321402e-05	246595869	246674083
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246669591	246676931	4	4	-0.4336	7.61485553321402e-05	246595869	246674083	0.000497470668161337	246676931	246696599
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246687126	246875016	45	43	0.2142	0.000497470668161337	246676931	246696599	0.00532771250986277	246836754	246951808
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	93	0.0036	0.00532771250986277	246836754	246951808	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	2747332	1064	1032	-0.0118	NA	NA	NA	1.71426206822643e-310	2722535	2770702
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	2749521	30233830	8634	8326	0.3249	1.71426206822643e-310	2722535	2770702	0	30220582	30248348
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	30235916	34543992	1824	1754	0.0069	0	30220582	30248348	1.10038970326489e-07	34516600	34558824
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	18	0.3956	1.10038970326489e-07	34516600	34558824	1.72784574658303e-07	34579933	34608979
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35553983	380	372	0.0096	1.72784574658303e-07	34579933	34608979	1.35740604309762e-21	35553983	35553983
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.896	1.35740604309762e-21	35553983	35553983	1.57874617645595e-17	35562007	35562007
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	35821494	101	99	0.0565	1.57874617645595e-17	35562007	35562007	1.00745747403313e-07	35818921	35821494
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.342	1.00745747403313e-07	35818921	35821494	7.6835596322056e-11	35844884	35844884
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	40002525	1886	1840	0.0111	7.6835596322056e-11	35844884	35844884	3.67930522554623e-23	39988395	40011650
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40005883	40099310	37	36	0.4708	3.67930522554623e-23	39988395	40011650	1.50224849677088e-21	40080603	40110640
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40103358	52600588	4783	4648	0.0194	1.50224849677088e-21	40080603	40110640	3.04071826698278e-08	52583578	52600588
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	3.04071826698278e-08	52583578	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8699	NA	NA	NA	1.27220190047642e-08	52635695	52639605
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	57251850	1554	1489	0.0094	1.27220190047642e-08	52635695	52639605	4.68075297828388e-14	57244746	57251850
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57263450	57300299	5	5	0.9829	4.68075297828388e-14	57244746	57251850	1.70524394682424e-13	57300299	57307517
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57307517	89649638	10027	9689	0.0135	1.70524394682424e-13	57300299	57307517	4.47279376804074e-11	89397985	89680164
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89650684	89902365	33	33	0.3578	4.47279376804074e-11	89397985	89680164	6.56125010297527e-12	89876334	91148554
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	179767214	25926	25050	0.0036	6.56125010297527e-12	89876334	91148554	8.08049060170887e-12	179764819	179767214
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.1734	8.08049060170887e-12	179764819	179767214	6.69789613498561e-12	179778919	179791128
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	201432619	6436	6218	0.0279	6.69789613498561e-12	179778919	179791128	0	201426311	201440516
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	201434370	242689978	15106	14612	-0.4386	0	201426311	201440516	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	55496455	19648	18970	0.0135	NA	NA	NA	0	55491422	55504023
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	55498393	88705548	10797	10386	-0.4089	0	55491422	55504023	4.53144805133719e-240	88641755	88727805
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	88711026	90374333	395	380	0.052	4.53144805133719e-240	88641755	88727805	1.25449241556613e-98	90329723	95064919
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	90391698	164001657	22650	21897	0.3501	1.25449241556613e-98	90329723	95064919	2.24672372463165e-72	164001657	164001657
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	2.24672372463165e-72	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.8247	NA	NA	NA	1.14432815381122e-75	164027724	164027724
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9791	0.3548	1.14432815381122e-75	164027724	164027724	2.45708901312312e-277	194354505	194358882
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194365648	5	5	-3.8995	2.45708901312312e-277	194354505	194358882	1.39997604683362e-235	194364470	194365648
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194366950	194366950	1	0	NA	1.39997604683362e-235	194364470	194365648	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1904	0.3378	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17814	0.0108	NA	NA	NA	2.03446036804542e-14	68899247	69075140
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-0.6119	2.03446036804542e-14	68899247	69075140	1.16063388031343e-16	69153675	69643272
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	69973535	81	79	0.0466	1.16063388031343e-16	69153675	69643272	3.07900885565388e-05	69934026	70025459
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69975778	70396310	64	61	0.2901	3.07900885565388e-05	69934026	70025459	1.55402648705081e-91	70389915	70422247
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70418733	95705936	8923	8623	-0.424	1.55402648705081e-91	70389915	70422247	0	95705936	95708102
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95708102	96340884	288	275	-2.0057	0	95705936	95708102	0	96339669	96340884
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	96343268	173660684	22032	21274	-0.4274	0	96339669	96340884	2.06329727121536e-68	173660684	173660684
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.7695	2.06329727121536e-68	173660684	173660684	4.28231232837848e-65	173666072	173666072
