Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	70459347	27002	26020	0.0083	NA	NA	NA	4.36359479820084e-61	70456638	70460606
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	70460606	70578540	61	61	0.5801	4.36359479820084e-61	70456638	70460606	3.13241408441643e-70	70574310	70584875
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	70581569	72537426	831	807	-0.0018	3.13241408441643e-70	70574310	70584875	5.81028088361464e-253	72537426	72537426
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	-2.7187	5.81028088361464e-253	72537426	72537426	8.96960305162714e-241	72574479	72574479
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	8.96960305162714e-241	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110014625	11701	11261	0.0037	NA	NA	NA	2.42349468671009e-10	110011494	110014625
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.7485	2.42349468671009e-10	110011494	110014625	3.37993185961294e-10	110041712	110058441
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	120333077	3815	3640	-0.0051	3.37993185961294e-10	110041712	110058441	3.05526114892332e-16	120331193	120347824
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120415520	12	11	-0.6921	3.05526114892332e-16	120331193	120347824	5.24279471541047e-16	120404156	120851476
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	143651396	81	78	-0.0328	5.24279471541047e-16	120404156	120851476	5.07107931589136e-23	143641813	143697723
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143653780	143789484	50	45	-0.5342	5.07107931589136e-23	143641813	143697723	7.95676964976077e-05	143765438	143802400
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	143893163	26	25	-0.1995	7.95676964976077e-05	143765438	143802400	0.000113070987425132	143826061	143928815
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143923947	144093719	8	8	-0.6293	0.000113070987425132	143826061	143928815	8.56287928670314e-11	144093719	144099712
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150839754	1861	1780	0.009	8.56287928670314e-11	144093719	144099712	1.12197973138196e-89	150839754	150839754
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-2.5611	1.12197973138196e-89	150839754	150839754	1.44317591704516e-45	150846148	150846148
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.44317591704516e-45	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	78	-0.0718	NA	NA	NA	4.22046380288999e-96	151026228	151026228
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.2123	4.22046380288999e-96	151026228	151026228	1.65718370418637e-229	151036435	151036435
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2577	0.0205	1.65718370418637e-229	151036435	151036435	2.1844610521141e-31	157133150	157133150
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.2211	2.1844610521141e-31	157133150	157133150	3.27454518601298e-32	157136342	157136342
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10869	-0.0051	3.27454518601298e-32	157136342	157136342	1.29665991525767e-14	185979586	185979586
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.5253	1.29665991525767e-14	185979586	185979586	1.46672557143499e-14	185988138	185988138
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1895	0.0236	1.46672557143499e-14	185988138	185988138	9.7197047872661e-13	194976022	195011344
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195097118	12	12	-0.5701	9.7197047872661e-13	194976022	195011344	3.81825004632465e-12	195091758	195104207
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	200602881	2157	2081	0.0065	3.81825004632465e-12	195091758	195104207	5.08659565668184e-09	200587846	200620756
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200609726	1	0	NA	5.08659565668184e-09	200587846	200620756	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200673525	25	24	-0.3481	NA	NA	NA	1.58298244877412e-08	200661094	200693672
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200676505	243702540	16019	15411	-0.0044	1.58298244877412e-08	200661094	200693672	3.49581866685983e-14	243700961	243703653
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243715818	8	8	-0.7579	3.49581866685983e-14	243700961	243703653	1.17270856042886e-12	243714007	243717078
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243717078	246794552	1268	1228	-0.0063	1.17270856042886e-12	243714007	243717078	0	246794552	246805521
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	25	-4.0443	0	246794552	246805521	1.22125370829375e-162	246858820	246862029
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	-0.0244	1.22125370829375e-162	246858820	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10462	-0.0015	NA	NA	NA	7.07759915016229e-32	33076512	33076512
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.231	7.07759915016229e-32	33076512	33076512	1.74493606978107e-29	33080437	33080437
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	614	0.0073	1.74493606978107e-29	33080437	33080437	5.53296489589295e-38	34542224	34543992
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.8111	5.53296489589295e-38	34542224	34543992	3.93281618660303e-38	34589997	34591681
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	39541647	2177	2094	-0.0048	3.93281618660303e-38	34589997	34591681	3.15594051539939e-08	39533888	39541647
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39546042	39548509	2	2	1.1565	3.15594051539939e-08	39533888	39541647	1.84045711405549e-08	39548509	39550075
