Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	54350252	20781	19794	0.0108	NA	NA	NA	1.57493283506659e-08	54339695	54359696
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54352067	54375815	15	15	0.5537	1.57493283506659e-08	54339695	54359696	8.27460055987858e-10	54369327	54381763
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54377635	72537426	7098	6732	7e-04	8.27460055987858e-10	54369327	54381763	1.91183815881704e-51	72537426	72537426
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	1.3782	1.91183815881704e-51	72537426	72537426	1.07960276248106e-51	72579311	72579311
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150839754	17560	16703	8e-04	1.07960276248106e-51	72579311	72579311	4.12271237295619e-156	150839754	150839754
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-3.3666	4.12271237295619e-156	150839754	150839754	6.48224397668985e-151	150851439	150851439
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	242886313	33905	32281	-0.0026	6.48224397668985e-151	150851439	150851439	4.74986145244411e-17	242884207	242886313
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	242888176	242903599	8	7	-1.0755	4.74986145244411e-17	242884207	242886313	3.35602707276403e-17	242903599	242907496
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	242907496	247186514	1760	1674	0.002	3.35602707276403e-17	242903599	242907496	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	132753228	40361	38366	0.0016	NA	NA	NA	1.80988586302739e-38	132753228	132753228
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132754617	132755508	2	2	2.9416	1.80988586302739e-38	132753228	132753228	5.63490831648604e-40	132755508	132755508
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132763461	179767214	15919	15127	0.0043	5.63490831648604e-40	132755508	132755508	3.43250670022563e-195	179767214	179767214
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-5.255	3.43250670022563e-195	179767214	179767214	4.64273352491658e-189	179778919	179778919
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242689978	21542	20542	2e-04	4.64273352491658e-189	179778919	179778919	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	53001678	18661	17744	0.0049	NA	NA	NA	4.51136115614127e-142	53001678	53001678
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53009361	3	3	-4.5887	4.51136115614127e-142	53001678	53001678	8.41115050053362e-16	53009361	53009361
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53010535	53011885	2	2	-6.2662	8.41115050053362e-16	53009361	53009361	1.37730789342766e-184	53011885	53011885
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	163984178	34818	33170	0.005	1.37730789342766e-184	53011885	53011885	1.08027359331317e-43	163979984	163989367
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163987457	164107951	31	28	0.8276	1.08027359331317e-43	163979984	163989367	2.33064944767442e-43	164101776	164112873
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10585	0.0077	2.33064944767442e-43	164101776	164112873	2.85048365984188e-08	196802920	196913373
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196966631	33	32	-0.3392	2.85048365984188e-08	196802920	196913373	6.00783914866726e-08	196945209	196982148
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196968244	199329592	951	903	-0.0034	6.00783914866726e-08	196945209	196982148	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	211	0.0268	NA	NA	NA	5.34618551664094e-10	682752	682752
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	5.34618551664094e-10	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.5117	NA	NA	NA	6.4978463364373e-09	691065	691065
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	3020	0.0191	6.4978463364373e-09	691065	691065	4.01259756452242e-197	9815760	9815760
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7992	4.01259756452242e-197	9815760	9815760	3.00357450857819e-220	9842644	9842644
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	64376590	13954	13256	-2e-04	3.00357450857819e-220	9842644	9842644	2.68285263028495e-129	64376590	64376590
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.2069	2.68285263028495e-129	64376590	64376590	2.38872374928096e-124	64390333	64390333
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1022	-0.0068	2.38872374928096e-124	64390333	64390333	1.65025460869163e-11	68897538	69085386
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.6055	1.65025460869163e-11	68897538	69085386	4.55953067032156e-11	69153675	69665979
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	86315398	5601	5319	0.0065	4.55953067032156e-11	69153675	69665979	1.90742648855461e-10	86315398	86315398
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	86320148	86326324	2	2	-1.5342	1.90742648855461e-10	86315398	86315398	2.41096435024708e-10	86326324	86326324
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	86341037	173660684	25785	24549	0.0029	2.41096435024708e-10	86326324	86326324	2.99424285836852e-28	173660684	173660684
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.468	2.99424285836852e-28	173660684	173660684	1.61544438262345e-28	173666072	173666072
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5056	0.007	1.61544438262345e-28	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3782	0.0042	NA	NA	NA	4.46271077215177e-80	12857302	12857302
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.28	4.46271077215177e-80	12857302	12857302	1.18900295226222e-87	12873052	12873052
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	59745401	12296	11709	0.002	1.18900295226222e-87	12873052	12873052	2.12980538238885e-17	59733584	59751964
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59749078	59811658	26	25	0.5515	2.12980538238885e-17	59733584	59751964	2.34972711739976e-17	59805491	59819751
