Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16817525	5786	5438	-0.0318	NA	NA	NA	6.2891491159831e-13	16666760	16921319
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16836160	17157415	25	25	0.3374	6.2891491159831e-13	16666760	16921319	2.04899442692164e-17	17124554	17178929
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17158730	64609636	18934	17816	-0.0029	2.04899442692164e-17	17124554	17178929	3.88165254698537e-17	64605783	64609636
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	64612267	64621287	5	5	-0.8364	3.88165254698537e-17	64605783	64609636	6.09886282812122e-12	64621287	64625944
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	64625944	72524413	3137	2954	0.0261	6.09886282812122e-12	64621287	64625944	6.24618379214594e-08	72521485	72533804
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72525842	72537426	7	7	-0.5753	6.24618379214594e-08	72521485	72533804	1.68242908573749e-97	72537426	72537426
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	2.4912	1.68242908573749e-97	72537426	72537426	3.09547456224765e-289	72579311	72579311
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110033018	11704	11006	0.025	3.09547456224765e-289	72579311	72579311	2.73449584944757e-20	110033018	110033018
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.7825	2.73449584944757e-20	110033018	110033018	1.34880340903843e-19	110039388	110039388
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	143623628	3896	3659	0.0175	1.34880340903843e-19	110039388	110039388	3.76645063758797e-27	142719230	143640540
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143623909	144003068	96	86	-0.3018	3.76645063758797e-27	142719230	143640540	1.02712294281561e-21	143832442	144112795
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	144093719	1	0	NA	1.02712294281561e-21	143832442	144112795	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1743	-0.0098	NA	NA	NA	4.06664908707071e-55	150819879	150819879
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.3167	4.06664908707071e-55	150819879	150819879	4.11744741862632e-51	150851439	150851439
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	150852858	1	0	NA	4.11744741862632e-51	150851439	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2573	-0.003	NA	NA	NA	3.48886786030804e-63	157133150	157133150
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.2723	3.48886786030804e-63	157133150	157133150	1.75004763988549e-69	157136342	157136342
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	165208722	3097	2924	0.0061	1.75004763988549e-69	157136342	157136342	2.51863097809020e-08	165208722	165208722
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	165211033	165213820	2	2	-1.1624	2.5186309780902e-08	165208722	165208722	6.63383950547221e-09	165213820	165213820
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	165215078	167495719	1011	969	0.0302	6.63383950547221e-09	165213820	165213820	8.47080964366668e-11	167483267	167498254
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167497116	167523140	8	8	0.6866	8.47080964366668e-11	167483267	167498254	1.28047512087204e-10	167507898	167529221
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	194978218	9178	8620	0.0319	1.28047512087204e-10	167507898	167529221	3.76349511186633e-16	194977713	195014129
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.722	3.76349511186633e-16	194977713	195014129	6.64189042990312e-72	195046932	195091758
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	246931601	19527	18354	0.0057	6.64189042990312e-72	195046932	195091758	4.54125289832166e-75	246928454	246931601
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246933929	246940630	5	5	-1.0638	4.54125289832166e-75	246928454	246931601	2.63256887888046e-18	246940630	246940630
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246941904	247186514	73	68	0.1119	2.63256887888046e-18	246940630	246940630	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10813	-9e-04	NA	NA	NA	3.69288999331360e-49	34542224	34543992
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	3.6928899933136e-49	34542224	34543992	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	15	1.0148	NA	NA	NA	7.61695129947048e-52	34589997	34591681
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	41091579	2875	2706	0.0084	7.61695129947048e-52	34589997	34591681	1.02495862285906e-08	41087172	41094296
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-0.725	1.02495862285906e-08	41087172	41094296	4.1742405575103e-09	41098849	41105253
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	52600588	4312	4057	0.0261	4.1742405575103e-09	41098849	41105253	1.10394262258727e-12	52588009	52600588
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.9041	1.10394262258727e-12	52588009	52600588	4.26949360492486e-12	52635695	52639605
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	112747508	16603	15526	0.0203	4.26949360492486e-12	52635695	52639605	1.26260502352664e-09	112747508	112747508
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112749123	112750646	2	2	-1.2366	1.26260502352664e-09	112747508	112747508	7.28453613548481e-58	112750646	112750646
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112752277	242666531	42479	39810	0.0268	7.28453613548481e-58	112750646	112750646	1.62143126696006e-58	242501239	242677069
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677011	242689978	6	6	-0.2484	1.62143126696006e-58	242501239	242677069	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	17514137	6487	6070	-0.0271	NA	NA	NA	1.48558514499779e-29	17514137	17514137
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17516200	17519829	3	3	-1.1176	1.48558514499779e-29	17514137	17514137	4.37678135778e-12	17519829	17519829
