Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26254	0.0051	NA	NA	NA	1.35202622676346e-100	72537426	72537426
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	1.6383	1.35202622676346e-100	72537426	72537426	4.74329582790632e-68	72579311	72579311
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72771792	23	22	-0.0736	4.74329582790632e-68	72579311	72579311	2.65645430538219e-21	72771792	72771792
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72786560	72856239	11	11	-0.9092	2.65645430538219e-21	72771792	72771792	1.15169564793419e-28	72856239	72866395
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72866395	150839754	17526	16446	-0.0019	1.15169564793419e-28	72856239	72866395	4.68061810698115e-140	150839754	150839754
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-3.2904	4.68061810698115e-140	150839754	150839754	2.13663470949613e-140	150846148	150846148
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	2.13663470949613e-140	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	247186514	35675	33629	-8e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	1619159	596	559	0.0138	NA	NA	NA	1.95660565781088e-08	1619159	1619159
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1621283	1622579	2	2	-1.2194	1.95660565781088e-08	1619159	1619159	3.14856103885217e-09	1622579	1622579
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1624267	34542224	10923	10291	-0.0025	3.14856103885217e-09	1622579	1622579	3.1337614915005e-34	34539740	34542224
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34551222	2	0	NA	3.1337614915005e-34	34539740	34542224	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	16	0.8034	NA	NA	NA	1.02354962651435e-33	34589997	34591681
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	180117780	44849	42118	-0.0046	1.02354962651435e-33	34589997	34591681	1.39396935072744e-13	180115198	180117780
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.8615	1.39396935072744e-13	180115198	180117780	9.16463931832253e-14	180129680	180133468
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	180131608	1	0	NA	9.16463931832253e-14	180129680	180133468	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180133468	242501239	21364	20093	0.0042	NA	NA	NA	3.26275365367927e-59	242496751	242506262
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242505261	1	0	NA	3.26275365367927e-59	242496751	242506262	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242596873	39	36	-0.7121	NA	NA	NA	7.31966231213906e-45	242596654	242601501
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242601501	242689978	27	26	0.082	7.31966231213906e-45	242596654	242601501	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	11893	-0.0012	NA	NA	NA	1.33352954565996e-18	37951628	37953375
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.9716	1.33352954565996e-18	37951628	37953375	2.31212236150195e-17	37961110	37963014
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	164005577	40804	38373	-0.0022	2.31212236150195e-17	37961110	37963014	1.71510614756713e-20	164005577	164005577
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	1.2817	1.71510614756713e-20	164005577	164005577	4.58554373060289e-21	164027724	164027724
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	191219222	9142	8597	0.0013	4.58554373060289e-21	164027724	164027724	4.02299515565706e-22	191219222	191219222
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-1.8577	4.02299515565706e-22	191219222	191219222	5.71730347968219e-21	191222891	191222891
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	191224191	1	0	NA	5.71730347968219e-21	191222891	191222891	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191225602	192546280	423	399	-0.0155	NA	NA	NA	4.53720164708437e-07	192542511	192546280
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.7408	4.53720164708437e-07	192542511	192546280	8.60441038152002e-07	192552734	192554451
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	196835413	1581	1493	-0.0018	8.60441038152002e-07	192552734	192554451	5.96597313304831e-06	196804569	196907040
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196920748	13	12	0.4007	5.96597313304831e-06	196804569	196907040	1.33452056491049e-05	196914122	196929826
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196924077	199329592	970	909	0.0056	1.33452056491049e-05	196914122	196929826	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	57739809	16188	15208	-0.0067	NA	NA	NA	2.76344724337326e-11	57733348	57739809
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57742531	57742531	1	0	NA	2.76344724337326e-11	57733348	57739809	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57745127	57789510	11	10	0.5937	NA	NA	NA	6.19015492626131e-11	57789510	57811097