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5109	-0.4404	4.28231232837848e-65	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	9643195	2919	2827	-0.0206	NA	NA	NA	4.62732912214754e-48	9628245	9660202
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	9648744	9949522	86	84	-0.4599	4.62732912214754e-48	9628245	9660202	2.56460578481733e-51	9929035	9965011
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	9952869	21480789	3347	3224	-0.0077	2.56460578481733e-51	9929035	9965011	6.84631460357522e-14	21480789	21480789
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.5357	6.84631460357522e-14	21480789	21480789	2.56807585342417e-15	21487474	21487474
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	24671613	932	884	0.0076	2.56807585342417e-15	21487474	21487474	1.80474888964522e-110	24663084	24680502
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24673849	25884192	203	198	-0.4422	1.80474888964522e-110	24663084	24680502	2.83971830558353e-119	25847072	25926201
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	25895699	59521690	8714	8442	0.0047	2.83971830558353e-119	25847072	25926201	2.42192664792323e-09	59519685	59521690
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	3	-1.0356	2.42192664792323e-09	59519685	59521690	1.94200756384834e-09	59531344	59535295
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	60165478	219	217	0.0028	1.94200756384834e-09	59531344	59535295	3.02907558643184e-125	60156087	60178726
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60167367	105824246	12759	12322	-0.4367	3.02907558643184e-125	60156087	60178726	1.00404150906719e-08	105796522	105838355
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	105831950	105912934	15	15	0.0186	1.00404150906719e-08	105796522	105838355	1.79726213747054e-05	105905421	105937096
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	105914264	106752548	131	130	0.3014	1.79726213747054e-05	105905421	105937096	1.90956551795855e-15	106737848	106778129
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106754190	107167497	184	178	0.0638	1.90956551795855e-15	106737848	106778129	1.07911465452338e-161	107158250	107175479
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	107170233	164273957	18632	17977	0.4716	1.07911465452338e-161	107158250	107175479	0	164269149	164281976
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	164276720	170754814	2258	2183	-0.0838	0	164269149	164281976	4.4680526593485e-107	170731329	170765849
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	170756116	171763777	356	345	0.2653	4.4680526593485e-107	170731329	170765849	1.66514978380413e-09	171753365	171770745
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	171765970	171789040	14	14	0.7373	1.66514978380413e-09	171753365	171770745	3.64404563896373e-07	171784069	171807330
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	171791220	180644810	2992	2901	0.2708	3.64404563896373e-07	171784069	171807330	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32538115	11673	11276	-0.0221	NA	NA	NA	5.8413621767485e-21	32519935	32543054
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32539864	32558677	4	4	-0.5483	5.8413621767485e-21	32519935	32543054	0.0613191552789594	32558677	32609525
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.4957	0.0613191552789594	32558677	32609525	3.2715969739507e-296	32628420	32633691
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	7998	0.0116	3.2715969739507e-296	32628420	32633691	8.53009602109286e-170	54035000	54035000
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.3954	8.53009602109286e-170	54035000	54035000	2.07305835852218e-183	54042734	54042734
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74762234	5312	5134	0.0201	2.07305835852218e-183	54042734	54042734	3.02428960716849e-07	74757796	74768342
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	0.728	3.02428960716849e-07	74757796	74768342	5.23946437057028e-07	74770645	74781818
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	79011979	1113	1071	0.0333	5.23946437057028e-07	74770645	74781818	5.07923882134269e-11	78987158	79024557
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	0.5325	5.07923882134269e-11	78987158	79024557	2.24728756503704e-11	79079988	79112799
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	86718639	2060	1988	0.0153	2.24728756503704e-11	79079988	79112799	1.71279333340682e-289	86635530	86756376
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	86728077	93405460	1924	1849	0.3313	1.71279333340682e-289	86635530	86756376	8.109095027948e-114	93375185	93424131
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	93414103	94055694	160	155	0.8384	8.109095027948e-114	93375185	93424131	2.5454050445225e-119	94050460	94064275
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	94057396	123166507	8762	8458	0.3376	2.5454050445225e-119	94050460	94064275	0	123150669	123184446
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	123168047	128630343	2035	1977	0.007	0	123150669	123184446	2.70819321629636e-09	128630343	128630343
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	128633373	128634513	2	2	-1.2815	2.70819321629636e-09	128630343	128630343	2.40591427240387e-11	128634513	128634513
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	128637126	131811902	1231	1182	0.0043	2.40591427240387e-11	128634513	128634513	3.67050548203761e-267	131788053	131828963
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131814725	138275237	2432	2356	0.3258	3.67050548203761e-267	131788053	131828963	0	138245388	138323183
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	138281804	156937319	6298	6099	-0.0091	0	138245388	138323183	2.79973136584195e-79	156921405	156981130
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	156941573	157405012	169	164	-0.4109	2.79973136584195e-79	156921405	156981130	5.43234068678306e-11	157397423	157412769
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	157408029	157447083	20	20	0.0421	5.43234068678306e-11	157397423	157412769	8.06731164799645e-13	157443781	157456219
