Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	8719798	2781	2658	0.0704	NA	NA	NA	8.48632813657444e-22	8709257	8725600
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8721624	8785480	36	35	-0.4444	8.48632813657444e-22	8709257	8725600	6.7578258809252e-23	8777140	8792500
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8786890	12793354	1701	1638	0.0576	6.7578258809252e-23	8777140	8792500	2.40458700391586e-14	12790795	13104898
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12831942	13649201	8	7	-0.8398	2.40458700391586e-14	12790795	13104898	9.06103191473159e-13	12839991	13654754
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13654754	16888048	1263	1216	0.0491	9.06103191473159e-13	12839991	13654754	3.04143354653176e-13	16836160	16917759
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16917759	17086698	8	8	-0.7878	3.04143354653176e-13	16836160	16917759	1.47066323578474e-14	17080364	17094326
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17094326	28742438	4890	4676	0.0519	1.47066323578474e-14	17080364	17094326	6.18946630268486e-38	28721216	28766376
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	28746992	29118210	172	169	0.348	6.18946630268486e-38	28721216	28766376	2.58154592641379e-43	29096871	29140514
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	29120796	34859068	2034	1956	0.0327	2.58154592641379e-43	29096871	29140514	3.38403827694134e-11	34853835	34859068
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34869589	34869589	1	0	NA	3.38403827694134e-11	34853835	34859068	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.9836	NA	NA	NA	4.18858642646198e-13	34883375	34883375
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	36133899	527	512	0.0088	4.18858642646198e-13	34883375	34883375	8.75651755837442e-57	36124061	36142787
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36135096	36463308	154	147	0.3921	8.75651755837442e-57	36124061	36142787	2.58902821799265e-54	36446788	36474095
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36464891	52376855	6326	6089	0.031	2.58902821799265e-54	36446788	36474095	1.02824931699815e-08	52367251	52376855
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52378388	52379645	2	2	1.2956	1.02824931699815e-08	52367251	52376855	8.73571894587507e-10	52379645	52382011
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52382011	86800503	12455	11993	0.0273	8.73571894587507e-10	52379645	52382011	2.98147904350754e-07	86797435	86800503
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86801675	86809511	6	6	-0.6112	2.98147904350754e-07	86797435	86800503	2.26509408922793e-07	86809511	86813797
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86811798	88652030	493	476	0.0279	2.26509408922793e-07	86809511	86813797	2.68854478679242e-32	88594706	88702195
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	88669048	88669048	1	0	NA	2.68854478679242e-32	88594706	88702195	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	88679904	89024147	132	126	0.3513	NA	NA	NA	8.26491393432964e-38	89005049	89041216
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	89025343	110033018	6618	6347	0.0403	8.26491393432964e-38	89005049	89041216	5.52777053418185e-10	110033018	110033018
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.3252	5.52777053418185e-10	110033018	110033018	4.3485867548248e-10	110039388	110039388
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2128	0.0315	4.3485867548248e-10	110039388	110039388	4.71262667730704e-109	116029725	116029725
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-4.1228	4.71262667730704e-109	116029725	116029725	4.6039701422241e-109	116033402	116033402
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	120333077	1592	1532	0.0199	4.6039701422241e-109	116033402	116033402	5.25064742850419e-10	120315921	120386887
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120338395	1	0	NA	5.25064742850419e-10	120315921	120386887	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120347824	120936550	36	34	-0.2944	NA	NA	NA	0.000183684017106330	120890717	120968980
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120938895	121017531	29	29	-0.0176	0.00018368401710633	120890717	120968980	1.31737737592572e-19	121017531	121017531
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	121023841	121052394	5	5	0.9949	1.31737737592572e-19	121017531	121017531	4.06022136747803e-18	121052394	141559466
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	143659690	26	25	-0.0274	4.06022136747803e-18	121052394	141559466	1.27634279765854e-15	143653780	143702972
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143793256	49	46	-0.5214	1.27634279765854e-15	143653780	143702972	7.6704009067647e-11	143786234	143805209
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143799153	144099712	33	33	-0.1398	7.6704009067647e-11	143786234	143805209	2.36905131549818e-21	144003068	144107002
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099998	150839754	1859	1767	0.3365	2.36905131549818e-21	144003068	144107002	1.90672508587253e-76	150839754	150839754
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-2.2295	1.90672508587253e-76	150839754	150839754	1.37298633221731e-76	150846148	150846148
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.37298633221731e-76	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2660	0.3537	NA	NA	NA	5.35007776544148e-96	157133150	157133150
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.7159	5.35007776544148e-96	157133150	157133150	7.8506487928681e-101	157136342	157136342
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	157138568	1	0	NA	7.8506487928681e-101	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157139824	185979586	11324	10917	0.3385	NA	NA	NA	7.08513357836404e-97	185979586	185979586
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-3.6357	7.08513357836404e-97	185979586	185979586	6.19129273378995e-94	185988138	185988138
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	227875096	14099	13517	0.3528	6.19129273378995e-94	185988138	185988138	1.15867536105040e-119	227875096	227875096
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-3.3192	1.1586753610504e-119	227875096	227875096	2.69238519692392e-114	227882805	227882805
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	231304179	1333	1289	0.3334	2.69238519692392e-114	227882805	227882805	2.00446388766015e-31	231287183	231315265
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231308203	231525328	105	95	-0.0175	2.00446388766015e-31	231287183	231315265	2.26958708360165e-35	231515332	231539203
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231529010	244434655	4974	4793	0.3395	2.26958708360165e-35	231515332	231539203	6.12717586692271e-23	244432228	244434655
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244436503	244453610	10	10	-0.5455	6.12717586692271e-23	244432228	244434655	3.80204615560547e-23	244453610	244455791
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244455791	244907498	210	203	0.3498	3.80204615560547e-23	244453610	244455791	1.48990277276453e-18	244891841	244925322
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244907523	245117370	88	85	0.0222	1.48990277276453e-18	244891841	244925322	8.99790756513938e-25	245100854	245136055
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	245118864	246831381	646	623	0.3873	8.99790756513938e-25	245100854	245136055	2.79624999312419e-06	246806669	246836754
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246834936	246855902	12	11	0.8235	2.79624999312419e-06	246806669	246836754	1.53761362940933e-05	246852126	246882156
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246857496	247186514	102	99	0.3328	1.53761362940933e-05	246852126	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13893579	4269	4086	0.3239	NA	NA	NA	6.60464252375479e-12	13838965	13906257
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13898849	14119560	37	37	-0.0186	6.60464252375479e-12	13838965	13906257	9.39136197061428e-13	14102521	14162960
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	14127524	15938055	510	492	0.3226	9.39136197061428e-13	14102521	14162960	2.3505406161451e-19	15934155	15938055
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15941346	15954717	9	9	-0.5168	2.3505406161451e-19	15934155	15938055	2.37065915906409e-18	15954717	15969580
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15969580	37813211	8086	7747	0.332	2.37065915906409e-18	15954717	15969580	4.39108177049924e-38	37812045	37819785
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37855837	20	20	-0.4822	4.39108177049924e-38	37812045	37819785	1.05768060046303e-38	37852371	37858379
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	132405798	27421	26360	0.3341	1.05768060046303e-38	37852371	37858379	4.6695108646637e-17	132397397	132724793
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132724793	132739926	6	6	-0.6695	4.6695108646637e-17	132397397	132724793	4.65019400041233e-19	132738691	132739926
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132747227	197698429	21087	20241	0.3388	4.65019400041233e-19	132738691	132739926	4.36122986188465e-22	197694473	197698429
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197702605	197702605	1	0	NA	4.36122986188465e-22	197694473	197698429	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197705422	197726367	11	11	-0.4604	NA	NA	NA	3.87816315818193e-23	197726367	197727619
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197727619	198301821	250	240	0.382	3.87816315818193e-23	197726367	197727619	1.5281874562885e-10	198300141	198301821
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198307946	198313546	4	4	-0.5556	1.5281874562885e-10	198300141	198301821	1.49434280931674e-09	198313546	198316089
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198316089	218837111	7644	7348	0.3389	1.49434280931674e-09	198313546	198316089	2.02194100552698e-07	218833753	218842100
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218839935	218849164	5	5	1.0509	2.02194100552698e-07	218833753	218842100	1.60303636499679e-08	218844854	218852974
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218850436	218976344	67	63	0.3414	1.60303636499679e-08	218844854	218852974	1.76614553449277e-10	218976344	218976344
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218977128	218978243	3	3	-0.6182	1.76614553449277e-10	218976344	218976344	2.25986249555399e-07	218978243	218978839
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218978839	236071705	5871	5676	0.3315	2.25986249555399e-07	218978243	218978839	0	236046224	236086250
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	236073551	242506262	2461	2375	0.0029	0	236046224	236086250	1.95017259251659e-08	242469111	242551627
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242666531	59	58	0.2398	1.95017259251659e-08	242469111	242551627	8.28856583658228e-05	242655973	242677220
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677011	242689978	6	6	-0.3583	8.28856583658228e-05	242655973	242677220	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	589224	199	189	0.0135	NA	NA	NA	2.98286816615925e-06	563904	595451
