Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16963812	5795	5337	0.0182	NA	NA	NA	4.32227400654828e-14	16926444	17080364
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17127039	12	12	0.705	4.32227400654828e-14	16926444	17080364	1.87307589253897e-15	17124554	17154037
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	69128015	20785	19088	0.0037	1.87307589253897e-15	17124554	17154037	1.41925622569171e-19	69123908	69128015
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	69135567	69160766	10	10	-0.8558	1.41925622569171e-19	69123908	69128015	4.33259312747148e-22	69160766	69167795
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	69167795	72536231	1291	1199	-0.0035	4.33259312747148e-22	69160766	69167795	5.54392983932937e-123	72536231	72539143
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	5.54392983932937e-123	72536231	72539143	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.7623	NA	NA	NA	2.17027760556251e-112	72574479	72579311
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	10733	0.0024	2.17027760556251e-112	72574479	72579311	3.48021724698215e-12	109987341	109987341
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.513	3.48021724698215e-12	109987341	109987341	9.469893193655e-13	109989998	109989998
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	109997318	2	0	NA	9.469893193655e-13	109989998	109989998	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109998502	141559466	3902	3574	-4e-04	NA	NA	NA	3.95663010158647e-28	121013177	143238284
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142719230	144099302	106	94	-0.328	3.95663010158647e-28	121013177	143238284	2.85399787393635e-27	143923947	144112795
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099712	150823073	1857	1696	-0.0035	2.85399787393635e-27	143923947	144112795	8.7801452390046e-51	150823073	150823073
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	1.388	8.7801452390046e-51	150823073	150823073	2.20365228331332e-48	150851439	150851439
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151024118	77	72	-0.0213	2.20365228331332e-48	150851439	150851439	1.19275136942602e-10	151022179	151024118
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151036435	5	5	0.821	1.19275136942602e-10	151022179	151024118	3.50087775192824e-10	151036435	151038091
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	151938534	369	343	-0.0244	3.50087775192824e-10	151036435	151038091	8.33225297132932e-09	151933142	151939880
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151939880	151956473	7	6	0.6951	8.33225297132932e-09	151933142	151939880	6.9972724056972e-07	151947494	151962651
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151956778	157128689	2302	2123	0.0178	6.9972724056972e-07	151947494	151962651	1.34495646845788e-07	157122453	157128689
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157133150	1	0	NA	1.34495646845788e-07	157122453	157128689	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.2108	NA	NA	NA	6.45707432041252e-08	157136342	157136342
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1493	-0.0125	6.45707432041252e-08	157136342	157136342	1.08032636076776e-42	161099582	161099582
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-2.7279	1.08032636076776e-42	161099582	161099582	2.32217543889851e-41	161104791	161104791
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	202172219	14457	13265	9e-04	2.32217543889851e-41	161104791	161104791	8.13249884252156e-18	202172219	202172219
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	202174206	202186638	6	5	-1.1458	8.13249884252156e-18	202172219	202172219	8.19266376504728e-18	202186638	202186638
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	202191463	246928454	16744	15437	-0.0031	8.19266376504728e-18	202186638	202186638	2.17190237694465e-11	246925002	246933929
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246931601	246931601	1	0	NA	2.17190237694465e-11	246925002	246933929	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246933929	246940630	5	5	-0.9285	NA	NA	NA	5.7926116519677e-15	246938370	246940630
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246941904	246941904	1	0	NA	5.7926116519677e-15	246938370	246940630	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246951149	247186514	72	65	0.0861	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10563	0.0031	NA	NA	NA	4.36543444148245e-37	34542224	34552935
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.9321	4.36543444148245e-37	34542224	34552935	3.30421933740132e-37	34579933	34591681
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	34589997	3	0	NA	3.30421933740132e-37	34579933	34591681	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	41091579	2875	2639	-0.0202	NA	NA	NA	2.6480723547754e-204	41091579	41091579
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-3.8607	2.6480723547754e-204	41091579	41091579	1.41591470025314e-210	41101640	41101640