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59813250	140203440	23781	22622	1e-04	2.34972711739976e-17	59805491	59819751	9.9257085079689e-09	140198797	140203440
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-0.7575	9.9257085079689e-09	140198797	140203440	2.05686469237109e-08	140216524	140224323
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140219465	1	0	NA	2.05686469237109e-08	140216524	140224323	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	180644810	13678	12993	0.0019	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11124	0.0037	NA	NA	NA	4.70980704384827e-279	32558677	32567462
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.7203	4.70980704384827e-279	32558677	32567462	4.1385960366638e-265	32628420	32633691
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	7887	0.006	4.1385960366638e-265	32628420	32633691	1.54576786390569e-130	54035000	54035000
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.4576	1.54576786390569e-130	54035000	54035000	4.21421158889406e-142	54042734	54042734
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6106	0.0025	4.21421158889406e-142	54042734	54042734	3.32900872138331e-22	79011979	79024557
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8565	3.32900872138331e-22	79011979	79024557	7.68570294655012e-22	79085247	79095415
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26513	3e-04	7.68570294655012e-22	79085247	79095415	4.16514874146903e-150	165643653	165643653
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.9798	4.16514874146903e-150	165643653	165643653	3.14396559804177e-133	165650610	165650610
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1724	-0.008	3.14396559804177e-133	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26093050	8797	8389	0.0013	NA	NA	NA	8.59697746865987e-71	26093050	26093050
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26097755	26097755	1	0	NA	8.59697746865987e-71	26093050	26093050	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.0155	NA	NA	NA	2.17162872978113e-68	26108369	26108369
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	26400538	119	110	0.0318	2.17162872978113e-68	26108369	26108369	5.27632755899233e-11	26400538	26400538
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26403038	26404540	2	2	1.6835	5.27632755899233e-11	26400538	26400538	5.08910524999759e-12	26404540	26404540
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26406021	125831554	33517	31871	0.0017	5.08910524999759e-12	26404540	26404540	2.31161779559336e-127	125831554	125831554
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.3097	2.31161779559336e-127	125831554	125831554	2.25073136449716e-125	125837524	125837524
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141690753	7492	7105	0.0047	2.25073136449716e-125	125837524	125837524	1.55314700473411e-14	141687978	141700432
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8265	1.55314700473411e-14	141687978	141700432	2.22279459152592e-14	141711513	141720324
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	2.22279459152592e-14	141711513	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142152205	166	160	-0.0707	NA	NA	NA	4.05992350774429e-25	142152205	142152205
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-1.9003	4.05992350774429e-25	142152205	142152205	1.12820419575773e-25	142166710	142166710
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-5.5614	1.12820419575773e-25	142166710	142166710	2.19469397638548e-142	142167908	142167908
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147702365	2339	2226	-0.0033	2.19469397638548e-142	142167908	142167908	5.35742347675552e-09	147699576	147702365
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147708382	3	3	-1.1769	5.35742347675552e-09	147699576	147702365	1.29566545471250e-07	147708382	147710037
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	158821263	4237	3998	-0.0036	1.2956654547125e-07	147708382	147710037	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25116684	8157	7770	-7e-04	NA	NA	NA	5.94697365558964e-18	25116684	25116684
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25119007	25119007	1	0	NA	5.94697365558964e-18	25116684	25116684	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25125700	4	4	1.4419	NA	NA	NA	1.60060945073037e-18	25125700	25125700
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	98255782	21021	20001	5e-04	1.60060945073037e-18	25125700	25125700	1.44628361560078e-14	98251625	98255782
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98262293	98281704	7	7	-0.972	1.44628361560078e-14	98251625	98255782	2.75664599550409e-14	98281704	98294699
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	98288633	104709402	2564	2461	0.0021	2.75664599550409e-14	98281704	98294699	6.24846793826223e-12	104709402	104709402
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104709434	104725861	2	2	-1.6676	6.24846793826223e-12	104709402	104709402	3.97880915789494e-12	104725861	104725861
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104726889	146264846	12810	12171	0.0094	3.97880915789494e-12	104725861	104725861	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12431	2e-04	NA	NA	NA	1.83646518396373e-68	70926188	70926188
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.8365	1.83646518396373e-68	70926188	70926188	2.24107053922915e-64	70930528	70930528
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23631	-0.0039	2.24107053922915e-64	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	13739	0.001	NA	NA	NA	4.06665506894683e-16	45461800	46407311
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47021415	74	72	0.3212	4.06665506894683e-16	45461800	46407311	5.10789124588488e-14	46527012	47088418
