Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12313	0.2608	NA	NA	NA	2.62911826031979e-12	34869589	34869589
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-1.0074	2.62911826031979e-12	34869589	34869589	1.46892455808347e-12	34883375	34883375
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14406	0.2481	1.46892455808347e-12	34883375	34883375	6.52387291150833e-37	72536231	72537426
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.3758	6.52387291150833e-37	72536231	72537426	1.12332338473019e-36	72579311	72589682
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108531247	11127	10689	0.254	1.12332338473019e-36	72579311	72589682	8.96418500978562e-10	108529665	108535814
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108533257	108533257	1	0	NA	8.96418500978562e-10	108529665	108535814	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-1.0306	NA	NA	NA	3.06435930887877e-09	108537259	108541074
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109373255	275	264	0.2353	3.06435930887877e-09	108537259	108541074	3.84918027284504e-08	109369942	109373255
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.2061	3.84918027284504e-08	109369942	109373255	3.99625670949101e-07	109376249	109379566
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	271	0.2238	3.99625670949101e-07	109376249	109379566	1.25081660872164e-25	109987341	109987341
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-2.4518	1.25081660872164e-25	109987341	109987341	1.77482984429890e-77	109989998	109989998
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	13	0.4222	1.7748298442989e-77	109989998	109989998	1.14259302053130e-25	110023268	110023268
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.9963	1.1425930205313e-25	110023268	110023268	2.77060700472985e-09	110039388	110041712
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147420558	4573	4386	0.2372	2.77060700472985e-09	110039388	110041712	2.45230910824001e-06	147381641	147428649
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147421614	147441409	7	7	0.9143	2.45230910824001e-06	147381641	147428649	5.115370195297e-06	147427208	147460661
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147446204	150823073	1271	1227	0.2549	5.115370195297e-06	147427208	147460661	7.57470491505218e-50	150823073	150836481
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	8	1.9756	7.57470491505218e-50	150823073	150836481	1.94496425245797e-40	150848509	150851439
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151028700	79	77	0.2516	1.94496425245797e-40	150848509	150851439	6.81445705027732e-07	151026228	151028700
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151032967	151033188	2	2	-1.0559	6.81445705027732e-07	151026228	151028700	5.03410445222291e-07	151033188	151036435
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151036435	157133150	2680	2571	0.2698	5.03410445222291e-07	151033188	151036435	1.84736586043427e-15	157133150	157133150
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6735	1.84736586043427e-15	157133150	157133150	6.41047647546161e-15	157136342	157136342
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167633991	4166	4010	0.2371	6.41047647546161e-15	157136342	157136342	2.63400614385454e-07	167629959	167633991
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167635367	167650436	5	5	-0.6207	2.63400614385454e-07	167629959	167633991	3.43844444556917e-07	167650436	167652399
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167650609	185979586	7154	6824	0.2389	3.43844444556917e-07	167650436	167652399	2.41709596317795e-10	185979586	185979586
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.3722	2.41709596317795e-10	185979586	185979586	3.54041115466972e-18	185988138	185988138
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	247186514	21583	20792	0.2419	3.54041115466972e-18	185988138	185988138	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11069	0.1802	NA	NA	NA	4.28505960002829e-47	34542224	34543992
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	18	-0.9435	4.28505960002829e-47	34542224	34543992	1.12733646290238e-49	34591681	34595734
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35818921	482	463	0.2179	1.12733646290238e-49	34591681	34595734	7.16814560123003e-09	35810125	35818921
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35844884	3	3	1.434	7.16814560123003e-09	35810125	35818921	8.52471669827242e-09	35844884	35851593
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37803744	882	851	0.2138	8.52471669827242e-09	35844884	35851593	3.08397818482995e-25	37797909	37813211
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37810001	37855837	23	23	-0.5375	3.08397818482995e-25	37797909	37813211	1.41784171728729e-27	37848754	37859985
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52828468	5849	5644	0.2147	1.41784171728729e-27	37848754	37859985	6.24431532138143e-07	52822404	52828468
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52836246	52845412	2	2	-1.1006	6.24431532138143e-07	52822404	52828468	1.93657366612030e-06	52845412	52855746
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52855746	87149187	11111	10709	0.2056	1.9365736661203e-06	52845412	52855746	2.41842138932622e-32	87136601	87245647
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	87721951	15	15	-0.8184	2.41842138932622e-32	87136601	87245647	3.89489119462278e-31	87661927	87926461