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17521317	32074432	4305	4038	0.001	4.37678135778e-12	17519829	17519829	1.19508923951318e-18	32074432	32074432
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.6893	1.19508923951318e-18	32074432	32074432	2.57476311160827e-17	32080848	32080848
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46769081	5127	4791	0.0299	2.57476311160827e-17	32080848	32080848	0	46769081	46769081
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-5.2677	0	46769081	46769081	0	46825048	46825048
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	46827727	1	0	NA	0	46825048	46825048	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46829442	75479859	10942	10300	0.0287	NA	NA	NA	1.50221242958884e-10	75464737	75787094
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75874255	17	16	-0.4357	1.50221242958884e-10	75464737	75787094	1.10734116626010e-10	75868882	76006248
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75875904	163992903	26595	24965	0.0326	1.1073411662601e-10	75868882	76006248	0	163992903	163997228
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	-4.196	0	163992903	163997228	0	164105613	164107951
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9491	0.0036	0	164105613	164107951	0	194354505	194354505
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.2873	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	932	-0.0689	0	194366950	194366950	3.23722070755893e-17	196806091	196911055
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	28	-0.5141	3.23722070755893e-17	196806091	196911055	1.18413623331836e-21	196945209	196966631
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199329592	955	896	0.0151	1.18413623331836e-21	196945209	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3170	-0.0218	NA	NA	NA	9.76593531868066e-262	9815760	9815760
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9832823	3	3	-5.5366	9.76593531868066e-262	9815760	9815760	1.35537028623629e-318	9832823	9832823
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	1.35537028623629e-318	9832823	9832823	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	20164942	2760	2585	-0.0224	NA	NA	NA	1.08698790668121e-09	20163979	20164942
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20165806	20173045	5	4	-0.8755	1.08698790668121e-09	20163979	20164942	1.70265903774449e-11	20173045	20175821
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20175821	20530602	158	144	0.0298	1.70265903774449e-11	20173045	20175821	3.90110152549021e-14	20530602	20530602
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20532031	20533486	2	2	1.4384	3.90110152549021e-14	20530602	20530602	1.27397182580521e-12	20533486	20533486
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20534892	25317753	1477	1385	0.0122	1.27397182580521e-12	20533486	20533486	3.69630707101780e-06	25284790	25382635
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25323370	25416664	41	37	0.254	3.6963070710178e-06	25284790	25382635	4.38238155092436e-06	25372207	25441021
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25418120	26563737	368	341	0.0128	4.38238155092436e-06	25372207	25441021	3.31564624447601e-251	26563737	26563737
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-5.8173	3.31564624447601e-251	26563737	26563737	3.79420778027811e-231	26566345	26566345
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	68905670	10223	9561	0.0251	3.79420778027811e-231	26566345	26566345	2.47597237965833e-14	68897538	69075140
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	12	0.6336	2.47597237965833e-14	68897538	69075140	3.05240612398082e-13	69153675	69656183
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	107156970	12666	11898	0.0373	3.05240612398082e-13	69153675	69656183	1.10439379016274e-09	107156970	107156970
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107159916	107161814	2	2	-1.224	1.10439379016274e-09	107156970	107156970	4.98723563865482e-11	107161814	107161814
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107163423	108367366	335	315	0.0451	4.98723563865482e-11	107161814	107161814	2.74163880008468e-09	108364733	108367366
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108374099	108381089	3	3	-0.9188	2.74163880008468e-09	108364733	108367366	1.88017026247749e-08	108381089	108385219
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108385219	131389694	6472	6109	0.039	1.88017026247749e-08	108381089	108385219	5.15887585332517e-36	131389694	131389694
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	131398317	131467917	10	10	-1.0141	5.15887585332517e-36	131389694	131389694	1.94354149655948e-74	131467917	131467917
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	131473982	191153613	17226	16181	0.009	1.94354149655948e-74	131467917	131467917	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	730853	221	205	0.1019	NA	NA	NA	1.75445273758079e-19	729262	730853
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	737829	873365	9	8	1.1227	1.75445273758079e-19	729262	730853	5.45318651300053e-37	873365	905462
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3513	-0.0696	5.45318651300053e-37	873365	905462	2.50335006371976e-09	12853151	12857302
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.153	2.50335006371976e-09	12853151	12857302	9.8070196768609e-09	12873052	13263185
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	17532173	1521	1437	0.0093	9.8070196768609e-09	12873052	13263185	5.47624076157402e-14	17526186	17532173
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17535163	17559190	9	8	-0.7102	5.47624076157402e-14	17526186	17532173	1.31339002943918e-13	17559190	17647063
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17647063	167666531	43477	40822	0.026	1.31339002943918e-13	17559190	17647063	7.69030973413016e-11	167665024	167666531