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	157449127	164677895	2624	2525	-0.443	8.06731164799645e-13	157443781	157456219	4.05695987839093e-07	164639225	164725351
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	164690316	164850077	20	20	-0.8107	4.05695987839093e-07	164639225	164725351	2.29964961344312e-07	164777706	164888482
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	164859556	165643653	135	130	-0.4506	2.29964961344312e-07	164777706	164888482	1.60041073455038e-152	165643653	165643653
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	-5.3493	1.60041073455038e-152	165643653	165643653	2.95818849722232e-184	165650610	165650610
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	167210466	688	658	-0.4232	2.95818849722232e-184	165650610	165650610	2.54369788902049e-76	167200101	167233398
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167211835	167752329	193	187	-0.0054	2.54369788902049e-76	167200101	167233398	3.90668554684312e-88	167745175	168048703
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168040442	170753106	923	896	-0.4537	3.90668554684312e-88	167745175	168048703	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5218	0.0685	NA	NA	NA	3.95218569647572e-101	16135701	16135701
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.1075	3.95218569647572e-101	16135701	16135701	1.32382839514254e-106	16140018	16140018
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	25945672	3354	3231	0.0591	1.32382839514254e-106	16140018	16140018	3.10693442808389e-11	25945469	25945672
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25946290	25949466	4	4	-0.9199	3.10693442808389e-11	25945469	25945672	9.31359333768815e-11	25949466	25950020
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25950020	62313533	10430	10051	0.0197	9.31359333768815e-11	25949466	25950020	0	62262998	62887285
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	62466030	71419165	2475	2407	0.2909	0	62262998	62887285	1.06192228971896e-130	71394314	71441507
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71420847	73976921	739	709	-0.0047	1.06192228971896e-130	71394314	71441507	2.76190538805873e-08	73777267	73976921
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	74119417	74899949	6	6	0.7586	2.76190538805873e-08	73777267	73976921	3.49115564481393e-09	74899949	74906193
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	74904226	77098411	588	571	0.004	3.49115564481393e-09	74899949	74906193	1.62986922500186e-146	77095733	77099636
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	77099636	77205615	49	48	-1.0892	1.62986922500186e-146	77095733	77099636	7.61818578270859e-168	77204425	77205615
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	77208540	77208540	1	0	NA	7.61818578270859e-168	77204425	77205615	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	77210809	118611324	16229	15682	-0.0095	NA	NA	NA	5.27348773594387e-145	118611324	118611324
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.02	5.27348773594387e-145	118611324	118611324	1.41831946165523e-142	118620875	118620875
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6591	-0.0113	1.41831946165523e-142	118620875	118620875	1.62437333838558e-41	133433384	133433384
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-1.343	1.62437333838558e-41	133433384	133433384	1.04789666213348e-42	133448277	133448277
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3565	-0.0132	1.04789666213348e-42	133448277	133448277	7.50847705782252e-102	141410894	141410894
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-1.5637	7.50847705782252e-102	141410894	141410894	5.52199443027338e-70	141440184	141440184
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	109	-0.0411	5.52199443027338e-70	141440184	141440184	6.22537702481161e-38	141690753	141698634
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-1.3454	6.22537702481161e-38	141690753	141698634	2.92034784012405e-45	141712786	141714168
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158191657	6538	6320	-0.0329	2.92034784012405e-45	141712786	141714168	9.25332145883375e-16	158191657	158191657
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-1.7852	9.25332145883375e-16	158191657	158191657	2.65545993470378e-15	158195947	158195947
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	204	0.0349	2.65545993470378e-15	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.3734	NA	NA	NA	1.43340535488002e-10	581533	581533
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.0696	1.43340535488002e-10	581533	581533	5.18813276889976e-15	588865	588865
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7697025	2276	2206	-0.4412	5.18813276889976e-15	588865	588865	6.14886238345946e-17	7697025	7697025
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7709141	7824059	4	4	-1.6538	6.14886238345946e-17	7697025	7697025	9.12524713783478e-17	7824059	7824059
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5554	-0.4161	9.12524713783478e-17	7824059	7824059	2.29338906137598e-29	25120552	25120552
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.29338906137598e-29	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.8816	NA	NA	NA	5.61527730805666e-29	25125700	25125700
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	28260023	1348	1293	-0.431	5.61527730805666e-29	25125700	25125700	0	28252004	28267015
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28261383	40892587	4064	3923	0.0095	0	28252004	28267015	1.39534219565759e-132	40892587	40892587
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.5405	1.39534219565759e-132	40892587	40892587	2.70945545389845e-127	40897469	40897469
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	66919387	6318	6094	0.0219	2.70945545389845e-127	40897469	40897469	0	66908187	66945900
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66921790	96875767	8781	8453	0.3908	0	66908187	66945900	0	96819401	96946000
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	96884423	115114599	6124	5911	0.7126	0	96819401	96946000	0	115059959	115150414
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115123135	121713648	2020	1961	1.1668	0	115059959	115150414	0	121697024	121739733
