Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16704522	5781	5559	0.0309	NA	NA	NA	9.73853759302618e-14	16659021	16799711
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16926444	12	12	-0.3626	9.73853759302618e-14	16659021	16799711	5.7936024227669e-08	16921319	17094326
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	24391166	3041	2918	0.0176	5.7936024227669e-08	16921319	17094326	7.40894375593707e-08	24389046	24391166
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-0.9065	7.40894375593707e-08	24389046	24391166	4.07305927124970e-08	24395691	24398563
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	24397212	1	0	NA	4.0730592712497e-08	24395691	24398563	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24398563	72537426	19057	18390	-0.0016	NA	NA	NA	2.40354926694333e-155	72537426	72537426
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.4248	2.40354926694333e-155	72537426	72537426	3.33155954749978e-162	72579311	72579311
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11286	-0.0107	3.33155954749978e-162	72579311	72579311	7.5696360081693e-12	110023268	110023268
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.8728	7.5696360081693e-12	110023268	110023268	1.62308877492261e-10	110039388	110058441
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	1.62308877492261e-10	110039388	110058441	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	111390573	547	522	-0.0143	NA	NA	NA	2.21030418858643e-08	111388684	111390573
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111396840	111423823	4	3	-0.7852	2.21030418858643e-08	111388684	111390573	1.99377450756721e-09	111423823	111435786
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111435786	150819879	5298	5094	-0.0132	1.99377450756721e-09	111423823	111435786	1.72147305405431e-276	150819879	150819879
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.113	1.72147305405431e-276	150819879	150819879	3.53415330849211e-154	150851439	150851439
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.0088	3.53415330849211e-154	150851439	150851439	0	151026228	151026228
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-5.1229	0	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2577	-0.0069	0	151036435	151036435	1.59646591561892e-39	157133150	157133150
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.9607	1.59646591561892e-39	157133150	157133150	3.46995492166324e-42	157136342	157136342
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200602881	15465	14959	-0.0132	3.46995492166324e-42	157136342	157136342	5.98701680754255e-19	200594055	200620756
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200803726	40	40	-0.313	5.98701680754255e-19	200594055	200620756	6.80571538814162e-20	200698665	200810641
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	227872808	9920	9577	-0.0017	6.80571538814162e-20	200698665	200810641	2.55446888080902e-07	227871579	227872808
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227875096	227875096	1	0	NA	2.55446888080902e-07	227871579	227872808	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-0.7098	NA	NA	NA	5.91511016821896e-08	227882805	227889619
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	243702540	6080	5886	-0.0032	5.91511016821896e-08	227882805	227889619	6.82304236328997e-26	243700961	243702540
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243714007	7	7	-0.8163	6.82304236328997e-26	243700961	243702540	5.10105947618617e-22	243714007	243715818
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243715818	247186514	1393	1355	0.0012	5.10105947618617e-22	243714007	243715818	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10503	0.0093	NA	NA	NA	1.90288523134665e-201	33076512	33076512
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.2515	1.90288523134665e-201	33076512	33076512	1.88886246036349e-204	33080437	33080437
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	35821494	1146	1108	0.0025	1.88886246036349e-204	33080437	33080437	4.42996214396173e-17	35821494	35821494
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.2526	4.42996214396173e-17	35821494	35821494	2.91796754052529e-16	35844884	35844884
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6451	-0.0087	2.91796754052529e-16	35844884	35844884	2.30958180365137e-12	52588009	52600588
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	2.30958180365137e-12	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7621	NA	NA	NA	2.11889931734620e-13	52635695	52639605
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4390	-0.0064	2.1188993173462e-13	52635695	52639605	3.17606515773949e-10	66357387	66357387
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	0.9488	3.17606515773949e-10	66357387	66357387	1.34741836509903e-09	66360747	66360747
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	106244482	10614	10253	-0.004	1.34741836509903e-09	66360747	66360747	1.73300041274929e-10	106244482	106244482
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-0.9973	1.73300041274929e-10	106244482	106244482	1.76218871179885e-23	106250718	106250718
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	212890878	33223	32111	-0.0083	1.76218871179885e-23	106250718	106250718	2.39049119104823e-24	212890878	212890878
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.0602	2.39049119104823e-24	212890878	212890878	6.96716100396498e-24	212898875	212898875
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10286	0.0075	6.96716100396498e-24	212898875	212898875	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	11383299	4086	3945	0.0117	NA	NA	NA	4.92325740111976e-17	11383299	11383299
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-0.9825	4.92325740111976e-17	11383299	11383299	6.10384019938318e-15	11389624	11389624
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	32074432	6706	6480	-0.013	6.10384019938318e-15	11389624	11389624	1.83011124465413e-17	32074432	32074432