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	592415	635754	11	11	-0.4603	2.98286816615925e-06	563904	595451	1.36697636537402e-07	626604	649496
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	641257	1	0	NA	1.36697636537402e-07	626604	649496	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	643285	15080087	5279	5084	0.0204	NA	NA	NA	1.70060876947911e-45	15062711	15093656
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	15082135	15082135	1	0	NA	1.70060876947911e-45	15062711	15093656	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	15085502	15385274	126	119	0.371	NA	NA	NA	1.10235887043137e-52	15370005	15401387
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	15388653	32074432	5179	5004	0.0011	1.10235887043137e-52	15370005	15401387	1.22796836792855e-42	32074432	32074432
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.539	1.22796836792855e-42	32074432	32074432	2.23651701447520e-39	32080848	32080848
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	48203233	5760	5518	0.0179	2.2365170144752e-39	32080848	32080848	0	48194732	48213373
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	48205561	89475107	14083	13491	-0.4118	0	48194732	48213373	4.04989288803141e-42	89473678	89475107
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89499433	12	12	-1.1864	4.04989288803141e-42	89473678	89475107	5.47214563854485e-20	89499433	89500935
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89500935	90391698	188	179	-0.3948	5.47214563854485e-20	89499433	89500935	5.94174918223351e-93	90362345	95034308
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95016192	101125894	1683	1614	0.0447	5.94174918223351e-93	90362345	95034308	2.12925040185876e-37	101115448	101132692
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101127773	101268751	69	67	-0.3937	2.12925040185876e-37	101115448	101132692	1.47683590316199e-40	101262922	101276781
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101271228	117298400	5065	4858	0.0407	1.47683590316199e-40	101262922	101276781	2.17573620437740e-178	117292024	117306781
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117300949	117300949	1	0	NA	2.1757362043774e-178	117292024	117306781	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117303448	118029464	262	253	-0.4341	NA	NA	NA	4.2737222724319e-153	118011564	118053281
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118035653	133189686	5788	5579	0.0278	4.2737222724319e-153	118011564	118053281	9.52118237274027e-08	133187633	133189686
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.2187	9.52118237274027e-08	133187633	133189686	8.22065790695488e-09	133194685	133198618
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	8.22065790695488e-09	133194685	133198618	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	137364327	1472	1413	0.0311	NA	NA	NA	3.98389677916454e-31	137357833	137370560
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137367154	137488644	43	42	-0.4536	3.98389677916454e-31	137357833	137370560	1.12444088994029e-06	137487108	137495461
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137493758	137502360	6	5	-1.1256	1.12444088994029e-06	137487108	137495461	9.46750308922345e-06	137497315	137509998
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137505051	137571198	26	25	-0.4361	9.46750308922345e-06	137497315	137509998	1.38930351788496e-19	137568837	137581474
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137576714	137854162	118	113	-1.0543	1.38930351788496e-19	137568837	137581474	0	137852049	137854162
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	137858039	156834492	5655	5443	0.035	0	137852049	137854162	1.10184926086540e-11	156821028	156844059
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156836111	156879305	22	21	-0.3958	1.1018492608654e-11	156821028	156844059	5.20895859003163e-13	156874111	156884586
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156880883	163020584	2307	2212	0.0514	5.20895859003163e-13	156874111	156884586	1.62342566954956e-143	163009037	163025302
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163025302	163992903	127	124	0.6631	1.62342566954956e-143	163009037	163025302	0	163992903	163992903
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-4.9899	0	163992903	163992903	6.90023805317944e-35	164005577	164005577
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	3	-0.0879	6.90023805317944e-35	164005577	164005577	3.7978727496098e-14	164027724	164027724
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-4.4028	3.7978727496098e-14	164027724	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10663	0.6051	0	164107951	164107951	2.17876272424883e-20	196809098	196904349
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	29	0.1116	2.17876272424883e-20	196809098	196904349	8.69992423271509e-15	196950095	196970927
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	198038358	430	405	0.5862	8.69992423271509e-15	196950095	196970927	1.27310055476618e-09	198036999	198038358
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.8432	1.27310055476618e-09	198036999	198038358	5.40536892650781e-11	198042681	198044259
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199320046	518	498	0.596	5.40536892650781e-11	198042681	198044259	2.38453349746812e-05	199309650	199321387
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199321387	199329592	3	3	-0.2304	2.38453349746812e-05	199309650	199321387	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.3171	NA	NA	NA	1.76310893746794e-19	58159	61552
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	5079730	1672	1616	0.6431	1.76310893746794e-19	58159	61552	4.75403592977738e-160	5042987	5103643
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5083003	5083003	1	0	NA	4.75403592977738e-160	5042987	5103643	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5084600	9815760	1711	1646	0.3415	NA	NA	NA	8.51229606355243e-07	9792028	9815760
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	1.2189	8.51229606355243e-07	9792028	9815760	6.9524756766046e-10	9842644	9853710
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	20976426	3141	3011	0.3223	6.9524756766046e-10	9842644	9853710	1.63817849559055e-23	20976426	20976426
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20978464	20984803	4	3	-1.2501	1.63817849559055e-23	20976426	20976426	5.12341196147477e-20	20984803	20984803
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20988104	23173629	625	601	0.3463	5.12341196147477e-20	20984803	20984803	2.53794483729571e-166	23110449	23239717
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	23189864	41735687	4939	4765	0.029	2.53794483729571e-166	23110449	23239717	2.5994624577963e-18	41709619	41757301
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	41736757	41955911	70	68	0.3282	2.5994624577963e-18	41709619	41757301	1.48266650196371e-14	41879393	42041415
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	41960824	43708890	453	438	0.0325	1.48266650196371e-14	41879393	42041415	9.4460161086376e-96	43708890	43708890
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	43715772	43719899	2	2	-4.0283	9.4460161086376e-96	43708890	43708890	2.28661090478791e-126	43719899	43719899
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	43730871	44119177	135	131	-0.0025	2.28661090478791e-126	43719899	43719899	1.41797626770320e-34	44104066	44130589
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	44121404	45299420	236	229	0.3265	1.4179762677032e-34	44104066	44130589	1.10476206977874e-45	45236386	45370820
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45316272	46530055	294	293	0.0144	1.10476206977874e-45	45236386	45370820	2.20392996804613e-88	46514383	46544733
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	46532329	46532329	1	0	NA	2.20392996804613e-88	46514383	46544733	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	46534703	55224998	1967	1892	0.3487	NA	NA	NA	4.79382806610209e-209	55222169	55226765
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	55226765	55635093	112	109	-0.458	4.79382806610209e-209	55222169	55226765	7.78326268961973e-185	55632721	55636287
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	55636287	56493867	313	304	0.3671	7.78326268961973e-185	55632721	55636287	0	56491951	56498693
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	56498693	57705600	489	465	-0.3838	0	56491951	56498693	2.48044190542409e-158	57692722	57713093
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57708311	58510414	128	126	0.3481	2.48044190542409e-158	57692722	57713093	6.66289378998515e-221	58499583	58520123
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	58520123	78831618	5146	4937	-0.4034	6.66289378998515e-221	58499583	58520123	1.28199109477433e-46	78827926	78841758
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78832885	78933986	45	43	-0.9927	1.28199109477433e-46	78827926	78841758	5.54266291314106e-47	78925960	78942272
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78940068	104410204	8840	8521	-0.4066	5.54266291314106e-47	78925960	78942272	1.19675615147869e-23	104402565	104410204
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104422011	104466830	8	8	-1.3745	1.19675615147869e-23	104402565	104410204	1.55728057588422e-25	104466830	104466830
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104470237	119883661	4553	4386	-0.4044	1.55728057588422e-25	104466830	104466830	2.71502955424103e-254	119882230	119889559
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119885391	120302459	183	172	-1.0745	2.71502955424103e-254	119882230	119889559	9.09020002103329e-251	120296111	120304770
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	120304770	173660684	14754	14180	-0.4082	9.09020002103329e-251	120296111	120304770	1.49075990350960e-15	173660684	173660684
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.1547	1.4907599035096e-15	173660684	173660684	9.37148234816427e-16	173666072	173666072
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3637	-0.4091	9.37148234816427e-16	173666072	173666072	2.0035263493386e-79	186676034	186676034
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.0485	2.0035263493386e-79	186676034	186676034	2.19995391407560e-69	186680176	186680176
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	295	-0.4257	2.1999539140756e-69	186680176	186680176	4.6761400560192e-07	187327270	187330240
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.3714	4.6761400560192e-07	187327270	187330240	3.09688533571501e-08	187338465	187346058
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	188079198	298	288	-0.4381	3.09688533571501e-08	187338465	187346058	6.35705920098398e-07	188076938	188079198
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188081084	188085059	3	3	-1.3061	6.35705920098398e-07	188076938	188079198	3.41241259427795e-06	188085059	188089090
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188089090	191153613	938	897	-0.4587	3.41241259427795e-06	188085059	188089090	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	514153	134	131	0.3613	NA	NA	NA	4.77903641242007e-05	491034	535514
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	515610	569884	26	26	0.6362	4.77903641242007e-05	491034	535514	4.45321498066029e-06	559821	589249
