Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16698906	5780	5605	0.0095	NA	NA	NA	1.93665647870175e-15	16666760	16704522
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17086698	17	15	-0.712	1.93665647870175e-15	16666760	16704522	3.96707419951893e-15	17080364	17094475
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17094326	72537426	22097	21521	0.0063	3.96707419951893e-15	17080364	17094475	9.56522165591058e-191	72537426	72537426
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	2.5785	9.56522165591058e-191	72537426	72537426	1.18307542089801e-194	72579311	72579311
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	142719230	15595	15165	0.0033	1.18307542089801e-194	72579311	72579311	1.19216011986990e-24	121011665	143631346
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142721264	144093719	104	103	-0.3406	1.1921601198699e-24	121011665	143631346	6.56727265899809e-25	143827741	144112795
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1811	0.0068	6.56727265899809e-25	143827741	144112795	1.37886784387607e-52	150819879	150819879
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.496	1.37886784387607e-52	150819879	150819879	1.45845821210074e-58	150851439	150851439
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151938534	451	445	-0.0105	1.45845821210074e-58	150851439	150851439	7.29702009704947e-08	151936219	151938534
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151939880	151946087	4	4	0.9094	7.29702009704947e-08	151936219	151938534	3.32783258570545e-06	151946087	151947494
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151947357	157133150	2306	2240	0.012	3.32783258570545e-06	151946087	151947494	2.33200158683646e-23	157133150	157133150
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.406	2.33200158683646e-23	157133150	157133150	1.33868471603522e-23	157136342	157136342
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	243702540	31510	30649	-3e-04	1.33868471603522e-23	157136342	157136342	1.17519050788129e-09	243699611	243702540
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243717078	9	9	-0.7477	1.17519050788129e-09	243699611	243702540	2.92937138121429e-09	243717078	243720139
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243718709	247186514	1391	1351	-0.0115	2.92937138121429e-09	243717078	243720139	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10581	-0.0098	NA	NA	NA	7.60299663355156e-24	33076512	33076512
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.4003	7.60299663355156e-24	33076512	33076512	4.7458013930805e-23	33080437	33080437
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	635	0.036	4.7458013930805e-23	33080437	33080437	8.56868363170272e-26	34539740	34552935
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	0.8537	8.56868363170272e-26	34539740	34552935	8.83555179193922e-31	34589997	34597294
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37813211	1370	1340	-0.0213	8.83555179193922e-31	34589997	34597294	4.01343313726371e-18	37810001	37820898
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37855837	20	20	-0.6803	4.01343313726371e-18	37810001	37820898	2.73629754237801e-19	37848754	37859985
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5660	-0.0026	2.73629754237801e-19	37848754	37859985	1.73984257668786e-08	52583578	52600588
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.9119	1.73984257668786e-08	52583578	52600588	4.95898624942273e-08	52635695	52642716
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	154601442	28544	27797	-0.0037	4.95898624942273e-08	52635695	52642716	1.89150937478871e-127	154601442	154601442
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-5.4658	1.89150937478871e-127	154601442	154601442	1.00854576752400e-125	154606943	154606943
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	180117780	9106	8868	-0.0048	1.008545767524e-125	154606943	154606943	2.43465664124084e-10	180115198	180117780
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.9377	2.43465664124084e-10	180115198	180117780	4.43327489675752e-10	180129680	180131608
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	242689978	21432	20846	5e-04	4.43327489675752e-10	180129680	180131608	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10530	-0.0094	NA	NA	NA	1.47195448359351e-71	32074432	32074432
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.0552	1.47195448359351e-71	32074432	32074432	8.90488062217048e-69	32080848	32080848
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	101817141	22033	21457	-0.0013	8.90488062217048e-69	32080848	32080848	4.13175467487108e-26	101805534	101837302
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101818659	101928096	43	43	0.5438	4.13175467487108e-26	101805534	101837302	6.39284634592488e-26	101917092	101939226
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101930007	164001657	20616	20113	-3e-04	6.39284634592488e-26	101917092	101939226	2.12019380918519e-44	164001657	164001657
