Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16704522	5781	5378	0.0072	NA	NA	NA	2.3684280070582e-09	16666760	16814050
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16713074	1	0	NA	2.3684280070582e-09	16666760	16814050	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	17080364	14	13	-0.3065	NA	NA	NA	3.25727338729297e-09	16961001	17104345
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17086698	24391166	3038	2843	0.0056	3.25727338729297e-09	16961001	17104345	7.39842405523666e-09	24391166	24391166
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-0.774	7.39842405523666e-09	24391166	24391166	2.33462738694953e-09	24395691	24395691
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	72525842	19052	17891	-4e-04	2.33462738694953e-09	24395691	24395691	2.47480387698573e-09	72524413	72533804
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	5	-0.4892	2.47480387698573e-09	72524413	72533804	2.47568630800875e-12	72537426	72537426
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	0.3533	2.47568630800875e-12	72537426	72537426	3.41761689848253e-13	72567555	72596993
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	100545896	9249	8652	-0.0069	3.41761689848253e-13	72567555	72596993	3.16981129540561e-10	100545896	100545896
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100547338	100551071	2	2	-0.7884	3.16981129540561e-10	100545896	100545896	1.42451920195879e-10	100551071	100551071
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100552814	110033018	2453	2292	-0.0041	1.42451920195879e-10	100551071	100551071	4.41341562797248e-12	110033018	110033018
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	-0.8402	4.41341562797248e-12	110033018	110033018	1.56363233329004e-11	110039388	110039388
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147203277	4556	4245	-0.0053	1.56363233329004e-11	110039388	110039388	7.99002876367181e-22	146286735	147315217
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147306304	1	0	NA	7.9900287636718e-22	146286735	147315217	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147497268	33	32	0.2801	NA	NA	NA	3.5515639077106e-19	147467273	147847659
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150823073	1261	1187	0.0054	3.5515639077106e-19	147467273	147847659	2.35619685951378e-45	150823073	150839754
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	7	-0.905	2.35619685951378e-45	150823073	150839754	1.38029880804807e-26	150844444	150851439
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	74	-0.0011	1.38029880804807e-26	150844444	150851439	0	151026228	151026228
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-5.6877	0	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2521	0.0034	0	151036435	151036435	6.96264140917568e-245	157133150	157133150
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.7812	6.96264140917568e-245	157133150	157133150	1.00706650332855e-251	157136342	157136342
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167479184	4106	3871	-0.0098	1.00706650332855e-251	157136342	157136342	1.71631538898086e-15	167475635	167483267
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167523140	12	12	-0.3994	1.71631538898086e-15	167475635	167483267	3.86358433834163e-15	167507898	167529221
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	172678230	2010	1899	-0.0103	3.86358433834163e-15	167507898	167529221	6.61197785043419e-24	172678230	172678230
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172681547	172684211	3	3	-0.9792	6.61197785043419e-24	172678230	172678230	1.74517128005708e-23	172684211	172684211
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172684859	172753186	35	30	0.0342	1.74517128005708e-23	172684211	172684211	2.3401411279999e-09	172751345	172754577
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172754577	172757208	3	3	-0.6796	2.3401411279999e-09	172751345	172754577	1.61338533979937e-11	172756253	172757208
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172766975	179014530	2527	2375	-0.0032	1.61338533979937e-11	172756253	172757208	4.61786021766204e-20	179014530	179014530
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179017844	179021834	3	3	-0.886	4.61786021766204e-20	179014530	179014530	3.49051756536975e-20	179021834	179021834
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179023488	185979586	2626	2446	-0.002	3.49051756536975e-20	179021834	179021834	2.72486210846229e-23	185979586	185979586
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1591	2.72486210846229e-23	185979586	185979586	1.02216615968144e-21	185988138	185988138
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200598243	4136	3865	-0.003	1.02216615968144e-21	185988138	185988138	1.34534612172943e-16	200592050	200612164
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200667381	24	24	-0.2987	1.34534612172943e-16	200592050	200612164	7.15639354909472e-17	200652799	200672373
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	246751473	17294	16245	-0.0031	7.15639354909472e-17	200652799	200672373	6.3458029208141e-30	246713340	246755298
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246875016	34	32	0.3202	6.3458029208141e-30	246713340	246755298	1.05106145545827e-21	246862029	246902260
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	86	-0.0076	1.05106145545827e-21	246862029	246902260	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	7019	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20341	33076512	10875	10163	-0.0023	NA	NA	NA	3.30071947476230e-17	33076512	33076512
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.0098	3.3007194747623e-17	33076512	33076512	2.48345137418165e-19	33080437	33080437
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	601	-0.0073	2.48345137418165e-19	33080437	33080437	1.87592793570544e-13	34527334	34558824
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	1.87592793570544e-13	34527334	34558824	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	17	0.2908	NA	NA	NA	1.26588299627611e-12	34579933	34597294
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37810001	1369	1278	-0.0023	1.26588299627611e-12	34579933	34597294	2.76972112226138e-106	37810001	37813211
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.7612	2.76972112226138e-106	37810001	37813211	4.84082316840467e-108	37848754	37855837
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	146571330	32143	30087	-0.0034	4.84082316840467e-108	37848754	37855837	1.14625350840517e-14	146562545	146571330
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.6754	1.14625350840517e-14	146562545	146571330	9.10595176532208e-16	146592775	146597405
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	178552260	10665	9990	-0.0038	9.10595176532208e-16	146592775	146597405	3.09852918663675e-13	178552260	178552260
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178553602	178555242	2	2	-0.8778	3.09852918663675e-13	178552260	178552260	3.52793518587336e-14	178555242	178555242
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178556781	179767214	537	495	-0.0107	3.52793518587336e-14	178555242	178555242	2.80492208926766e-24	179767214	179767214
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.9094	2.80492208926766e-24	179767214	179767214	4.14091254538308e-22	179778919	179778919
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	208057199	9107	8553	-0.0038	4.14091254538308e-22	179778919	179778919	1.04968677834523e-16	208057199	208057199
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-0.9808	1.04968677834523e-16	208057199	208057199	1.01764263715755e-15	208066245	208066245
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	242689978	12433	11670	-0.0026	1.01764263715755e-15	208066245	208066245	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	7373793	2514	2348	-0.0074	NA	NA	NA	1.60123202216321e-11	7373793	7373793
