Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	3316830	870	843	-0.4777	NA	NA	NA	3.94358533490645e-06	3314364	3316830
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	3320251	3322558	2	2	-1.6994	3.94358533490645e-06	3314364	3316830	1.91768010192353e-06	3322558	3326548
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	3323742	3323742	1	0	NA	1.91768010192353e-06	3322558	3326548	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	3326548	7413664	1358	1318	-0.5668	NA	NA	NA	0	7408775	7419346
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7418082	10939978	1487	1441	0.1165	0	7408775	7419346	0	10938738	10942696
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10941525	16704522	2063	1997	-0.5557	0	10938738	10942696	3.4729869749928e-32	16704522	16704522
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16838573	7	7	-1.8059	3.4729869749928e-32	16704522	16704522	1.4561633675522e-05	16838573	16917759
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17094475	11	10	-1.1373	1.4561633675522e-05	16838573	16917759	3.19332008566973e-05	16963812	17127039
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	17200551	30	30	-0.6205	3.19332008566973e-05	16963812	17127039	6.11739321862923e-05	17192590	17205857
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17201651	17216816	9	9	0.0289	6.11739321862923e-05	17192590	17205857	4.01887636590614e-09	17212041	17222215
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17218458	19512475	973	945	-0.5691	4.01887636590614e-09	17212041	17222215	0.000156910697498426	19504888	19513920
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19513920	19522825	5	5	0.0016	0.000156910697498426	19504888	19513920	0.00031049481819296	19521497	19533455
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	19524565	30114644	4346	4224	-0.5705	0.00031049481819296	19521497	19533455	0	30097066	30136953
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	30123745	65142202	13827	13428	0.076	0	30097066	30136953	1.43236488570037e-17	65142202	65142202
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	65143602	65146090	2	2	-1.1105	1.43236488570037e-17	65142202	65142202	4.73114024961449e-09	65146090	65146090
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	65149489	72537426	2903	2835	0.065	4.73114024961449e-09	65146090	65146090	3.05609060670820e-256	72537426	72537426
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	-2.6795	3.0560906067082e-256	72537426	72537426	2.26462241250088e-249	72574479	72574479
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	93597803	6791	6601	0.0521	2.26462241250088e-249	72574479	72574479	0	93587706	93602829
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	93599388	95396255	760	736	0.5174	0	93587706	93602829	1.04033575691707e-09	95384637	95423374
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	95402929	95459245	26	23	0.881	1.04033575691707e-09	95384637	95423374	5.3063402169229e-11	95445534	95465546
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	95461224	95925264	107	103	0.45	5.3063402169229e-11	95445534	95465546	2.19374812397518e-51	95903568	95955859
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	95932286	142723311	7914	7666	0.0597	2.19374812397518e-51	95903568	95955859	4.24338657106482e-58	121052394	142727791
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142725580	144099302	103	97	-0.3673	4.24338657106482e-58	121052394	142727791	2.35752998724867e-44	143994475	144108338
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099712	146294654	560	545	0.0357	2.35752998724867e-44	143994475	144108338	2.00428646070438e-30	146283719	147203277
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147510532	38	37	-0.4903	2.00428646070438e-30	146283719	147203277	5.11208061627097e-45	147508217	147644831
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	149616800	736	713	0.1012	5.11208061627097e-45	147508217	147644831	1.06589773122167e-172	149607729	149623033
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149617905	150819879	522	507	0.5146	1.06589773122167e-172	149607729	149623033	5.2930057971997e-121	150819879	150823073
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.5042	5.2930057971997e-121	150819879	150823073	7.17822262064365e-76	150848509	150851439
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.4651	7.17822262064365e-76	150848509	150851439	6.29947922174126e-11	151024118	151026228
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	3	1.553	6.29947922174126e-11	151024118	151026228	3.83271179985369e-08	151036435	151038091
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2605	0.5414	3.83271179985369e-08	151036435	151038091	7.17496151682405e-67	157133150	157133150
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.9102	7.17496151682405e-67	157133150	157133150	1.00910331591529e-79	157136342	157136342
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161373544	1708	1663	0.4906	1.00910331591529e-79	157136342	157136342	9.88282169747729e-13	161373544	161373544
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161377009	161378557	2	2	-0.8917	9.88282169747729e-13	161373544	161373544	4.42095600025521e-12	161378557	161378557
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161379993	167483267	2398	2331	0.484	4.42095600025521e-12	161378557	161378557	1.17468306552968e-10	167479184	167483267
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	9	1.0953	1.17468306552968e-10	167479184	167483267	1.43703154693082e-09	167520743	167529221
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	185979586	7208	6989	0.4993	1.43703154693082e-09	167520743	167529221	3.86297428318318e-22	185979586	185979586
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.392	3.86297428318318e-22	185979586	185979586	9.11788113398456e-23	185988138	185988138
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	207530234	6789	6594	0.5262	9.11788113398456e-23	185988138	185988138	0	207523070	207540128
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	207532089	231081524	8547	8296	0.0605	0	207523070	207540128	0	231078001	231086843
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231086843	234961557	1569	1520	-0.6445	0	231078001	231086843	2.51808651835305e-153	234961557	234961557
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	234964701	234969561	4	4	-4.0848	2.51808651835305e-153	234961557	234961557	2.55106448775748e-143	234969561	234969561
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	234973127	245153422	3931	3828	-0.6665	2.55106448775748e-143	234969561	234969561	0	245147891	245154849
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	245154849	247186514	743	719	0.0916	0	245147891	245154849	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	584056	191	189	0.4663	NA	NA	NA	1.05092156538379e-94	559923	596400
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	587345	52600588	18541	18019	0.073	1.05092156538379e-94	559923	596400	2.32271416388919e-168	52600588	52600588
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	2.32271416388919e-168	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-3.5044	NA	NA	NA	3.97995052628279e-189	52635695	52635695
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	61016554	2602	2514	0.0519	3.97995052628279e-189	52635695	52635695	0	61008603	61022823
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	61018555	66967442	2121	2060	0.5008	0	61008603	61022823	0	66944920	66984624
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66970991	89377705	6849	6633	0.0626	0	66944920	66984624	1.36577826624368e-08	89283054	89382979
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89379689	89410161	11	11	-0.4501	1.36577826624368e-08	89283054	89382979	7.64735695365507e-07	89404145	89649638
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89624945	89890854	35	35	0.0069	7.64735695365507e-07	89404145	89649638	6.59507687202115e-12	89879264	91057122
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	91270311	15	15	-0.5107	6.59507687202115e-12	89879264	91057122	3.86846915188327e-16	91270311	94892170
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	102074208	2442	2370	0.0637	3.86846915188327e-16	91270311	94892170	2.14171881977820e-16	102047624	102082026
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	102078102	102140448	25	24	0.5217	2.1417188197782e-16	102047624	102082026	1.99222159890109e-16	102135910	102150161
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	102141061	140223613	10033	9719	0.0513	1.99222159890109e-16	102135910	102150161	0	140184712	140261404
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	140237605	140237605	1	0	NA	0	140184712	140261404	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	140243958	146571330	2203	2143	0.4817	NA	NA	NA	1.55427000422017e-193	146571330	146571330