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	2.12019380918519e-44	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-3.2744	NA	NA	NA	1.16106317710999e-44	164012645	164012645
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	196822133	11155	10840	-0.002	1.16106317710999e-44	164012645	164012645	1.00438812181703e-24	196809098	196905767
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	31	-0.6255	1.00438812181703e-24	196809098	196905767	1.91548815989813e-23	196952514	196968244
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	928	-0.0117	1.91548815989813e-23	196952514	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173660684	49835	48568	0.0041	NA	NA	NA	1.47772032079328e-53	173660684	173660684
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	3.5745	1.47772032079328e-53	173660684	173660684	4.83938678761398e-56	173666072	173666072
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3962	-0.0027	4.83938678761398e-56	173666072	173666072	2.02141539669521e-55	187330240	187330240
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.56	2.02141539669521e-55	187330240	187330240	3.12840968272303e-51	187333619	187333619
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1213	-0.0174	3.12840968272303e-51	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3893	-0.0213	NA	NA	NA	6.07532245251648e-12	12857302	12857302
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-1.6958	6.07532245251648e-12	12857302	12857302	2.71580630130046e-11	12873052	12873052
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	127434789	31341	30505	0.0012	2.71580630130046e-11	12873052	12873052	5.12613181321828e-49	127434789	127434789
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-3.42	5.12613181321828e-49	127434789	127434789	6.00364978722883e-49	127438118	127438118
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	180644810	18446	17974	-0.0045	6.00364978722883e-49	127438118	127438118	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11347	0.0028	NA	NA	NA	7.02590480247846e-53	32558677	32588005
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	7.02590480247846e-53	32558677	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32600962	8	7	-1.8972	NA	NA	NA	0.165697521045816	32588005	32628420
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	8	-0.7107	0.165697521045816	32588005	32628420	0.0973214805088157	32609525	32654861
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32711957	27	27	-0.0368	0.0973214805088157	32609525	32654861	2.39469901347279e-14	32709263	32718991
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	9	-1.6821	2.39469901347279e-14	32709263	32718991	2.3366726697539e-52	32723722	32728487
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8044	-0.0051	2.3366726697539e-52	32723722	32728487	6.07601424546834e-103	54035000	54035000
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0506	6.07601424546834e-103	54035000	54035000	2.11017354935295e-102	54042734	54042734
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6275	0.0128	2.11017354935295e-102	54042734	54042734	4.85894652436058e-15	79011979	79024557
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.7499	4.85894652436058e-15	79011979	79024557	1.90243887313413e-14	79085247	79101978
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6586	-0.0045	1.90243887313413e-14	79085247	79101978	4.74348507413363e-146	103841482	103841482
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.188	4.74348507413363e-146	103841482	103841482	1.03309039590445e-149	103868154	103868154
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20539	0.0021	1.03309039590445e-149	103868154	103868154	9.00677795031524e-11	165642393	165643653
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1681	9.00677795031524e-11	165642393	165643653	1.38657674838693e-11	165650610	165653315
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1747	-0.0274	1.38657674838693e-11	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5251	-0.0024	NA	NA	NA	7.84850023841217e-56	16135701	16135701
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.5989	7.84850023841217e-56	16135701	16135701	6.53592026098906e-54	16140018	16140018
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	93162991	23058	22464	0.0016	6.53592026098906e-54	16140018	16140018	3.82844399427264e-106	93162991	93162991
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-5.0301	3.82844399427264e-106	93162991	93162991	3.89372143458560e-104	93168978	93168978
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	141690753	21483	20917	0.0108	3.8937214345856e-104	93168978	93168978	6.69815395392255e-247	141690753	141690753
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.457	6.69815395392255e-247	141690753	141690753	7.99885824518849e-233	141714168	141714168