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7375107	7376517	2	2	-0.8221	1.60123202216321e-11	7373793	7373793	2.97196889163628e-11	7376517	7376517
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7378691	9712726	829	781	-0.0028	2.97196889163628e-11	7376517	7376517	2.41589514637625e-07	9708898	9715511
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9715511	9722646	5	4	0.4703	2.41589514637625e-07	9708898	9715511	2.41359278506614e-07	9720244	9732817
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9728245	11383299	737	685	0.0013	2.41359278506614e-07	9720244	9732817	7.05123471064246e-23	11383299	11383299
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-0.9376	7.05123471064246e-23	11383299	11383299	3.73760380332982e-22	11389624	11389624
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	32074432	6706	6281	-0.0106	3.73760380332982e-22	11389624	11389624	3.77985571342452e-52	32074432	32074432
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.717	3.77985571342452e-52	32074432	32074432	7.09878161486248e-51	32080848	32080848
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1777	0.003	7.09878161486248e-51	32080848	32080848	2.35912299867783e-38	37953375	37953375
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.8589	2.35912299867783e-38	37953375	37953375	7.2001994527614e-37	37961110	37961110
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	99891210	19496	18263	-0.0032	7.2001994527614e-37	37961110	37961110	8.23188670629855e-12	99891210	99891210
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	0.8555	8.23188670629855e-12	99891210	99891210	1.21338047185851e-11	99897201	99897201
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20011	-0.0048	1.21338047185851e-11	99897201	99897201	3.65447697037877e-54	163989367	163997228
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	24	-0.5263	3.65447697037877e-54	163989367	163997228	2.69774215668367e-56	164105613	164112873
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9501	-0.001	2.69774215668367e-56	164105613	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.9059	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	937	-0.0039	0	194366950	194366950	2.14657142092730e-28	196810503	196822133
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929805	20	17	-0.4619	2.1465714209273e-28	196810503	196822133	3.42350971759079e-28	196929805	196929826
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929826	199329592	964	909	0.0029	3.42350971759079e-28	196929805	196929826	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	0.3723	NA	NA	NA	4.95176216643149e-10	53781	71148
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	682752	205	191	0.0035	4.95176216643149e-10	53781	71148	2.26657030532258e-09	679789	682752
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	2.26657030532258e-09	679789	682752	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	0.7525	NA	NA	NA	7.35302992255257e-10	691065	691065
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	57658932	15943	14865	-0.0023	7.35302992255257e-10	691065	691065	1.68374331650394e-09	57657821	57658932
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57660448	57660448	1	0	NA	1.68374331650394e-09	57657821	57658932	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57662866	57665367	2	2	-0.6709	NA	NA	NA	1.35877406336854e-08	57665367	57665367
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57668601	64376590	1188	1115	0.0073	1.35877406336854e-08	57665367	57665367	3.29627853189593e-12	64376590	64376590
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-0.7958	3.29627853189593e-12	64376590	64376590	5.07047925320973e-10	64390333	64390333
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	173224400	32287	30330	-0.0039	5.07047925320973e-10	64390333	64390333	2.91284398322493e-15	173224400	173224400
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.9574	2.91284398322493e-15	173224400	173224400	6.21639333119008e-13	173228860	173228860
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	180	-0.0097	6.21639333119008e-13	173228860	173228860	1.34719076511238e-23	173660684	173660684
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.6251	1.34719076511238e-23	173660684	173660684	2.44825727463507e-44	173666072	173666072
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3553	9e-04	2.44825727463507e-44	173666072	173666072	1.32364106209415e-144	186676034	186676034
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.8722	1.32364106209415e-144	186676034	186676034	9.94695576416344e-138	186680176	186680176
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	293	-2e-04	9.94695576416344e-138	186680176	186680176	3.04139993945418e-52	187330240	187330240
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.465	3.04139993945418e-52	187330240	187330240	6.5901692895568e-83	187333619	187333619
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190896423	1187	1108	-0.0113	6.5901692895568e-83	187333619	187333619	5.0698312069133e-16	190891595	190896423
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190899523	190921041	9	8	-0.4983	5.0698312069133e-16	190891595	190896423	5.8562555738806e-17	190921041	190924564
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	41	0.0299	5.8562555738806e-17	190921041	190924564	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	76351306	20994	19729	-0.0012	NA	NA	NA	1.07187051731560e-16	76351306	76351306
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76355058	76357585	2	2	-0.9941	1.0718705173156e-16	76351306	76351306	7.94677180935843e-17	76357585	76357585
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76359138	140201609	19083	17876	-0.0045	7.94677180935843e-17	76357585	76357585	8.24196655010654e-59	140201609	140201609
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-0.9136	8.24196655010654e-59	140201609	140201609	3.46023455859977e-40	140216524	140216524
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140533456	137	132	-0.005	3.46023455859977e-40	140216524	140216524	1.29907582382989e-12	140533456	140533456
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140541178	3	3	-0.8482	1.29907582382989e-12	140533456	140533456	2.01871424172747e-18	140541178	140541178
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140542704	167012359	8431	7921	-0.0045	2.01871424172747e-18	140541178	140541178	5.08253640188814e-27	167012359	167012359
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167015034	167020614	4	3	-1.02	5.08253640188814e-27	167012359	167012359	1.10403091105214e-25	167020614	167020614
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167022098	172345157	2312	2200	0.0026	1.10403091105214e-25	167020614	167020614	1.31611320063574e-10	172345157	172345157
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172348216	172349917	2	2	-0.8144	1.31611320063574e-10	172345157	172345157	2.29631374677362e-10	172349917	172349917
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172351264	180342860	2670	2507	0.0123	2.29631374677362e-10	172349917	172349917	3.87940756567644e-11	180192214	180346557
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	-0.4162	3.87940756567644e-11	180192214	180346557	2.08704652975532e-08	180355807	180365950
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	101	0.0127	2.08704652975532e-08	180355807	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	0.0217	NA	NA	NA	1.71124211539705e-76	200350	200350
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	234115	13	13	-0.6442	1.71124211539705e-76	200350	200350	1.46753231930602e-47	234115	234115
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	236535	1	0	NA	1.46753231930602e-47	234115	234115	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	17482872	6072	5671	-0.0035	NA	NA	NA	2.07819121191962e-13	17482872	17482872
