Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	45914119	17361	16987	0.0153	NA	NA	NA	1.15726580359689e-19	45901735	45919499
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45915806	45986208	36	36	0.5479	1.15726580359689e-19	45901735	45919499	2.41416037370383e-23	45983532	46002887
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45987333	72537426	10497	10316	0.0084	2.41416037370383e-23	45983532	46002887	3.12435609687440e-79	72537426	72539143
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.6451	3.1243560968744e-79	72537426	72539143	4.42248797902e-80	72574479	72579311
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17203	0.0061	4.42248797902e-80	72574479	72579311	1.03723594065234e-116	150819879	150819879
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	2.0611	1.03723594065234e-116	150819879	150819879	5.93320266508057e-107	150852858	150852858
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151024118	76	73	-0.0811	5.93320266508057e-107	150852858	150852858	1.75875481644802e-10	151022179	151024118
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151036435	5	5	0.8331	1.75875481644802e-10	151022179	151024118	1.06470455946457e-06	151036435	151042365
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	151038091	1	0	NA	1.06470455946457e-06	151036435	151042365	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151040463	157133150	2678	2620	0.0145	NA	NA	NA	5.07491110953824e-48	157133150	157133150
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.3365	5.07491110953824e-48	157133150	157133150	3.77308936002145e-51	157136342	157136342
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	13045	7e-04	3.77308936002145e-51	157136342	157136342	0	194978218	194978218
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-4.1891	0	194978218	194978218	0	195065867	195065867
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	240183327	16919	16588	-6e-04	0	195065867	195065867	1.31206903540957e-09	240178124	240183327
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240186194	240201877	10	10	0.6813	1.31206903540957e-09	240178124	240183327	1.61296901301378e-09	240201877	240208035
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240203199	247186514	2676	2632	-0.0056	1.61296901301378e-09	240201877	240208035	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37800512	12907	12638	-0.0041	NA	NA	NA	7.4587546037559e-19	37789939	37812045
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	24	-0.5991	7.4587546037559e-19	37789939	37812045	4.61344155201799e-19	37847519	37862351
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	242686945	64895	63602	0.0012	4.61344155201799e-19	37847519	37862351	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	23483775	8146	7972	0.0031	NA	NA	NA	7.3008196158796e-10	23482480	23483775
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	23486888	23495167	5	5	-0.9336	7.3008196158796e-10	23482480	23483775	3.95157388837769e-10	23495167	23498573
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	23498573	32074432	2645	2586	-0.0115	3.95157388837769e-10	23495167	23498573	1.99017303932812e-16	32074432	32074432
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8244	1.99017303932812e-16	32074432	32074432	9.00408836507402e-15	32080848	32080848
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	87966357	19450	19097	0.0042	9.00408836507402e-15	32080848	32080848	2.90308015105402e-08	87959333	87966357
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	87974953	87984547	2	2	-1.3881	2.90308015105402e-08	87959333	87966357	3.63933344484826e-08	87984547	87984547
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	87991120	133189686	13459	13163	0.0015	3.63933344484826e-08	87984547	87984547	7.82844439207712e-09	133187633	133189686
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4418	7.82844439207712e-09	133187633	133189686	3.25640177266121e-09	133194685	133197276
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9587	-0.001	3.25640177266121e-09	133194685	133197276	1.98054174872629e-19	164005577	164005577
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2988	1.98054174872629e-19	164005577	164005577	1.98127179903725e-19	164027724	164036648
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9941	0.0011	1.98127179903725e-19	164027724	164036648	3.19891023862979e-18	194354505	194354505
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194365648	5	5	1.2592	3.19891023862979e-18	194354505	194354505	2.07028971635331e-16	194365648	194366950
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194366950	196822133	997	972	-0.0155	2.07028971635331e-16	194365648	194366950	1.49032361122128e-49	196820428	196905767
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196958467	30	30	-0.9355	1.49032361122128e-49	196820428	196905767	4.97590332563186e-49	196952514	196961238
