Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16698906	5780	5440	0.0869	NA	NA	NA	1.77355224526298e-09	16660353	16799711
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	16961001	14	13	-0.4156	1.77355224526298e-09	16660353	16799711	2.55353769183223e-141	16917759	17114337
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16963812	52376855	14111	13286	-0.0864	2.55353769183223e-141	16917759	17114337	8.76376863708818e-147	52376855	52376855
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52378388	52379645	2	2	1.484	8.76376863708818e-147	52376855	52376855	6.54855008280916e-19	52379645	52379645
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52382011	61543686	3605	3396	-0.1304	6.54855008280916e-19	52379645	52379645	3.23026914931042e-06	61542582	61543686
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61545219	61546720	2	2	-1.054	3.23026914931042e-06	61542582	61543686	9.87217101573108e-25	61546720	61546720
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61548178	61551216	3	3	-1.5892	9.87217101573108e-25	61546720	61546720	1.77379233886831e-26	61551216	61551216
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61552893	72537426	4377	4143	-0.1217	1.77379233886831e-26	61551216	61551216	5.77558438154895e-242	72537426	72539143
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-2.2661	5.77558438154895e-242	72537426	72539143	5.55046658617762e-234	72574479	72579311
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	116029725	13928	13067	-0.125	5.55046658617762e-234	72574479	72579311	2.1806706340157e-11	116029725	116029725
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.362	2.1806706340157e-11	116029725	116029725	1.53529828238861e-11	116033402	116033402
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	118761562	1032	977	-0.1322	1.53529828238861e-11	116033402	116033402	1.27807942777873e-102	118688388	118795064
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	118766119	120333077	560	518	0.1441	1.27807942777873e-102	118688388	118795064	4.32141541559901e-10	120327958	120347824
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120415520	12	11	-0.3485	4.32141541559901e-10	120327958	120347824	1.3245632671233e-09	120383098	120851476
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	121052394	59	57	0.1148	1.3245632671233e-09	120383098	120851476	2.80967452299641e-08	121030970	121052394
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	143238284	8	8	-0.3645	2.80967452299641e-08	121030970	121052394	2.8448962307139e-10	143238284	143623628
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143623628	143659690	18	16	0.1927	2.8448962307139e-10	143238284	143623628	1.11500764625878e-31	143658181	143700072
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143697723	1	0	NA	1.11500764625878e-31	143658181	143700072	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143803856	52	50	-0.4371	NA	NA	NA	3.41931743121939e-06	143800457	143803856
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143805209	143808283	3	3	0.1067	3.41931743121939e-06	143800457	143803856	0.000151011081642072	143808283	143811671
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143809389	144093719	24	23	-0.3272	0.000151011081642072	143808283	143811671	1.30658586028263e-18	144003068	144105332
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1736	0.1546	1.30658586028263e-18	144003068	144105332	4.22066505293701e-80	150819879	150823073
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.6624	4.22066505293701e-80	150819879	150823073	4.50149949772098e-63	150848509	150851439
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.1125	4.50149949772098e-63	150848509	150851439	3.38690264101897e-09	151026228	151026228
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	1.2139	3.38690264101897e-09	151026228	151026228	0	151032967	151032967
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	151036435	2	2	0.9459	0	151032967	151032967	0.00130905432700361	151036435	151042365
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2512	0.1735	0.00130905432700361	151036435	151042365	2.02109208774888e-51	157133150	157133150
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.9247	2.02109208774888e-51	157133150	157133150	8.63526816884666e-60	157136342	157136342
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	176066981	7488	7042	0.1413	8.63526816884666e-60	157136342	157136342	0	176012959	176118697
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	176070852	180673179	1815	1708	0.3959	0	176012959	176118697	4.58083754702141e-271	180651965	180706575
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	180677484	198502681	5195	4900	0.1581	4.58083754702141e-271	180651965	180706575	0	198491147	198512210
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	198512210	211067168	5042	4771	-0.4783	0	198491147	198512210	4.59987291123486e-84	211067168	211067168
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211070042	211079988	4	4	-2.9473	4.59987291123486e-84	211067168	211067168	6.23591389581606e-87	211079988	211079988
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211082419	212578133	449	421	-0.5103	6.23591389581606e-87	211079988	211079988	3.13701627326701e-210	212568008	212587846
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212579946	247186514	12917	12149	-0.1413	3.13701627326701e-210	212568008	212587846	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10836	0.1678	NA	NA	NA	2.29100197910338e-52	34542224	34543992
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	2.29100197910338e-52	34542224	34543992	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	16	1.1137	NA	NA	NA	7.54104613953354e-57	34589997	34591681
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	66357387	11754	11055	0.1613	7.54104613953354e-57	34589997	34591681	8.35013659280183e-15	66357387	66357387
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.5607	8.35013659280183e-15	66357387	66357387	1.16577616825369e-235	66360747	66360747
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	89890854	7059	6680	0.248	1.16577616825369e-235	66360747	66360747	2.20673605595089e-239	89879264	89902365
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	91179406	14	14	-0.3869	2.20673605595089e-239	89879264	89902365	2.33906915876555e-13	91173586	94892170
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91270311	115249749	5761	5402	0.1404	2.33906915876555e-13	91173586	94892170	4.96679268186868e-15	115247758	115249749
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115251898	115258615	5	5	-0.7924	4.96679268186868e-15	115247758	115249749	2.62418905909223e-15	115258615	115258615
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115260545	132405798	4217	3976	0.1422	2.62418905909223e-15	115258615	115258615	6.4940526292693e-13	132397397	132724793
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132724793	132739926	6	6	-0.644	6.4940526292693e-13	132397397	132724793	2.57274759872534e-13	132738691	132747227
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132747227	139769674	2442	2302	0.1264	2.57274759872534e-13	132738691	132747227	1.00710953902123e-35	139667015	139879290
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	139776874	140809632	219	202	0.3515	1.00710953902123e-35	139667015	139879290	1.70384939315808e-11	140793273	140818959
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	140810883	140900372	44	42	0.6627	1.70384939315808e-11	140793273	140818959	2.12015888597103e-14	140887217	140912809
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	140906496	141144823	110	103	0.3446	2.12015888597103e-14	140887217	140912809	3.27951913623233e-16	141126792	141165133
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141149348	141527183	188	176	0.5769	3.27951913623233e-16	141126792	141165133	1.21847120351067e-32	141508228	141553984
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141528800	146571330	1713	1597	0.3501	1.21847120351067e-32	141508228	141553984	6.88417996929415e-18	146552736	146571330
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.4209	6.88417996929415e-18	146552736	146571330	2.69974727610786e-18	146592775	146592775
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	153167113	1872	1759	0.3605	2.69974727610786e-18	146592775	146592775	1.79895697229894e-33	153167113	153167113
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	153168326	153169656	2	2	-1.6808	1.79895697229894e-33	153167113	153167113	2.26781769394188e-99	153169656	153169656
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	153172033	165389488	3831	3614	0.3229	2.26781769394188e-99	153169656	153169656	8.79518400450269e-96	165357783	165392362
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	165390791	165417677	14	13	0.6175	8.79518400450269e-96	165357783	165392362	8.3484784311492e-11	165417677	165430377
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	165421906	169100876	1283	1212	0.1543	8.3484784311492e-11	165417677	165430377	3.17818211056903e-97	169084045	169117621
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	169104547	169104547	1	0	NA	3.17818211056903e-97	169084045	169117621	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	169107844	170041494	406	376	-0.1359	NA	NA	NA	2.56399337471744e-88	170015035	170052562