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6589	-0.007	7.99885824518849e-233	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.0283	NA	NA	NA	3.77135006996672e-36	581533	581533
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.0236	3.77135006996672e-36	581533	581533	1.00992792251960e-34	588865	588865
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	603	-0.0134	1.0099279225196e-34	588865	588865	6.66534763634836e-07	2229727	2234351
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.9839	6.66534763634836e-07	2229727	2234351	1.6814609699284e-07	2251011	2257255
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25022606	7388	7194	-0.0067	1.6814609699284e-07	2251011	2257255	2.11152429547624e-10	25017905	25022606
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	1.1315	2.11152429547624e-10	25017905	25022606	2.12750128685487e-10	25047250	25057567
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	39350798	4941	4808	5e-04	2.12750128685487e-10	25047250	25057567	6.8180755419862e-123	39345557	39352361
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	1.0096	6.8180755419862e-123	39345557	39352361	1.12596869410234e-119	39504332	39509423
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	39508035	1	0	NA	1.12596869410234e-119	39504332	39509423	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39509423	144968840	30979	30152	0.001	NA	NA	NA	1.82281884187558e-09	144968840	144968840
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.5851	1.82281884187558e-09	144968840	144968840	1.28184700186193e-08	144970777	144970777
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	434	0.0063	1.28184700186193e-08	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12703	-2e-04	NA	NA	NA	6.97823072801571e-09	70923005	70926188
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.493	6.97823072801571e-09	70923005	70926188	1.14712532742098e-08	70930528	70930528
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23098	-0.008	1.14712532742098e-08	70930528	70930528	3.05660521802214e-12	137352394	137352394
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.7493	3.05660521802214e-12	137352394	137352394	2.65148627620324e-11	137356880	137356880
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1074	-0.0131	2.65148627620324e-11	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	56115736	17031	16584	-0.0086	NA	NA	NA	3.19682880990748e-11	56112067	56115736
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	10	0.743	3.19682880990748e-11	56112067	56115736	2.37761937030928e-11	56138767	56142414
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	77917893	7551	7356	0.0011	2.37761937030928e-11	56138767	56142414	7.06191226963865e-47	77917893	77917893
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.6928	7.06191226963865e-47	77917893	77917893	1.94143102758574e-44	77928738	77928738
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19639	-0.0081	1.94143102758574e-44	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1719	-0.015	NA	NA	NA	2.67297033792711e-189	4923300	4923300
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.3532	2.67297033792711e-189	4923300	4923300	2.93510626443662e-196	4932214	4932214
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55124730	15130	14724	0.0013	2.93510626443662e-196	4932214	4932214	2.47791836174540e-08	55088012	55140052
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55197848	31	30	0.3847	2.4779183617454e-08	55088012	55140052	1.46343700679247e-08	55187282	55225136
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	134450318	28366	27635	-6e-04	1.46343700679247e-08	55187282	55225136	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4220	0.0118	NA	NA	NA	1.30391306384738e-23	11110735	11116883
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.4174	1.30391306384738e-23	11110735	11116883	5.50839486491142e-24	11140421	11143592
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	46992235	11147	10855	0.0088	5.50839486491142e-24	11140421	11143592	2.65351859958076e-45	46992235	46992235
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-3.3184	2.65351859958076e-45	46992235	46992235	1.25660183547377e-45	46996769	46996769
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	72071460	9217	8958	0.0199	1.25660183547377e-45	46996769	46996769	4.61713147389828e-10	72065239	72082702
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	72082702	72102816	5	5	-0.9988	4.61713147389828e-10	72065239	72082702	7.59218731743117e-10	72099297	72108340
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	72108340	130943064	19902	19355	0.0074	7.59218731743117e-10	72099297	72108340	1.90448468616837e-14	130943064	130943064
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.9082	1.90448468616837e-14	130943064	130943064	1.31823437958697e-13	130946248	130946248
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	537	0.0122	1.31823437958697e-13	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7137	0.0012	NA	NA	NA	2.20407605050623e-93	37953582	37953582
