Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16713074	5782	5595	0.0213	NA	NA	NA	1.67125747196331e-07	16663329	16816180
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	17086698	15	15	-0.5155	1.67125747196331e-07	16663329	16816180	1.57021190111586e-07	16961001	17112697
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17094326	72537426	22097	21468	0.0062	1.57021190111586e-07	16961001	17112697	7.70211898326065e-56	72537426	72540240
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	1.5187	7.70211898326065e-56	72537426	72540240	4.76973814200937e-59	72571158	72579311
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11367	0.0039	4.76973814200937e-59	72571158	72579311	6.17715152144681e-15	110015739	110023268
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-1.3379	6.17715152144681e-15	110015739	110023268	3.02282466812613e-14	110041712	110058441
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150819879	5849	5686	-0.0084	3.02282466812613e-14	110041712	110058441	2.16520002236178e-45	150819879	150819879
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	11	1.4028	2.16520002236178e-45	150819879	150819879	1.96273775227595e-43	150852858	150852858
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2665	0.0071	1.96273775227595e-43	150852858	150852858	6.29214608409233e-24	157133150	157133150
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.4401	6.29214608409233e-24	157133150	157133150	1.08053975069132e-25	157136342	157136342
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12900	-0.0076	1.08053975069132e-25	157136342	157136342	2.52876704608406e-269	194978218	194978218
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195062793	8	8	-3.9267	2.52876704608406e-269	194978218	194978218	3.61480499461903e-268	195062793	195062793
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	247186514	19606	19020	-0.002	3.61480499461903e-268	195062793	195062793	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11157	-5e-04	NA	NA	NA	7.60996453602851e-19	34539740	34551222
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.7665	7.60996453602851e-19	34539740	34551222	8.92174085978995e-19	34579933	34583814
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	154601442	35744	34662	-0.0039	8.92174085978995e-19	34579933	34583814	1.55121691008968e-142	154601442	154601442
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-5.6868	1.55121691008968e-142	154601442	154601442	2.02169765850419e-141	154606943	154606943
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	29542	0.0026	2.02169765850419e-141	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	46769081	15925	15412	0.0014	NA	NA	NA	7.2683790994068e-19	46767765	46769081
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	7	-1.1191	7.2683790994068e-19	46767765	46769081	1.58544029274488e-18	46825048	46827727
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	99891210	16250	15689	0.0119	1.58544029274488e-18	46825048	46827727	2.58175668176498e-145	99891210	99891210
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.801	2.58175668176498e-145	99891210	99891210	2.81802081195779e-146	99897201	99897201
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20630	-0.0085	2.81802081195779e-146	99897201	99897201	1.72043545266243e-25	164005577	164005577
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.5424	1.72043545266243e-25	164005577	164005577	3.35818434417461e-26	164027724	164027724
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9858	-0.0012	3.35818434417461e-26	164027724	164027724	1.29224599999975e-280	194354505	194354505
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.5597	1.29224599999975e-280	194354505	194354505	1.10043142027646e-248	194366950	194366950
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1923	-0.0139	1.10043142027646e-248	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3299	0.0215	NA	NA	NA	4.3550275501526e-228	9815760	9815760
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.2704	4.3550275501526e-228	9815760	9815760	1.15557916434243e-252	9842644	9842644
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	64376590	13954	13516	-7e-04	1.15557916434243e-252	9842644	9842644	6.59025423855687e-124	64376590	64376590
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.2276	6.59025423855687e-124	64376590	64376590	1.92617989979040e-115	64390333	64390333
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68899247	1078	1044	0.0033	1.9261798997904e-115	64390333	64390333	1.66403632590334e-09	68892434	69075140
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69165814	16	16	0.5503	1.66403632590334e-09	68892434	69075140	6.8799920748705e-10	69142044	69687545
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	187330240	35471	34330	-3e-04	6.8799920748705e-10	69142044	69687545	5.34753225258321e-72	187330240	187330240
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.0242	5.34753225258321e-72	187330240	187330240	2.54925810672355e-66	187333619	187333619
