Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12760663	4512	4261	0.0289	NA	NA	NA	1.29941290797589e-10	12755715	12790795
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12761998	13649201	14	13	-0.5283	1.29941290797589e-10	12755715	12790795	6.54771144378357e-10	12839991	13658321
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13654754	72537426	23368	22081	0.004	6.54771144378357e-10	12839991	13658321	1.01803569976226e-189	72537426	72537426
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	8	-2.8438	1.01803569976226e-189	72537426	72537426	6.44254393106469e-191	72574479	72574479
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	6.44254393106469e-191	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84484082	3488	3303	-1e-04	NA	NA	NA	4.22299995403914e-32	84484082	84484082
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-2.3664	4.22299995403914e-32	84484082	84484082	4.963853614828e-31	84487429	84487429
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	94060783	3500	3317	0.0027	4.963853614828e-31	84487429	84487429	6.82443612831308e-15	94060783	94060783
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.6411	6.82443612831308e-15	94060783	94060783	9.81319103673886e-16	94062928	94062928
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103929627	3125	2954	-3e-04	9.81319103673886e-16	94062928	94062928	1.81230331089417e-08	103926458	103929627
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103932025	103932025	1	0	NA	1.81230331089417e-08	103926458	103929627	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-0.9947	NA	NA	NA	8.54484239896014e-08	104012520	104108153
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	110014625	1580	1497	-0.0055	8.54484239896014e-08	104012520	104108153	9.07244324957199e-12	110011494	110014625
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110039388	5	5	-0.9399	9.07244324957199e-12	110011494	110014625	1.44384513721035e-12	110039388	110058441
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	1.44384513721035e-12	110039388	110058441	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150823073	5850	5556	-0.0081	NA	NA	NA	1.07514519262905e-71	150823073	150823073
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	1.5333	1.07514519262905e-71	150823073	150823073	1.62207091422322e-74	150851439	150851439
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	73	-0.0458	1.62207091422322e-74	150851439	150851439	1.38181640851882e-17	151024118	151026228
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	1.0849	1.38181640851882e-17	151024118	151026228	1.51646967382195e-12	151036435	151038091
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2555	0.0112	1.51646967382195e-12	151036435	151038091	4.9183000872458e-36	157133150	157133150
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.5263	4.9183000872458e-36	157133150	157133150	6.75467501358076e-37	157136342	157136342
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	246794552	32786	31088	-0.0033	6.75467501358076e-37	157136342	157136342	1.11711345079906e-34	246755298	246806669
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246864725	28	27	-0.6698	1.11711345079906e-34	246755298	246806669	4.42737444143603e-38	246863179	246875016
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246875016	247186514	96	93	0.0011	4.42737444143603e-38	246863179	246875016	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10923	4e-04	NA	NA	NA	8.01529783158272e-37	34542224	34551222
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.8379	8.01529783158272e-37	34542224	34551222	5.59086359761002e-37	34583814	34591681
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37810001	1369	1292	-0.0139	5.59086359761002e-37	34583814	34591681	2.62998902429019e-20	37797909	37818455
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.5931	2.62998902429019e-20	37797909	37818455	2.65682669639206e-22	37847519	37859985
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	106244482	20979	19921	-0.0028	2.65682669639206e-22	37847519	37859985	4.29243056492046e-16	106244482	106244482
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106253229	3	3	-1.3692	4.29243056492046e-16	106244482	106244482	2.68069642793644e-15	106253229	106253229
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106256521	115796599	2464	2315	-0.0038	2.68069642793644e-15	106253229	106253229	1.72997667503728e-06	115783810	115808228
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115799330	115828114	13	13	0.4335	1.72997667503728e-06	115783810	115808228	1.29956082788079e-06	115819193	115842552
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115836143	146571330	8684	8243	-0.0037	1.29956082788079e-06	115819193	115842552	7.95464505304675e-214	146571330	146571330
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	3	-4.9289	7.95464505304675e-214	146571330	146571330	2.79115131782887e-218	146592775	146592775
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31007	-0.0029	2.79115131782887e-218	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10253	-0.0052	NA	NA	NA	3.69323990411471e-69	32074432	32074432
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.3884	3.69323990411471e-69	32074432	32074432	1.03303744115576e-67	32080848	32080848
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99891210	21385	20258	-0.0024	1.03303744115576e-67	32080848	32080848	9.32795825040218e-25	99891210	99891210
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.0754	9.32795825040218e-25	99891210	99891210	1.80517750410953e-24	99897201	99897201