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	97184240	1083	1037	0.1821	3.89489119462278e-31	87661927	87926461	7.38553632093008e-06	97152330	97187531
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97187531	97231582	4	4	-0.6772	7.38553632093008e-06	97152330	97187531	1.91230509459165e-06	97228759	97379946
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97241094	100897564	1318	1268	0.2195	1.91230509459165e-06	97228759	97379946	0	100884244	100919250
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	100902319	154601442	14968	14396	-0.1615	0	100884244	100919250	2.03460370959777e-09	154601442	154601442
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-1.7123	2.03460370959777e-09	154601442	154601442	1.17622844586346e-09	154606943	154606943
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	212890878	19852	19094	-0.1326	1.17622844586346e-09	154606943	154606943	3.87309682725925e-48	212890878	212890878
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-2.5418	3.87309682725925e-48	212890878	212890878	6.78768831098471e-46	212898875	212898875
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10250	-0.1457	6.78768831098471e-46	212898875	212898875	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10337	0.2351	NA	NA	NA	5.29876888202939e-51	32074432	32074432
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.2125	5.29876888202939e-51	32074432	32074432	1.76122897172695e-50	32080848	32080848
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99891210	21385	20559	0.2477	1.76122897172695e-50	32080848	32080848	3.46875427530167e-27	99891210	99891210
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.3134	3.46875427530167e-27	99891210	99891210	1.86716807400834e-27	99897201	99897201
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	99900982	1	0	NA	1.86716807400834e-27	99897201	99897201	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99903920	133189686	11523	11057	0.2458	NA	NA	NA	9.03237492970594e-10	133187633	133189686
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.8045	9.03237492970594e-10	133187633	133189686	1.27100858513042e-09	133194685	133194685
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9405	0.2512	1.27100858513042e-09	133194685	133194685	3.34927000232494e-80	164005577	164005577
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	3.0002	3.34927000232494e-80	164005577	164005577	2.73703720715975e-31	164027724	164027724
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.8587	2.73703720715975e-31	164027724	164027724	3.21687779687527e-13	164101776	164121847
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	199329592	12116	11664	0.2601	3.21687779687527e-13	164101776	164121847	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.2676	NA	NA	NA	5.97485033750146e-74	53781	71148
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	48777988	14262	13675	0.6074	5.97485033750146e-74	53781	71148	0	48777734	52380712
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52380712	53542293	402	395	-0.292	0	48777734	52380712	6.68356008656263e-15	53524124	53558459
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53544618	53650324	51	48	0.1289	6.68356008656263e-15	53524124	53558459	4.93342636017207e-62	53642520	53652897
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53651331	56932583	1146	1099	-0.7089	4.93342636017207e-62	53642520	53652897	1.05431177377392e-116	56912898	56940911
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	56934811	58291468	410	387	-0.261	1.05431177377392e-116	56912898	56940911	5.60173643880578e-107	58269905	58299208
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	58299208	58953207	75	73	0.6085	5.60173643880578e-107	58269905	58299208	2.07503315187606e-61	58892385	59005639
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	58969103	72017328	2784	2661	0.0804	2.07503315187606e-61	58892385	59005639	0	72017328	72017328
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	72020874	72869997	290	281	1.6284	0	72017328	72017328	2.06996815813501e-148	72864202	72895773
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	72874142	77484580	1464	1392	2.1974	2.06996815813501e-148	72864202	72895773	9.1891783486634e-119	77473706	77489444
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	77487908	77963640	210	202	2.8423	9.1891783486634e-119	77473706	77489444	1.45029386201570e-45	77951884	77974350
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	77966684	78146098	68	67	3.525	1.4502938620157e-45	77951884	77974350	0.00801701170912048	78127516	78152105
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78147957	78157996	5	5	3.0516	0.00801701170912048	78127516	78152105	3.34411589063643e-22	78157996	78157996
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78160496	78295753	65	63	1.5252	3.34411589063643e-22	78157996	78157996	0	78295753	78295753
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78299199	131833588	16750	16110	-0.6878	0	78295753	78295753	0	131813290	131865154
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	131838807	173655477	11842	11368	-0.1392	0	131813290	131865154	1.72235537670751e-06	173653588	173660684
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173659100	173666072	4	4	0.7822	1.72235537670751e-06	173653588	173660684	2.41585605013304e-07	173663054	173674198
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	190701706	5211	5010	-0.1817	2.41585605013304e-07	173663054	173674198	7.54439508256965e-28	190670997	190710812