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191041481	1234	1194	-0.0246	2.54925810672355e-66	187333619	187333619	0.000138760464312021	190984557	191133096
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.4682	0.000138760464312021	190984557	191133096	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	150181399	43854	42520	-0.0032	NA	NA	NA	7.4665717455852e-12	150171154	150185190
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.9067	7.4665717455852e-12	150171154	150185190	4.58717814396983e-12	150201145	150204134
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9602	0.0114	4.58717814396983e-12	150201145	150204134	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32548736	11676	11301	0.0064	NA	NA	NA	2.05758257522771e-20	32539864	32595402
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32634977	19	18	0.7382	2.05758257522771e-20	32539864	32595402	5.79539474180464e-17	32609525	32653710
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	35862502	1381	1336	0.0076	5.79539474180464e-17	32609525	32653710	9.96983997425198e-07	35856922	35866245
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.7892	9.96983997425198e-07	35856922	35866245	8.64636180898271e-08	35870753	35878656
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6693	0.0038	8.64636180898271e-08	35870753	35878656	6.67493118710927e-117	54035000	54035000
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.177	6.67493118710927e-117	54035000	54035000	1.80247735572227e-114	54042734	54042734
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12772	-0.0072	1.80247735572227e-114	54042734	54042734	2.08767566419130e-194	103841482	103841482
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.7055	2.0876756641913e-194	103841482	103841482	1.19461520654217e-199	103868154	103868154
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20441	-8e-04	1.19461520654217e-199	103868154	103868154	6.14358276638131e-152	165643653	165643653
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.1123	6.14358276638131e-152	165643653	165643653	2.73877994900446e-135	165650610	165650610
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1749	-0.0212	2.73877994900446e-135	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26097755	8798	8533	5e-04	NA	NA	NA	5.33374890179977e-120	26097755	26097755
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-5.26	5.33374890179977e-120	26097755	26097755	2.16529585874295e-119	26108369	26108369
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	118611324	30465	29524	-3e-04	2.16529585874295e-119	26108369	26108369	9.9817125204607e-135	118611324	118611324
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.5603	9.9817125204607e-135	118611324	118611324	1.49994104592753e-132	118620875	118620875
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6607	0.0078	1.49994104592753e-132	118620875	118620875	9.34068520688514e-08	133426938	133436265
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7115	9.34068520688514e-08	133426938	133436265	2.26343256649409e-08	133447868	133456873
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3706	-0.0042	2.26343256649409e-08	133447868	133456873	2.41700571160917e-301	141690753	141690753
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.7462	2.41700571160917e-301	141690753	141690753	7.96169756920406e-173	141714168	141714168
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142161005	170	165	0.0539	7.96169756920406e-173	141714168	141714168	8.86607025534182e-58	142161005	142161005
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-3.7324	8.86607025534182e-58	142161005	142161005	1.69528674505421e-86	142167908	142167908
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147702365	2339	2277	0.003	1.69528674505421e-86	142167908	142167908	6.28064330565625e-41	147702365	147702365
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.1386	6.28064330565625e-41	147702365	147702365	1.13179547674828e-38	147707161	147707161
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158191657	4024	3898	-0.0204	1.13179547674828e-38	147707161	147707161	7.97908404471988e-92	158191657	158191657
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-4.8018	7.97908404471988e-92	158191657	158191657	1.19025055961352e-87	158195947	158195947
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	208	0.0689	1.19025055961352e-87	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	151472	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	166493	581533	118	116	-0.0098	NA	NA	NA	7.60112406311315e-43	581533	581533
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.0533	7.60112406311315e-43	581533	581533	5.46715569660856e-41	588865	588865
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	40892587	13453	13020	-0.0023	5.46715569660856e-41	588865	588865	2.01491331542791e-107	40892587	40892587
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.9122	2.01491331542791e-107	40892587	40892587	1.32687623304611e-105	40897469	40897469
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	144968840	30537	29625	0.0013	1.32687623304611e-105	40897469	40897469	4.64301323623631e-12	144968840	144968840