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121716133	146264846	7747	7491	0.806	0	121697024	121739733	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	34707979	11165	10788	-0.4061	NA	NA	NA	0	34697197	34720850
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34712688	36667505	793	768	0.0092	0	34697197	34720850	8.47227326490889e-184	36659337	36679951
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	36670415	67927172	794	777	-0.4048	8.47227326490889e-184	36659337	36679951	1.20004256244178e-96	67913672	70212537
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	303	-0.0173	1.20004256244178e-96	67913672	70212537	5.63181487995727e-21	70926188	70926188
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.8249	5.63181487995727e-21	70926188	70926188	2.72615369542045e-31	70930528	70930528
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22983	-0.0261	2.72615369542045e-31	70930528	70930528	5.81635385027429e-31	137352394	137352394
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.7161	5.81635385027429e-31	137352394	137352394	4.33705823353441e-13	137356880	137356880
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1049	-0.0632	4.33705823353441e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9410	-0.4438	NA	NA	NA	5.72555878159264e-91	27038538	27038538
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.4009	5.72555878159264e-91	27038538	27038538	8.0927590529042e-96	27041812	27041812
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	28435107	540	528	-0.4264	8.0927590529042e-96	27041812	27041812	3.20741126308704e-255	28426823	28443515
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	28436291	56315035	6840	6607	-0.0022	3.20741126308704e-255	28426823	28443515	4.65078962729943e-11	56315035	56315035
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56316969	56321197	3	3	-1.1653	4.65078962729943e-11	56315035	56315035	9.058105741005e-12	56321197	56321197
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56325023	56325023	1	0	NA	9.058105741005e-12	56321197	56321197	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56327004	95457765	13050	12590	0.0102	NA	NA	NA	2.28310401921188e-31	95440579	95476491
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95461099	95723447	92	90	0.355	2.28310401921188e-31	95440579	95476491	2.08329814574885e-28	95705746	95739376
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95725311	100676022	2100	2046	0.0192	2.08329814574885e-28	95705746	95739376	1.00684163436555e-08	100672415	100676022
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.8612	1.00684163436555e-08	100672415	100676022	7.80645828995192e-08	100686787	100693036
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	103601921	1210	1172	0.0097	7.80645828995192e-08	100686787	100693036	0	103592576	103607411
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	103604177	114100979	3416	3307	-0.434	0	103592576	103607411	3.23035890188728e-28	114100979	114100979
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.6294	3.23035890188728e-28	114100979	114100979	1.18317709515335e-26	114106460	114106460
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	116776572	1090	1030	-0.4386	1.18317709515335e-26	114106460	114106460	0	116748552	116801260
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	116785315	127566573	4012	3860	0.0189	0	116748552	116801260	4.54428429078439e-12	127560827	127568592
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127598425	13	13	-0.5625	4.54428429078439e-12	127560827	127568592	1.29684008478642e-10	127590461	127612608
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127599309	135285645	2704	2621	-0.007	1.29684008478642e-10	127590461	127612608	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1715	-0.4013	NA	NA	NA	1.70319307340131e-193	4923300	4923300
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.3427	1.70319307340131e-193	4923300	4923300	1.20491307082946e-208	4932214	4932214
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	14705188	4013	3867	-0.4356	1.20491307082946e-208	4932214	4932214	0	14689025	14714337
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	14707183	18896166	1582	1524	0.0118	0	14689025	14714337	5.64265355818554e-11	18890351	18908541
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18932031	8	8	-0.665	5.64265355818554e-11	18890351	18908541	4.95064835264772e-10	18917191	18938056
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18933855	22158775	1208	1163	-0.006	4.95064835264772e-10	18917191	18938056	5.33309709944822e-16	22134544	22168355
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22161359	22260156	43	42	0.3565	5.33309709944822e-16	22134544	22168355	7.06338443991488e-14	22254378	22277403
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22262723	22885411	203	196	0.0089	7.06338443991488e-14	22254378	22277403	6.91300352303882e-40	22874320	22890451
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22890451	23296124	62	59	-0.491	6.91300352303882e-40	22874320	22890451	4.17500133111669e-44	23286103	23324916
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	23305334	55123719	8010	7747	0.011	4.17500133111669e-44	23286103	23324916	1.40643590684136e-24	55097806	55129329
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	36	0.4939	1.40643590684136e-24	55097806	55129329	3.21516814988992e-19	55202450	55225136
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	94525952	14323	13857	0.0508	3.21516814988992e-19	55202450	55225136	0	94514108	94537704
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	94527607	107284914	3962	3847	0.3757	0	94514108	94537704	1.85430016442984e-255	107284914	107284914
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-6.039	1.85430016442984e-255	107284914	107284914	5.48878309783994e-243	107292148	107292148
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9735	0.3484	5.48878309783994e-243	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	881	0.3486	NA	NA	NA	1.07400999352377e-21	2106791	2109441