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146585707	2	2	-4.7227	1.55427000422017e-193	146571330	146571330	4.86340918253089e-195	146585707	146585707
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146589486	146592775	2	0	NA	4.86340918253089e-195	146585707	146585707	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	161702896	4503	4351	0.4845	NA	NA	NA	4.51989422273547e-262	161691043	161722257
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	161704227	163651046	764	745	0.8252	4.51989422273547e-262	161691043	161722257	7.24976037642035e-258	163584149	163716465
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	163659654	242689978	27482	26623	0.4931	7.24976037642035e-258	163584149	163716465	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	16399468	6066	5886	0.0585	NA	NA	NA	3.55523758525364e-78	16398058	16401916
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	16401916	16480890	41	40	-0.7113	3.55523758525364e-78	16398058	16401916	1.53829126053625e-77	16479449	16483357
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	16483357	75798154	20774	20174	0.0517	1.53829126053625e-77	16479449	16483357	2.62142630179064e-22	75783255	75850223
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	75875904	13	13	-0.4142	2.62142630179064e-22	75783255	75850223	1.25761701390741e-09	75868882	76013273
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	89475107	3747	3647	0.0626	1.25761701390741e-09	75868882	76013273	1.46926570146384e-31	89473678	89475107
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.7832	1.46926570146384e-31	89473678	89475107	5.99011923209935e-30	89500935	89500935
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	101204759	1908	1850	0.0718	5.99011923209935e-30	89500935	89500935	1.09790531279676e-08	101186388	101209166
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101206426	101246854	20	20	0.452	1.09790531279676e-08	101186388	101209166	1.94692310158708e-09	101241128	101259002
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101248558	133189686	11127	10766	0.0567	1.94692310158708e-09	101241128	101259002	3.74653965230430e-12	133189686	133189686
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4623	3.7465396523043e-12	133189686	133189686	7.89541214895235e-13	133194685	133194685
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9474	0.0541	7.89541214895235e-13	133194685	133194685	1.66390448278295e-39	164005577	164009321
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.5897	1.66390448278295e-39	164005577	164009321	5.08104623581209e-27	164023502	164027724
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164938650	219	215	0.112	5.08104623581209e-27	164023502	164027724	6.88220063318505e-06	164936461	164938650
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164940763	164946757	2	2	1.1903	6.88220063318505e-06	164936461	164938650	3.03913649078755e-08	164946757	164948576
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164948576	194354505	9929	9625	0.0607	3.03913649078755e-08	164946757	164948576	5.35945139158317e-13	194353315	194354505
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194365648	5	5	0.9445	5.35945139158317e-13	194353315	194354505	7.31298490860223e-12	194365648	194366950
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194366950	196822133	997	967	0.0829	7.31298490860223e-12	194365648	194366950	2.04473494673521e-37	196820428	196835413
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	29	-0.5524	2.04473494673521e-37	196820428	196835413	7.57070225607701e-36	196957322	196966631
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	922	0.1024	7.57070225607701e-36	196957322	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	8	-0.7659	NA	NA	NA	1.83019040701183e-13	53781	65688
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	1991600	681	663	0.1119	1.83019040701183e-13	53781	65688	1.19718902372645e-11	1979385	2038143
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	2010549	2097816	32	32	0.5351	1.19718902372645e-11	1979385	2038143	1.24212719993857e-36	2080073	2103388
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	2099446	68905670	17711	17190	0.0541	1.24212719993857e-36	2080073	2103388	2.50078229592683e-30	68899247	69085386
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	0.7418	2.50078229592683e-30	68899247	69085386	9.56322851848079e-20	69153675	69643272
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119938753	16479	15987	0.0571	9.5632285184808e-20	69153675	69643272	6.34798487462279e-285	119931046	119944970
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119942405	121371746	434	422	0.5098	6.34798487462279e-285	119931046	119944970	2.39341404653565e-178	121361938	121387093
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	121376671	122779719	383	374	0.0224	2.39341404653565e-178	121361938	121387093	0	122776753	122786406
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122784075	142899467	4684	4542	-0.6628	0	122776753	122786406	7.97044382682784e-11	142896367	142899467
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	142902432	142910912	3	3	0.3992	7.97044382682784e-11	142896367	142899467	7.05506911529447e-11	142910912	142915638
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	142915638	173224400	9210	8946	-0.6591	7.05506911529447e-11	142910912	142915638	4.83428888661135e-34	173224400	173224400
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.903	4.83428888661135e-34	173224400	173224400	5.7000466807595e-33	173228860	173228860
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4148	-0.6629	5.7000466807595e-33	173228860	173228860	6.41464849084617e-63	187330240	187330240
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.7426	6.41464849084617e-63	187330240	187330240	6.72270493942923e-60	187333619	187333619
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1200	-0.6698	6.72270493942923e-60	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2515	0.4904	NA	NA	NA	2.36478162115329e-29	8750027	8750027
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.789	2.36478162115329e-29	8750027	8750027	5.54056874743346e-33	8800001	8800001
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	21480789	3743	3649	0.4798	5.54056874743346e-33	8800001	8800001	0	21470585	21490654
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	35766655	3622	3512	0.06	0	21470585	21490654	2.02360226112231e-275	35759083	35778619
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	35768399	37159342	510	497	0.4979	2.02360226112231e-275	35759083	35778619	8.05692282477904e-293	37155106	37167238
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37161508	56689578	4745	4607	0.0525	8.05692282477904e-293	37155106	37167238	0	56679499	56698797
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56698797	59049686	789	772	-0.6969	0	56679499	56698797	1.00927620673099e-209	59048949	59049686
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59051483	59409736	153	153	0.0126	1.00927620673099e-209	59048949	59049686	8.4211714677414e-232	59402889	59414820
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59414820	134825071	21761	21117	-0.662	8.4211714677414e-232	59402889	59414820	7.69853908905629e-13	134825071	134825071
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	134828588	134831494	2	2	-1.7819	7.69853908905629e-13	134825071	134825071	0.00423909592678665	134831494	134890387
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	134835253	136622209	603	582	-3.0369	0.00423909592678665	134831494	134890387	0	136620800	136622209
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	136623467	136911344	126	123	-0.7238	0	136620800	136622209	1.10576509025459e-254	136908680	136918559
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	136918559	150181399	5191	5031	0.0685	1.10576509025459e-254	136908680	136918559	1.90677802765971e-14	150171154	150181399
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.7295	1.90677802765971e-14	150171154	150181399	1.53950888021331e-14	150202601	150204134
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155416484	1624	1578	0.0594	1.53950888021331e-14	150202601	150204134	6.27911849856326e-08	155411053	155416484
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	3	0.9605	6.27911849856326e-08	155411053	155416484	1.39936729199156e-21	155421443	155427589
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180189516	8155	7888	0.0723	1.39936729199156e-21	155421443	155427589	1.12376500395993e-20	180182580	180194323
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180192214	180362342	12	11	-0.4245	1.12376500395993e-20	180182580	180194323	1.41474694162044e-09	180355807	180365950