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167667958	167670883	2	2	1.1238	7.69030973413016e-11	167665024	167666531	1.98202832742985e-07	167670883	167673354
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167673354	180644810	4780	4494	-0.0294	1.98202832742985e-07	167670883	167673354	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	251128	62	55	0.2296	NA	NA	NA	2.83652734712815e-23	228968	283152
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	252939	29950805	10525	9909	-0.0198	2.83652734712815e-23	228968	283152	6.84011942549088e-26	29939288	29972382
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	13	-0.6296	6.84011942549088e-26	29939288	29972382	5.07626236453152e-16	30004636	30021908
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	32558677	1076	1010	0.0206	5.07626236453152e-16	30004636	30021908	2.17677135448908e-115	32558677	32558677
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	7	-2.4158	2.17677135448908e-115	32558677	32558677	8.0020316019351e-130	32600962	32600962
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54033505	8302	7794	0.0097	8.0020316019351e-130	32600962	32600962	2.20198631226664e-17	54033505	54033505
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54035000	1	0	NA	2.20198631226664e-17	54033505	54033505	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.38	NA	NA	NA	1.20991867030319e-49	54042734	54042734
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	32312	0.0218	1.20991867030319e-49	54042734	54042734	6.46609652083224e-47	165642393	165645537
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.884	6.46609652083224e-47	165642393	165645537	5.78676818075305e-14	165650610	165653315
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	166414597	296	275	-0.1112	5.78676818075305e-14	165650610	165653315	4.54854473453878e-11	166414597	166414597
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166418511	166422386	3	3	-1.1264	4.54854473453878e-11	166414597	166414597	5.17187889074776e-10	166422386	166425475
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	166425475	170753106	1505	1411	-0.0265	5.17187889074776e-10	166422386	166425475	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	38258332	13600	12784	-0.0159	NA	NA	NA	3.80083530419711e-22	38238549	38269153
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38323325	31	28	-0.3408	3.80083530419711e-22	38238549	38269153	2.12672724276510e-11	38317119	38333171
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38325369	117930840	25337	23737	0.0297	2.1267272427651e-11	38317119	38333171	1.14651407337373e-12	117929350	117930840
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	117933613	117933613	1	0	NA	1.14651407337373e-12	117929350	117930840	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	117935831	117941979	4	4	-0.9991	NA	NA	NA	1.50581787291694e-13	117941979	117941979
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	117944491	125831554	3465	3262	0.0312	1.50581787291694e-13	117941979	117941979	2.03922479959679e-209	125831554	125831554
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.5533	2.03922479959679e-209	125831554	125831554	6.6170321287929e-204	125837524	125837524
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3409	0.0406	6.6170321287929e-204	125837524	125837524	4.09479157952579e-13	133426996	133433384
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7695	4.09479157952579e-13	133426996	133433384	3.14236724094571e-13	133448277	133455682
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	147702365	6352	5950	0.005	3.14236724094571e-13	133448277	133455682	1.88224187248817e-10	147702365	147702365
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.3622	1.88224187248817e-10	147702365	147702365	1.07924172845206e-11	147707161	147707161
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	149478933	698	648	0.0045	1.07924172845206e-11	147707161	147707161	7.39625832935994e-10	149443138	149505440
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149483098	149618691	23	20	-0.3853	7.39625832935994e-10	149443138	149505440	1.04241476043239e-05	149579172	149660721
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149619471	151728811	909	844	-0.0501	1.04241476043239e-05	149579172	149660721	2.01503087003563e-09	151724590	151734110
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151745100	9	8	-0.7199	2.01503087003563e-09	151724590	151734110	6.81523238273924e-14	151740878	151750057
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151747905	158821263	2599	2431	-0.032	6.81523238273924e-14	151740878	151750057	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	0.0708	NA	NA	NA	7.48583681796741e-84	581533	581533
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.4683	7.48583681796741e-84	581533	581533	2.85976925693273e-67	588865	588865
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	3983448	1343	1264	-0.0666	2.85976925693273e-67	588865	588865	3.7000453581523e-28	3982046	3983448
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3984761	3991110	5	5	-1.1138	3.7000453581523e-28	3982046	3983448	2.70094038363568e-17	3991110	3991110
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3992938	3992938	1	0	NA	2.70094038363568e-17	3991110	3991110	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3994373	6926661	921	867	-0.1216	NA	NA	NA	7.4424765574405e-17	6909487	6926661
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	0.5735	7.4424765574405e-17	6909487	6926661	2.10535806362011e-10	7790934	8143301
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	13648457	1999	1870	-0.0212	2.10535806362011e-10	7790934	8143301	3.84852532116613e-08	13642330	13648457