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	170043974	173264995	1289	1205	0.1492	2.56399337471744e-88	170015035	170052562	1.53447306047784e-126	173247034	173278401
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	173267255	174865589	576	544	-0.1506	1.53447306047784e-126	173247034	173278401	9.84004528807174e-236	174847459	174887976
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	174868854	191379678	5419	5112	-0.493	9.84004528807174e-236	174847459	174887976	0	191341136	191404998
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191388594	207245337	5335	5029	-0.1053	0	191341136	191404998	5.95727269358246e-176	207238870	207255956
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	207247922	208057199	286	271	-0.5176	5.95727269358246e-176	207238870	207255956	5.34329449251836e-32	208057199	208057199
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-2.4713	5.34329449251836e-32	208057199	208057199	3.93881807460571e-31	208066245	208066245
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	213224962	1905	1775	-0.4624	3.93881807460571e-31	208066245	208066245	3.5605221673368e-07	213219060	213224962
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213233047	213240662	2	2	0.5264	3.5605221673368e-07	213219060	213224962	6.97338298374613e-08	213240662	213252006
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213252006	216729717	1350	1270	-0.4766	6.97338298374613e-08	213240662	213252006	0	216721157	216738390
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	216730935	227949124	3629	3407	-0.109	0	216721157	216738390	9.9335683492572e-14	227946001	227949124
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227973265	10	9	0.5311	9.9335683492572e-14	227946001	227949124	2.10238057632302e-12	227973265	227981126
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227976902	242689978	5537	5206	-0.0996	2.10238057632302e-12	227973265	227981126	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	29311953	9856	9266	-0.1472	NA	NA	NA	1.26959934339031e-140	29298016	29328820
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29314120	30743173	517	490	0.1234	1.26959934339031e-140	29298016	29328820	9.58785443426164e-06	30736463	30756139
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	30746189	30764531	10	8	0.5382	9.58785443426164e-06	30736463	30756139	2.71088239775990e-07	30758196	30770607
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	30766134	32074432	412	390	0.0955	2.7108823977599e-07	30758196	30770607	2.29787016929010e-129	32074432	32074432
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.4748	2.2978701692901e-129	32074432	32074432	5.1869472008069e-99	32080848	32080848
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	75479859	16078	15104	0.1446	5.1869472008069e-99	32080848	32080848	1.48512978204729e-20	75464737	75799026
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	15	-0.3394	1.48512978204729e-20	75464737	75799026	0.000151682938701265	75853052	76013273
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	76066005	16	15	0.1804	0.000151682938701265	75853052	76013273	8.46846126761352e-06	76057688	76070315
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76067455	76086048	9	9	-0.344	8.46846126761352e-06	76057688	76070315	4.84403858912517e-08	76081578	76091014
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76088381	99603113	5161	4857	0.1532	4.84403858912517e-08	76081578	76091014	0	99583926	99657358
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99629408	105903282	1804	1691	-0.1219	0	99583926	99657358	0	105868576	105929841
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	105908379	127191618	7298	6919	-0.4981	0	105868576	105929841	0	127179755	127207956
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127193022	133189686	2527	2377	-0.1064	0	127179755	127207956	2.86328227742097e-12	133189686	133189686
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.239	2.86328227742097e-12	133189686	133189686	6.45524695482742e-15	133194685	133194685
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133660356	166	157	-0.1165	6.45524695482742e-15	133194685	133194685	1.83810764968540e-50	133649717	133680759
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133661769	133661769	1	0	NA	1.8381076496854e-50	133649717	133680759	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133664322	164005577	9613	9013	0.177	NA	NA	NA	2.69746960796880e-83	164005577	164005577
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-3.1278	2.6974696079688e-83	164005577	164005577	0	164012645	164012645
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164023502	2	2	0.3863	0	164012645	164012645	0.000118970086264749	164023502	164027724
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164027724	164107951	21	19	-0.5754	0.000118970086264749	164023502	164027724	1.08062325450182e-54	164105613	164112873
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	8956	0.1837	1.08062325450182e-54	164105613	164112873	1.04702014556231e-50	192540351	192546280
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.3957	1.04702014556231e-50	192540351	192546280	3.66992599716374e-07	192552734	192557162
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	196822133	1580	1498	0.3253	3.66992599716374e-07	192552734	192557162	9.40104608046037e-13	196809098	196911055
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	19	-0.1135	9.40104608046037e-13	196809098	196911055	8.37386995050871e-12	196925203	196945209
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	903	0.3302	8.37386995050871e-12	196925203	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	84450	16	15	-0.5934	NA	NA	NA	9.85429044905818e-19	75050	100189
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92093	92093	1	0	NA	9.85429044905818e-19	75050	100189	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	93573	18979157	5828	5497	-0.1073	NA	NA	NA	1.35483815575873e-24	18957355	18989170
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	18985386	19218019	41	38	-0.5469	1.35483815575873e-24	18957355	18989170	1.34303691407843e-25	19201011	19244472
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	19224241	44659553	7015	6607	-0.1382	1.34303691407843e-25	19201011	19244472	3.67788450112238e-16	44646450	44659553
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	44667664	44697745	4	4	0.8679	3.67788450112238e-16	44646450	44659553	2.12477340441565e-16	44697745	44697745
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	44705915	68905670	5528	5173	-0.1395	2.12477340441565e-16	44697745	44697745	0	68905670	68905670
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-3.2286	0	68905670	68905670	1.07870811968071e-166	69165814	69165814
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70519888	178	167	-0.0901	1.07870811968071e-166	69165814	69165814	7.77736896498845e-66	70519888	70519888
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70523201	70551081	15	14	-1.4071	7.77736896498845e-66	70519888	70519888	3.19610291909102e-95	70551081	70551081
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70553214	77208115	2130	2002	-0.129	3.19610291909102e-95	70551081	70551081	0	77202205	77225288
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	77213446	82847882	2132	1995	-0.4953	0	77202205	77225288	0	82821047	82862373
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	82851130	86792558	1282	1204	-0.1289	0	82821047	82862373	0	86783956	86801568
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	86795305	107275274	6968	6546	-0.4977	0	86783956	86801568	5.66386999670177e-41	107275274	107275274
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-2.0962	5.66386999670177e-41	107275274	107275274	9.69850298770289e-40	107281410	107281410
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	154666892	13196	12425	-0.5055	9.6985029877029e-40	107281410	107281410	2.5216800676265e-10	154664054	154670185
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	154668174	154683823	8	8	0.0833	2.5216800676265e-10	154664054	154670185	6.1751136454383e-10	154680745	154690675
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	154686278	155102526	133	122	-0.5217	6.1751136454383e-10	154680745	154690675	3.31379069185457e-59	155068109	155152669
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	155110331	157241755	651	615	-0.138	3.31379069185457e-59	155068109	155152669	3.04589971461631e-282	157199363	157311437
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	157251443	173224400	4496	4244	-0.5009	3.04589971461631e-282	157199363	157311437	2.17956572089099e-10	173224400	173224400
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.6741	2.17956572089099e-10	173224400	173224400	1.39952971568802e-10	173228860	173228860
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5182	-0.5114	1.39952971568802e-10	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	22636768	6746	6390	0.1282	NA	NA	NA	1.08106991361544e-10	22631547	22636768