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	53683740	1771	1669	0.0156	5.10789124588488e-14	46527012	47088418	2.71095858276742e-24	53683740	53683740
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-2.3619	2.71095858276742e-24	53683740	53683740	2.52532007471712e-24	53687880	53687880
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	135285645	28504	27088	2e-04	2.52532007471712e-24	53687880	53687880	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	417965	84	82	-0.0265	NA	NA	NA	3.10599319258531e-11	417965	417965
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	420644	422010	2	2	1.8408	3.10599319258531e-11	417965	417965	2.56311066219671e-14	422010	422010
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	423403	55118214	16819	16041	8e-04	2.56311066219671e-14	422010	422010	1.95313656634508e-46	55112618	55127355
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-0.756	1.95313656634508e-46	55112618	55127355	2.85746841624539e-46	55203706	55219985
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	81530809	9955	9442	0.0048	2.85746841624539e-46	55203706	55219985	1.64553397356676e-123	81530809	81530809
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81540765	3	3	-4.3334	1.64553397356676e-123	81530809	81530809	6.94610569209874e-130	81540765	81540765
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	134450318	18402	17505	-4e-04	6.94610569209874e-130	81540765	81540765	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3574	-0.0027	NA	NA	NA	1.23588724869197e-15	9456107	9528590
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9604633	14	14	0.7341	1.23588724869197e-15	9456107	9528590	2.29862620294272e-19	9599999	9610054
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11116883	573	535	-0.0166	2.29862620294272e-19	9599999	9610054	8.30478688712362e-158	11116883	11116883
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	-3.3037	8.30478688712362e-158	11116883	11116883	5.80232455026931e-149	11140421	11140421
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	132289090	40825	38863	0.0042	5.80232455026931e-149	11140421	11140421	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11634	0.0014	NA	NA	NA	4.94564664713623e-41	49964838	49964838
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.984	4.94564664713623e-41	49964838	49964838	2.29500869289045e-41	49971732	49971732
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1717	0.0136	2.29500869289045e-41	49971732	49971732	1.36922055614957e-13	56607869	56658479
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.6305	1.36922055614957e-13	56607869	56658479	2.17665110787914e-14	56681665	56691355
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	100690991	13039	12409	0.0033	2.17665110787914e-14	56681665	56691355	5.3289163879629e-36	100690991	100690991
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.7619	5.3289163879629e-36	100690991	100690991	6.79942966028882e-36	100693892	100693892
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4337	0.0117	6.79942966028882e-36	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.0566	NA	NA	NA	4.94067796649483e-06	18544772	18864561
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	50	-0.6576	4.94067796649483e-06	18544772	18864561	6.44848546414659e-48	19490630	19538610
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40680589	7589	7246	-0.004	6.44848546414659e-48	19490630	19538610	6.01398548478031e-12	40663660	40680589
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	7	-0.7084	6.01398548478031e-12	40663660	40680589	8.02302433754871e-09	40726930	40754507
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	46775775	1359	1297	0.0149	8.02302433754871e-09	40726930	40754507	7.08523710474719e-11	46774115	46775775
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46778735	46787389	5	5	-0.9309	7.08523710474719e-11	46774115	46775775	2.69458044353529e-09	46787389	46789074
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46789074	73061942	10399	9843	-0.0017	2.69458044353529e-09	46787389	46789074	1.44071929632825e-12	73058103	73061942
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.9029	1.44071929632825e-12	73058103	73061942	4.47607695096556e-11	73092112	73101327
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2769	0.0052	4.47607695096556e-11	73092112	73101327	1.06078575835972e-164	79174722	79174722
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-4.5075	1.06078575835972e-164	79174722	79174722	1.22075007880518e-175	79183154	79183154
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	106358491	9540	9078	0.0046	1.22075007880518e-175	79183154	79183154	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18857376	22	21	-0.0095	NA	NA	NA	1.44860129662652e-05	18835660	19123327
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18860281	20079935	133	129	0.3646	1.44860129662652e-05	18835660	19123327	2.2499711229566e-36	20020938	20347935
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	74669752	21556	20468	0.0035	2.2499711229566e-36	20020938	20347935	2.21997467042964e-175	74669752	74669752
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.4465	2.21997467042964e-175	74669752	74669752	2.72082904010338e-175	74680439	74680439
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	95609756	7615	7216	-0.0013	2.72082904010338e-175	74680439	74680439	1.02675995534941e-15	95606006	95609756
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-1.1085	1.02675995534941e-15	95606006	95609756	4.31907497556665e-17	95632390	95656272
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	98232932	1072	1016	0.0076	4.31907497556665e-17	95632390	95656272	4.92847768547705e-16	98232932	98232932