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39550075	66357387	9575	9215	0.0017	1.84045711405549e-08	39548509	39550075	4.93538244653601e-08	66355634	66357387
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.1292	4.93538244653601e-08	66355634	66357387	2.53608735443369e-07	66360747	66362975
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	242689978	54531	52463	-0.0019	2.53608735443369e-07	66360747	66362975	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10344	-0.0068	NA	NA	NA	3.90765245851896e-61	32074432	32074432
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.9909	3.90765245851896e-61	32074432	32074432	8.3687285934473e-58	32080848	32080848
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	67814980	13570	13050	6e-04	8.3687285934473e-58	32080848	32080848	2.24748039928413e-99	67813407	67819063
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67819063	67971907	40	40	-0.8752	2.24748039928413e-99	67813407	67819063	2.42671769280607e-100	67967580	67974350
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67974350	133189686	19301	18568	-0.0016	2.42671769280607e-100	67967580	67974350	3.57524357993542e-11	133189686	133189686
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3445	3.57524357993542e-11	133189686	133189686	2.71383954616704e-11	133194685	133194685
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.71383954616704e-11	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9394	-0.0026	NA	NA	NA	1.10243174878673e-08	164001657	164005577
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-1.1946	1.10243174878673e-08	164001657	164005577	9.39174080914545e-09	164012645	164012645
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	192546280	9571	9197	-0.0022	9.39174080914545e-09	164012645	164012645	2.51845871731575e-08	192544305	192546280
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.8262	2.51845871731575e-08	192544305	192546280	5.20276973157346e-08	192552734	192554451
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	558	-0.0046	5.20276973157346e-08	192552734	192554451	3.44770900592623e-238	194354505	194354505
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.6049	3.44770900592623e-238	194354505	194354505	8.87876718438511e-250	194366950	194366950
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	964	-0.0101	8.87876718438511e-250	194366950	194366950	2.19184537364485e-19	196810503	196905767
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196942158	23	21	-0.5555	2.19184537364485e-19	196810503	196905767	2.05618813869593e-20	196929805	196945209
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	199329592	961	921	0.0126	2.05618813869593e-20	196929805	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3295	0.0169	NA	NA	NA	2.51453411621825e-158	9815760	9815760
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	-4.0538	2.51453411621825e-158	9815760	9815760	6.47362435859689e-166	9842644	9842644
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5947	-0.0078	6.47362435859689e-166	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34457648	1	0	NA	0	34445002	34445002	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	5	-4.7653	NA	NA	NA	0	34491115	34491115
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	173224400	40070	38464	-3e-04	0	34491115	34491115	3.22462678624696e-72	173224400	173224400
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.3035	3.22462678624696e-72	173224400	173224400	2.80883980527185e-72	173228860	173228860
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4112	-0.0049	2.80883980527185e-72	173228860	173228860	1.37550425201412e-19	187330240	187330240
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	1.2249	1.37550425201412e-19	187330240	187330240	2.47623630944736e-20	187338465	187338465
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	191153613	1239	1191	-0.0125	2.47623630944736e-20	187338465	187338465	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	150181399	43854	42193	-0.0033	NA	NA	NA	5.9875349902254e-11	150171154	150181399
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	6	-0.7788	5.9875349902254e-11	150171154	150181399	1.09193782453479e-11	150202601	150204134
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180194323	9784	9444	2e-04	1.09193782453479e-11	150202601	150204134	1.32447159462432e-09	180187846	180344964
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	10	-0.5504	1.32447159462432e-09	180187846	180344964	3.85964157692185e-08	180357210	180365977
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	106	0.0027	3.85964157692185e-08	180357210	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11252	0.0015	NA	NA	NA	2.09305716574248e-174	32558677	32564884
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.4	2.09305716574248e-174	32558677	32564884	9.75870865059285e-168	32595402	32600962
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54035000	8303	8018	-9e-04	9.75870865059285e-168	32595402	32600962	1.56981424505153e-111	54035000	54035000
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.3744	1.56981424505153e-111	54035000	54035000	2.87211613389376e-114	54042734	54042734
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12738	0.0028	2.87211613389376e-114	54042734	54042734	2.03014770169886e-12	103827105	103841482