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	131794498	25880	23758	-0.0016	1.41591470025314e-210	41101640	41101640	2.91828652168201e-25	131627503	131832358
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131808130	131976434	35	31	0.5436	2.91828652168201e-25	131627503	131832358	8.74316159331238e-27	131925519	132049286
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131982998	146571330	4739	4355	-0.012	8.74316159331238e-27	131925519	132049286	2.54599733642318e-13	146562545	146571330
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.0868	2.54599733642318e-13	146562545	146571330	8.33586491628353e-13	146592775	146597405
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	205413350	19211	17670	-0.0029	8.33586491628353e-13	146592775	146597405	1.19304644502252e-08	205413350	205413350
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205416243	205418715	2	2	-1.2889	1.19304644502252e-08	205413350	205413350	9.60420615927487e-09	205418715	205418715
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205419981	205419981	1	0	NA	9.60420615927487e-09	205418715	205418715	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205422095	242686945	13534	12417	9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	3735	0.0071	NA	NA	NA	2.74125359746424e-08	11383299	11383299
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	2	-1.2019	2.74125359746424e-08	11383299	11383299	7.44290855800305e-08	11389624	11392863
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	17514137	2398	2206	-0.0023	7.44290855800305e-08	11389624	11392863	7.7753262321353e-08	17511765	17514137
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17516200	17519829	3	3	-0.9809	7.7753262321353e-08	17511765	17514137	2.83456718262181e-07	17519829	17521317
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17521317	32074432	4305	3972	-0.0223	2.83456718262181e-07	17519829	17521317	1.08965915682537e-13	32074432	32074432
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5613	1.08965915682537e-13	32074432	32074432	5.93301539869115e-13	32080848	32080848
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	116140997	26435	24283	-0.0032	5.93301539869115e-13	32080848	32080848	3.87389298679213e-09	116140997	116140997
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116142213	116143347	2	2	-1.3366	3.87389298679213e-09	116140997	116140997	2.16804045089623e-09	116143347	116143347
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116146946	133189686	6474	5929	-0.0055	2.16804045089623e-09	116143347	116143347	1.88378083347693e-09	133189686	133189686
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3294	1.88378083347693e-09	133189686	133189686	1.39535576766954e-09	133194685	133198618
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.39535576766954e-09	133194685	133198618	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	8965	-8e-04	NA	NA	NA	7.82347154425181e-34	164005577	164005577
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.5411	7.82347154425181e-34	164005577	164005577	5.65302727556301e-33	164027724	164027724
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11158	1e-04	5.65302727556301e-33	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	20164942	6157	5627	0.0077	NA	NA	NA	5.76317728047478e-13	20163979	20164942
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20165806	20173045	5	5	-0.9657	5.76317728047478e-13	20163979	20164942	1.16196277490548e-12	20173045	20175821
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20175821	68899247	12269	11263	-0.0042	1.16196277490548e-12	20173045	20175821	4.07977614591643e-17	68893816	68905670
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69165814	16	16	0.6165	4.07977614591643e-17	68893816	68905670	5.46729327459915e-16	69144974	69665979
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	77383751	2402	2204	0.003	5.46729327459915e-16	69144974	69665979	4.85439058474908e-11	77381975	77383751
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	77386414	77396930	6	6	-0.8321	4.85439058474908e-11	77381975	77383751	2.67600454591593e-11	77396930	77398720
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	77398720	88751091	4176	3836	-0.0025	2.67600454591593e-11	77396930	77398720	1.16396884388804e-10	88751091	88751091
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88752705	88752705	1	0	NA	1.16396884388804e-10	88751091	88751091	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.4	NA	NA	NA	2.86741747605484e-10	88756721	88756721
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	156811828	19949	18328	-0.0045	2.86741747605484e-10	88756721	88756721	2.54105408200623e-08	156811828	156811828
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156813933	156816254	2	2	-1.2726	2.54105408200623e-08	156811828	156811828	1.42451105680844e-08	156816254	156816254
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156819284	156819284	1	0	NA	1.42451105680844e-08	156816254	156816254	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156822589	188385577	9328	8588	-6e-04	NA	NA	NA	1.64234607321033e-13	188383110	188385577