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-0.885	2.07819121191962e-13	17482872	17482872	2.40352131856546e-12	17488010	17488010
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	32539864	5546	5202	-0.0038	2.40352131856546e-12	17488010	17488010	2.97616060980157e-70	32538115	32613538
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32543054	32762061	69	65	0.3738	2.97616060980157e-70	32538115	32613538	2.51827101825539e-49	32713363	32766023
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	35862502	1333	1247	0.0114	2.51827101825539e-49	32713363	32766023	9.45253377963362e-12	35862270	35864636
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	0.517	9.45253377963362e-12	35862270	35864636	5.08062227965283e-13	35872078	35875112
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	49027493	5147	4826	0.0011	5.08062227965283e-13	35872078	35875112	7.32476708449842e-08	49022360	49027493
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49039318	49045025	2	2	-0.7023	7.32476708449842e-08	49022360	49027493	2.6647587246396e-08	49045025	49049568
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49049568	54033505	1757	1641	-0.0088	2.6647587246396e-08	49045025	49049568	8.9986425031606e-91	54033505	54033505
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54035000	1	0	NA	8.9986425031606e-91	54033505	54033505	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	2	-2.4624	NA	NA	NA	2.18254320783746e-100	54042734	54042734
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4249	-0.0059	2.18254320783746e-100	54042734	54042734	2.16979052872377e-13	72919733	72919733
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	2	-0.887	2.16979052872377e-13	72919733	72919733	3.33943168994357e-15	72924440	72924440
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	705	6e-04	3.33943168994357e-15	72924440	72924440	0	74647491	74647491
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-6.4006	0	74647491	74647491	0	74653360	74653360
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79015901	1141	1072	0.0055	0	74653360	74653360	8.89840831802656e-21	79011979	79015901
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79018959	79018959	1	0	NA	8.89840831802656e-21	79011979	79015901	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4432	NA	NA	NA	8.0071536519379e-23	79091850	79095415
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	5871	-0.0038	8.0071536519379e-23	79091850	79095415	0	102039635	102039635
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-6.493	0	102039635	102039635	0	102044331	102044331
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	464	0.0128	0	102044331	102044331	0	103841482	103841482
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.5365	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	103873584	1	0	NA	0	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103882598	110498221	2255	2104	-0.0054	NA	NA	NA	9.11018498057388e-32	110498221	110498221
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	6	-0.7984	9.11018498057388e-32	110498221	110498221	2.00736179079530e-32	110520229	110520229
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	110521603	1	0	NA	2.0073617907953e-32	110520229	110520229	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110524191	132748175	7475	7023	-0.0095	NA	NA	NA	4.03514183067861e-16	132748175	132748175
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132749309	132752481	3	3	-0.8041	4.03514183067861e-16	132748175	132748175	2.37183175268582e-16	132752481	132752481
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132754426	165643653	11364	10668	-0.0039	2.37183175268582e-16	132752481	132752481	3.07101503692704e-29	165643653	165643653
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.9138	3.07101503692704e-29	165643653	165643653	1.39432517595178e-28	165650610	165650610
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1692	-0.0144	1.39432517595178e-28	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	245	0.0216	NA	NA	NA	8.04278901916919e-10	1038517	1038517
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.8333	8.04278901916919e-10	1038517	1038517	8.1979205675621e-13	1047707	1047707
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	38262701	13339	12518	-0.0026	8.1979205675621e-13	1047707	1047707	1.14930228615644e-14	38244071	38270942
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38264758	38335964	37	35	0.2228	1.14930228615644e-14	38244071	38270942	9.97508921409066e-17	38330907	38345457
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	40141701	771	723	-0.0232	9.97508921409066e-17	38330907	38345457	2.01824480597018e-49	40141701	40141701
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	40143146	40143146	1	0	NA	2.01824480597018e-49	40141701	40141701	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	40145021	40182494	14	14	0.6307	NA	NA	NA	1.27555373546411e-43	40182494	40183666
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	40183666	75188956	8063	7616	0.0041	1.27555373546411e-43	40182494	40183666	3.11521745900665e-46	75188956	75188956
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75192598	75207560	7	7	0.916	3.11521745900665e-46	75188956	75188956	8.2101888105317e-44	75207560	75207560
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	76147819	280	261	0.0261	8.2101888105317e-44	75207560	75207560	1.87543253650047e-11	76051954	76305940
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76271458	76365382	8	8	0.46	1.87543253650047e-11	76051954	76305940	5.22325402044105e-15	76331090	76421843
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76421843	93162991	5666	5325	-0.007	5.22325402044105e-15	76331090	76421843	1.96353169671523e-11	93162991	93162991
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.8124	1.96353169671523e-11	93162991	93162991	2.54547341137581e-11	93168978	93168978
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2433	0.0034	2.54547341137581e-11	93168978	93168978	7.38627555348285e-19	100164752	100164752
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100166257	1	0	NA	7.38627555348285e-19	100164752	100164752	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-0.8417	NA	NA	NA	8.6223156385366e-17	100174991	100174991
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	113036114	5614	5262	-0.0045	8.6223156385366e-17	100174991	100174991	7.05342800663785e-14	113036114	113039324
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	113038218	113038218	1	0	NA	7.05342800663785e-14	113036114	113039324	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	113039324	113044613	3	3	-0.7702	NA	NA	NA	4.43851545087161e-15	113042385	113044613
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	113052705	120870445	3560	3332	-0.0072	4.43851545087161e-15	113042385	113044613	2.14250523783174e-08	120868807	120870445
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120872125	120874365	2	2	-0.7112	2.14250523783174e-08	120868807	120870445	2.14806112401181e-08	120874365	120878194
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120878194	125831554	2192	2035	-0.0066	2.14806112401181e-08	120874365	120878194	1.64507166950137e-07	125829681	125831554
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	0.5396	1.64507166950137e-07	125829681	125831554	6.95040475890124e-07	125837524	125839386
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3411	-0.0029	6.95040475890124e-07	125837524	125839386	2.5745392917211e-42	133433384	133433384
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7947	2.5745392917211e-42	133433384	133433384	1.94912742988867e-44	133448277	133448277
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3492	0.0029	1.94912742988867e-44	133448277	133448277	1.62500610408351e-32	141409512	141417702