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	22638781	22638781	1	0	NA	1.08106991361544e-10	22631547	22636768	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	22641267	22655240	7	7	-0.5151	NA	NA	NA	1.27276116767255e-10	22655240	22672749
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	22657917	22657917	1	0	NA	1.27276116767255e-10	22655240	22672749	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	22672749	42662906	5454	5143	0.1207	NA	NA	NA	4.40511789982613e-09	42662906	42662906
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42664919	42666538	2	2	-0.9838	4.40511789982613e-09	42662906	42662906	8.95572549478153e-09	42666538	42666538
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42667950	58307402	3427	3210	0.1041	8.95572549478153e-09	42666538	42666538	0	58293158	58331366
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58308698	68857852	3408	3183	-0.1486	0	58293158	58331366	0	68855834	68864742
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68859738	68862665	2	0	NA	0	68855834	68864742	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68864742	71142084	140	131	-0.975	NA	NA	NA	1.11927833204114e-103	71077546	71166577
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	71151957	80930420	3664	3477	-0.508	1.11927833204114e-103	71077546	71166577	0	80909936	80941872
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80932709	94314659	3629	3416	-0.1436	0	80909936	80941872	0	94312861	94316351
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94316351	177361544	25984	24452	0.5902	0	94312861	94316351	0	177351426	177422009
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177416642	180194323	1180	1102	0.1186	0	177351426	177422009	1.18547131467843e-32	180194323	180194323
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	9	-0.945	1.18547131467843e-32	180194323	180194323	3.92011706988586e-32	180362342	180362342
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	104	0.1224	3.92011706988586e-32	180362342	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.4454	NA	NA	NA	4.30639334256566e-07	183349	211079
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	-0.0658	4.30639334256566e-07	183349	211079	3.22599148370686e-08	232366	252939
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	2915451	1080	1016	-0.4464	3.22599148370686e-08	232366	252939	1.08318291709981e-280	2900712	2925074
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	2918933	6362778	1364	1290	-0.0928	1.08318291709981e-280	2900712	2925074	4.24200427117564e-266	6329130	6396148
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	6364801	29981912	8093	7623	0.1533	4.24200427117564e-266	6329130	6396148	1.05267388753924e-13	29980445	29992946
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29985620	30000990	6	6	0.9314	1.05267388753924e-13	29980445	29992946	3.41769979323527e-10	29992946	30005338
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	31124735	486	448	0.1851	3.41769979323527e-10	29992946	30005338	9.17545636649505e-197	31117597	31144628
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31128871	31134382	3	0	NA	9.17545636649505e-197	31117597	31144628	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31139628	32558677	589	557	-0.3115	NA	NA	NA	1.01111342755397e-103	32558677	32567462
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	-1.972	1.01111342755397e-103	32558677	32567462	3.48949338259356e-15	32626619	32633691
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.4313	3.48949338259356e-15	32626619	32633691	5.88925779968414e-14	32713363	32716255
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	6	-1.7228	5.88925779968414e-14	32713363	32716255	4.14716852013222e-143	32728487	32728487
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7773	-0.163	4.14716852013222e-143	32728487	32728487	2.2175651761915e-129	54035000	54035000
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.648	2.2175651761915e-129	54035000	54035000	3.22539812209041e-152	54042734	54042734
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	56452907	882	824	-0.1359	3.22539812209041e-152	54042734	54042734	4.9434764928698e-190	56435957	56471927
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56454526	89731966	8541	8055	0.1229	4.9434764928698e-190	56435957	56471927	1.00282896993879e-175	89726261	89747791
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	89740115	89740115	1	0	NA	1.00282896993879e-175	89726261	89747791	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	89740622	90297852	246	241	0.5709	NA	NA	NA	4.11637935250934e-172	90290402	90303844
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	90299790	97469051	1712	1617	0.12	4.11637935250934e-172	90290402	90303844	1.57203431399182e-15	97461559	97475925
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	97470257	97514428	21	21	0.5509	1.57203431399182e-15	97461559	97475925	2.44239407854972e-15	97505110	97518324
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	97516017	101024587	1007	950	0.1139	2.44239407854972e-15	97505110	97518324	5.49100703154873e-102	101020516	101024587
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	101028583	101186578	77	71	-0.4959	5.49100703154873e-102	101020516	101024587	6.95726372930465e-112	101186578	101190640
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	101190640	103841482	720	685	0.1407	6.95726372930465e-112	101186578	101190640	3.15831590687378e-215	103841482	103841482
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.5353	3.15831590687378e-215	103841482	103841482	2.03382427759346e-207	103868154	103868154
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	113183124	3329	3127	0.1195	2.03382427759346e-207	103868154	103868154	0	113155619	113207942
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	113190062	121993579	2488	2336	-0.2483	0	113155619	113207942	0	121936821	122020210
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122003324	165643653	15289	14363	-0.4986	0	121936821	122020210	1.91788755284486e-11	165643653	165645537
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-1.3756	1.91788755284486e-11	165643653	165645537	8.00158374472278e-10	165649379	165653315
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1704	-0.5088	8.00158374472278e-10	165649379	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	2183141	693	662	0.5316	NA	NA	NA	0	2165813	2192649
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2186733	69673258	20223	19049	0.1317	0	2165813	2192649	3.13312951267278e-24	69647064	69696995
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69675543	69895671	120	111	-0.1129	3.13312951267278e-24	69647064	69696995	6.40379901138991e-28	69878247	69960167
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69898132	69898132	1	0	NA	6.40379901138991e-28	69878247	69960167	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69901240	101169747	10459	9831	0.1561	NA	NA	NA	0	101159506	101184714
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	101171078	109217320	3465	3269	-0.1387	0	101159506	101184714	5.481242093237e-172	109217320	109217320
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109231462	2	2	-4.9111	5.481242093237e-172	109217320	109217320	0	109231462	109231462
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109233214	109240210	3	2	-1.8182	0	109231462	109231462	6.89030503719709e-22	109240210	109240210
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	112293693	1397	1322	-0.1606	6.89030503719709e-22	109240210	109240210	3.16735604235906e-319	112273897	112314617
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112294983	118611324	2902	2743	0.1444	3.16735604235906e-319	112273897	112314617	3.82135836310061e-200	118611324	118611324
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.0833	3.82135836310061e-200	118611324	118611324	2.99046391292639e-211	118620875	118620875
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2978	0.1451	2.99046391292639e-211	118620875	118620875	1.29666172455203e-173	125831554	125831554
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.6925	1.29666172455203e-173	125831554	125831554	1.56325775484077e-160	125837524	125837524
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3444	0.2793	1.56325775484077e-160	125837524	125837524	4.91332156346708e-56	133426996	133433384
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	1.03	4.91332156346708e-56	133426996	133433384	2.86907922067252e-12	133448277	133455682
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	147702365	6352	5989	0.3174	2.86907922067252e-12	133448277	133455682	5.08336514787539e-12	147702365	147702365
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.003	5.08336514787539e-12	147702365	147702365	5.2972062749237e-11	147707161	147707161
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	150301118	998	930	0.3019	5.2972062749237e-11	147707161	147707161	2.51137663284684e-10	150301118	150301118
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150304339	150306801	2	2	1.5647	2.51137663284684e-10	150301118	150301118	1.27392958686187e-09	150306801	150309339
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150308129	150308129	1	0	NA	1.27392958686187e-09	150306801	150309339	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150309339	158821263	3237	3033	0.3077	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	0.0557	NA	NA	NA	1.55532496295116e-10	581533	581533