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.267	1.83011124465413e-17	32074432	32074432	5.33616567494251e-17	32080848	32080848
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	78248090	16952	16304	-0.0021	5.33616567494251e-17	32080848	32080848	3.02763570693600e-09	78239601	78260953
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	78249428	78264444	8	8	0.3491	3.027635706936e-09	78239601	78260953	6.63619153664025e-05	78251454	78273001
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	78267329	133189686	15951	15373	-0.0035	6.63619153664025e-05	78251454	78273001	1.62924710515448e-40	133189686	133189686
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-1.9	1.62924710515448e-40	133189686	133189686	2.43078162958010e-39	133194685	133194685
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.4307816295801e-39	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9452	-0.0088	NA	NA	NA	7.76750310698196e-46	164005577	164009321
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.4443	7.76750310698196e-46	164005577	164009321	1.58996250334751e-46	164019640	164027724
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	192548135	9569	9216	-0.009	1.58996250334751e-46	164019640	164027724	3.14631086483824e-08	192546280	192548135
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192549325	192552734	3	3	-0.7295	3.14631086483824e-08	192546280	192548135	6.87530748642245e-08	192552734	192554451
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	566	-0.005	6.87530748642245e-08	192552734	192554451	0	194354505	194354505
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.9445	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	963	-0.0034	0	194366950	194366950	3.52435568656647e-23	196820428	196905767
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	19	-0.4716	3.52435568656647e-23	196820428	196905767	2.29436185784751e-20	196928503	196942158
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	932	0	2.29436185784751e-20	196928503	196942158	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9254	0.0166	NA	NA	NA	6.52822244153484e-35	34439897	34445002
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.607	6.52822244153484e-35	34439897	34445002	1.72211922122739e-11	34491115	34506297
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	94155297	17359	16761	-0.0089	1.72211922122739e-11	34491115	34506297	4.04788066121717e-18	94155297	94155297
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94156438	94158490	2	2	-1.2931	4.04788066121717e-18	94155297	94155297	1.79646862198526e-18	94158490	94158490
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94160687	94160687	1	0	NA	1.79646862198526e-18	94158490	94158490	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94163196	187330240	26986	26032	-0.0103	NA	NA	NA	3.16664891072404e-39	187330240	187330240
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.8605	3.16664891072404e-39	187330240	187330240	1.46391665749743e-35	187333619	187333619
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1189	0.0238	1.46391665749743e-35	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	730853	221	218	0.0506	NA	NA	NA	1.77290296838284e-08	727098	737829
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	737829	829954	7	7	0.5888	1.77290296838284e-08	727098	737829	1.94912275384005e-42	829954	829954
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-1.0847	1.94912275384005e-42	829954	829954	7.39552880771102e-14	873365	873365
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	7222660	1943	1876	0.0506	7.39552880771102e-14	873365	873365	1.16366209487759e-22	7222660	7222660
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7232549	7246064	4	4	-0.9702	1.16366209487759e-22	7222660	7222660	1.36285806860161e-23	7246064	7246064
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7253683	12857302	1798	1734	0.0068	1.36285806860161e-23	7246064	7246064	1.93120906169631e-16	12857302	12857302
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.1638	1.93120906169631e-16	12857302	12857302	1.98395608188768e-18	12873052	12873052
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180194323	49668	47920	-0.0038	1.98395608188768e-18	12873052	12873052	3.38214234822163e-17	180189516	180194323
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	9	-0.5278	3.38214234822163e-17	180189516	180194323	9.59342452769108e-15	180362342	180364670
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	106	0.0467	9.59342452769108e-15	180362342	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	0.0282	NA	NA	NA	9.9789423596128e-17	183349	210326
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	322557	59	55	-0.3231	9.9789423596128e-17	183349	210326	6.2385528257655e-31	313153	329100
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	323898	26853170	9269	8934	-0.0081	6.2385528257655e-31	313153	329100	7.7124532482123e-11	26811016	26853170
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26855591	26868404	5	5	0.5287	7.7124532482123e-11	26811016	26853170	2.65917836956615e-08	26868404	27054075
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	27049454	29950805	1214	1166	-0.0192	2.65917836956615e-08	26868404	27054075	3.00239348376076e-14	29937319	29992946
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30040917	23	23	0.3214	3.00239348376076e-14	29937319	29992946	1.21306074489091e-11	30005338	30053354
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30046181	31385778	572	547	-0.018	1.21306074489091e-11	30005338	30053354	1.30971262031254e-15	31383925	31385778
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31395330	5	5	-0.8158	1.30971262031254e-15	31383925	31385778	6.28023272964543e-16	31395330	31418006
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31418006	32558677	490	473	-0.0129	6.28023272964543e-16	31395330	31418006	3.63738316139647e-47	32558677	32590568
