Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72541443	27897	26709	0.0137	NA	NA	NA	2.96645991941287e-13	72536231	72543019
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72543019	72579311	11	11	0.5621	2.96645991941287e-13	72536231	72543019	9.20605170740154e-08	72574479	72610316
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	143700072	15621	14939	-0.0025	9.20605170740154e-08	72574479	72610316	1.13399805365398e-15	143641813	143715443
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	143789484	44	43	-0.3987	1.13399805365398e-15	143641813	143715443	8.35568628416366e-15	143775908	143802400
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	147352661	607	582	-0.0021	8.35568628416366e-15	143775908	143802400	6.39676799042481e-08	147311437	147381641
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147357754	147497268	24	23	0.3874	6.39676799042481e-08	147311437	147381641	2.65139082592700e-08	147467273	148120872
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150839754	1264	1200	0.0333	2.651390825927e-08	147467273	148120872	5.99915089746391e-29	150839754	150839754
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	-1.9789	5.99915089746391e-29	150839754	150839754	9.16368470266724e-27	150846148	150846148
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	9.16368470266724e-27	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2643	0.0237	NA	NA	NA	1.15656580278620e-26	157133150	157133150
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.4712	1.1565658027862e-26	157133150	157133150	6.79084262319828e-30	157136342	157136342
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200609726	15466	14779	-0.0085	6.79084262319828e-30	157136342	157136342	9.25727291565408e-09	200584100	200620756
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200698665	33	32	-0.355	9.25727291565408e-09	200584100	200620756	8.33034566104115e-09	200679934	200813827
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200701140	246769018	17286	16574	-0.0031	8.33034566104115e-09	200679934	200813827	2.02945509313761e-20	246751473	246806669
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	29	-0.5517	2.02945509313761e-20	246751473	246806669	3.40658075978892e-14	246862029	246902470
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	92	0.0147	3.40658075978892e-14	246862029	246902470	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	27094463	8277	7907	-0.0066	NA	NA	NA	2.63512791150381e-07	27086448	27094463
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27096168	27103054	4	4	-0.7096	2.63512791150381e-07	27086448	27094463	0.000788750463482976	27103054	27113764
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27104657	33076512	2595	2481	-0.0022	0.000788750463482976	27103054	27113764	4.60200312583143e-35	33076512	33076512
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.8747	4.60200312583143e-35	33076512	33076512	3.05920728409628e-50	33080437	33080437
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	615	-0.0115	3.05920728409628e-50	33080437	33080437	8.80918912046969e-19	34539603	34554208
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6119	8.80918912046969e-19	34539603	34554208	1.58089358949647e-15	34580533	34597294
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	242689978	66287	63415	-0.0043	1.58089358949647e-15	34580533	34597294	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10330	-0.011	NA	NA	NA	9.24579153357472e-12	32074432	32074432
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5389	9.24579153357472e-12	32074432	32074432	1.40666292379226e-11	32080848	32080848
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1809	0.0033	1.40666292379226e-11	32080848	32080848	2.10209240180999e-08	37949781	37953375
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7577	2.10209240180999e-08	37949781	37953375	4.25321890039346e-11	37961110	37963736
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	53001678	5975	5698	0.0188	4.25321890039346e-11	37961110	37963736	2.43868159191891e-10	52997045	53001678
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.9859	2.43868159191891e-10	52997045	53001678	1.56397438847760e-11	53011885	53014254
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	99891210	13516	12926	-0.0131	1.5639743884776e-11	53011885	53014254	9.62018462613452e-79	99891210	99891210
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-3.9201	9.62018462613452e-79	99891210	99891210	2.57490708894137e-75	99897201	99897201
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164001657	21305	20396	-0.0092	2.57490708894137e-75	99897201	99897201	5.9352866930336e-33	164001657	164009321
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	5.9352866930336e-33	164001657	164009321	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	1.8346	NA	NA	NA	4.82712749611886e-21	164019640	164027724
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-0.403	4.82712749611886e-21	164019640	164027724	1.91583106664538e-07	164093750	164142230
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10626	-0.0042	1.91583106664538e-07	164093750	164142230	1.79179896141895e-09	196805434	196911010
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-0.4536	1.79179896141895e-09	196805434	196911010	6.3606379593895e-10	196925203	196946355
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	915	0.0339	6.3606379593895e-10	196925203	196946355	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	64376590	17351	16626	-0.0029	NA	NA	NA	1.77081057715338e-40	64376590	64376590