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57795601	68905670	2233	2086	-0.005	6.19015492626131e-11	57789510	57811097	2.57340029861166e-19	68899247	69075140
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	0.688	2.57340029861166e-19	68899247	69075140	1.10735700355559e-19	69144974	69643272
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	94078581	8450	7925	0.0039	1.10735700355559e-19	69144974	69643272	3.21560581750534e-22	94073863	94086315
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	94136052	23	22	0.5618	3.21560581750534e-22	94073863	94086315	1.41763905788183e-21	94130134	94142545
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94139171	187330240	26998	25339	0.005	1.41763905788183e-21	94130134	94142545	1.00360318109359e-70	187330240	187330240
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.2894	1.00360318109359e-70	187330240	187330240	1.1295454495339e-65	187333619	187333619
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1162	-0.0142	1.1295454495339e-65	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	178040439	52736	49632	-0.0018	NA	NA	NA	1.17842215661485e-35	178040439	178040439
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-2.3556	1.17842215661485e-35	178040439	178040439	5.51985422463192e-31	178045608	178045608
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180346557	910	849	0.0171	5.51985422463192e-31	178045608	178045608	1.13867755352871e-08	180342860	180346557
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180348365	1	0	NA	1.13867755352871e-08	180342860	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180362342	6	6	-0.6902	NA	NA	NA	5.16279650979026e-09	180362342	180365950
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	104	0.005	5.16279650979026e-09	180362342	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	9978	-6e-04	NA	NA	NA	1.06362564707405e-09	29935438	29986370
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30030032	19	17	-0.4271	1.06362564707405e-09	29935438	29986370	2.08176117059216e-10	29995247	30040901
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30031367	32558677	1071	1015	0.0323	2.08176117059216e-10	29995247	30040901	1.13694034662173e-47	32548736	32567462
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	18	0.9797	1.13694034662173e-47	32548736	32567462	4.60437883516145e-56	32631315	32650672
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	65767409	10695	10076	-0.0056	4.60437883516145e-56	32631315	32650672	2.15024387682401e-70	65767409	65767409
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-3.304	2.15024387682401e-70	65767409	65767409	1.1748583149998e-72	65771532	65771532
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	74647491	2888	2712	0.0122	1.1748583149998e-72	65771532	65771532	1.11561489207281e-129	74647491	74647491
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-3.6357	1.11561489207281e-129	74647491	74647491	1.39494740802654e-119	74655219	74655219
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79018959	1141	1084	0.0107	1.39494740802654e-119	74655219	74655219	2.56334414333679e-22	79015901	79024557
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.7694	2.56334414333679e-22	79015901	79024557	1.00619296513848e-22	79079988	79095415
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6375	-0.0064	1.00619296513848e-22	79079988	79095415	1.49482794870258e-22	103841482	103841482
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103860573	3	3	1.5121	1.49482794870258e-22	103841482	103841482	5.83264868342203e-22	103860573	103860573
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103868154	134629897	10481	9882	0.0054	5.83264868342203e-22	103860573	103860573	2.7942941121018e-09	134627341	134629897
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.8613	2.7942941121018e-09	134627341	134629897	3.11385768307627e-09	134635779	134639397
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10016	-0.0024	3.11385768307627e-09	134635779	134639397	2.00846732219484e-17	165643653	165643653
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1572	2.00846732219484e-17	165643653	165643653	1.26517811680429e-16	165650610	165650610
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1700	-0.0136	1.26517811680429e-16	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	64523575	19562	18425	-0.0063	NA	NA	NA	9.06754127077265e-09	64523575	64523575
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.212	9.06754127077265e-09	64523575	64523575	1.15919387469914e-08	64532949	64532949
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	118611324	19701	18546	0.0024	1.15919387469914e-08	64532949	64532949	3.29008264527043e-11	118609124	118611324
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.1182	3.29008264527043e-11	118609124	118611324	3.62791068798868e-11	118620875	118622742