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188387387	188396640	5	5	-0.9966	1.64234607321033e-13	188383110	188385577	4.06985137976403e-14	188396640	188399835
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188399835	190749363	737	682	0.0101	4.06985137976403e-14	188396640	188399835	1.00111286084625e-14	190695751	190767854
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190752920	190913517	57	54	-0.3132	1.00111286084625e-14	190695751	190767854	1.55389215827813e-06	190885794	190953947
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190915643	191153613	48	37	-0.0055	1.55389215827813e-06	190885794	190953947	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	179	0.0398	NA	NA	NA	1.10158818258131e-10	681141	681141
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	-1.3078	1.10158818258131e-10	681141	681141	9.72708115494254e-09	686701	686701
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	140200229	39879	36670	-0.005	9.72708115494254e-09	686701	686701	5.89468827990213e-09	140196482	140200229
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.626	5.89468827990213e-09	140196482	140200229	6.9695579067582e-09	140216524	140224323
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150171154	3766	3477	-0.0055	6.9695579067582e-09	140216524	140224323	2.67706818828781e-12	150162435	150171154
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150181399	150181399	1	0	NA	2.67706818828781e-12	150162435	150171154	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	6	-0.8922	NA	NA	NA	3.93493794126711e-14	150202601	150207307
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	150204134	1	0	NA	3.93493794126711e-14	150202601	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	155416484	1623	1485	0.01	NA	NA	NA	1.46771831010039e-07	155411053	155416484
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	3	0.9557	1.46771831010039e-07	155411053	155416484	5.48360799809797e-07	155421443	155427589
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180189516	8155	7502	0.0056	5.48360799809797e-07	155421443	155427589	8.72346590728655e-09	180180648	180342860
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180192214	180362342	12	12	-0.5228	8.72346590728655e-09	180180648	180342860	3.62451249396564e-07	180352261	180378586
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180632269	110	100	0.0083	3.62451249396564e-07	180352261	180378586	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29966336	10589	9769	0.0058	NA	NA	NA	3.48139949026513e-08	29941766	29973024
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	29972382	1	0	NA	3.48139949026513e-08	29941766	29973024	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29973024	30000990	9	8	0.621	NA	NA	NA	1.01304393035471e-06	29998009	30010234
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	32558677	1078	1000	0.0296	1.01304393035471e-06	29998009	30010234	1.40315226250381e-174	32558677	32564884
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.1199	1.40315226250381e-174	32558677	32564884	1.95294281518237e-27	32629848	32633691
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	25	0.0119	1.95294281518237e-27	32629848	32633691	1.78067017456898e-14	32713363	32718991
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-1.5648	1.78067017456898e-14	32713363	32718991	1.33533141893286e-46	32723722	32728487
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7603	-8e-04	1.33533141893286e-46	32723722	32728487	3.06206033817401e-20	54035000	54035000
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.5832	3.06206033817401e-20	54035000	54035000	1.33383305898244e-20	54042734	54042734
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65188211	2239	2065	-0.0156	1.33383305898244e-20	54042734	54042734	7.51677130090314e-07	65181846	65188211
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65195261	65203286	3	3	-0.9581	7.51677130090314e-07	65181846	65188211	1.3593926702325e-07	65203286	65213724
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65213724	74759340	3069	2801	0.0058	1.3593926702325e-07	65203286	65213724	3.38360770054312e-09	74757796	74768342
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74762234	74766480	2	0	NA	3.38360770054312e-09	74757796	74768342	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74768342	74773321	4	4	0.9212	NA	NA	NA	2.54232231934436e-09	74772169	74780074
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	79018959	1115	1023	0.0051	2.54232231934436e-09	74772169	74780074	9.01925607219414e-16	79011979	79028813
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79024557	1	0	NA	9.01925607219414e-16	79011979	79028813	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79028813	79091850	12	11	-0.7066	NA	NA	NA	1.05707336575515e-14	79085247	79101978
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	25554	-0.0055	1.05707336575515e-14	79085247	79101978	2.35296639845969e-79	165643653	165643653