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-2.8761	1.77081057715338e-40	64376590	64376590	1.4947944757436e-36	64390333	64390333
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	64398986	1	0	NA	1.4947944757436e-36	64390333	64390333	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64405760	68905670	1079	1033	-0.0109	NA	NA	NA	8.03555717864887e-12	68897538	69075140
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69656183	16	16	-0.5871	8.03555717864887e-12	68897538	69075140	4.77686532910248e-13	69165814	69687545
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69665979	94073863	8446	8050	-0.0034	4.77686532910248e-13	69165814	69687545	1.70526727007993e-111	94073863	94073863
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-4.7153	1.70526727007993e-111	94073863	94073863	6.75631094416008e-115	94078581	94078581
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	173660684	22938	21929	-0.0087	6.75631094416008e-115	94078581	94078581	3.51481809475648e-35	173660684	173660684
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.6351	3.51481809475648e-35	173660684	173660684	1.27944786935197e-36	173666072	173666072
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3620	-0.0036	1.27944786935197e-36	173666072	173666072	1.41901460136354e-51	186676034	186676034
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1118	1.41901460136354e-51	186676034	186676034	3.83579753496009e-49	186680176	186680176
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1485	-0.0228	3.83579753496009e-49	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	98781278	27764	26600	-0.0072	NA	NA	NA	6.6208992847576e-11	98775747	98781278
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98803249	98836557	5	5	-0.9649	6.6208992847576e-11	98775747	98781278	2.17190669102024e-10	98836557	98849766
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98849766	180342860	25877	24728	-0.0043	2.17190669102024e-10	98836557	98849766	4.18717521722481e-09	180189516	180342860
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	0.7604	4.18717521722481e-09	180189516	180342860	6.29694820001642e-08	180358977	180365950
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	6.29694820001642e-08	180358977	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	107	0.0234	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.043	NA	NA	NA	1.20375084865520e-15	198124	204881
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	241674	17	17	-0.6604	1.2037508486552e-15	198124	204881	3.64389603998871e-18	240119	248239
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	26811016	9309	8897	0.0025	3.64389603998871e-18	240119	248239	5.53398705521256e-08	26797255	26811016
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.9242	5.53398705521256e-08	26797255	26811016	4.52779251550228e-09	26861184	26863540
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29941766	1216	1159	0.0274	4.52779251550228e-09	26861184	26863540	1.65501068287103e-09	29931329	29972382
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	29950805	1	0	NA	1.65501068287103e-09	29931329	29972382	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.4785	NA	NA	NA	1.05733687495189e-08	30000990	30031367
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1021	0.0457	1.05733687495189e-08	30000990	30031367	3.41536036059086e-108	32558677	32567462
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.4352	3.41536036059086e-108	32558677	32567462	0.000977749712147006	32590568	32600962
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32628420	5	5	-0.1211	0.000977749712147006	32590568	32600962	1.23546176722919e-21	32628420	32628420
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-1.7393	1.23546176722919e-21	32628420	32628420	6.92061543906256e-22	32633691	32633691
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.1035	6.92061543906256e-22	32633691	32633691	5.21104686511602e-06	32709263	32728285
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	13	-0.7914	5.21104686511602e-06	32709263	32728285	3.62973528032459e-19	32728487	32742767
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	170753106	44381	42546	-0.0051	3.62973528032459e-19	32728487	32742767	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5144	0.0171	NA	NA	NA	6.363023090193e-73	16135701	16135701
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.8391	6.363023090193e-73	16135701	16135701	1.76199080347263e-71	16140018	16140018
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	118611324	33875	32464	-0.0021	1.76199080347263e-71	16140018	16140018	4.84885263619624e-120	118611324	118611324
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.0512	4.84885263619624e-120	118611324	118611324	3.67633851875552e-99	118620875	118620875
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	120089714	604	576	-0.0068	3.67633851875552e-99	118620875	118620875	2.07456216252597e-08	120087494	120089714
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120098907	5	5	-0.9392	2.07456216252597e-08	120087494	120089714	3.35980981687866e-10	120098907	120101979
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	141405145	9922	9476	-0.0012	3.35980981687866e-10	120098907	120101979	6.83444531024679e-07	141387458	141413352
