Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	103932025	38026	35948	0.0095	NA	NA	NA	1.02970696826225e-20	103929627	103932025
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-1.1358	1.02970696826225e-20	103929627	103932025	1.5589476223272e-11	104012520	104012520
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	109373255	1285	1219	-0.0054	1.5589476223272e-11	104012520	104012520	7.179261269462e-06	109369942	109373255
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.0085	7.179261269462e-06	109369942	109373255	2.42517049077757e-05	109376249	109379566
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	256	0.0156	2.42517049077757e-05	109376249	109379566	3.14589492710827e-16	109987341	109987341
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.7782	3.14589492710827e-16	109987341	109987341	1.68137019147834e-17	109989998	109989998
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150823073	5867	5538	-0.0016	1.68137019147834e-17	109989998	109989998	5.57117110630095e-98	150823073	150836481
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	1.9583	5.57117110630095e-98	150823073	150836481	9.72499070571896e-84	150848509	150851439
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0542	9.72499070571896e-84	150848509	150851439	7.64437787847319e-11	151026228	151026228
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	1.2079	7.64437787847319e-11	151026228	151026228	7.3782506297444e-07	151032967	151033188
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	157133150	2681	2535	0.0224	7.3782506297444e-07	151032967	151033188	4.91359088773572e-17	157133150	157133150
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.8191	4.91359088773572e-17	157133150	157133150	4.92750370847208e-18	157136342	157136342
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1533	-0.0192	4.92750370847208e-18	157136342	157136342	4.64881747479604e-23	161099582	161099582
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-2.0254	4.64881747479604e-23	161099582	161099582	5.25944576395192e-24	161104791	161104791
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	185979586	9701	9207	-0.0128	5.25944576395192e-24	161104791	161104791	5.77060540654729e-13	185979586	185979586
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.5106	5.77060540654729e-13	185979586	185979586	4.99913160865908e-13	185988138	185988138
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200596027	4135	3875	0.0078	4.99913160865908e-13	185988138	185988138	3.2294417168409e-10	200571339	200620756
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200787319	39	35	-0.3164	3.2294417168409e-10	200571339	200620756	1.76102381827570e-09	200678532	200813827
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16564	-0.002	1.7610238182757e-09	200678532	200813827	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10288	-0.0057	NA	NA	NA	6.00639968663739e-07	33074522	33076512
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.1265	6.00639968663739e-07	33074522	33076512	1.82385484562822e-08	33080437	33081681
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	622	-0.0012	1.82385484562822e-08	33080437	33081681	0	34543992	34552935
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	0	34543992	34552935	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	17	-4.4798	NA	NA	NA	0	34583814	34589997
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37789939	1364	1289	-0.0258	0	34583814	34589997	2.13683865370698e-07	37769721	37818455
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37848754	24	24	-0.3605	2.13683865370698e-07	37769721	37818455	1.22020175775387e-08	37832778	37866455
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37852371	106244482	20982	19812	-4e-04	1.22020175775387e-08	37832778	37866455	1.29162256361034e-11	106240400	106244482
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106256521	4	4	-1.0098	1.29162256361034e-11	106240400	106244482	1.0541484214745e-11	106256521	106261767
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106261767	154601442	13367	12670	-0.0054	1.0541484214745e-11	106256521	106261767	2.55100354037249e-203	154601442	154601442
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-5.7456	2.55100354037249e-203	154601442	154601442	1.59673762517559e-203	154606943	154606943
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	180117780	9106	8619	-0.0088	1.59673762517559e-203	154606943	154606943	2.63699786236083e-12	180115198	180117780
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180127415	5	5	-0.9253	2.63699786236083e-12	180115198	180117780	3.53804859874204e-12	180127415	180131608
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180129680	180129680	1	0	NA	3.53804859874204e-12	180127415	180131608	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	242689978	21432	20245	-0.0045	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10214	-0.0149	NA	NA	NA	1.64576459053026e-14	32074432	32074432
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5441	1.64576459053026e-14	32074432	32074432	2.48971513480143e-13	32080848	32080848
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	75479859	16078	15267	-0.0042	2.48971513480143e-13	32080848	32080848	2.73219504397149e-16	75464737	75787094
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	17	0.5802	2.73219504397149e-16	75464737	75787094	2.85712396631306e-17	75868882	76006248
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	99891210	5289	5002	0.0025	2.85712396631306e-17	75868882	76006248	1.43556290768375e-132	99891210	99891210
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.578	1.43556290768375e-132	99891210	99891210	4.26054461278183e-126	99897201	99897201