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.6971	2.20407605050623e-93	37953582	37953582	1.48512966468585e-98	37957844	37957844
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4747	-8e-04	1.48512966468585e-98	37957844	37957844	4.21400886633264e-30	49964838	49964838
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.6171	4.21400886633264e-30	49964838	49964838	1.31514281782979e-27	49971732	49971732
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	89659397	10072	9800	0.0035	1.31514281782979e-27	49971732	49971732	1.23036465609978e-98	89659397	89659397
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.9017	1.23036465609978e-98	89659397	89659397	3.7861855775275e-103	89662326	89662326
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4660	0.0037	3.7861855775275e-103	89662326	89662326	3.46259750295303e-71	100690991	100690991
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.079	3.46259750295303e-71	100690991	100690991	2.50531224430348e-67	100693892	100693892
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4431	-0.0243	2.50531224430348e-67	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.7682	NA	NA	NA	1.42492852908980e-73	19489920	19535787
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73071404	19360	18868	0.0049	1.4249285290898e-73	19489920	19535787	3.69179679607138e-12	73061942	73071404
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	3.69179679607138e-12	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.0172	NA	NA	NA	3.1627240935968e-12	73092112	73101327
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	106358491	12458	12143	-0.0062	3.1627240935968e-12	73092112	73101327	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	67289684	18585	18086	-0.0033	NA	NA	NA	1.5075274745321e-12	67282827	67289684
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67290829	67307573	7	7	0.9638	1.5075274745321e-12	67282827	67289684	1.19681730894487e-12	67307573	67310476
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67310476	100298352	12730	12396	-0.0043	1.19681730894487e-12	67307573	67310476	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	456	0.0192	NA	NA	NA	1.19771156175174e-07	1296506	1296767
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.4527	1.19771156175174e-07	1296506	1296767	2.65883838826510e-08	1300341	1302875
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	14876356	4993	4842	-0.0044	2.6588383882651e-08	1300341	1302875	5.76194570676878e-09	14678535	14876356
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	13	-0.5972	5.76194570676878e-09	14678535	14876356	3.87126503310867e-09	15029941	15039224
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	57230251	9439	9187	0.0034	3.87126503310867e-09	15029941	15039224	6.69717386360056e-41	57230251	57230251
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57232392	57233657	2	2	-3.1425	6.69717386360056e-41	57230251	57230251	2.21129207359984e-41	57233657	57233657
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57235636	75093957	5600	5445	0.0015	2.21129207359984e-41	57233657	57233657	8.55712430305955e-16	75093957	75093957
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.6043	8.55712430305955e-16	75093957	75093957	8.5947098831569e-17	75100865	75100865
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	593	-0.023	8.5947098831569e-17	75100865	75100865	5.59884878275096e-58	76925748	76929598
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.7843	5.59884878275096e-58	76925748	76929598	2.48235304387251e-52	76938723	76940218
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4401	-0.0121	2.48235304387251e-52	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027736	416	406	-0.0091	NA	NA	NA	3.02825134861010e-09	1027736	1027736
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1028979	1028979	1	0	NA	3.0282513486101e-09	1027736	1027736	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5122	NA	NA	NA	2.63560011385826e-08	1030766	1030766
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	8147124	3123	3047	0.0126	2.63560011385826e-08	1030766	1030766	9.57852887484392e-09	8144634	8147124
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.5493	9.57852887484392e-09	8144634	8147124	3.05706170413602e-09	8149084	8154339
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	36673853	10327	10041	0.0081	3.05706170413602e-09	8149084	8154339	1.87780832634028e-98	36673853	36673853
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	3.0806	1.87780832634028e-98	36673853	36673853	1.26267294703904e-100	36684619	36684619
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41518222	2010	1951	0.0138	1.26267294703904e-100	36684619	36684619	1.38845798806884e-12	41504832	41519702
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41519702	41566540	22	22	-0.5115	1.38845798806884e-12	41504832	41519702	8.04219992862324e-07	41561017	41576147