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141406414	141446728	21	18	-0.4144	6.83444531024679e-07	141387458	141413352	1.32035141608096e-06	141435643	141462167
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141449014	147702365	2635	2523	-0.0042	1.32035141608096e-06	141435643	141462167	3.19650546446256e-14	147702365	147702365
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7701	3.19650546446256e-14	147702365	147702365	3.89764566475495e-13	147707161	147707161
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4079	-0.0125	3.89764566475495e-13	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	0.0198	NA	NA	NA	5.97787736318634e-17	581533	581533
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.9757	5.97787736318634e-17	581533	581533	1.41258885350195e-18	588865	588865
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12399	-0.0093	1.41258885350195e-18	588865	588865	9.08889459747277e-78	39341524	39354149
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.7339	9.08889459747277e-78	39341524	39354149	8.06379782884945e-77	39500219	39509423
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	145330767	31132	29772	-0.0045	8.06379782884945e-77	39500219	39509423	4.28907804486655e-07	145328970	145330767
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-1.2763	4.28907804486655e-07	145328970	145330767	1.62961896924117e-06	145334573	145336073
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	285	0.073	1.62961896924117e-06	145334573	145336073	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5219	-0.0111	NA	NA	NA	8.07490796665937e-67	15802255	15802255
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.5493	8.07490796665937e-67	15802255	15802255	4.1959965804203e-62	15807123	15807123
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	15813356	1	0	NA	4.1959965804203e-62	15807123	15807123	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	39048058	7265	6965	-0.0051	NA	NA	NA	1.45562325374909e-25	38758232	39146895
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	67903104	17	17	-0.7969	1.45562325374909e-25	38758232	39146895	2.03508571893810e-18	43445839	67910461
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67907649	70926188	329	316	-0.0486	2.0350857189381e-18	43445839	67910461	1.07204864490062e-19	70926188	70926188
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8876	1.07204864490062e-19	70926188	70926188	2.75840763552121e-16	70930528	70930528
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22733	-0.0093	2.75840763552121e-16	70930528	70930528	3.40958698968122e-20	137352394	137352394
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.0921	3.40958698968122e-20	137352394	137352394	2.56583383989797e-15	137356880	137356880
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1048	2e-04	2.56583383989797e-15	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	42900	-0.0061	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5742476	2139	2036	-0.003	NA	NA	NA	2.73329759456388e-15	5738494	5742476
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5763749	13	13	-0.7878	2.73329759456388e-15	5738494	5742476	8.50501898971665e-19	5763749	5766615
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	49671267	14567	13927	-0.0074	8.50501898971665e-19	5763749	5766615	1.69326819212675e-10	49666382	49671267
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	6	-0.8797	1.69326819212675e-10	49666382	49671267	2.25948414088044e-10	49710027	49721954
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55123719	179	172	-0.0643	2.25948414088044e-10	49710027	49721954	6.25358260584876e-18	55097753	55129329
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	0.3894	6.25358260584876e-18	55097753	55129329	6.17951900140045e-11	55200744	55231935
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4428	0.0227	6.17951900140045e-11	55200744	55231935	7.50015909495695e-20	66463477	66463477
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.1001	7.50015909495695e-20	66463477	66463477	8.8639543492427e-21	66469412	66469412
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22701	-0.0086	8.8639543492427e-21	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3597	0.0015	NA	NA	NA	4.61530790229484e-26	9516067	9528590
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	11	1.0274	4.61530790229484e-26	9516067	9528590	7.0528578202899e-28	9589725	9599999
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	11116883	575	543	-0.02	7.0528578202899e-28	9589725	9599999	1.55886448581355e-104	11116883	11116883
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-3.0683	1.55886448581355e-104	11116883	11116883	6.09640056086756e-114	11128557	11128557
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	6.09640056086756e-114	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	39033	0.0051	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	51294959	12807	12238	-0.007	NA	NA	NA	4.58157913469553e-08	51293672	51294959
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51296396	51300398	4	4	-0.9396	4.58157913469553e-08	51293672	51294959	2.75774519896845e-08	51300398	51301682
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	100690991	14269	13651	-0.0061	2.75774519896845e-08	51300398	51301682	6.77914488750712e-26	100690991	100690991
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.2724	6.77914488750712e-26	100690991	100690991	9.32917788833899e-24	100693892	100693892