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	106	0.1379	1.41474694162044e-09	180355807	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11339	0.0571	NA	NA	NA	1.04885648617182e-242	32558677	32558677
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	-2.6351	1.04885648617182e-242	32558677	32558677	8.1173577336197e-06	32595402	32613538
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32633691	7	7	-0.7935	8.1173577336197e-06	32595402	32613538	0.000230315460840935	32613538	32650672
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	0.0824	0.000230315460840935	32613538	32650672	3.96347704331664e-14	32711957	32720656
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.5779	3.96347704331664e-14	32711957	32720656	1.07397444991737e-67	32723366	32728487
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54033505	8258	8019	0.0687	1.07397444991737e-67	32723366	32728487	2.75974536307743e-109	54033505	54033505
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54035000	1	0	NA	2.75974536307743e-109	54033505	54033505	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.3252	NA	NA	NA	1.71732184013136e-114	54042734	54042734
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	57473192	1321	1288	0.0425	1.71732184013136e-114	54042734	54042734	4.65722275543524e-43	57464041	57482077
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57475656	57672491	72	72	-0.3589	4.65722275543524e-43	57464041	57482077	2.95147542873761e-42	57636890	57718525
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57683389	100582030	10887	10569	0.0585	2.95147542873761e-42	57636890	57718525	6.41048602914844e-08	100580274	100582030
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100587654	100592843	3	3	-0.857	6.41048602914844e-08	100580274	100582030	7.54242488399672e-08	100592843	100599668
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100599668	102013989	420	401	0.0517	7.54242488399672e-08	100592843	100599668	0	102012055	102017781
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102015675	103841482	504	487	-0.6001	0	102012055	102017781	3.32160322147818e-135	103841482	103841482
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.7681	3.32160322147818e-135	103841482	103841482	7.18357454093396e-131	103868154	103868154
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	150942477	16010	15501	-0.6508	7.18357454093396e-131	103868154	103868154	5.04521434612548e-12	150935767	150946915
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	150946915	150961278	6	6	0.1437	5.04521434612548e-12	150935767	150946915	2.37493567531855e-11	150959122	150962420
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	150962420	165643653	5090	4923	-0.6386	2.37493567531855e-11	150959122	150962420	7.49539886590527e-95	165643653	165643653
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.3451	7.49539886590527e-95	165643653	165643653	3.73726956649306e-87	165650610	165650610
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1750	-0.6314	3.73726956649306e-87	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5227	0.0851	NA	NA	NA	8.3773363085711e-15	16135701	16135701
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.5752	8.3773363085711e-15	16135701	16135701	4.0964836427362e-22	16140018	16140018
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	109217320	29571	28709	0.067	4.0964836427362e-22	16140018	16140018	3.51531291478994e-182	109217320	109217320
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-4.3107	3.51531291478994e-182	109217320	109217320	0.00691156848937168	109231462	109233214
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.3832	0.00691156848937168	109231462	109233214	2.13651318053055e-13	109240210	109240210
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4155	0.0606	2.13651318053055e-13	109240210	109240210	1.26107906446315e-16	118611324	118611324
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.3634	1.26107906446315e-16	118611324	118611324	3.72804750464346e-16	118620875	118620875
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3082	0.0738	3.72804750464346e-16	118620875	118620875	9.00487010344703e-173	125831554	125831554
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.0963	9.00487010344703e-173	125831554	125831554	3.54277903200036e-170	125837524	125837524
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3546	0.0696	3.54277903200036e-170	125837524	125837524	1.45029145822094e-11	133426996	133433384
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.748	1.45029145822094e-11	133426996	133433384	3.13932386346702e-12	133448277	133455682
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141409512	3699	3588	0.064	3.13932386346702e-12	133448277	133455682	3.79764546474512e-11	141402937	141413352
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141435643	13	13	0.5776	3.79764546474512e-11	141402937	141413352	1.22557872801843e-10	141432778	141443577
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141690753	118	117	0.0457	1.22557872801843e-10	141432778	141443577	1.35026151944099e-42	141689547	141690753
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.3039	1.35026151944099e-42	141689547	141690753	1.73048493151572e-44	141714168	141714168
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	143503317	659	641	0.085	1.73048493151572e-44	141714168	141714168	1.35407725758018e-10	143500499	143503317
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.0014	1.35407725758018e-10	143500499	143503317	2.24543180767709e-10	143584350	143584350
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	149297742	2523	2452	0.0732	2.24543180767709e-10	143584350	143584350	7.177861366926e-07	149197278	149410229
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149298946	149619471	51	50	-0.1449	7.177861366926e-07	149197278	149410229	4.00409311625681e-08	149579172	149671817
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149626372	151728811	908	886	0.1001	4.00409311625681e-08	149579172	149671817	6.56123220683685e-08	151723833	151730250
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.4948	6.56123220683685e-08	151723833	151730250	1.36320762914544e-07	151740878	151750057
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	156488598	1545	1494	0.0735	1.36320762914544e-07	151740878	151750057	6.59531019773223e-17	156488598	156490484
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156490484	156495904	4	3	1.4477	6.59531019773223e-17	156488598	156490484	6.96903102551636e-14	156492262	156495904
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156497496	158821263	1051	1023	0.0986	6.96903102551636e-14	156492262	156495904	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	0.4284	NA	NA	NA	7.43725097892343e-14	581533	581533
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.4453	7.43725097892343e-14	581533	581533	9.98558646526624e-21	588865	588865
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	593	0.5111	9.98558646526624e-21	588865	588865	6.14075515576314e-22	2234351	2234351
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.8965	6.14075515576314e-22	2234351	2234351	1.68081061830287e-29	2251011	2251011
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	3320638	410	400	0.4634	1.68081061830287e-29	2251011	2251011	5.17657921184096e-205	3313530	3334869
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3323272	25022606	6978	6782	0.0562	5.17657921184096e-205	3313530	3334869	3.95518326153401e-13	25017905	25022606
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	1.0885	3.95518326153401e-13	25017905	25022606	1.52777494430835e-13	25047250	25057567
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	39350798	4941	4798	0.0616	1.52777494430835e-13	25047250	25057567	1.75125707929585e-205	39345557	39352361
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	1.1257	1.75125707929585e-205	39345557	39352361	9.39150516007174e-156	39504332	39508035
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	422	0.0765	9.39150516007174e-156	39504332	39508035	2.65723662506640e-14	40892587	40892587
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.6273	2.6572366250664e-14	40892587	40892587	4.53222688959781e-16	40897469	40897469
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	66702757	6220	6047	0.0502	4.53222688959781e-16	40897469	40897469	0	66700457	66705968
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66705968	98757753	9533	9222	0.809	0	66700457	66705968	0	98750339	98767354
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98761411	100227920	612	591	1.2844	0	98750339	98767354	0	100221371	100235879