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.7203	4.64301323623631e-12	144968840	144968840	8.11190243223058e-09	144970777	144970777
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	436	0.0322	8.11190243223058e-09	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7756	-0.0041	NA	NA	NA	1.22871959372324e-172	23343915	23343915
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-5.0639	1.22871959372324e-172	23343915	23343915	5.25098110617729e-161	23365926	23365926
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	140145683	29941	28984	-0.0046	5.25098110617729e-161	23365926	23365926	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45478103	14453	14040	-0.011	NA	NA	NA	1.22833524038373e-41	45468415	45489823
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45478162	46558272	74	73	-0.5232	1.22833524038373e-41	45468415	45489823	1.20140653981786e-42	46547543	47021415
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46561216	77917893	10065	9751	-0.0025	1.20140653981786e-42	46547543	47021415	2.56039725383323e-60	77917893	77917893
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.0391	2.56039725383323e-60	77917893	77917893	1.06381739519129e-54	77928738	77928738
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	82866553	1494	1450	0.0164	1.06381739519129e-54	77928738	77928738	1.22692450076278e-09	82857476	82869426
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82881204	6	6	-0.9092	1.22692450076278e-09	82857476	82869426	1.53763566653970e-09	82878509	82884042
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	135285645	18713	18150	-0.004	1.5376356665397e-09	82878509	82884042	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	24395406	9055	8758	-0.0046	NA	NA	NA	2.18718486400892e-31	24395406	24395406
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	24400064	24405796	2	2	-2.8168	2.18718486400892e-31	24395406	24395406	6.36155285605041e-33	24405796	24405796
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	24413618	55118214	7848	7634	0.0057	6.36155285605041e-33	24405796	24405796	1.50777777414748e-30	55097806	55127355
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.6081	1.50777777414748e-30	55097806	55127355	4.81051977445317e-30	55205278	55223056
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27479	0.0013	4.81051977445317e-30	55205278	55223056	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3647	0.0095	NA	NA	NA	1.36797752201982e-19	9456107	9531133
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.8782	1.36797752201982e-19	9456107	9531133	2.72865889444807e-23	9589725	9604633
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11104973	570	556	-0.0328	2.72865889444807e-23	9589725	9604633	1.25860235333718e-32	11104085	11104973
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	1.1305	1.25860235333718e-32	11104085	11104973	2.35783934077134e-30	11140421	11143592
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	46992235	11147	10788	-0.0055	2.35783934077134e-30	11140421	11143592	3.57578019360382e-15	46992235	46992235
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.913	3.57578019360382e-15	46992235	46992235	6.86021192042024e-15	46996769	46996769
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	132289090	29676	28750	0.0073	6.86021192042024e-15	46996769	46996769	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11854	-0.0059	NA	NA	NA	1.01523462774909e-83	49964838	49964838
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-4.3885	1.01523462774909e-83	49964838	49964838	1.18677831804855e-76	49971732	49971732
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1764	-0.0028	1.18677831804855e-76	49971732	49971732	4.93447587696128e-19	56610886	56657371
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.7823	4.93447587696128e-19	56610886	56657371	1.69630561432783e-20	56681665	56691355
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	114123340	17603	17029	0.0078	1.69630561432783e-20	56681665	56691355	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	-5e-04	NA	NA	NA	0.0184300903857181	18527871	19403640
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19441654	30	30	-0.3883	0.0184300903857181	18527871	19403640	9.46915284846756e-09	19420732	19461755
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	73061942	19382	18796	-0.006	9.46915284846756e-09	19420732	19461755	7.24953856336023e-44	73061942	73061942
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	8	-1.6014	7.24953856336023e-44	73061942	73061942	1.81808118506003e-39	73101327	73101327
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	74152538	523	506	0.0262	1.81808118506003e-39	73101327	73101327	5.52779445053558e-08	74150749	74152538
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.4285	5.52779445053558e-08	74150749	74152538	7.23299080097929e-08	74155334	74155334
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	105597555	11689	11318	0.0048	7.23299080097929e-08	74155334	74155334	0	105597555	105597555
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-4.8043	0	105597555	105597555	3.71002406603421e-131	105632168	105632168