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	10883	-0.0066	1.80517750410953e-24	99897201	99897201	5.90870399327494e-09	133187633	133189686
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.2731	5.90870399327494e-09	133187633	133189686	5.21806493048448e-09	133194685	133194685
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9293	-0.0048	5.21806493048448e-09	133194685	133194685	2.96187844553176e-223	163992903	163992903
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	-3.3098	2.96187844553176e-223	163992903	163992903	0.228771895717723	164001657	164056430
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-4.0853	0.228771895717723	164001657	164056430	0	164107951	164107951
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9617	-0.0057	0	164107951	164107951	2.80901705526605e-261	194354505	194354505
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.8074	2.80901705526605e-261	194354505	194354505	5.51388700695948e-241	194366950	194366950
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1865	0	5.51388700695948e-241	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3235	0.0277	NA	NA	NA	3.02019251246147e-137	9815760	9815760
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	-3.8885	3.02019251246147e-137	9815760	9815760	8.91694867855549e-136	9842644	9842644
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	107275274	27755	26333	-0.0048	8.91694867855549e-136	9842644	9842644	4.33614791798593e-241	107275274	107275274
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-4.4806	4.33614791798593e-241	107275274	107275274	1.21977824283382e-242	107281410	107281410
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	191153613	24005	22711	-0.003	1.21977824283382e-242	107281410	107281410	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2477	0.0048	NA	NA	NA	8.42725167681267e-12	8734494	8750027
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.8061	8.42725167681267e-12	8734494	8750027	7.45706121075747e-11	8800001	8809384
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	132399992	34306	32546	-0.0068	7.45706121075747e-11	8800001	8809384	7.22721767892744e-09	132397775	132399992
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	132404820	132408087	3	3	1.0252	7.22721767892744e-09	132397775	132399992	1.56405908407270e-08	132408087	132412519
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	132412519	150181399	6936	6532	-0.0037	1.5640590840727e-08	132408087	132412519	4.80363631863475e-12	150171154	150181399
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	6	-0.8597	4.80363631863475e-12	150171154	150181399	6.3397399805681e-13	150202601	150204134
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180194323	9784	9263	0.0065	6.3397399805681e-13	150202601	150204134	2.31859464182650e-26	180194323	180194323
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180346557	3	3	-1.7205	2.3185946418265e-26	180194323	180194323	5.93343554836923e-13	180346557	180346557
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	5	-4.6896	5.93343554836923e-13	180346557	180346557	3.9515516466964e-243	180358977	180358977
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	101	-0.015	3.9515516466964e-243	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11094	0.0016	NA	NA	NA	1.05214209146786e-40	32558677	32563252
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	1.2386	1.05214209146786e-40	32558677	32563252	0.00625231561377742	32595402	32629848
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32634977	9	8	0.3444	0.00625231561377742	32595402	32629848	0.0519820327665237	32609525	32667180
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	165643653	42614	40448	-0.0039	0.0519820327665237	32609525	32667180	1.01673543518524e-16	165642393	165643653
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2105	1.01673543518524e-16	165642393	165643653	4.34256918927289e-16	165650610	165653315
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1690	0.0033	4.34256918927289e-16	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	71894353	21787	20635	-0.0012	NA	NA	NA	2.67367775435199e-49	71894353	71894353
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.9002	2.67367775435199e-49	71894353	71894353	2.77220387746237e-48	71912065	71912065
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	86064853	4064	3855	0.0015	2.77220387746237e-48	71912065	71912065	1.71055529254164e-08	86060919	86064853
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86073120	86079696	3	3	-1.0194	1.71055529254164e-08	86060919	86064853	8.05992032431756e-09	86079696	86087816
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86087816	103863630	6687	6324	0.0071	8.05992032431756e-09	86079696	86087816	4.81318345457682e-11	103863630	103863630
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-1.3903	4.81318345457682e-11	103863630	103863630	1.88824749262308e-10	103868375	103868375
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	141422860	17263	16367	0.0013	1.88824749262308e-10	103868375	103868375	2.74224211489093e-07	141413352	141432778
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	141440184	9	9	-0.5561	2.74224211489093e-07	141413352	141432778	6.54895217554807e-06	141431668	141446728
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	0.0181	6.54895217554807e-06	141431668	141446728	2.31728103400872e-32	141689547	141690753
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.2087	2.31728103400872e-32	141689547	141690753	1.65142571230594e-40	141714168	141720324
