Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12631	-0.004	NA	NA	NA	5.91228430657668e-09	34859068	34869589
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-1.262	5.91228430657668e-09	34859068	34869589	4.95426421897135e-10	34883375	34884849
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14735	0.0097	4.95426421897135e-10	34883375	34884849	6.794549258247e-31	72536231	72537426
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.1721	6.794549258247e-31	72536231	72537426	1.87185885365267e-33	72579311	72589682
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17202	0.0066	1.87185885365267e-33	72579311	72589682	3.91115170601261e-25	150818222	150823073
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	11	1.1507	3.91115170601261e-25	150818222	150823073	1.51233021284176e-24	150851439	150857070
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2710	0.0051	1.51233021284176e-24	150851439	150857070	3.93168227665698e-38	157133150	157133150
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.3245	3.93168227665698e-38	157133150	157133150	8.67249016741691e-38	157136342	157136342
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	204482369	17090	16777	0.0147	8.6724901674169e-38	157136342	157136342	7.50979927565774e-11	204477621	204482369
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204483717	204637883	9	9	-0.8517	7.50979927565774e-11	204477621	204482369	4.09201266684137e-11	204637883	204652511
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204650322	247186514	15811	15505	0.0177	4.09201266684137e-11	204637883	204652511	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13113316	4162	4072	0.0197	NA	NA	NA	1.20424703660109e-12	13080406	13119002
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.623	1.20424703660109e-12	13080406	13119002	2.6157567780939e-08	13196226	13211200
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	34551222	7347	7199	0.0109	2.6157567780939e-08	13196226	13211200	1.11800954739985e-25	34542224	34551222
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34583814	16	16	0.9924	1.11800954739985e-25	34542224	34551222	5.2615195680116e-28	34583814	34591681
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	66357387	11755	11520	-0.006	5.2615195680116e-28	34583814	34591681	7.19838855592503e-90	66357387	66357387
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.0149	7.19838855592503e-90	66357387	66357387	1.37820188308216e-87	66360747	66360747
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	242689978	54531	53503	0.0168	1.37820188308216e-87	66360747	66360747	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	138072549	45461	44589	0.0147	NA	NA	NA	2.66617536385808e-09	138071399	138072549
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	138078049	138078103	2	2	1.7464	2.66617536385808e-09	138071399	138072549	4.47501867745841e-10	138078103	138078103
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	138078182	152844016	4522	4425	0.0098	4.47501867745841e-10	138078103	138078103	5.97447947203872e-44	152840662	152851538
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	152851538	152944158	20	20	-1.1133	5.97447947203872e-44	152840662	152851538	7.50932242424923e-45	152941169	152946078
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	152946078	163992903	3483	3412	0.0147	7.50932242424923e-45	152941169	152946078	8.26718217520088e-53	163992903	164005577
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.7853	8.26718217520088e-53	163992903	164005577	0.00948846414849219	164001657	164036648
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.8906	0.00948846414849219	164001657	164036648	3.13893738252194e-26	164105613	164115417
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8935	0.0175	3.13893738252194e-26	164105613	164115417	7.21008810622068e-83	191219222	191219222
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-4.838	7.21008810622068e-83	191219222	191219222	8.51921205803727e-76	191222891	191222891
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	199329592	2992	2937	0.0269	8.51921205803727e-76	191222891	191222891	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	146796157	41552	40788	0.0067	NA	NA	NA	4.34499916326016e-13	146796157	146796157
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	146797896	146800085	2	2	1.9872	4.34499916326016e-13	146796157	146796157	2.74799678633341e-13	146800085	146800085
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	146802531	173224400	8086	7928	0.0335	2.74799678633341e-13	146800085	146800085	1.17886966056419e-74	173224400	173224400
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.5005	1.17886966056419e-74	173224400	173224400	6.91355218593858e-83	173228860	173228860
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	189	0.0322	6.91355218593858e-83	173228860	173228860	7.29731266512325e-37	173660684	173660684