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	13660743	13695841	4	4	-0.8571	3.84852532116613e-08	13642330	13648457	4.16346345112601e-08	13695841	13709571
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	13709571	25022606	3725	3484	-0.0111	4.16346345112601e-08	13695841	13709571	1.09099864236988e-10	25017905	25022606
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25030003	1	0	NA	1.09099864236988e-10	25017905	25022606	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25034970	25039370	2	2	1.3515	NA	NA	NA	4.12314846972334e-11	25039370	25039370
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4652	0.0156	4.12314846972334e-11	25039370	25039370	4.72816537472761e-148	39345557	39350798
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	0.9169	4.72816537472761e-148	39345557	39350798	1.23191038078448e-143	39505256	39508035
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	75470767	9776	9192	0.0261	1.23191038078448e-143	39505256	39508035	4.5049542052972e-12	75470767	75470767
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75477572	75486872	3	3	-1.1182	4.5049542052972e-12	75470767	75470767	8.16330945297816e-13	75486872	75486872
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75496260	102684753	8019	7554	0.0333	8.16330945297816e-13	75486872	75486872	2.61467397683259e-08	102682688	102690502
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102686166	102688379	2	0	NA	2.61467397683259e-08	102682688	102690502	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102690502	102695889	4	4	-0.7805	NA	NA	NA	1.75782193163925e-23	102693995	102697333
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102697333	146264846	13629	12856	0.0041	1.75782193163925e-23	102693995	102697333	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	10436984	3883	3646	-0.0773	NA	NA	NA	2.5451557045232e-36	10435381	10436984
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	10438832	10440953	2	2	-1.1453	2.5451557045232e-36	10435381	10436984	1.69377941209433e-08	10440953	10440953
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	10444266	15802255	1573	1474	-0.0262	1.69377941209433e-08	10440953	10440953	4.04618866408402e-09	15801123	15802255
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.1315	4.04618866408402e-09	15801123	15802255	2.78891155493255e-08	15807123	15813356
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2224	-0.0108	2.78891155493255e-08	15807123	15813356	1.52834901670758e-15	22477358	22477358
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.535	1.52834901670758e-15	22477358	22477358	3.37397971537102e-14	22492603	22492603
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	153	-0.0277	3.37397971537102e-14	22492603	22492603	4.85924795376628e-08	23338535	23343915
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.9277	4.85924795376628e-08	23338535	23343915	1.48996256913153e-07	23365926	23395558
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4714	0.0163	1.48996256913153e-07	23365926	23395558	5.83286908863158e-127	70926188	70926188
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.3929	5.83286908863158e-127	70926188	70926188	5.13532843375317e-127	70930528	70930528
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14536	0.0108	5.13532843375317e-127	70930528	70930528	4.91022375588485e-12	116124007	116124007
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.3855	4.91022375588485e-12	116124007	116124007	5.47388987419525e-11	116130333	116130333
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7785	-0.0346	5.47388987419525e-11	116130333	116130333	1.48148127236243e-74	137352394	137352394
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-3.6002	1.48148127236243e-74	137352394	137352394	5.33431920051569e-63	137356880	137356880
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1032	-0.0014	5.33431920051569e-63	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	13510	-0.0166	NA	NA	NA	1.69554267749228e-149	45487335	46384985
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	46568496	72	68	0.8144	1.69554267749228e-149	45487335	46384985	1.97964763945711e-138	46561216	47017598
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	99883881	17493	16418	0.0205	1.97964763945711e-138	46561216	47017598	4.3497902242301e-309	99881777	99887552
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	99885268	100211473	147	134	-0.8262	4.3497902242301e-309	99881777	99887552	7.29516106203052e-291	100206713	100212794
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100212794	122758447	8120	7619	0.0075	7.29516106203052e-291	100206713	100212794	9.35494919930608e-15	122751618	122758447
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122760448	122774523	5	5	-0.9736	9.35494919930608e-15	122751618	122758447	1.94050171778146e-12	122774523	122777587
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122777587	135285645	4514	4262	-0.0334	1.94050171778146e-12	122774523	122777587	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5828251	2180	2054	-0.0196	NA	NA	NA	1.73917302591831e-21	5828251	5828251
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5832681	5832681	1	0	NA	1.73917302591831e-21	5828251	5828251	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5834025	5839924	5	5	-1.2956	NA	NA	NA	5.092116982264e-22	5839924	5839924
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5848930	7758275	829	787	-0.0852	5.092116982264e-22	5839924	5839924	1.24746270829375e-11	7758275	7758275
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7771593	2	2	-1.5	1.24746270829375e-11	7758275	7758275	0.00706737259994434	7771593	7774554
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7774067	7783492	7	7	-4.799	0.00706737259994434	7771593	7774554	0	7783492	7783492