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	571442	776194	63	59	0.2538	4.45321498066029e-06	559821	589249	1.00832455067366e-07	730853	776194
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	870657	6	5	1.1172	1.00832455067366e-07	730853	776194	2.22642868045385e-09	870657	873365
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	873365	12441674	3660	3524	0.3225	2.22642868045385e-09	870657	873365	2.49831622750763e-152	12424659	12453006
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12453006	13429981	109	107	1.0043	2.49831622750763e-152	12424659	12453006	1.12803198618445e-19	13345654	13537684
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13444114	15068555	596	569	1.296	1.12803198618445e-19	13345654	13537684	2.73262204019555e-108	15054268	15079192
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	15072069	15842335	233	225	0.7992	2.73262204019555e-108	15054268	15079192	1.6328674131833e-63	15833811	15848893
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	15844358	16301504	211	200	1.2352	1.6328674131833e-63	15833811	15848893	4.92569903443625e-29	16278373	16337266
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	16314931	16513891	44	40	1.7769	4.92569903443625e-29	16278373	16337266	3.24810488654289e-229	16511880	16513891
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	16515103	16515103	1	0	NA	3.24810488654289e-229	16511880	16513891	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	16518419	16883534	176	166	0.3465	NA	NA	NA	1.69397367523592e-83	16879550	16888777
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	16885599	17212259	114	112	0.989	1.69397367523592e-83	16879550	16888777	9.66537003885494e-125	17207815	17218601
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17214734	20764816	869	834	0.357	9.66537003885494e-125	17207815	17218601	1.82260636206873e-73	20747747	20777041
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20767407	21167521	66	63	0.9943	1.82260636206873e-73	20747747	20777041	1.34034620896818e-10	21120106	21214634
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21171340	21610433	65	61	0.5561	1.34034620896818e-10	21120106	21214634	3.13487023820503e-18	21598643	21616990
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21614671	21712727	28	27	1.2665	3.13487023820503e-18	21598643	21616990	8.38298929547595e-07	21690890	21739417
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21716795	21868104	70	69	0.9103	8.38298929547595e-07	21690890	21739417	6.6862791545792e-16	21858622	21877909
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21869703	22090344	67	62	1.3341	6.6862791545792e-16	21858622	21877909	9.13250028723787e-160	22088394	22093175
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	22093175	23491662	470	458	0.3621	9.13250028723787e-160	22088394	22093175	4.22836220421335e-212	23468785	23498047
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	23498047	24614468	250	245	1.0012	4.22836220421335e-212	23468785	23498047	1.50613609040053e-231	24610844	24617567
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24617567	26778108	352	338	0.3336	1.50613609040053e-231	24610844	24617567	1.44273219815074e-135	26769770	26804375
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	26786268	27733440	207	195	0.8807	1.44273219815074e-135	26769770	26804375	1.60705500313833e-61	27722740	27745326
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	27740722	28189220	69	67	1.4929	1.60705500313833e-61	27722740	27745326	7.48188114118359e-26	28161091	28219739
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	28199508	28745559	80	78	1.049	7.48188114118359e-26	28161091	28219739	1.20043889952307e-87	28741488	28755206
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	28751340	29383517	114	109	0.3013	1.20043889952307e-87	28741488	28755206	1.40208001658781e-45	29366396	29396767
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	29387725	30891954	187	182	0.7789	1.40208001658781e-45	29366396	29396767	6.62794141061552e-65	30846928	30938399
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	30904975	31799261	297	284	0.3447	6.62794141061552e-65	30846928	30938399	2.35798887878825e-54	31781464	31820265
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	31801650	32942718	499	476	0.6652	2.35798887878825e-54	31781464	31820265	0	32940729	32945399
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32945399	34477434	479	462	1.6219	0	32940729	32945399	1.17988142358422e-101	34419035	34515628
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	34484836	35222658	286	274	1.1042	1.17988142358422e-101	34419035	34515628	5.8744738637924e-11	35211448	35224152
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	35224152	35258934	18	18	1.5954	5.8744738637924e-11	35211448	35224152	1.20235493278686e-05	35252773	35281726
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	35260505	37449150	764	743	1.2225	1.20235493278686e-05	35252773	35281726	3.30592316040164e-41	37431964	37463960
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37452978	37917189	170	164	0.8662	3.30592316040164e-41	37431964	37463960	6.00671467653563e-135	37907097	37928994
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37923561	39221087	458	443	1.5477	6.00671467653563e-135	37907097	37928994	1.49097876616839e-11	39203913	39224198
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	39223067	39267919	22	20	1.0486	1.49097876616839e-11	39203913	39224198	1.31378245740467e-11	39258511	39277851
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	39270029	40769006	288	274	1.4866	1.31378245740467e-11	39258511	39277851	5.89176035464923e-206	40767001	40773223
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	40773223	41208130	183	177	0.6989	5.89176035464923e-206	40767001	40773223	6.64198475989963e-50	41195959	41221973
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41209621	43736735	865	822	0.3621	6.64198475989963e-50	41195959	41221973	1.53351319269143e-05	43728982	43738927
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	43738927	43744847	4	4	1.0559	1.53351319269143e-05	43728982	43738927	8.83597379520136e-06	43741980	43751811
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	43748512	45034352	247	241	0.3876	8.83597379520136e-06	43741980	43751811	7.72826721910532e-06	44948886	45048753
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45039508	45141151	17	16	0.7244	7.72826721910532e-06	44948886	45048753	6.88661177507565e-16	45131988	45162935
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45147025	46008694	261	245	1.2493	6.88661177507565e-16	45131988	45162935	0	46008694	46008694
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	46136065	59959592	3224	3115	-0.0091	0	46008694	46008694	2.84297811725517e-25	59940952	59977717
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59962748	60152642	71	68	0.3397	2.84297811725517e-25	59940952	59977717	1.04802828543500e-12	60132435	60171206
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60156087	60436983	113	110	0.0105	1.048028285435e-12	60132435	60171206	4.04779349695276e-10	60405242	60455772
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60448767	60611208	48	46	0.3086	4.04779349695276e-10	60405242	60455772	8.18014534764064e-15	60569600	60666013
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60616675	127507997	18770	18000	-0.005	8.18014534764064e-15	60569600	60666013	1.27426175888876e-28	127486937	127519247
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127512410	127693619	76	76	0.3302	1.27426175888876e-28	127486937	127519247	1.77353644935123e-25	127671926	127707203
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127696460	138742506	4048	3860	7e-04	1.77353644935123e-25	127671926	127707203	1.71583838108763e-21	138732403	138746904
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138743982	138844937	53	50	-0.3705	1.71583838108763e-21	138732403	138746904	9.32456635836486e-20	138838295	138907986
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138893482	180644810	14238	13658	-0.0028	9.32456635836486e-20	138838295	138907986	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	244363	58	56	0.0407	NA	NA	NA	6.84688169757386e-12	236535	251128
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	246974	323898	42	38	-0.3509	6.84688169757386e-12	236535	251128	5.60875904840831e-16	314877	332608
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	326323	32548736	11576	11092	0.0224	5.60875904840831e-16	314877	332608	9.4266159401118e-130	32548736	32588005
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32650672	20	20	-1.4327	9.4266159401118e-130	32548736	32588005	2.92418339504838e-08	32609525	32650672
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32653710	32713363	26	26	-0.0982	2.92418339504838e-08	32609525	32650672	3.63344632731137e-05	32711957	32728285
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	-0.7569	3.63344632731137e-05	32711957	32728285	1.61561930058058e-19	32732764	32742767
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	33706463	422	409	0.0193	1.61561930058058e-19	32732764	32742767	6.42775938678598e-08	33692004	33718097
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33708772	33757937	25	24	0.389	6.42775938678598e-08	33692004	33718097	1.24618990137137e-08	33745964	33773509
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33761108	57297153	9056	8697	0.0356	1.24618990137137e-08	33745964	33773509	1.09540863375090e-40	57271682	57323506
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57298746	57298746	1	0	NA	1.0954086337509e-40	57271682	57323506	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57300498	57672491	145	140	-0.2749	NA	NA	NA	2.15529082975017e-43	57623527	57763538
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57683389	103841482	11814	11353	0.0335	2.15529082975017e-43	57623527	57763538	3.36316206052969e-185	103841482	103841482
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.6812	3.36316206052969e-185	103841482	103841482	1.80546213645972e-177	103868154	103868154
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	152087982	16522	15827	0.0252	1.80546213645972e-177	103868154	103868154	2.63125984287578e-26	152087982	152087982
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152091142	152100384	5	5	-1.268	2.63125984287578e-26	152087982	152087982	4.67489188832172e-25	152100384	152100384
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152102362	166414597	4879	4710	0.0019	4.67489188832172e-25	152100384	152100384	1.80164298675163e-18	166414597	166414597
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166418511	166422386	3	3	-1.4117	1.80164298675163e-18	166414597	166414597	3.11654124621622e-16	166422386	166422386
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166425475	170753106	1505	1451	0.0106	3.11654124621622e-16	166422386	166422386	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	36388040	12844	12334	0.0016	NA	NA	NA	5.69119782150941e-19	36377005	36394671
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	36389161	36446198	27	27	-0.4828	5.69119782150941e-19	36377005	36394671	8.63221433349121e-19	36437293	36450495