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105948347	72	71	-0.127	3.71002406603421e-131	105632168	105632168	3.73382438047916e-186	105948347	105948347
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	-4.817	3.73382438047916e-186	105948347	105948347	8.98547026815403e-290	105989160	105989160
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	144	0.0758	8.98547026815403e-290	105989160	105989160	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	74669752	21711	21016	-0.0097	NA	NA	NA	1.84062898640607e-100	74669752	74669752
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.5133	1.84062898640607e-100	74669752	74669752	1.13598947959522e-105	74680439	74680439
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	95609756	7615	7379	-0.0091	1.13598947959522e-105	74680439	74680439	4.711623316155e-10	95602982	95609756
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.9184	4.711623316155e-10	95602982	95609756	1.86679219560943e-09	95632390	95658438
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1913	-0.0167	1.86679219560943e-09	95632390	95658438	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34317157	10707	10344	0.0191	NA	NA	NA	7.58484683634367e-62	34306513	34329518
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	50	0.8074	7.58484683634367e-62	34306513	34329518	3.61508615247774e-68	34596655	34617260
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9451	0.001	3.61508615247774e-68	34596655	34617260	1.49616821613811e-40	75093957	75093957
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	3.117	1.49616821613811e-40	75093957	75093957	4.09882248426328e-43	75100865	75100865
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	585	-0.0032	4.09882248426328e-43	75100865	75100865	6.13401312120495e-15	76923844	76925748
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9301	6.13401312120495e-15	76923844	76925748	3.48819689763843e-12	76940218	76944661
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4368	0.0118	3.48819689763843e-12	76940218	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	402	0.0069	NA	NA	NA	6.13882919856753e-10	1028979	1028979
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5973	6.13882919856753e-10	1028979	1028979	1.22300710279891e-09	1030766	1030766
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	13037	0.0063	1.22300710279891e-09	1030766	1030766	3.48791614523588e-44	36673853	36673853
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	2.0958	3.48791614523588e-44	36673853	36673853	5.84519684509347e-45	36683509	36683509
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41515622	2010	1953	0.0287	5.84519684509347e-45	36683509	36683509	4.64570007568164e-32	41504832	41522429
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	41706870	67	66	-0.4588	4.64570007568164e-32	41504832	41522429	1.11854651030535e-28	41700762	42151941
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41708551	78653545	13681	13231	0.0136	1.11854651030535e-28	41700762	42151941	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22328	-0.0027	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40540618	12693	12317	0.0037	NA	NA	NA	1.51924291159214e-88	40540618	40540618
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.0086	1.51924291159214e-88	40540618	40540618	1.10205993211685e-93	40553315	40553315
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	55109221	6385	6191	0.0025	1.10205993211685e-93	40553315	40553315	1.76362249800592e-11	55101935	55113794
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55110677	55153276	19	19	0.5751	1.76362249800592e-11	55101935	55113794	1.50777501289409e-11	55145368	55167598
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55155617	63788698	3959	3823	7e-04	1.50777501289409e-11	55145368	55167598	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	572	0.0014	NA	NA	NA	6.76182380868306e-18	1499421	1516966
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9906	6.76182380868306e-18	1499421	1516966	1.43641927207354e-20	1525300	1544485
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3560	0.0084	1.43641927207354e-20	1525300	1544485	1.49068476309836e-08	12089020	12095485
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4453	1.49068476309836e-08	12089020	12095485	7.82415423416063e-08	12113855	12127349
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16725	3e-04	7.82415423416063e-08	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13005	-7e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2904	0.0068	NA	NA	NA	8.53167604850752e-32	22644243	22682428
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	0.9533	8.53167604850752e-32	22644243	22682428	5.94462554894976e-36	22714979	22721042
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6365	0.0064	5.94462554894976e-36	22714979	22721042	3.43611774514333e-44	35472378	35472378
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.297	3.43611774514333e-44	35472378	35472378	4.84992987958587e-40	35476942	35476942