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6423	0.0063	3.62791068798868e-11	118620875	118622742	1.48083274885921e-266	133433384	133436265
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.2567	1.48083274885921e-266	133433384	133436265	7.24601056407148e-256	133447868	133448277
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	158821263	10592	10003	0.002	7.24601056407148e-256	133447868	133448277	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	697	-0.0169	NA	NA	NA	8.94608184413207e-11	2231804	2234351
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.9903	8.94608184413207e-11	2231804	2234351	5.00066784311886e-12	2251011	2257255
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25022606	7388	6930	-0.0045	5.00066784311886e-12	2251011	2257255	2.10918475683002e-14	25017905	25022606
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	1.0698	2.10918475683002e-14	25017905	25022606	1.25653976151684e-12	25047250	25047250
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	25120552	26	22	-0.0222	1.25653976151684e-12	25047250	25047250	6.50441448684237e-19	25120552	25120552
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	6.50441448684237e-19	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.7489	NA	NA	NA	5.46650933169885e-20	25125700	25125700
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4624	-0.0054	5.46650933169885e-20	25125700	25125700	1.15000195316112e-159	39345557	39352361
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	0.9417	1.15000195316112e-159	39345557	39352361	1.26782612815326e-130	39504332	39508035
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	414	0.0167	1.26782612815326e-130	39504332	39508035	1.64173308904916e-32	40892587	40892587
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.3603	1.64173308904916e-32	40892587	40892587	1.7531081645227e-35	40897469	40897469
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	125164145	24282	22818	-0.0013	1.7531081645227e-35	40897469	40897469	5.25163064299983e-18	125162733	125164145
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	125171129	125179270	6	6	-0.9822	5.25163064299983e-18	125162733	125164145	6.40938654079238e-20	125179270	125182377
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	125182377	137748793	3850	3646	-0.0028	6.40938654079238e-20	125179270	125182377	1.13808681142350e-90	137737806	137751905
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	32	-0.8994	1.1380868114235e-90	137737806	137751905	4.20165106588243e-73	137919308	137931707
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	144968840	2367	2226	-0.0033	4.20165106588243e-73	137919308	137931707	2.64919879877805e-17	144968840	144968840
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.7551	2.64919879877805e-17	144968840	144968840	2.30665623004221e-21	144970777	144970777
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	145328970	149	137	0.0126	2.30665623004221e-21	144970777	144970777	2.67814707689881e-07	145327758	145328970
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145330767	145334573	3	3	-0.8108	2.67814707689881e-07	145327758	145328970	2.64146494846965e-06	145334573	145336073
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	280	0.0326	2.64146494846965e-06	145334573	145336073	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5154	-6e-04	NA	NA	NA	8.34738428119486e-17	15802255	15802255
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.6294	8.34738428119486e-17	15802255	15802255	7.16783445210413e-17	15807123	15807123
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7126	-0.0021	7.16783445210413e-17	15807123	15807123	5.28122480268844e-11	70926188	70926188
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.3235	5.28122480268844e-11	70926188	70926188	8.52369019465507e-11	70930528	70930528
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	8.52369019465507e-11	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	140145683	24869	23318	-0.0053	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4396	-0.0152	NA	NA	NA	1.73966267258016e-10	13553503	13553503
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.3359	1.73966267258016e-10	13553503	13553503	1.71350011823939e-11	13556315	13556315
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	13557998	1	0	NA	1.71350011823939e-11	13556315	13556315	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13559717	27038538	5044	4760	-0.0107	NA	NA	NA	5.42969338734807e-116	27038538	27038538
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.119	5.42969338734807e-116	27038538	27038538	7.96983636600524e-110	27041812	27041812
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	13954	-0.0076	7.96983636600524e-110	27041812	27041812	3.23448614054874e-16	77917893	77917893