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100229373	122469754	7066	6849	0.8139	0	100221371	100235879	6.28301140977213e-09	122465339	122469754
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122475698	122486046	3	3	1.7909	6.28301140977213e-09	122465339	122469754	2.17550478126004e-09	122486046	122490361
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122490361	134563298	3954	3844	0.7992	2.17550478126004e-09	122486046	122490361	7.4593540900373e-11	134548178	134574614
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	134564982	134610351	27	25	1.1694	7.4593540900373e-11	134548178	134574614	9.41957040327004e-09	134594256	134625331
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	134612570	143889160	2773	2688	0.8083	9.41957040327004e-09	134594256	134625331	2.73290381346148e-08	143873583	143919572
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143893146	143994134	26	26	0.4623	2.73290381346148e-08	143873583	143919572	1.46280384509632e-06	143948892	144172829
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143996408	146264846	776	746	0.8582	1.46280384509632e-06	143948892	144172829	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	18124944	6281	6084	-0.6707	NA	NA	NA	0	18109196	18135372
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	18135372	20169756	683	664	0.0327	0	18109196	18135372	2.02882140550392e-133	20135063	20185733
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	20172893	20798129	292	280	0.4545	2.02882140550392e-133	20135063	20185733	6.99750708629295e-102	20791226	20812545
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	20799914	22477358	581	569	0.0575	6.99750708629295e-102	20791226	20812545	1.07815619205239e-11	22477358	22477358
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.3304	1.07815619205239e-11	22477358	22477358	9.7345928971255e-14	22492603	22492603
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	155	0.0564	9.7345928971255e-14	22492603	22492603	3.99460899661327e-10	23338535	23343915
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	1.014	3.99460899661327e-10	23338535	23343915	3.29433805039023e-15	23365926	23377660
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	43599449	4731	4596	0.0719	3.29433805039023e-15	23365926	23377660	4.97348667097117e-14	39130211	44199401
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	67927172	18	18	-0.3336	4.97348667097117e-14	39130211	44199401	3.26635649730497e-09	67915082	70207320
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	311	0.0495	3.26635649730497e-09	67915082	70207320	4.22164420950335e-114	70926188	70926188
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.8045	4.22164420950335e-114	70926188	70926188	5.50311706056539e-100	70930528	70930528
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9632	0.0482	5.50311706056539e-100	70930528	70930528	3.82201071855502e-21	100348045	100348045
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.7511	3.82201071855502e-21	100348045	100348045	1.0921059353817e-18	100350814	100350814
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	101087809	329	322	0.0431	1.0921059353817e-18	100350814	100350814	1.01812098868674e-194	101064389	101095349
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	101089802	111974503	3480	3361	0.473	1.01812098868674e-194	101064389	101095349	3.76830224559401e-10	111966278	111980714
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	111975882	111998685	15	15	0.0274	3.76830224559401e-10	111966278	111980714	1.62552984843059e-09	111994926	112004994
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112000077	127377542	5957	5803	0.4925	1.62552984843059e-09	111994926	112004994	0	127362735	127402894
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	127381061	140145683	5168	5007	0.1291	0	127362735	127402894	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	5928266	2107	2026	0.0472	NA	NA	NA	6.72133461004337e-08	5926641	5928266
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5932300	5934406	2	2	1.1912	6.72133461004337e-08	5926641	5928266	4.24919101901603e-08	5934406	5934406
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5936486	13553503	2573	2508	0.06	4.24919101901603e-08	5934406	5934406	7.13772414557853e-13	13553503	13553503
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.3501	7.13772414557853e-13	13553503	13553503	2.85359034239904e-13	13556315	13556315
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	26439576	4816	4684	0.047	2.85359034239904e-13	13556315	13556315	4.17510947475233e-14	26439576	26439576
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26440962	26446184	4	4	-0.9711	4.17510947475233e-14	26439576	26439576	2.04089033687812e-12	26446184	26446184
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26449621	27038538	225	216	0.0649	2.04089033687812e-12	26446184	26446184	7.39877132833015e-21	27038538	27038538
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.9241	7.39877132833015e-21	27038538	27038538	4.61424963321465e-22	27041812	27041812
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	38564782	3764	3650	0.0504	4.61424963321465e-22	27041812	27041812	2.10382532605824e-09	38537336	38588454
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38576711	39116538	19	19	-0.3546	2.10382532605824e-09	38537336	38588454	7.10909371710854e-09	38643804	42209250
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	41971605	45476905	938	915	0.0646	7.10909371710854e-09	38643804	42209250	2.25837459367914e-20	45456945	46384985
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45478103	47074824	89	88	-0.2332	2.25837459367914e-20	45456945	46384985	4.83163971408939e-23	47040444	47099857
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47078975	67894066	5773	5606	0.0498	4.83163971408939e-23	47040444	47099857	6.95382810886716e-107	67891993	67898770
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67897530	68032304	60	59	-0.6856	6.95382810886716e-107	67891993	67898770	1.06227077343358e-105	68028901	68041193
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68041193	71025439	1335	1293	0.074	1.06227077343358e-105	68028901	68041193	0	71023793	71030956
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	71027836	77917870	2882	2795	-0.6045	0	71023793	71030956	3.78609201041493e-19	77917870	77917870
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77917893	1	0	NA	3.78609201041493e-19	77917870	77917870	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.081	NA	NA	NA	4.57132724724348e-19	77928738	77928738
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	88401278	3087	2995	-0.6418	4.57132724724348e-19	77928738	77928738	8.02708329278131e-10	88394169	88407358
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	88402869	88417415	8	8	7e-04	8.02708329278131e-10	88394169	88407358	4.41536715003627e-10	88410225	88421904
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	88418707	100676022	4667	4525	-0.6443	4.41536715003627e-10	88410225	88421904	8.34812691724082e-141	100676022	100678817
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-4.4916	8.34812691724082e-141	100676022	100678817	5.20580986313548e-71	100686753	100686753
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	100846879	61	61	-0.616	5.20580986313548e-71	100686753	100686753	7.82449201759286e-05	100841527	100846879
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100848559	100856918	3	3	0.0724	7.82449201759286e-05	100841527	100846879	3.47933947445589e-32	100856918	100862720
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100858325	112063645	3970	3856	-0.6412	3.47933947445589e-32	100856918	100862720	3.88873591320433e-231	112058192	112065224
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112065224	112444765	149	141	0.0836	3.88873591320433e-231	112058192	112065224	6.18903075709271e-06	112437503	112450053
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112446765	112458576	7	7	0.638	6.18903075709271e-06	112437503	112450053	2.54404532376475e-07	112454711	112463178
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	112459915	126113575	4982	4832	0.0626	2.54404532376475e-07	112454711	112463178	2.73226601008712e-11	126109730	126113575
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126117715	126132468	8	8	-0.5963	2.73226601008712e-11	126109730	126113575	8.16683704518569e-12	126132468	126136220
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126134868	127563278	550	533	0.1046	8.16683704518569e-12	126132468	126136220	8.77450399722276e-12	127556450	127569849
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127598425	14	14	-0.4317	8.77450399722276e-12	127556450	127569849	8.00397656336466e-12	127584239	127612803