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.5191	1.62500610408351e-32	141409512	141417702	8.75633460763517e-28	141434131	141442231
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2485	-0.0033	8.75633460763517e-28	141434131	141442231	2.56013740180782e-35	147702365	147702365
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.5812	2.56013740180782e-35	147702365	147702365	3.92321780107475e-38	147707161	147707161
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	156483966	3181	2967	0.0036	3.92321780107475e-38	147707161	147707161	1.06094220891277e-14	156483966	156483966
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	0.98	1.06094220891277e-14	156483966	156483966	1.12388891579880e-12	156490484	156490484
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	978	0.0041	1.1238889157988e-12	156490484	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	0.0169	NA	NA	NA	3.33073778643639e-17	581533	581533
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3357	3.33073778643639e-17	581533	581533	1.10727692273706e-27	588865	588865
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	5574577	1889	1791	-0.004	1.10727692273706e-27	588865	588865	1.76836535692458e-14	5574577	5574577
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-0.9621	1.76836535692458e-14	5574577	5574577	4.83243940510762e-18	5591702	5591702
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	6909487	378	358	0.0057	4.83243940510762e-18	5591702	5591702	1.04875853080281e-54	6909487	6909487
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	6926661	7156900	2	0	NA	1.04875853080281e-54	6909487	6909487	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.8012	NA	NA	NA	2.55829676681918e-48	7824059	7824059
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	51191560	12911	12121	-3e-04	2.55829676681918e-48	7824059	7824059	4.8255602961171e-13	51191560	51191560
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	4.8255602961171e-13	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.7357	NA	NA	NA	9.6871819510778e-14	51200291	51204788
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	9.6871819510778e-14	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	88232510	10874	10184	-0.0067	NA	NA	NA	4.77794958638719e-26	88232510	88232510
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	88234539	88234539	1	0	NA	4.77794958638719e-26	88232510	88232510	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	88236504	88240596	3	3	-0.9984	NA	NA	NA	1.96979829732754e-24	88240596	88240596
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	88242755	146264846	18371	17205	-0.0033	1.96979829732754e-24	88240596	88240596	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	22477358	7836	7323	-0.0058	NA	NA	NA	1.73029073148135e-11	22477358	22477358
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.8372	1.73029073148135e-11	22477358	22477358	7.26539514730478e-13	22492603	22492603
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	151	-0.0186	7.26539514730478e-13	22492603	22492603	0	23343915	23343915
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	2	-5.4109	0	23343915	23343915	0	23365926	23365926
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	30407055	1772	1647	-0.0161	0	23365926	23365926	1.48735829491131e-246	30407055	30407055
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	30410579	30414069	2	0	NA	1.48735829491131e-246	30407055	30407055	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	30425335	30549999	37	32	-0.9521	NA	NA	NA	3.39839383139362e-237	30549999	30549999
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	30553953	70926188	3258	3049	0.0035	3.39839383139362e-237	30549999	30549999	4.59131027669207e-234	70926188	70926188
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.7715	4.59131027669207e-234	70926188	70926188	1.84870742625669e-246	70930528	70930528
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9327	-0.0046	1.84870742625669e-246	70930528	70930528	3.75282867754816e-12	100348045	100348045
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	0.8554	3.75282867754816e-12	100348045	100348045	8.60867706487876e-13	100350814	100350814
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116118907	5545	5206	-0.0036	8.60867706487876e-13	100350814	100350814	1.06792001573082e-07	116116077	116118907
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116130333	4	2	-0.6797	1.06792001573082e-07	116116077	116118907	1.36175634829359e-07	116130333	116132839
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	118441495	860	808	-0.0137	1.36175634829359e-07	116130333	116132839	0	118441495	118441495
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118443864	118588632	66	60	-0.9661	0	118441495	118441495	0	118588632	118588632
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118591951	133607124	5891	5528	0.0031	0	118588632	118588632	4.06044437800603e-17	133607124	133607124
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133609822	133611099	2	2	1.0412	4.06044437800603e-17	133607124	133607124	5.9342110022321e-17	133611099	133611099
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133612653	138786186	2047	1921	0.0013	5.9342110022321e-17	133611099	133611099	4.16481232534988e-11	138786186	138786186
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138787852	138791196	2	2	-0.8465	4.16481232534988e-11	138786186	138786186	2.86295266097896e-08	138791196	138804983
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138794487	138794487	1	0	NA	2.86295266097896e-08	138791196	138804983	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138804983	140145683	531	506	-2e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	26366253	9473	8915	-0.004	NA	NA	NA	7.68546220353233e-13	26361821	26380327
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26366341	26392771	12	12	-0.3675	7.68546220353233e-13	26361821	26380327	2.94749200150285e-10	26386157	26399551
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26395501	27038538	244	225	0.0136	2.94749200150285e-10	26386157	26399551	8.03760136404203e-37	27038538	27038538
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.2807	8.03760136404203e-37	27038538	27038538	4.25015430548068e-73	27041812	27041812
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1468	-0.0024	4.25015430548068e-73	27041812	27041812	7.13404053120857e-17	31284926	31284926
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31287101	1	0	NA	7.13404053120857e-17	31284926	31284926	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31289799	31291525	2	2	-1.0258	NA	NA	NA	2.39837613341796e-17	31291525	31291525
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	12436	-0.0063	2.39837613341796e-17	31291525	31291525	2.02919260372483e-13	77917893	77917893
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.7306	2.02919260372483e-13	77917893	77917893	7.77177393881005e-13	77928738	77928738
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	82863076	1493	1401	-0.0094	7.77177393881005e-13	77928738	77928738	3.34725277794779e-25	82863076	82863076
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82866553	82869426	2	0	NA	3.34725277794779e-25	82863076	82863076	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82871659	82881204	5	5	-0.8087	NA	NA	NA	3.68867817381647e-27	82881204	82881204
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	97449717	4823	4513	-0.0087	3.68867817381647e-27	82881204	82881204	3.91036830634903e-10	97449717	97449717
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	97458529	97460217	2	2	-0.7941	3.91036830634903e-10	97449717	97449717	6.25616668808045e-10	97460217	97460217
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	97464566	132797428	12952	12132	-0.0048	6.25616668808045e-10	97460217	97460217	4.64740021410172e-17	132797428	132797428