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	36448217	109217320	22090	21217	0.0058	8.63221433349121e-19	36437293	36450495	7.79852691473453e-10	109212149	109217320
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109245944	7	7	0.7145	7.79852691473453e-10	109212149	109217320	4.50479967647455e-10	109245944	109248626
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109247295	141410894	14835	14213	0.0162	4.50479967647455e-10	109245944	109248626	1.12608924373474e-10	141406414	141422860
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5431	1.12608924373474e-10	141406414	141422860	1.53851691645568e-09	141429405	141443577
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147168935	2375	2282	0.0153	1.53851691645568e-09	141429405	141443577	1.27123627479803e-67	147149279	147182498
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147170276	147702365	264	259	0.3362	1.27123627479803e-67	147149279	147182498	2.13894654187861e-13	147702365	147702365
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.1834	2.13894654187861e-13	147702365	147702365	4.60929604796946e-12	147707161	147707161
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1560	0.3283	4.60929604796946e-12	147707161	147707161	7.45397815766248e-30	151728811	151728811
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.8457	7.45397815766248e-30	151728811	151728811	1.15109503588160e-27	151743145	151743145
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2501	0.3242	1.1510950358816e-27	151743145	151743145	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	709	-0.4241	NA	NA	NA	5.82508413800065e-121	2234351	2234351
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-3.9143	5.82508413800065e-121	2234351	2234351	5.1352537945101e-161	2251011	2251011
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	7226901	1652	1594	-0.4462	5.1352537945101e-161	2251011	2251011	2.81336129172494e-24	7226901	7322035
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-1.4141	2.81336129172494e-24	7226901	7322035	2.96296285267807e-24	7729311	8143301
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	8139999	2	0	NA	2.96296285267807e-24	7729311	8143301	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8143301	10722127	1049	1013	-0.4146	NA	NA	NA	0	10721048	10724261
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10723158	25120552	4707	4510	-1.1041	0	10721048	10724261	1.66498964895812e-36	25120552	25120552
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.66498964895812e-36	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.5983	NA	NA	NA	3.44584196398495e-40	25125700	25125700
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	35414727	3687	3537	-1.1192	3.44584196398495e-40	25125700	25125700	0	35412038	35417102
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	35417102	37671414	550	530	-0.424	0	35412038	35417102	0	37671414	37671414
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	37673461	39350798	675	653	1.0464	0	37671414	37671414	8.20227318415741e-48	39339800	39354149
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	1.6809	8.20227318415741e-48	39339800	39354149	1.62035142386698e-14	39499752	39511632
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	39566067	22	22	1.0904	1.62035142386698e-14	39499752	39511632	4.72560033097364e-07	39556705	39579093
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39567325	39621785	16	16	0.6752	4.72560033097364e-07	39556705	39579093	4.81615340241155e-07	39616489	39641522
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39625172	40192983	187	180	1.0895	4.81615340241155e-07	39616489	39641522	1.49599954841978e-45	40147598	40284700
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40208325	53820633	2861	2746	0.7688	1.49599954841978e-45	40147598	40284700	3.66811273459733e-59	53811632	53834519
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	53824974	54231307	57	54	1.421	3.66811273459733e-59	53811632	53834519	2.34632497807869e-07	54142331	54240565
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	54236167	54304304	21	21	0.9703	2.34632497807869e-07	54142331	54240565	7.45016049317633e-47	54302415	54309487
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	54306166	61661426	2046	1962	1.6351	7.45016049317633e-47	54302415	54309487	0	61659387	61661426
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	61664369	63377340	551	529	0.5474	0	61659387	61661426	2.46982393802686e-262	63377340	63377340
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	63379224	63386160	5	5	-4.0604	2.46982393802686e-262	63377340	63377340	0	63386160	63386160
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	63388204	87431545	6970	6684	0.5679	0	63386160	63386160	0	87431545	87432979
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87432979	98196004	3291	3160	-0.4541	0	87431545	87432979	0	98189907	98202721
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98197356	146264846	15406	14813	0.0092	0	98189907	98202721	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	194104	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194193	578654	182	176	0.3231	NA	NA	NA	3.77139229782342e-16	577359	580722
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	580722	598488	9	9	-0.5555	3.77139229782342e-16	577359	580722	3.11576344869253e-23	596009	600119
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	600119	27715455	8833	8485	0.3575	3.11576344869253e-23	596009	600119	4.23217549180339e-14	27672060	27745844
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27721268	27900094	32	32	-0.0237	4.23217549180339e-14	27672060	27745844	2.09853332930069e-14	27879092	27920767
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27906783	29090995	504	484	0.3507	2.09853332930069e-14	27879092	27920767	1.10421628805206e-17	29048847	29116382
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	29094104	29401443	57	56	0.0376	1.10421628805206e-17	29048847	29116382	2.38480640025485e-18	29365301	29464611
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	29407091	47002187	3121	3002	0.3813	2.38480640025485e-18	29365301	29464611	1.71786999886546e-21	45359327	66245109
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	67927172	12	12	-0.4178	1.71786999886546e-21	45359327	66245109	2.26795275124464e-07	67915082	70207320
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	306	-0.0037	2.26795275124464e-07	67915082	70207320	9.21415182901903e-12	70926188	70926188
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.2658	9.21415182901903e-12	70926188	70926188	2.98173861392926e-09	70930528	70930528
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	72036098	453	435	0.0159	2.98173861392926e-09	70930528	70930528	3.27922062423519e-158	72028766	72056479
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	72051218	73510319	645	608	-0.427	3.27922062423519e-158	72028766	72056479	8.73734429749266e-128	73499318	73519284
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73512233	74147787	275	265	0.0393	8.73734429749266e-128	73499318	73519284	1.18290529761649e-183	74139528	74159902
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	74151289	86960197	3987	3839	-0.4367	1.18290529761649e-183	74139528	74159902	1.23034876976861e-08	86956605	86960197
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.7443	1.23034876976861e-08	86956605	86960197	5.49178505974655e-08	86965458	86968271
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116124007	10106	9741	-0.4241	5.49178505974655e-08	86965458	86968271	8.05714427042286e-09	116124007	116124007
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.6471	8.05714427042286e-09	116124007	116124007	1.94278846490906e-08	116130333	116132839
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	123449399	2434	2339	-0.4275	1.94278846490906e-08	116130333	116132839	2.91246788411589e-10	123449399	123449399
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123451454	123453227	2	2	0.9126	2.91246788411589e-10	123449399	123449399	4.78200310580957e-10	123453227	123453227
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123455396	129499038	2659	2547	-0.403	4.78200310580957e-10	123453227	123453227	4.97137300879785e-06	129495684	129499038
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129500901	129506210	3	3	-1.247	4.97137300879785e-06	129495684	129499038	4.26644391713015e-06	129506210	129510647
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129508476	129508476	1	0	NA	4.26644391713015e-06	129506210	129510647	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129510647	137352394	3196	3044	-0.3501	NA	NA	NA	2.03378053757262e-31	137352394	137352394
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.1542	2.03378053757262e-31	137352394	137352394	1.65338531373080e-27	137356880	137356880
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	139192387	727	696	-0.284	1.6533853137308e-27	137356880	137356880	5.67657337116887e-08	139166622	139213971
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139195458	139279601	30	30	0.0714	5.67657337116887e-08	139166622	139213971	1.04355154453254e-12	139265554	139288594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139282065	140145683	346	322	-0.4087	1.04355154453254e-12	139265554	139288594	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	23739140	8438	8108	0.3379	NA	NA	NA	2.32222432801732e-15	23739140	23739140
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	23741132	23746151	3	3	-0.9848	2.32222432801732e-15	23739140	23739140	2.53675240615599e-14	23746151	23746151
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	23748740	38669536	5072	4863	0.3308	2.53675240615599e-14	23746151	23746151	0	38662590	41971605
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	39116538	46396163	951	911	-0.3889	0	38662590	41971605	3.72253003695864e-23	45487335	46410048
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46399272	47040444	68	62	-0.7661	3.72253003695864e-23	45487335	46410048	4.10623896214395e-25	46552024	47068616
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47057097	73123149	7990	7673	-0.4048	4.10623896214395e-25	46552024	47068616	5.79550945555656e-23	73103151	73140785
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73126525	73249070	56	56	-0.0406	5.79550945555656e-23	73103151	73140785	8.29664444614286e-22	73229863	73262822
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73250218	77917893	2014	1931	-0.4042	8.29664444614286e-22	73229863	73262822	5.33477229318937e-52	77917893	77917893
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.2849	5.33477229318937e-52	77917893	77917893	9.09516293851144e-50	77928669	77928669
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	85600455	2258	2176	-0.4158	9.09516293851144e-50	77928669	77928669	1.21818100983282e-09	85579124	85600455
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	85611812	85637440	6	6	-1.1609	1.21818100983282e-09	85579124	85600455	2.34502625436755e-10	85637440	85647969
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	85647969	118129976	11759	11298	-0.3931	2.34502625436755e-10	85637440	85647969	0	118121246	118138436
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	118131809	127563278	3473	3331	0.0356	0	118121246	118138436	8.25698482016732e-14	127559479	127568592