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190706272	190924564	69	68	-0.6255	7.54439508256965e-28	190670997	190710812	7.51349826018889e-15	190915643	190940021
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191153613	44	43	-0.1809	7.51349826018889e-15	190915643	190940021	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	32144814	8732	8416	-0.1747	NA	NA	NA	1.09207358649552e-126	32144814	32144814
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32146491	32203336	30	27	1.3119	1.09207358649552e-126	32144814	32144814	2.32964580242583e-120	32203336	32203336
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32206845	97060205	18709	17992	-0.1494	2.32964580242583e-120	32203336	32203336	1.76816059490054e-62	97060205	97060205
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	6	-2.3887	1.76816059490054e-62	97060205	97060205	3.47970085825662e-63	97119376	97119376
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	150156233	16370	15719	-0.1375	3.47970085825662e-63	97119376	97119376	5.24009621194843e-65	150156233	150171154
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150202601	13	12	-1.7592	5.24009621194843e-65	150156233	150171154	3.75621864377257e-62	150191627	150202601
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9385	-0.1633	3.75621864377257e-62	150191627	150202601	5.85116063765087e-12	180342860	180342860
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180346557	2	2	-1.906	5.85116063765087e-12	180342860	180342860	1.89989263263393e-06	180346557	180346557
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	5	-4.4603	1.89989263263393e-06	180346557	180346557	9.83465187469354e-149	180358977	180358977
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	-0.1831	9.83465187469354e-149	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	11985933	4306	4163	-0.5937	NA	NA	NA	0	11960449	12026808
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	11987738	32558677	7371	7057	-0.1709	0	11960449	12026808	9.57133253705623e-135	32558677	32564884
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	-2.7228	9.57133253705623e-135	32558677	32564884	2.27621643867521e-13	32595402	32609525
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32711957	34	34	-0.3857	2.27621643867521e-13	32595402	32609525	5.55139214965275e-06	32697056	32723722
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32762061	22	22	0.6056	5.55139214965275e-06	32697056	32723722	2.27657976730970e-24	32734957	32767722
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7904	-0.1402	2.2765797673097e-24	32734957	32767722	6.14393049202202e-124	54035000	54035000
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.6095	6.14393049202202e-124	54035000	54035000	4.21970707159001e-121	54042734	54042734
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2310	-0.1442	4.21970707159001e-121	54042734	54042734	4.77787414467226e-15	65767409	65767409
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-2.1045	4.77787414467226e-15	65767409	65767409	3.97328403466193e-18	65771532	65771532
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	66453686	232	224	-0.1255	3.97328403466193e-18	65771532	65771532	5.80179492927465e-13	66453686	66453686
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66456250	66460548	2	2	-1.8045	5.80179492927465e-13	66453686	66453686	5.1105759252557e-11	66460548	66460548
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66461980	77490500	3516	3383	-0.1358	5.1105759252557e-11	66460548	66460548	8.57063732072278e-69	77490500	77490500
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.4727	8.57063732072278e-69	77490500	77490500	5.40144981424049e-71	77509983	77509983
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	95726038	4753	4567	-0.1338	5.40144981424049e-71	77509983	77509983	0	95699269	95950797
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95938306	165643653	23411	22530	0.5596	0	95699269	95950797	1.23833394724638e-223	165643653	165643653
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.5901	1.23833394724638e-223	165643653	165643653	4.0449128592484e-228	165650610	165650610
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1746	0.5026	4.0449128592484e-228	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	86771217	26140	25145	-0.1449	NA	NA	NA	5.08034486238413e-14	86769476	86771217
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86781265	3	3	-1.3179	5.08034486238413e-14	86769476	86771217	0	86781265	86785324
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86785324	141413352	23661	22741	0.1335	0	86781265	86785324	0	141408013	141419692
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141440184	13	13	0.8257	0	141408013	141419692	5.26775226625611e-11	141434131	141443577
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	0.137	5.26775226625611e-11	141434131	141443577	9.52821379519138e-12	141687978	141690753
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8901	9.52821379519138e-12	141687978	141690753	2.6124690041851e-10	141714168	141721894
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6502	0.1538	2.6124690041851e-10	141714168	141721894	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	175455	4	4	-0.2063	NA	NA	NA	0.0940332337867832	166493	396082
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	177663	581533	115	108	-0.711	0.0940332337867832	166493	396082	2.05704876365343e-22	581533	581533
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.2294	2.05704876365343e-22	581533	581533	1.91769888708258e-22	588865	588865