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.221	1.55532496295116e-10	581533	581533	3.39306779243878e-12	588865	588865
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2185528	602	566	0.1092	3.39306779243878e-12	588865	588865	1.49803425963620e-09	2154433	2195811
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2190452	2251011	18	17	-0.2961	1.4980342596362e-09	2154433	2195811	3.37587073561958e-09	2243659	2277060
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	34955423	10956	10340	0.0979	3.37587073561958e-09	2243659	2277060	2.30760016131355e-11	34955423	34955423
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	34962834	34970329	3	3	-0.9368	2.30760016131355e-11	34955423	34955423	1.26387278214014e-12	34970329	34970329
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	34978201	40892587	1874	1766	0.1228	1.26387278214014e-12	34970329	34970329	2.62372587265687e-18	40892587	40892587
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.6759	2.62372587265687e-18	40892587	40892587	2.61852522808346e-17	40897469	40897469
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	57089729	3582	3345	0.1097	2.61852522808346e-17	40897469	40897469	0	57076776	57104200
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57091172	108551265	15924	15023	0.4373	0	57076776	57104200	4.6333585223289e-314	108551265	108551265
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108554750	108554750	1	0	NA	4.6333585223289e-314	108551265	108551265	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108558524	108561266	2	2	-0.9549	NA	NA	NA	7.6175696476413e-16	108561266	108561266
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108565465	124462064	4462	4212	0.5223	7.6175696476413e-16	108561266	108561266	0	124448317	124478908
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	124463499	141889183	5447	5130	0.816	0	124448317	124478908	1.65275361033320e-166	141852451	141956196
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141894864	146264846	1572	1470	1.0386	1.6527536103332e-166	141852451	141956196	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5095	0.1671	NA	NA	NA	7.37983849366748e-95	15802255	15802255
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.2419	7.37983849366748e-95	15802255	15802255	3.09794221807325e-88	15807123	15807123
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	47002187	7280	6858	0.1553	3.09794221807325e-88	15807123	15807123	1.38006670171151e-15	44199401	66245109
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	67927172	12	12	-0.4383	1.38006670171151e-15	44199401	66245109	2.80635000547148e-16	67923904	68483889
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	300	0.1245	2.80635000547148e-16	67923904	68483889	7.7434430928173e-22	70926188	70926188
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.694	7.7434430928173e-22	70926188	70926188	2.41800322627758e-19	70930528	70930528
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	92875833	7099	6680	0.12	2.41800322627758e-19	70930528	70930528	3.54179037820757e-24	92840034	92898999
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	92880349	93059152	62	58	-0.2069	3.54179037820757e-24	92840034	92898999	0	93042023	93100066
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93063499	140138746	17706	16660	0.0661	0	93042023	93100066	0	139883011	140138841
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140138841	140145683	3	3	0.3319	0	139883011	140138841	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	5928266	2107	2006	-0.0609	NA	NA	NA	4.09184434575045e-14	5928266	5928266
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5932300	5936486	3	3	1.0502	4.09184434575045e-14	5928266	5928266	1.66274739420864e-13	5936486	5937853
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5937853	13553503	2572	2412	-0.0488	1.66274739420864e-13	5936486	5937853	2.02409363522443e-06	13551930	13553503
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.992	2.02409363522443e-06	13551930	13553503	1.25958028092907e-62	13556315	13556315
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4755	0.1067	1.25958028092907e-62	13556315	13556315	6.47900709338069e-122	27038538	27038538
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.9621	6.47900709338069e-122	27038538	27038538	3.99004780454801e-126	27041812	27041812
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	38564782	3764	3526	0.1339	3.99004780454801e-126	27041812	27041812	4.68921102356344e-09	38528154	38582079
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38576711	39116538	19	18	-0.2436	4.68921102356344e-09	38528154	38582079	7.84400720076752e-09	38659048	42211161
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	41971605	46402308	952	902	0.1504	7.84400720076752e-09	38659048	42211161	1.62444708055116e-18	45478103	46430095
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46404919	46404919	1	0	NA	1.62444708055116e-18	45478103	46430095	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46406159	47172534	110	104	-0.0951	NA	NA	NA	1.69504166285367e-99	47152717	47970511
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	69835856	6566	6194	0.1823	1.69504166285367e-99	47152717	47970511	2.61109075986546e-96	69835856	69837432
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	3	1.339	2.61109075986546e-96	69835856	69837432	7.78440078275039e-32	69839583	69843195
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	85790989	5742	5423	0.2931	7.78440078275039e-32	69839583	69843195	0	85785664	85796408
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	85796408	108424351	8575	8067	-0.5262	0	85785664	85796408	0	108419941	108427222
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	108427222	111007617	632	599	0.2528	0	108419941	108427222	0	111005013	111010098
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111010098	127563278	5995	5642	0.9319	0	111005013	111010098	1.50481492008618e-72	127560827	127566573
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127599309	15	12	0.0034	1.50481492008618e-72	127560827	127566573	9.28151445464108e-35	127598425	127607438
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127607438	135085997	2649	2494	1.0231	9.28151445464108e-35	127598425	127607438	2.71811517907906e-55	135082051	135104029
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135102317	135285645	54	52	0.4203	2.71811517907906e-55	135082051	135104029	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	663904	184	179	-0.3772	NA	NA	NA	1.94518099518580e-07	661520	663904
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	667517	671033	2	2	1.0301	1.9451809951858e-07	661520	663904	4.57988509971765e-14	671033	671033
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	675008	12227265	4680	4422	-0.4623	4.57988509971765e-14	671033	671033	4.10518966660631e-12	12225871	12227265
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12228830	12236593	4	4	0.3898	4.10518966660631e-12	12225871	12227265	4.98969988819439e-11	12236593	12238783
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12238783	24395406	4185	3951	-0.4919	4.98969988819439e-11	12236593	12238783	1.07280743503091e-32	24395406	24395406
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	24400064	24405796	2	2	-2.603	1.07280743503091e-32	24395406	24395406	2.41786404217852e-173	24405796	24405796
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	24413618	55118214	7848	7385	-0.3012	2.41786404217852e-173	24405796	24405796	3.82192206530942e-157	55118214	55123719
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	-1.3954	3.82192206530942e-157	55118214	55123719	9.45115013270324e-211	55207305	55209626
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	79908736	9681	9126	-0.1134	9.45115013270324e-211	55207305	55209626	0	79886532	79919649
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	79910591	107284914	8604	8151	0.2522	0	79886532	79919649	1.80748243348777e-202	107284914	107284914
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-4.1065	1.80748243348777e-202	107284914	107284914	1.16029022228709e-151	107292148	107292148
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9470	0.402	1.16029022228709e-151	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	7899058	3251	3066	0.2826	NA	NA	NA	6.17505907214147e-09	7876756	7915879
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7900758	7951531	19	19	0.6619	6.17505907214147e-09	7876756	7915879	1.00205490385323e-07	7940846	7975671
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7955907	9523923	471	444	0.2892	1.00205490385323e-07	7940846	7975671	6.05016832557332e-14	9456107	9543817
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	12	0.9158	6.05016832557332e-14	9456107	9543817	7.08244161710078e-18	9578398	9604633
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	10462211	330	316	0.2714	7.08244161710078e-18	9578398	9604633	4.75885292008938e-09	10457163	10466791
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	10	-0.2282	4.75885292008938e-09	10457163	10466791	2.13830517149030e-08	10480460	10493984