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	55123719	13882	12991	0.0045	0	7783492	7783492	3.28953743342104e-22	55079532	55136234
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55197848	32	32	0.3012	3.28953743342104e-22	55079532	55136234	1.14245903314622e-07	55187282	55230765
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	66463477	4644	4367	0.0053	1.14245903314622e-07	55187282	55230765	6.83488673740035e-44	66463477	66463477
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.7384	6.83488673740035e-44	66463477	66463477	1.4341427698706e-46	66469412	66469412
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22291	0.0036	1.4341427698706e-46	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4063	-0.0328	NA	NA	NA	6.55983316020556e-29	11112600	11116883
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.004	6.55983316020556e-29	11112600	11116883	1.3366253180993e-22	11140421	11143592
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	123367713	37780	35546	0.0091	1.3366253180993e-22	11140421	11143592	3.17591215318052e-24	123344064	123383462
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123370406	123421199	27	24	0.3033	3.17591215318052e-24	123344064	123383462	3.46253245412103e-25	123414105	123453097
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123423659	132289090	3018	2836	-0.024	3.46253245412103e-25	123414105	123453097	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31428172	4884	4615	0.0156	NA	NA	NA	7.22870541279826e-40	31428172	31428172
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-2.4974	7.22870541279826e-40	31428172	31428172	6.59725278039636e-31	31436314	31436314
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	33030946	709	652	0.0125	6.59725278039636e-31	31436314	31436314	4.96578334988468e-08	33028007	33030946
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.9748	4.96578334988468e-08	33028007	33030946	1.42133216373812e-09	33042557	33042557
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	37953582	1740	1629	0.0233	1.42133216373812e-09	33042557	33042557	4.05494212650062e-16	37953582	37953582
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.5942	4.05494212650062e-16	37953582	37953582	2.29122198587307e-15	37957844	37957844
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6277	0.0138	2.29122198587307e-15	37957844	37957844	0	56650373	56650373
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	-5.1528	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	89659397	8253	7764	0.0244	0	56685341	56685341	1.84167159359995e-34	89659397	89659397
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.2631	1.84167159359995e-34	89659397	89659397	1.15187453419559e-32	89662326	89662326
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100689280	4784	4487	0.0127	1.15187453419559e-32	89662326	89662326	5.44092503129854e-178	100689280	100689280
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100690991	100690991	1	0	NA	5.44092503129854e-178	100689280	100689280	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.2195	NA	NA	NA	4.55807275858187e-161	100693892	100693892
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	100695073	1	0	NA	4.55807275858187e-161	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100696985	114123340	4561	4280	-0.0571	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	-0.2664	NA	NA	NA	0.000814253647310736	18544772	19323579
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	49	-0.7137	0.000814253647310736	18544772	19323579	1.25651002965734e-76	19489920	19497023
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21404592	932	883	0.0059	1.25651002965734e-76	19489920	19497023	7.6213943367836e-43	21377203	21431585
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21406288	22047168	318	302	-0.2416	7.6213943367836e-43	21377203	21431585	7.79388217839386e-54	22017734	22071780
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	106358491	30575	28641	-5e-04	7.79388217839386e-54	22017734	22071780	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	27258600	2028	1894	0.0181	NA	NA	NA	1.61152344649197e-12	27256848	27258600
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	27259615	27259615	1	0	NA	1.61152344649197e-12	27256848	27258600	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	27262681	27269466	4	4	-1.029	NA	NA	NA	2.84364263357761e-12	27269466	27269466
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	27270296	63376273	14734	13796	-0.0107	2.84364263357761e-12	27269466	27269466	1.55430975261045e-09	63376273	63376273
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63377410	63378446	2	2	-1.291	1.55430975261045e-09	63376273	63376273	2.00491613486393e-09	63378446	63378446
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63379468	87423643	9621	8992	-0.0132	2.00491613486393e-09	63378446	63378446	5.34626067919112e-11	87422242	87423643
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87426783	87426783	1	0	NA	5.34626067919112e-11	87422242	87423643	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87428021	87435510	5	5	-0.882	NA	NA	NA	1.96718344195253e-19	87435510	87436562
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87436562	96332514	3213	3030	-0.0516	1.96718344195253e-19	87435510	87436562	2.74229357984547e-21	96332514	96332514
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	96335046	96336996	2	2	-1.2702	2.74229357984547e-21	96332514	96332514	1.01033024065818e-09	96336996	96336996
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	96340028	99630163	1436	1340	-0.0358	1.01033024065818e-09	96336996	96336996	2.48132347576262e-34	99630163	99630163
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99632987	99632987	1	0	NA	2.48132347576262e-34	99630163	99630163	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.2434	NA	NA	NA	1.64668824731721e-28	99635701	99635701