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	101817141	646	607	-0.0274	4.26054461278183e-126	99897201	99897201	5.6436955652681e-30	101811219	101833461
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101818659	101928096	43	40	0.483	5.6436955652681e-30	101811219	101833461	3.83066501769241e-28	101925481	101939226
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101930007	133189686	10835	10201	-0.0088	3.83066501769241e-28	101925481	101939226	7.01761416942979e-11	133189686	133189686
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3837	7.01761416942979e-11	133189686	133189686	4.11048702529379e-11	133194685	133194685
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9278	-0.007	4.11048702529379e-11	133194685	133194685	5.10366733334753e-10	163977334	164023502
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164083826	22	19	-0.4375	5.10366733334753e-10	163977334	164023502	2.06982577561087e-10	164063626	164112873
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164086905	194354505	10136	9581	-0.0047	2.06982577561087e-10	164063626	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.1135	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	943	-0.0087	0	194366950	194366950	6.10648177178174e-11	196809098	196911010
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	18	-0.4702	6.10648177178174e-11	196809098	196911010	1.50994037291922e-11	196924340	196946355
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	907	0.024	1.50994037291922e-11	196924340	196946355	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	119334954	34745	32953	-0.0058	NA	NA	NA	9.21639066361052e-104	119334954	119334954
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	2	-4.1177	9.21639066361052e-104	119334954	119334954	1.94569379014252e-107	119348829	119348829
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173660684	15087	14288	-0.009	1.94569379014252e-107	119348829	119348829	5.67429479351137e-47	173660684	173660684
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.7386	5.67429479351137e-47	173660684	173660684	1.11940556964236e-48	173666072	173666072
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3859	-0.0042	1.11940556964236e-48	173666072	173666072	7.15495666932542e-174	187330240	187330240
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-5.1484	7.15495666932542e-174	187330240	187330240	1.99150735849476e-175	187333619	187333619
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1169	0.0044	1.99150735849476e-175	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	119987696	33321	31478	-0.0106	NA	NA	NA	2.56226700945253e-17	119986471	119987696
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	119989655	119989655	1	0	NA	2.56226700945253e-17	119986471	119987696	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	119991810	120002994	6	6	-0.989	NA	NA	NA	2.78558025564081e-16	120002994	120005250
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120005250	180346557	20320	19225	-3e-04	2.78558025564081e-16	120002994	120005250	8.10007069195402e-316	180346557	180346557
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	5	-4.6542	8.10007069195402e-316	180346557	180346557	7.64285062549258e-249	180358977	180358977
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	104	5e-04	7.64285062549258e-249	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	18371831	6538	6148	-0.0011	NA	NA	NA	6.11061812141167e-09	18368026	18371831
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.0025	6.11061812141167e-09	18368026	18371831	6.09628613710899e-10	18378787	18380299
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	22661835	1296	1230	-0.0135	6.09628613710899e-10	18378787	18380299	1.06532356977932e-16	22661835	22661835
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	22664996	22672338	4	4	-1.1431	1.06532356977932e-16	22661835	22661835	1.18114868157559e-14	22672338	22674196
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	22674196	32558677	3836	3636	0.0078	1.18114868157559e-14	22672338	22674196	4.36246436660921e-170	32558677	32564884
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	-1.9664	4.36246436660921e-170	32558677	32564884	4.96939384356368e-185	32628420	32633691
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	79011979	14728	13965	0.0025	4.96939384356368e-185	32628420	32633691	1.47299855353430e-11	78990768	79015901
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	14	0.5417	1.4729985535343e-11	78990768	79015901	2.80714770297622e-12	79079988	79105311
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	79095415	1	0	NA	2.80714770297622e-12	79079988	79105311	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	160101056	25924	24536	-0.0049	NA	NA	NA	3.81930640232396e-08	160099132	160101056
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160102719	160104075	2	2	1.1948	3.81930640232396e-08	160099132	160101056	5.13556915826454e-09	160104075	160104075
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160106791	160106791	1	0	NA	5.13556915826454e-09	160104075	160104075	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	160108305	165643653	1944	1840	-0.0338	NA	NA	NA	1.79854269743162e-294	165643653	165643653
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.8718	1.79854269743162e-294	165643653	165643653	2.454548988973e-272	165650610	165650610
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170738014	1802	1720	-0.0299	2.454548988973e-272	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170748606	170753106	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	64353539	19499	18463	-0.0033	NA	NA	NA	2.94021702329599e-13	64350416	64353539