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4360	-0.0276	9.32917788833899e-24	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	73061942	19419	18558	0.0037	NA	NA	NA	3.25270818556932e-33	73061942	73061942
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	8	-1.305	3.25270818556932e-33	73061942	73061942	2.34197673772398e-30	73101327	73104540
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	106358491	12457	11929	-7e-04	2.34197673772398e-30	73101327	73104540	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	96	-0.2538	NA	NA	NA	3.26265047200644e-10	19412049	19845942
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	3.26265047200644e-10	19412049	19845942	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	20316992	59	58	-0.631	NA	NA	NA	1.3629277842003e-53	20088256	20335887
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	20321772	1	0	NA	1.3629277842003e-53	20088256	20335887	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20330200	74115754	21305	20349	3e-04	NA	NA	NA	4.28681050096826e-10	74113558	74115754
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74127210	74133391	4	4	-1.0795	4.28681050096826e-10	74113558	74115754	3.21376305721375e-10	74133391	74137073
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	91933764	6847	6545	-0.0095	3.21376305721375e-10	74133391	74137073	2.31714926110512e-09	91922164	91937335
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91937335	91965744	8	8	-0.7358	2.31714926110512e-09	91922164	91937335	1.27958887529325e-09	91962960	91977797
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91968739	100298352	2998	2878	-0.0156	1.27958887529325e-09	91962960	91977797	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31854794	10571	10099	0.0173	NA	NA	NA	5.61452241496576e-27	31841022	32481309
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33842125	51	47	-0.5038	5.61452241496576e-27	31841022	32481309	4.19080035766743e-28	33559207	34056516
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33846647	75093957	9901	9460	0.0069	4.19080035766743e-28	33559207	34056516	3.22356016892246e-09	75089974	75093957
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0303	3.22356016892246e-09	75089974	75093957	2.81356394576372e-06	75100865	75102639
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4929	-0.0129	2.81356394576372e-06	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	0.0484	NA	NA	NA	2.48068669271196e-14	1028979	1028979
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.8582	2.48068669271196e-14	1028979	1028979	2.46193464625234e-14	1030766	1030766
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36672710	13451	12843	0.0249	2.46193464625234e-14	1030766	1030766	3.09347295318072e-07	36664609	36672710
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.739	3.09347295318072e-07	36664609	36672710	4.00800892515477e-07	36684619	36692052
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1931	0.0539	4.00800892515477e-07	36684619	36692052	1.42739672048914e-30	41512318	41527705
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	66	0.5108	1.42739672048914e-30	41512318	41527705	1.88697901825681e-33	41702238	42151941
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13077	0.0242	1.88697901825681e-33	41702238	42151941	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10542	-0.0078	NA	NA	NA	2.79177074990854e-90	36509250	36509250
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-4.2308	2.79177074990854e-90	36509250	36509250	1.38393853266746e-87	36519728	36519728
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	76116026	11980	11467	-0.0181	1.38393853266746e-87	36519728	36519728	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	470	0.0725	NA	NA	NA	4.61654035260881e-07	1395246	1398325
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.4807	4.61654035260881e-07	1395246	1398325	1.94317232722899e-10	1400840	1400840
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	63788698	22565	21533	0.0457	1.94317232722899e-10	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	-0.0167	NA	NA	NA	2.05929894119283e-57	1506379	1515948
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-1.8794	2.05929894119283e-57	1506379	1515948	2.35827346867381e-63	1525300	1531162
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20081	-0.0053	2.35827346867381e-63	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12846	-0.0066	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	395	0.0472	NA	NA	NA	4.67431057618722e-72	16521073	16521073
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-4.0219	4.67431057618722e-72	16521073	16521073	3.45348168548345e-66	16524408	16524408
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	21571489	2113	2028	0.0239	3.45348168548345e-66	16524408	16524408	8.0111495559463e-11	21571489	21571489
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.3869	8.0111495559463e-11	21571489	21571489	4.33644945955731e-11	21576859	21579649
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22644243	458	440	0.017	4.33644945955731e-11	21576859	21579649	1.27597969252934e-238	22644243	22677959
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22667608	1	0	NA	1.27597969252934e-238	22644243	22677959	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	-2.9515	NA	NA	NA	0	22721042	22725305
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6248	0.0068	0	22721042	22725305	6.62600645030961e-80	35472378	35472378