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-2.6398	2.35296639845969e-79	165643653	165643653	8.44282834333764e-77	165650610	165650610
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1662	0.002	8.44282834333764e-77	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	160641	10	10	0.5662	NA	NA	NA	6.96902699328646e-08	157816	181901
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	163711	163711	1	0	NA	6.96902699328646e-08	157816	181901	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	5091521	1841	1688	0.01	NA	NA	NA	2.62014650321718e-27	5089238	5094299
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5094299	5156434	20	16	-0.7942	2.62014650321718e-27	5089238	5094299	2.31683127946276e-28	5153183	5164676
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5164676	64523575	17689	16294	-0.0032	2.31683127946276e-28	5153183	5164676	1.06971761908302e-09	64523575	64523575
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.3467	1.06971761908302e-09	64523575	64523575	2.38336949044488e-09	64532949	64532949
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	141410894	30239	27755	0.0026	2.38336949044488e-09	64532949	64532949	2.00634210461304e-08	141405145	141422860
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5079	2.00634210461304e-08	141405145	141422860	5.16023736734875e-08	141429405	141446728
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	158821263	6879	6279	-0.0027	5.16023736734875e-08	141429405	141446728	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	106	0.0065	NA	NA	NA	5.29843641357087e-16	581533	581533
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.0291	5.29843641357087e-16	581533	581533	9.5640848597371e-22	588865	588865
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25017905	8007	7317	-0.0024	9.5640848597371e-22	588865	588865	7.1326264649493e-08	25013753	25017905
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25022606	25022606	1	0	NA	7.1326264649493e-08	25013753	25017905	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.0191	NA	NA	NA	4.21509756858538e-06	25034970	25047250
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	25	0.0415	4.21509756858538e-06	25034970	25047250	2.99550012256702e-31	25120552	25120552
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.99550012256702e-31	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.6384	NA	NA	NA	7.70447984735796e-40	25125700	25125700
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	122469754	28845	26490	-0.0016	7.70447984735796e-40	25125700	25125700	1.18115721724617e-08	122461108	122469754
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122475698	122486046	3	3	1.0459	1.18115721724617e-08	122461108	122469754	7.1944088327067e-09	122486046	122490361
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122490361	142329141	6171	5680	-0.0046	7.1944088327067e-09	122486046	122490361	1.20830159502097e-08	142329141	142329141
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142331353	142332708	2	2	-1.2752	1.20830159502097e-08	142329141	142329141	1.82226454955314e-07	142332708	142332708
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142334063	144968840	930	856	0.0083	1.82226454955314e-07	142332708	142332708	3.89096133931382e-13	144968840	144968840
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.6938	3.89096133931382e-13	144968840	144968840	9.94515429679086e-13	144970777	144970777
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	413	0.0103	9.94515429679086e-13	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11924560	4169	3820	-5e-04	NA	NA	NA	1.44911397062566e-06	11921360	11924560
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11930111	11942522	3	3	-0.9181	1.44911397062566e-06	11921360	11924560	9.7640931701317e-07	11942522	11946612
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11946612	15802255	1286	1187	-0.008	9.7640931701317e-07	11942522	11946612	3.11650703300460e-07	15801123	15802255
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.1451	3.1165070330046e-07	15801123	15802255	4.41035717730586e-07	15807123	15813356
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2182	-0.0081	4.41035717730586e-07	15807123	15813356	1.07510748962626e-12	22477358	22477358
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.5145	1.07510748962626e-12	22477358	22477358	1.28126695332943e-12	22492603	22492603
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	4774	0.0032	1.28126695332943e-12	22492603	22492603	2.63105448199707e-08	70923005	70926188
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.2433	2.63105448199707e-08	70923005	70926188	1.46689275934893e-08	70930528	70935055
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14233	-0.0108	1.46689275934893e-08	70930528	70935055	5.43844374326902e-08	116124007	116124007
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.2262	5.43844374326902e-08	116124007	116124007	1.39828509868501e-07	116130333	116132839
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7618	0.0057	1.39828509868501e-07	116130333	116132839	2.89039648765006e-17	137352394	137352394