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127599309	127599309	1	0	NA	8.00397656336466e-12	127584239	127612803	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127607438	135285645	2703	2620	0.0703	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	660290	182	173	0.1265	NA	NA	NA	9.31374095376634e-09	656306	660290
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	661520	671033	4	4	1.1546	9.31374095376634e-09	656306	660290	3.35742991450064e-10	671033	675008
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	675008	4536833	1411	1358	0.1187	3.35742991450064e-10	671033	675008	6.15750854990735e-09	4533510	4536833
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4543246	4547977	4	4	-0.8521	6.15750854990735e-09	4533510	4536833	3.62439421463359e-09	4547977	4549687
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4549687	5738494	536	520	0.0503	3.62439421463359e-09	4547977	4549687	1.28742726543606e-08	5730121	5747806
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5766615	17	15	-0.406	1.28742726543606e-08	5730121	5747806	5.97573043083231e-45	5763749	5775970
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	66463477	19428	18841	0.0756	5.97573043083231e-45	5763749	5775970	2.16171813774817e-43	66463477	66463477
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.1054	2.16171813774817e-43	66463477	66463477	1.50650677389595e-33	66469412	66469412
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	100326386	11317	11010	0.0704	1.50650677389595e-33	66469412	66469412	0	100325021	100328256
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	100328256	111035314	3564	3445	-0.662	0	100325021	100328256	0	111031371	111037943
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	111037943	112416807	498	489	0.0482	0	111031371	111037943	0	112414845	112418935
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	112418935	113976883	671	644	-0.6452	0	112414845	112418935	1.03736189505923e-11	113972484	113983919
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	113996548	5	5	-1.5101	1.03736189505923e-11	113972484	113983919	1.07702808413007e-11	113992975	113999831
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113999831	129810482	5765	5613	-0.6317	1.07702808413007e-11	113992975	113999831	0	129806820	129812506
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	129812506	134450318	1900	1825	0.0311	0	129806820	129812506	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	7884886	3245	3166	0.0952	NA	NA	NA	1.69684063152583e-12	7859302	7905005
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	7981679	39	39	0.4301	1.69684063152583e-12	7859302	7905005	5.81688162812219e-14	7969578	8006268
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7985677	9523923	457	445	0.0678	5.81688162812219e-14	7969578	8006268	4.89404263982628e-06	9416092	9531133
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.4844	4.89404263982628e-06	9416092	9531133	2.52339390070544e-06	9589725	9630105
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11116883	574	563	0.0588	2.52339390070544e-06	9589725	9630105	4.79061335103257e-08	11110735	11116883
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	0.7336	4.79061335103257e-08	11110735	11116883	7.98416543816275e-09	11140421	11147675
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	27538318	5783	5609	0.0581	7.98416543816275e-09	11140421	11147675	1.33075878764175e-07	27536526	27538318
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	27539643	27542280	3	3	-0.8327	1.33075878764175e-07	27536526	27538318	2.14341591683553e-77	27542280	27542280
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	27544931	27546507	2	2	-0.3998	2.14341591683553e-77	27542280	27542280	0.0216143347374078	27546507	27666100
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	27548947	31171313	1033	1002	0.0611	0.0216143347374078	27546507	27666100	5.1959077138615e-19	31081498	31192445
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31173065	31298659	41	40	0.4657	5.1959077138615e-19	31081498	31192445	1.61756882336859e-17	31287684	31308483
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	34308659	975	943	0.0853	1.61756882336859e-17	31287684	31308483	3.3114370747403e-09	34308659	34308659
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34424331	34647417	2	2	-1.1336	3.3114370747403e-09	34308659	34308659	2.02416584532763e-14	34647417	34647417
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36244407	54105677	6423	6251	0.076	2.02416584532763e-14	34647417	34647417	6.9082892213605e-71	54101783	54109364
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54107237	54261210	52	49	-0.5997	6.9082892213605e-71	54101783	54109364	6.06559433255529e-72	54253825	54264563
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54264563	112058383	19201	18674	0.0673	6.06559433255529e-72	54253825	54264563	1.80041857739e-17	112049481	112065306
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112059870	112079330	8	8	0.5454	1.80041857739e-17	112049481	112065306	1.11345113610578e-06	112072064	112084577
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112081805	115212914	920	892	0.037	1.11345113610578e-06	112072064	112084577	6.02714519669879e-273	115204634	115227486
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	115216698	116611234	552	538	0.526	6.02714519669879e-273	115204634	115227486	8.82494971695468e-301	116605791	116618869
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	116612796	130694393	5184	5004	0.0895	8.82494971695468e-301	116605791	116618869	2.24883138812230e-14	130694393	130694393
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.598	2.2488313881223e-14	130694393	130694393	3.02832317394138e-14	130701040	130701040
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	90	0.0458	3.02832317394138e-14	130701040	130701040	2.41724449874757e-32	130943064	130943064
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.3496	2.41724449874757e-32	130943064	130943064	1.86307521129022e-23	130946248	130946248
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	535	0.1462	1.86307521129022e-23	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	22590186	1393	1354	0.0691	NA	NA	NA	0	22574337	22597999
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22593084	34212770	4519	4390	0.4904	0	22574337	22597999	0	34212770	34223960
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34223960	34566316	96	92	-0.6541	0	34212770	34223960	9.07616877740015e-12	34559519	34572045
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34568451	34598642	18	17	-0.0629	9.07616877740015e-12	34559519	34572045	2.06967345228681e-17	34592997	34603352
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34601014	37953582	1312	1277	-0.6605	2.06967345228681e-17	34592997	34603352	1.44014268078958e-105	37953582	37953582
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.852	1.44014268078958e-105	37953582	37953582	4.3902157270096e-121	37957844	37957844
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4744	-0.6649	4.3902157270096e-121	37957844	37957844	4.50839022129872e-16	49964838	49964838
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	0.8873	4.50839022129872e-16	49964838	49964838	6.09564449096974e-15	49971732	49971732
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56352475	1749	1695	-0.6588	6.09564449096974e-15	49971732	49971732	4.94325524452638e-171	56352475	56352475
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56356167	56371959	9	9	-3.1104	4.94325524452638e-171	56352475	56352475	3.68692821066794e-107	56371959	56371959
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56377361	56650373	46	45	-0.6247	3.68692821066794e-107	56371959	56371959	3.14531316902569e-20	56646284	56658479
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.1108	3.14531316902569e-20	56646284	56658479	6.04903401418746e-31	56685341	56688605
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	89659397	8252	7993	-0.6565	6.04903401418746e-31	56685341	56688605	3.51174393107358e-80	89659397	89659397
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.1203	3.51174393107358e-80	89659397	89659397	3.36103873483779e-75	89662326	89662326
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	93834338	1709	1660	-0.645	3.36103873483779e-75	89662326	89662326	0	93832633	93836916
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	93836916	95353249	673	651	0.0664	0	93832633	93836916	0	95350712	95353495
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	95353495	100690991	2403	2317	-0.6576	0	95350712	95353495	1.77687264314940e-22	100690991	100690991
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.5242	1.7768726431494e-22	100690991	100690991	1.13975190117971e-34	100693892	100693892