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	3771559	1246	1208	-0.7936	1.91769888708258e-22	588865	588865	3.05436108154864e-08	3771559	3771559
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3773975	3776617	2	2	-2.2961	3.05436108154864e-08	3771559	3771559	2.26275094855436e-09	3776617	3776617
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3779135	25022606	6760	6495	-0.7105	2.26275094855436e-09	3776617	3776617	1.38758732028951e-12	25017905	25022606
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	-2.0439	1.38758732028951e-12	25017905	25022606	5.11681925672325e-13	25047250	25057567
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	28845989	1627	1559	-0.7048	5.11681925672325e-13	25047250	25057567	1.47390412430555e-240	28843847	28849150
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28849150	29145252	147	142	0.2865	1.47390412430555e-240	28843847	28849150	3.30279507673109e-52	29132752	29166201
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	29147511	29147511	1	0	NA	3.30279507673109e-52	29132752	29166201	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	29150141	32797545	1285	1224	-0.1656	NA	NA	NA	3.10503290384731e-10	32792898	32797545
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.4835	3.10503290384731e-10	32792898	32797545	3.11982900058763e-10	32808049	32822954
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	32817020	2	0	NA	3.11982900058763e-10	32808049	32822954	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32822954	39350798	1876	1786	-0.1728	NA	NA	NA	0	39350798	39352361
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	-4.0336	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	43502304	1345	1293	-0.1439	0	39504332	39505256	3.00161562437259e-133	43385428	47066831
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	43507390	51184437	830	797	0.2225	3.00161562437259e-133	43385428	47066831	1.05048004226695e-10	51181891	51189068
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51186216	51186216	1	0	NA	1.05048004226695e-10	51181891	51189068	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51187470	51200291	7	7	-0.6659	NA	NA	NA	9.26479431177402e-12	51196227	51204788
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	9.26479431177402e-12	51196227	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	97327227	13473	12955	0.234	NA	NA	NA	0	97321019	97337077
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	97330449	146264846	15776	15164	0.7973	0	97321019	97337077	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	23338535	7998	7696	0.2417	NA	NA	NA	6.81088783577407e-128	23338535	23338535
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23343915	1	0	NA	6.81088783577407e-128	23338535	23338535	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.1398	NA	NA	NA	3.28767763660834e-120	23365926	23365926
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	43776365	4734	4532	0.2515	3.28767763660834e-120	23365926	23365926	1.39954433614487e-05	38745124	67911945
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	44199401	70212537	21	20	-0.1338	1.39954433614487e-05	38745124	67911945	5.22980345515412e-18	70174301	70217543
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70215204	70923005	313	302	0.5178	5.22980345515412e-18	70174301	70217543	4.07960119758219e-11	70923005	70923005
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70926188	70926188	1	0	NA	4.07960119758219e-11	70923005	70923005	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0933	NA	NA	NA	1.07700454111411e-09	70930528	70930528
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9547	0.5246	1.07700454111411e-09	70930528	70930528	5.13394087139962e-23	100348045	100348045
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.8495	5.13394087139962e-23	100348045	100348045	2.07276008388041e-22	100350814	100350814
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	137352394	13844	13314	0.533	2.07276008388041e-22	100350814	100350814	1.96939401216812e-15	137352394	137352394
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-1.4573	1.96939401216812e-15	137352394	137352394	1.86785617165964e-14	137356880	137356880
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1055	0.5575	1.86785617165964e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	38585875	13499	12915	0.3758	NA	NA	NA	0	38554841	38604325
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38588454	47172534	1078	1040	-0.1687	0	38554841	38604325	1.62951474101402e-16	47149768	47958106
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	48144393	69	68	0.1939	1.62951474101402e-16	47149768	47958106	1.56116026645957e-06	48123102	48159488
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	48148549	48272394	27	25	-0.2084	1.56116026645957e-06	48123102	48159488	1.75998845547202e-08	48213527	49068754
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	48277415	50721556	684	659	0.206	1.75998845547202e-08	48213527	49068754	1.18915648078353e-17	50710796	51180654
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51158614	51456551	49	47	-0.2296	1.18915648078353e-17	50710796	51180654	1.89858575047378e-22	51263742	51468904
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51462955	51846711	83	82	0.2889	1.89858575047378e-22	51263742	51468904	3.98558936539773e-30	51839914	51871039