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64357426	64358351	2	2	-1.0654	2.94021702329599e-13	64350416	64353539	1.05994271510045e-07	64358351	64364689
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64364689	118611324	19764	18688	0.0035	1.05994271510045e-07	64358351	64364689	4.56916110417857e-164	118611324	118611324
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.2659	4.56916110417857e-164	118611324	118611324	3.13095421174771e-163	118620875	118620875
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3001	-0.0056	3.13095421174771e-163	118620875	118620875	1.42770135738991e-77	125831554	125831554
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125836353	2	2	-3.6097	1.42770135738991e-77	125831554	125831554	3.15778220156587e-71	125836353	125836353
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125837524	125837524	1	0	NA	3.15778220156587e-71	125836353	125836353	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3437	-0.0055	NA	NA	NA	1.81708841367245e-11	133426938	133433384
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7333	1.81708841367245e-11	133426938	133433384	2.32870966104042e-12	133448277	133455682
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141414719	3702	3487	0.0054	2.32870966104042e-12	133448277	133455682	4.93013950710242e-08	141406414	141429405
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141417702	141442231	13	13	-0.4618	4.93013950710242e-08	141406414	141429405	8.53795903079577e-07	141431668	141452085
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141443577	141690753	115	108	0.013	8.53795903079577e-07	141431668	141452085	9.75714303519563e-16	141687978	141690753
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	0.8089	9.75714303519563e-16	141687978	141690753	5.55362811384656e-16	141714168	141720303
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6409	-0.0094	5.55362811384656e-16	141714168	141720303	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	112	-0.0079	NA	NA	NA	1.34493643704215e-50	581533	581533
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.7737	1.34493643704215e-50	581533	581533	4.52205191042928e-45	588865	588865
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12203	-0.0069	4.52205191042928e-45	588865	588865	0	39350798	39352361
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39418739	23	21	-3.4239	0	39350798	39352361	9.4518811789729e-05	39379539	39427807
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39420136	39488281	28	27	-4.7054	9.4518811789729e-05	39379539	39427807	4.85545268632215e-06	39475979	39488281
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39490826	39505256	8	7	-2.9438	4.85545268632215e-06	39475979	39488281	5.4337202438771e-195	39505256	39505256
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	426	6e-04	5.4337202438771e-195	39505256	39505256	2.00376151755320e-14	40892587	40892587
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-1.4755	2.0037615175532e-14	40892587	40892587	2.65501661703723e-12	40897469	40897469
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29263	-0.0053	2.65501661703723e-12	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	719	-0.0027	NA	NA	NA	4.20383871951682e-08	2133384	2135333
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.1532	4.20383871951682e-08	2133384	2135333	6.61198640530288e-08	2139868	2143843
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	15801123	4695	4417	-0.0073	6.61198640530288e-08	2139868	2143843	3.25286637453718e-87	15801123	15801123
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15802255	15802255	1	0	NA	3.25286637453718e-87	15801123	15801123	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.6874	NA	NA	NA	4.0893329930405e-80	15807123	15807123
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	19364447	1241	1177	-0.0086	4.0893329930405e-80	15807123	15807123	2.89623309663108e-39	19358483	19367239
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	19365634	19460403	44	41	0.5692	2.89623309663108e-39	19358483	19367239	2.82897860639828e-40	19452468	19464896
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	19462535	70926188	6327	5941	-0.0048	2.82897860639828e-40	19452468	19464896	3.80926860753089e-19	70926188	70926188
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7987	3.80926860753089e-19	70926188	70926188	2.62641501744428e-18	70930528	70930528
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22534	-0.0073	2.62641501744428e-18	70930528	70930528	1.64368532036220e-42	137352394	137352394
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.7077	1.6436853203622e-42	137352394	137352394	3.04234863755478e-32	137356880	137356880
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1026	0.0116	3.04234863755478e-32	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9240	-0.0063	NA	NA	NA	4.09310593950461e-12	27038538	27038538
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.4433	4.09310593950461e-12	27038538	27038538	2.73445899637235e-12	27041812	27041812
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	27043861	1	0	NA	2.73445899637235e-12	27041812	27041812	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27045226	69834520	11410	10778	-0.0073	NA	NA	NA	1.07219300323171e-09	69834520	69837432
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69835856	69835856	1	0	NA	1.07219300323171e-09	69834520	69837432	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	3	1.0535	NA	NA	NA	1.84370001971322e-08	69839583	69843195