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.0141	7.29731266512325e-37	173660684	173660684	4.26557262412206e-34	173666072	173666072
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3990	0.0335	4.26557262412206e-34	173666072	173666072	6.36599880244362e-57	187330240	187330240
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.8877	6.36599880244362e-57	187330240	187330240	9.46719408603186e-54	187333619	187333619
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1219	0.0584	9.46719408603186e-54	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3889	0.0164	NA	NA	NA	5.21701909664516e-20	12857302	12857302
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-2.2819	5.21701909664516e-20	12857302	12857302	1.19150128046757e-17	12873052	12873052
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180644810	49789	48813	0.0108	1.19150128046757e-17	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	37	0.2701	NA	NA	NA	1.70584216883534e-07	173437	202063
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	200350	1	0	NA	1.70584216883534e-07	173437	202063	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	234115	13	13	-0.3861	NA	NA	NA	0.000261431469109747	234115	237952
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	241674	4	4	0.4501	0.000261431469109747	234115	237952	4.5351889998843e-08	240119	244363
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	326323	44	43	-0.6143	4.5351889998843e-08	240119	244363	3.33676712958024e-28	318496	331014
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	31385778	11081	10865	0.0025	3.33676712958024e-28	318496	331014	0.000110823106540124	31290478	31385778
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31389372	2	2	-0.7507	0.000110823106540124	31290478	31385778	7.45494142557e-18	31389372	31389372
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31390982	31395330	3	3	-1.2058	7.45494142557e-18	31389372	31389372	1.28932189852297e-07	31395330	31418006
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31418006	32558677	490	485	-0.008	1.28932189852297e-07	31395330	31418006	1.08918159706077e-168	32558677	32558677
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	-3.1636	1.08918159706077e-168	32558677	32558677	4.75099871099256e-18	32605300	32613538
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32713363	35	34	-0.3505	4.75099871099256e-18	32605300	32613538	1.08860511393933e-09	32709263	32720656
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-3.0167	1.08860511393933e-09	32709263	32720656	1.251706300005e-07	32723722	32728487
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32745693	9	9	-0.1037	1.251706300005e-07	32723722	32728487	1.78745487801929e-06	32745693	32758904
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32756637	32762061	4	4	-1.7084	1.78745487801929e-06	32745693	32758904	2.9513127112563e-19	32760574	32762061
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	32766023	1	0	NA	2.9513127112563e-19	32760574	32762061	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	74647491	13536	13287	0.0022	NA	NA	NA	8.74577987591719e-109	74647491	74647491
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-5.6497	8.74577987591719e-109	74647491	74647491	6.41912295414308e-112	74653360	74653360
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1125	-0.018	6.41912295414308e-112	74653360	74653360	2.5538628518137e-23	79015901	79018959
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-1.0395	2.5538628518137e-23	79015901	79018959	1.48053354414711e-24	79091850	79095415
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	170753106	29680	29115	0.0128	1.48053354414711e-24	79091850	79095415	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	178408	14	14	0.7222	NA	NA	NA	6.89302705273735e-12	176344	184924
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	180716	109217320	34947	34327	-0.0028	6.89302705273735e-12	176344	184924	4.04534913222316e-138	109217320	109217320
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.1446	4.04534913222316e-138	109217320	109217320	0.00238212253054198	109231462	109233214
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-2.2264	0.00238212253054198	109231462	109233214	9.86695578766193e-17	109240210	109240210
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	133433384	11129	10917	0.0192	9.86695578766193e-17	109240210	109240210	5.54727742801425e-10	133426938	133436265
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.899	5.54727742801425e-10	133426938	133436265	2.57307478998660e-10	133447868	133455682
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3767	0.0021	2.5730747899866e-10	133447868	133455682	2.14908895871002e-17	141689547	141700432
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.0345	2.14908895871002e-17	141689547	141700432	1.00641850759866e-16	141711513	141720303
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2462	0.0156	1.00641850759866e-16	141711513	141720303	1.08691830906241e-61	147702365	147702365