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	934	2e-04	4.97590332563186e-49	196952514	196961238	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	73637870	19667	19256	0.0034	NA	NA	NA	5.0473743423555e-08	73636513	73637870
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	73639203	73643917	3	3	-1.1209	5.0473743423555e-08	73636513	73637870	2.18317303653137e-08	73643917	73646592
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	73646592	107156970	11442	11225	0.0054	2.18317303653137e-08	73643917	73646592	2.75529398628425e-10	107156970	107156970
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107159916	107161814	2	2	-1.5104	2.75529398628425e-10	107156970	107156970	5.10116561875107e-10	107161814	107161814
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107163423	173224400	18525	18167	-0.0016	5.10116561875107e-10	107161814	107161814	1.08989999678986e-73	173224400	173224400
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.9504	1.08989999678986e-73	173224400	173224400	4.0841258126685e-76	173228860	173228860
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173659100	192	190	0.02	4.0841258126685e-76	173228860	173228860	5.0795531105392e-20	173659100	173659100
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173660684	173660684	1	0	NA	5.0795531105392e-20	173659100	173659100	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.068	NA	NA	NA	7.26670216164287e-21	173666072	173666072
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3990	-0.0043	7.26670216164287e-21	173666072	173666072	7.69494324694848e-17	187330240	187330240
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	1.3178	7.69494324694848e-17	187330240	187330240	1.49890703772440e-15	187338465	187346058
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	188219215	337	330	-7e-04	1.4989070377244e-15	187338465	187346058	5.76257473217955e-07	188207985	188219215
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188222090	188239227	7	7	-0.6721	5.76257473217955e-07	188207985	188219215	3.70201584886476e-07	188239227	188245678
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188241475	191153613	895	872	-6e-04	3.70201584886476e-07	188239227	188245678	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	730853	221	218	-0.0232	NA	NA	NA	1.65184685048570e-06	725954	730853
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	737829	829954	7	7	0.6987	1.6518468504857e-06	725954	730853	1.00168966300752e-07	829954	873365
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	8750027	2375	2323	-0.01	1.00168966300752e-07	829954	873365	1.55295216858615e-08	8734494	8768055
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.813	1.55295216858615e-08	8734494	8768055	4.71088902117413e-09	8782193	8819532
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	34109454	6906	6774	-0.0053	4.71088902117413e-09	8782193	8819532	8.81730495599541e-10	34095994	34109454
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	34113383	34119834	4	4	-1.0308	8.8173049559954e-10	34095994	34109454	2.12738507660141e-09	34119834	34126838
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	34126838	127434789	25799	25279	-0.0016	2.12738507660141e-09	34119834	34126838	1.50947825195567e-104	127434789	127434789
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-4.6471	1.50947825195567e-104	127434789	127434789	1.37622052074627e-93	127438118	127438118
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	150181399	8534	8354	-1e-04	1.37622052074627e-93	127438118	127438118	1.30558943643473e-09	150166447	150185190
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8221	1.30558943643473e-09	150166447	150185190	4.59893103180168e-10	150201145	150207307
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9725	0.0065	4.59893103180168e-10	150201145	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	31457884	11200	10991	0.0022	NA	NA	NA	4.52225727705983e-65	31456663	31467551
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31467551	31559059	29	29	-0.9915	4.52225727705983e-65	31456663	31467551	8.21357129030734e-61	31558079	31563829
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31563829	32558677	448	444	0.0318	8.21357129030734e-61	31558079	31563829	6.94157198888542e-94	32558677	32558677
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.2412	6.94157198888542e-94	32558677	32558677	5.24454034446112e-99	32600962	32600962
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54035000	8303	8136	0.003	5.24454034446112e-99	32600962	32600962	9.63597724585873e-20	54035000	54035000
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.7576	9.63597724585873e-20	54035000	54035000	5.71827516579832e-22	54042734	54042734
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6308	0.0012	5.71827516579832e-22	54042734	54042734	1.24287897729682e-18	79015901	79018959
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.7781	1.24287897729682e-18	79015901	79018959	4.12964383886895e-18	79091850	79112799