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.724	1.07400999352377e-21	2106791	2109441	3.22659728530455e-20	2127537	2128807
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	6018148	1564	1513	0.3017	3.22659728530455e-20	2127537	2128807	1.93085380810549e-120	5977543	6044079
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6020297	9523923	1251	1205	0.0471	1.93085380810549e-120	5977543	6044079	2.05637925262684e-111	9523923	9523923
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	-3.2011	2.05637925262684e-111	9523923	9523923	6.81501923006708e-107	9550789	9550789
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	11116883	583	562	0.0283	6.81501923006708e-107	9550789	9550789	3.3704305562245e-20	11112600	11116883
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.0752	3.3704305562245e-20	11112600	11116883	1.36859860317732e-13	11140421	11147675
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11143592	1	0	NA	1.36859860317732e-13	11140421	11147675	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	11395862	69	69	0.0523	NA	NA	NA	1.79506206137781e-24	11395862	11395862
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-1.3807	1.79506206137781e-24	11395862	11395862	1.59676349814204e-34	11435643	11435643
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	14353127	1228	1187	0.0332	1.59676349814204e-34	11435643	11435643	0	14313235	14390963
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	14360189	17928374	1094	1055	-0.414	0	14313235	14390963	0	17880287	17983741
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	17942569	23503373	1710	1643	0.0069	0	17880287	17983741	0	23452842	23556001
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23515748	37201219	3790	3662	0.3664	0	23452842	23556001	1.61103819850082e-165	37137828	37233528
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	37208456	38874919	527	513	0.0129	1.61103819850082e-165	37137828	37233528	1.28266192252206e-54	38851662	38890418
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	38879316	39181597	112	109	-0.4315	1.28266192252206e-54	38851662	38890418	2.04007502175731e-58	39171505	39188893
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	39184120	41328353	799	771	0.0137	2.04007502175731e-58	39171505	39188893	0.217555081954914	41224675	41343392
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41331241	41349220	5	5	0.3376	0.217555081954914	41224675	41343392	6.94750774191378e-10	41349220	41353529
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41353529	42288831	214	208	-0.4644	6.94750774191378e-10	41349220	41353529	2.35704645091779e-183	42280053	42316957
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	42312216	43258794	364	358	-1.1532	2.35704645091779e-183	42280053	42316957	6.64871270682504e-66	43254036	43260132
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	43260132	43358414	50	50	-0.4232	6.64871270682504e-66	43254036	43260132	1.199746675176e-53	43356809	43368979
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	43361318	44536889	417	405	-1.1472	1.199746675176e-53	43356809	43368979	4.52224347381749e-40	44533520	44538577
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44538577	44620729	36	34	-0.3975	4.52224347381749e-40	44533520	44538577	4.79219162224963e-45	44619372	44625305
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44623170	45877315	344	337	-1.1504	4.79219162224963e-45	44619372	44625305	0	45873630	45880901
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	45880901	51395102	2339	2246	-0.4168	0	45873630	45880901	0	51387201	51402038
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51397219	79619243	9393	9089	0.0726	0	51387201	51402038	6.0895582201949e-11	79609512	79620891
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79620891	79639360	12	12	0.6464	6.0895582201949e-11	79609512	79620891	6.33097479205357e-12	79638060	79646929
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	79641014	82935235	1026	994	0.0633	6.33097479205357e-12	79638060	79646929	2.96590789528755e-07	82881625	83002772
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	82950135	83086703	18	17	-0.3245	2.96590789528755e-07	82881625	83002772	5.62960892631793e-08	83072014	83100983
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	83089179	90234866	1809	1753	0.0733	5.62960892631793e-08	83072014	83100983	0	90208114	90253427
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	90240530	121595936	11675	11268	-0.4294	0	90208114	90253427	1.45660854555908e-07	121587541	121597885
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121597885	121612439	9	9	0.138	1.45660854555908e-07	121587541	121597885	7.9063641033704e-08	121611424	121618728
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121613579	132289090	3778	3627	-0.4417	7.9063641033704e-08	121611424	121618728	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	19310619	304	299	-0.0231	NA	NA	NA	1.13645769222331e-11	19303561	19311820
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19311820	19355808	16	16	0.5549	1.13645769222331e-11	19303561	19311820	3.25230750418045e-14	19346267	19376087
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19357527	37953582	7018	6757	7e-04	3.25230750418045e-14	19346267	19376087	1.24436626120701e-48	37953582	37953582
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.8509	1.24436626120701e-48	37953582	37953582	5.28754511265468e-52	37957844	37957844
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	40094913	849	825	-0.0029	5.28754511265468e-52	37957844	37957844	7.09075962906036e-08	40092874	40094913
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40096507	40103148	4	4	-0.8061	7.09075962906036e-08	40092874	40094913	5.48074235191447e-09	40103148	40107140
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40107140	40532803	180	174	-0.0092	5.48074235191447e-09	40103148	40107140	1.85673417117445e-07	40531583	40532803
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40534826	40537156	3	3	0.8336	1.85673417117445e-07	40531583	40532803	6.17780653888182e-06	40537156	40539442