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.2907	1.08691830906241e-61	147702365	147702365	1.99519471724891e-55	147707161	147707161
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4160	0.0216	1.99519471724891e-55	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.1758	NA	NA	NA	5.3179019852434e-48	581533	581533
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.9094	5.3179019852434e-48	581533	581533	2.44732357230077e-33	588865	588865
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6926661	2270	2221	-0.0073	2.44732357230077e-33	588865	588865	1.73988110399743e-12	6905670	7226901
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	0.7965	1.73988110399743e-12	6905670	7226901	5.03915178973602e-11	7709141	8143301
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	18894239	3783	3718	-0.0042	5.03915178973602e-11	7709141	8143301	1.70958617594907e-12	18891449	18897287
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18896032	18908287	7	7	-1.0204	1.70958617594907e-12	18891449	18897287	4.75621279978202e-11	18904146	18910176
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18910176	25119007	1967	1920	-0.0075	4.75621279978202e-11	18904146	18910176	1.04275260796428e-31	25119007	25119007
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25124428	3	3	2.5692	1.04275260796428e-31	25119007	25119007	2.60378006326055e-34	25124428	25124428
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25125700	25125700	1	0	NA	2.60378006326055e-34	25124428	25124428	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4825	-0.0071	NA	NA	NA	0	39350798	39350798
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	-4.5327	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	434	-0.0418	0	39505256	39505256	1.51078818280195e-92	40892587	40892587
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.969	1.51078818280195e-92	40892587	40892587	3.9320741321506e-87	40897469	40897469
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30406	0.0095	3.9320741321506e-87	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	1050234	398	390	0.105	NA	NA	NA	2.22853140631397e-37	1047501	1053728
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	1051623	1127572	26	25	-0.9029	2.22853140631397e-37	1047501	1053728	3.66463425384475e-37	1121862	1133537
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	1133537	22477358	7413	7273	0.001	3.66463425384475e-37	1121862	1133537	1.29982013468004e-14	22477358	22477358
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.0271	1.29982013468004e-14	22477358	22477358	2.4501095767471e-13	22492603	22492603
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	100348045	15154	14874	0.0092	2.4501095767471e-13	22492603	22492603	2.67315796040902e-74	100348045	100348045
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-4.6796	2.67315796040902e-74	100348045	100348045	2.31985450983605e-76	100350814	100350814
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	112062107	3851	3770	0.0102	2.31985450983605e-76	100350814	100350814	7.50736197763328e-39	112062107	112062107
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-3.3493	7.50736197763328e-39	112062107	112062107	1.08646133994687e-34	112069192	112069192
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	140145683	11096	10879	0.0129	1.08646133994687e-34	112069192	112069192	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	30405924	11008	10799	-0.0107	NA	NA	NA	3.94077829216409e-16	30403043	30405924
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	30407617	30410824	2	2	1.8025	3.94077829216409e-16	30403043	30405924	1.10591374091153e-10	30410824	30413875
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	30413875	31284926	282	277	-0.0515	1.10591374091153e-10	30410824	30413875	9.20209420648389e-181	31284926	31284926
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-6.2043	9.20209420648389e-181	31284926	31284926	4.14070718536978e-198	31291525	31291525
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	45489823	3162	3105	-0.0158	4.14070718536978e-198	31291525	31291525	2.90095744680463e-97	45480572	46389734
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	46568496	72	71	0.8928	2.90095744680463e-97	45480572	46389734	4.43646031947068e-95	46556477	47021415
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	77917893	10063	9881	-0.0014	4.43646031947068e-95	46556477	47021415	1.80458554611061e-36	77917893	77917893
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.6997	1.80458554611061e-36	77917893	77917893	2.43824979507996e-37	77928738	77928738
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19803	0.0169	2.43824979507996e-37	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	133624249	45025	44196	0.0165	NA	NA	NA	7.77478730913033e-14	133602412	133624249
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	133625464	133625464	1	0	NA	7.77478730913033e-14	133602412	133624249	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	133627464	133629337	2	2	0.8936	NA	NA	NA	0.179966824408290	133629337	133742470