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.65142571230594e-40	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158821263	6751	6408	9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	112	0.0268	NA	NA	NA	3.37298672203869e-14	581533	581533
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.8246	3.37298672203869e-14	581533	581533	3.56126567960765e-19	588865	588865
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25017905	8007	7595	-0.0037	3.56126567960765e-19	588865	588865	1.41849542628583e-11	25013753	25017905
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25022606	25022606	1	0	NA	1.41849542628583e-11	25013753	25017905	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	1.0122	NA	NA	NA	2.18883196716332e-11	25047250	25057567
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	144968840	35980	34066	-5e-04	2.18883196716332e-11	25047250	25057567	8.48790532035558e-13	144968840	144968840
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.5104	8.48790532035558e-13	144968840	144968840	4.88301287608141e-11	144970777	144970777
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	427	0.0367	4.88301287608141e-11	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	5291815	1951	1841	0.0113	NA	NA	NA	9.49336741587713e-07	5260192	5299591
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5294864	5325044	13	12	0.4594	9.49336741587713e-07	5260192	5299591	2.54104437318748e-07	5316167	5344558
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5327449	15802255	3493	3319	-0.007	2.54104437318748e-07	5316167	5344558	7.32381673681863e-11	15801123	15802255
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.3672	7.32381673681863e-11	15801123	15802255	2.81509741135031e-11	15807123	15807123
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2242	-0.0128	2.81509741135031e-11	15807123	15807123	5.62558652437779e-12	22477358	22477358
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.4086	5.62558652437779e-12	22477358	22477358	1.40955949758586e-16	22492603	22492603
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	154	0.0076	1.40955949758586e-16	22492603	22492603	2.18085904816108e-11	23343915	23343915
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.9652	2.18085904816108e-11	23343915	23343915	1.14395626937582e-08	23365926	23377660
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	29161373	1570	1492	-0.0163	1.14395626937582e-08	23365926	23377660	9.29270854212365e-11	29155476	29161373
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	29166889	29177446	3	3	-1.1033	9.29270854212365e-11	29155476	29161373	4.62030347463461e-11	29177446	29177446
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	29180925	70926188	3496	3287	0.0109	4.62030347463461e-11	29177446	29177446	1.08873177253453e-14	70926188	70926188
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.5738	1.08873177253453e-14	70926188	70926188	2.00545914156754e-14	70930528	70930528
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9380	-0.009	2.00545914156754e-14	70930528	70930528	2.69487875040902e-84	100348045	100348045
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-3.7588	2.69487875040902e-84	100348045	100348045	1.94770350260295e-85	100350814	100350814
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5262	-0.0165	1.94770350260295e-85	100350814	100350814	2.87439869918429e-10	116124007	116124007
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.3483	2.87439869918429e-10	116124007	116124007	6.01001771187524e-10	116130333	116130333
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	134542664	7250	6872	0.0032	6.01001771187524e-10	116130333	116130333	7.87941002409843e-10	134542664	134542664
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134544331	134545846	2	2	1.3472	7.87941002409843e-10	134542664	134542664	1.07459151310829e-08	134545846	134545846
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134548747	140145683	2148	2033	0.029	1.07459151310829e-08	134545846	134545846	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	46529536	14517	13763	-0.0089	NA	NA	NA	7.90177829343403e-16	46505401	46568496
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46530848	47943524	62	61	0.2961	7.90177829343403e-16	46505401	46568496	4.80102508824845e-16	47154240	47978963
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47946216	70949263	7096	6702	-0.0087	4.80102508824845e-16	47154240	47978963	3.0448806488176e-228	70949263	70949263
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-4.3861	3.0448806488176e-228	70949263	70949263	4.08188673315777e-229	70960187	70960187
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	114100979	15308	14518	0.0039	4.08188673315777e-229	70960187	70960187	7.03201770214304e-56	114100979	114100979
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.0783	7.03201770214304e-56	114100979	114100979	1.15485184595223e-57	114106460	114106460
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	1.15485184595223e-57	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	122758447	3299	3123	-0.0034	NA	NA	NA	1.52466211505914e-17	122751618	122758447
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122760448	122774523	5	5	-1.0887	1.52466211505914e-17	122751618	122758447	2.15788340613722e-16	122774523	122777587
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122777587	135285645	4514	4308	-0.0097	2.15788340613722e-16	122774523	122777587	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2033	0.0146	NA	NA	NA	0	5741031	5741031
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-4.4962	0	5741031	5741031	0	5763749	5763749