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98237721	2	2	-1.8752	4.92847768547705e-16	98232932	98232932	1.01052871132586e-13	98237721	98237721
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98239454	98239454	1	0	NA	1.01052871132586e-13	98237721	98237721	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	610	0.0023	NA	NA	NA	3.67492489637608e-24	99632987	99632987
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.4484	3.67492489637608e-24	99632987	99632987	2.2621796293483e-25	99635701	99635701
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	256	-0.0089	2.2621796293483e-25	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34297461	10703	10202	0.0163	NA	NA	NA	2.8101965195852e-16	34240270	34347190
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34302966	34602318	56	54	0.4105	2.8101965195852e-16	34240270	34347190	1.14169320420805e-18	34552260	34631759
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9266	0.0099	1.14169320420805e-18	34552260	34631759	2.67463799584024e-59	75093957	75093957
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.6361	2.67463799584024e-59	75093957	75093957	8.56814455413669e-59	75100865	75100865
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	586	0.0212	8.56814455413669e-59	75100865	75100865	3.49413657253794e-143	76923844	76923844
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	3.49413657253794e-143	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.8985	NA	NA	NA	5.91526430935234e-134	76940218	76940218
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4296	-8e-04	5.91526430935234e-134	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	399	0.0473	NA	NA	NA	6.34562766885823e-12	1028979	1028979
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.6857	6.34562766885823e-12	1028979	1028979	1.92210440305449e-10	1030766	1030766
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	412	-0.003	1.92210440305449e-10	1030766	1030766	2.22697735282843e-08	1903358	1904451
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.2388	2.22697735282843e-08	1903358	1904451	4.2285053908669e-09	1906391	1909371
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12369	0.001	4.2285053908669e-09	1906391	1909371	6.95912994564855e-32	36673853	36673853
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	3	-2.2499	6.95912994564855e-32	36673853	36673853	8.94802451333579e-31	36684619	36684619
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1914	0.0132	8.94802451333579e-31	36684619	36684619	6.76152153059872e-11	41512318	41522429
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41568539	21	18	-0.5452	6.76152153059872e-11	41512318	41522429	6.46426719949487e-05	41561017	41581624
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41652861	38	37	-0.8832	6.46426719949487e-05	41561017	41581624	5.82679606167468e-62	41648545	41697532
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41697532	78653545	13686	12995	0.0022	5.82679606167468e-62	41648545	41697532	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	165	0.0236	NA	NA	NA	3.40148250390069e-13	500897	500897
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	1.7402	3.40148250390069e-13	500897	500897	4.05556081560297e-13	505456	505456
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	76116026	22787	21627	7e-04	4.05556081560297e-13	505456	505456	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1191598	387	371	0.0661	NA	NA	NA	1.55726436066472e-11	1191598	1191598
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1193659	1198432	3	0	NA	1.55726436066472e-11	1191598	1191598	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1200840	1202176	2	2	1.8317	NA	NA	NA	1.12756894289629e-11	1202176	1202176
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1203447	11448975	4780	4556	0.0227	1.12756894289629e-11	1202176	1202176	4.90849728354234e-13	11448975	11448975
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.9298	4.90849728354234e-13	11448975	11448975	2.89672641282352e-15	11452390	11452390
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	20386500	4041	3836	0.0167	2.89672641282352e-15	11452390	11452390	1.04613790037309e-22	20383210	20386500
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20493401	16	14	-0.8623	1.04613790037309e-22	20383210	20386500	4.0363644087975e-22	20493401	20510787
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	63788698	13828	13157	0.0162	4.0363644087975e-22	20493401	20510787	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	555	-0.0047	NA	NA	NA	3.69674060358728e-147	1506379	1516966
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-3.2736	3.69674060358728e-147	1506379	1516966	2.67456917376993e-187	1525300	1531162
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19911	0.002	2.67456917376993e-187	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	36789648	8545	8154	0.0049	NA	NA	NA	9.5578090319705e-55	36789648	36789648
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	3.408	9.5578090319705e-55	36789648	36789648	1.31992193419498e-46	36791668	36791668
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	36792708	1	0	NA	1.31992193419498e-46	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36793649	46922972	4893	4649	9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1080	0.0147	NA	NA	NA	5.4147790980744e-30	18125356	18125356
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.7403	5.4147790980744e-30	18125356	18125356	1.47052126186007e-30	18129194	18129194
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	35472378	8418	7985	0.0106	1.47052126186007e-30	18129194	18129194	1.76581120959329e-48	35472378	35472378
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4128	1.76581120959329e-48	35472378	35472378	6.25498816936595e-46	35476942	35476942