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	15	0.8506	3.63738316139647e-47	32558677	32590568	1.60365846480244e-08	32613538	32634977
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	26	0.0187	1.60365846480244e-08	32613538	32634977	9.9865594931651e-05	32707427	32720656
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.6885	9.9865594931651e-05	32707427	32720656	2.14656692111471e-17	32723366	32731072
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862502	1346	1300	-0.0046	2.14656692111471e-17	32723366	32731072	3.74946482166617e-15	35856922	35862502
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.7452	3.74946482166617e-15	35856922	35862502	6.833490369382e-18	35873335	35875112
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6650	-0.0042	6.833490369382e-18	35873335	35875112	1.39458164411543e-33	54035000	54035000
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.4192	1.39458164411543e-33	54035000	54035000	2.87830358694439e-34	54042734	54042734
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6206	-0.0018	2.87830358694439e-34	54042734	54042734	0	79018959	79018959
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-5.4543	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	6066	-0.0079	0	79091850	79091850	4.35497141118964e-18	102039635	102039635
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.0474	4.35497141118964e-18	102039635	102039635	9.9881070970886e-19	102044331	102044331
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	468	-0.0018	9.9881070970886e-19	102044331	102044331	1.9491812675167e-24	103841482	103841482
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0232	1.9491812675167e-24	103841482	103841482	7.24574020539218e-24	103868154	103868154
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10099	-0.0139	7.24574020539218e-24	103868154	103868154	8.08385990603852e-22	134629897	134629897
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-1.0071	8.08385990603852e-22	134629897	134629897	5.15253897361521e-22	134635779	134635779
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10223	-0.014	5.15253897361521e-22	134635779	134635779	4.75823040916912e-103	165643653	165643653
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.1068	4.75823040916912e-103	165643653	165643653	2.37541915651275e-86	165650610	165650610
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1752	0.0203	2.37541915651275e-86	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1037402	259	245	0.0612	NA	NA	NA	1.15559119536248e-17	1036135	1037402
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1038517	1047707	3	3	-1.0326	1.15559119536248e-17	1036135	1037402	2.30528471571177e-25	1047707	1047707
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	16135701	5126	4929	0.0151	2.30528471571177e-25	1047707	1047707	2.44943006358780e-26	16135701	16135701
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.1336	2.4494300635878e-26	16135701	16135701	6.81729798918416e-15	16140018	16140018
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	28931256	4671	4515	-0.0129	6.81729798918416e-15	16140018	16140018	7.5549839568592e-26	28931256	28931256
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	28935347	28946764	5	5	-0.9607	7.5549839568592e-26	28931256	28931256	1.08577344593066e-24	28946764	28946764
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	28948661	109966116	25200	24359	0.0041	1.08577344593066e-24	28946764	28946764	5.37955341636651e-08	109964306	109966116
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109974402	3	3	-0.7322	5.37955341636651e-08	109964306	109966116	5.90611171658529e-08	109974402	109976628
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	127454823	7942	7664	-0.0122	5.90611171658529e-08	109974402	109976628	6.34894837906375e-19	127454823	127454823
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	127458264	127459412	2	2	-1.3408	6.34894837906375e-19	127454823	127454823	2.78623845400773e-19	127459412	127459412
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	127460961	141410894	6590	6377	0.0041	2.78623845400773e-19	127459412	127459412	8.2315416736234e-18	141409512	141413352
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	12	0.5329	8.2315416736234e-18	141409512	141413352	2.29779733401436e-15	141434131	141440184
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141690753	118	115	0.0136	2.29779733401436e-15	141434131	141440184	2.81516194188969e-212	141690753	141698634
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.6625	2.81516194188969e-212	141690753	141698634	4.31449635509517e-260	141712786	141714168
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	4.31449635509517e-260	141712786	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142152205	166	159	-3e-04	NA	NA	NA	8.93454305996291e-07	142140540	142152205
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142187073	8	8	0.4185	8.93454305996291e-07	142140540	142152205	3.22393803112195e-07	142187073	142192030
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187097	143582864	485	465	-0.0019	3.22393803112195e-07	142187073	142192030	2.49815722024493e-08	143582864	143582864
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143583309	143584350	2	2	0.894	2.49815722024493e-08	143582864	143582864	1.11874297357494e-08	143584350	143584350
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	146350117	1173	1139	9e-04	1.11874297357494e-08	143584350	143584350	4.79364612513756e-15	146350117	146350117
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146351946	146353730	2	2	-1.165	4.79364612513756e-15	146350117	146350117	1.32073842667869e-14	146353730	146353730
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146356235	147702365	675	647	-0.0058	1.32073842667869e-14	146353730	146353730	3.34708577528276e-12	147702365	147702365
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.0819	3.34708577528276e-12	147702365	147702365	1.65099517633192e-12	147707161	147707161