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.8218	2.89039648765006e-17	137352394	137352394	7.24684091671172e-15	137356880	137356880
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1003	-4e-04	7.24684091671172e-15	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	103213758	33397	30666	-0.0043	NA	NA	NA	3.02034141443934e-10	103211761	103213758
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	103216493	103221144	3	3	-1.1519	3.02034141443934e-10	103211761	103213758	9.55671578251655e-11	103221144	103224073
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	103224073	124327243	7528	6922	-0.0029	9.55671578251655e-11	103221144	103224073	1.36292059696468e-07	124325094	124327243
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124328915	124328915	1	0	NA	1.36292059696468e-07	124325094	124327243	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	0.9741	NA	NA	NA	2.01523337961849e-07	124340356	124368725
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3559	-0.0091	2.01523337961849e-07	124340356	124368725	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1103180	363	329	0.003	NA	NA	NA	4.25305930188947e-07	1101451	1103180
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1104014	1105351	3	3	-1.0664	4.25305930188947e-07	1101451	1103180	2.76058929056162e-08	1105351	1106234
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1106234	6301891	2015	1866	0.008	2.76058929056162e-08	1105351	1106234	1.50204645892895e-14	6301891	6301891
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6303665	6306970	3	2	1.7321	1.50204645892895e-14	6301891	6301891	9.6104208832784e-16	6306970	6306970
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6309611	66463477	19198	17595	0.0039	9.6104208832784e-16	6306970	6306970	4.5227139404499e-12	66463477	66463477
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.5293	4.5227139404499e-12	66463477	66463477	3.98259684173156e-12	66469412	66469412
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	93292470	9185	8489	-0.0013	3.98259684173156e-12	66469412	66469412	5.85401909618899e-09	93292470	93292470
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93308447	93308447	1	0	NA	5.85401909618899e-09	93292470	93292470	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93322204	93327413	2	2	-1.3298	NA	NA	NA	3.84536792751558e-09	93327413	93327413
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93337860	106733851	4210	3890	-0.0069	3.84536792751558e-09	93327413	93327413	3.93765171294535e-198	106733851	106733851
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-4.2446	3.93765171294535e-198	106733851	106733851	1.81686606405094e-211	106747920	106747920
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134080062	10209	9358	0.0014	1.81686606405094e-211	106747920	106747920	1.44468588473705e-07	134066876	134088877
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134082923	134111832	11	11	0.5073	1.44468588473705e-07	134066876	134088877	6.18122896769478e-06	134103060	134123259
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134113671	134450318	98	97	0.0112	6.18122896769478e-06	134103060	134123259	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	60484585	20547	18891	0.0055	NA	NA	NA	1.07995876647136e-09	60483632	60484585
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60488994	60497102	4	3	-1.1153	1.07995876647136e-09	60483632	60484585	7.38993797214519e-10	60497102	60498211
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60498211	85217891	7937	7314	-0.0024	7.38993797214519e-10	60497102	60498211	3.03153700697203e-08	85215714	85219810
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85219810	85227102	4	4	-0.8897	3.03153700697203e-08	85215714	85219810	4.05329336902397e-08	85224957	85228436
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85228436	130694393	16022	14724	-5e-04	4.05329336902397e-08	85224957	85228436	1.04063367567164e-07	130690343	130694393
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2276	1.04063367567164e-07	130690343	130694393	1.25221076279758e-07	130701040	130701040
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	586	0.0154	1.25221076279758e-07	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6759	-0.0019	NA	NA	NA	3.85043968528947e-11	37953582	37953582
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.4342	3.85043968528947e-11	37953582	37953582	1.29886243409079e-11	37957844	37957844
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4482	-0.006	1.29886243409079e-11	37957844	37957844	1.90346657687742e-29	49964838	49964838
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.2643	1.90346657687742e-29	49964838	49964838	1.56614115784297e-26	49971732	49971732
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	49974447	1	0	NA	1.56614115784297e-26	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49981330	56650373	1803	1677	-0.0081	NA	NA	NA	0	56650373	56650373