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9934	2.03014770169886e-12	103827105	103841482	1.25128179095625e-12	103868154	103873584
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10080	-3e-04	1.25128179095625e-12	103868154	103873584	1.89385378259927e-08	134627341	134629897
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	1.89385378259927e-08	134627341	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.9512	NA	NA	NA	2.62278537648008e-08	134635779	134639397
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10224	-0.008	2.62278537648008e-08	134635779	134639397	5.42375813384569e-108	165643653	165643653
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165645537	1	0	NA	5.42375813384569e-108	165643653	165643653	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165648188	165650610	3	3	-3.2776	NA	NA	NA	3.15289813910868e-100	165650610	165650610
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1746	-0.0139	3.15289813910868e-100	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	133433384	46095	44300	0.0016	NA	NA	NA	2.50637032228319e-10	133426996	133436265
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	10	0.5946	2.50637032228319e-10	133426996	133436265	1.76358234077791e-11	133453811	133458252
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141410894	3698	3560	9e-04	1.76358234077791e-11	133453811	133458252	0	141410894	141413352
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	12	-3.6968	0	141410894	141413352	1.64106922256398e-216	141438504	141440184
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141689547	115	115	0.0024	1.64106922256398e-216	141438504	141440184	6.78681706582564e-180	141689547	141689547
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	6.78681706582564e-180	141689547	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-3.42	NA	NA	NA	1.45916754963979e-317	141714168	141714168
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6501	-0.0041	1.45916754963979e-317	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0148	NA	NA	NA	2.60089890670009e-23	581533	581533
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.7552	2.60089890670009e-23	581533	581533	1.12441739843875e-19	588865	588865
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7732	-0.0083	1.12441739843875e-19	588865	588865	1.09702965602874e-13	25120552	25120552
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.09702965602874e-13	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.49	NA	NA	NA	1.1499427606762e-10	25125700	25125700
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25127887	1	0	NA	1.1499427606762e-10	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25129043	25463846	162	158	0.0275	NA	NA	NA	2.39773040800345e-09	25463846	25463846
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25469017	2	2	-1.3927	2.39773040800345e-09	25463846	25463846	3.31526616793212e-12	25469017	25469017
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25470598	39350798	4747	4544	-0.0042	3.31526616793212e-12	25469017	25469017	8.15392609101408e-162	39345557	39350798
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.9272	8.15392609101408e-162	39345557	39350798	5.44353404656612e-139	39505256	39508035
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	426	0.0308	5.44353404656612e-139	39505256	39508035	8.1607879957211e-146	40892587	40892587
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.5097	8.1607879957211e-146	40892587	40892587	4.97760190037855e-133	40897469	40897469
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	144968840	30537	29436	-9e-04	4.97760190037855e-133	40897469	40897469	4.64505236500463e-15	144968840	144968840
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.5585	4.64505236500463e-15	144968840	144968840	1.96869401361771e-11	144970777	144972090
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	428	0.0285	1.96869401361771e-11	144970777	144972090	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5244	-0.0034	NA	NA	NA	1.42903536964663e-93	15802255	15802255
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.7086	1.42903536964663e-93	15802255	15802255	1.72605056060846e-93	15807123	15807123
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7274	0.0017	1.72605056060846e-93	15807123	15807123	8.40160259778417e-10	70926188	70926188
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.2398	8.40160259778417e-10	70926188	70926188	8.45768354478533e-10	70930528	70930528
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9574	-0.008	8.45768354478533e-10	70930528	70930528	1.55018485927727e-131	100348045	100348045
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-4.429	1.55018485927727e-131	100348045	100348045	1.62521344140873e-126	100350814	100350814
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	137352394	13844	13349	-0.0022	1.62521344140873e-126	100350814	100350814	6.11388899837489e-18	137352394	137352394
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.6961	6.11388899837489e-18	137352394	137352394	2.5880173792886e-15	137356880	137356880
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1061	-0.0054	2.5880173792886e-15	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917870	24591	23633	-0.0045	NA	NA	NA	1.26387121020403e-09	77916218	77917870
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77928738	4	4	0.8879	1.26387121020403e-09	77916218	77917870	1.43272890264446e-09	77928738	77936034