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	147708382	1	0	NA	1.65099517633192e-12	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	148416647	321	311	0.0063	NA	NA	NA	1.14875448960703e-37	148416647	148416647
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148418227	148419737	2	2	-1.8054	1.14875448960703e-37	148416647	148416647	2.07198014947139e-33	148419737	148419737
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148421193	158821263	3914	3773	0.0195	2.07198014947139e-33	148419737	148419737	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.0467	NA	NA	NA	6.48211450008787e-06	579405	581533
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-0.7612	6.48211450008787e-06	579405	581533	3.05297175011009e-10	588865	591112
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	16304869	5174	4988	0.0137	3.05297175011009e-10	588865	591112	2.0089499515666e-11	16294663	16304869
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16309306	16315130	2	2	-0.9102	2.0089499515666e-11	16294663	16304869	1.15477550961563e-08	16315130	16373516
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16373516	25022606	2832	2732	4e-04	1.15477550961563e-08	16315130	16373516	7.91033663283393e-14	25022606	25022606
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	0.9302	7.91033663283393e-14	25022606	25022606	3.11076894424509e-14	25039370	25039370
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	31806677	2579	2479	-0.0067	3.11076894424509e-14	25039370	25039370	1.96401261002910e-08	31802758	31806677
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31810293	31815721	4	4	-0.6394	1.9640126100291e-08	31802758	31806677	9.27538754579594e-10	31815721	31817573
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31817573	40892587	2859	2767	0.0077	9.27538754579594e-10	31815721	31817573	9.49323924791652e-284	40892587	40892587
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.7879	9.49323924791652e-284	40892587	40892587	1.32203848806673e-257	40897469	40897469
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29960	-0.0022	1.32203848806673e-257	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7571	-0.005	NA	NA	NA	2.70750248052341e-19	22477358	22477358
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.3274	2.70750248052341e-19	22477358	22477358	1.17207353141118e-19	22492603	22492603
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5034	-0.0055	1.17207353141118e-19	22492603	22492603	1.14338846656543e-55	70926188	70926188
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.2143	1.14338846656543e-55	70926188	70926188	3.28920652971908e-56	70930528	70930528
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14931	-0.0045	3.28920652971908e-56	70930528	70930528	1.26319989192964e-11	116124007	116124007
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0408	1.26319989192964e-11	116124007	116124007	1.79659738197967e-19	116130333	116130333
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7991	0.0073	1.79659738197967e-19	116130333	116130333	4.84917730528678e-20	137352394	137352394
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-1.4067	4.84917730528678e-20	137352394	137352394	1.95212231346018e-17	137356880	137356880
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1073	0.0406	1.95212231346018e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	70949263	21675	20915	-0.0052	NA	NA	NA	5.73038340022025e-13	70945853	70949263
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.7953	5.73038340022025e-13	70945853	70949263	7.74474496441803e-13	70960187	70964344
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	76976973	2460	2361	-7e-04	7.74474496441803e-13	70960187	70964344	4.32005786054174e-09	76976403	76976973
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76977706	76980809	3	3	-0.7793	4.32005786054174e-09	76976403	76976973	4.74486215954656e-11	76980809	76980984
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76980984	77917893	450	431	0.0033	4.74486215954656e-11	76980809	76980984	2.8734071850181e-148	77917893	77917893
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.4537	2.8734071850181e-148	77917893	77917893	7.51069755885814e-128	77928669	77928669
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19541	0.0082	7.51069755885814e-128	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	20799632	8146	7845	0.0098	NA	NA	NA	5.28715060501909e-15	20797855	20799632
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-0.8746	5.28715060501909e-15	20797855	20799632	4.1120267405485e-13	20806094	20806094
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	22697024	609	580	-0.009	4.1120267405485e-13	20806094	20806094	3.43178397270966e-10	22696804	22697024
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22699636	22701429	2	2	-0.9463	3.43178397270966e-10	22696804	22697024	1.77210343579867e-09	22701429	22701429
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	22704476	55118214	8145	7872	0.0012	1.77210343579867e-09	22701429	22701429	1.60886352062272e-93	55114405	55124730
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	37	-0.6714	1.60886352062272e-93	55114405	55124730	1.43953365097594e-84	55207305	55219985
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4485	0.0069	1.43953365097594e-84	55207305	55219985	4.7922660485903e-09	66463477	66463477
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9843	4.7922660485903e-09	66463477	66463477	4.5179433794526e-10	66469412	66469412
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134443483	23719	22852	0.0028	4.5179433794526e-10	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134450318	134450318	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9528590	3743	3623	0.007	NA	NA	NA	0	9528590	9531133
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9531133	9554149	4	4	-4.0195	0	9528590	9531133	1.03792939180585e-05	9550789	9554149
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9607363	10	9	-1.1126	1.03792939180585e-05	9550789	9554149	2.03512814938254e-54	9604633	9607363