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	13	-4.2567	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	80702464	6579	6074	-0.0046	0	56685341	56685341	7.03255890553836e-145	80702464	80702464
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	80706175	80709263	2	2	-5.1024	7.03255890553836e-145	80702464	80702464	2.79186113786880e-151	80709263	80709263
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	80714506	100690991	6459	5913	0.003	2.7918611378688e-151	80709263	80709263	6.9925235980876e-13	100690991	100690991
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.5272	6.9925235980876e-13	100690991	100690991	9.65339406277445e-13	100693892	100693892
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4031	-0.0063	9.65339406277445e-13	100693892	100693892	1.04250478993698e-17	113788788	113788788
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.8028	1.04250478993698e-17	113788788	113788788	6.36058485748045e-16	113792974	113792974
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	135	0.0213	6.36058485748045e-16	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18446762	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18505611	19475864	52	46	-0.3412	NA	NA	NA	3.28970082254275e-14	19456276	19497023
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19478367	73075500	19369	17767	-0.0015	3.28970082254275e-14	19456276	19497023	1.18235332426059e-12	73058103	73082262
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73104540	7	7	0.8222	1.18235332426059e-12	73058103	73082262	1.52217012948329e-12	73101327	73123455
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73106558	73106558	1	0	NA	1.52217012948329e-12	73101327	73123455	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73107419	105597555	12212	11152	-0.0011	NA	NA	NA	0	105597555	105597555
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.7151	0	105597555	105597555	3.53275526025651e-171	105632168	105632168
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	44	-0.0498	3.53275526025651e-171	105632168	105632168	3.70666677805491e-19	105856972	105856972
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.3153	3.70666677805491e-19	105856972	105856972	5.75165073151095e-10	105875924	105881677
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	169	0.0538	5.75165073151095e-10	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18824622	11	11	0.1652	NA	NA	NA	0.000205904202456221	18741716	18831600
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18826924	18848213	8	8	0.6786	0.000205904202456221	18741716	18831600	4.70695166707191e-05	18843998	18863056
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19537035	80	75	0.1381	4.70695166707191e-05	18843998	18863056	3.18475858829082e-18	19415360	19822150
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	3.18475858829082e-18	19415360	19822150	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	20088256	56	54	0.6539	NA	NA	NA	7.76004143820372e-50	20065525	20310916
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	22138119	326	302	0.0043	7.76004143820372e-50	20065525	20310916	8.84843939439023e-32	22138119	22138119
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22219332	22219332	1	0	NA	8.84843939439023e-32	22138119	22138119	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22238807	22250971	2	2	-2.4467	NA	NA	NA	2.67003987675373e-32	22250971	22250971
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	100298352	30837	28273	-0.0023	2.67003987675373e-32	22250971	22250971	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	9678	0.0082	NA	NA	NA	2.9411279506998e-12	31818508	32529486
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33536526	44	42	0.3473	2.9411279506998e-12	31818508	32529486	9.9614225312296e-14	33514033	34058222
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	68710277	7684	7041	-7e-04	9.9614225312296e-14	33514033	34058222	2.86801551571908e-17	68693086	68710277
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-0.837	2.86801551571908e-17	68693086	68710277	1.02767770414727e-15	68753209	68842364
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	70645378	802	737	-0.0356	1.02767770414727e-15	68753209	68842364	8.00235837388904e-22	70645378	70645378
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70647078	70647078	1	0	NA	8.00235837388904e-22	70645378	70645378	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70653499	70664807	3	3	1.5892	NA	NA	NA	9.6044400690588e-21	70664807	70664807
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70665447	70665447	1	0	NA	9.6044400690588e-21	70664807	70664807	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70669873	75092501	1406	1288	-0.0066	NA	NA	NA	2.48254455596206e-60	75092501	75092501
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	2.48254455596206e-60	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.6914	NA	NA	NA	3.62462411726984e-58	75100865	75100865
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	563	-0.0241	3.62462411726984e-58	75100865	75100865	2.7876365906437e-58	76923844	76929598
