Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26250	0.0079	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	-4.2621	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103899771	10103	9557	-0.008	0	72579311	72579311	5.74720724978015e-18	103895306	103904723
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103901454	104012520	18	18	0.5184	5.74720724978015e-18	103895306	103904723	1.8132127200669e-17	103956767	104116989
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	146274661	6134	5781	-0.0045	1.8132127200669e-17	103956767	104116989	1.36999568565670e-13	146245733	146294654
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146279228	147510532	43	38	0.3148	1.3699956856567e-13	146245733	146294654	7.92742547783219e-13	147490553	148088434
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1195	0.0073	7.92742547783219e-13	147490553	148088434	2.77231993198299e-112	150819879	150823073
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.7719	2.77231993198299e-112	150819879	150823073	5.03486250110161e-74	150848509	150851439
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0074	5.03486250110161e-74	150848509	150851439	1.24033181706166e-148	151026228	151026228
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	-4.0503	1.24033181706166e-148	151026228	151026228	0	151032967	151032967
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	151036435	2	2	-5.901	0	151032967	151032967	7.76462810628414e-246	151036435	151036435
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157128689	2678	2528	0.0126	7.76462810628414e-246	151036435	151036435	1.29106436830350e-17	157128689	157128689
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157133150	1	0	NA	1.2910643683035e-17	157128689	157128689	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.6212	NA	NA	NA	5.99014100439438e-19	157136342	157136342
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200609726	15466	14632	-0.0093	5.99014100439438e-19	157136342	157136342	2.96230774033634e-12	200584100	200620756
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200787319	35	34	-0.3313	2.96230774033634e-12	200584100	200620756	1.42712358889146e-12	200683992	200810641
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16457	-0.0033	1.42712358889146e-12	200683992	200810641	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	28837963	9060	8534	9e-04	NA	NA	NA	4.50264575254498e-08	28834930	28840904
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28840904	28845065	3	3	0.8878	4.50264575254498e-08	28834930	28840904	9.93070698038766e-08	28844400	28849577
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28849577	33076512	1813	1703	-0.0037	9.93070698038766e-08	28844400	28849577	1.24722593948173e-08	33074522	33076512
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.1447	1.24722593948173e-08	33074522	33076512	3.17745592308839e-09	33080437	33080437
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	52600588	7854	7382	-0.0061	3.17745592308839e-09	33080437	33080437	7.37671543125856e-210	52600588	52600588
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	7.37671543125856e-210	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52622353	3	3	-4.3434	NA	NA	NA	1.26231587379035e-216	52622353	52622353
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52635695	52635695	1	0	NA	1.26231587379035e-216	52622353	52622353	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	89377705	11572	10925	-0.005	NA	NA	NA	3.75812493274088e-35	89289123	89379689
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89379689	89730278	27	27	-0.5742	3.75812493274088e-35	89289123	89379689	1.60206607234167e-07	89716517	89745998
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89742890	89877995	16	16	-1.0076	1.60206607234167e-07	89716517	89745998	0.000431767896981626	89871269	89890854
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89879264	91131762	8	8	-0.492	0.000431767896981626	89871269	89890854	3.36518703455177e-07	89902365	91151411
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91133575	106244482	3550	3377	-0.0108	3.36518703455177e-07	89902365	91151411	8.6240432069714e-27	106244482	106244482
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.9307	8.6240432069714e-27	106244482	106244482	9.27638561120073e-27	106250718	106250718
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	242689978	43915	41397	-0.006	9.27638561120073e-27	106250718	106250718	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10192	-0.0094	NA	NA	NA	5.06566140724626e-19	32074432	32074432
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5946	5.06566140724626e-19	32074432	32074432	5.63168586996445e-17	32080848	32080848
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	53001678	7864	7417	0.0107	5.63168586996445e-17	32080848	32080848	0	53001678	53001678
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-4.6284	0	53001678	53001678	0	53011885	53011885
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	132926900	24924	23547	-0.0109	0	53011885	53011885	1.88214963302139e-11	132924193	132926900
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	132928512	132932564	4	4	-0.9194	1.88214963302139e-11	132924193	132926900	1.70720064834859e-16	132932564	132932564
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	132933753	133189686	114	107	0.0428	1.70720064834859e-16	132932564	132932564	3.61886743082948e-17	133189686	133189686