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11109483	232	213	0.2932	2.1383051714903e-08	10480460	10493984	2.97842526140944e-48	11109483	11109483
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11140421	10	10	1.523	2.97842526140944e-48	11109483	11109483	3.83311610116945e-56	11140421	11140421
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	32916956	7533	7119	0.3058	3.83311610116945e-56	11140421	11140421	0	32913053	32921680
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	32918171	46992235	3614	3424	-0.1706	0	32913053	32921680	6.22181195534839e-11	46992235	46992235
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.3638	6.22181195534839e-11	46992235	46992235	4.08245878272847e-10	46996769	46996769
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	51992672	2225	2098	-0.1465	4.08245878272847e-10	46996769	46996769	2.76722211172248e-18	51969743	52020010
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51994055	52134037	66	60	0.154	2.76722211172248e-18	51969743	52020010	9.82757125112395e-20	52114017	52151141
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52135536	65925733	4772	4517	-0.1477	9.82757125112395e-20	52114017	52151141	0	65867894	65948331
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	65930261	80523687	4733	4417	0.1071	0	65867894	65948331	6.29002774590977e-44	80523687	80523687
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80530084	80538710	6	6	-1.261	6.29002774590977e-44	80523687	80523687	7.84826246471944e-38	80538710	80538710
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80541356	81774893	335	319	0.121	7.84826246471944e-38	80538710	80538710	4.62752853404874e-06	81771892	81774893
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	81778657	81784803	3	3	0.9187	4.62752853404874e-06	81771892	81774893	7.44865722355798e-08	81784803	81786101
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	81786101	92329384	2613	2466	0.0971	7.44865722355798e-08	81784803	81786101	6.93277488533093e-10	92305348	92329384
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92332880	92332880	1	0	NA	6.93277488533093e-10	92305348	92329384	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92335619	92346568	8	8	-0.2462	NA	NA	NA	2.40280790615453e-14	92346568	92349687
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92348429	96828561	1718	1616	-1.0219	2.40280790615453e-14	92346568	92349687	0	96816672	96845017
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	96833551	100624427	1470	1386	-0.4738	0	96816672	96845017	3.26184394570665e-18	100624427	100624427
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	2	-2.0721	3.26184394570665e-18	100624427	100624427	2.17927482763411e-18	100629832	100629832
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	100631726	1	0	NA	2.17927482763411e-18	100629832	100629832	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100634203	130694393	11076	10438	-0.4517	NA	NA	NA	1.81549603482688e-12	130694393	130694393
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.8944	1.81549603482688e-12	130694393	130694393	1.01972739291902e-15	130701040	130701040
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	85	-0.5	1.01972739291902e-15	130701040	130701040	1.18121782787344e-34	130943064	130943064
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6159	1.18121782787344e-34	130943064	130943064	1.85518971599877e-25	130946248	130946248
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	513	-0.4086	1.85518971599877e-25	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6900	0.1013	NA	NA	NA	7.77957530180928e-132	37953582	37953582
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.0493	7.77957530180928e-132	37953582	37953582	9.31173935344522e-142	37957844	37957844
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	43357049	2257	2126	0.0868	9.31173935344522e-142	37957844	37957844	0	43341603	43371452
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	43359400	49964838	2622	2468	-0.187	0	43341603	43371452	8.1363906221565e-89	49964838	49964838
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.5428	8.1363906221565e-89	49964838	49964838	3.33909365664609e-86	49971732	49971732
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1683	-0.1907	3.33909365664609e-86	49971732	49971732	4.35696075280536e-34	56646284	56650373
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	13	0.6441	4.35696075280536e-34	56646284	56650373	1.55643466491463e-37	56685341	56686863
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	63146866	1464	1385	-0.203	1.55643466491463e-37	56685341	56686863	8.79307672152623e-19	63130828	63151929
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63151929	63246969	17	17	-0.7299	8.79307672152623e-19	63130828	63151929	1.13110796420626e-19	63245583	63322571
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63280389	78418688	4574	4290	-0.1926	1.13110796420626e-19	63245583	63322571	0	78383173	78466758
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	78425709	100689280	6984	6567	0.0683	0	78383173	78466758	3.82861170790136e-124	100689280	100689280
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100690991	100690991	1	0	NA	3.82861170790136e-124	100689280	100689280	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-3.8899	NA	NA	NA	1.59626547730407e-112	100693892	100693892
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4327	0.0622	1.59626547730407e-112	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.5552	NA	NA	NA	1.88772494583871e-18	18505611	19271102
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	22481730	1491	1401	-0.0823	1.88772494583871e-18	18505611	19271102	2.22421036753120e-14	22472801	22486418
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22484080	22500758	12	12	-0.5813	2.2242103675312e-14	22472801	22486418	1.12395969720916e-10	22496305	22510478
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22502170	26085337	1250	1179	-0.121	1.12395969720916e-10	22496305	22510478	0	26072739	26091234
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26087031	51995417	8002	7543	-0.4902	0	26072739	26091234	5.08874336247476e-293	51993540	52000284
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	52000284	52377723	184	177	0.1569	5.08874336247476e-293	51993540	52000284	5.26973449336250e-54	52362416	52402208
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	52379340	69086125	6683	6262	-0.1288	5.2697344933625e-54	52362416	52402208	3.35028287225779e-09	69083716	69090571
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69097052	6	6	0.5225	3.35028287225779e-09	69083716	69090571	2.54864905791009e-09	69093444	69100795
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69098569	73061942	1785	1675	-0.1161	2.54864905791009e-09	69093444	69100795	2.69187814519548e-25	73058103	73061942
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.8432	2.69187814519548e-25	73058103	73061942	5.55987620788298e-23	73092112	73101327
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	81107759	3712	3485	-0.1097	5.55987620788298e-23	73092112	73101327	0	81096932	81145526
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	81115731	88087065	1458	1370	-0.5186	0	81096932	81145526	2.37391715160980e-10	88087065	88087065
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	88089060	88090516	2	2	0.6228	2.3739171516098e-10	88087065	88087065	2.86494327865032e-07	88090516	88092995
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	88092995	101704652	5499	5193	-0.4569	2.86494327865032e-07	88090516	88092995	3.43231479100378e-53	101704652	101704652
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101707771	101707860	2	2	-3.2752	3.43231479100378e-53	101704652	101704652	2.04865939044791e-50	101707860	101707860
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101713121	105787390	1575	1482	-0.4115	2.04865939044791e-50	101707860	101707860	3.07085451205519e-10	105783533	105788623
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105799261	7	7	-1.1156	3.07085451205519e-10	105783533	105788623	1.90310863216735e-11	105798116	105800545
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105800545	105850033	20	20	-0.4135	1.90310863216735e-11	105798116	105800545	2.76305266680157e-14	105848335	105856972
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-1.4127	2.76305266680157e-14	105848335	105856972	3.66433608690319e-18	105875924	105897061
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	123	-0.4545	3.66433608690319e-18	105875924	105897061	1.02828995187136e-06	106209063	106232699
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106252126	15	12	-0.0125	1.02828995187136e-06	106209063	106232699	0.000191363257866467	106240343	106269748
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106253648	106358491	37	35	-0.4133	0.000191363257866467	106240343	106269748	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3723	NA	NA	NA	8.54478432230668e-11	18450562	18692865
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	136	-0.6779	8.54478432230668e-11	18450562	18692865	1.66613782413393e-257	20065525	20308014