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	2.7876365906437e-58	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	1.7737	NA	NA	NA	1.06937339091660e-56	76938723	76940218
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4128	-3e-04	1.0693733909166e-56	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	30543860	11671	10733	0.0111	NA	NA	NA	1.24522963588323e-07	30540455	30543860
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30562246	30564576	2	2	1.2519	1.24522963588323e-07	30540455	30543860	7.51010192085142e-09	30564576	30564576
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30566574	31471890	370	327	-0.0054	7.51010192085142e-09	30564576	30564576	7.02793372751262e-06	31457889	31483188
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31473186	31503774	13	11	-0.4534	7.02793372751262e-06	31457889	31483188	2.84039821107172e-06	31490899	31897238
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36634734	1800	1644	0.0079	2.84039821107172e-06	31490899	31897238	1.13710442007946e-17	36633313	36634734
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-1.1132	1.13710442007946e-17	36633313	36634734	3.48628845085665e-09	36644002	36644182
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36673853	10	10	-0.1063	3.48628845085665e-09	36644002	36644182	1.40300846154030e-57	36673853	36673853
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.7795	1.4030084615403e-57	36673853	36673853	1.75589784318687e-134	36684619	36684619
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36686013	1	0	NA	1.75589784318687e-134	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36687917	40874079	1806	1661	0.0169	NA	NA	NA	3.04231564368331e-07	40866844	40874079
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	4	-0.7905	3.04231564368331e-07	40866844	40874079	1.12916743501511e-07	41031191	41066163
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41515622	196	176	0.0306	1.12916743501511e-07	41031191	41066163	2.33372587309388e-80	41514481	41518222
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	41708551	68	66	-0.7015	2.33372587309388e-80	41514481	41518222	3.56493742475095e-88	41706870	42143048
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	3.56493742475095e-88	41706870	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12527	0.0076	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21153	-0.0073	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1420	0.0065	NA	NA	NA	3.51124691578726e-10	3591120	3591120
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.5648	3.51124691578726e-10	3591120	3591120	3.26173426549291e-12	3593646	3593646
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	20386500	7677	7027	0.0176	3.26173426549291e-12	3593646	3593646	8.17987414993995e-28	20384757	20399700
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20493401	16	15	-0.8437	8.17987414993995e-28	20384757	20399700	3.16275097734783e-27	20474417	20507235
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	63788698	13828	12690	0.0106	3.16275097734783e-27	20474417	20507235	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	528	0.0075	NA	NA	NA	5.52132248306976e-116	1506379	1515948
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.4071	5.52132248306976e-116	1506379	1515948	9.40222901162538e-144	1525300	1531162
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19229	-0.0019	9.40222901162538e-144	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12307	-0.0046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	37685496	10764	9901	0.0077	NA	NA	NA	1.03598465636435e-24	37683516	37685496
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	14	-0.8094	1.03598465636435e-24	37683516	37685496	1.07761484550060e-23	37715385	37718669
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5279	0.0077	1.0776148455006e-23	37715385	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2773	NA	NA	NA	5.11189849495474e-23	94062	94062
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.8082	5.11189849495474e-23	94062	94062	3.25700671761463e-30	104732	104732
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	106242	1	0	NA	3.25700671761463e-30	104732	104732	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	124528	15	13	0.0182	NA	NA	NA	4.80374270293819e-10	124528	127113
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.3695	4.80374270293819e-10	124528	127113	1.42459919598951e-17	129544	130528
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	689	-0.0449	1.42459919598951e-17	129544	130528	8.28964687592291e-15	1427392	1431240
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2619	8.28964687592291e-15	1427392	1431240	3.24802018148456e-12	1432891	1434970
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	935	-0.0501	3.24802018148456e-12	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	33924214	11985	11030	1.002	0	2708113	2711273	1.63407768760152e-18	33918650	33929974