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4283	3.61886743082948e-17	133189686	133189686	1.11969797055162e-14	133194685	133194685
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9270	-0.0075	1.11969797055162e-14	133194685	133194685	1.21147198908399e-166	164005577	164005577
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.9879	1.21147198908399e-166	164005577	164005577	1.07738041375210e-56	164027724	164027724
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164115417	22	22	0.4948	1.0773804137521e-56	164027724	164027724	1.36571721713652e-20	164112873	164126256
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164121847	194354505	10128	9578	-0.0096	1.36571721713652e-20	164112873	164126256	0	194354505	194354505
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	0	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	-4.8776	NA	NA	NA	0	194366950	194366950
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1879	-5e-04	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173224400	49640	46780	-0.0076	NA	NA	NA	7.5867699785264e-27	173224400	173224400
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.9112	7.5867699785264e-27	173224400	173224400	6.87953409009778e-33	173228860	173228860
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	187	-9e-04	6.87953409009778e-33	173228860	173228860	2.92802789975785e-105	173660684	173660684
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.4847	2.92802789975785e-105	173660684	173660684	2.87720759077385e-93	173666072	173666072
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	190772330	5226	4949	-0.0061	2.87720759077385e-93	173666072	173666072	2.28545803725826e-23	190754887	190792612
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190910126	49	47	-0.3708	2.28545803725826e-23	190754887	190792612	4.65524265421464e-07	190888913	190950585
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190913517	190913517	1	0	NA	4.65524265421464e-07	190888913	190950585	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190915643	191153613	48	43	-0.0284	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	127434789	35318	33255	-0.0092	NA	NA	NA	1.01889664218927e-178	127434789	127434789
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-4.8273	1.01889664218927e-178	127434789	127434789	1.26174064826288e-164	127438118	127438118
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	140533456	4904	4625	0.0031	1.26174064826288e-164	127438118	127438118	1.99341433567325e-10	140533456	140533456
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.247	1.99341433567325e-10	140533456	140533456	2.40831241448465e-10	140538666	140538666
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	150155049	3621	3434	-0.0084	2.40831241448465e-10	140538666	140538666	2.42093369896576e-17	150151948	150161037
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150156233	150156233	1	0	NA	2.42093369896576e-17	150151948	150161037	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150202601	13	10	-0.7198	NA	NA	NA	4.04493881468028e-18	150199780	150207307
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9163	0.0023	4.04493881468028e-18	150199780	150207307	1.40795210769795e-11	180194323	180346557
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6543	1.40795210769795e-11	180194323	180346557	3.173165966322e-09	180355807	180364670
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	0.0277	3.173165966322e-09	180355807	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	0.0136	NA	NA	NA	1.31754598140538e-14	198124	210326
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	241674	17	17	-0.5973	1.31754598140538e-14	198124	210326	3.46503643725938e-22	236535	246974
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	32564884	11622	10951	-0.0014	3.46503643725938e-22	236535	246974	3.05645096370462e-38	32564884	32564884
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32600962	7	4	-1.6008	3.05645096370462e-38	32564884	32564884	3.43417580477191e-22	32600962	32600962
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32626619	4	4	0.4921	3.43417580477191e-22	32600962	32600962	0.0210079861194982	32626619	32682366
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	32739800	46	43	-0.4007	0.0210079861194982	32626619	32682366	2.42861997481808e-23	32700719	32756637
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	54035000	8253	7772	-7e-04	2.42861997481808e-23	32700719	32756637	3.20536152938079e-157	54035000	54035000
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.8292	3.20536152938079e-157	54035000	54035000	4.09895900656888e-168	54042734	54042734
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79015901	6431	6070	-0.0048	4.09895900656888e-168	54042734	54042734	1.36510096258337e-12	79005118	79024557
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79018959	79018959	1	0	NA	1.36510096258337e-12	79005118	79024557	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.5107	NA	NA	NA	2.39243774181014e-12	79085247	79105311
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26306	-0.0086	2.39243774181014e-12	79085247	79105311	6.05763558909846e-18	165643653	165643653
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1066	6.05763558909846e-18	165643653	165643653	1.25988519861825e-16	165650610	165650610
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1708	1e-04	1.25988519861825e-16	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	250	0.0253	NA	NA	NA	1.82992266942742e-09	1036135	1036135