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	41226643	3052	2974	0.0141	4.84992987958587e-40	35476942	35476942	7.37783058869241e-11	41219395	41226643
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41237593	41276170	9	9	-0.8145	7.37783058869241e-11	41219395	41226643	3.93168788781309e-10	41276170	41286119
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41279485	49571068	3942	3822	0.0026	3.93168788781309e-10	41276170	41286119	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1742	-0.0347	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43668	1.0165	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	0.0369	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	121	-4.3819	NA	NA	NA	5.77647093998491e-21	3219200	3773948
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	4425391	10	10	-0.8152	5.77647093998491e-21	3219200	3773948	7.87836448544855e-12	4272867	4948824
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	4431527	1	0	NA	7.87836448544855e-12	4272867	4948824	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7256919	233	229	-3.9899	NA	NA	NA	4.69567975770944e-06	7221322	7294545
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7349064	46	44	-2.807	4.69567975770944e-06	7221322	7294545	7.55337059127581e-07	7307884	7375948
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7350629	7723783	105	101	-4.0685	7.55337059127581e-07	7307884	7375948	0.000474573133297759	7707621	7745143
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-2.8237	0.000474573133297759	7707621	7745143	0.00416162365140764	7745143	7821580
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-4.0602	0.00416162365140764	7745143	7821580	0.000113369020399665	7893056	7905286
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.1662	0.000113369020399665	7893056	7905286	1.11008220345119e-06	7914104	7919636
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	375	-4.1891	1.11008220345119e-06	7914104	7919636	3.05313361917269e-34	10513747	10515697
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	11	-0.6688	3.05313361917269e-34	10513747	10515697	1.22960201787168e-07	10631941	11660512
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	13119344	206	199	-3.2934	1.22960201787168e-07	10631941	11660512	0.0215753719039784	12972283	13119344
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.5712	0.0215753719039784	12972283	13119344	1.84886576029339e-06	13128515	13129843
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	42	-3.8994	1.84886576029339e-06	13128515	13129843	0.0485039142916402	13147329	13407320
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13256555	1	0	NA	0.0485039142916402	13147329	13407320	NA	NA	NA
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13663517	167	159	-4.3429	NA	NA	NA	1.19049575492995e-05	13606316	13691261
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13670791	13705594	9	7	-2.7297	1.19049575492995e-05	13606316	13691261	7.00884445910125e-06	13700962	13718946
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14342834	190	182	-4.4187	7.00884445910125e-06	13700962	13718946	4.5871512258338e-07	14273899	14404284
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	94	-3.7483	4.5871512258338e-07	14273899	14404284	1.53635924581247e-11	14506319	14530134
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14549297	12	11	-1.254	1.53635924581247e-11	14506319	14530134	4.0949388050005e-15	14545228	14553021
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14550971	15920478	430	413	-4.1321	4.0949388050005e-15	14545228	14553021	1.37019061758859e-05	15821860	15932535
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15980898	21	19	-2.7911	1.37019061758859e-05	15821860	15932535	7.95844925197474e-05	15975479	16002819
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15982684	16035717	21	19	-4.0801	7.95844925197474e-05	15975479	16002819	0.00176912661862156	16025800	16039703
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-2.0586	0.00176912661862156	16025800	16039703	1.23441590454180e-06	16039703	16062175
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	21036503	784	749	-4.2774	1.2344159045418e-06	16039703	16062175	4.11242538644596e-07	21034708	21043581
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.9806	4.11242538644596e-07	21034708	21043581	2.81784050902715e-06	21043581	21060047
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22930737	363	347	-4.2383	2.81784050902715e-06	21043581	21060047	1.07215400616760e-48	22926726	25737663
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.5349	1.0721540061676e-48	22926726	25737663	7.80678429865084e-07	26933862	26952278
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27006628	13	12	-3.3256	7.80678429865084e-07	26933862	26952278	0.385982775504997	26980386	27031809
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27007874	27039222	8	8	-2.521	0.385982775504997	26980386	27031809	0.0137506426136906	27009433	27068911
MSK_252152914586_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-1.0345	0.0137506426136906	27009433	27068911	NA	NA	NA