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	92040694	3748	3664	-0.0059	4.12964383886895e-18	79091850	79112799	1.04999696212747e-27	92027701	92047175
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	92047175	92169772	18	18	-0.8148	1.04999696212747e-27	92027701	92047175	8.93665142467001e-28	92160084	92189334
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	92181575	150684499	18927	18528	-0.001	8.93665142467001e-28	92160084	92189334	7.67731545396693e-150	150684499	150684499
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	150687486	150688943	2	2	-5.5981	7.67731545396693e-150	150684499	150684499	1.18336440721418e-141	150688943	150688943
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	150690761	165643653	5177	5075	-0.01	1.18336440721418e-141	150688943	150688943	1.31386752623793e-169	165643653	165643653
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.3445	1.31386752623793e-169	165643653	165643653	2.01977461676115e-166	165650610	165650610
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	166414597	296	293	-0.0449	2.01977461676115e-166	165650610	165650610	2.64759955725278e-170	166414597	166414597
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166418511	166422386	3	3	-4.8663	2.64759955725278e-170	166414597	166414597	1.29640968935142e-142	166422386	166422386
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166425475	170753106	1505	1486	-0.0293	1.29640968935142e-142	166422386	166422386	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5265	8e-04	NA	NA	NA	1.20420445683856e-08	16132924	16135701
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.4448	1.20420445683856e-08	16132924	16135701	2.68128295552056e-08	16140018	16141776
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	148344939	47358	46367	0.0027	2.68128295552056e-08	16140018	16141776	3.09088348725948e-33	148339062	148351344
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148347151	148446884	49	47	0.5698	3.09088348725948e-33	148339062	148351344	1.19689672466932e-30	148440148	148455371
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148451275	158821263	3898	3808	-0.0156	1.19689672466932e-30	148440148	148455371	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.0208	NA	NA	NA	1.32281550472168e-07	581533	581533
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3458	1.32281550472168e-07	581533	581533	3.71909524097654e-07	588865	591112
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	608	-0.0123	3.71909524097654e-07	588865	591112	9.41276656913146e-08	2231804	2234351
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.9924	9.41276656913146e-08	2231804	2234351	2.65422036051914e-08	2251011	2269984
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	2265853	3	0	NA	2.65422036051914e-08	2251011	2269984	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2269984	25120552	7415	7274	-0.0036	NA	NA	NA	1.80169127700927e-15	25120552	25120552
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.80169127700927e-15	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.8721	NA	NA	NA	1.79049303590665e-16	25125700	25125700
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4811	-5e-04	1.79049303590665e-16	25125700	25125700	3.09768965846717e-118	39345557	39352361
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.9282	3.09768965846717e-118	39345557	39352361	7.64023601807816e-108	39504332	39508035
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	57210373	4076	3995	0.0031	7.64023601807816e-108	39504332	39508035	5.0607578496412e-15	57200381	57234518
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57212447	57262363	21	21	0.5816	5.0607578496412e-15	57200381	57234518	1.68078186692170e-16	57253611	57266597
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57263583	85422157	8008	7852	-0.0034	1.6807818669217e-16	57253611	57266597	3.90791037555585e-10	85420037	85422157
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-0.9522	3.90791037555585e-10	85420037	85422157	9.41987212080866e-10	85431319	85434122
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	146264846	19323	18959	0.0046	9.41987212080866e-10	85431319	85434122	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7678	-0.0015	NA	NA	NA	4.86837142480786e-13	22477358	22477358
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.6697	4.86837142480786e-13	22477358	22477358	8.0685680559392e-14	22492603	22492603
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	28827180	1625	1591	-0.0032	8.0685680559392e-14	22492603	22492603	4.6078502010041e-10	28825441	28827180
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28830610	28836164	4	4	-1.0184	4.6078502010041e-10	28825441	28827180	4.98450401864551e-09	28836164	28839082
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28837633	28837633	1	0	NA	4.98450401864551e-09	28836164	28839082	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28839082	70926188	3603	3531	0.0133	NA	NA	NA	8.20755703787757e-71	70926188	70926188