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77926390	1	0	NA	3.23448614054874e-16	77917893	77917893	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928669	77928738	2	2	-1.6204	NA	NA	NA	2.7462994085788e-16	77928738	77928738
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	87940764	2888	2730	-0.004	2.7462994085788e-16	77928738	77928738	5.13056566173609e-09	87937890	87940764
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87943093	87947609	4	4	-0.8647	5.13056566173609e-09	87937890	87940764	4.03615244086288e-09	87947609	87950392
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87950392	114100979	9500	8970	-0.0019	4.03615244086288e-09	87947609	87950392	3.05703965184295e-37	114100979	114100979
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.3989	3.05703965184295e-37	114100979	114100979	2.66427169075113e-36	114106460	114106460
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7320	-0.0092	2.66427169075113e-36	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	15874	-0.0042	NA	NA	NA	1.53938393831754e-33	55112618	55127355
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	33	-0.5744	1.53938393831754e-33	55112618	55127355	7.56554391693654e-35	55203706	55223056
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	131537126	27174	25550	-7e-04	7.56554391693654e-35	55203706	55223056	2.84949286081792e-08	131535289	131537126
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131539800	131541187	2	2	-1.1839	2.84949286081792e-08	131535289	131537126	1.31534307258267e-08	131541187	131541187
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131543020	134450318	1183	1117	-0.0182	1.31534307258267e-08	131541187	131541187	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7884886	3246	3074	0.0059	NA	NA	NA	5.04421545797199e-53	7876756	7896259
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	8015452	50	46	-0.6031	5.04421545797199e-53	7876756	7896259	9.82428011934242e-54	8009244	8020582
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8018443	132289090	41865	39364	0.0018	9.82428011934242e-54	8009244	8020582	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6906	-0.0056	NA	NA	NA	7.3714044657864e-99	37953582	37953582
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-3.9373	7.3714044657864e-99	37953582	37953582	8.86839460963496e-105	37957844	37957844
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4584	-0.0014	8.86839460963496e-105	37957844	37957844	6.10561386195799e-24	49964838	49964838
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9041	6.10561386195799e-24	49964838	49964838	1.05208558721471e-20	49971732	49971732
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1704	-0.0084	1.05208558721471e-20	49971732	49971732	2.48637139871401e-19	56610886	56658479
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	2.48637139871401e-19	56610886	56658479	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.6856	NA	NA	NA	1.82918917620718e-20	56681665	56688605
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	56686863	1	0	NA	1.82918917620718e-20	56681665	56688605	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	100690991	13039	12309	0.0022	NA	NA	NA	4.02069838721278e-11	100690991	100690991
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.3549	4.02069838721278e-11	100690991	100690991	2.47360181891657e-11	100693892	100693892
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4135	-0.0113	2.47360181891657e-11	100693892	100693892	1.40631622331207e-08	113787620	113788788
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.2088	1.40631622331207e-08	113787620	113788788	5.46012151686649e-07	113792974	113794669
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	145	0.019	5.46012151686649e-07	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	0.529	NA	NA	NA	8.2548464296085e-50	19483933	19535787
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40676611	7588	7163	0.0013	8.2548464296085e-50	19483933	19535787	1.42806264908427e-08	40659171	40676611
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	-0.5974	1.42806264908427e-08	40659171	40676611	3.40190572185746e-08	40726930	40746865
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	105597555	23986	22555	-0.0024	3.40190572185746e-08	40726930	40746865	0	105597555	105597555
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.3093	0	105597555	105597555	9.37098011561185e-139	105632168	105632168
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105923686	69	65	-0.055	9.37098011561185e-139	105632168	105632168	1.55047439698066e-14	105917286	105946993
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105945006	1	0	NA	1.55047439698066e-14	105917286	105946993	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	18	-0.6264	NA	NA	NA	5.78938092508333e-25	105998412	106015449
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	86	0.0056	5.78938092508333e-25	105998412	106015449	1.30215735674297e-05	106199156	106234009