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	77917870	3445	3249	0.0082	1.84370001971322e-08	69839583	69843195	2.57474126101527e-06	77911504	77917870
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77928738	4	4	0.7965	2.57474126101527e-06	77911504	77917870	1.30631356381502e-06	77928738	77936034
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	82866553	1494	1427	-0.0066	1.30631356381502e-06	77928738	77936034	7.92833137871871e-09	82857476	82866553
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82881204	6	5	-0.8299	7.92833137871871e-09	82857476	82866553	6.75613367001094e-09	82881204	82885457
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	135285645	18713	17682	-0.0052	6.75613367001094e-09	82881204	82885457	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1689	0.0031	NA	NA	NA	5.79882025013713e-292	4923300	4923300
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.7001	5.79882025013713e-292	4923300	4923300	8.60799783171487e-292	4932214	4932214
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	340	-0.012	8.60799783171487e-292	4932214	4932214	5.0219333060032e-23	5734978	5741031
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7826	5.0219333060032e-23	5734978	5741031	4.14737332363523e-26	5765438	5766615
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	48340988	14364	13553	-0.006	4.14737332363523e-26	5765438	5766615	1.22679326430328e-68	48335032	48345272
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48343333	48612062	44	42	-0.7527	1.22679326430328e-68	48335032	48345272	5.7439223080707e-56	48583374	48621072
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48621072	55127355	347	332	-0.0398	5.7439223080707e-56	48583374	48621072	2.00003077086836e-21	55112618	55131703
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55129329	55209626	36	34	0.4359	2.00003077086836e-21	55112618	55131703	3.84456367939058e-16	55205278	55225136
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4368	0.0164	3.84456367939058e-16	55205278	55225136	1.39741558158289e-39	66463477	66463477
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.6549	1.39741558158289e-39	66463477	66463477	1.44594980660535e-42	66469412	66469412
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	107155002	13586	12858	-0.0074	1.44594980660535e-42	66469412	66469412	2.07169387273257e-11	107151582	107160270
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107157031	107157031	1	0	NA	2.07169387273257e-11	107151582	107160270	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107160270	107176389	8	8	0.6949	NA	NA	NA	4.46243139384634e-11	107174600	107180273
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107177546	107177546	1	0	NA	4.46243139384634e-11	107174600	107180273	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	134450318	10124	9596	-0.0049	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	9523923	3741	3561	0.0069	NA	NA	NA	3.33508304344403e-44	9516067	9531133
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	14	1.0718	3.33508304344403e-44	9516067	9531133	7.45698909125218e-47	9607363	9626623
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	542	-0.0214	7.45698909125218e-47	9607363	9626623	1.54155754241768e-15	11112600	11116883
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11121204	1	0	NA	1.54155754241768e-15	11112600	11116883	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11140421	6	6	0.9263	NA	NA	NA	7.44559485837399e-14	11140421	11143592
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	12422129	466	440	0.0037	7.44559485837399e-14	11140421	11143592	6.97475610669409e-185	12422129	12422129
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	5	-3.8365	6.97475610669409e-185	12422129	12422129	1.15812200299904e-225	12433043	12433043
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	31132762	6348	6032	-0.0068	1.15812200299904e-225	12433043	12433043	8.62452492045427e-40	31084265	31171313
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31296973	42	42	0.5512	8.62452492045427e-40	31084265	31171313	2.21012512771542e-36	31295667	31303495
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31298659	31298659	1	0	NA	2.21012512771542e-36	31295667	31303495	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	132289090	33963	32046	0.0055	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	29059780	4075	3859	-0.013	NA	NA	NA	4.60409438740046e-08	29058752	29063854
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29061544	29066721	4	4	0.8428	4.60409438740046e-08	29058752	29063854	2.09865945143170e-08	29063854	29068496
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29068496	37953582	3259	3083	-0.0109	2.0986594514317e-08	29063854	29068496	3.92646921409924e-33	37953582	37953582
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.3236	3.92646921409924e-33	37953582	37953582	7.3686510569932e-34	37957844	37957844
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	114118270	24303	22958	-0.0081	7.3686510569932e-34	37957844	37957844	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	54	-0.6756	NA	NA	NA	5.24123462204323e-72	19489920	19535787
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	105597555	31582	29829	0	5.24123462204323e-72	19489920	19535787	1.37791971056597e-195	105597555	105597555
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105630089	11	9	-2.7167	1.37791971056597e-195	105597555	105597555	1.94363955179979e-114	105630089	105630089
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105632168	105632168	1	0	NA	1.94363955179979e-114	105630089	105630089	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	209	0.0187	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0976	NA	NA	NA	1.61374994165356e-13	18692865	18741716