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	257	0.0476	1.64668824731721e-28	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	938	0.0369	NA	NA	NA	3.4435325799819e-10	2593067	2600740
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2649851	4	4	1.0993	3.4435325799819e-10	2593067	2600740	3.33875739515324e-15	2649851	2660804
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2660804	14687636	4450	4174	-0.0443	3.33875739515324e-15	2649851	2660804	2.02055052778568e-09	14672496	14687636
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	15	-0.5097	2.02055052778568e-09	14672496	14687636	3.80402121579814e-11	15029941	15040558
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	31854794	5089	4772	0.0052	3.80402121579814e-11	15029941	15040558	4.91767581035622e-13	31818957	32525705
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33536526	45	44	0.3307	4.91767581035622e-13	31818957	32525705	1.34977708671802e-14	33511910	34056516
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	57203733	4293	4038	0.0058	1.34977708671802e-14	33511910	34056516	3.01443499151176e-09	57201427	57203733
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2239	3.01443499151176e-09	57201427	57203733	7.17176656807460e-09	57206772	57208375
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5264	-0.0039	7.1717665680746e-09	57206772	57208375	4.39349242250571e-20	75093957	75093957
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.4772	4.39349242250571e-20	75093957	75093957	9.36267426414274e-23	75100865	75100865
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	574	-0.0539	9.36267426414274e-23	75100865	75100865	2.58338837918675e-74	76925748	76925748
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76929598	1	0	NA	2.58338837918675e-74	76925748	76925748	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	7	1.7578	NA	NA	NA	4.96642672399439e-69	76940218	76940218
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4217	-0.0462	4.96642672399439e-69	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36634734	13856	13011	-0.0212	NA	NA	NA	1.60684710974854e-27	36624778	36634734
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-0.9183	1.60684710974854e-27	36624778	36634734	2.31145744705591e-06	36641335	36649589
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36673853	10	10	-0.1696	2.31145744705591e-06	36641335	36649589	2.44923984087887e-73	36673853	36673853
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.663	2.44923984087887e-73	36673853	36673853	1.05281788710481e-120	36684619	36684619
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41526558	2014	1876	-0.0144	1.05281788710481e-120	36684619	36684619	4.73102339038895e-100	41522429	41529227
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41527705	41710400	64	60	-0.7983	4.73102339038895e-100	41522429	41529227	9.9231352478145e-106	41706870	42142363
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12875	-0.0278	9.9231352478145e-106	41706870	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	159	0.0648	NA	NA	NA	2.4268058903921e-23	500897	500897
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	1.8567	2.4268058903921e-23	500897	500897	5.8538624224968e-44	505456	505456
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	75240793	22459	21099	-0.0242	5.8538624224968e-44	505456	505456	7.49042418639225e-41	75231474	75256228
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75243011	75282954	16	15	0.4146	7.49042418639225e-41	75231474	75256228	0.000102590464309470	75264292	75304100
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75284189	75284189	1	0	NA	0.00010259046430947	75264292	75304100	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75286857	76116026	311	296	0.0505	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1398325	491	458	0.0493	NA	NA	NA	3.57449399303094e-30	1398325	1398325
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.4759	3.57449399303094e-30	1398325	1398325	1.06879557977869e-32	1400840	1400840
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	14773105	6113	5755	-0.0232	1.06879557977869e-32	1400840	1400840	6.50866729571706e-15	14772035	14773105
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14776890	14783573	6	6	-1.0089	6.50866729571706e-15	14772035	14773105	5.78655069351309e-17	14783573	14787533
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14787533	15637575	434	412	-0.0319	5.78655069351309e-17	14783573	14787533	6.37712667545105e-20	15627509	15641897
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15640597	15692586	23	22	0.5428	6.37712667545105e-20	15627509	15641897	5.36698733540499e-19	15685046	15698069
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15693617	59414898	13985	13155	-0.0229	5.36698733540499e-19	15685046	15698069	1.10838380747572e-06	59398679	59421197
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59441741	13	13	-0.4275	1.10838380747572e-06	59398679	59421197	1.14700119450974e-14	59440274	59448341
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59442709	63788698	1991	1888	0.0041	1.14700119450974e-14	59440274	59448341	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	555	0.0419	NA	NA	NA	8.62766104475943e-102	1516966	1516966
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.3053	8.62766104475943e-102	1516966	1516966	5.13283992339383e-86	1531162	1531162
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	8303692	2390	2216	-0.0634	5.13283992339383e-86	1531162	1531162	1.27213522481001e-10	8303692	8303692
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8304958	8305019	2	2	1.3296	1.27213522481001e-10	8303692	8303692	1.42450108425050e-23	8305019	8305019