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	11	-0.6261	8.25698482016732e-14	127559479	127568592	1.76474238222292e-13	127584068	127598425
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	135285645	2706	2612	0.0439	1.76474238222292e-13	127584068	127598425	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1707	-0.3334	NA	NA	NA	2.63660211244746e-13	4919011	4923300
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-1.1176	2.63660211244746e-13	4919011	4923300	4.05811088895157e-07	4932214	4934594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	7771593	1240	1178	-0.3995	4.05811088895157e-07	4932214	4934594	2.79555964468958e-08	7758275	7774554
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7774067	7783492	7	7	-1.0533	2.79555964468958e-08	7758275	7774554	1.31888736488803e-08	7781505	7803570
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7797993	1	0	NA	1.31888736488803e-08	7781505	7803570	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	18896166	4347	4201	-0.4014	NA	NA	NA	1.71561741046252e-09	18888184	18896166
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18932031	8	8	-1.0395	1.71561741046252e-09	18888184	18896166	1.09719150492742e-09	18932031	18940966
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18933855	55118214	9525	9127	-0.4032	1.09719150492742e-09	18932031	18940966	1.85948675555565e-27	55097753	55124730
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.0718	1.85948675555565e-27	55097753	55124730	1.44887639275153e-22	55202450	55229096
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4466	-0.3343	1.44887639275153e-22	55202450	55229096	1.52365219472282e-29	66463477	66463477
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.753	1.52365219472282e-29	66463477	66463477	1.56705040556414e-34	66469412	66469412
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22729	-0.3936	1.56705040556414e-34	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3600	0.3097	NA	NA	NA	1.17791924083682e-46	9516067	9531133
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.4666	1.17791924083682e-46	9516067	9531133	6.10445306408873e-45	9589725	9607363
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	9604633	1	0	NA	6.10445306408873e-45	9589725	9607363	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11116883	573	544	0.3048	NA	NA	NA	5.05286128469921e-11	11112600	11116883
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	1.2148	5.05286128469921e-11	11112600	11116883	5.6887280788432e-206	11128557	11143592
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11140421	2	0	NA	5.6887280788432e-206	11128557	11143592	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	68775973	19208	18480	0.266	NA	NA	NA	1.57732271056812e-216	68729644	68843509
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	68782918	69105695	112	105	-0.0825	1.57732271056812e-216	68729644	68843509	8.32005499263184e-24	69080326	69129279
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69107188	120805873	17411	16755	0.1941	8.32005499263184e-24	69080326	69129279	9.86029604694041e-11	120805873	120805873
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120806897	120810710	2	2	-1.023	9.86029604694041e-11	120805873	120805873	1.4054011121615e-06	120810710	120812093
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120812093	121200074	115	113	0.1935	1.4054011121615e-06	120810710	120812093	4.4523841355844e-12	121195848	121200074
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121201230	121215301	7	7	-0.6888	4.4523841355844e-12	121195848	121200074	1.35243049265094e-14	121215301	121217263
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121217263	130943064	3418	3271	0.1757	1.35243049265094e-14	121215301	121217263	2.52013137003863e-16	130943064	130943064
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.882	2.52013137003863e-16	130943064	130943064	9.7986317600846e-14	130946248	130946248
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	515	0.2316	9.7986317600846e-14	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	19230465	273	259	-0.4234	NA	NA	NA	3.70948830387986e-43	19219934	19237905
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19231320	19408185	55	53	-1.0378	3.70948830387986e-43	19219934	19237905	8.1348539243007e-63	19380708	19416292
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19412814	35375198	6074	5840	-0.416	8.1348539243007e-63	19380708	19416292	2.96866997329043e-167	35375198	35378611
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	35376634	35385781	6	6	-3.4264	2.96866997329043e-167	35375198	35378611	5.12133253438401e-176	35382670	35385781
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	35387380	49964838	5811	5614	-0.4149	5.12133253438401e-176	35382670	35385781	1.30673791334402e-43	49964838	49964838
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.9973	1.30673791334402e-43	49964838	49964838	6.22427042355495e-42	49971732	49971732
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	84765734	9091	8722	-0.4153	6.22427042355495e-42	49971732	49971732	1.32704922738962e-64	84765734	84765734
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	84773782	84778111	2	2	-3.6112	1.32704922738962e-64	84765734	84765734	2.50795947072014e-73	84778111	84778111
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	84786172	89659397	979	948	-0.3946	2.50795947072014e-73	84778111	84778111	4.62376423904588e-13	89659397	89659397
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	0.979	4.62376423904588e-13	89659397	89659397	4.29917034308480e-11	89662326	89662326
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	8980	-0.4111	4.2991703430848e-11	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-1.1485	NA	NA	NA	1.96788197867744e-95	19490630	19497023
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5467	-0.3936	1.96788197867744e-95	19490630	19497023	3.33774193732736e-15	34666996	34674458
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34685308	4	4	0.6594	3.33774193732736e-15	34666996	34674458	6.101356702454e-14	34685308	34689453
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34689453	40676611	1894	1825	-0.4006	6.101356702454e-14	34685308	34689453	8.61774258231855e-12	40663660	40680589
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40741934	9	9	0.2473	8.61774258231855e-12	40663660	40680589	6.19271353282193e-24	40726930	40754507
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40746865	50262443	2410	2321	-0.4099	6.19271353282193e-24	40726930	40754507	4.64115934173263e-41	50254967	50267622
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	50265556	50395602	71	68	0.0332	4.64115934173263e-41	50254967	50267622	3.55564057477220e-45	50386522	50402839
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	50397746	55085966	1776	1690	-0.4291	3.5556405747722e-45	50386522	50402839	2.81440808961037e-24	55084969	55089742
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55089742	55122237	16	16	-1.1183	2.81440808961037e-24	55084969	55089742	1.12378487358500e-23	55119374	55123286
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55123286	71212812	6595	6320	-0.4213	1.123784873585e-23	55119374	55123286	4.94288422958164e-63	71201527	71220733
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	71217524	71572270	126	118	-0.0036	4.94288422958164e-63	71201527	71220733	8.37846171875205e-53	71561574	71588792
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	71577802	73075500	771	739	-0.4099	8.37846171875205e-53	71561574	71588792	1.19742511017019e-27	73075500	73083141
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	-1.7948	1.19742511017019e-27	73075500	73083141	4.83248355166415e-23	73091980	73092112
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73697101	294	282	-0.3913	4.83248355166415e-23	73091980	73092112	1.12171151057656e-134	73689439	73705666
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73699361	80745805	3259	3123	0.0278	1.12171151057656e-134	73689439	73705666	2.51753707655872e-31	80720574	80774805
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80746958	81021806	126	116	0.3368	2.51753707655872e-31	80720574	80774805	1.66693185803196e-29	81005077	81038080
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	81024284	106221696	8729	8394	0.0328	1.66693185803196e-29	81005077	81038080	3.1992071428361e-07	106207549	106240343
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106280415	22	22	0.3883	3.1992071428361e-07	106207549	106240343	0.0049968990993579	106242757	106294906
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106281746	106358491	28	27	0.0605	0.0049968990993579	106242757	106294906	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.0711	NA	NA	NA	7.12947328741692e-17	18452491	18692865
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	92	-1.6749	7.12947328741692e-17	18452491	18692865	1.24048948443513e-09	19391934	19819961
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	56	-1.257	1.24048948443513e-09	19391934	19819961	4.64363747324196e-115	20065525	20308014
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32514939	3672	3518	-0.4194	4.64363747324196e-115	20065525	20308014	1.51682477831230e-13	32451841	32525865
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	23	-0.8741	1.5168247783123e-13	32451841	32525865	5.53232743979371e-11	32583146	32667508
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	5.53232743979371e-11	32583146	32667508	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	32686908	9	9	-6e-04	NA	NA	NA	0.000672909808748594	32669751	32706323
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32688712	50050784	7141	6855	-0.4047	0.000672909808748594	32669751	32706323	1.91734259496383e-08	50050476	50050784
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50053032	50059941	3	3	-1.3942	1.91734259496383e-08	50050476	50050784	1.12196666265372e-08	50059941	50062594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50062594	74669752	10705	10292	-0.4116	1.12196666265372e-08	50059941	50062594	1.21040571828673e-14	74665386	74669752
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.7016	1.21040571828673e-14	74665386	74669752	2.14424875529998e-12	74680439	74696127
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	163	-0.3495	2.14424875529998e-12	74680439	74696127	2.33784670457258e-08	75114211	75115806
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	0.9354	2.33784670457258e-08	75114211	75115806	1.29810716684413e-10	75119713	75121466
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9038	-0.4172	1.29810716684413e-10	75119713	75121466	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	19429459	6543	6301	0.0271	NA	NA	NA	5.29259921170431e-38	19410798	19438970
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	19432586	19649181	112	106	-0.343	5.29259921170431e-38	19410798	19438970	1.72167396965473e-39	19639406	19659355
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	19650409	33841331	3966	3806	0.0375	1.72167396965473e-39	19639406	19659355	1.19600451497268e-09	33647856	33841331
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33842125	34054713	4	4	-0.8294	1.19600451497268e-09	33647856	33841331	5.90571329587144e-08	34054713	34056516