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	133630575	134424808	271	268	0.2247	0.17996682440829	133629337	133742470	0.00116275074759558	134405096	134432265
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134428081	134450318	5	5	0.8909	0.00116275074759558	134405096	134432265	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	130943064	44609	43741	0.003	NA	NA	NA	1.12897771375300e-17	130943064	130943064
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.1244	1.128977713753e-17	130943064	130943064	2.18873575932593e-10	130946248	130950835
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	130947790	1	0	NA	2.18873575932593e-10	130946248	130950835	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130950835	132289090	549	539	0.0716	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	89659397	22293	21839	0.0077	NA	NA	NA	2.42055038635639e-106	89659397	89659397
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-5.518	2.42055038635639e-106	89659397	89659397	5.6733956367922e-108	89662326	89662326
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9186	0.0295	5.6733956367922e-108	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	0.854	NA	NA	NA	1.00221319319073e-07	18544772	19287128
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	18864561	1	0	NA	1.00221319319073e-07	18544772	19287128	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	85526127	23998	23495	0.0033	NA	NA	NA	2.96565106717567e-10	85518928	85526127
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85531343	85557854	6	6	-1.0403	2.96565106717567e-10	85518928	85526127	1.452297107144e-09	85557854	85567783
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85567783	105948347	7714	7558	0.0101	1.452297107144e-09	85557854	85567783	8.80034604447345e-10	105923159	105961558
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	106002179	17	16	-0.6403	8.80034604447345e-10	105923159	105961558	4.85386109247743e-16	105998412	106015449
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	139	0.2332	4.85386109247743e-16	105998412	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	30686	0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32513457	10575	10347	-0.0031	NA	NA	NA	1.5887028598058e-15	31841022	32529486
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32515876	33846647	48	48	-0.4784	1.5887028598058e-15	31841022	32529486	2.60647990600001e-15	33559207	34058222
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33868686	34317157	84	83	0.054	2.60647990600001e-15	33559207	34058222	6.057708777028e-17	34292521	34339543
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	51	0.5887	6.057708777028e-17	34292521	34339543	1.58171901615979e-28	34584793	34630537
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9554	-5e-04	1.58171901615979e-28	34584793	34630537	4.40551155313197e-40	75093957	75093957
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.5066	4.40551155313197e-40	75093957	75093957	1.20865828616072e-39	75100865	75100865
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5018	0.0099	1.20865828616072e-39	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13608	-0.0074	NA	NA	NA	8.3719727286353e-41	36673853	36675987
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.3033	8.3719727286353e-41	36673853	36675987	4.7642022679823e-38	36682031	36683509
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	36684619	1	0	NA	4.7642022679823e-38	36682031	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1964	-0.0322	NA	NA	NA	3.68485224109412e-46	41514481	41526558
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	42147225	70	69	-0.7112	3.68485224109412e-46	41514481	41526558	5.16535106816144e-52	41710400	42153189
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	78653545	13676	13406	-0.0139	5.16535106816144e-52	41710400	42153189	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22487	0.0064	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22616	-0.0291	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	0.0939	NA	NA	NA	3.45027505551243e-152	1506379	1506379
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-3.4917	3.45027505551243e-152	1506379	1506379	2.23650528069343e-165	1531162	1531162
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	14707043	4583	4486	0.0137	2.23650528069343e-165	1531162	1531162	9.67664660332023e-56	14704393	14713458
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14710983	14773957	34	32	-1.0077	9.67664660332023e-56	14704393	14713458	1.88107365188164e-52	14771030	14775971
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14775971	62419534	16367	16036	0.0025	1.88107365188164e-52	14771030	14775971	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	46922972	13440	13203	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	33944548	8738	8553	-0.0078	NA	NA	NA	6.7087776282259e-08	33942457	33944548