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	5765438	1	0	NA	0	5763749	5763749	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	13980	-0.0026	NA	NA	NA	1.85465979716007e-29	55097806	55131703
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	38	-0.5226	1.85465979716007e-29	55097806	55131703	3.45060719338804e-31	55203706	55223056
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	65328528	4134	3931	0.0133	3.45060719338804e-31	55203706	55223056	7.53206682742442e-13	65327335	65328528
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65329885	65336354	5	5	-0.9418	7.53206682742442e-13	65327335	65328528	2.95471801527898e-12	65336354	65338663
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65338663	107284914	14145	13419	-4e-04	2.95471801527898e-12	65336354	65338663	2.55354132689208e-132	107284914	107284914
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-4.7523	2.55354132689208e-132	107284914	107284914	2.31226504572498e-141	107292148	107292148
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9562	-0.0023	2.31226504572498e-141	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	132287226	45160	42795	0.0015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	34578806	6015	5705	-0.0066	NA	NA	NA	2.75907602343957e-07	34572045	34587106
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34580008	34598642	11	11	0.4853	2.75907602343957e-07	34572045	34587106	7.94110967798312e-07	34589015	34610187
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34601014	37950801	1311	1249	-0.0044	7.94110967798312e-07	34589015	34610187	4.54684829918222e-11	37950801	37950801
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37953582	37953582	1	0	NA	4.54684829918222e-11	37950801	37950801	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.4295	NA	NA	NA	2.68878562434244e-12	37957844	37957844
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	42368413	1773	1676	-0.0122	2.68878562434244e-12	37957844	37957844	3.61302566037611e-89	42361812	42371434
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42369769	42663797	135	127	0.4821	3.61302566037611e-89	42361812	42371434	9.0339631570376e-88	42655055	42671652
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42667696	49964838	2971	2808	-0.0017	9.0339631570376e-88	42655055	42671652	7.19112562080635e-38	49964838	49964838
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.4968	7.19112562080635e-38	49964838	49964838	1.99077667931660e-34	49971732	49971732
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1710	-0.0066	1.9907766793166e-34	49971732	49971732	3.55506673997850e-23	56610886	56650373
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.7217	3.5550667399785e-23	56610886	56650373	1.48234515099379e-23	56686863	56691355
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	113788788	17451	16556	-0.0012	1.48234515099379e-23	56686863	56691355	1.64768624749743e-10	113787620	113788788
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	-1.1395	1.64768624749743e-10	113787620	113788788	6.19836668072683e-10	113794669	113797828
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	139	-0.0101	6.19836668072683e-10	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.2463	NA	NA	NA	0.00883709126778916	18508651	19325098
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.769	0.00883709126778916	18508651	19325098	6.06321821041877e-92	19490630	19497023
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40680589	7589	7215	0.0093	6.06321821041877e-92	19490630	19497023	3.72318958548220e-19	40670538	40680589
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	7	-0.9784	3.7231895854822e-19	40670538	40680589	1.80597001962161e-18	40726930	40741934
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	106358491	24229	22965	-0.0017	1.80597001962161e-18	40726930	40741934	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18867285	25	25	0.1319	NA	NA	NA	0.000568424627912682	18843998	19150242
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18874259	20088256	131	122	0.4001	0.000568424627912682	18843998	19150242	4.02097448307465e-57	20053008	20330200
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	29492	-0.0032	4.02097448307465e-57	20053008	20330200	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	37560	14876356	5467	5166	0.0133	NA	NA	NA	1.34780519669262e-33	14687636	14876356
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.9094	1.34780519669262e-33	14687636	14876356	2.8231007254743e-34	15029941	15037844
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	15034210	1	0	NA	2.8231007254743e-34	15029941	15037844	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15037844	54352394	8213	7774	0.0068	NA	NA	NA	1.10710514217254e-26	54352394	54356704
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54363713	4	4	-1.5143	1.10710514217254e-26	54352394	54356704	0.0611107390577996	54362111	54376805
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54365385	54379839	6	5	-3.8114	0.0611107390577996	54362111	54376805	3.74312546561969e-08	54376805	54379839
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	5	0.5882	3.74312546561969e-08	54376805	54379839	0.000109416753384224	54399890	54428808
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1127	-0.0045	0.000109416753384224	54399890	54428808	1.07786485609034e-07	57201427	57203733
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1729	1.07786485609034e-07	57201427	57203733	1.39467399202060e-07	57206772	57208375
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5294	-0.0011	1.3946739920206e-07	57206772	57208375	7.53029821856061e-75	75093957	75093957