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32454294	3670	3429	0.0603	1.66613782413393e-257	20065525	20308014	2.13302322336400e-24	32451841	32514939
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32456500	32661846	27	27	-0.4403	2.133023223364e-24	32451841	32514939	1.60697281487357e-23	32583146	32669751
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	35911788	1029	958	0.0503	1.60697281487357e-23	32583146	32669751	1.52454100361934e-09	35823614	35952079
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35917871	36063512	32	30	0.353	1.52454100361934e-09	35823614	35952079	0.000253662968721750	36046380	36063512
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	36065510	36076845	3	3	1.0546	0.00025366296872175	36046380	36063512	2.55912925348085e-132	36076845	36084570
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	36084570	73456281	16264	15273	0.1021	2.55912925348085e-132	36076845	36084570	8.79115360416068e-272	73456281	73456281
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73458872	73576388	63	60	-1.0547	8.79115360416068e-272	73456281	73456281	1.06311751220127e-316	73576388	73576388
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73578652	79517643	2473	2307	0.149	1.06311751220127e-316	73576388	73576388	0	79476651	79577043
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	79522676	99632987	7331	6886	-0.1436	0	79476651	79577043	4.64627613674863e-10	99632987	99632987
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0593	4.64627613674863e-10	99632987	99632987	1.24506835238197e-10	99635701	99635701
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	99693156	34	31	-0.0724	1.24506835238197e-10	99635701	99635701	2.39833997328241e-05	99686915	99694467
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99694467	99703285	5	5	-0.6253	2.39833997328241e-05	99686915	99694467	0.000126121473423702	99702062	99708207
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99705042	100217181	228	212	-0.1246	0.000126121473423702	99702062	99708207	1.99815145065787e-08	100212401	100278665
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.804	1.99815145065787e-08	100212401	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	451	0.1619	NA	NA	NA	2.96615336478503e-08	1296506	1296767
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.4551	2.96615336478503e-08	1296506	1296767	4.25920916370048e-10	1300341	1302875
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	8414592	2740	2561	0.1318	4.25920916370048e-10	1300341	1302875	2.33071372454088e-28	8290113	8510098
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8419134	8894892	160	149	0.3902	2.33071372454088e-28	8290113	8510098	1.53760791330284e-36	8870860	8914367
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8896830	14876356	2093	1980	0.1249	1.53760791330284e-36	8870860	8914367	3.00429949266707e-14	14678535	14876356
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	14956177	1	0	NA	3.00429949266707e-14	14678535	14876356	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956252	15029941	13	13	-0.4234	NA	NA	NA	1.08395909469884e-13	15029941	15037844
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	19886330	1269	1194	0.1379	1.08395909469884e-13	15029941	15037844	3.35891892515873e-172	19841388	19911763
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	19894202	21258019	504	471	-0.2403	3.35891892515873e-172	19841388	19911763	3.02784616269459e-07	21240874	21479879
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	9	-0.7156	3.02784616269459e-07	21240874	21479879	2.6017282475095e-09	21492912	21508397
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	21504151	1	0	NA	2.6017282475095e-09	21492912	21508397	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21507188	22553207	285	272	-0.1944	NA	NA	NA	8.12015920469724e-16	22547406	22561536
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22561536	22617217	8	8	-0.9088	8.12015920469724e-16	22547406	22561536	5.056134081454e-32	22609825	22625780
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	45686517	3523	3310	-0.1006	5.056134081454e-32	22609825	22625780	0	45674378	45709948
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45698615	51602386	1742	1623	-0.462	0	45674378	45709948	0	51588956	51618181
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	51611747	54365385	877	820	-1.0204	0	51588956	51618181	0.053639585293291	54324724	54365385
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54366535	54368717	2	2	-0.3677	0.053639585293291	54324724	54365385	1.30755171637463e-12	54368717	54368717
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54376805	54379839	3	3	-2.336	1.30755171637463e-12	54368717	54368717	7.24871302610611e-16	54379839	54379839
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	55714371	549	512	-0.9919	7.24871302610611e-16	54379839	54379839	0.000135209048852631	55660891	55722945
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55717094	55737917	11	11	-0.6894	0.000135209048852631	55660891	55722945	1.65064671513405e-21	55729681	55780848
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55739483	68693086	4033	3814	-0.9997	1.65064671513405e-21	55729681	55780848	2.45719486927801e-20	68693014	68732367
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-1.7173	2.45719486927801e-20	68693014	68732367	7.48395584715364e-15	68753209	68838384
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	69397102	253	238	-0.9188	7.48395584715364e-15	68753209	68838384	4.90915175788901e-27	69374507	69410176
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69398720	69398720	1	0	NA	4.90915175788901e-27	69374507	69410176	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69401319	69755375	161	154	-0.6145	NA	NA	NA	1.95851459573873e-41	69746655	69770318
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69758635	69758635	1	0	NA	1.95851459573873e-41	69746655	69770318	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	70117330	151	143	-1.0142	NA	NA	NA	1.77079698840987e-141	70117330	70121661
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70120043	70501158	173	167	-2.0722	1.77079698840987e-141	70117330	70121661	0	70490891	70501158
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70503046	72918129	713	679	-1.067	0	70490891	70501158	4.48586001194234e-08	72915477	72951581
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-1.6215	4.48586001194234e-08	72915477	72951581	8.78812697497636e-07	72956298	73025340
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	706	-1.0138	8.78812697497636e-07	72956298	73025340	5.06170784666273e-23	75093957	75093957
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.6949	5.06170784666273e-23	75093957	75093957	6.84545239387878e-54	75100865	75100865
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	571	-0.5302	6.84545239387878e-54	75100865	75100865	2.14148263265690e-91	76923844	76923844
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76929598	2	0	NA	2.1414826326569e-91	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	7	1.3074	NA	NA	NA	1.91082244949666e-70	76940218	76940218
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4266	-0.4701	1.91082244949666e-70	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	391	-0.4316	NA	NA	NA	2.05668927891645e-10	1028979	1028979
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.9352	2.05668927891645e-10	1028979	1028979	6.9398647518579e-10	1030766	1031233
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1902148	433	408	-0.3883	6.9398647518579e-10	1030766	1031233	2.71618437619422e-09	1901302	1904451
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1903358	1903358	1	0	NA	2.71618437619422e-09	1901302	1904451	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	0.5271	NA	NA	NA	3.16573417667629e-12	1906352	1909371
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	21132919	7266	6877	-0.4396	3.16573417667629e-12	1906352	1909371	8.27073239913326e-07	21087086	21153289
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21134532	21216023	33	31	-0.7024	8.27073239913326e-07	21087086	21153289	4.85508967636625e-07	21179880	21243246
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21218000	31470227	3886	3667	-0.4483	4.85508967636625e-07	21179880	21243246	2.4548912487072e-06	31457889	31470227
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31471890	31471890	1	0	NA	2.4548912487072e-06	31457889	31470227	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31473186	31503774	13	8	-0.9481	NA	NA	NA	8.46597321049528e-07	31503774	31895551
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	345	-0.4661	8.46597321049528e-07	31503774	31895551	1.37402475748650e-23	32828797	32828797
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.2213	1.3740247574865e-23	32828797	32828797	6.32977143006744e-22	32832642	32832642
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	40874079	3261	3066	-0.3943	6.32977143006744e-22	32832642	32832642	4.77170656272594e-14	40869151	40874079
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41017338	4	4	-1.2224	4.77170656272594e-14	40869151	40874079	3.41012517339584e-11	41017338	41026062
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41506317	194	180	-0.3564	3.41012517339584e-11	41017338	41026062	0.283994304568905	41362958	41512318