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	132797428	19277	18533	-0.0053	1.43272890264446e-09	77928738	77936034	8.37057208775322e-37	132797428	132797428
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-2.4089	8.37057208775322e-37	132797428	132797428	1.67011613630453e-25	132801463	132801463
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	906	-0.0241	1.67011613630453e-25	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2064	-9e-04	NA	NA	NA	0	5741031	5741031
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-4.5897	0	5741031	5741031	0	5765438	5765438
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	66463477	19429	18695	0.0029	0	5765438	5765438	2.43621797631793e-28	66463477	66463477
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.1164	2.43621797631793e-28	66463477	66463477	7.73863024674983e-28	66469412	66469412
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	93308447	9186	8857	-2e-04	7.73863024674983e-28	66469412	66469412	4.35969305712083e-12	93308447	93308447
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93322204	93327413	2	2	-1.4174	4.35969305712083e-12	93308447	93308447	9.69707436008635e-13	93327413	93327413
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93337860	134450318	14532	13987	-0.0034	9.69707436008635e-13	93327413	93327413	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	130936199	44608	43000	0.0033	NA	NA	NA	1.46532546271650e-17	130936199	130936199
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130943064	130943064	1	0	NA	1.4653254627165e-17	130936199	130936199	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6937	NA	NA	NA	2.09732704428916e-17	130946248	130946248
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	528	0.0163	2.09732704428916e-17	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	30411	-0.0037	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.2985	NA	NA	NA	0.000915638136985396	18527871	19297767
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.7242	0.000915638136985396	18527871	19297767	1.14117958373803e-89	19492531	19497023
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	105607572	31585	30338	0.0015	1.14117958373803e-89	19492531	19497023	4.20683594361685e-10	105597555	105609466
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	9	0.6174	4.20683594361685e-10	105597555	105609466	4.05090743197707e-16	105630089	105673157
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	-0.0749	4.05090743197707e-16	105630089	105673157	6.44712307464355e-14	105783533	105787390
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.6856	6.44712307464355e-14	105783533	105787390	2.46126735812780e-06	105798116	105800545
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105850033	21	19	-0.059	2.4612673581278e-06	105798116	105800545	7.48956367116443e-15	105850033	105850033
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-1.2659	7.48956367116443e-15	105850033	105850033	5.7208348222925e-22	105875924	105875924
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105948347	19	18	0.0637	5.7208348222925e-22	105875924	105875924	7.0657786436734e-22	105946993	105948347
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105985458	12	11	-0.7458	7.0657786436734e-22	105946993	105948347	1.20989486604243e-17	105985458	105994646
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105989160	106358491	147	143	-0.0072	1.20989486604243e-17	105985458	105994646	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19806497	103	100	0.1214	NA	NA	NA	6.90710340698662e-14	19465359	19845942
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19819961	20060061	50	49	-0.24	6.90710340698662e-14	19465359	19845942	4.4563208974102e-08	20003276	20391586
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20065525	74669752	21558	20735	-3e-04	4.4563208974102e-08	20003276	20391586	1.21886367204192e-192	74669752	74669752
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.8951	1.21886367204192e-192	74669752	74669752	6.69426238821264e-196	74680439	74680439
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	95609756	7615	7329	-0.0022	6.69426238821264e-196	74680439	74680439	7.37193170298225e-11	95606006	95609756
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.7699	7.37193170298225e-11	95606006	95609756	1.99338638995246e-10	95632390	95661854
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	99632987	1712	1656	-0.0071	1.99338638995246e-10	95632390	95661854	2.67335472065767e-14	99632987	99632987
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.528	2.67335472065767e-14	99632987	99632987	2.80382253581078e-14	99635701	99635701
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	99636724	1	0	NA	2.80382253581078e-14	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99637714	100298352	271	259	0.0127	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34333833	10710	10302	0.0114	NA	NA	NA	5.03981679384026e-21	34302966	34350707
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34339543	34602318	49	48	0.3925	5.03981679384026e-21	34302966	34350707	3.65332368600617e-23	34578641	34623136
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	68693086	7540	7270	0.0066	3.65332368600617e-23	34578641	34623136	7.96916526876813e-15	68693014	68693086