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20088256	150	146	-1.1042	1.61374994165356e-13	18692865	18741716	4.07974300430505e-257	20079935	20088256
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	22138119	326	308	-0.0328	4.07974300430505e-257	20079935	20088256	9.31694734672249e-12	22138119	22138119
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22219332	22250971	3	3	1.1775	9.31694734672249e-12	22138119	22138119	3.5893570686309e-11	22250971	22351404
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	74669752	21226	20037	-7e-04	3.5893570686309e-11	22250971	22351404	8.55397800115134e-10	74664249	74669752
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.9598	8.55397800115134e-10	74664249	74669752	4.07712472247809e-10	74680439	74696127
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9093	-0.0095	4.07712472247809e-10	74680439	74696127	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33445329	10599	10036	0.0187	NA	NA	NA	1.78036338450470e-09	32532079	33505210
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33469289	33536526	17	17	0.3322	1.7803633845047e-09	32532079	33505210	3.2436220460707e-07	33527454	33868686
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	33538171	1	0	NA	3.2436220460707e-07	33527454	33868686	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	34325501	91	84	-0.0326	NA	NA	NA	1.11544728236531e-64	34317157	34333833
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34329518	34602318	51	50	0.7843	1.11544728236531e-64	34317157	34333833	7.49583666536378e-87	34588639	34617260
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9204	0.0084	7.49583666536378e-87	34588639	34617260	1.09704384333663e-08	75092501	75093957
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.9904	1.09704384333663e-08	75092501	75093957	1.30550349176799e-08	75100865	75102639
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	579	-0.0226	1.30550349176799e-08	75100865	75102639	1.22726061987018e-17	76923844	76929598
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8614	1.22726061987018e-17	76923844	76929598	1.61688036964784e-14	76938723	76942679
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4290	-0.0035	1.61688036964784e-14	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	391	0.038	NA	NA	NA	9.50969276897613e-17	1028979	1028979
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7823	9.50969276897613e-17	1028979	1028979	1.29525766199218e-16	1030766	1030766
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11346	0.0184	1.29525766199218e-16	1030766	1030766	4.8179620485037e-121	32828797	32828797
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.6516	4.8179620485037e-121	32828797	32828797	3.11533119740214e-115	32832642	32832642
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	34442393	480	459	0.0419	3.11533119740214e-115	32832642	32832642	3.79636620186626e-09	34442393	34442393
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34445816	34446608	2	2	-1.2957	3.79636620186626e-09	34442393	34442393	3.27713615524621e-09	34446608	34446608
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34451067	36673853	966	910	0.0322	3.27713615524621e-09	34446608	34446608	3.16767585612383e-10	36672710	36673853
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.8405	3.16767585612383e-10	36672710	36673853	8.10321761893929e-10	36684619	36687917
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1912	0.0405	8.10321761893929e-10	36684619	36687917	3.7485739170892e-17	41555295	41579322
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41708551	45	43	0.4375	3.7485739170892e-17	41555295	41579322	1.20709403041275e-19	41647135	42153189
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	1.20709403041275e-19	41647135	42153189	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12860	0.0217	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21720	-0.0119	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	464	0.0548	NA	NA	NA	7.93833563257936e-10	1398325	1398325
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5268	7.93833563257936e-10	1398325	1398325	1.55876051781882e-10	1400840	1400840
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	59414898	20561	19410	0.0387	1.55876051781882e-10	1400840	1400840	6.95042419685715e-12	59412581	59421197
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.665	6.95042419685715e-12	59412581	59421197	7.50702775898484e-11	59434159	59440262
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	20	-0.1297	7.50702775898484e-11	59434159	59440262	0.00251595001060461	59487170	59502178
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59504796	6	6	-0.5583	0.00251595001060461	59487170	59502178	0.000181766796172590	59502178	59512768
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59505797	59505797	1	0	NA	0.00018176679617259	59502178	59512768	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59507350	63788698	1965	1867	0.0195	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	553	-0.0057	NA	NA	NA	1.49069380726828e-75	1506379	1523000
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-2.2113	1.49069380726828e-75	1506379	1523000	2.82863727292020e-95	1515948	1531162
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62382266	20983	19808	-0.005	2.8286372729202e-95	1515948	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62419534	62419534	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12708	-0.0047	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	49533056	16553	15630	0.0166	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49565816	49571068	3	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	744	0.0269	NA	NA	NA	5.57850923756039e-07	1427338	1427392