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41508943	41508943	1	0	NA	0.283994304568905	41362958	41512318	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41512318	41518222	4	4	-0.6516	NA	NA	NA	0.000105150707716569	41518222	41527705
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41519702	41566540	22	21	-1.0079	0.000105150707716569	41518222	41527705	5.27320770925583e-12	41562786	41570512
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41644979	36	35	-0.6712	5.27320770925583e-12	41562786	41570512	3.91628650834065e-10	41632724	41706870
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41647135	41647135	1	0	NA	3.91628650834065e-10	41632724	41706870	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	43726934	708	659	-0.3771	NA	NA	NA	6.10298899813086e-195	43710846	43740834
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43729275	78653545	12980	12152	-0.0772	6.10298899813086e-195	43710846	43740834	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	43946993	13180	12384	-0.0917	NA	NA	NA	0	43939851	43954389
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	43949147	53276474	3087	2926	-0.546	0	43939851	43954389	0	53264957	53282784
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53277721	71037842	4962	4676	-0.1659	0	53264957	53282784	0	71029558	71044726
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	71041018	75243011	1408	1336	-0.6864	0	71029558	71044726	5.53508505150066e-08	75229407	75269342
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75247123	75295688	21	21	-0.3521	5.53508505150066e-08	75229407	75269342	9.23425888874303e-05	75273869	75314007
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75296893	76116026	306	291	-0.6454	9.23425888874303e-05	75273869	75314007	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	465	-0.3719	NA	NA	NA	3.14490551432213e-36	1398325	1398325
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.2125	3.14490551432213e-36	1398325	1398325	7.45523321818271e-36	1400840	1400840
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	982	-0.3706	7.45523321818271e-36	1400840	1400840	8.71865800633754e-06	3588389	3591120
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3596968	3	3	-1.2422	8.71865800633754e-06	3588389	3591120	4.98467520815774e-06	3596968	3599322
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3599322	4760281	556	517	-0.3696	4.98467520815774e-06	3596968	3599322	5.7316555574043e-319	4753119	4767005
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4762663	11445761	3076	2892	0.1284	5.7316555574043e-319	4753119	4767005	4.32285446176165e-09	11445761	11445761
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11448975	11448975	1	0	NA	4.32285446176165e-09	11445761	11445761	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.4065	NA	NA	NA	1.76058164228319e-09	11452390	11453579
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	45022704	9525	8958	0.1077	1.76058164228319e-09	11452390	11453579	0	45010107	45039248
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45023973	53749997	3737	3521	-0.193	0	45010107	45039248	3.24370265348490e-12	53745313	53751657
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53751657	53762109	12	11	0.3181	3.2437026534849e-12	53745313	53751657	1.78248332526572e-07	53760344	53771096
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53762657	59246409	2518	2365	-0.1247	1.78248332526572e-07	53760344	53771096	2.08158497630329e-08	59244965	59246409
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-1.1007	2.08158497630329e-08	59244965	59246409	5.94080534515278e-09	59251831	59253728
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	1960	-0.1256	5.94080534515278e-09	59251831	59253728	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	234763	84	80	-0.5025	NA	NA	NA	2.84763829464978e-39	228950	244158
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	236155	1506379	502	464	-0.0969	2.84763829464978e-39	228950	244158	1.8062374267556e-19	1499421	1511632
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.6701	1.8062374267556e-19	1499421	1511632	1.73627946865366e-26	1531162	1544485
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3463	-0.1681	1.73627946865366e-26	1531162	1544485	2.02686531486708e-11	12095485	12095485
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.0783	2.02686531486708e-11	12095485	12095485	2.06495550463755e-12	12113855	12113855
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	22491656	3742	3522	-0.1991	2.06495550463755e-12	12113855	12113855	5.0511090777542e-247	22453169	22512585
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	22494404	26148060	1005	953	0.0935	5.0511090777542e-247	22453169	22512585	6.08195141197562e-20	26147112	26148060
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	9	-0.7263	6.08195141197562e-20	26147112	26148060	7.20486668086726e-21	26161111	26162094
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	47823692	7254	6836	0.1029	7.20486668086726e-21	26161111	26162094	3.60178965563228e-74	47781020	47861005
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	47825720	47825720	1	0	NA	3.60178965563228e-74	47781020	47861005	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	47830011	48707554	375	357	0.3556	NA	NA	NA	2.23643827958509e-24	48702019	48717040
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48709613	48814149	49	43	0.8273	2.23643827958509e-24	48702019	48717040	2.1296816023689e-35	48806609	48821758
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48815624	62419534	4856	4522	0.3107	2.1296816023689e-35	48806609	48821758	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12602	-0.1477	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15471221	9	9	-0.1974	NA	NA	NA	0.00121772678604292	15448186	15556036
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15472087	18256334	1189	1124	0.1881	0.00121772678604292	15448186	15556036	1.48031561235637e-152	18228518	18279742
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18257360	22667608	1785	1678	-0.088	1.48031561235637e-152	18228518	18279742	4.61137306136151e-35	22643742	22679305
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.6812	4.61137306136151e-35	22643742	22679305	4.84828327486885e-47	22720195	22735036
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32451747	5255	4934	-0.1183	4.84828327486885e-47	22720195	22735036	5.35071059439081e-314	32446998	32455158
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32453583	33857917	445	419	0.3573	5.35071059439081e-314	32446998	32455158	4.35664930311494e-216	33846755	33868998
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	33861494	37621766	2037	1908	-0.0891	4.35664930311494e-216	33846755	33868998	6.33723399588877e-20	37621766	37621766
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-1.9409	6.33723399588877e-20	37621766	37621766	2.25600720249712e-21	37626069	37626069
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	40025517	1240	1178	-0.098	2.25600720249712e-21	37626069	37626069	6.90870617508921e-08	40017002	40025517
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40027630	40028911	2	2	1.0184	6.90870617508921e-08	40017002	40025517	8.53228005383694e-08	40028911	40030431
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40030431	44234760	2094	1954	-0.092	8.53228005383694e-08	40028911	40030431	0	44232094	44244182
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44244182	49571068	2477	2318	-0.9499	0	44232094	44244182	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0955	NA	NA	NA	4.51407777909597e-14	94062	94062
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-1.7424	4.51407777909597e-14	94062	94062	3.64180751832346e-33	108902	110101
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	2301365	1383	1302	-0.4632	3.64180751832346e-33	108902	110101	7.31872897527431e-07	2299493	2302065
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.3761	7.31872897527431e-07	2299493	2302065	2.89960988595451e-06	2304008	2307925
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2373235	73	72	-0.4825	2.89960988595451e-06	2304008	2307925	3.35086388693078e-07	2355802	2380252
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374031	2426938	63	60	-0.8049	3.35086388693078e-07	2355802	2380252	1.90548602539455e-17	2426938	2426938
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	0.956	1.90548602539455e-17	2426938	2426938	1.81283754029411e-12	2428307	2430156
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2672401	224	209	-0.5049	1.81283754029411e-12	2428307	2430156	4.57960649898887e-05	2667268	2674962
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2693493	12	11	-0.9148	4.57960649898887e-05	2667268	2674962	0.0109916205243852	2687501	2699364
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2695630	1	0	NA	0.0109916205243852	2687501	2699364	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695951	2708291	14	14	-0.565	NA	NA	NA	9.62192272157625e-59	2708113	2708291
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	40853509	14121	13270	0.5423	9.62192272157625e-59	2708113	2708291	0	40848821	40860443