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.7101	7.96916526876813e-15	68693014	68693086	8.11892779181382e-14	68753209	68838384
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75092501	2213	2134	-0.0091	8.11892779181382e-14	68753209	68838384	2.90059851119013e-31	75092501	75092501
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	2.90059851119013e-31	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.7975	NA	NA	NA	1.06682586464278e-32	75100865	75100865
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	577	-0.0142	1.06682586464278e-32	75100865	75100865	2.51880511471891e-104	76925748	76929598
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.1209	2.51880511471891e-104	76925748	76929598	1.74829284561903e-100	76938723	76940218
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4331	-0.0029	1.74829284561903e-100	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	0.0294	NA	NA	NA	4.54978927539835e-19	1028979	1028979
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7834	4.54978927539835e-19	1028979	1028979	1.80386073406857e-19	1030766	1030766
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	12904	0.0137	1.80386073406857e-19	1030766	1030766	2.44373820528521e-46	36673853	36673853
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-1.6952	2.44373820528521e-46	36673853	36673853	6.25119563158844e-48	36683509	36683509
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41521544	2013	1929	0.0247	6.25119563158844e-48	36683509	36683509	1.87276916767588e-106	41518222	41522429
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	64	-0.6938	1.87276916767588e-106	41518222	41522429	2.03273643230894e-99	41708551	42143048
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13158	0.0129	2.03273643230894e-99	41708551	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22062	-0.0078	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	468	0.026	NA	NA	NA	2.25711607140841e-13	1398325	1398325
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5917	2.25711607140841e-13	1398325	1398325	1.16265800124318e-13	1400840	1400840
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	20841320	8828	8494	0.0338	1.16265800124318e-13	1400840	1400840	2.49532641076912e-08	20809612	20854536
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20897098	15	15	-0.4173	2.49532641076912e-08	20809612	20854536	2.30112854980974e-08	20887746	20913550
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	56823430	10536	10099	0.0244	2.30112854980974e-08	20887746	20913550	3.30495460257828e-08	56816785	56823430
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	7	-0.6165	3.30495460257828e-08	56816785	56823430	5.48893151932153e-08	56840346	56846683
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3064	0.0123	5.48893151932153e-08	56840346	56846683	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	-3e-04	NA	NA	NA	2.10838545079459e-72	1506379	1511632
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.7424	2.10838545079459e-72	1506379	1511632	6.83402010306218e-86	1528899	1531162
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20190	-0.0032	6.83402010306218e-86	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12895	-0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	23991961	3606	3477	0.0204	NA	NA	NA	1.93611852067677e-40	23959291	24005497
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23994618	23994618	1	0	NA	1.93611852067677e-40	23959291	24005497	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23997055	24237964	87	84	0.4301	NA	NA	NA	4.36303772052388e-47	24228128	24256981
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24239149	24239149	1	0	NA	4.36303772052388e-47	24228128	24256981	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24241592	35472378	5856	5646	0.0104	NA	NA	NA	7.64409919598284e-31	35472378	35472378
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	2.2065	7.64409919598284e-31	35472378	35472378	1.12923219591115e-27	35476942	35476942
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6736	0.017	1.12923219591115e-27	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1431411	789	760	-0.0023	NA	NA	NA	7.38432523636636e-17	1431411	1431411
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.7258	7.38432523636636e-17	1431411	1431411	6.24064231667958e-23	1432953	1432953
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	62	0.0039	6.24064231667958e-23	1432953	1432953	1.20150561112706e-06	1528179	1528282
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.6538	1.20150561112706e-06	1528179	1528282	0.000103376299442126	1530474	1535069
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1715742	168	158	-0.0224	0.000103376299442126	1530474	1535069	2.3490140442997e-06	1715594	1715742
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1720574	1720840	2	2	-1.0548	2.3490140442997e-06	1715594	1715742	3.81932634205448e-05	1720840	1722337
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1722337	1870412	93	89	-0.0202	3.81932634205448e-05	1720840	1722337	5.79346641020203e-07	1869264	1870412
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1870855	1873302	3	2	-1.2243	5.79346641020203e-07	1869264	1870412	1.53463852429465e-08	1873302	1873302
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1873761	2708291	669	639	-0.0287	1.53463852429465e-08	1873302	1873302	0	2708113	2711273