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	1.014	4.64740021410172e-17	132797428	132797428	1.63186867571736e-14	132801463	132801463
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	134739406	723	688	-2e-04	1.63186867571736e-14	132801463	132801463	1.46812735206614e-12	134739406	134739406
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	0.9429	1.46812735206614e-12	134739406	134739406	1.09803606565301e-10	134743423	134743423
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	196	-0.0089	1.09803606565301e-10	134743423	134743423	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4533510	1596	1488	0.0064	NA	NA	NA	2.18369535892745e-29	4533510	4533510
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4536833	4536833	1	0	NA	2.18369535892745e-29	4533510	4533510	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4543246	4547977	4	4	-1.0336	NA	NA	NA	7.09967127760447e-33	4547977	4547977
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4549687	4923300	171	163	-0.0227	7.09967127760447e-33	4547977	4547977	4.35055146743294e-20	4923300	4923300
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-0.8165	4.35055146743294e-20	4923300	4923300	1.48452957308310e-21	4932214	4932214
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	347	-0.0108	1.4845295730831e-21	4932214	4932214	2.66758118755394e-60	5741031	5741031
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	13	-0.7699	2.66758118755394e-60	5741031	5741031	5.60397193710631e-61	5765438	5765438
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	4882	-0.0043	5.60397193710631e-61	5765438	5765438	1.09121548614560e-13	18890351	18896166
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.5469	1.0912154861456e-13	18890351	18896166	2.09997459142600e-15	18917191	18929375
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	20799632	768	714	0.0067	2.099974591426e-15	18917191	18929375	5.68733379005722e-16	20797855	20799632
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-0.7891	5.68733379005722e-16	20797855	20799632	3.42876544075029e-15	20806094	20806094
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	49671267	8570	8042	-0.0016	3.42876544075029e-15	20806094	20806094	7.68400575822875e-32	49671267	49671267
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	8	-0.692	7.68400575822875e-32	49671267	49671267	1.03554843295459e-31	49710027	49721954
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55118214	178	169	0.0114	1.03554843295459e-31	49710027	49721954	5.66977661913497e-54	55114405	55124730
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.465	5.66977661913497e-54	55114405	55124730	4.49304214785404e-65	55205278	55217189
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4344	0.0053	4.49304214785404e-65	55205278	55217189	4.60139879361748e-16	66463477	66463477
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0455	4.60139879361748e-16	66463477	66463477	1.98725591332011e-18	66469412	66469412
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	99025912	10854	10202	-0.004	1.98725591332011e-18	66469412	66469412	9.86780122177427e-11	99008939	99032916
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99074552	22	22	0.241	9.86780122177427e-11	99008939	99032916	5.46056407134271e-11	99064450	99081056
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	106733851	2522	2360	-0.0065	5.46056407134271e-11	99064450	99081056	4.18868483611075e-11	106730906	106733851
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.5747	4.18868483611075e-11	106730906	106733851	5.61792602351848e-11	106747920	106754784
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9711	-0.0027	5.61792602351848e-11	106747920	106754784	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3509	-7e-04	NA	NA	NA	9.55471701177101e-21	9516067	9543817
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9626623	17	12	-0.4784	9.55471701177101e-21	9516067	9543817	8.69606369932227e-23	9607363	9626736
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	33170663	8161	7634	-0.0058	8.69606369932227e-23	9607363	9626736	1.62225294844938e-15	33170663	33170663
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33178741	33184017	2	0	NA	1.62225294844938e-15	33170663	33170663	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.9655	NA	NA	NA	5.54504487358731e-16	33198331	33198331
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	47943680	3974	3729	0.0017	5.54504487358731e-16	33198331	33198331	1.08825951352006e-11	47935363	47951326
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47945783	47976836	14	13	0.3293	1.08825951352006e-11	47935363	47951326	3.38023863669101e-11	47968365	47984575
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47978691	130694393	28603	26866	5e-04	3.38023863669101e-11	47968365	47984575	1.89458645971008e-09	130694393	130694393
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.7761	1.89458645971008e-09	130694393	130694393	2.42114804959838e-13	130701040	130701040
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	83	-0.0118	2.42114804959838e-13	130701040	130701040	3.90411294278573e-57	130943064	130943064
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6097	3.90411294278573e-57	130943064	130943064	1.57602010831892e-42	130946248	130946248
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	514	0.012	1.57602010831892e-42	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11445	-0.0045	NA	NA	NA	2.18700943260898e-41	49964838	49964838
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.5655	2.18700943260898e-41	49964838	49964838	1.19586900631863e-33	49971732	49971732
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51305353	594	562	-3e-04	1.19586900631863e-33	49971732	49971732	2.71270974459981e-22	51305353	51305353
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51306676	51307725	2	2	-1.1589	2.71270974459981e-22	51305353	51305353	3.75834544462405e-23	51307725	51307725
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51310019	89657473	9475	8880	-8e-04	3.75834544462405e-23	51307725	51307725	0	89657473	89657473
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89659397	89659397	1	0	NA	0	89657473	89657473	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-5.0015	NA	NA	NA	0	89662326	89662326
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100689280	4784	4497	-0.002	0	89662326	89662326	2.1770141160969e-138	100689280	100689280
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100690991	100690991	1	0	NA	2.1770141160969e-138	100689280	100689280	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-3.0192	NA	NA	NA	8.39520191241824e-135	100693892	100693892
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4122	-0.0062	8.39520191241824e-135	100693892	100693892	1.25147769077383e-20	113788788	113788788
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.9135	1.25147769077383e-20	113788788	113788788	1.40237524683487e-15	113794669	113794669
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114118270	148	143	0.0241	1.40237524683487e-15	113794669	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	6	0.1822	NA	NA	NA	4.64325917779195e-05	18508651	19441654
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	18864561	1	0	NA	4.64325917779195e-05	18508651	19441654	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	21523818	1041	975	0.0015	NA	NA	NA	3.04610778482525e-72	21506124	21536847
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21526238	21948273	204	194	0.2401	3.04610778482525e-72	21506124	21536847	3.38611759507235e-08	21945464	21955428
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21950230	21960647	7	7	0.6551	3.38611759507235e-08	21945464	21955428	3.2204222823409e-05	21951294	21966870
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21963328	22057437	57	55	0.2646	3.2204222823409e-05	21951294	21966870	2.33888054274013e-31	22051630	22066142