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51849944	51849944	1	0	NA	3.98558936539773e-30	51839914	51871039	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51852787	77917893	9102	8744	-0.1339	NA	NA	NA	1.02840491050168e-49	77917893	77917893
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.5837	1.02840491050168e-49	77917893	77917893	1.92569389356531e-49	77928669	77928669
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	77928738	1	0	NA	1.92569389356531e-49	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	96962810	6086	5852	-0.1647	NA	NA	NA	9.29014387752338e-08	96951995	96972830
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	96967222	96996072	15	13	-0.7144	9.29014387752338e-08	96951995	96972830	2.45361368989983e-07	96987297	97013280
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	96997375	135285645	14112	13530	-0.1616	2.45361368989983e-07	96987297	97013280	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55095200	16900	16238	0.2408	NA	NA	NA	1.32212552999865e-10	55046539	55127355
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55097753	55207305	43	41	0.6056	1.32212552999865e-10	55046539	55127355	3.51178542395684e-154	55202450	55221692
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	69171586	5537	5326	-0.018	3.51178542395684e-154	55202450	55221692	0	69136540	69195212
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	69175386	75756847	2667	2565	0.33	0	69136540	69195212	0	75749919	75765590
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	75760172	77026523	490	465	1.0467	0	75749919	75765590	4.69392429572347e-108	77013574	77048842
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77029084	78142186	461	441	1.5663	4.69392429572347e-108	77013574	77048842	2.14829911115396e-58	78125813	78160281
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	78145726	79312807	449	428	1.201	2.14829911115396e-58	78125813	78160281	0	79302870	79337705
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	79318333	87582588	2611	2512	0.4852	0	79302870	79337705	0	87572531	87622833
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	87589237	134450318	16146	15527	-0.1605	0	87572531	87622833	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3593	0.4707	NA	NA	NA	8.77523982214608e-27	9516067	9531133
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	1.4179	8.77523982214608e-27	9516067	9531133	1.83230677744141e-25	9599999	9626623
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10462211	326	315	0.4777	1.83230677744141e-25	9599999	9626623	7.88416383445711e-20	10459455	10462211
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	9	-0.5648	7.88416383445711e-20	10459455	10462211	1.95701635230211e-20	10485848	10491341
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	19468110	3129	3006	0.4967	1.95701635230211e-20	10485848	10491341	0	19453688	19485215
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19469446	23969597	1427	1370	0.9156	0	19453688	19485215	4.85694010727558e-194	23962524	23973331
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23971965	24308807	204	193	1.6677	4.85694010727558e-194	23962524	23973331	4.50663668899701e-82	24296245	24322453
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	24311063	26847833	1005	954	2.1584	4.50663668899701e-82	24296245	24322453	0	26840396	26853042
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	26849253	29650571	922	882	1.5269	0	26840396	26853042	0	29645107	29657051
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29653623	34647417	1394	1329	0.8375	0	29645107	29657051	0	34302633	36739877
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36244407	46992235	3308	3190	0.265	0	34302633	36739877	4.79266659055918e-09	46992235	46992235
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.2559	4.79266659055918e-09	46992235	46992235	8.13348582608751e-17	46996769	46996769
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130943064	29124	27963	0.2476	8.13348582608751e-17	46996769	46996769	5.48416432672947e-16	130943064	130943064
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.9526	5.48416432672947e-16	130943064	130943064	4.2288730615668e-11	130946248	130947790
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132287226	549	531	0.2505	4.2288730615668e-11	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6779	-0.1679	NA	NA	NA	6.45728417754914e-15	36969571	36969571
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-2.1284	6.45728417754914e-15	36969571	36969571	1.21910099657950e-18	36982877	36982877
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	285	-0.1287	1.2191009965795e-18	36982877	36982877	4.95906883515024e-69	37953582	37953582
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.6816	4.95906883515024e-69	37953582	37953582	3.74905965729461e-60	37957844	37957844
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	71375082	10323	9938	-0.1462	3.74905965729461e-60	37957844	37957844	5.71009126105981e-13	71375082	71375082
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-1.9624	5.71009126105981e-13	71375082	71375082	1.07099461641186e-13	71377671	71377671
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4466	-0.1309	1.07099461641186e-13	71377671	71377671	7.82674990735889e-07	89657473	89659397
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.1886	7.82674990735889e-07	89657473	89659397	4.55829828234123e-07	89662326	89663261
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4595	-0.1551	4.55829828234123e-07	89662326	89663261	1.09859886498107e-12	100690991	100690991