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	14	-0.3429	1.30215735674297e-05	106199156	106234009	6.91868699633593e-07	106249962	106260876
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	0.2005	6.91868699633593e-07	106249962	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18848213	19	19	-0.11	NA	NA	NA	0.00131679010017597	18831600	18857376
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	18884436	10	10	-0.5622	0.00131679010017597	18831600	18857376	0.0539444486829179	18860281	19220256
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18886649	19421704	65	59	-0.3002	0.0539444486829179	18860281	19220256	1.31089988099938e-07	19389869	19819961
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	20308014	63	62	-0.6145	1.31089988099938e-07	19389869	19819961	1.10519626575656e-69	20065525	20316992
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32514939	3671	3467	-0.0105	1.10519626575656e-69	20065525	20316992	1.30047914302868e-37	32456500	32520164
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	24	-0.7238	1.30047914302868e-37	32456500	32520164	2.46305777807640e-39	32581730	32664506
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	2.4630577780764e-39	32581730	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74669752	17858	16741	-0.0053	NA	NA	NA	1.46074811307932e-111	74669752	74669752
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.9492	1.46074811307932e-111	74669752	74669752	2.15328431321358e-82	74680439	74680439
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	157	0.0139	2.15328431321358e-82	74680439	74680439	6.50305896107324e-18	75115806	75115806
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.7565	6.50305896107324e-18	75115806	75115806	1.13594597083838e-19	75119713	75119713
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8029	-0.0032	1.13594597083838e-19	75119713	75119713	4.66525318793505e-11	98228743	98232932
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.0839	4.66525318793505e-11	98228743	98232932	1.76137152254641e-11	98239454	98243586
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	856	-0.0127	1.76137152254641e-11	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	4072412	1621	1534	0.0184	NA	NA	NA	1.27026492416507e-07	4068938	4072412
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4074751	4080313	4	4	-0.8412	1.27026492416507e-07	4068938	4072412	1.17221329714364e-08	4080313	4083178
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4083178	22561536	5927	5566	-0.0011	1.17221329714364e-08	4080313	4083178	3.3729048278119e-09	22547406	22567551
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	22617217	7	7	-0.6546	3.3729048278119e-09	22547406	22567551	9.85964603715792e-09	22609825	22636249
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	32379126	3014	2841	0.014	9.85964603715792e-09	22609825	22636249	9.87578372833725e-12	31818957	32532079
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33536526	43	41	0.3347	9.87578372833725e-12	31818957	32532079	2.87117869296728e-15	33517367	33868686
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	57203733	4293	4033	-0.0098	2.87117869296728e-15	33517367	33868686	5.46849446046553e-38	57203733	57203733
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.4253	5.46849446046553e-38	57203733	57203733	4.15824647526956e-39	57206772	57206772
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5256	-8e-04	4.15824647526956e-39	57206772	57206772	9.01926569362598e-28	75093957	75093957
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.6727	9.01926569362598e-28	75093957	75093957	5.4570449959876e-27	75100865	75100865
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	571	-0.0151	5.4570449959876e-27	75100865	75100865	4.64535261027107e-56	76923844	76929598
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	4.64535261027107e-56	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-1.5453	NA	NA	NA	1.95961773752577e-57	76938723	76940218
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4262	-0.0055	1.95961773752577e-57	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13006	0.0074	NA	NA	NA	2.41408809169701e-70	36673853	36675987
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.1092	2.41408809169701e-70	36673853	36675987	4.86850873327311e-74	36682031	36683509
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41564408	2032	1916	0.0134	4.86850873327311e-74	36682031	36683509	8.0064491131172e-18	41549217	41574775
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	42151941	52	51	-0.3178	8.0064491131172e-18	41549217	41574775	1.41545088588783e-16	41710400	42166852
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	12822	0.0084	1.41545088588783e-16	41710400	42166852	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10356	-0.0055	NA	NA	NA	8.74308584818775e-109	36509250	36509250