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	34325501	83	77	-0.0683	5.90571329587144e-08	34054713	34056516	1.71651722114631e-29	34306513	34339543
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34329518	34602318	51	50	0.4339	1.71651722114631e-29	34306513	34339543	1.25979009834152e-13	34584793	34631759
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	35004950	54	53	0.0252	1.25979009834152e-13	34584793	34631759	1.0379288006273e-29	34994467	45087457
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	54121998	2792	2675	-0.3976	1.0379288006273e-29	34994467	45087457	0	54097381	54138594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54124059	68693086	4694	4524	-0.0793	0	54097381	54138594	3.68020772242644e-32	68693086	68693086
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-1.1234	3.68020772242644e-32	68693086	68693086	2.33462515186772e-34	68753209	68753209
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1405	-0.1066	2.33462515186772e-34	68753209	68753209	2.06128382491213e-16	72917554	72918129
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72963578	6	6	-1.0226	2.06128382491213e-16	72917554	72918129	2.61739423422287e-14	72963578	72964783
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72964783	76923844	1367	1316	-0.1028	2.61739423422287e-14	72963578	72964783	2.64182926497515e-15	76922411	76931247
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.64182926497515e-15	76922411	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.7218	NA	NA	NA	5.47344443264081e-14	76937156	76944661
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88579887	4467	4313	-0.1014	5.47344443264081e-14	76937156	76944661	1.97611399448904e-17	88569288	88590514
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88582823	88690571	46	43	0.2946	1.97611399448904e-17	88569288	88590514	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1906319	855	821	-0.3208	NA	NA	NA	4.23441841653099e-08	1904451	1906319
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906352	1906391	2	2	0.9615	4.23441841653099e-08	1904451	1906319	2.90078110607756e-10	1906391	1906391
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15727076	5445	5237	-0.3831	2.90078110607756e-10	1906391	1906391	1.18314517775794e-100	15727076	15727076
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-4.6334	1.18314517775794e-100	15727076	15727076	7.92883194762651e-104	15733964	15733964
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	30543860	5367	5150	-0.377	7.92883194762651e-104	15733964	15733964	1.92582349037549e-18	30543860	30543860
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30562246	30564576	2	2	1.4427	1.92582349037549e-18	30543860	30543860	1.04270346464987e-18	30564576	30564576
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30566574	31477672	374	365	-0.4055	1.04270346464987e-18	30564576	30564576	2.05918274075866e-06	31471890	31483188
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31479804	31503774	9	8	-0.9607	2.05918274075866e-06	31471890	31483188	1.30485404063547e-07	31493990	31893451
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36634734	1800	1732	-0.3588	1.30485404063547e-07	31493990	31893451	1.57005646749882e-153	36634734	36634734
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-3.6771	1.57005646749882e-153	36634734	36634734	5.11838746335753e-42	36644182	36644182
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36673853	10	10	-0.5915	5.11838746335753e-42	36644182	36644182	6.30329825354086e-28	36673853	36673853
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.3491	6.30329825354086e-28	36673853	36673853	2.50810117886919e-45	36684619	36684619
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1739	-0.3214	2.50810117886919e-45	36684619	36684619	8.47814206928692e-09	40869151	41015177
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	6	-1.0755	8.47814206928692e-09	40869151	41015177	4.23689288654177e-10	41015177	41062669
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41568539	220	213	-0.3565	4.23689288654177e-10	41015177	41062669	6.11947079409337e-46	41564408	41572001
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41710400	45	44	-0.9626	6.11947079409337e-46	41564408	41572001	1.53723974911537e-43	41706870	42143048
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3322	-0.3798	1.53723974911537e-43	41706870	42143048	5.20585754943188e-47	52440878	52440878
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-2.6861	5.20585754943188e-47	52440878	52440878	3.6783416620351e-47	52447064	52447064
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	60531378	3269	3122	-0.3664	3.6783416620351e-47	52447064	52447064	0	60524467	60544662
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	60536000	78635423	6924	6637	-0.977	0	60524467	60544662	1.52083495793890e-56	78629345	78635423
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78636731	78653545	3	3	-0.0217	1.5208349579389e-56	78629345	78635423	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	2818670	931	899	-0.4009	NA	NA	NA	3.43014124506721e-81	2818670	2818670
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	2820418	2821810	2	2	-3.8873	3.43014124506721e-81	2818670	2818670	2.32391589720786e-74	2821810	2821810
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	2830441	9996857	2579	2467	-0.4061	2.32391589720786e-74	2821810	2821810	1.77144886898689e-34	9976161	10013933
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10003063	10186986	36	34	0.1752	1.77144886898689e-34	9976161	10013933	3.90061978232357e-32	10159339	10200951
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10191738	13876592	1318	1276	-0.3883	3.90061978232357e-32	10159339	10200951	1.52703568587397e-79	13871825	13893922
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13878744	13878744	1	0	NA	1.52703568587397e-79	13871825	13893922	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13880609	14765463	93	91	0.1726	NA	NA	NA	1.68790228536022e-90	14759031	14769239
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14767960	33478697	5478	5268	-0.4018	1.68790228536022e-90	14759031	14769239	0	33463564	33490246
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	33490246	35850919	455	438	-1.1247	0	33463564	33490246	1.25431211305451e-102	35838580	35863670
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35863670	36509250	88	87	-0.4621	1.25431211305451e-102	35838580	35863670	1.17880921850696e-14	36509250	36509250
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.0234	1.17880921850696e-14	36509250	36509250	8.41676575056062e-16	36519728	36519728
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	5014	-0.4215	8.41676575056062e-16	36519728	36519728	3.40418584520116e-09	53092949	53092949
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.6571	3.40418584520116e-09	53092949	53092949	7.59863808564784e-09	53099601	53099601
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	64676277	3355	3201	-0.4179	7.59863808564784e-09	53099601	53099601	0	64661540	64691567
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64680379	75223901	3073	2983	-0.0708	0	64661540	64691567	5.45019256163427e-13	75201383	75243011
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75229407	75296893	30	28	0.2569	5.45019256163427e-13	75201383	75243011	6.59471324696318e-05	75269342	75327294
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75299455	75870106	216	208	-0.0426	6.59471324696318e-05	75269342	75327294	6.13099622883437e-21	75842184	75907351
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75895830	76116026	89	87	-0.4136	6.13099622883437e-21	75842184	75907351	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	468	-0.2517	NA	NA	NA	3.46418774316161e-07	1395246	1398325
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.0372	3.46418774316161e-07	1395246	1398325	1.50416152815469e-14	1400840	1400840
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11891730	4846	4620	-0.3472	1.50416152815469e-14	1400840	1400840	8.9066612599206e-15	11891730	11891730
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11901947	11903427	2	2	-2.1159	8.9066612599206e-15	11891730	11891730	6.89805642805153e-16	11903427	11903427
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11919492	12466891	227	219	-0.4211	6.89805642805153e-16	11903427	11903427	7.14952109359676e-47	12466891	12466891
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12469959	12470827	2	2	-3.3233	7.14952109359676e-47	12466891	12466891	1.50153243995304e-42	12470827	12470827
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12474988	22610167	4231	4061	-0.3623	1.50153243995304e-42	12470827	12470827	1.45273163712977e-287	22605896	22632044
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22616761	32545047	363	350	-0.9686	1.45273163712977e-287	22605896	22632044	9.45591586752911e-49	24157855	32929768
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32929768	33058646	19	19	0.1787	9.4559158675291e-49	24157855	32929768	2.03764435366996e-51	33058646	33071406
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33071406	34079352	253	243	1.2941	2.03764435366996e-51	33058646	33071406	2.71924423912623e-104	34064638	34090637
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	34083581	35032023	325	310	1.8564	2.71924423912623e-104	34064638	34090637	9.60104539024345e-234	35029836	35035029
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35035029	35420309	104	102	0.7177	9.60104539024345e-234	35029836	35035029	1.73097829247047e-27	35388639	35453154
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35427288	36167290	223	209	0.3235	1.73097829247047e-27	35388639	35453154	2.16443515171262e-41	36097808	36240280
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36174895	38161535	618	595	0.0315	2.16443515171262e-41	36097808	36240280	1.04887345043415e-229	38160305	38161535
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38174374	38369877	85	82	1.0304	1.04887345043415e-229	38160305	38161535	3.62753728544367e-40	38365407	38375983
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38372504	38565423	79	78	0.3622	3.62753728544367e-40	38365407	38375983	2.84683253724240e-21	38547183	38577010
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38567503	39204345	250	244	-0.0247	2.8468325372424e-21	38547183	38577010	1.09284103647119e-09	39168125	39215357
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39205686	39316832	43	40	0.3083	1.09284103647119e-09	39168125	39215357	3.04421494412373e-53	39308066	39328764
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39328764	39655044	177	169	1.1945	3.04421494412373e-53	39308066	39328764	0	39653616	39657503
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39657503	40834217	496	481	-0.034	0	39653616	39657503	9.62614705937914e-256	40834217	40839016
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40839016	40990935	79	76	1.2618	9.62614705937914e-256	40834217	40839016	4.45347220101124e-09	40960685	41007308
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40993064	41094815	55	52	1.659	4.45347220101124e-09	40960685	41007308	3.0402306304425e-22	41087126	41106426