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	40854918	40854918	1	0	NA	0	40848821	40860443	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	40856511	48339561	2545	2385	1.2319	NA	NA	NA	2.09229271191549e-08	48336463	48344969
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48340652	48348402	6	6	0.5366	2.09229271191549e-08	48336463	48344969	1.29105326876667e-06	48343387	48351995
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48349677	48459785	54	51	1.224	1.29105326876667e-06	48343387	48351995	3.50286596156422e-12	48445023	48477694
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48461913	48461913	1	0	NA	3.50286596156422e-12	48445023	48477694	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48463257	53787671	1516	1418	0.9187	NA	NA	NA	1.09634389087455e-201	53748870	53809720
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53793588	58499056	954	895	0.5624	1.09634389087455e-201	53748870	53809720	1.02639780108885e-56	58022661	61978846
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	61848414	63190464	214	206	0.8915	1.02639780108885e-56	58022661	61978846	6.28372083890534e-33	63138639	63262464
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	63190602	63723348	124	121	0.5013	6.28372083890534e-33	63138639	63262464	6.6593172736153e-154	63720014	63727629
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	63725802	69037414	1393	1335	1.2169	6.6593172736153e-154	63720014	63727629	0	69034637	69041890
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69039555	100508541	6657	6281	0.5645	0	69034637	69041890	0	100501711	100511230
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	100509935	102002204	437	414	1.2042	0	100501711	100511230	7.58181407343198e-90	101963372	102038630
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	102005404	102005404	1	0	NA	7.58181407343198e-90	101963372	102038630	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	102008376	117502704	5369	5031	0.9352	NA	NA	NA	0	117492387	117506257
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	117503802	140176737	7461	7024	1.4547	0	117492387	117506257	8.83112422075898e-36	140135471	140189805
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140180757	140378699	83	76	1.8511	8.83112422075898e-36	140135471	140189805	2.69893327771321e-40	140375051	140518817
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140383353	146087729	1157	1099	1.4377	2.69893327771321e-40	140375051	140518817	6.29921171695497e-12	146087729	146087729
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	0.0727	6.29921171695497e-12	146087729	146087729	1.0973775210934e-07	146095707	146098710
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	154038318	2905	2750	1.4242	1.0973775210934e-07	146095707	146098710	4.16146051466555e-13	154031239	154038318
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	9	2.2459	4.16146051466555e-13	154031239	154038318	2.30090591641883e-18	154078819	154079002
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154284539	56	55	1.4026	2.30090591641883e-18	154078819	154079002	5.35629112811198e-05	154215471	154297852
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154288438	154317185	8	8	1.8703	5.35629112811198e-05	154215471	154297852	0.000124570486548129	154311003	154391267
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154317531	154442377	26	21	1.431	0.000124570486548129	154311003	154391267	1.50853250868240e-55	154442377	154442377
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	0	NA	1.5085325086824e-55	154442377	154442377	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154450309	2	2	-1.7389	NA	NA	NA	3.35287515543646e-60	154450309	154450309
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	1.5041	3.35287515543646e-60	154450309	154450309	4.78049050457561e-68	154582414	154586690
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.2498	4.78049050457561e-68	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	124	-3.4445	NA	NA	NA	1.56759599620602e-08	3772482	4272867
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	10	-1.3425	1.56759599620602e-08	3772482	4272867	2.40615152218241e-06	5531459	6711090
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	116	-3.3842	2.40615152218241e-06	5531459	6711090	1.67517481762467e-06	6918114	7016814
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7658121	219	199	-2.5978	1.67517481762467e-06	6918114	7016814	0.000196803531240490	7603458	7670119
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7659535	7709619	32	31	-3.6815	0.00019680353124049	7603458	7670119	8.25639208065079e-09	7700496	7712882
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	25	-2.0384	8.25639208065079e-09	7700496	7712882	8.02920489943184e-10	7776265	7784314
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7829133	14	14	-3.7004	8.02920489943184e-10	7776265	7784314	7.00435204912331e-07	7827650	7829133
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7829944	7836700	6	6	-2.1802	7.00435204912331e-07	7827650	7829133	1.58532068975881e-06	7836700	7841425
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7841425	7853950	7	6	-3.675	1.58532068975881e-06	7836700	7841425	0.0459347055381521	7852359	7947666
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7855856	7859390	2	0	NA	0.0459347055381521	7852359	7947666	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7997485	30	28	-2.3099	NA	NA	NA	5.57399498503042e-09	7947666	8010446
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8245608	60	54	-3.5401	5.57399498503042e-09	7947666	8010446	0.0172060083901617	8201959	8557343
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8835526	171	155	-3.0206	0.0172060083901617	8201959	8557343	6.28052098841107e-05	8696392	8961669
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8836109	10513747	139	134	-3.5744	6.28052098841107e-05	8696392	8961669	9.76932195829769e-25	10512616	10515697
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10631941	12	12	-0.8471	9.76932195829769e-25	10512616	10515697	0.000151869599933164	10620136	12518008
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	10645500	1	0	NA	0.000151869599933164	10620136	12518008	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13128515	207	195	-2.405	NA	NA	NA	0.0309107542392537	12970269	13161955
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13283695	52	48	-2.992	0.0309107542392537	12970269	13161955	0.000656923430904691	13169265	13421917
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13285595	14342834	357	327	-3.5354	0.000656923430904691	13169265	13421917	6.43976961906735e-06	14130722	14407293
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	92	-2.9515	6.43976961906735e-06	14130722	14407293	0.00119365941989664	14485806	14555872
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14644293	36	34	-1.997	0.00119365941989664	14485806	14555872	3.66900594184862e-11	14572190	14694578
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15518749	315	303	-3.3897	3.66900594184862e-11	14572190	14694578	3.07735223317778e-05	15458280	15551462
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15519963	15630463	46	40	-2.5075	3.07735223317778e-05	15458280	15551462	1.33477465931768e-06	15563346	15658114
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15915466	46	43	-3.7354	1.33477465931768e-06	15563346	15658114	2.63563569232324e-12	15892492	15932535
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15979526	21	21	-1.9648	2.63563569232324e-12	15892492	15932535	0.00115873744586775	15958396	15996118
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15980898	16035717	22	22	-3.1104	0.00115873744586775	15958396	15996118	0.000256128615410166	16019249	16035717
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16036892	1	0	NA	0.000256128615410166	16019249	16035717	NA	NA	NA
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16037646	16042966	5	5	-1.3075	NA	NA	NA	4.61261324334851e-05	16042966	16062961
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	21036503	784	742	-3.4726	4.61261324334851e-05	16042966	16062961	9.12756603639092e-07	21028489	21042490
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.197	9.12756603639092e-07	21028489	21042490	5.10749395637308e-08	21047798	21059229
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22165808	264	250	-3.4723	5.10749395637308e-08	21047798	21059229	1.33932401609602e-06	22058759	22165808
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22166564	22177335	6	6	-1.4182	1.33932401609602e-06	22058759	22165808	2.13240707428157e-06	22177335	22177335
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22181855	3	3	-3.1845	2.13240707428157e-06	22177335	22177335	0.00388487960785770	22181855	22205568
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22371003	29	26	-4.3115	0.0038848796078577	22181855	22205568	1.23778033641611e-07	22308420	22400925
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22373608	22930737	61	57	-3.2437	1.23778033641611e-07	22308420	22400925	1.32257548328373e-25	22924754	26872527
MSK_252152915135_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.4407	1.32257548328373e-25	22924754	26872527	NA	NA	NA