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11110735	570	559	-0.0452	2.03512814938254e-54	9604633	9607363	0.000582681038737325	11098025	11110735
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11112600	11116883	2	2	-0.5683	0.000582681038737325	11098025	11110735	0.00401862884443977	11116883	11125311
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-3.5945	0.00401862884443977	11116883	11125311	2.24971496306094e-78	11128557	11128557
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	2.24971496306094e-78	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	66	-0.0477	NA	NA	NA	1.8981473491611e-13	11393473	11395862
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.945	1.8981473491611e-13	11393473	11395862	9.86760103568281e-25	11435643	11435643
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	28486517	6044	5852	-0.0131	9.86760103568281e-25	11435643	11435643	1.33301651806808e-10	28486517	28489394
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28489394	28492064	3	3	-0.8149	1.33301651806808e-10	28486517	28489394	5.55089034114368e-10	28490565	28493347
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28493347	31084265	693	671	-0.0014	5.55089034114368e-10	28490565	28493347	1.54924358552813e-23	31079618	31132762
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31248212	24	24	-0.447	1.54924358552813e-23	31079618	31132762	3.13007837436629e-25	31233136	31253273
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	47964921	4731	4552	-0.0137	3.13007837436629e-25	31233136	31253273	1.34456651008614e-09	47958058	47964921
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47968365	47976836	5	5	0.5798	1.34456651008614e-09	47958058	47964921	2.50564465369976e-09	47976836	47981768
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47978691	100624427	17523	16937	-0.0101	2.50564465369976e-09	47976836	47981768	3.90031398580084e-10	100620923	100624427
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-0.8184	3.90031398580084e-10	100620923	100624427	3.91556926111498e-11	100629832	100631726
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	132289090	11723	11299	0.0141	3.91556926111498e-11	100629832	100631726	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7071	-0.0037	NA	NA	NA	1.84532744559951e-64	37953582	37953582
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.4889	1.84532744559951e-64	37953582	37953582	8.6981554637022e-69	37957844	37957844
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49958475	4878	4701	-0.0245	8.6981554637022e-69	37957844	37957844	4.78353586866698e-18	49958475	49958475
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	4.78353586866698e-18	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.2805	NA	NA	NA	3.11959804701223e-17	49971732	49971732
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1737	-0.008	3.11959804701223e-17	49971732	49971732	1.81771070032346e-36	56646284	56658479
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	1.81771070032346e-36	56646284	56658479	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.6833	NA	NA	NA	3.5879999360858e-37	56681665	56686863
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	100690991	13040	12554	-0.0029	3.5879999360858e-37	56681665	56686863	1.23521623094443e-26	100690991	100690991
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.5392	1.23521623094443e-26	100690991	100690991	6.80152079754315e-25	100693892	100693892
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4374	0.0068	6.80152079754315e-25	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.1839	NA	NA	NA	0.000185596845991231	18544772	19295733
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	54	-0.7293	0.000185596845991231	18544772	19295733	6.17565085782568e-154	19490630	19494416
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	69086125	17568	16925	-0.0104	6.17565085782568e-154	19490630	19494416	5.7221715879239e-10	69084841	69086125
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.7937	5.7221715879239e-10	69084841	69086125	4.27442196177746e-10	69092211	69093444
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1717	-0.0057	4.27442196177746e-10	69092211	69093444	2.33272947789481e-51	73061942	73061942
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	9	-1.0392	2.33272947789481e-51	73061942	73061942	2.29229853995204e-32	73101327	73101327
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	73307681	93	88	-0.0315	2.29229853995204e-32	73101327	73101327	1.18530888878071e-21	73307681	73307681
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73309616	73315317	4	4	-1.0706	1.18530888878071e-21	73307681	73307681	3.48893351178632e-23	73315317	73315317
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	105597555	12117	11665	0.0065	3.48893351178632e-23	73315317	73315317	0	105597555	105597555
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-2.8719	0	105597555	105597555	5.75479234832051e-162	105632168	105632168
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106231012	184	180	-0.022	5.75479234832051e-162	105632168	105632168	3.43579873619044e-05	106214372	106238148
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106232699	106255190	12	11	-0.416	3.43579873619044e-05	106214372	106238148	9.64719845196548e-05	106242757	106279632
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	34	0.0434	9.64719845196548e-05	106242757	106279632	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1106	NA	NA	NA	0.012015181482737	18427151	18824622
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18882292	23	22	-0.1787	0.012015181482737	18427151	18824622	2.24802079698393e-07	18863056	19126890
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18884436	19421704	66	65	0.0889	2.24802079698393e-07	18863056	19126890	1.08162547993341e-10	19412049	19465359
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	19844217	15	15	-0.3329	1.08162547993341e-10	19412049	19465359	8.45204313733082e-08	19819961	19910696