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154038318	45001	43292	0.9731	0	2708113	2711273	1.75752910931469e-11	154031239	154047749
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078401	10	9	1.717	1.75752910931469e-11	154031239	154047749	6.49720184452532e-11	154054530	154079002
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078819	154582414	123	121	1.0022	6.49720184452532e-11	154054530	154079002	2.37318612372215e-225	154578922	154586690
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0319	2.37318612372215e-225	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-3.6008	NA	NA	NA	1.08122672073715e-17	3219200	3772482
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.0745	1.08122672073715e-17	3219200	3772482	4.70744768999261e-12	5422507	6688691
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	166	-3.282	4.70744768999261e-12	5422507	6688691	5.29118251027935e-07	7021965	7210986
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7485594	128	122	-2.4533	5.29118251027935e-07	7021965	7210986	0.00054569196639631	7389797	7491280
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7606496	14	12	-4.1255	0.00054569196639631	7389797	7491280	1.02332863013475e-05	7605311	7619476
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	19	-2.3357	1.02332863013475e-05	7605311	7619476	3.11173576327767e-14	7647060	7655293
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	34	-4.2116	3.11173576327767e-14	7647060	7655293	1.86291264716917e-06	7705876	7734410
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	9080779	359	350	-3.1959	1.86291264716917e-06	7705876	7734410	3.53597996880948e-05	8956787	9094974
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9081196	9155283	20	18	-4.448	3.53597996880948e-05	8956787	9094974	0.00100019012034362	9132086	10049346
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9157232	10501368	71	67	-3.4782	0.00100019012034362	9132086	10049346	0.382598809357507	9171109	10512616
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	10515697	7	7	-2.8341	0.382598809357507	9171109	10512616	1.12269329122779e-14	10512616	10515697
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.431	1.12269329122779e-14	10512616	10515697	0.165180125487522	10622062	11249952
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11673476	5	5	-1.4293	0.165180125487522	10622062	11249952	1.06729962264e-05	11249952	11673476
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12536761	11	10	-4.292	1.06729962264e-05	11249952	11673476	6.35150187795859e-07	12533900	12545716
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	52	-2.0642	6.35150187795859e-07	12533900	12545716	1.32641623123625e-05	12638022	12700767
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	18	-3.6355	1.32641623123625e-05	12638022	12700767	5.21404473273039e-06	12756268	12825903
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	12898049	25	23	-2.418	5.21404473273039e-06	12756268	12825903	0.000659008410175921	12876008	12919413
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12898852	12898852	1	0	NA	0.000659008410175921	12876008	12919413	NA	NA	NA
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12899653	12928074	12	12	-3.4942	NA	NA	NA	0.000508445864616548	12924438	12972283
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	76	-2.0215	0.000508445864616548	12924438	12972283	4.21454449276044e-08	13112411	13133803
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-4.0399	4.21454449276044e-08	13112411	13133803	0.00136774922438724	13147329	13165652
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	28	-2.8096	0.00136774922438724	13147329	13165652	0.000126823427606407	13215006	13314593
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13823928	205	195	-3.6501	0.000126823427606407	13215006	13314593	0.000128956347984793	13780026	13828384
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.1776	0.000128956347984793	13780026	13828384	3.66006375878422e-06	13863616	13870089
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	116	-3.757	3.66006375878422e-06	13863616	13870089	2.27771292267699e-05	14118164	14122129
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.3918	2.27771292267699e-05	14118164	14122129	1.70448063426782e-07	14143748	14169526
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	27	-4.1843	1.70448063426782e-07	14143748	14169526	1.23852937848673e-07	14335755	14359748
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	91	-2.8968	1.23852937848673e-07	14335755	14359748	1.09598240155495e-05	14500820	14536962
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-1.1723	1.09598240155495e-05	14500820	14536962	0.0226218293588525	14536962	14585542
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14694578	31	30	-2.5934	0.0226218293588525	14536962	14585542	0.0277042995333353	14563486	14894476
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15208612	135	130	-3.3762	0.0277042995333353	14563486	14894476	0.000403868550791915	15200639	15221212
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-1.7395	0.000403868550791915	15200639	15221212	1.80742139899995e-05	15227049	15251900
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	22930737	1456	1417	-3.476	1.80742139899995e-05	15227049	15251900	2.68675063277044e-70	22923722	26871442
MSK_252152915425_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.2977	2.68675063277044e-70	22923722	26871442	NA	NA	NA