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8316776	26148060	6048	5693	-0.0384	1.4245010842505e-23	8305019	8305019	3.96124341761056e-24	26145205	26148764
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26158310	8	7	-0.6662	3.96124341761056e-24	26145205	26148764	6.47444655282806e-09	26156944	26168610
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26161111	43633334	5670	5318	-0.0099	6.47444655282806e-09	26156944	26168610	2.89885459189573e-273	43633334	43633334
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43637768	43638107	2	2	-6.5796	2.89885459189573e-273	43633334	43633334	7.61229049339234e-267	43638107	43638107
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43640726	62249141	6801	6395	-0.0326	7.61229049339234e-267	43638107	43638107	8.26209479070799e-29	62212078	62267614
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62250909	62419534	63	61	0.2459	8.26209479070799e-29	62212078	62267614	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2864	-0.0308	NA	NA	NA	3.14041707423721e-09	22564705	22573420
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-1.0334	3.14041707423721e-09	22564705	22573420	3.22712123336814e-09	22585040	22589739
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	36789648	5479	5134	-0.0401	3.22712123336814e-09	22585040	22589739	1.46057216614230e-16	36789648	36789648
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.5685	1.4605721661423e-16	36789648	36789648	4.91184935023042e-20	36791668	36791668
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4577	-0.0525	4.91184935023042e-20	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2781	-0.0127	NA	NA	NA	0	22667608	22682428
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	21	-3.5506	0	22667608	22682428	0	22715919	22721042
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	35472378	6548	6164	-0.037	0	22715919	22721042	1.21215783589422e-15	35472378	35472378
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.6261	1.21215783589422e-15	35472378	35472378	9.311148485602e-22	35476942	35476942
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6555	-0.0334	9.311148485602e-22	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.4654	NA	NA	NA	3.4892804466623e-18	94062	94062
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	3.4892804466623e-18	94062	94062	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-1.625	NA	NA	NA	1.3141552887625e-42	104732	104732
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	266212	114	108	0.1314	1.3141552887625e-42	104732	104732	5.79107824152693e-18	266212	266212
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	2.0261	5.79107824152693e-18	266212	266212	4.01536953635597e-20	267079	267079
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	2708291	1664	1571	0.0347	4.01536953635597e-20	267079	267079	0	2708113	2711273
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	105374269	29340	27523	0.9867	0	2708113	2711273	1.60357184946417e-144	105370618	105374269
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	105410186	105432233	3	3	-0.1351	1.60357184946417e-144	105370618	105374269	2.12391572138284e-10	105432233	105441581
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	105441581	118756710	4661	4393	1.0143	2.12391572138284e-10	105432233	105441581	1.35120861731281e-07	118753502	118756710
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118758343	118771103	2	2	2.229	1.35120861731281e-07	118753502	118756710	3.92093190650786e-68	118771103	118771103
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118773270	154017980	10986	10357	0.9561	3.92093190650786e-68	118771103	118771103	1.45462546013468e-64	153999014	154025967
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154078819	20	19	1.3487	1.45462546013468e-64	153999014	154025967	3.67380014075901e-06	154051619	154094350
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	117	0.9815	3.67380014075901e-06	154051619	154094350	1.33921552382136e-148	154578922	154586690
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	181	0.0649	1.33921552382136e-148	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-4.4819	NA	NA	NA	3.73113448588515e-42	3219200	3772482
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.9261	3.73113448588515e-42	3219200	3772482	2.13336766269036e-18	4948824	6652845
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	169	-4.0671	2.13336766269036e-18	4948824	6652845	7.22525747495681e-09	7025866	7204505
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7461576	120	114	-2.9494	7.22525747495681e-09	7025866	7204505	1.28361091432146e-10	7355550	7485594
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7713973	76	71	-4.3954	1.28361091432146e-10	7355550	7485594	4.44971482528658e-13	7709619	7723783
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7714929	7782532	24	22	-2.4377	4.44971482528658e-13	7709619	7723783	1.96203077142095e-05	7740903	7798534
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-3.7854	1.96203077142095e-05	7740903	7798534	2.52442999161438e-07	7897073	7905286
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.9221	2.52442999161438e-07	7897073	7905286	1.53446166967398e-07	7914104	7918899
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7964586	11	11	-4.4173	1.53446166967398e-07	7914104	7918899	5.78304691696144e-05	7938700	7970340
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7970340	7997485	8	8	-2.6026	5.78304691696144e-05	7938700	7970340	1.13761151813889e-05	7992221	8036254
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8280065	65	60	-4.2935	1.13761151813889e-05	7992221	8036254	1.04977533614001e-10	8259766	8289709
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8327467	15	11	-2.3316	1.04977533614001e-10	8259766	8289709	2.16242542299398e-12	8324328	8334196