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41099855	41367495	131	125	1.0685	3.0402306304425e-22	41087126	41106426	1.20695504811926e-51	41366274	41370682
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41370682	41438493	32	29	-0.0718	1.20695504811926e-51	41366274	41370682	2.62511424069823e-07	41415204	41524046
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41500221	43269856	761	728	0.2472	2.62511424069823e-07	41415204	41524046	9.0825280183318e-28	43268728	43271977
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43271977	43285711	8	8	1.3851	9.0825280183318e-28	43268728	43271977	5.10048267155469e-07	43278484	43323196
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43288887	43775851	236	230	1.9045	5.10048267155469e-07	43278484	43323196	7.41884319937095e-57	43760803	43780407
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43778228	44168620	184	178	1.2996	7.41884319937095e-57	43760803	43780407	2.75137773654422e-31	44159868	44172884
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44170051	44334124	60	54	0.6626	2.75137773654422e-31	44159868	44172884	1.08461154152539e-11	44321218	44346161
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44336813	44442538	51	50	0.2082	1.08461154152539e-11	44321218	44346161	0.000403311289724473	44431523	44452631
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44444533	44460119	6	6	0.8442	0.000403311289724473	44431523	44452631	3.04468215398240e-07	44453818	44478784
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44473559	44808180	168	160	1.6291	3.0446821539824e-07	44453818	44478784	1.20817463709000e-85	44792826	44823382
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44813196	44813196	1	0	NA	1.20817463709e-85	44792826	44823382	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44814926	46093579	554	521	1.0293	NA	NA	NA	0	46091500	46096473
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46096473	47564693	645	619	-0.0526	0	46091500	46096473	4.4381447247591e-34	47551326	47582697
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	47566258	47566258	1	0	NA	4.4381447247591e-34	47551326	47582697	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	47568266	47953618	142	140	0.2697	NA	NA	NA	0.000101176412501526	47880116	48205963
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48122394	48279312	6	6	0.8027	0.000101176412501526	47880116	48205963	5.60637464979347e-12	48276273	48321523
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48321523	49613079	500	488	-0.0665	5.60637464979347e-12	48276273	48321523	2.84321701167773e-95	49613079	49613079
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49615049	49650853	19	18	1.3374	2.84321701167773e-95	49613079	49613079	2.49130918009659e-98	49650853	49650853
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49662411	49837958	90	88	-0.0438	2.49130918009659e-98	49650853	49650853	3.46422353585941e-160	49837958	49839608
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49839608	50063487	112	106	1.0644	3.46422353585941e-160	49837958	49839608	9.97454310419517e-319	50060020	50065677
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50065677	53609847	1690	1616	-0.0499	9.97454310419517e-319	50060020	50065677	1.58190768191125e-163	53608780	53609847
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53612889	53718772	50	50	1.0903	1.58190768191125e-163	53608780	53609847	4.34253669446469e-29	53713637	53727736
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53722131	53928532	112	109	0.4212	4.34253669446469e-29	53713637	53727736	3.82205398461703e-39	53915594	53939281
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53930009	54823668	410	393	-0.0394	3.82205398461703e-39	53915594	53939281	1.88010267260906e-218	54821645	54828212
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	54826122	55245444	202	195	0.8586	1.88010267260906e-218	54821645	54828212	4.87882311125009e-09	55242195	55256119
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55247874	55344000	11	10	0.0587	4.87882311125009e-09	55242195	55256119	0.0203065767561232	55250187	55347589
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55346279	55392899	22	21	-0.4455	0.0203065767561232	55250187	55347589	1.66122718572083e-12	55384684	55398245
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55393997	55690433	144	138	0.0922	1.66122718572083e-12	55384684	55398245	1.41207188013751e-33	55676017	55707065
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55691485	56044068	161	152	-0.3625	1.41207188013751e-33	55676017	55707065	4.72407040691932e-15	56024515	56058170
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56046186	56184103	73	69	0.0066	4.72407040691932e-15	56024515	56058170	2.82406259000079e-08	56163411	56204057
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56185374	56342638	87	81	0.2936	2.82406259000079e-08	56163411	56204057	5.15911136457869e-54	56337491	56347932
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56345927	56589192	116	113	1.0461	5.15911136457869e-54	56337491	56347932	1.75256827602376e-307	56586296	56590993
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56590993	59054088	1104	1064	-0.0238	1.75256827602376e-307	56586296	56590993	8.09663223261933e-91	59046892	59077445
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59058484	59539331	254	246	0.408	8.09663223261933e-91	59046892	59077445	1.41384482028303e-147	59537113	59541594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59541594	59691818	73	70	1.7485	1.41384482028303e-147	59537113	59541594	8.58477243929186e-148	59687205	59693095
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59693095	59919813	101	99	0.3836	8.58477243929186e-148	59687205	59693095	4.24613725302463e-06	59907921	59919813
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60070468	60095608	12	12	-0.0904	4.24613725302463e-06	59907921	59919813	1.99564209744969e-14	60095608	60104585
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60104585	60184770	36	35	0.5865	1.99564209744969e-14	60095608	60104585	1.32907230338398e-16	60180295	60196530
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60186901	60188379	2	0	NA	1.32907230338398e-16	60180295	60196530	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60189469	60508679	157	150	1.1789	NA	NA	NA	0	60507346	60508679
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60510395	62566278	968	932	-0.476	0	60507346	60508679	5.79711206814141e-85	62566278	62570544
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62570544	62613750	19	19	0.8233	5.79711206814141e-85	62566278	62570544	5.2504987607657e-09	62601750	62622778
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62615567	63575960	477	452	0.3346	5.2504987607657e-09	62601750	62622778	2.51166012650517e-102	63573707	63579911
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63579911	63788698	100	94	-0.4277	2.51166012650517e-102	63573707	63579911	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	562	0.2948	NA	NA	NA	4.74366129369524e-110	1506379	1515948
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.2138	4.74366129369524e-110	1506379	1515948	6.78928081635588e-153	1525300	1531162
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3547	0.3414	6.78928081635588e-153	1525300	1531162	1.83142635820715e-12	12095485	12095485
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.8057	1.83142635820715e-12	12095485	12095485	5.8034455354107e-14	12113855	12113855
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	14369261	728	710	0.3244	5.8034455354107e-14	12113855	12113855	1.60013958660449e-19	14368060	14369261
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14372827	14372827	1	0	NA	1.60013958660449e-19	14368060	14369261	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14373978	14388257	8	8	-0.5477	NA	NA	NA	1.10460899143277e-18	14388257	14400025
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14400025	23209280	3230	3109	0.3235	1.10460899143277e-18	14388257	14400025	1.08879198610930e-09	23180287	23231771
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	23211557	23289012	29	29	-0.0117	1.0887919861093e-09	23180287	23231771	1.58936637309109e-07	23278322	23318845
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	23290474	26145205	749	719	0.3262	1.58936637309109e-07	23278322	23318845	3.84354289199065e-25	26144661	26145205
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26147112	26161111	11	11	-0.6478	3.84354289199065e-25	26144661	26145205	4.37338702624904e-07	26161111	26170594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	29313069	14	12	0.1901	4.37338702624904e-07	26161111	26170594	5.83342945707205e-05	26173123	29341563
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29314396	57348556	10444	10037	0.5921	5.83342945707205e-05	26173123	29341563	2.86543992285970e-197	57322661	57436334
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57350569	60553073	1268	1208	0.8607	2.8654399228597e-197	57322661	57436334	4.88007821115865e-15	60553016	60557051
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60553440	60561656	5	5	-0.1151	4.88007821115865e-15	60553016	60557051	7.94980308780294e-07	60559058	60565059
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60562422	62084974	672	639	0.8334	7.94980308780294e-07	60559058	60565059	7.36786153836283e-37	62065586	62103625
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62087358	62419534	132	125	0.3727	7.36786153836283e-37	62065586	62103625	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9965872	5	5	-0.046	NA	NA	NA	0.000288659327288613	9965872	9994686
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9975302	10167413	17	17	-0.7309	0.000288659327288613	9965872	9994686	8.99066119865848e-13	10165953	10167413
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	8.99066119865848e-13	10165953	10167413	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	13695208	13	12	0.0648	NA	NA	NA	0.000150869523408407	13690922	13741362
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13696483	14088878	29	26	-0.3912	0.000150869523408407	13690922	13741362	1.09937773237645e-10	13879604	14307689
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14092232	30560916	5470	5250	-0.0227	1.09937773237645e-10	13879604	14307689	4.31132196463521e-10	30560916	30560916
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	30562633	30564088	2	2	-1.3111	4.31132196463521e-10	30560916	30560916	1.39397086033916e-10	30564088	30564088
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	30566798	32795816	1048	1008	-0.0233	1.39397086033916e-10	30564088	30564088	5.6580601979125e-08	32787302	32809527
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32806404	32823377	9	9	0.5089	5.6580601979125e-08	32787302	32809527	1.40564432503446e-07	32818633	32830198
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32824508	36789648	1951	1870	-0.0389	1.40564432503446e-07	32818633	32830198	3.70130781044179e-22	36789648	36789648
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.9074	3.70130781044179e-22	36789648	36789648	8.05717920817963e-21	36791668	36791668
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4697	-0.0323	8.05717920817963e-21	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1088	-0.3327	NA	NA	NA	3.33269236735591e-14	18125356	18125356