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22059557	22059557	1	0	NA	2.33888054274013e-31	22051630	22066142	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22061243	34674458	4432	4155	-0.0016	NA	NA	NA	2.12085924407632e-21	34674458	34674458
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	0.9367	2.12085924407632e-21	34674458	34674458	2.53608128680585e-22	34683810	34683810
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	78842396	16416	15397	-0.0022	2.53608128680585e-22	34683810	34683810	7.70920119746332e-14	78842396	78842396
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78844477	78844837	2	2	-0.9175	7.70920119746332e-14	78842396	78842396	2.45206641019675e-14	78844837	78844837
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78851145	79174722	170	161	-0.0249	2.45206641019675e-14	78844837	78844837	3.95420498992583e-319	79174722	79174722
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.6979	3.95420498992583e-319	79174722	79174722	0	79183154	79183154
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8747	-6e-04	0	79183154	79183154	6.97493864357335e-23	105595302	105602602
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105703388	15	13	-0.4675	6.97493864357335e-23	105595302	105602602	1.875825536586e-05	105630089	105736025
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105707746	105787390	18	18	-0.1347	1.875825536586e-05	105630089	105736025	3.24081726675731e-09	105787390	105787390
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105795807	5	5	0.4071	3.24081726675731e-09	105787390	105787390	5.50571029486506e-05	105795807	105800545
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105856972	24	20	0.0334	5.50571029486506e-05	105795807	105800545	9.39679181998243e-12	105856591	105856972
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-0.5528	9.39679181998243e-12	105856591	105856972	3.21767455585244e-10	105881893	105897061
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	164	0.0314	3.21767455585244e-10	105881893	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1142	NA	NA	NA	9.39560586929918e-15	18452491	18692865
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18886649	25	25	-0.3548	9.39560586929918e-15	18452491	18692865	1.00283580652657e-08	18882292	19137963
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19465359	68	64	-0.084	1.00283580652657e-08	18882292	19137963	2.15721697584576e-10	19424067	19465359
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19835471	9	7	-0.6302	2.15721697584576e-10	19424067	19465359	8.55724418648799e-20	19835471	19835471
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-1.9872	8.55724418648799e-20	19835471	19835471	5.11724724049194e-30	19844217	19844217
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20088256	47	44	-0.5648	5.11724724049194e-30	19844217	19844217	6.95640719195889e-114	20079935	20308014
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	41638388	7354	6876	-0.0061	6.95640719195889e-114	20079935	20308014	1.03866543646967e-22	41638388	41638388
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41682937	4	4	0.8288	1.03866543646967e-22	41638388	41638388	9.56988822408754e-23	41682937	41682937
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	41704248	1	0	NA	9.56988822408754e-23	41682937	41682937	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41706959	75518598	14538	13610	-0.0039	NA	NA	NA	3.96506615333612e-20	75518598	75518598
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75519691	75520672	2	2	-1.1141	3.96506615333612e-20	75518598	75518598	1.71712730585197e-20	75520672	75520672
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75521740	98232932	8353	7805	-0.0049	1.71712730585197e-20	75520672	75520672	2.04771330245609e-12	98232932	98232932
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98237721	2	2	-0.8772	2.04771330245609e-12	98232932	98232932	3.35183986704561e-13	98237721	98237721
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98239454	98239454	1	0	NA	3.35183986704561e-13	98237721	98237721	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	602	-0.0074	NA	NA	NA	1.96090472763742e-14	99632987	99632987
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	0.9194	1.96090472763742e-14	99632987	99632987	3.60229194044322e-16	99635701	99635701
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	244	-0.0175	3.60229194044322e-16	99635701	99635701	1.72926679074279e-14	100212401	100217283
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.5563	1.72926679074279e-14	100212401	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1994618	782	733	0.0037	NA	NA	NA	4.5042779664735e-08	1990435	1994618
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1995829	2000527	4	4	0.5635	4.5042779664735e-08	1990435	1994618	1.50088488557971e-09	2000527	2005613
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2005613	30358855	9170	8625	0.0038	1.50088488557971e-09	2000527	2005613	5.26997618801245e-29	30358855	30358855
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30360747	30366530	5	5	-0.8484	5.26997618801245e-29	30358855	30358855	2.04308267694908e-26	30366530	30366530
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30368171	32379126	612	575	0.0094	2.04308267694908e-26	30366530	30366530	7.11476618174636e-77	31862577	32481309
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	43	-0.505	7.11476618174636e-77	31862577	32481309	3.39987414287376e-92	33559207	33830585
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	75093957	9904	9316	-2e-04	3.39987414287376e-92	33559207	33830585	5.82452221637609e-78	75093957	75093957
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.7534	5.82452221637609e-78	75093957	75093957	1.08648813157486e-93	75100865	75100865
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75791088	158	148	-0.0141	1.08648813157486e-93	75100865	75100865	3.00236717835134e-22	75791088	75791088
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75793352	75799719	4	4	-0.7701	3.00236717835134e-22	75791088	75791088	4.9977679965672e-19	75799719	75799719
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75800985	79735089	1374	1282	-0.0162	4.9977679965672e-19	75799719	75799719	1.91451448337071e-19	79733015	79736350
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	79736350	79744613	4	4	-0.7803	1.91451448337071e-19	79733015	79736350	1.80571815579022e-18	79740765	79744613
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	79747298	88690571	3591	3361	0.0041	1.80571815579022e-18	79740765	79744613	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	392	0.033	NA	NA	NA	1.1770005572431e-30	1028979	1028979
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4464	1.1770005572431e-30	1028979	1028979	5.8337523190659e-34	1030766	1030766
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	15727076	5883	5503	0.0052	5.8337523190659e-34	1030766	1030766	0	15727076	15727076
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.4908	0	15727076	15727076	0	15733964	15733964
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	36673853	7567	7066	0.0048	0	15733964	15733964	0	36673853	36673853
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-3.7486	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36686013	1	0	NA	0	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36687917	41564408	2030	1895	0.023	NA	NA	NA	4.10415944907659e-68	41562786	41570512
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	42142363	48	45	-0.4101	4.10415944907659e-68	41562786	41570512	6.89693603890248e-63	41704093	42147225
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42143048	52440878	3479	3257	0.0036	6.89693603890248e-63	41704093	42147225	1.43325065784496e-287	52440878	52440878
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-3.3666	1.43325065784496e-287	52440878	52440878	3.49727068665918e-274	52447064	52447064