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.1357	1.82992266942742e-09	1036135	1036135	0	1038517	1038517
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.0502	0	1038517	1038517	5.81370767453305e-10	1047707	1049599
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	14261787	4396	4145	0.0122	5.81370767453305e-10	1047707	1049599	1.98245385232593e-11	14261787	14263414
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14263414	14266755	3	3	-1.036	1.98245385232593e-11	14261787	14263414	4.22745097006027e-12	14265179	14266755
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14268336	18244187	1478	1400	-0.0148	4.22745097006027e-12	14265179	14266755	1.71676306973503e-09	18244187	18244187
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18248366	18251736	2	2	-1.121	1.71676306973503e-09	18244187	18244187	3.18867397082829e-08	18251736	18260638
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18260638	118611324	33124	31282	-0.0044	3.18867397082829e-08	18251736	18260638	3.96853495532624e-218	118611324	118611324
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.4434	3.96853495532624e-218	118611324	118611324	9.35111130063662e-210	118620875	118620875
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6421	-0.0051	9.35111130063662e-210	118620875	118620875	1.60707115534179e-16	133426938	133433384
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7724	1.60707115534179e-16	133426938	133433384	1.57387334343169e-17	133448277	133453811
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3505	0.0053	1.57387334343169e-17	133448277	133453811	1.54021147256043e-14	141408013	141413352
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.578	1.54021147256043e-14	141408013	141413352	1.68122141956990e-13	141435643	141443577
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141440184	1	0	NA	1.6812214195699e-13	141435643	141443577	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2494	-3e-04	NA	NA	NA	4.65284614178456e-19	147702365	147704200
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	4	-1.1865	4.65284614178456e-19	147702365	147704200	2.51944974361529e-19	147708382	147710037
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	158821263	4236	4015	0.0057	2.51944974361529e-19	147708382	147710037	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	701	0.0254	NA	NA	NA	8.30826166031119e-09	2231804	2243659
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2261571	6	5	-0.724	8.30826166031119e-09	2231804	2243659	1.26652358664225e-09	2251011	2265853
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2265853	10012087	2367	2231	0.0036	1.26652358664225e-09	2251011	2265853	3.39618161368132e-12	10012087	10012087
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10013994	10017348	3	2	-1.2822	3.39618161368132e-12	10012087	10012087	1.65163982055228e-11	10017348	10017348
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10019015	10019015	1	0	NA	1.65163982055228e-11	10017348	10017348	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10020724	85422157	22124	20887	-0.0077	NA	NA	NA	0	85422157	85422157
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-5.1246	0	85422157	85422157	0	85431319	85431319
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	146264846	19323	18187	-0.0044	0	85431319	85431319	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5160	-3e-04	NA	NA	NA	6.38648611816119e-13	15802255	15802255
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.3131	6.38648611816119e-13	15802255	15802255	1.39866622945944e-12	15807123	15807123
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2401	-0.0173	1.39866622945944e-12	15807123	15807123	2.81117427284696e-129	23343915	23343915
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.428	2.81117427284696e-129	23343915	23343915	1.844452541528e-128	23365926	23365926
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39146895	4728	4432	-9e-04	1.844452541528e-128	23365926	23365926	1.93027498167469e-08	39091349	43626920
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	44199401	7	7	0.5944	1.93027498167469e-08	39091349	43626920	1.54603504693641e-09	43626920	47002187
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	45359327	70926188	334	312	-0.0309	1.54603504693641e-09	43626920	47002187	2.05276909841680e-18	70926188	70926188
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.7246	2.0527690984168e-18	70926188	70926188	7.2837667437496e-21	70930528	70930528
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	93434678	7285	6896	-0.0168	7.2837667437496e-21	70930528	70930528	2.82767986580846e-09	93432783	93434678
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	3	-0.9607	2.82767986580846e-09	93432783	93434678	5.89709288172401e-09	93439862	93445852
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	93443960	1	0	NA	5.89709288172401e-09	93439862	93445852	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93445852	140145683	17581	16544	-0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9167	-0.0069	NA	NA	NA	1.27907285326130e-165	27038538	27038538
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.7125	1.2790728532613e-165	27038538	27038538	1.58917829245916e-158	27041812	27041812
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	135285645	35077	33123	-0.0046	1.58917829245916e-158	27041812	27041812	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1667	0.0107	NA	NA	NA	1.0787115658933e-308	4923300	4923300