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	98232932	30299	29281	-0.0034	8.45204313733082e-08	19819961	19910696	2.41123519254598e-10	98228743	98232932
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	0.8324	2.41123519254598e-10	98228743	98232932	1.31192640177951e-09	98239454	98243586
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	874	0.001	1.31192640177951e-09	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10194	0.0192	NA	NA	NA	9.52445761132025e-15	31845232	32513457
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33348511	21	20	-0.3664	9.52445761132025e-15	31845232	32513457	1.35444458173247e-19	33320529	33373014
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33370459	33647856	25	24	-1.0851	1.35444458173247e-19	33320529	33373014	7.21904921491977e-150	33647856	33647856
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	49740591	1804	1744	0.0192	7.21904921491977e-150	33647856	33647856	4.42355673004662e-26	49740591	49740591
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	49742403	49743700	2	2	-1.5709	4.42355673004662e-26	49740591	49740591	7.85915240537102e-27	49743700	49743700
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	49745554	54348362	1270	1228	0.0142	7.85915240537102e-27	49743700	49743700	1.30077850814085e-08	54339225	54368717
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54390060	12	12	-0.3654	1.30077850814085e-08	54339225	54368717	4.27458648275892e-06	54379839	54390060
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54402057	3	3	0.9264	4.27458648275892e-06	54379839	54390060	3.5299201037101e-13	54402057	54402057
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57203733	1199	1147	0.0091	3.5299201037101e-13	54402057	54402057	1.37416280494077e-105	57203733	57203733
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.108	1.37416280494077e-105	57203733	57203733	8.27942544492874e-114	57206772	57206772
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68732367	3391	3285	0.0133	8.27942544492874e-114	57206772	57206772	1.21845375299084e-19	68732367	68732367
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68734100	68753209	7	7	-0.6894	1.21845375299084e-19	68732367	68732367	4.59081820258982e-17	68753209	68838384
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72941901	1455	1409	0.0116	4.59081820258982e-17	68753209	68838384	1.13499981432439e-11	72929786	72941901
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	5	-0.6776	1.13499981432439e-11	72929786	72941901	3.25480843401172e-12	72964783	73022578
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	727	0.0129	3.25480843401172e-12	72964783	73022578	6.43146533243347e-21	75093957	75093957
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1714	6.43146533243347e-21	75093957	75093957	2.03175831735357e-22	75100865	75100865
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76922411	608	580	-0.0034	2.03175831735357e-22	75100865	75100865	1.70046033230726e-33	76922411	76929598
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76923844	76940218	10	9	0.8432	1.70046033230726e-33	76922411	76929598	2.81009305109658e-30	76937156	76942679
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	87165574	3852	3721	0.0219	2.81009305109658e-30	76937156	76942679	1.70729859150925e-10	87165574	87165574
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87167051	87169085	2	2	-1.0181	1.70729859150925e-10	87165574	87165574	1.40038859723775e-09	87169085	87170962
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87170962	88690571	659	637	0.0118	1.40038859723775e-09	87169085	87170962	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13339	0.0077	NA	NA	NA	2.99788257511804e-106	36673853	36673853
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.8435	2.99788257511804e-106	36673853	36673853	8.720941717199e-104	36684619	36684619
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1967	0.0101	8.720941717199e-104	36684619	36684619	2.91726610271113e-17	41555295	41568539
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41624013	27	26	-0.3545	2.91726610271113e-17	41555295	41568539	4.39271781593906e-19	41624013	41631495
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	78653545	13698	13221	0.0027	4.39271781593906e-19	41624013	41631495	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15668	0.0017	NA	NA	NA	1.05472109854686e-11	53092949	53092949
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.0476	1.05472109854686e-11	53092949	53092949	5.71551043673716e-11	53099601	53099601
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	65357415	3565	3435	-0.0018	5.71551043673716e-11	53099601	53099601	3.23529405252193e-14	65356061	65357415
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.8368	3.23529405252193e-14	65356061	65357415	1.31635304864068e-14	65367911	65369843
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	3076	0.0085	1.31635304864068e-14	65367911	65369843	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	209	0.0441	NA	NA	NA	5.16463086511258e-37	790526	790526
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	-1.8504	5.16463086511258e-37	790526	790526	3.54650598767472e-33	794978	794978
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	40352568	12388	11961	0.0174	3.54650598767472e-33	794978	794978	1.37332278608023e-09	40350432	40352568
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.0144	1.37332278608023e-09	40350432	40352568	1.08437381301398e-10	40356341	40356341
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	56823430	7262	6988	0.0139	1.08437381301398e-10	40356341	40356341	6.22942932286418e-35	56822197	56823430
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.8964	6.22942932286418e-35	56822197	56823430	4.44671829416735e-31	56840346	56840346