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-1.9249	1.09859886498107e-12	100690991	100690991	6.81677526659872e-13	100693892	100693892
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113078863	4157	3970	-0.1716	6.81677526659872e-13	100693892	100693892	9.12522379815637e-12	113078863	113078863
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113080379	113082111	2	2	-1.8502	9.12522379815637e-12	113078863	113078863	1.15730884178141e-12	113082111	113082111
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113094285	114123340	403	385	-0.1251	1.15730884178141e-12	113082111	113082111	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105948347	31726	30494	-0.1305	NA	NA	NA	6.86265718786055e-27	105946993	105948347
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105985458	12	12	-1.1912	6.86265718786055e-27	105946993	105948347	7.05275266924378e-17	105985458	105989160
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105989160	106358491	147	141	-0.3071	7.05275266924378e-17	105985458	105989160	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.211	NA	NA	NA	0.00143870748975754	18452491	18826924
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20079935	150	147	-0.8971	0.00143870748975754	18452491	18826924	1.23473660628446e-165	20053008	20310916
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	20088256	1	0	NA	1.23473660628446e-165	20053008	20310916	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	59040958	14626	14031	-0.1544	NA	NA	NA	0	59028806	59048959
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59041381	74669752	6929	6654	0.1822	0	59028806	59048959	6.13611004207317e-114	74669752	74671626
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.551	6.13611004207317e-114	74669752	74671626	2.42113826901456e-113	74680338	74680439
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99630163	9332	8974	0.1551	2.42113826901456e-113	74680338	74680439	9.24779671073435e-10	99627656	99630163
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99632987	99635701	3	3	1.4493	9.24779671073435e-10	99627656	99630163	5.97524625561545e-11	99635701	99636724
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	264	0.0998	5.97524625561545e-11	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33517367	10609	10199	-0.1236	NA	NA	NA	3.19644782669351e-163	33509843	33525500
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33519338	35004950	204	193	-0.7768	3.19644782669351e-163	33509843	33525500	2.04140026646520e-160	34984981	45067187
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	75093957	9710	9333	-0.1401	2.0414002664652e-160	34984981	45067187	5.60381987795179e-60	75093957	75093957
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.2344	5.60381987795179e-60	75093957	75093957	1.03643615641065e-59	75100865	75100865
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	588	-0.1882	1.03643615641065e-59	75100865	75100865	2.09217631266709e-317	76925748	76929598
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.7563	2.09217631266709e-317	76925748	76929598	0	76938723	76940218
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88381719	4378	4216	-0.1546	0	76938723	76940218	2.47599754218954e-21	88363658	88388074
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88383914	88481530	45	45	0.2511	2.47599754218954e-21	88363658	88388074	7.26755554684608e-10	88472904	88509171
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88484433	88690571	90	89	-0.086	7.26755554684608e-10	88472904	88509171	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	13916990	5792	5566	-0.1313	NA	NA	NA	1.32595062595157e-14	13857137	13923753
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	13918488	13946265	14	13	0.2652	1.32595062595157e-14	13857137	13923753	0.000399908298800287	13933686	13965221
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	13948583	28515407	5010	4806	-0.1274	0.000399908298800287	13933686	13965221	3.08840867971552e-10	28513538	28518845
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	28517135	28526715	6	6	-1.0705	3.08840867971552e-10	28513538	28518845	4.61354928281555e-09	28523143	28529842
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	28528342	31461588	1216	1159	-0.1586	4.61354928281555e-09	28523143	28529842	1.60162200349766e-07	31441419	31474518
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	17	-0.6578	1.60162200349766e-07	31441419	31474518	1.84899682392707e-08	31479804	31893451
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32828797	366	352	-0.1594	1.84899682392707e-08	31479804	31893451	5.11841151488785e-119	32828797	32828797
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.2936	5.11841151488785e-119	32828797	32828797	2.18401603117994e-100	32832642	32832642
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36672710	1447	1384	-0.1079	2.18401603117994e-100	32832642	32832642	3.52718557648344e-09	36665978	36672710
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	6	-1.0372	3.52718557648344e-09	36665978	36672710	7.37089920325176e-16	36684619	36686013
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15186	-0.1169	7.37089920325176e-16	36684619	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	76116026	22963	22047	0.4866	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	357732	58	56	-0.102	NA	NA	NA	3.17969683806232e-15	343979	379530
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	362421	1398325	434	417	-0.5198	3.17969683806232e-15	343979	379530	4.52678887982969e-10	1395246	1398325