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.3914	1.0787115658933e-308	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55124730	15130	14239	-0.0046	0	4932214	4932214	1.38897967812804e-21	55112618	55127355
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55209626	37	34	0.4218	1.38897967812804e-21	55112618	55127355	4.16107197203464e-20	55205278	55225136
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4363	0.0137	4.16107197203464e-20	55205278	55225136	1.41107735469767e-45	66463477	66463477
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.4928	1.41107735469767e-45	66463477	66463477	1.88880036310525e-45	66469412	66469412
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22373	-0.0043	1.88880036310525e-45	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	282	0.0542	NA	NA	NA	2.91738931370872e-13	734832	736988
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.9168	2.91738931370872e-13	734832	736988	1.37355005676375e-11	743223	745410
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3262	0.0091	1.37355005676375e-11	743223	745410	3.81625717257267e-257	9523923	9523923
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.8103	3.81625717257267e-257	9523923	9523923	3.35343051401124e-267	9554149	9554149
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	31171313	7410	6964	-0.0079	3.35343051401124e-267	9554149	9554149	6.75643684786238e-33	31132716	31177645
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31173065	31298659	41	40	0.469	6.75643684786238e-33	31132716	31177645	5.5424574746888e-29	31295667	31303495
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	33184017	724	688	0.0048	5.5424574746888e-29	31295667	31303495	2.38676049488774e-232	33184017	33184017
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-5.6818	2.38676049488774e-232	33184017	33184017	7.54732205550736e-237	33198331	33198331
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	81689864	15654	14780	-0.0027	7.54732205550736e-237	33198331	33198331	7.01970012699169e-64	81687455	81693972
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	81693972	81736503	24	23	-0.8778	7.01970012699169e-64	81687455	81693972	3.49070016670766e-64	81733675	81739219
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	81739219	132289090	17559	16553	0.0018	3.49070016670766e-64	81733675	81739219	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6942	-0.01	NA	NA	NA	1.66786299418711e-98	37953582	37953582
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.6677	1.66786299418711e-98	37953582	37953582	4.43473284230692e-104	37957844	37957844
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4610	-0.01	4.43473284230692e-104	37957844	37957844	1.06197084092215e-62	49964838	49964838
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.8707	1.06197084092215e-62	49964838	49964838	1.16983995639610e-61	49971732	49971732
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	113788788	19271	18139	-0.0074	1.1698399563961e-61	49971732	49971732	8.77462578812824e-10	113786144	113788788
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	-0.9723	8.77462578812824e-10	113786144	113788788	3.93729527630453e-10	113794669	113797828
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	136	0.0255	3.93729527630453e-10	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105946993	31725	29921	-0.0035	NA	NA	NA	3.2300782649574e-21	105923686	105946993
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106002179	18	17	-0.6005	3.2300782649574e-21	105923686	105946993	3.19943938285992e-21	106002179	106015449
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	134	0.056	3.19943938285992e-21	106002179	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0881	NA	NA	NA	1.91551708531057e-08	18450562	18741716
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19845942	105	100	-0.7093	1.91551708531057e-08	18450562	18741716	1.24689139077063e-10	19845942	19845942
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.8537	1.24689139077063e-10	19845942	19845942	2.77674016318564e-12	19882711	19882711
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	39	-0.5866	2.77674016318564e-12	19882711	19882711	6.38183117018168e-47	20065525	20310916
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20379	-0.004	6.38183117018168e-47	20065525	20310916	5.53016755095970e-169	74669752	74671626
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.4407	5.5301675509597e-169	74669752	74671626	2.03025916379616e-168	74680338	74680439
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9054	-0.0012	2.03025916379616e-168	74680338	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	9924	0.0147	NA	NA	NA	5.94175735619638e-33	31843922	32513457
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	43	-0.4594	5.94175735619638e-33	31843922	32513457	2.34790126567733e-32	33538171	33846647
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	75093957	9904	9308	0.0018	2.34790126567733e-32	33538171	33846647	7.00428668769208e-37	75093957	75093957
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.8595	7.00428668769208e-37	75093957	75093957	3.32697537889306e-36	75100865	75100865
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	581	-0.0207	3.32697537889306e-36	75100865	75100865	1.25383817766990e-20	76923844	76929598
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8566	1.2538381776699e-20	76923844	76929598	3.75523199509388e-18	76938723	76942679