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	3	-0.8937	5.57850923756039e-07	1427338	1427392	8.53609507098007e-07	1432953	1434970
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	577	0.0298	8.53609507098007e-07	1432953	1434970	1.38795412700012e-09	2301365	2302065
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9779	1.38795412700012e-09	2301365	2302065	3.72349671117255e-10	2304398	2306110
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	368	-0.0218	3.72349671117255e-10	2304398	2306110	0	2708113	2712641
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2711273	1	0	NA	0	2708113	2712641	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	154582414	45133	42697	0.9215	NA	NA	NA	0	154578922	154586690
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888033	200	187	-0.0156	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	114	-4.0667	NA	NA	NA	1.71756003484219e-11	3733715	4174561
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	10	-1.0123	1.71756003484219e-11	3733715	4174561	2.1073489161437e-09	5593746	6692482
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6955902	120	115	-3.79	2.1073489161437e-09	5593746	6692482	4.36091009305901e-07	6922654	7016814
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7653082	214	200	-2.8767	4.36091009305901e-07	6922654	7016814	8.57329480401268e-08	7619927	7665429
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	42	-4.2839	8.57329480401268e-08	7619927	7665429	7.73268995113085e-10	7714929	7726921
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.8911	7.73268995113085e-10	7714929	7726921	6.5324498065493e-08	7781968	7806091
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	393	-3.7331	6.5324498065493e-08	7781968	7806091	1.8211902948931e-21	10511255	10515697
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.4357	1.8211902948931e-21	10511255	10515697	0.0507476630968113	10622062	11660512
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-1.9578	0.0507476630968113	10622062	11660512	0.000548878341856666	11249952	12502304
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	0.000548878341856666	11249952	12502304	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.4662	NA	NA	NA	9.5186849156115e-07	12537944	12554612
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.2084	9.5186849156115e-07	12537944	12554612	0.000294739079774325	12627138	12730281
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	19	-3.6984	0.000294739079774325	12627138	12730281	0.000123085461998664	12772155	12872417
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	108	-2.3333	0.000123085461998664	12772155	12872417	8.2945508121603e-40	13111594	13140274
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	382	-3.9491	8.2945508121603e-40	13111594	13140274	5.4057697703409e-11	14262916	14382361
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	92	-3.0392	5.4057697703409e-11	14262916	14382361	0.000124146664677625	14489801	14546195
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	24	-1.7465	0.000124146664677625	14489801	14546195	0.0210128019644819	14550971	14685149
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14700040	23	22	-3.1432	0.0210128019644819	14550971	14685149	0.182382990317043	14585542	15141311
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15915466	394	381	-3.6311	0.182382990317043	14585542	15141311	0.00126445981706423	15559959	16066990
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16198927	118	112	-3.0705	0.00126445981706423	15559959	16066990	1.88587330364204e-09	16162358	16247995
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16199764	16199764	1	0	NA	1.88587330364204e-09	16162358	16247995	NA	NA	NA
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16200557	17482749	216	201	-4.0104	NA	NA	NA	1.41527487370573e-06	17429989	17492482
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17557953	13	13	-2.2325	1.41527487370573e-06	17429989	17492482	7.71876248231097e-05	17533546	17631818
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036503	485	456	-3.8393	7.71876248231097e-05	17533546	17631818	6.92798809167654e-06	21028489	21042490
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.2476	6.92798809167654e-06	21028489	21042490	1.65502815542579e-06	21047798	21059229
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21687813	163	157	-3.859	1.65502815542579e-06	21047798	21059229	0.00227270315539352	21559551	21691199
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21689031	21761022	13	12	-2.5262	0.00227270315539352	21559551	21691199	1.34956510647851e-06	21755980	21787852
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	78	-4.1081	1.34956510647851e-06	21755980	21787852	8.60076663253943e-11	22055660	22139807
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8011	8.60076663253943e-11	22055660	22139807	3.1089870009018e-17	22177335	22178964
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	83	-4.2962	3.1089870009018e-17	22177335	22178964	2.35320442256950e-89	22926726	22930737
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0887	2.3532044225695e-89	22926726	22930737	3.66822818145708e-05	26943701	26998633
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	18	-2.4436	3.66822818145708e-05	26943701	26998633	8.64081028299449e-06	27006628	27067889
MSK_252152915168_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-0.5604	8.6408102829945e-06	27006628	27067889	NA	NA	NA