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40538325	49964838	3843	3726	0.0134	6.17780653888182e-06	40537156	40539442	1.47973116656768e-58	49964838	49964838
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.0148	1.47973116656768e-58	49964838	49964838	1.02426532844353e-49	49971732	49971732
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1742	0	1.02426532844353e-49	49971732	49971732	3.05113589930354e-14	56610886	56657371
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-0.6196	3.05113589930354e-14	56610886	56657371	1.07394344806847e-17	56680346	56686863
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	71375082	3624	3511	0.0237	1.07394344806847e-17	56680346	56686863	9.08524764644459e-116	71375082	71375082
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2616	9.08524764644459e-116	71375082	71375082	1.20802435528007e-119	71377671	71377671
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	90962425	5004	4843	0.0239	1.20802435528007e-119	71377671	71377671	0	90946446	90976698
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	90964855	109857886	7351	7120	0.3367	0	90946446	90976698	0	109847029	109875418
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	109860665	114123340	1624	1557	0.0079	0	109847029	109875418	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19453177	41	39	-0.3406	NA	NA	NA	9.68079262177962e-14	19434957	19465322
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19455232	21528132	1010	972	0.0142	9.68079262177962e-14	19434957	19465322	3.36534793686398e-43	21501507	21551504
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21529816	22061243	268	263	0.2768	3.36534793686398e-43	21501507	21551504	5.78300339264995e-49	22044438	22090754
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	34674458	4431	4291	0.0189	5.78300339264995e-49	22044438	22090754	2.17895015514981e-11	34666996	34674458
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1753	2.17895015514981e-11	34666996	34674458	9.70641546136468e-12	34683810	34685308
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73058103	13664	13221	0.0093	9.70641546136468e-12	34683810	34685308	0.00100560764087154	73037412	73061942
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73060301	73075500	5	4	-0.4701	0.00100560764087154	73037412	73061942	0.000147830996297047	73075500	73075500
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	-2.0456	0.000147830996297047	73075500	73075500	3.2933765789161e-56	73092112	73092112
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	106218059	12406	11987	-0.0181	3.2933765789161e-56	73092112	73092112	1.10715941272210e-37	106205848	106234009
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	-0.429	1.1071594127221e-37	106205848	106234009	3.22982227603864e-07	106240343	106260876
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0728	3.22982227603864e-07	106240343	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3853	NA	NA	NA	1.46017684167529e-06	18450562	18741716
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20316992	154	151	-0.3153	1.46017684167529e-06	18450562	18741716	4.52443770877231e-38	20022359	20391586
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	32440694	3654	3527	-0.0165	4.52443770877231e-38	20022359	20391586	7.80389614695905e-09	32427407	32452971
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32442322	32676783	45	42	0.2589	7.80389614695905e-09	32427407	32452971	2.86224671856969e-07	32561887	32726383
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32678940	64181419	13322	12891	0.0023	2.86224671856969e-07	32561887	32726383	0	64159995	64194850
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64184776	69260389	2107	2031	0.3385	0	64159995	64194850	2.89027103678322e-08	69248176	69260389
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69262017	69264503	2	2	-0.9069	2.89027103678322e-08	69248176	69260389	4.93774137736525e-08	69264503	69264503
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69266172	72247168	1347	1300	0.3425	4.93774137736525e-08	69264503	69264503	1.48278599735384e-108	72206599	72268819
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72248248	75115806	1249	1215	0.5995	1.48278599735384e-108	72206599	72268819	1.28516557796907e-08	75114211	75115806
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.942	1.28516557796907e-08	75114211	75115806	1.31622703633732e-09	75119713	75119713
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	99632987	9161	8853	0.5844	1.31622703633732e-09	75119713	75119713	1.67773090168096e-08	99630163	99632987
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99636724	3	3	1.632	1.67773090168096e-08	99630163	99632987	1.73246700703099e-07	99636724	99637714
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99637714	100217181	266	253	0.6032	1.73246700703099e-07	99636724	99637714	1.06729633913597e-07	100212401	100282819
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.2217	1.06729633913597e-07	100212401	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	451	0.0519	NA	NA	NA	1.08267196473618e-11	1296506	1296767
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.7934	1.08267196473618e-11	1296506	1296767	4.30927816894086e-17	1300341	1300341
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	1302875	1	0	NA	4.30927816894086e-17	1300341	1300341	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1304232	22553207	7075	6864	-0.0096	NA	NA	NA	6.46109321256741e-09	22338034	22567551
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22561536	22617217	8	8	-0.6717	6.46109321256741e-09	22338034	22567551	2.18928278261212e-09	22609825	22636249
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	75093957	12964	12541	-6e-04	2.18928278261212e-09	22609825	22636249	8.24974914588888e-11	75092501	75093957
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1693	8.24974914588888e-11	75092501	75093957	2.02112935199100e-10	75100865	75102639
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4966	-0.0076	2.021129351991e-10	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	822	-0.387	NA	NA	NA	1.71463796825866e-07	1902148	1904451