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4236	0.0059	3.75523199509388e-18	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	389	0.0501	NA	NA	NA	2.03951197703088e-12	1028979	1028979
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4108	2.03951197703088e-12	1028979	1028979	3.91044338060961e-13	1030766	1030766
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	10987	0.0149	3.91044338060961e-13	1030766	1030766	6.34024859977866e-11	31439551	31467971
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.4122	6.34024859977866e-11	31439551	31467971	1.76172122503296e-11	31490899	31895551
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1715	0.0203	1.76172122503296e-11	31490899	31895551	6.16780857800663e-190	36673853	36673853
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-3.2685	6.16780857800663e-190	36673853	36673853	2.46716171970738e-186	36684619	36684619
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	14836	0.0178	2.46716171970738e-186	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	1890337	639	608	0.0406	NA	NA	NA	1.84246393113208e-59	1888264	1896337
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1896337	1973621	21	18	-0.86	1.84246393113208e-59	1888264	1896337	5.08669675766818e-48	1970787	1975578
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1975578	76116026	22303	21021	-0.0082	5.08669675766818e-48	1970787	1975578	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40352568	12609	11928	0.0267	NA	NA	NA	5.32752261386679e-08	40350432	40352568
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.1252	5.32752261386679e-08	40350432	40352568	2.53802047675405e-08	40356341	40356341
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	40540618	82	74	0.0173	2.53802047675405e-08	40356341	40356341	5.26252647659906e-135	40540618	40540618
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.152	5.26252647659906e-135	40540618	40540618	1.05958867266212e-182	40553315	40553315
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	59414898	8359	7865	0.026	1.05958867266212e-182	40553315	40553315	1.10069787581557e-16	59412581	59414898
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.6784	1.10069787581557e-16	59412581	59414898	9.6965412573154e-17	59434202	59440262
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1899	0.016	9.6965412573154e-17	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	548	0.0113	NA	NA	NA	5.23831277985838e-87	1506379	1511632
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1523000	6	6	-2.1345	5.23831277985838e-87	1506379	1511632	0.0390345347384554	1515948	1523000
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1525300	1532433	4	4	-0.9022	0.0390345347384554	1515948	1523000	7.73903104712806e-11	1531162	1544485
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	19842	2e-04	7.73903104712806e-11	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	22573420	3062	2884	-0.0078	NA	NA	NA	6.31401261062693e-14	22573420	22573420
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-1.1387	6.31401261062693e-14	22573420	22573420	5.40468917170005e-13	22585040	22585040
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46922972	10375	9789	-0.0013	5.40468917170005e-13	22585040	22585040	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1075	0.0285	NA	NA	NA	3.22020682111975e-07	18123761	18125356
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	-1.0774	3.22020682111975e-07	18123761	18125356	4.04821939684605e-07	18129194	18131561
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22667608	1849	1733	0.0258	4.04821939684605e-07	18129194	18131561	0	22667608	22679305
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.1949	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	12743	0.0184	0	22720195	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.3692	NA	NA	NA	1.78032325872432e-19	94062	94062
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	6	-1.132	1.78032325872432e-19	94062	94062	4.31671489336843e-22	103089	104732
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	16	-0.1327	4.31671489336843e-22	103089	104732	8.79280565466965e-08	122273	127779
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.8057	8.79280565466965e-08	122273	127779	3.02570206599909e-10	129544	132689
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	702	0.0014	3.02570206599909e-10	129544	132689	3.35559351500835e-17	1427392	1431240
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1647	3.35559351500835e-17	1427392	1431240	4.47367838609813e-18	1432891	1432953
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2706218	1000	937	-0.0052	4.47367838609813e-18	1432891	1432953	0	2705378	2711273
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708113	2708291	2	0	NA	0	2705378	2711273	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	42584	0.9435	NA	NA	NA	0	154578922	154586690
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	187	0.0119	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	120	-3.8976	NA	NA	NA	8.28164923254124e-17	3777766	4174561
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-0.7804	8.28164923254124e-17	3777766	4174561	6.35837257659551e-09	5531459	6692482
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	5672441	1	0	NA	6.35837257659551e-09	5531459	6692482	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7054924	174	157	-3.5336	NA	NA	NA	7.61364781288754e-09	7013903	7152044
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	109	-2.4648	7.61364781288754e-09	7013903	7152044	2.55945374319947e-16	7384405	7600570