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9544	0.0067	3.49727068665918e-274	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10317	-0.0022	NA	NA	NA	6.44265903383657e-10	36509250	36509250
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-0.7735	6.44265903383657e-10	36509250	36509250	1.65924427522803e-09	36519728	36524577
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	76116026	11980	11286	-0.0063	1.65924427522803e-09	36519728	36524577	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	11	-0.0301	NA	NA	NA	1.06473411900184e-65	239700	239700
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.4995	1.06473411900184e-65	239700	239700	7.55326358864722e-34	243026	243026
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	244260	1	0	NA	7.55326358864722e-34	243026	243026	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	245293	790526	204	193	0.0249	NA	NA	NA	2.88703348608770e-12	790526	790526
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	0.9157	2.8870334860877e-12	790526	790526	2.99945904698708e-09	794978	798817
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	249	0.0352	2.99945904698708e-09	794978	798817	1.09886779305039e-31	1398325	1398325
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.6524	1.09886779305039e-31	1398325	1398325	3.38086838438842e-40	1400840	1400840
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11445761	4677	4378	0.0116	3.38086838438842e-40	1400840	1400840	7.91842511028313e-30	11445761	11445761
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11448975	11448975	1	0	NA	7.91842511028313e-30	11445761	11445761	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.4289	NA	NA	NA	2.99286329998893e-31	11452390	11452390
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	55769042	14181	13313	0.0077	2.99286329998893e-31	11452390	11452390	1.36269946563911e-89	55769042	55769042
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-2.4044	1.36269946563911e-89	55769042	55769042	3.95619307784374e-67	55772729	55772729
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	58008337	1051	990	-8e-04	3.95619307784374e-67	55772729	55772729	1.69249957253629e-23	58003357	58008337
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58010034	58010034	1	0	NA	1.69249957253629e-23	58003357	58008337	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58019853	58044489	10	10	0.5694	NA	NA	NA	1.70075701056350e-23	58044489	58057185
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58057185	59414898	636	592	0.0044	1.7007570105635e-23	58044489	58057185	1.5160390645215e-32	59414898	59414898
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.6926	1.5160390645215e-32	59414898	59414898	5.75982002660306e-35	59434202	59434202
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	22	-0.1242	5.75982002660306e-35	59434202	59434202	2.15744400246085e-22	59491509	59491509
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.981	2.15744400246085e-22	59491509	59491509	2.94185984231764e-15	59497049	59497049
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1856	-0.0054	2.94185984231764e-15	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	548	0.0061	NA	NA	NA	3.52247679069119e-246	1506379	1515948
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.6122	3.52247679069119e-246	1506379	1515948	0	1525300	1531162
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	3767748	931	870	0.0015	0	1525300	1531162	2.87689908127419e-10	3767748	3767748
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3771151	3772462	2	2	-0.7811	2.87689908127419e-10	3767748	3767748	4.51771694689309e-10	3772462	3774394
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3774394	51906833	16244	15247	-0.0016	4.51771694689309e-10	3772462	3774394	8.99828951961947e-14	51906833	51906833
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51910029	51914527	2	2	-0.9036	8.99828951961947e-14	51906833	51906833	4.68480858238177e-12	51914527	51914527
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51916264	51916264	1	0	NA	4.68480858238177e-12	51914527	51914527	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51917762	62419534	3804	3589	-0.0027	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12613	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2377	0.0108	NA	NA	NA	1.17087607382895e-52	21571489	21571489
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.5646	1.17087607382895e-52	21571489	21571489	8.22156994211413e-55	21576859	21576859
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22354945	325	303	0.0124	8.22156994211413e-55	21576859	21576859	2.41325042379222e-09	22353852	22354945
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-0.7834	2.41325042379222e-09	22353852	22354945	5.68085841832551e-09	22357051	22357051
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	22667608	132	125	0.0125	5.68085841832551e-09	22357051	22357051	1.17819804537378e-18	22643742	22686690
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	-0.3913	1.17819804537378e-18	22643742	22686690	9.14640850929426e-25	22718614	22736990
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32110063	5042	4705	0.0039	9.14640850929426e-25	22718614	22736990	2.49738370941302e-09	32108954	32110063
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-0.775	2.49738370941302e-09	32108954	32110063	4.03859661059708e-10	32112051	32112051
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	35472378	1503	1419	0.0087	4.03859661059708e-10	32112051	32112051	1.21724863998392e-46	35472378	35472378
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.6604	1.21724863998392e-46	35472378	35472378	2.16147247242885e-41	35476942	35476942
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	41220567	3051	2854	0.0095	2.16147247242885e-41	35476942	35476942	9.3208826121518e-11	41213175	41237593
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41279485	11	11	0.3759	9.3208826121518e-11	41213175	41237593	2.46179607514059e-11	41274958	41289552
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3690	0.0022	2.46179607514059e-11	41274958	41289552	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.0737	NA	NA	NA	3.47875072010130e-15	94062	98390
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	3.4787507201013e-15	94062	98390	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	1.0678	NA	NA	NA	3.44818491948542e-21	104486	106242
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	127779	18	15	0.1137	3.44818491948542e-21	104486	106242	5.15597181597339e-25	127779	127779
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	2	1.5019	5.15597181597339e-25	127779	127779	1.37557986025946e-30	130528	130528
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2302065	1366	1268	-0.0055	1.37557986025946e-30	130528	130528	7.53467984707123e-24	2302065	2302065
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9391	7.53467984707123e-24	2302065	2302065	5.0716304931639e-26	2304398	2304398
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	335	0.0065	5.0716304931639e-26	2304398	2304398	2.04163083673648e-12	2668419	2686115
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2573	2.04163083673648e-12	2668419	2686115	2.07185884593909e-178	2708291	2708291
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8432497	1781	1670	0.9177	2.07185884593909e-178	2708291	2708291	1.38494672760792e-15	8406115	8452395
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8466917	17	17	0.6461	1.38494672760792e-15	8406115	8452395	1.16747811685965e-12	8449254	8486398
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.16747811685965e-12	8449254	8486398	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	153329988	42919	40260	0.9463	NA	NA	NA	2.57471168067868e-17	153328351	153340901