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	33946354	33948163	2	2	1.6621	6.7087776282259e-08	33942457	33944548	3.43812744303205e-08	33948163	33948163
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	33949734	35472378	812	796	-0.0153	3.43812744303205e-08	33948163	33948163	3.0959217994117e-33	35472378	35472378
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.3325	3.0959217994117e-33	35472378	35472378	4.72304007357629e-33	35476942	35476942
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6860	4e-04	4.72304007357629e-33	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	0.2287	NA	NA	NA	4.80241827760937e-19	124528	124528
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	1.6767	4.80241827760937e-19	124528	124528	3.82285551687455e-14	130528	132689
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2708113	1758	1732	0.0752	3.82285551687455e-14	130528	132689	0	2705378	2711273
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	154582414	45135	44282	0.9113	0	2705378	2711273	3.12500667616824e-124	154570196	154601146
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154830421	156	153	0.2118	3.12500667616824e-124	154570196	154601146	1.63945149865088e-06	154810697	154838880
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154830698	154888224	45	45	0.6054	1.63945149865088e-06	154810697	154838880	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-4.4354	NA	NA	NA	1.76517973455981e-22	3223585	3733715
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	9	-0.9441	1.76517973455981e-22	3223585	3733715	9.52568166219564e-13	4425391	4846477
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7165588	195	193	-4.1485	9.52568166219564e-13	4425391	4846477	2.95304436401622e-07	7051884	7221322
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7169915	7169915	1	0	NA	2.95304436401622e-07	7051884	7221322	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7177061	7331655	72	72	-3.0987	NA	NA	NA	1.84299699662185e-06	7284775	7349064
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7332632	7723783	116	114	-4.1252	1.84299699662185e-06	7284775	7349064	1.88362196784298e-05	7717556	7723783
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7733351	4	4	-1.3703	1.88362196784298e-05	7717556	7723783	0.0600145795205913	7731490	7756907
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7734410	7782532	14	13	-3.1677	0.0600145795205913	7731490	7756907	0.00409725887475972	7745143	7831268
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	417	-4.2701	0.00409725887475972	7745143	7831268	4.77584325189009e-39	10512616	10535786
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	17	-1.0538	4.77584325189009e-39	10512616	10535786	3.81464818973203e-06	10655750	12530596
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12682301	67	64	-3.3239	3.81464818973203e-06	10655750	12530596	0.00733981718267217	12557151	12710000
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-4.718	0.00733981718267217	12557151	12710000	0.000623381759549404	12786515	12857197
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12898852	22	22	-3.4831	0.000623381759549404	12786515	12857197	0.00246368234555759	12869489	12905395
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12899653	12926941	11	11	-4.7118	0.00246368234555759	12869489	12905395	0.00397792702071314	12925401	12992839
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13119344	77	77	-2.9806	0.00397792702071314	12925401	12992839	0.233246827245857	12970269	13119344
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.4098	0.233246827245857	12970269	13119344	1.12709133816959e-05	13128515	13136828
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	42	-3.8174	1.12709133816959e-05	13128515	13136828	3.25131069229660e-05	13176983	13329968
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14342834	366	353	-4.555	3.2513106922966e-05	13176983	13329968	5.24370701206892e-08	14244120	14407293
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-3.8699	5.24370701206892e-08	14244120	14407293	2.57273906367220e-06	14494397	14538156
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.5727390636722e-06	14494397	14538156	NA	NA	NA
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14561228	20	20	-2.3274	NA	NA	NA	1.40937016117586e-16	14554415	14569287
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14563486	22055660	1519	1483	-4.3879	1.40937016117586e-16	14554415	14569287	3.1590357726272e-08	22040373	22139807
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22056953	22179794	14	14	-2.6386	3.1590357726272e-08	22040373	22139807	1.66717937486499e-08	22176501	22200078
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	25737663	93	91	-4.4751	1.66717937486499e-08	22176501	22200078	1.09931978067651e-50	23283689	26872527
MSK_252152914662_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	83	-1.6468	1.09931978067651e-50	23283689	26872527	NA	NA	NA