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33929974	33994987	11	10	0.0719	1.63407768760152e-18	33918650	33929974	1.41879471677606e-16	33988646	34011080
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	34000748	34000748	1	0	NA	1.41879471677606e-16	33988646	34011080	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	34006734	76998610	10942	10028	0.9833	NA	NA	NA	2.6104825046506e-09	76998610	76998610
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.5348	2.6104825046506e-09	76998610	76998610	2.04451785685405e-09	77010018	77010018
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	20214	0.9935	2.04451785685405e-09	77010018	77010018	2.49009477253093e-10	154028488	154038318
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	9	1.7516	2.49009477253093e-10	154028488	154038318	3.88457309695828e-10	154078819	154086636
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154441943	89	84	0.9906	3.88457309695828e-10	154078819	154086636	2.03697727406227e-07	154436759	154441943
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154449960	4	4	1.9725	2.03697727406227e-07	154436759	154441943	4.66290269308582e-09	154449960	154450309
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	27	1.0899	4.66290269308582e-09	154449960	154450309	1.53013227358236e-67	154582414	154586690
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	184	-0.0268	1.53013227358236e-67	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	9	-3.8129	NA	NA	NA	0.0476332029617478	2712481	2775895
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2784560	25	24	-2.6533	0.0476332029617478	2712481	2775895	2.15489011324606e-05	2773629	2810364
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3733715	89	79	-3.6834	2.15489011324606e-05	2773629	2810364	1.14467845233274e-32	3223585	3733715
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8881	1.14467845233274e-32	3223585	3733715	5.83080504337733e-16	5531459	6688691
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	155	-3.4063	5.83080504337733e-16	5531459	6688691	9.95359906946708e-09	7017919	7200061
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7652302	160	152	-2.5238	9.95359906946708e-09	7017919	7200061	1.91125519060361e-07	7614417	7653082
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7653082	7709619	36	33	-3.8551	1.91125519060361e-07	7614417	7653082	0.000509257216853381	7702787	7716001
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7726921	10	9	-2.8153	0.000509257216853381	7702787	7716001	0.407062994085638	7713973	7774773
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7782532	17	17	-2.0924	0.407062994085638	7713973	7774773	3.93824294458780e-06	7756907	7807668
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	388	-3.3484	3.9382429445878e-06	7756907	7807668	3.40044845174901e-26	10506718	10513747
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	15	-0.6719	3.40044845174901e-26	10506718	10513747	1.25105590345978e-10	11673476	12514978
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12928074	123	113	-2.895	1.25105590345978e-10	11673476	12514978	0.000143536587514023	12850287	12982236
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	75	-2.0837	0.000143536587514023	12850287	12982236	3.53729284088894e-26	13109337	13138841
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13823928	247	230	-3.4719	3.53729284088894e-26	13109337	13138841	0.000523150560327885	13779192	13851627
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.0673	0.000523150560327885	13779192	13851627	5.16193426161393e-08	13854528	13869106
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	112	-3.7532	5.16193426161393e-08	13854528	13869106	2.29825530537749e-05	14118164	14122129
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.5567	2.29825530537749e-05	14118164	14122129	0.000115443527609582	14143748	14203911
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14352278	31	28	-3.6538	0.000115443527609582	14143748	14203911	0.00381954371461117	14328579	14455003
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14694578	137	130	-2.7984	0.00381954371461117	14328579	14455003	9.95954711155194e-06	14503927	14913412
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	16387273	561	515	-3.3392	9.95954711155194e-06	14503927	14913412	2.04192004449376e-05	16256821	16445577
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	37	-4.2083	2.04192004449376e-05	16256821	16445577	8.44141484014423e-05	16614663	16756327
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	22930737	1002	919	-3.3729	8.44141484014423e-05	16614663	16756327	1.64843836676011e-28	22923722	25737663
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-1.2231	1.64843836676011e-28	22923722	25737663	5.69225557466152e-06	26943701	26995399
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.7456	5.69225557466152e-06	26943701	26995399	5.09808362201113e-06	27007874	27068911
MSK_252152915427_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-0.9362	5.09808362201113e-06	27007874	27068911	NA	NA	NA