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.9065	7.53029821856061e-75	75093957	75093957	4.54304793412228e-74	75100865	75100865
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	4.54304793412228e-74	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	76923844	608	572	-0.0296	NA	NA	NA	1.26580672414962e-68	76923844	76929598
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	1.26580672414962e-68	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	1.8388	NA	NA	NA	2.76880530133972e-65	76938723	76940218
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4274	0.0048	2.76880530133972e-65	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	397	0.0278	NA	NA	NA	1.48946292530164e-09	1027736	1028979
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.3723	1.48946292530164e-09	1027736	1028979	2.46529418413382e-10	1030766	1030766
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	16478477	6204	5885	0.0178	2.46529418413382e-10	1030766	1030766	3.44743490374660e-08	16476613	16480516
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16480516	16483386	3	3	-0.9748	3.4474349037466e-08	16476613	16480516	5.65536536288029e-08	16483230	16487824
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16487824	36678537	7247	6841	0.0096	5.65536536288029e-08	16483230	16487824	2.08867479215494e-54	36678537	36678537
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36680557	36683509	3	2	-3.032	2.08867479215494e-54	36678537	36678537	1.35451270449961e-54	36683509	36683509
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41518222	2011	1904	0.018	1.35451270449961e-54	36683509	36683509	8.7942443790022e-19	41512318	41519702
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41519702	41568539	23	23	-0.5141	8.7942443790022e-19	41512318	41519702	7.61567907531816e-09	41562786	41576147
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41704093	42	41	-0.8221	7.61567907531816e-09	41562786	41576147	0.0360575953620461	41625390	41706870
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	41710400	3	3	-1.1755	0.0360575953620461	41625390	41706870	2.58071697312271e-12	41710400	41710400
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	58435991	5911	5620	0.0101	2.58071697312271e-12	41710400	41710400	8.59478663392699e-09	58432074	58439971
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	7	0.6722	8.59478663392699e-09	58432074	58439971	7.57246273711191e-08	58448749	58459873
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	78653545	7761	7324	0.0164	7.57246273711191e-08	58448749	58459873	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15321	-0.0089	NA	NA	NA	9.74600698099173e-11	53092949	53092949
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.387	9.74600698099173e-11	53092949	53092949	1.25259044005711e-10	53099601	53099601
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6418	-0.0095	1.25259044005711e-10	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	460	0.0314	NA	NA	NA	2.93702290071642e-07	1395246	1398325
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.2232	2.93702290071642e-07	1395246	1398325	3.08985681554173e-07	1400840	1405308
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	56825794	19380	18299	0.0274	3.08985681554173e-07	1400840	1405308	3.66338069792362e-10	56822197	56825794
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.7178	3.66338069792362e-10	56822197	56825794	1.45006383736405e-10	56840346	56842447
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58008337	527	500	0.0205	1.45006383736405e-10	56840346	56842447	8.78249993337847e-21	58003357	58008337
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58010034	58044412	10	10	-0.8402	8.78249993337847e-21	58003357	58008337	2.90334212052312e-16	58044038	58044489
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58044489	58208527	49	44	-0.0586	2.90334212052312e-16	58044038	58044489	6.67986854875711e-05	58192331	58212113
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.4384	6.67986854875711e-05	58192331	58212113	6.76868736008855e-07	58239871	58254174
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	63788698	2579	2443	0.02	6.76868736008855e-07	58239871	58254174	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	545	-0.0031	NA	NA	NA	1.14592118364522e-129	1506379	1516966
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.6264	1.14592118364522e-129	1506379	1516966	1.10217394292039e-160	1525300	1531162
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19904	-5e-04	1.10217394292039e-160	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	46922972	13440	12747	5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2845	0.0232	NA	NA	NA	3.33921998753736e-33	22644243	22682428
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.7965	3.33921998753736e-33	22644243	22682428	2.59046558240471e-38	22718614	22736990
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6164	0.0076	2.59046558240471e-38	22718614	22736990	2.33867640626692e-21	35472378	35472378
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.9224	2.33867640626692e-21	35472378	35472378	3.06995510848726e-19	35476942	35476942
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6618	0.0166	3.06995510848726e-19	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	122273	28	28	0.1202	NA	NA	NA	2.9876995434386e-13	122273	127113
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	124528	124528	1	0	NA	2.9876995434386e-13	122273	127113	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.3713	NA	NA	NA	2.33776539862366e-20	129544	130528
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	714	-0.0153	2.33776539862366e-20	129544	130528	5.8642602421927e-19	1431411	1431411