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.9642	8.20755703787757e-71	70926188	70926188	2.09415336715632e-68	70930528	70930528
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24316	-0.0039	2.09415336715632e-68	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135284109	44807	43944	-0.0031	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5828251	2180	2148	-3e-04	NA	NA	NA	6.54681310847655e-10	5827948	5828251
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5832681	5832681	1	0	NA	6.54681310847655e-10	5827948	5828251	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5834025	5839924	5	5	-1.0347	NA	NA	NA	3.60086843336736e-11	5839924	5848930
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5848930	73971970	22188	21733	0.0091	3.60086843336736e-11	5839924	5848930	6.09112978688726e-10	73971970	73971970
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73973459	73974735	2	2	1.5738	6.09112978688726e-10	73971970	73971970	6.07590755511461e-11	73974735	73974735
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73976782	107157031	10795	10579	0.0043	6.07590755511461e-11	73974735	73974735	3.53653401637878e-07	107148977	107157031
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107160270	107177546	9	9	0.6135	3.53653401637878e-07	107148977	107157031	3.97605403600952e-07	107177546	107183398
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	134450318	10124	9934	-4e-04	3.97605403600952e-07	107177546	107183398	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3658	0.0076	NA	NA	NA	6.28090620689854e-207	9523923	9523923
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.3966	6.28090620689854e-207	9523923	9523923	6.38735410876295e-36	9554149	9554149
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	9	-0.9327	6.38735410876295e-36	9554149	9554149	1.50126532760851e-16	9590351	9626623
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	560	-0.0232	1.50126532760851e-16	9590351	9626623	4.37429787410179e-11	11116883	11116883
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11123452	2	2	-1.5767	4.37429787410179e-11	11116883	11116883	0.000150867538345727	11123452	11125311
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11125311	11130871	4	4	-3.8128	0.000150867538345727	11123452	11125311	3.96601141917777e-98	11130871	11130871
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	70	0.0153	3.96601141917777e-98	11130871	11130871	1.45316158222713e-10	11389830	11419189
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11433210	5	5	-1.0012	1.45316158222713e-10	11389830	11419189	9.82802127656936e-11	11430887	11440927
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11435643	11435643	1	0	NA	9.82802127656936e-11	11430887	11440927	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	85217891	24077	23587	0.0031	NA	NA	NA	1.24492929720698e-08	85215714	85217891
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85219810	85227102	4	4	-1.014	1.24492929720698e-08	85215714	85217891	2.05059300052617e-08	85227102	85228436
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85228436	132289090	16668	16317	0.0061	2.05059300052617e-08	85227102	85228436	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	51296396	12808	12573	-0.0017	NA	NA	NA	9.0620128092959e-08	51294959	51296396
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.1128	9.0620128092959e-08	51294959	51296396	4.92835440918487e-08	51300398	51301682
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56650373	1214	1187	0.0152	4.92835440918487e-08	51300398	51301682	0	56650373	56650373
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	13	-4.3878	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	17264	-0.0038	0	56685341	56685341	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	20426824	517	507	-0.0326	NA	NA	NA	9.58554351695232e-20	20407882	20435941
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20430810	20490129	25	25	-0.6713	9.58554351695232e-20	20407882	20435941	2.33508071717909e-26	20477376	20501524
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20494025	20494025	1	0	NA	2.33508071717909e-26	20477376	20501524	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20495523	26617968	2353	2309	0.018	NA	NA	NA	2.78725407695217e-16	26608712	26624069
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26624069	26679204	11	10	0.8744	2.78725407695217e-16	26608712	26624069	5.8249526860068e-17	26679204	26692124
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26683465	73071404	16513	16156	-7e-04	5.8249526860068e-17	26679204	26692124	2.23465822894476e-14	73061942	73071404
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.9664	2.23465822894476e-14	73061942	73071404	7.44962389840237e-12	73092112	73104540
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	74152538	524	514	0.0225	7.44962389840237e-12	73092112	73104540	2.20609021752565e-07	74150749	74152538