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8327502	8547778	52	51	-4.4986	2.16242542299398e-12	8324328	8334196	2.04635053558348e-07	8539855	8548774
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8548774	8569769	15	14	-3.0281	2.04635053558348e-07	8539855	8548774	1.91586792775892e-06	8566630	8573516
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8570815	8637652	17	15	-4.3341	1.91586792775892e-06	8566630	8573516	2.85295498436672e-05	8614217	8652693
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8641679	8685946	12	10	-2.7955	2.85295498436672e-05	8614217	8652693	1.00083111135148e-06	8678888	8692156
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8687580	9160624	119	106	-4.3993	1.00083111135148e-06	8678888	8692156	1.93412160677891e-06	9145335	9160624
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10012024	11	8	-2.6901	1.93412160677891e-06	9145335	9160624	1.98364160039031e-07	10012024	10032083
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10515697	65	62	-4.564	1.98364160039031e-07	10012024	10032083	8.65118889077608e-47	10513747	10515697
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10535786	1	0	NA	8.65118889077608e-47	10513747	10515697	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10537808	10645500	11	11	-0.5216	NA	NA	NA	0.000196806964673485	10631941	12511461
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	67	-2.8083	0.000196806964673485	10631941	12511461	0.00119616605110605	12605673	12700767
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.3393	0.00119616605110605	12605673	12700767	1.27650337490513e-05	12809152	12852769
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12882767	17	16	-2.6947	1.27650337490513e-05	12809152	12852769	2.45967091542259e-05	12869489	12890628
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12887023	12887023	1	0	NA	2.45967091542259e-05	12869489	12890628	NA	NA	NA
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12888523	12926941	15	14	-4.3721	NA	NA	NA	6.37778821372193e-09	12925401	12958620
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	45	-2.0202	6.37778821372193e-09	12925401	12958620	0.000259892183510108	13019119	13052633
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13086552	16	15	-3.603	0.000259892183510108	13019119	13052633	6.65830414095628e-06	13080405	13101234
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13087750	13129843	17	17	-1.9706	6.65830414095628e-06	13080405	13101234	3.5263450656815e-06	13114969	13140274
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13271228	47	45	-3.5316	3.5263450656815e-06	13114969	13140274	2.62855645442667e-08	13213249	13314593
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13272362	14342834	361	335	-4.4204	2.62855645442667e-08	13213249	13314593	2.8313920508949e-25	14330251	14377844
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14687556	136	125	-3.2247	2.8313920508949e-25	14330251	14377844	2.81083749951771e-07	14549297	14705886
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14689490	15189646	128	116	-4.2089	2.81083749951771e-07	14549297	14705886	8.42133269043278e-05	15180502	15189646
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15191780	15201695	5	4	-1.5299	8.42133269043278e-05	15180502	15189646	1.25473259124536e-14	15201695	15201695
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15203221	15208612	6	6	-4.5897	1.25473259124536e-14	15201695	15201695	1.18045129873404e-08	15208612	15209166
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	9	-1.7318	1.18045129873404e-08	15208612	15209166	1.57092479112521e-07	15228303	15250474
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	16017681	291	270	-4.0842	1.57092479112521e-07	15228303	15250474	5.00714143300701e-10	16004746	16018437
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16018437	16062961	17	12	-1.737	5.00714143300701e-10	16004746	16018437	6.07809578764755e-13	16062175	16066990
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16064208	17785103	334	321	-4.2081	6.07809578764755e-13	16062175	16066990	9.96828726466526e-08	17775484	17785103
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17786688	17792907	4	4	-0.918	9.96828726466526e-08	17775484	17785103	9.26518062264151e-13	17792907	17795392
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17795392	19610243	147	139	-4.3584	9.2651806226415e-13	17792907	17795392	1.30345956995576e-08	19608039	19610243
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3628	1.30345956995576e-08	19608039	19610243	3.37910357552479e-07	19613864	19614809
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036503	292	278	-4.3891	3.37910357552479e-07	19613864	19614809	2.30336798005973e-12	21035621	21041164
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.3315	2.30336798005973e-12	21035621	21041164	1.50392643239449e-13	21048365	21054605
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21497583	140	135	-4.3322	1.50392643239449e-13	21048365	21054605	1.27491092056759e-06	21490803	21497583
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-1.784	1.27491092056759e-06	21490803	21497583	3.24830517001806e-08	21559551	21574425
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22139807	117	111	-4.3429	3.24830517001806e-08	21559551	21574425	2.48538002975534e-09	22055660	22158616
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	10	-2.5519	2.48538002975534e-09	22055660	22158616	3.00848279778704e-12	22176501	22181855
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22930737	92	87	-4.5117	3.00848279778704e-12	22176501	22181855	5.87606596505204e-85	22926726	25737663
MSK_252152915143_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	79	-1.4073	5.87606596505204e-85	22926726	25737663	NA	NA	NA