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.8433	5.8642602421927e-19	1431411	1431411	2.83507307953491e-17	1432953	1432953
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	959	-0.031	2.83507307953491e-17	1432953	1432953	0	2708113	2711273
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	21739	1.0206	0	2708113	2711273	5.64240416976617e-60	76998610	76998610
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.5006	5.64240416976617e-60	76998610	76998610	1.42460221996625e-60	77010018	77010018
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	92268730	2490	2359	1.0332	1.42460221996625e-60	77010018	77010018	3.85153038547892e-08	92263775	92268730
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	92289605	92294987	2	2	-0.2982	3.85153038547892e-08	92263775	92268730	1.10590071817943e-07	92294987	92303812
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	92303812	154017980	19559	18553	1.0224	1.10590071817943e-07	92294987	92303812	6.98438790444906e-11	154004739	154022916
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154078819	20	19	1.5246	6.98438790444906e-11	154004739	154022916	9.36865975718002e-10	154056623	154091384
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	113	1.054	9.36865975718002e-10	154056623	154091384	7.27028880071774e-222	154582414	154586690
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0256	7.27028880071774e-222	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	121	-3.8977	NA	NA	NA	6.19921281095564e-19	3780462	4413507
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.1519	6.19921281095564e-19	3780462	4413507	6.64906232778303e-12	4948824	6652845
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.5914	6.64906232778303e-12	4948824	6652845	2.13822802976884e-07	7025866	7211779
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7410906	114	103	-2.744	2.13822802976884e-07	7025866	7211779	1.24128731947058e-10	7311948	7584183
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7418921	10513747	536	504	-3.532	1.24128731947058e-10	7311948	7584183	6.93117545571163e-20	10512616	10513747
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	6.93117545571163e-20	10512616	10513747	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	10	-0.5983	NA	NA	NA	1.70371825394884e-06	10622062	12452734
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	10645500	1	0	NA	1.70371825394884e-06	10622062	12452734	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13114169	203	196	-2.7772	NA	NA	NA	0.00689116221683504	13035511	13114169
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13114969	13128515	4	4	-0.9028	0.00689116221683504	13035511	13114169	6.15257446598626e-09	13128515	13129843
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	393	-3.7011	6.15257446598626e-09	13128515	13129843	8.44948102788833e-13	14273899	14404284
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14681738	133	127	-2.9428	8.44948102788833e-13	14273899	14404284	4.48967315736985e-09	14546195	14698076
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	15206674	140	136	-3.7724	4.48967315736985e-09	14546195	14698076	2.46387941706948e-09	15201695	15220050
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	11	-2.0524	2.46387941706948e-09	15201695	15220050	4.44984862219319e-08	15227049	15249591
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15564959	192	181	-3.7009	4.44984862219319e-08	15227049	15249591	0.000128046335193481	15553682	15564959
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15566377	15583573	6	5	-1.9003	0.000128046335193481	15553682	15564959	8.78874549480668e-07	15583573	15590299
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	53	-4.0107	8.78874549480668e-07	15583573	15590299	1.36167615930578e-11	15902561	15915466
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15920478	1	0	NA	1.36167615930578e-11	15902561	15915466	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15953710	9	9	-1.9337	NA	NA	NA	0.000743693767825963	15953710	15975479
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15955821	16037646	35	31	-3.139	0.000743693767825963	15953710	15975479	0.000503259144925541	16027648	16037646
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16039703	16039703	1	0	NA	0.000503259144925541	16027648	16037646	NA	NA	NA
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16040789	16042966	3	3	-1.0339	NA	NA	NA	7.55255104645546e-05	16042966	16062961
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	22139807	1051	994	-3.649	7.55255104645546e-05	16042966	16062961	5.26284758972916e-06	22052726	22165808
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9681	5.26284758972916e-06	22052726	22165808	6.14135736262478e-07	22169951	22181855
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	90	-3.7138	6.14135736262478e-07	22169951	22181855	6.8109010391899e-51	23283689	26870361
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.1086	6.8109010391899e-51	23283689	26870361	4.45496008292202e-15	26945084	26945893
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.733	4.45496008292202e-15	26945084	26945893	8.76603609501217e-06	26980386	26995399
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.5654	8.76603609501217e-06	26980386	26995399	0.000325000995661841	27006628	27019256
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.5053	0.000325000995661841	27006628	27019256	9.66575330933215e-07	27039222	27064654
MSK_252152915428_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.854	9.66575330933215e-07	27039222	27064654	NA	NA	NA