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	6.25498816936595e-46	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	49571068	7002	6629	0.0095	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	30	0.1806	NA	NA	NA	9.43307852076745e-16	127779	127779
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	129104	1	0	NA	9.43307852076745e-16	127779	127779	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129544	130528	2	2	2.7173	NA	NA	NA	1.07937424556228e-19	130528	130528
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	89	0.0807	1.07937424556228e-19	130528	130528	1.48768293887238e-10	264190	266212
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	2.0346	1.48768293887238e-10	264190	266212	9.0708868588843e-18	267079	267079
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1528282	725	685	0.0389	9.0708868588843e-18	267079	267079	8.88118394170355e-10	1528282	1528282
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1529377	2	2	-1.4513	8.88118394170355e-10	1528282	1528282	0	1529377	1529377
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1530314	1530474	2	2	-0.9409	0	1529377	1529377	8.21717204877385e-05	1530474	1533546
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2708291	935	881	0.0211	8.21717204877385e-05	1530474	1533546	0	2706218	2711273
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	21736	0.9028	0	2706218	2711273	2.03263220674853e-58	76998610	76998610
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.7668	2.03263220674853e-58	76998610	76998610	3.36287483321263e-58	77010018	77010018
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154050185	22064	21027	0.9027	3.36287483321263e-58	77010018	77010018	6.32506062442259e-07	154046681	154050185
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154051619	154078401	6	5	1.7483	6.32506062442259e-07	154046681	154050185	4.75941328281353e-06	154078401	154085354
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078819	154442377	91	87	0.895	4.75941328281353e-06	154078401	154085354	1.68830435840822e-97	154442377	154442377
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-3.5487	1.68830435840822e-97	154442377	154442377	3.99137022038893e-121	154450309	154450309
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.9166	3.99137022038893e-121	154450309	154450309	3.35945918110989e-39	154578922	154586690
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	-0.0036	3.35945918110989e-39	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3780462	128	117	-4.2087	NA	NA	NA	7.14669919589029e-16	3773948	4413507
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4174561	4174561	1	0	NA	7.14669919589029e-16	3773948	4413507	NA	NA	NA
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.7223	NA	NA	NA	1.66213135711004e-08	5422507	6692482
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	167	-3.9669	1.66213135711004e-08	5422507	6692482	8.82857665110784e-09	7029972	7190466
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7304209	79	73	-2.818	8.82857665110784e-09	7029972	7190466	4.43627839384978e-13	7259689	7331655
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	10513747	573	537	-3.9114	4.43627839384978e-13	7259689	7331655	5.00230907183106e-25	10512616	10513747
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.6262	5.00230907183106e-25	10512616	10513747	2.89581186169631e-06	10620136	12502304
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	63	-3.0925	2.89581186169631e-06	10620136	12502304	0.00155018685873224	12605673	12700767
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.4545	0.00155018685873224	12605673	12700767	1.10605971403637e-05	12796639	12850287
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12899653	23	22	-3.2643	1.10605971403637e-05	12796639	12850287	6.01654111575138e-05	12888523	12905395
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12901857	12928074	11	11	-4.5002	6.01654111575138e-05	12888523	12905395	1.37396961157539e-06	12928074	12958620
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13119344	76	74	-2.6584	1.37396961157539e-06	12928074	12958620	0.0878925184817062	13010597	13119344
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.4911	0.0878925184817062	13010597	13119344	8.84173501787915e-06	13128515	13129843
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14407293	440	415	-4.1287	8.84173501787915e-06	13128515	13129843	1.14081775510082e-09	14370346	14449913
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14694578	109	105	-3.3648	1.14081775510082e-09	14370346	14449913	6.96767843273372e-09	14545228	14742448
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	22139807	1499	1428	-4.0872	6.96767843273372e-09	14545228	14742448	1.76384914924849e-06	22052726	22165808
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0532	1.76384914924849e-06	22052726	22165808	1.43470164715675e-11	22175425	22179794
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	89	-4.2232	1.43470164715675e-11	22175425	22179794	1.34762390838191e-50	23283689	26870361
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-1.5134	1.34762390838191e-50	23283689	26870361	0.00068286499140081	26933862	27003308
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.9549	0.00068286499140081	26933862	27003308	6.225961000364e-05	27007874	27053237
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-1.0657	6.225961000364e-05	27007874	27053237	8.65861500412687e-09	27131764	27163598
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.855	8.65861500412687e-09	27131764	27163598	8.92619546294255e-15	27172283	27176933
MSK_252152915175_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.2499	8.92619546294255e-15	27172283	27176933	NA	NA	NA