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	1.3322	3.33269236735591e-14	18125356	18125356	3.11527825253199e-13	18129194	18129194
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22667608	1849	1793	-0.3701	3.11527825253199e-13	18129194	18129194	7.99992384410332e-10	22603439	22686731
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22735036	23	21	0.0885	7.99992384410332e-10	22603439	22686731	6.58366577768123e-14	22714979	22744274
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22736990	28606054	3215	3075	-0.4001	6.58366577768123e-14	22714979	22744274	2.39146854826509e-10	28599591	28613000
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28610900	28627112	9	9	-1.0444	2.39146854826509e-10	28599591	28613000	7.69072803298404e-10	28618618	28630731
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28628752	29634583	548	518	-0.3623	7.69072803298404e-10	28618618	28630731	3.08654065496478e-44	29619257	29656594
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29635792	30035305	199	191	-0.0012	3.08654065496478e-44	29619257	29656594	1.78596965191478e-65	30018244	30051801
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	30037962	37621766	3765	3633	-0.3725	1.78596965191478e-65	30018244	30051801	8.95637289947582e-35	37621766	37621766
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.9536	8.95637289947582e-35	37621766	37621766	2.19334131043701e-26	37626069	37626069
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	18	-0.3522	2.19334131043701e-26	37626069	37626069	2.46933581717909e-56	37685496	37685496
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-3.1996	2.46933581717909e-56	37685496	37685496	0	37715385	37715385
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41226643	1825	1742	-0.3728	0	37715385	37715385	5.49969182360561e-09	41216678	41246992
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41237593	41276170	9	8	-1.0333	5.49969182360561e-09	41216678	41246992	3.52493744022538e-08	41248301	41287060
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41279485	45982956	2394	2305	-0.3654	3.52493744022538e-08	41248301	41287060	1.01378718131707e-07	45981620	45982956
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45985025	45986561	2	2	-1.6621	1.01378718131707e-07	45981620	45982956	2.7150129567434e-09	45986561	45986561
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45988943	49571068	1546	1469	-0.3796	2.7150129567434e-09	45986561	45986561	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1528282	854	823	-0.4718	NA	NA	NA	1.73544804388743e-06	1526804	1528282
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-1.4078	1.73544804388743e-06	1526804	1528282	4.57564669025244e-07	1530474	1534998
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1533361	1	0	NA	4.57564669025244e-07	1530474	1534998	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533546	1751766	192	187	-0.5083	NA	NA	NA	2.12932304671773e-09	1749777	1751766
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1753446	1755974	4	4	-1.5483	2.12932304671773e-09	1749777	1751766	1.11509756689403e-07	1755974	1760214
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1760214	2426938	485	465	-0.5241	1.11509756689403e-07	1755974	1760214	6.6152145033306e-09	2425776	2426938
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.0274	6.6152145033306e-09	2425776	2426938	1.73744050963305e-12	2428307	2428307
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2672401	224	214	-0.5109	1.73744050963305e-12	2428307	2428307	3.49252610021549e-05	2659101	2687984
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	25	-0.8099	3.49252610021549e-05	2659101	2687984	6.8618409978437e-95	2708291	2711273
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	7329097	1468	1408	0.4787	6.8618409978437e-95	2708291	2711273	7.9173074357924e-10	7314090	7329097
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7339149	7401581	10	10	-0.1888	7.9173074357924e-10	7314090	7329097	4.20607088195686e-14	7401581	7415126
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7410939	8452395	313	297	0.4902	4.20607088195686e-14	7401581	7415126	1.66424661306432e-10	8449254	8456422
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	-0.2082	1.66424661306432e-10	8449254	8456422	1.27415903317945e-09	8465433	8477126
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.27415903317945e-09	8465433	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	122889947	33354	31996	0.5255	NA	NA	NA	1.45757472077808e-102	122885100	122899018
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	122891800	123019458	65	64	-0.2324	1.45757472077808e-102	122885100	122899018	1.23304972148417e-106	123015873	123022684
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	123022684	126076298	775	741	0.5391	1.23304972148417e-106	123015873	123022684	4.37549927794587e-185	126051583	126116254
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	126089523	126870151	123	116	-0.2455	4.37549927794587e-185	126051583	126116254	3.88219522192755e-184	126850375	126888914
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	126878153	154582414	9018	8661	0.5187	3.88219522192755e-184	126850375	126888914	0	154578922	154586690
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.494	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-3.8531	NA	NA	NA	2.46452793275124e-17	3034907	3223585
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	2.46452793275124e-17	3034907	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	13	-0.9155	NA	NA	NA	2.73428435683646e-12	5593746	6692482
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	167	-3.5755	2.73428435683646e-12	5593746	6692482	8.36171359239459e-10	7016002	7177061
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	125	-2.573	8.36171359239459e-10	7016002	7177061	1.33309289672550e-08	7418921	7603458
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	65	-3.7541	1.3330928967255e-08	7418921	7603458	1.60899779391321e-05	7693377	7749796
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	86	-2.7459	1.60899779391321e-05	7693377	7749796	8.90901869211409e-09	7938700	8048263
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8280065	62	60	-3.9463	8.90901869211409e-09	7938700	8048263	1.42919004218407e-13	8259766	8292347
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8324291	13	13	-1.7516	1.42919004218407e-13	8259766	8292347	6.17727821218416e-09	8308608	8334196
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10513747	292	279	-3.7565	6.17727821218416e-09	8308608	8334196	5.39841854980982e-22	10511255	10535786
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.1734	5.39841854980982e-22	10511255	10535786	6.4173378032385e-11	11660512	12502304
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.8097	6.4173378032385e-11	11660512	12502304	8.80455067390084e-05	12536761	12558585
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12637987	45	44	-1.9741	8.80455067390084e-05	12536761	12558585	0.000132069695928484	12602617	12725675
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12638022	12926941	65	60	-3.1149	0.000132069695928484	12602617	12725675	1.27748947572033e-05	12876008	12973132
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13129843	80	77	-2.082	1.27748947572033e-05	12876008	12973132	3.43099965708019e-38	13114169	13138841
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	391	-3.7893	3.43099965708019e-38	13114169	13138841	0.0285086424129022	13983799	14354682
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14358464	7	6	-3.3567	0.0285086424129022	13983799	14354682	5.57301073326366e-08	14356069	14359748
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14379418	11	11	-1.5626	5.57301073326366e-08	14356069	14359748	2.78053374568713e-05	14377844	14388689
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14380301	14508021	78	74	-3.1234	2.78053374568713e-05	14377844	14388689	9.06096365510553e-05	14492454	14545228
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	9.06096365510553e-05	14492454	14545228	NA	NA	NA
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.938	NA	NA	NA	8.25290488293005e-08	14557473	14603508
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	401	-3.4996	8.25290488293005e-08	14557473	14603508	0.0258341808983227	15537260	16079877
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16189066	113	109	-3.0734	0.0258341808983227	15537260	16079877	2.9809374126688e-06	16146953	16221882
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16190541	16679419	98	96	-3.883	2.9809374126688e-06	16146953	16221882	1.86441777585812e-05	16672333	16685944
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	16716541	10	8	-2.1176	1.86441777585812e-05	16672333	16685944	3.13367252384907e-05	16707690	16732671
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16719600	17067188	42	42	-3.864	3.13367252384907e-05	16707690	16732671	5.76974637935643e-05	16929465	17073540
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17073540	17101969	7	7	-2.1495	5.76974637935643e-05	16929465	17073540	2.59840534075754e-06	17087869	17101969
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17107617	17143034	7	7	-3.7977	2.59840534075754e-06	17087869	17101969	3.34512409587597e-10	17143034	17147469
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17147469	17167011	4	4	-2.122	3.34512409587597e-10	17143034	17147469	3.37678837525043e-07	17167011	17170574
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17170574	17482749	54	50	-4.1189	3.37678837525043e-07	17167011	17170574	1.05797072121328e-21	17473674	17482749
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17557953	13	13	-2.0975	1.05797072121328e-21	17473674	17482749	2.59190759681684e-06	17548302	17615190
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036503	485	471	-3.7749	2.59190759681684e-06	17548302	17615190	6.92065346891569e-07	21034708	21042490
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.1926	6.92065346891569e-07	21034708	21042490	1.23575114397070e-07	21047798	21057446
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	251	-3.8175	1.2357511439707e-07	21047798	21057446	0.000537093844758735	22031798	22157319
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.2623	0.000537093844758735	22031798	22157319	1.75472495533553e-10	22176501	22179794
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-4.2243	1.75472495533553e-10	22176501	22179794	2.89702208486952e-107	22930737	22930737
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26952278	35	33	-0.7068	2.89702208486952e-107	22930737	22930737	9.79944935396676e-13	26950080	26952278
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26957814	26980386	3	3	-3.6314	9.79944935396676e-13	26950080	26952278	0.000100942633715964	26980386	26989053
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	12	-1.1147	0.000100942633715964	26980386	26989053	2.61933294221112e-06	27009433	27019306
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.8131	2.61933294221112e-06	27009433	27019306	2.38701338815465e-14	27032300	27053237
MSK_252152915107_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	32	-1.0913	2.38701338815465e-14	27032300	27053237	NA	NA	NA