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.218	6.62600645030961e-80	35472378	35472378	1.65794457009810e-72	35476942	35476942
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36861482	785	753	0.0495	1.6579445700981e-72	35476942	35476942	2.23502729670168e-06	36856168	36869386
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36865292	36876540	7	7	-0.6515	2.23502729670168e-06	36856168	36869386	6.63404955640112e-07	36868339	36893322
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36877753	41220567	2259	2162	0.0481	6.63404955640112e-07	36868339	36893322	8.82647717762902e-09	41213175	41246992
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41279485	11	11	0.6746	8.82647717762902e-09	41213175	41246992	4.50471742970855e-09	41254513	41289552
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3771	0.006	4.50471742970855e-09	41254513	41289552	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	755	-0.0068	NA	NA	NA	6.37277573779115e-07	1427338	1431240
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	3	-1.0433	6.37277573779115e-07	1427338	1431240	4.37238196682082e-07	1431411	1434970
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2301365	608	570	0.0252	4.37238196682082e-07	1431411	1434970	1.00169153415299e-09	2300485	2302065
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.9884	1.00169153415299e-09	2300485	2302065	1.33796352106738e-12	2304398	2306110
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	369	-0.0156	1.33796352106738e-12	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43102	0.9368	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.0042	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-3.7372	NA	NA	NA	7.9907361202901e-21	3034907	3772482
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	7.9907361202901e-21	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.9443	NA	NA	NA	7.27512661056538e-11	5531459	6696721
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	164	-3.4661	7.27512661056538e-11	5531459	6696721	1.73188882557234e-08	7019523	7205930
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	121	-2.4262	1.73188882557234e-08	7019523	7205930	1.9861103004258e-06	7375948	7612732
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7723783	77	74	-3.5465	1.9861103004258e-06	7375948	7612732	1.57023845185038e-05	7707621	7726921
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.8142	1.57023845185038e-05	7707621	7726921	2.95943715867243e-07	7781968	7799614
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	407	-3.4633	2.95943715867243e-07	7781968	7799614	6.03307150069145e-17	10506718	10550419
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.1176	6.03307150069145e-17	10506718	10550419	4.02390835990604e-11	11673476	12452734
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12537944	10	10	-4.3142	4.02390835990604e-11	11673476	12452734	2.59420093922992e-06	12537944	12550566
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	13129843	191	183	-2.2719	2.59420093922992e-06	12537944	12550566	1.12400892477303e-39	13106723	13147329
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	386	-3.6108	1.12400892477303e-39	13106723	13147329	4.31629045760250e-12	14244120	14386474
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14700040	145	135	-2.7741	4.3162904576025e-12	14244120	14386474	6.18310715783811e-06	14585542	14708015
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14875973	42	39	-3.8741	6.18310715783811e-06	14585542	14708015	0.00284154115979722	14796505	15089058
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	15284717	129	123	-3.0863	0.00284154115979722	14796505	15089058	2.6900187005477e-05	15249591	15309005
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15389388	67	62	-3.9497	2.6900187005477e-05	15249591	15309005	0.000116704455077288	15363339	15426319
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15390599	15682936	118	116	-3.0984	0.000116704455077288	15363339	15426319	0.000227464013486239	15580942	15716500
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15915466	38	37	-4.0902	0.000227464013486239	15580942	15716500	1.40366874849469e-05	15867364	15975479
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	152	-2.9717	1.40366874849469e-05	15867364	15975479	5.83702270982907e-07	16195788	16677667
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22139807	938	893	-3.5773	5.83702270982907e-07	16195788	16677667	5.52665974855398e-05	22041876	22139807
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.6152	5.52665974855398e-05	22041876	22139807	3.41884866191797e-09	22177335	22181855
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	85	-3.9075	3.41884866191797e-09	22177335	22181855	2.07350263846405e-48	22924754	22930737
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0442	2.07350263846405e-48	22924754	22930737	3.58957154563119e-14	26945084	26950080
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.27	3.58957154563119e-14	26945084	26950080	6.9799047252262e-07	26965406	26984336
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	9	-0.9977	6.9799047252262e-07	26965406	26984336	2.01009346220238e-08	27009433	27019256
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.3818	2.01009346220238e-08	27009433	27019256	1.59847035620458e-09	27039222	27053237
MSK_252152915167_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.688	1.59847035620458e-09	27039222	27053237	NA	NA	NA