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	44	-0.875	8.04219992862324e-07	41561017	41576147	2.92249199344784e-70	41708551	42142363
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13296	0.0092	2.92249199344784e-70	41708551	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	64722966	19577	19056	-0.0063	NA	NA	NA	6.00576531931001e-14	64720049	64728518
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64726735	64749099	11	11	-0.7985	6.00576531931001e-14	64720049	64728518	7.13555840572096e-13	64744037	64752752
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	64750382	76116026	3375	3292	-0.0253	7.13555840572096e-13	64744037	64752752	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	467	0.0073	NA	NA	NA	1.14567135277911e-10	1398325	1398325
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.7497	1.14567135277911e-10	1398325	1398325	5.48117289482449e-11	1400840	1400840
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	63788698	22565	21922	0.0201	5.48117289482449e-11	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	558	-0.0251	NA	NA	NA	3.13064803214441e-33	1499421	1506379
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.2637	3.13064803214441e-33	1499421	1506379	2.81640474688159e-34	1532433	1544485
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3582	-0.0019	2.81640474688159e-34	1532433	1544485	5.18818430125071e-08	12089020	12095485
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4	5.18818430125071e-08	12089020	12095485	1.95762546348068e-07	12113855	12127349
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16863	-0.0056	1.95762546348068e-07	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13048	-0.0047	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2918	0.0155	NA	NA	NA	2.5464614533395e-102	22667608	22682428
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22702398	10	10	-2.3151	2.5464614533395e-102	22667608	22682428	0.0741543693204594	22682428	22712211
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22704683	22721042	11	11	-3.701	0.0741543693204594	22682428	22712211	1.26333613445311e-302	22720195	22721042
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	49571068	13553	13189	0.0011	1.26333613445311e-302	22720195	22721042	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.2906	NA	NA	NA	1.72046113402011e-07	3237	95819
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.7581	1.72046113402011e-07	3237	95819	6.64798016737774e-13	106242	110101
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	127779	15	15	0.0269	6.64798016737774e-13	106242	110101	3.02132398183113e-17	127779	127779
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	132689	4	4	-1.1608	3.02132398183113e-17	127779	127779	5.13752057411866e-10	132689	132721
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132721	1431411	754	732	-0.0218	5.13752057411866e-10	132689	132721	2.98455274781869e-18	1431411	1431411
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.1744	2.98455274781869e-18	1431411	1431411	1.92434384176942e-15	1432953	1432953
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2426938	749	723	-0.0453	1.92434384176942e-15	1432953	1432953	9.7467639056095e-06	2425776	2426938
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.2772	9.7467639056095e-06	2425776	2426938	8.97758241299436e-10	2428307	2430156
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2708291	251	242	-0.0819	8.97758241299436e-10	2428307	2430156	0	2708113	2711273
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22315	1.0501	0	2708113	2711273	1.91029218392846e-23	76998610	76998610
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.5517	1.91029218392846e-23	76998610	76998610	6.30766493301684e-24	77010018	77010018
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	103061281	5489	5351	1.0598	6.30766493301684e-24	77010018	77010018	5.38094533540335e-19	103053381	103083982
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103062376	103191693	36	34	1.6275	5.38094533540335e-19	103053381	103083982	6.6831844992591e-20	103177359	103232959
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103224094	154017980	16526	16085	1.0498	6.6831844992591e-20	103177359	103232959	1.7586307187172e-07	154002412	154023900
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154079002	21	19	1.539	1.7586307187172e-07	154002412	154023900	2.90559767550529e-06	154051619	154095976
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	119	1.0597	2.90559767550529e-06	154051619	154095976	4.56643909138659e-151	154578922	154586690
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0318	4.56643909138659e-151	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-3.9166	NA	NA	NA	4.6708276397103e-18	3034907	3777766
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.3443	4.6708276397103e-18	3034907	3777766	1.14381233062507e-11	4948824	6692482