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	10513747	529	498	-3.5833	2.55945374319947e-16	7384405	7600570	2.12056820484073e-19	10511255	10515697
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.4125	2.12056820484073e-19	10511255	10515697	0.098110939961615	10622062	11673476
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-1.7174	0.098110939961615	10622062	11673476	7.51600543976577e-07	11660512	12452734
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	9	-4.9287	7.51600543976577e-07	11660512	12452734	1.63901366317358e-09	12541506	12550566
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12542979	1	0	NA	1.63901366317358e-09	12541506	12550566	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12545716	12682301	53	49	-1.9466	NA	NA	NA	5.17059826750202e-06	12634446	12696242
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.5784	5.17059826750202e-06	12634446	12696242	4.95764844391766e-06	12809152	12861657
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13040293	77	72	-2.1488	4.95764844391766e-06	12809152	12861657	0.000322547903178091	13008662	13045641
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13066849	13	13	-3.6472	0.000322547903178091	13008662	13045641	1.77758136638085e-05	13062151	13081856
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13129843	23	21	-1.9634	1.77758136638085e-05	13062151	13081856	2.84251348400701e-08	13121152	13136828
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13133803	1	0	NA	2.84251348400701e-08	13121152	13136828	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13149825	8	8	-4.5533	NA	NA	NA	0.00215511011987124	13146483	13167862
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13150942	13283695	42	39	-2.9124	0.00215511011987124	13146483	13167862	2.16537678277983e-09	13254711	13314244
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13285595	14122129	326	303	-4.0616	2.16537678277983e-09	13254711	13314244	7.20999758074353e-15	14097679	14321882
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14508021	127	118	-3.1002	7.20999758074353e-15	14097679	14321882	8.63908701729394e-06	14489801	14538156
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14524829	2	0	NA	8.63908701729394e-06	14489801	14538156	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	23	-1.669	NA	NA	NA	1.68904769790215e-10	14563486	14598838
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15284717	194	182	-3.3841	1.68904769790215e-10	14563486	14598838	8.62023105134962e-05	15223545	15311814
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15389388	67	66	-4.1176	8.62023105134962e-05	15223545	15311814	9.17021583285403e-07	15374939	15450495
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15390599	15630463	110	101	-3.1872	9.17021583285403e-07	15374939	15450495	0.00357620187079712	15477260	15675166
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15911389	45	43	-4.0861	0.00357620187079712	15477260	15675166	5.49225798371722e-05	15862122	15998663
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	15915466	1	0	NA	5.49225798371722e-05	15862122	15998663	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	152	-3.1476	NA	NA	NA	5.61301573971595e-10	16282623	16471053
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17067188	101	98	-4.1838	5.61301573971595e-10	16282623	16471053	0.000525412240283181	16922080	17076673
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17073540	17101969	7	6	-2.1538	0.000525412240283181	16922080	17076673	2.66497111557483e-08	17093068	17101969
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17107617	17143034	7	7	-4.5101	2.66497111557483e-08	17093068	17101969	2.74361265805861e-06	17138190	17143034
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17147469	17238655	16	16	-2.9686	2.74361265805861e-06	17138190	17143034	2.06885684016854e-05	17238655	17284587
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17242317	17482749	42	40	-4.4088	2.06885684016854e-05	17238655	17284587	2.22985468440903e-10	17467755	17487972
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17557953	13	11	-1.9723	2.22985468440903e-10	17467755	17487972	3.38478329492644e-05	17530333	17631818
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036503	485	446	-3.7401	3.38478329492644e-05	17530333	17631818	2.84575377631962e-06	21028489	21041164
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.1286	2.84575377631962e-06	21028489	21041164	1.62419486179164e-07	21048365	21057446
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22058759	260	239	-3.8864	1.62419486179164e-07	21048365	21057446	1.15052182209796e-08	22049641	22058759
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22139807	22139807	1	0	NA	1.15052182209796e-08	22049641	22058759	NA	NA	NA
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.4798	NA	NA	NA	1.24913040933503e-15	22177335	22179794
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-4.2583	1.24913040933503e-15	22177335	22179794	1.29759323595723e-68	22926726	23283689
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	27019256	50	46	-1.2262	1.29759323595723e-68	22926726	23283689	6.8104320100586e-08	27007874	27019256
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.9628	6.8104320100586e-08	27007874	27019256	1.85408696891769e-10	27039222	27063070
MSK_252152915171_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.6805	1.85408696891769e-10	27039222	27063070	NA	NA	NA