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-4.0138	8.74308584818775e-109	36509250	36509250	8.72197502297942e-106	36519728	36519728
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	4887	-0.0127	8.72197502297942e-106	36519728	36519728	8.31723689772876e-63	53092949	53092949
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.1031	8.31723689772876e-63	53092949	53092949	1.90049416921275e-61	53099601	53099601
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6354	-0.0126	1.90049416921275e-61	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	459	-0.0076	NA	NA	NA	2.70828583006134e-19	1398325	1398325
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9182	2.70828583006134e-19	1398325	1398325	1.53991539888902e-19	1400840	1400840
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	980	0.0135	1.53991539888902e-19	1400840	1400840	1.30976991617458e-11	3591120	3591120
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.462	1.30976991617458e-11	3591120	3591120	5.36802704920722e-13	3593646	3593646
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	20841320	7784	7311	0.0171	5.36802704920722e-13	3593646	3593646	5.08888564191395e-08	20809612	20854536
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20897098	15	14	-0.4289	5.08888564191395e-08	20809612	20854536	1.06559483974037e-07	20887746	20909791
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	56825794	10537	9932	0.0093	1.06559483974037e-07	20887746	20909791	4.65704317755466e-10	56822197	56825794
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.6915	4.65704317755466e-10	56822197	56825794	2.31338421222442e-10	56840346	56844304
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	558	-0.0045	2.31338421222442e-10	56840346	56844304	6.36363986303906e-10	58203159	58212113
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	14	0.473	6.36363986303906e-10	58203159	58212113	1.20274147148236e-08	58239871	58261341
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63787171	2576	2425	0.0041	1.20274147148236e-08	58239871	58261341	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	543	-0.0063	NA	NA	NA	2.6985078152217e-23	1499421	1511632
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8638	2.6985078152217e-23	1499421	1511632	1.33825216882228e-23	1528899	1544485
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62069950	20841	19602	-0.0047	1.33825216882228e-23	1528899	1544485	1.88015591866860e-08	62068336	62069950
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62070900	62072374	2	2	1.1948	1.8801559186686e-08	62068336	62069950	6.54386292736333e-09	62072374	62073952
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62073952	62419534	140	129	0.0065	6.54386292736333e-09	62072374	62073952	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12645	-0.0073	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2823	0.0096	NA	NA	NA	2.76105507718035e-35	22644243	22679305
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	0.7843	2.76105507718035e-35	22644243	22679305	8.58816007611246e-40	22715919	22721042
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6141	-0.0033	8.58816007611246e-40	22715919	22721042	9.97157246482973e-45	35472378	35472378
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.6322	9.97157246482973e-45	35472378	35472378	1.08615650584733e-41	35476942	35476942
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6594	7e-04	1.08615650584733e-41	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	4926	5	5	0.2709	NA	NA	NA	4.57871353145316e-10	4926	4926
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	94062	94062	1	0	NA	4.57871353145316e-10	4926	4926	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.4861	NA	NA	NA	1.35511833723926e-09	106242	110101
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	13	-0.0011	1.35511833723926e-09	106242	110101	1.71108150559959e-09	124528	127113
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.3511	1.71108150559959e-09	124528	127113	2.54388699303849e-19	129544	130528
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	132689	1	0	NA	2.54388699303849e-19	129544	130528	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132721	1427338	751	712	-0.0275	NA	NA	NA	4.16070339987164e-19	1427338	1431240
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1427392	1427392	1	0	NA	4.16070339987164e-19	1427338	1431240	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.3394	NA	NA	NA	1.79900821872290e-17	1432891	1432953
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	61	-0.0573	1.7990082187229e-17	1432891	1432953	4.94279154308626e-09	1528179	1528282
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530314	3	3	-0.9764	4.94279154308626e-09	1528179	1528282	4.45366099022716e-07	1530314	1533361