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.3726	2.20609021752565e-07	74150749	74152538	2.1942642929164e-07	74155334	74157425
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	75381596	581	573	0.0234	2.1942642929164e-07	74155334	74157425	5.32880722433182e-09	75379862	75381596
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75382966	75388634	3	3	-1.2363	5.32880722433182e-09	75379862	75381596	4.19134418662952e-09	75388634	75389752
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75389752	106221696	11298	11076	-0.002	4.19134418662952e-09	75388634	75389752	9.18831456586238e-09	106205848	106232699
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106280415	22	21	0.4565	9.18831456586238e-09	106205848	106232699	0.000125661212476348	106260962	106303994
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106281746	106358491	28	28	0.0614	0.000125661212476348	106260962	106303994	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	99632987	31048	30399	-0.0025	NA	NA	NA	1.085327411344e-21	99632987	99632987
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.865	1.085327411344e-21	99632987	99632987	1.00395308076322e-13	99635701	99635701
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	262	0.0146	1.00395308076322e-13	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5365	0.0038	NA	NA	NA	1.54614819480525e-06	14666341	14958374
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15042407	19	19	-0.4278	1.54614819480525e-06	14666341	14958374	1.97019177554223e-07	15037844	15056457
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15043869	32379126	5086	4982	0.0281	1.97019177554223e-07	15037844	15056457	3.17165051422838e-08	31801065	32529486
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	44	0.3429	3.17165051422838e-08	31801065	32529486	9.36732831465694e-11	33522601	34061029
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	75093957	9905	9710	0.0014	9.36732831465694e-11	33522601	34061029	3.66886384570384e-26	75093957	75093957
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	2.4673	3.66886384570384e-26	75093957	75093957	2.1948599747013e-28	75100865	75100865
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	600	-0.0146	2.1948599747013e-28	75100865	75100865	1.82912664311718e-18	76923844	76925748
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.993	1.82912664311718e-18	76923844	76925748	2.79857023386486e-15	76940218	76942679
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4404	-0.0085	2.79857023386486e-15	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	412	0.0174	NA	NA	NA	7.16704291467593e-14	1028979	1028979
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.9221	7.16704291467593e-14	1028979	1028979	1.94609509580774e-13	1030766	1030766
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	425	0.0296	1.94609509580774e-13	1030766	1030766	1.59583072947598e-10	1903358	1904451
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.4161	1.59583072947598e-10	1903358	1904451	5.88036408308003e-12	1906391	1906391
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	32828797	11564	11314	0.0096	5.88036408308003e-12	1906391	1906391	1.18531271283432e-96	32828797	32828797
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.7556	1.18531271283432e-96	32828797	32828797	1.44881645894810e-100	32832642	32832642
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36634734	1433	1397	0.0144	1.4488164589481e-100	32832642	32832642	4.67258802249997e-12	36633313	36637908
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-1.0512	4.67258802249997e-12	36633313	36637908	9.38147871557857e-06	36644002	36649076
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36673853	10	10	-0.1344	9.38147871557857e-06	36644002	36649076	4.19981245593663e-44	36673853	36673853
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	2.0061	4.19981245593663e-44	36673853	36673853	1.93737636780563e-53	36684619	36684619
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36760017	32	32	-0.0326	1.93737636780563e-53	36684619	36684619	1.01338207763628e-14	36757716	36762918
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36761288	36778929	12	12	-0.8742	1.01338207763628e-14	36757716	36762918	3.72256461420436e-19	36775716	36780629
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36780629	41521544	1968	1914	0.0274	3.72256461420436e-19	36775716	36780629	5.1629275564728e-71	41518222	41526558
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	65	-0.7203	5.1629275564728e-71	41518222	41526558	1.92754174084798e-76	41706870	42143048
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	58534378	5955	5831	0.0169	1.92754174084798e-76	41706870	42143048	2.6683118472757e-142	58534378	58534378
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58536986	58540522	2	2	-5.6695	2.6683118472757e-142	58534378	58534378	1.01184146748060e-131	58540522	58540522