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153348763	8	7	0.2872	2.57471168067868e-17	153328351	153340901	2.79732168281774e-11	153342841	153355101
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153351248	154582414	408	371	0.9184	2.79732168281774e-11	153342841	153355101	0	154578922	154582414
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	184	-0.0097	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	110	-4.4916	NA	NA	NA	3.7815518268169e-36	3223585	3773948
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.2092	3.7815518268169e-36	3223585	3773948	3.86002996929348e-18	5422507	6652845
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	157	-4.0922	3.86002996929348e-18	5422507	6652845	1.24801514531314e-08	7029972	7201478
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	113	-3.031	1.24801514531314e-08	7029972	7201478	0.00487003235804387	7375948	7581867
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7614417	15	12	-4.7647	0.00487003235804387	7375948	7581867	0.00196523611065169	7603458	7631265
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7614571	7653082	16	14	-2.7739	0.00196523611065169	7603458	7631265	6.20753524574899e-07	7645258	7658121
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7713973	38	35	-4.6302	6.20753524574899e-07	7645258	7658121	1.03878078801424e-11	7707621	7716001
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7714929	7782532	24	22	-2.8859	1.03878078801424e-11	7707621	7716001	0.00467919959159781	7749796	7835361
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7938700	47	45	-3.8643	0.00467919959159781	7749796	7835361	0.00899769734351212	7855856	7947666
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7942730	7997485	12	11	-2.6765	0.00899769734351212	7855856	7947666	9.72273901852323e-14	7996758	8005148
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8280065	65	55	-4.7068	9.72273901852323e-14	7996758	8005148	1.38322219468538e-14	8241630	8299833
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8652693	102	93	-3.5695	1.38322219468538e-14	8241630	8299833	6.62247177277876e-09	8589035	8712094
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8659109	10513747	203	175	-4.3726	6.62247177277876e-09	8589035	8712094	3.92837170894516e-32	10512616	10515697
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.7183	3.92837170894516e-32	10512616	10515697	6.24772797438787e-14	10622062	10655750
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12541506	18	15	-4.4456	6.24772797438787e-14	10622062	10655750	2.45546395820145e-08	12532441	12542979
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12593244	26	23	-1.9856	2.45546395820145e-08	12532441	12542979	2.03210779017662e-06	12588578	12601014
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12594824	12611624	9	8	-4.1674	2.03210779017662e-06	12588578	12601014	9.85932947377741e-05	12607539	12619162
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	16	-2.0433	9.85932947377741e-05	12607539	12619162	6.32882438174849e-10	12658135	12687167
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.0023	6.32882438174849e-10	12658135	12687167	9.67661334309536e-06	12820920	12857197
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12898852	22	21	-2.8343	9.67661334309536e-06	12820920	12857197	0.0212515269513372	12861657	12911576
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12899653	12928074	12	12	-3.8156	0.0212515269513372	12861657	12911576	5.7641289584571e-06	12925401	12960717
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	71	-2.0486	5.7641289584571e-06	12925401	12960717	1.82485705695239e-08	13119344	13129843
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13140274	6	5	-5.2885	1.82485705695239e-08	13119344	13129843	0.0118167316873075	13136828	13140274
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13146483	13153117	7	6	-4.1909	0.0118167316873075	13136828	13140274	0.0487164643173115	13153117	13233514
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13262997	33	31	-3.1472	0.0487164643173115	13153117	13233514	3.38096107491838e-14	13254711	13281871
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13633041	161	137	-4.5395	3.38096107491838e-14	13254711	13281871	2.91740502822587e-05	13572080	13633041
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13644667	13716000	13	9	-3.0955	2.91740502822587e-05	13572080	13633041	2.05755459457366e-05	13716000	13759681
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14342834	189	171	-4.6051	2.05755459457366e-05	13716000	13759681	3.61531589405886e-12	14330251	14354682
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14382361	21	20	-3.038	3.61531589405886e-12	14330251	14354682	2.9791707266948e-08	14380301	14382361
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14383746	14404979	9	9	-5.1802	2.9791707266948e-08	14380301	14382361	2.30731311091219e-06	14404979	14411113
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14407293	14524829	68	58	-3.3987	2.30731311091219e-06	14404979	14411113	2.55230075342038e-10	14506319	14524829
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14545228	9	7	-0.8164	2.55230075342038e-10	14506319	14524829	0.00043227371719661	14545228	14557473
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14546195	14546195	1	0	NA	0.00043227371719661	14545228	14557473	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14547168	14644293	24	23	-2.9929	NA	NA	NA	7.84942483244935e-05	14563486	14698076
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14681738	1	0	NA	7.84942483244935e-05	14563486	14698076	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	15208612	142	127	-4.1165	NA	NA	NA	2.93759667428297e-06	15203221	15209166
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15228303	8	7	-2.0881	2.93759667428297e-06	15203221	15209166	0.000435294624590065	15225775	15250474
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15240367	15316364	55	45	-3.8849	0.000435294624590065	15225775	15250474	8.99114117443232e-05	15301380	15317370
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15317370	15340715	15	14	-5.2533	8.99114117443232e-05	15301380	15317370	1.40119962450586e-12	15339564	15340715
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15342258	15346755	4	4	-3.0731	1.40119962450586e-12	15339564	15340715	0.000211479574920679	15346755	15355928
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15348526	15405339	35	31	-4.8263	0.000211479574920679	15346755	15355928	0.00527648899720625	15389388	15479343
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15406461	15915466	147	135	-3.9563	0.00527648899720625	15389388	15479343	0.0328876411812491	15553682	16083793
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16215750	126	113	-3.4495	0.0328876411812491	15553682	16083793	3.22635696537543e-15	16175250	16290147
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16217583	16217583	1	0	NA	3.22635696537543e-15	16175250	16290147	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	22139807	973	874	-4.3223	NA	NA	NA	3.58673795440299e-08	22052726	22139807
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1352	3.58673795440299e-08	22052726	22139807	9.41928369802366e-13	22177335	22181855
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	9.41928369802366e-13	22177335	22181855	NA	NA	NA
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22930737	92	77	-4.732	NA	NA	NA	2.45488273597947e-82	22926726	22930737
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0635	2.45488273597947e-82	22926726	22930737	1.04381635217448e-18	26945084	26950080
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.9437	1.04381635217448e-18	26945084	26950080	0.000707603079599934	26965406	27000085
MSK_252152915164_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	43	-1.2311	0.000707603079599934	26965406	27000085	NA	NA	NA