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1530474	1530474	1	0	NA	4.45366099022716e-07	1530314	1533361	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2303192	543	512	-0.0262	NA	NA	NA	4.34247328332828e-38	2303192	2303192
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.1835	4.34247328332828e-38	2303192	2303192	2.25734631375223e-45	2304398	2304398
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	369	-0.078	2.25734631375223e-45	2304398	2304398	0	2708291	2711273
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	47727864	16531	15575	0.9933	0	2708291	2711273	2.45623168170240e-64	47725263	47734767
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47734767	47845497	46	42	0.2101	2.4562316817024e-64	47725263	47734767	7.10937804988622e-52	47843433	47906417
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47898068	76998610	6362	5964	0.9601	7.10937804988622e-52	47843433	47906417	5.14663392852777e-44	76998610	76998610
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.2052	5.14663392852777e-44	76998610	76998610	4.67295152077917e-49	77010018	77010018
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	20765	0.9898	4.67295152077917e-49	77010018	77010018	2.07212393069915e-13	154031239	154044828
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.6438	2.07212393069915e-13	154031239	154044828	1.66098587582869e-10	154078401	154085354
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	119	1.0029	1.66098587582869e-10	154078401	154085354	2.04565546604303e-200	154578922	154586690
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	0.0058	2.04565546604303e-200	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3733715	123	120	-3.3534	NA	NA	NA	1.20304560736032e-20	3034907	3772482
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9165	1.20304560736032e-20	3034907	3772482	5.5248357132745e-11	5422507	6692482
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	165	-3.0312	5.5248357132745e-11	5422507	6692482	7.8922483218861e-05	7006750	7231063
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7349064	98	93	-2.2585	7.8922483218861e-05	7006750	7231063	0.337918918377869	7088207	7632577
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7350629	7653082	61	56	-2.6875	0.337918918377869	7088207	7632577	0.00120162492368486	7581867	7663037
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	33	-3.6841	0.00120162492368486	7581867	7663037	3.16640525747743e-08	7703962	7722458
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7996758	85	79	-2.431	3.16640525747743e-08	7703962	7722458	4.47389733762087e-07	7919636	8057124
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	8289709	67	66	-3.3664	4.47389733762087e-07	7919636	8057124	0.00119800141925821	8195174	8463583
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8681965	108	103	-2.728	0.00119800141925821	8195174	8463583	0.00208921084561952	8540974	8823361
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	10513747	196	183	-3.2205	0.00208921084561952	8540974	8823361	1.87730272568784e-22	10511255	10513747
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	1.87730272568784e-22	10511255	10513747	NA	NA	NA
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.3994	NA	NA	NA	5.11429472693906e-06	10645500	11673476
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13090026	194	184	-2.1723	5.11429472693906e-06	10645500	11673476	0.00721631769266025	12972283	13104920
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13090512	13129843	14	13	-1.1646	0.00721631769266025	12972283	13104920	1.92313133095944e-14	13128515	13137597
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14343139	409	383	-3.2638	1.92313133095944e-14	13128515	13137597	0.701180338497533	13987507	14356069
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14359748	7	6	-2.6776	0.701180338497533	13987507	14356069	0.00105342696798890	14352278	14361732
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14380301	11	11	-1.2217	0.0010534269679889	14352278	14361732	2.42255964489339e-05	14379418	14390028
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	16228031	654	622	-2.8896	2.42255964489339e-05	14379418	14390028	5.83629434375957e-06	16019249	16719600
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16229149	22930737	1068	1007	-3.1808	5.83629434375957e-06	16019249	16719600	5.18298611842346e-30	22924754	23283689
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-0.9749	5.18298611842346e-30	22924754	23283689	2.42905310490400e-06	26943701	26995399
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.2117	2.429053104904e-06	26943701	26995399	0.000283593282251428	27007874	27073018
MSK_252152914892_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	28	-0.8961	0.000283593282251428	27007874	27073018	NA	NA	NA