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4431	-0.6589	1.13975190117971e-34	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19478367	54	50	-0.2153	NA	NA	NA	5.92746421850027e-21	19455232	19540294
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19483933	69086125	17574	17043	0.0641	5.92746421850027e-21	19455232	19540294	2.46120557490249e-26	69081023	69092211
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69100795	8	8	0.639	2.46120557490249e-26	69081023	69092211	6.13130372983158e-33	69095909	69106345
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69102970	105850033	14066	13677	0.0697	6.13130372983158e-33	69095909	69106345	4.30776403980596e-31	105850033	105850033
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-1.1978	4.30776403980596e-31	105850033	105850033	1.28844162155050e-15	105875924	105881677
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	172	0.0558	1.2884416215505e-15	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	63313397	16736	16232	0.0585	NA	NA	NA	6.63372903993197e-16	63311952	63316693
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63316693	63335588	10	10	-0.6602	6.63372903993197e-16	63311952	63316693	1.27856605874267e-17	63334135	63338114
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63338114	71611082	3630	3516	0.0862	1.27856605874267e-17	63334135	63338114	0	71607091	71616723
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	71615621	74669752	1335	1287	-0.5646	0	71607091	71616723	5.5484457668387e-68	74669752	74671626
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.0597	5.5484457668387e-68	74669752	74671626	1.35151431181748e-74	74680338	74680439
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	85054510	3831	3706	-0.62	1.35151431181748e-74	74680338	74680439	0	85051418	85055518
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85055518	92762224	3050	2961	0.0787	0	85051418	85055518	0	92755436	92769664
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	92763456	98232932	1812	1752	0.4942	0	92755436	92769664	3.42292322063403e-10	98228743	98232932
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98245361	5	4	1.3784	3.42292322063403e-10	98228743	98232932	3.01015977523490e-09	98245361	98247306
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98247306	99495586	567	554	0.4998	3.0101597752349e-09	98245361	98247306	1.78020634827736e-33	99484960	99507126
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99500996	99632987	68	67	0.0784	1.78020634827736e-33	99484960	99507126	4.83019151397841e-16	99632987	99632987
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.5657	4.83019151397841e-16	99632987	99632987	1.47370593650688e-11	99635701	99636724
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	266	0.085	1.47370593650688e-11	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	457	0.1678	NA	NA	NA	1.45655451786471e-16	1296767	1296767
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	2.0768	1.45655451786471e-16	1296767	1296767	7.9308047048542e-16	1300341	1300341
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2150352	363	354	0.1844	7.9308047048542e-16	1300341	1300341	5.79107029581299e-06	2149000	2150352
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2153036	2156333	2	2	-0.9941	5.79107029581299e-06	2149000	2150352	5.41797405320278e-15	2156333	2161566
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2160318	2160318	1	0	NA	5.41797405320278e-15	2156333	2161566	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2161566	14687636	4626	4502	0.0924	NA	NA	NA	1.24305201421287e-16	14669740	14876356
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	14	-0.3756	1.24305201421287e-16	14669740	14876356	1.27528371146073e-08	15028108	15040558
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	21258019	1773	1721	0.0754	1.27528371146073e-08	15028108	15040558	3.7878157342289e-07	21239284	21477973
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	10	-0.4129	3.7878157342289e-07	21239284	21477973	6.65535590876832e-10	21492912	21508397
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22338034	283	272	0.1189	6.65535590876832e-10	21492912	21508397	4.01329187131748e-21	22333565	22338034
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22617217	11	11	-0.6178	4.01329187131748e-21	22333565	22338034	6.09408833670973e-16	22617217	22625780
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	57276719	7383	7147	0.0847	6.09408833670973e-16	22617217	22625780	0	57274587	57290880
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57288504	68693014	3356	3263	-0.6219	0	57274587	57290880	1.85498683494343e-55	68685696	68732367
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68693086	68710277	2	0	NA	1.85498683494343e-55	68685696	68732367	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-1.255	NA	NA	NA	6.970135650688e-14	68747578	68842364
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1409	-0.6277	6.970135650688e-14	68747578	68842364	1.3022486055111e-19	72917554	72918129
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-1.3983	1.3022486055111e-19	72917554	72918129	4.66288169218132e-12	72964783	73022578
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	76923844	1366	1330	-0.6486	4.66288169218132e-12	72964783	73022578	8.85295397110596e-16	76922411	76933534
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	8.85295397110596e-16	76922411	76933534	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	-1.4051	NA	NA	NA	1.60227332650541e-33	76937156	76944661
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	87252497	3892	3770	-0.6098	1.60227332650541e-33	76937156	76944661	0	87247027	87258561
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87256611	88690571	620	598	0.1534	0	87247027	87258561	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	406	-0.5625	NA	NA	NA	5.29966620011334e-12	1028979	1028979
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.9482	5.29966620011334e-12	1028979	1028979	3.46377430070999e-12	1030766	1031233
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	425	-0.4946	3.46377430070999e-12	1030766	1031233	5.95767818202106e-23	1904451	1904451
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.121	5.95767818202106e-23	1904451	1904451	5.50397737328051e-28	1906391	1906391
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15727076	5445	5277	-0.6002	5.50397737328051e-28	1906391	1906391	1.15191968187589e-27	15727076	15727076
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-2.1742	1.15191968187589e-27	15727076	15727076	2.01002853001441e-14	15733964	15733964
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	26570251	3664	3557	-0.5793	2.01002853001441e-14	15733964	15733964	9.39762111068155e-08	26564122	26576671
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26572553	26584555	8	8	0.0132	9.39762111068155e-08	26564122	26576671	6.04906835556945e-09	26579449	26588986
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26587438	31473186	2068	2005	-0.6221	6.04906835556945e-09	26579449	26588986	6.44036941115952e-07	31462463	31474518
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31474518	31503774	12	12	-1.0807	6.44036941115952e-07	31462463	31474518	9.85343235168585e-09	31499568	31895551
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1773	-0.586	9.85343235168585e-09	31499568	31895551	1.48769019464801e-29	36673853	36675987
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-1.9718	1.48769019464801e-29	36673853	36675987	1.95419481906510e-28	36682031	36683509
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	38308109	785	770	-0.5585	1.9541948190651e-28	36682031	36683509	0	38304416	38309724
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38309724	41514481	1224	1184	0.1296	0	38304416	38309724	2.01284960947182e-25	41506317	41514481
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41515622	41562786	22	22	-0.4891	2.01284960947182e-25	41506317	41514481	2.24445663295697e-14	41561017	41568539
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41564408	41644979	38	37	-0.9557	2.24445663295697e-14	41561017	41568539	1.23885394314920e-10	41636402	41652861
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41647135	41648545	2	0	NA	1.2388539431492e-10	41636402	41652861	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	41710400	8	8	-0.337	NA	NA	NA	8.27393435865236e-35	41706870	42158650
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13261	0.1002	8.27393435865236e-35	41706870	42158650	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	19134694	5821	5652	0.064	NA	NA	NA	7.35453197220756e-136	19133236	19136539
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19136539	19275432	71	69	-0.7029	7.35453197220756e-136	19133236	19136539	9.02626135888413e-138	19273952	19277215