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1969	4.52678887982969e-10	1395246	1398325	5.39013827405379e-10	1400840	1400840
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	9206484	3605	3446	-0.5975	5.39013827405379e-10	1400840	1400840	1.31084934977102e-55	9184834	9221184
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9208587	9752454	188	185	-0.1587	1.31084934977102e-55	9184834	9221184	1.09516215388792e-29	9733054	9773522
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9754445	10103375	173	166	0.2326	1.09516215388792e-29	9733054	9773522	2.51023244185155e-37	10086654	10130811
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10105065	20645841	4805	4612	-0.1099	2.51023244185155e-37	10086654	10130811	1.16217973686212e-87	20635010	20651057
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20649226	20976406	100	98	0.5658	1.16217973686212e-87	20635010	20651057	5.98401364797089e-80	20971623	21000594
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20993871	20993871	1	0	NA	5.98401364797089e-80	20971623	21000594	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20998115	21756017	226	220	-0.1534	NA	NA	NA	1.30132439347807e-133	21752341	21758589
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21757216	24152318	571	539	0.4989	1.30132439347807e-133	21752341	21758589	0	24146680	24157855
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	24157855	36233743	933	894	1.67	0	24146680	24157855	2.83204095667178e-119	36205286	36264840
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36240280	37173674	233	229	1.0824	2.83204095667178e-119	36205286	36264840	0	37170627	37178270
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	37178270	38872385	677	656	-0.1206	0	37170627	37178270	2.1460621274276e-269	38870362	38874398
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38874398	39219866	125	119	1.0366	2.1460621274276e-269	38870362	38874398	1.53365526869430e-36	39211879	39238827
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39223095	39223095	1	0	NA	1.5336552686943e-36	39211879	39238827	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39224219	40293708	444	428	0.575	NA	NA	NA	1.96499214767657e-38	40276248	40305665
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40296431	40540618	117	107	1.0789	1.96499214767657e-38	40276248	40305665	8.41939673320868e-106	40540618	40540618
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.1779	8.41939673320868e-106	40540618	40540618	5.00755812399573e-124	40553315	40553315
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	42694064	921	881	1.0281	5.00755812399573e-124	40553315	40553315	5.43421997804569e-76	42673272	42715067
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42696168	43744680	509	493	1.4106	5.43421997804569e-76	42673272	42715067	0	43743653	43749271
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43748595	44425923	302	287	2.5239	0	43743653	43749271	4.40882397744328e-73	44419029	44437529
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44431523	44881983	204	195	3.2246	4.40882397744328e-73	44419029	44437529	2.68230585132036e-38	44864943	44903793
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44884928	45752634	384	365	2.7587	2.68230585132036e-38	44864943	44903793	2.05640982306972e-71	45741767	45759063
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45756165	46259906	195	186	2.1441	2.05640982306972e-71	45741767	45759063	0	46259906	46259906
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46261380	51313257	2089	2025	-0.1323	0	46259906	46259906	3.83147480287599e-21	51313257	51313257
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51316654	51319006	3	3	-2.0451	3.83147480287599e-21	51313257	51313257	6.1900553049407e-21	51319006	51319006
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51320617	63788698	5756	5526	-0.1586	6.1900553049407e-21	51319006	51319006	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	557	0.2045	NA	NA	NA	1.03336100542686e-118	1511632	1511632
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	6	-3.0639	1.03336100542686e-118	1511632	1511632	2.61907487053688e-140	1531162	1531162
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	26147112	8439	8095	0.2236	2.61907487053688e-140	1531162	1531162	1.80917750457887e-08	26139849	26150897
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148060	28266113	18	17	-0.2725	1.80917750457887e-08	26139849	26150897	0	28250082	29308105
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	62374886	12524	12069	0.4252	0	28250082	29308105	0	62249141	62379059
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62379059	62419534	3	3	-0.0661	0	62249141	62379059	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12936	-0.1491	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49133893	16372	15756	-0.1269	NA	NA	NA	7.24004961927193e-08	49133893	49133893
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49139180	49139217	2	2	-1.5895	7.24004961927193e-08	49133893	49133893	1.22216017346879e-07	49139217	49139217
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49140454	49571068	183	177	-0.1106	1.22216017346879e-07	49139217	49139217	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.08	NA	NA	NA	1.21182026934875e-05	4893	95819
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	1.0552	1.21182026934875e-05	4893	95819	4.81899346153649e-12	104486	106242
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	772351	503	482	0.1044	4.81899346153649e-12	104486	106242	7.03055931464833e-08	767373	775073