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.6551	1.71463796825866e-07	1902148	1904451	5.99244926026944e-09	1906391	1909371
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	34442393	12046	11625	-0.4248	5.99244926026944e-09	1906391	1909371	3.67618932433514e-19	34442393	34442393
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34445816	34446608	2	2	-2.3186	3.67618932433514e-19	34442393	34442393	1.06557323241279e-19	34446608	34446608
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34451067	36673853	966	926	-0.4042	1.06557323241279e-19	34446608	34446608	1.12852625221126e-25	36673853	36673853
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36675987	1	0	NA	1.12852625221126e-25	36673853	36673853	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36684619	5	5	0.9749	NA	NA	NA	1.08516371363925e-24	36684619	36684619
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1956	-0.3956	1.08516371363925e-24	36684619	36684619	1.64035312764375e-36	41561017	41572001
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	43	-0.9666	1.64035312764375e-36	41561017	41572001	5.13278270375479e-36	41706870	42147225
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13212	-0.4017	5.13278270375479e-36	41706870	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	9531929	3272	3174	0.3678	NA	NA	NA	0	9516530	9551861
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	9535424	9535424	1	0	NA	0	9516530	9551861	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	9536800	18133729	2285	2211	0.0161	NA	NA	NA	0	18116875	18165820
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18138667	49454374	9585	9265	-0.4465	0	18116875	18165820	1.36332951861560e-09	49454374	49454374
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	49460662	49464433	2	2	-1.7339	1.3633295186156e-09	49454374	49454374	2.73883457750611e-10	49464433	49464433
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	49468722	53092949	1053	1022	-0.44	2.73883457750611e-10	49464433	49464433	3.76089725754156e-26	53092949	53092949
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.5311	3.76089725754156e-26	53092949	53092949	2.71724373330747e-24	53099601	53099601
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6525	-0.4453	2.71724373330747e-24	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	9662553	4264	4102	-0.3742	NA	NA	NA	0	9628828	9693624
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9664346	56823430	15609	15107	0.0187	0	9628828	9693624	0	56823430	56823430
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-4.3233	0	56823430	56823430	0	56840346	56840346
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1146	-0.0278	0	56840346	56840346	4.86096742868506e-18	59414645	59414898
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.912	4.86096742868506e-18	59414645	59414898	3.74003803745514e-18	59434202	59440262
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1940	-0.0254	3.74003803745514e-18	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	-0.0139	NA	NA	NA	2.99018377971196e-106	1506379	1516966
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1525300	7	6	-2.7394	2.99018377971196e-106	1506379	1516966	0.138027405128120	1516966	1525300
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	1532433	3	3	-1.0986	0.13802740512812	1516966	1525300	1.82354200256398e-10	1532433	1544485
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3570	0.0053	1.82354200256398e-10	1532433	1544485	3.82430030313612e-08	12089020	12095485
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.2056	3.82430030313612e-08	12089020	12095485	5.32201329325393e-09	12113855	12127349
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	21231072	3433	3314	-0.0156	5.32201329325393e-09	12113855	12127349	1.11779732533173e-12	21218936	21255176
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21233374	21301202	31	31	-0.3832	1.11779732533173e-12	21218936	21255176	4.02671535817267e-11	21288668	21313854
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21305173	26142400	1279	1241	-0.0061	4.02671535817267e-11	21288668	21313854	4.05404324128066e-09	26135735	26148060
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26144661	29306447	23	23	-0.4009	4.05404324128066e-09	26135735	26148060	7.92295962787507e-10	28250082	29320846
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29308105	62419534	12525	12094	-0.0101	7.92295962787507e-10	28250082	29320846	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	9888812	2	2	0.1183	NA	NA	NA	0.00453051949069647	9888812	13687936
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9905318	40397894	10328	10001	-0.4356	0.00453051949069647	9888812	13687936	0	40387454	40411024
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40398976	43998218	1743	1676	0.0159	0	40387454	40411024	1.18085856900851e-190	43984707	44019177
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43999292	46922972	1367	1326	0.3401	1.18085856900851e-190	43984707	44019177	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	20755201	2135	2073	0.0362	NA	NA	NA	7.1093420112195e-77	20725820	20775561
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20757296	21898315	548	525	0.3074	7.1093420112195e-77	20725820	20775561	3.08455582958125e-06	21880239	21907624
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21899916	21940676	24	23	0.6505	3.08455582958125e-06	21880239	21907624	0.00054731911387391	21928255	21973164
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21941882	22696162	283	274	0.3446	0.00054731911387391	21928255	21973164	1.07777915520164e-08	22686690	22701205
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22720195	13	12	0.9573	1.07777915520164e-08	22686690	22701205	1.8288000409122e-13	22713972	22725305
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	26917173	2324	2231	0.3089	1.8288000409122e-13	22713972	22725305	0	26899734	26947001
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	26923456	35472378	4225	4107	0.019	0	26899734	26947001	1.57972799173326e-13	35472378	35472378