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19277215	25300994	1774	1725	0.0401	9.02626135888413e-138	19273952	19277215	0	25297227	25306789
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	25306789	58357822	10313	10000	-0.6713	0	25297227	25306789	0	58356591	58359797
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	58359797	75243011	4658	4526	0.0434	0	58356591	58359797	2.89705886826677e-16	75235682	75254596
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75247123	75296893	22	21	0.5311	2.89705886826677e-16	75235682	75254596	1.61248180331764e-08	75280844	75308746
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75299455	76116026	305	300	0.0963	1.61248180331764e-08	75280844	75308746	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	10	-0.5627	NA	NA	NA	1.25027008706149e-31	239700	239700
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.3799	1.25027008706149e-31	239700	239700	2.21488260972648e-16	243026	243026
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	1198432	376	362	-0.4618	2.21488260972648e-16	243026	243026	2.39074704351555e-08	1191598	1198432
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1200840	1202176	2	2	0.8642	2.39074704351555e-08	1191598	1198432	3.30595988463591e-14	1202176	1202176
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1203447	1398325	100	95	-0.5599	3.30595988463591e-14	1202176	1202176	4.36533987160589e-73	1398325	1398325
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.7025	4.36533987160589e-73	1398325	1398325	1.42423308576271e-46	1400840	1400840
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1005	-0.4596	1.42423308576271e-46	1400840	1400840	4.97774947751156e-08	3591120	3591120
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.8006	4.97774947751156e-08	3591120	3591120	5.46066044404677e-08	3593646	3593646
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	8234435	2159	2098	-0.4946	5.46066044404677e-08	3593646	3593646	0	8228614	8278231
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8237399	8242802	2	0	NA	0	8228614	8278231	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8274857	9979420	702	683	0.1201	NA	NA	NA	0	9977139	9984119
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9980373	11589825	834	815	-0.4689	0	9977139	9984119	0	11580631	11599120
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11591856	20841320	4087	3966	0.1384	0	11580631	11599120	1.80245044028450e-07	20809612	20870473
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20897098	15	15	-0.3239	1.8024504402845e-07	20809612	20870473	4.05640647102357e-07	20878378	20909791
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	45622242	5618	5451	0.1109	4.05640647102357e-07	20878378	20909791	0	45619531	45629126
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45623632	52200088	2742	2655	-0.5443	0	45619531	45629126	0	52197498	52202917
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52201922	53971805	857	826	0.1476	0	52197498	52202917	9.35156834070936e-08	53971389	53971805
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53977494	53983034	4	4	-0.7492	9.35156834070936e-08	53971389	53971805	9.2404561215404e-08	53983034	53984354
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53984354	57873635	1824	1755	0.1261	9.2404561215404e-08	53983034	53984354	0	57866386	57878951
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57876367	63788698	2677	2592	-0.5795	0	57866386	57878951	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	564	0.0796	NA	NA	NA	2.70603856204998e-57	1506379	1506379
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	8	1.7795	2.70603856204998e-57	1506379	1506379	7.95349901678911e-78	1532433	1532433
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	15338131	4885	4727	0.0593	7.95349901678911e-78	1532433	1532433	0	15323764	15346471
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15339993	17497428	836	814	0.4442	0	15323764	15346471	4.3565695940783e-289	17489688	17504547
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	17499791	21231072	1404	1365	0.045	4.3565695940783e-289	17489688	17504547	1.46930365466630e-08	21228879	21233374
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21233374	21242154	4	4	-0.7761	1.4693036546663e-08	21228879	21233374	6.12771192573348e-08	21242143	21242452
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21242452	26145205	1308	1268	0.0638	6.12771192573348e-08	21242143	21242452	5.77085983248874e-15	26144661	26147112
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26147112	26161111	11	11	-0.6239	5.77085983248874e-15	26144661	26147112	1.13036650775856e-16	26158310	26162094
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	54270915	9273	9003	0.0931	1.13036650775856e-16	26158310	26162094	0	54261152	54280287
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	54272820	62419534	3262	3171	0.5349	0	54261152	54280287	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9905318	4	4	0.1134	NA	NA	NA	0.000590057453836295	9886732	10004854
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9965872	10167413	18	17	-0.4692	0.000590057453836295	9886732	10004854	1.16922767284118e-14	10154777	13600227
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	1.16922767284118e-14	10154777	13600227	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	43645627	11875	11534	0.0609	NA	NA	NA	5.42294423581887e-12	43641648	43645627
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43660918	8	7	0.721	5.42294423581887e-12	43641648	43645627	2.07826326256376e-06	43660918	43664367
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43661998	46922972	1535	1485	0.1177	2.07826326256376e-06	43660918	43664367	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16339714	299	289	0.0897	NA	NA	NA	6.54614939375302e-234	16337763	16347241
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16343980	18123761	831	815	-0.5378	6.54614939375302e-234	16337763	16347241	4.30897848471276e-09	18121820	18123761
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18125356	18131561	4	4	0.3851	4.30897848471276e-09	18121820	18123761	1.31303538254045e-08	18131561	18132555
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18132555	21571489	1386	1359	-0.5449	1.31303538254045e-08	18131561	18132555	7.0740809751096e-07	21564629	21571489
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.2053	7.0740809751096e-07	21564629	21571489	0.00136790178532556	21576859	21584867
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	450	-0.4978	0.00136790178532556	21576859	21584867	1.48794910182965e-79	22667608	22686690
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	21	-1.9871	1.48794910182965e-79	22667608	22686690	3.76710738921788e-117	22713972	22721042
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	37621766	7738	7501	-0.5921	3.76710738921788e-117	22713972	22721042	4.18277713484268e-27	37621766	37621766
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.036	4.18277713484268e-27	37621766	37621766	2.46213792704869e-11	37626069	37626069
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5644	-0.5534	2.46213792704869e-11	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.4872	NA	NA	NA	9.72921440689131e-25	94062	94062
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.0335	9.72921440689131e-25	94062	94062	6.605806726785e-11	104732	108902
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	127779	18	17	-0.0162	6.605806726785e-11	104732	108902	9.67000411137593e-06	124528	127779
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	129104	1	0	NA	9.67000411137593e-06	124528	127779	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129544	132721	4	4	-0.9412	NA	NA	NA	2.05014486878064e-06	132721	134946
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133501	771824	479	463	0.0018	2.05014486878064e-06	132721	134946	5.254018022545e-05	748909	774894
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	772351	797536	19	17	-0.4068	5.254018022545e-05	748909	774894	3.64577674635571e-05	793677	814363
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800669	1431411	255	247	-0.0123	3.64577674635571e-05	793677	814363	6.08821001972486e-14	1431411	1431411
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.8456	6.08821001972486e-14	1431411	1431411	2.15270468622055e-21	1432953	1432953
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	2.15270468622055e-21	1432953	1432953	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	1521019	56	56	-1e-04	NA	NA	NA	5.46611847350789e-10	1519743	1526617
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1522369	1530474	10	10	-0.6752	5.46611847350789e-10	1519743	1526617	1.48371608297078e-08	1529356	1534998