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	170	-3.6717	1.14381233062507e-11	4948824	6692482	7.10074822651036e-08	7024303	7205930
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	125	-2.7319	7.10074822651036e-08	7024303	7205930	0.0307633726407396	7320048	7572591
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	12	-4.0882	0.0307633726407396	7320048	7572591	0.000568278170785103	7600570	7619927
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7643041	12	12	-2.7125	0.000568278170785103	7600570	7619927	1.47698996832125e-05	7625006	7656915
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7645258	7645258	1	0	NA	1.47698996832125e-05	7625006	7656915	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7723783	49	48	-3.9065	NA	NA	NA	1.44033117800029e-17	7719658	7731490
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-2.0073	1.44033117800029e-17	7719658	7731490	1.80614306876800e-09	7758635	7785973
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	29	-3.6891	1.806143068768e-09	7758635	7785973	2.06315471880025e-08	7853950	7865557
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-1.952	2.06315471880025e-08	7853950	7865557	1.10924826479388e-06	7905553	7936024
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	382	-3.7183	1.10924826479388e-06	7905553	7936024	6.44246035586868e-25	10513747	10515697
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.5292	6.44246035586868e-25	10513747	10515697	7.67800169842819e-06	10645500	12452734
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13104920	198	195	-2.6275	7.67800169842819e-06	10645500	12452734	0.00930658512693021	13048283	13106723
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-0.9414	0.00930658512693021	13048283	13106723	1.93658300606395e-17	13128515	13129843
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13649497	209	203	-3.7413	1.93658300606395e-17	13128515	13129843	4.08327594907492e-07	13597813	13670791
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13716000	11	11	-2.0939	4.08327594907492e-07	13597813	13670791	4.30567115805949e-13	13705594	13716331
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13823928	27	26	-4.2387	4.30567115805949e-13	13705594	13716331	2.72734247827841e-07	13787559	13828384
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.5085	2.72734247827841e-07	13787559	13828384	5.38765362278458e-05	13863616	13873700
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14404979	184	179	-3.9901	5.38765362278458e-05	13863616	13873700	7.66025014183806e-06	14384653	14415559
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14407293	14407293	1	0	NA	7.66025014183806e-06	14384653	14415559	NA	NA	NA
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14434038	15	12	-2.634	NA	NA	NA	0.000655589015972027	14416385	14434065
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14434065	14451317	12	12	-4.0589	0.000655589015972027	14416385	14434065	4.77465057372474e-12	14449913	14454048
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14454048	14466597	10	10	-2.1053	4.77465057372474e-12	14449913	14454048	1.25414196850831e-05	14464288	14480242
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14473497	14508021	28	25	-3.5872	1.25414196850831e-05	14464288	14480242	2.99838657782812e-07	14503927	14530328
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14566592	23	23	-1.7571	2.99838657782812e-07	14503927	14530328	4.72209281882497e-13	14557473	14581797
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14569287	15143138	119	115	-3.8326	4.72209281882497e-13	14557473	14581797	0.000890065963945222	14883615	15291532
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15144239	16182565	409	399	-3.3779	0.000890065963945222	14883615	15291532	1.14634440503857e-08	16002819	16467063
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	21036503	725	711	-3.8104	1.14634440503857e-08	16002819	16467063	1.33847788391614e-07	21034708	21042490
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.3096	1.33847788391614e-07	21034708	21042490	2.31793273872867e-09	21047798	21057446
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	253	-3.8659	2.31793273872867e-09	21047798	21057446	1.47407026300304e-08	22055660	22165808
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8576	1.47407026300304e-08	22055660	22165808	2.44275479876906e-10	22175425	22179794
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-4.012	2.44275479876906e-10	22175425	22179794	1.85402620739682e-63	22926726	22930737
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.1616	1.85402620739682e-63	22926726	22930737	9.23267988350027e-05	26941769	27000085
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.46	9.23267988350027e-05	26941769	27000085	6.23461348989401e-06	27003308	27064654
MSK_252152915140_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.8429	6.23461348989401e-06	27003308	27064654	NA	NA	NA