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.6241	1.57972799173326e-13	35472378	35472378	2.06556297910898e-12	35476942	35476942
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6763	0.0115	2.06556297910898e-12	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2301365	1399	1336	-0.3522	NA	NA	NA	4.58238756583826e-12	2300485	2301365
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.7171	4.58238756583826e-12	2300485	2301365	1.40104328498864e-16	2304398	2306110
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2426938	136	127	-0.4419	1.40104328498864e-16	2304398	2306110	3.22034617723827e-13	2426938	2426938
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.2057	3.22034617723827e-13	2426938	2426938	7.3857674426332e-11	2428307	2428307
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2708291	251	247	-0.3689	7.3857674426332e-11	2428307	2428307	0	2708113	2711273
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22150	0.6689	0	2708113	2711273	4.00987655689495e-23	76998610	76998610
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.8391	4.00987655689495e-23	76998610	76998610	1.16691478991185e-21	77010018	77010018
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	119623939	11384	10979	0.7644	1.16691478991185e-21	77010018	77010018	0	119609295	119630212
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	119624948	154578922	10808	10452	1.2488	0	119609295	119630212	0	154570196	154586690
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154582414	1	0	NA	0	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	0.1186	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-3.9748	NA	NA	NA	1.66821930533494e-11	3773948	4272867
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.4585	1.66821930533494e-11	3773948	4272867	3.11920411673787e-06	5422507	6715636
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	171	-3.7402	3.11920411673787e-06	5422507	6715636	3.93313614349094e-07	7021965	7204505
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	122	-2.7686	3.93313614349094e-07	7021965	7204505	2.85377897682633e-06	7368837	7619476
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7722458	74	73	-3.8721	2.85377897682633e-06	7368837	7619476	6.25870656905155e-07	7709619	7726921
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	17	-2.0984	6.25870656905155e-07	7709619	7726921	5.19889966150751e-09	7758635	7799614
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	416	-3.8036	5.19889966150751e-09	7758635	7799614	4.75925229135563e-23	10511255	10535786
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	17	-1.1377	4.75925229135563e-23	10511255	10535786	1.59876060315267e-19	11673476	12452734
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12537944	11	11	-4.2917	1.59876060315267e-19	11673476	12452734	4.30702034956898e-05	12533900	12554612
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	53	-2.4238	4.30702034956898e-05	12533900	12554612	2.19381789295194e-06	12646477	12700767
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-4.0416	2.19381789295194e-06	12646477	12700767	0.0025361420207677	12792780	12887023
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12999095	59	58	-2.8594	0.0025361420207677	12792780	12887023	0.000419274713398004	12959689	13004854
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-1.5141	0.000419274713398004	12959689	13004854	8.71009631270945e-05	13032760	13061201
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13104920	26	25	-2.8903	8.71009631270945e-05	13032760	13061201	0.00870941755884172	13061201	13109337
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.5776	0.00870941755884172	13061201	13109337	3.03127000339516e-10	13129843	13137597
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13158272	15	13	-4.0207	3.03127000339516e-10	13129843	13137597	0.0454317339065272	13140274	13238502
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13262997	30	30	-3.0297	0.0454317339065272	13140274	13238502	1.43030839233771e-07	13240240	13283695
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13427571	68	66	-4.1665	1.43030839233771e-07	13240240	13283695	6.29944555661793e-10	13422642	13430638
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13430638	13437661	6	6	-1.9158	6.29944555661793e-10	13422642	13430638	6.11900398971181e-07	13436273	13440916
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13438904	14342834	289	275	-4.0504	6.11900398971181e-07	13436273	13440916	2.97583399132085e-17	14323815	14388689
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14700040	145	135	-3.0656	2.97583399132085e-17	14323815	14388689	4.6789725747762e-07	14538156	14841337
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15915466	394	376	-3.7737	4.6789725747762e-07	14538156	14841337	6.43133513859791e-05	15650200	16039703
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16187669	112	107	-3.1266	6.43133513859791e-05	15650200	16039703	5.62857846190942e-11	16133263	16228031
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16189066	22139807	988	948	-3.9416	5.62857846190942e-11	16133263	16228031	7.31904827570802e-06	22049641	22139807
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0044	7.31904827570802e-06	22049641	22139807	2.29749701738965e-19	22177335	22178964
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22367156	31	30	-4.7383	2.29749701738965e-19	22177335	22178964	0.000263757399187744	22241781	22771961
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22371003	22930737	62	59	-3.9519	0.000263757399187744	22241781	22771961	4.28413811561827e-78	22930737	22930737
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-0.9379	4.28413811561827e-78	22930737	22930737	2.58072395723892e-06	26945084	27000085
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.4219	2.58072395723892e-06	26945084	27000085	0.00158353160231704	26998633	27070887
MSK_252152915086_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-1.0451	0.00158353160231704	26998633	27070887	NA	NA	NA