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	56842447	1	0	NA	4.44671829416735e-31	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56844304	63788698	3177	3063	-0.0017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	0.0074	NA	NA	NA	2.90606057635816e-31	1506379	1511632
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8067	2.90606057635816e-31	1506379	1511632	3.46236665846404e-33	1531162	1544485
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20256	0.0084	3.46236665846404e-33	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	27258126	4438	4288	-0.0098	NA	NA	NA	1.29648073748348e-29	27258126	27258126
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	27260832	27262559	2	2	-1.5963	1.29648073748348e-29	27258126	27258126	2.08170124286044e-26	27262559	27262559
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	27266229	46922972	9001	8692	0.0036	2.08170124286044e-26	27262559	27262559	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2884	0.0303	NA	NA	NA	3.51767489101387e-46	22644243	22677959
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.7283	3.51767489101387e-46	22644243	22677959	2.23959187898941e-51	22721042	22735036
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13073	0.0216	2.23959187898941e-51	22721042	22735036	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	3237	3	3	-0.083	NA	NA	NA	2.82816838186987e-15	3237	3237
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4893	94062	3	3	0.1674	2.82816838186987e-15	3237	3237	3.01144472398632e-06	94062	98390
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.3016	3.01144472398632e-06	94062	98390	1.44385604339462e-06	106242	115195
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	742385	480	464	0.0548	1.44385604339462e-06	106242	115195	2.8380662226202e-14	742385	742385
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	747220	3	3	-0.8895	2.8380662226202e-14	742385	742385	9.45719988699954e-12	747220	747837
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747837	2301365	900	875	0.0345	9.45719988699954e-12	747220	747837	1.7809995510308e-07	2299493	2302065
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.6106	1.7809995510308e-07	2299493	2302065	5.2909378734161e-09	2304398	2306110
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	375	0.0099	5.2909378734161e-09	2304398	2306110	0	2708291	2711273
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	69646994	21211	20469	0.956	0	2708291	2711273	1.81340280801329e-14	69646994	69646994
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69649160	69650824	2	2	-0.2538	1.81340280801329e-14	69646994	69646994	4.57676653089962e-11	69650824	69650824
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69659613	76998610	1726	1660	0.9581	4.57676653089962e-11	69650824	69650824	9.15858995727879e-15	76998610	76998610
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.3508	9.15858995727879e-15	76998610	76998610	8.00977552890565e-16	77010018	77010018
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21341	0.9585	8.00977552890565e-16	77010018	77010018	1.21553756947538e-26	154037006	154044828
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.7206	1.21553756947538e-26	154037006	154044828	7.54752749829675e-29	154078401	154079002
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	120	0.9497	7.54752749829675e-29	154078401	154079002	0	154582414	154582414
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0043	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-4.0502	NA	NA	NA	5.66192063908299e-26	3219200	3773948
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	5.66192063908299e-26	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.3925	NA	NA	NA	1.86076334095333e-11	5422507	6692482
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	165	-3.6685	1.86076334095333e-11	5422507	6692482	2.85638310026181e-07	7016814	7197846
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	125	-2.7804	2.85638310026181e-07	7016814	7197846	0.00112164428487395	7418921	7495687
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	12	-4.4305	0.00112164428487395	7418921	7495687	1.99393326265797e-13	7608619	7608619
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7619927	5	5	-2.2372	1.99393326265797e-13	7608619	7608619	0.000180009464998763	7619476	7632577
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7625006	7709619	48	47	-4.0918	0.000180009464998763	7619476	7632577	1.38650138136050e-05	7697921	7749796
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7999759	87	84	-3.0992	1.3865013813605e-05	7697921	7749796	1.14865013155669e-09	7947666	8043008
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8005148	8289709	65	60	-4.2399	1.14865013155669e-09	7947666	8043008	9.6380779254041e-08	8229100	8324328
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8697715	118	116	-3.4339	9.6380779254041e-08	8229100	8324328	0.000429603691077694	8681965	8706644
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	8722568	10	10	-4.6173	0.000429603691077694	8681965	8706644	0.10461781455847	8706644	8894919
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8724320	8956787	65	62	-3.7683	0.10461781455847	8706644	8894919	0.000488341244655988	8880912	9069601
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	35	-4.5878	0.000488341244655988	8880912	9069601	3.23842621572639e-10	9153682	9160624
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10004173	10	10	-2.6989	3.23842621572639e-10	9153682	9160624	4.60808748268662e-08	10001056	10030654
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10012024	10429196	42	41	-4.1428	4.60808748268662e-08	10001056	10030654	0.000750929171992074	10397038	10429196
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10433178	10446230	4	4	-2.6173	0.000750929171992074	10397038	10429196	7.62270638685255e-07	10446230	10451527
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10448819	10513747	19	19	-4.3879	7.62270638685255e-07	10446230	10451527	7.4127124922167e-44	10513747	10515697