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	773688	793712	16	14	-0.4466	7.03055931464833e-08	767373	775073	5.32357892441279e-07	786791	806941
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	796371	2303192	869	832	0.0811	5.32357892441279e-07	786791	806941	2.60246320048808e-31	2303192	2303192
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.2718	2.60246320048808e-31	2303192	2303192	8.1739993717987e-33	2304398	2304398
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	377	0.1449	8.1739993717987e-33	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43325	1.1458	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	0.1452	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	128	-4.0724	NA	NA	NA	3.06226016003965e-09	3733715	4272867
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.7821	3.06226016003965e-09	3733715	4272867	2.01738902355809e-06	5531459	6711090
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6971636	131	126	-3.9212	2.01738902355809e-06	5531459	6711090	0.000100440929532429	6921156	7138628
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6973086	7996758	323	316	-3.221	0.000100440929532429	6921156	7138628	1.02773655866245e-07	7782532	8178487
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10513747	371	359	-3.8178	1.02773655866245e-07	7782532	8178487	2.48315505127766e-16	10506718	10595079
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	2.48315505127766e-16	10506718	10595079	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	18	-1.4408	NA	NA	NA	2.36717165001889e-10	11660512	12452734
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-4.9451	2.36717165001889e-10	11660512	12452734	2.52485112502510e-05	12533900	12550566
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	13129843	192	187	-2.6338	2.5248511250251e-05	12533900	12550566	1.98659652869284e-27	13104920	13146483
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13553112	184	176	-4.0465	1.98659652869284e-27	13104920	13146483	0.000273515481381626	13508776	13573345
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13555650	13705594	34	31	-3.1903	0.000273515481381626	13508776	13573345	1.39710638516117e-06	13633041	13765657
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14342834	190	184	-4.2671	1.39710638516117e-06	13633041	13765657	0.000119416156604883	14273899	14359748
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14382361	21	20	-3.1386	0.000119416156604883	14273899	14359748	2.70946287755309e-05	14376942	14382361
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14383746	14390028	6	6	-5.4561	2.70946287755309e-05	14376942	14382361	0.000283626010389419	14390028	14411113
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14391767	14391767	1	0	NA	0.000283626010389419	14390028	14411113	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14404284	14524829	70	67	-3.336	NA	NA	NA	6.17894991845827e-06	14500820	14539230
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	22	-1.7798	6.17894991845827e-06	14500820	14539230	7.69716692829623e-12	14561228	14597771
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15920478	418	402	-3.8162	7.69716692829623e-12	14561228	14597771	4.12951459583245e-05	15807366	15947948
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15979526	20	20	-2.4096	4.12951459583245e-05	15807366	15947948	0.00542912607556674	15955821	16040789
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15980898	16224597	112	110	-3.4381	0.00542912607556674	15955821	16040789	2.50258279587124e-08	16189066	16371504
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16228031	19610243	406	390	-4.2096	2.50258279587124e-08	16189066	16371504	5.55442526194067e-06	19608039	19610243
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	0.0904	5.55442526194067e-06	19608039	19610243	2.37703986110986e-05	19613864	19614809
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22930737	661	636	-4.0042	2.37703986110986e-05	19613864	19614809	6.47368959482168e-51	22924754	23283689
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-0.9599	6.47368959482168e-51	22924754	23283689	1.17864518235602e-12	26945084	26950080
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.694	1.17864518235602e-12	26945084	26950080	0.00243367782928666	26957814	26980386
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	26989053	2	2	-0.505	0.00243367782928666	26957814	26980386	2.70894404780538e-64	26989053	26989053
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	26990807	1	0	NA	2.70894404780538e-64	26989053	26989053	NA	NA	NA
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	27003308	4	4	-2.5199	NA	NA	NA	5.06750575225964e-11	27003308	27003308
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.5983	5.06750575225964e-11	27003308	27003308	1.61512932439257e-31	27019256	27019256
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.4908	1.61512932439257e-31	27019256	27019256	4.48190687735852e-31	27039222	27039222
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.931	4.48190687735852e-31	27039222	27039222	4.1542970616829e-18	27137064	27137064
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27167148	2	2	-4.568	4.1542970616829e-18	27137064	27137064	3.96460631822797e-15	27167148	27167148
MSK_252152915117_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27171797	57440809	14	14	-0.8572	3.96460631822797e-15	27167148	27167148	NA	NA	NA