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58544106	78653545	7722	7543	0.0042	1.0118414674806e-131	58540522	58540522	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	63445177	19300	18898	-0.0033	NA	NA	NA	3.42984511255029e-11	63441505	63445177
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	63451647	63465530	5	4	-1.1316	3.42984511255029e-11	63441505	63445177	2.41231149280884e-10	63465530	63469303
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	63469303	76116026	3659	3591	-0.0213	2.41231149280884e-10	63465530	63469303	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	476	-0.0036	NA	NA	NA	1.74063879078426e-23	1398325	1398325
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.5384	1.74063879078426e-23	1398325	1398325	2.13192407092056e-23	1400840	1400840
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1797537	185	183	-0.0287	2.13192407092056e-23	1400840	1400840	2.02044790678128e-11	1797537	1797537
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1798246	1799778	2	2	1.7911	2.02044790678128e-11	1797537	1797537	4.00796862187406e-11	1799778	1799778
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1801091	11448975	4491	4389	0.0355	4.00796862187406e-11	1799778	1799778	3.6766334318029e-10	11448975	11448975
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.7167	3.6766334318029e-10	11448975	11448975	1.6521359743181e-10	11452390	11452390
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	20841320	4148	4071	0.0243	1.6521359743181e-10	11452390	11452390	3.66270477585226e-10	20810051	20847760
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20890025	14	14	-0.6058	3.66270477585226e-10	20810051	20847760	4.4851628696623e-10	20887746	20901410
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20897098	39831223	3059	2999	0.0022	4.4851628696623e-10	20887746	20901410	1.20046283991526e-68	39831223	39831223
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39832970	39838646	2	2	-4.0948	1.20046283991526e-68	39831223	39831223	1.96832276854088e-66	39838646	39838646
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39846390	63788698	10662	10442	0.0241	1.96832276854088e-66	39838646	39838646	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	570	-0.0052	NA	NA	NA	6.49278496651875e-15	1499421	1506379
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8389	6.49278496651875e-15	1499421	1506379	1.81494869963400e-14	1532433	1546858
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20545	0.0011	1.814948699634e-14	1532433	1546858	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13182	-0.0114	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22679305	2985	2919	0.0045	NA	NA	NA	4.13793803533631e-25	22667608	22686731
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22682428	22725305	20	19	0.8564	4.13793803533631e-25	22667608	22686731	3.07300046805507e-26	22715919	22735036
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	47727982	12752	12503	0.0127	3.07300046805507e-26	22715919	22735036	9.3423429141478e-07	47708562	47740900
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47730290	47791848	17	17	0.4835	9.3423429141478e-07	47708562	47740900	3.45587188714398e-07	47777763	47807957
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47794480	49571068	783	769	-0.0078	3.45587188714398e-07	47777763	47807957	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.5747	NA	NA	NA	1.85690841597492e-19	94062	94062
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6838	1.85690841597492e-19	94062	94062	3.12318824889638e-26	104732	106242
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	266212	114	112	-0.0028	3.12318824889638e-26	104732	106242	5.98135130507237e-10	266212	266212
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.8926	5.98135130507237e-10	266212	266212	3.18871851798399e-12	267079	267079
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1431411	660	647	0.079	3.18871851798399e-12	267079	267079	4.22852478100436e-10	1431411	1431411
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.5667	4.22852478100436e-10	1431411	1431411	2.6371218260705e-09	1432953	1434970
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2283668	589	580	0.0396	2.6371218260705e-09	1432953	1434970	4.21737012760867e-05	2269775	2291993
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2284493	2304398	24	23	0.4022	4.21737012760867e-05	2269775	2291993	2.84972705348616e-06	2299493	2313752
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	382	0.0134	2.84972705348616e-06	2299493	2313752	0	2708113	2711273
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	26269430	8951	8792	0.9928	0	2708113	2711273	1.73936755685516e-150	26269430	26269430
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	26273307	26275542	3	3	-3.9839	1.73936755685516e-150	26269430	26269430	1.47344860069145e-147	26275542	26275542
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	26277201	154017980	36038	35305	0.9925	1.47344860069145e-147	26275542	26275542	9.94399530569616e-13	154005945	154023900