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	11	-0.4662	7.4127124922167e-44	10513747	10515697	8.61788568790357e-11	10622062	10645500
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	10655750	2	2	-5.1175	8.61788568790357e-11	10622062	10645500	6.14016521264556e-15	10655750	10655750
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11249952	11698871	4	4	-0.9748	6.14016521264556e-15	10655750	10655750	3.34133322584769e-13	11698871	11698871
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.204	3.34133322584769e-13	11698871	11698871	1.46718428916808e-06	12537944	12550566
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-2.166	1.46718428916808e-06	12537944	12550566	4.08948601886761e-09	12651786	12696242
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.9685	4.08948601886761e-09	12651786	12696242	1.86988929638901e-08	12809152	12861657
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12839975	1	0	NA	1.86988929638901e-08	12809152	12861657	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12843307	13129843	112	106	-2.3843	NA	NA	NA	3.78114472093872e-06	13087750	13148290
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13262997	45	43	-3.4659	3.78114472093872e-06	13087750	13148290	0.00307369730058754	13164641	13358173
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13823928	201	191	-4.069	0.00307369730058754	13164641	13358173	0.00050833340363368	13777254	13853174
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.6733	0.00050833340363368	13777254	13853174	2.42747371046586e-06	13853174	13870089
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14352278	157	149	-4.1791	2.42747371046586e-06	13853174	13870089	1.27284839685703e-09	14328579	14390028
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	90	-3.3397	1.27284839685703e-09	14328579	14390028	1.63922624877147e-08	14498784	14530328
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.63922624877147e-08	14498784	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.6594	NA	NA	NA	4.02682676068039e-05	14563486	14585542
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.1642	4.02682676068039e-05	14563486	14585542	3.58554140270291e-08	14597771	14598838
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.9603	3.58554140270291e-08	14597771	14598838	6.7419257794376e-10	14644293	14681738
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14883615	56	52	-4.1858	6.7419257794376e-10	14644293	14681738	0.000227414412044976	14849277	14883615
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14909937	4	4	-2.0701	0.000227414412044976	14849277	14883615	1.02525828354830e-05	14909937	14916784
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14913412	14994704	12	12	-3.7252	1.0252582835483e-05	14909937	14916784	1.05316638633271e-06	14986956	14994704
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15005207	15018205	3	3	-1.6866	1.05316638633271e-06	14986956	14994704	4.48375218398164e-09	15018205	15022037
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15137457	27	26	-4.3554	4.48375218398164e-09	15018205	15022037	3.76066977144355e-05	15124246	15159692
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15272429	71	67	-3.1432	3.76066977144355e-05	15124246	15159692	1.27718532041274e-08	15249591	15284717
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15273305	15407219	89	83	-4.1919	1.27718532041274e-08	15249591	15284717	0.000100384571612727	15379192	15462739
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15408015	15687088	108	105	-3.4458	0.000100384571612727	15379192	15462739	0.00209286129996337	15540379	15716500
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	37	-4.2544	0.00209286129996337	15540379	15716500	7.60164454532172e-08	15892492	15953710
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16217583	127	124	-3.1593	7.60164454532172e-08	15892492	15953710	1.66243836677591e-12	16180512	16300643
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	22139807	973	928	-3.9146	1.66243836677591e-12	16180512	16300643	1.48818223945232e-06	22051284	22139807
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9847	1.48818223945232e-06	22051284	22139807	3.02737776168469e-15	22177335	22177335
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.7619	3.02737776168469e-15	22177335	22177335	7.9707209617642e-05	22182080	22203194
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22252795	21	20	-4.986	7.9707209617642e-05	22182080	22203194	0.000111960324095785	22248936	22400925
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	25737663	69	64	-4.036	0.000111960324095785	22248936	22400925	2.51855303261302e-70	25737663	25737663
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.0229	2.51855303261302e-70	25737663	25737663	2.85571529483702e-15	26945084	26952278
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.6369	2.85571529483702e-15	26945084	26952278	0.00946041118221491	26957814	26980386
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	26989053	2	2	-0.7339	0.00946041118221491	26957814	26980386	2.38767926349177e-22	26989053	26989053
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	26990807	1	0	NA	2.38767926349177e-22	26989053	26989053	NA	NA	NA
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	27003308	4	4	-2.5787	NA	NA	NA	1.08917761487890e-18	27003308	27003308
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.5489	1.0891776148789e-18	27003308	27003308	3.80236308552333e-51	27019256	27019256
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.1384	3.80236308552333e-51	27019256	27019256	5.29664129139317e-39	27039222	27039222
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.4516	5.29664129139317e-39	27039222	27039222	5.55042246443817e-08	27131764	27163598
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-2.6032	5.55042246443817e-08	27131764	27163598	5.76501221761362e-11	27172283	27176933
MSK_252152915423_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.3271	5.76501221761362e-11	27172283	27176933	NA	NA	NA