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2372138	618	602	-0.0065	1.48371608297078e-08	1529356	1534998	4.11795066319925e-11	2355802	2376763
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2373235	2418980	55	54	-0.3376	4.11795066319925e-11	2355802	2376763	0.00281956165126064	2406726	2421183
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2426938	9	9	0.0035	0.00281956165126064	2406726	2421183	7.64094314172482e-20	2426938	2426938
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.8244	7.64094314172482e-20	2426938	2426938	7.66465346484209e-14	2428307	2428307
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2708291	251	243	-0.0223	7.66465346484209e-14	2428307	2428307	0	2708113	2712641
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2711273	1	0	NA	0	2708113	2712641	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	112185834	31917	30884	1.1473	NA	NA	NA	0	112148193	112208476
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	112190356	152655026	12543	12146	1.5872	0	112148193	112208476	2.39605983592289e-10	152655026	152655026
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	0.1023	2.39605983592289e-10	152655026	152655026	1.33633753970654e-05	152657445	152669503
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154038318	538	526	1.5548	1.33633753970654e-05	152657445	152669503	5.51889221733902e-08	154028488	154038318
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078401	10	9	2.3659	5.51889221733902e-08	154028488	154038318	8.6481586362133e-10	154078401	154086636
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078819	154078819	1	0	NA	8.6481586362133e-10	154078401	154086636	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154570196	120	118	1.6219	NA	NA	NA	1.23429173559505e-11	154570075	154582414
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154578922	154627446	9	9	0.7989	1.23429173559505e-11	154570075	154582414	0.000895029440190525	154599547	154659376
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154627861	154888224	194	185	0.3609	0.000895029440190525	154599547	154659376	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.7282	NA	NA	NA	2.17186392980997e-33	3223585	3733715
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4425391	9	9	0.0412	2.17186392980997e-33	3223585	3733715	0.0141988205742328	4413507	4948824
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	5593746	7	7	-1.4195	0.0141988205742328	4413507	4948824	0.00202614009012580	4948824	6715636
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	165	-3.2402	0.0020261400901258	4948824	6715636	1.13446082043011e-07	7016814	7201478
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7401540	115	112	-2.3145	1.13446082043011e-07	7016814	7201478	3.06236603529136e-08	7342985	7481187
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	7722458	89	89	-3.4286	3.06236603529136e-08	7342985	7481187	0.000485721854699367	7679075	7788596
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	8043008	84	79	-2.6957	0.000485721854699367	7679075	7788596	6.60740365779038e-07	7936024	8168499
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8047462	8047462	1	0	NA	6.60740365779038e-07	7936024	8168499	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8048263	10515697	364	347	-3.4255	NA	NA	NA	1.36464380691415e-18	10512616	10595079
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	19	-1.1595	1.36464380691415e-18	10512616	10595079	5.10238191517536e-07	11249952	12502304
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.7982	5.10238191517536e-07	11249952	12502304	0.000536672580377044	12533900	12563030
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.9545	0.000536672580377044	12533900	12563030	1.19351383128948e-05	12627138	12700767
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.54	1.19351383128948e-05	12627138	12700767	0.000505124215365836	12804329	12876008
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12999095	59	59	-2.338	0.000505124215365836	12804329	12876008	0.000511231976125963	12964087	13004854
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-1.0793	0.000511231976125963	12964087	13004854	7.26971782322658e-08	13035511	13052633
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13104920	26	26	-2.5493	7.26971782322658e-08	13035511	13052633	2.26551926103925e-06	13089124	13106723
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-0.7947	2.26551926103925e-06	13089124	13106723	3.96208978171854e-06	13121152	13138841
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	41	-2.7786	3.96208978171854e-06	13121152	13138841	8.8627377477752e-06	13166582	13286708
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13644667	165	163	-3.6158	8.8627377477752e-06	13166582	13286708	4.35479837987519e-05	13594931	13644667
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13649497	13700962	9	8	-2.087	4.35479837987519e-05	13594931	13644667	3.86305769428866e-07	13700962	13716000
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13701755	14358464	199	193	-3.7621	3.86305769428866e-07	13700962	13716000	1.59756526845320e-12	14342834	14388689
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	89	-2.8452	1.5975652684532e-12	14342834	14388689	2.3659361862849e-06	14492454	14539230
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.3659361862849e-06	14492454	14539230	NA	NA	NA
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	24	-1.3562	NA	NA	NA	0.000757198303230097	14557473	14581797
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14598838	7	7	-3.4623	0.000757198303230097	14557473	14581797	3.56709487926107e-09	14598838	14598838
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.6742	3.56709487926107e-09	14598838	14598838	9.16226371180104e-07	14644293	14684159
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14700040	13	13	-2.7985	9.16226371180104e-07	14644293	14684159	0.158663902356241	14691724	15112995
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15139441	90	89	-3.5711	0.158663902356241	14691724	15112995	0.000150422792098479	15046358	15176870
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	80	-2.786	0.000150422792098479	15046358	15176870	4.41712669143633e-07	15263754	15303557
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	96	-3.6752	4.41712669143633e-07	15263754	15303557	5.36087257432278e-07	15429742	15433122
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.4821	5.36087257432278e-07	15429742	15433122	3.57700650388899e-09	15447091	15450495
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	29	-3.7574	3.57700650388899e-09	15447091	15450495	0.000292717932297079	15499052	15542314
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15564959	27	26	-2.7607	0.000292717932297079	15499052	15542314	0.00285355611736077	15552815	15573579
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15566377	15583573	6	6	-1.2905	0.00285355611736077	15552815	15573579	3.29751007193721e-12	15582236	15587741
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15920478	57	53	-3.7866	3.29751007193721e-12	15582236	15587741	3.22955611416577e-09	15892492	15956978
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16071977	59	58	-2.5254	3.22955611416577e-09	15892492	15956978	1.29497819581310e-08	16036892	16100397
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	17487972	276	272	-3.4943	1.2949781958131e-08	16036892	16100397	0.0041335365602263	17238655	17792907
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17893954	89	88	-2.9832	0.0041335365602263	17238655	17792907	1.96342134799814e-06	17792907	18073675
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	21036503	408	397	-3.6454	1.96342134799814e-06	17792907	18073675	3.0548269768382e-09	21035621	21041164
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.0105	3.0548269768382e-09	21035621	21041164	1.56701673038316e-08	21048365	21057446
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	254	-3.5294	1.56701673038316e-08	21048365	21057446	7.31029462643142e-05	22041876	22157319
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	10	-2.0499	7.31029462643142e-05	22041876	22157319	1.72078743839687e-06	22178964	22202315
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22930737	92	91	-3.656	1.72078743839687e-06	22178964	22202315	2.64488589799196e-76	22926726	22930737
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-0.4442	2.64488589799196e-76	22926726	22930737	7.27712357453316e-09	26945084	26989053
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.1072	7.27712357453316e-09	26945084	26989053	0.0026182243300155	26990807	27068911
MSK_252152914893_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.8985	0.0026182243300155	26990807	27068911	NA	NA	NA