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154079002	21	21	1.565	9.94399530569616e-13	154005945	154023900	4.67667571214268e-10	154070179	154093013
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	121	1.0042	4.67667571214268e-10	154070179	154093013	5.10298419039058e-124	154578922	154599547
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0242	5.10298419039058e-124	154578922	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-3.9049	NA	NA	NA	1.01590760551089e-24	3219200	3772482
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.7412	1.01590760551089e-24	3219200	3772482	3.07173109986859e-18	5422507	6652845
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	170	-3.7192	3.07173109986859e-18	5422507	6652845	1.90199237510570e-11	7027599	7193174
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7653082	158	156	-2.6416	1.9019923751057e-11	7027599	7193174	1.26118175142373e-08	7614571	7660965
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-4.0802	1.26118175142373e-08	7614571	7660965	5.77434867197349e-10	7717556	7726921
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7749796	10	9	-1.6921	5.77434867197349e-10	7717556	7726921	3.64356462180834e-05	7745143	7782532
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7751430	10513747	437	424	-3.6226	3.64356462180834e-05	7745143	7782532	7.78451661369125e-22	10511255	10535786
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	17	-0.7608	7.78451661369125e-22	10511255	10535786	8.98291730604787e-06	10655750	12533900
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13104920	193	193	-2.612	8.98291730604787e-06	10655750	12533900	0.00276503822389906	12958620	13114169
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.3961	0.00276503822389906	12958620	13114169	1.27898012099824e-10	13129843	13133803
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13153920	13	11	-4.1209	1.27898012099824e-10	13129843	13133803	0.0661984770507279	13148290	13233514
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13155705	13259414	30	30	-3.0759	0.0661984770507279	13148290	13233514	2.11703390808184e-05	13215006	13320153
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13261173	14352278	368	362	-4.03	2.11703390808184e-05	13215006	13320153	1.49599118371213e-14	14323815	14381372
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	92	-3.0395	1.49599118371213e-14	14323815	14381372	0.000128279145310957	14496442	14530328
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14547168	13	13	-1.3395	0.000128279145310957	14496442	14530328	0.00616300720513318	14530328	14563486
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14694578	31	31	-2.8614	0.00616300720513318	14530328	14563486	1.71767778008615e-06	14644293	14695441
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	14729413	21	21	-4.5016	1.71767778008615e-06	14644293	14695441	0.000333387345175446	14712496	14729413
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14731122	14747796	7	7	-3.2698	0.000333387345175446	14712496	14729413	1.78499586119191e-05	14747796	14765141
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14754064	14883615	20	20	-4.5518	1.78499586119191e-05	14747796	14765141	0.0161655066107102	14852617	15118268
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15690301	315	303	-3.5065	0.0161655066107102	14852617	15118268	0.0988334917942395	15453525	15774136
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15915466	36	36	-4.1711	0.0988334917942395	15453525	15774136	8.1503435101137e-06	15867364	15969469
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	103	-2.9477	8.1503435101137e-06	15867364	15969469	1.17728666807643e-12	16124286	16214032
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	21036503	729	712	-3.9141	1.17728666807643e-12	16124286	16214032	5.80948506642844e-08	21034708	21036503
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.9603	5.80948506642844e-08	21034708	21036503	8.19832171542685e-10	21054519	21057446
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21689031	164	160	-3.8629	8.19832171542685e-10	21054519	21057446	5.44425099483952e-05	21669178	21692175
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21691199	21761022	12	12	-2.3824	5.44425099483952e-05	21669178	21692175	1.61714096747563e-06	21752451	21787090
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	82	-3.9537	1.61714096747563e-06	21752451	21787090	7.6789022274289e-10	22055660	22139807
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.6446	7.6789022274289e-10	22055660	22139807	2.87606277212436e-08	22177335	22181855
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	91	-3.9816	2.87606277212436e-08	22177335	22181855	1.35775730306291e-49	22924754	26870361
MSK_252152914663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	85	-1.3487	1.35775730306291e-49	22924754	26870361	NA	NA	NA
