Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1640562	211	199	0.0783	NA	NA	NA	1.72653156543301e-08	1640562	1640562
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	1654026	2	2	-1.543	1.72653156543301e-08	1640562	1640562	1.82210193779334e-12	1654026	1654026
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	17094475	5586	5427	0.0067	1.82210193779334e-12	1654026	1654026	5.27422264925699e-17	17094326	17104345
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	17112697	4	4	1.3261	5.27422264925699e-17	17094326	17104345	8.95338079578772e-18	17104345	17112697
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17114337	45400021	11353	11006	-0.0039	8.95338079578772e-18	17104345	17112697	2.30437770559512e-22	45400021	45400021
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45407239	45416135	5	5	-1.3323	2.30437770559512e-22	45400021	45400021	7.72635631153992e-24	45416135	45416135
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45426884	72537426	10733	10414	0.0079	7.72635631153992e-24	45416135	45416135	5.02242408976052e-83	72537426	72539143
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.4883	5.02242408976052e-83	72537426	72539143	5.10467245527606e-86	72574479	72579311
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103932025	10118	9806	0.011	5.10467245527606e-86	72574479	72579311	1.22929523085496e-08	103929627	103932025
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-1.0356	1.22929523085496e-08	103929627	103932025	4.43240428185962e-08	104012520	104108153
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	110014625	1580	1534	-6e-04	4.43240428185962e-08	104012520	104108153	4.06517157030524e-08	110011494	110023268
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.7362	4.06517157030524e-08	110011494	110023268	1.31249556982165e-08	110034542	110060587
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	120333077	3815	3686	0.0114	1.31249556982165e-08	110034542	110060587	5.44839503670161e-12	120329400	120347824
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120415520	12	11	-0.635	5.44839503670161e-12	120329400	120347824	3.2756430456112e-10	120386887	120851476
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	143659690	85	81	-0.0985	3.2756430456112e-10	120386887	120851476	3.01854861089080e-15	143653780	143708689
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143789484	46	46	-0.5055	3.0185486108908e-15	143653780	143708689	0.000738984902318889	143766955	143806379
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	143830859	24	24	-0.1726	0.000738984902318889	143766955	143806379	0.000785076124234403	143822873	143952457
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143832442	144003068	9	9	-0.6796	0.000785076124234403	143822873	143952457	2.6273706187558e-10	143975987	144099302
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	150819879	1858	1790	-0.0214	2.6273706187558e-10	143975987	144099302	3.06232160168198e-170	150819879	150819879
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.4582	3.06232160168198e-170	150819879	150819879	4.73111809466399e-172	150851439	150851439
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151936219	450	434	-9e-04	4.73111809466399e-172	150851439	150851439	1.02480492711632e-06	151922222	151941258
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151938534	151966172	13	13	0.4326	1.02480492711632e-06	151922222	151941258	4.9739055921507e-06	151956812	151981982
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151968128	157133150	2298	2224	-9e-04	4.9739055921507e-06	151956812	151981982	2.27389955134090e-62	157133150	157133150
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.4228	2.2738995513409e-62	157133150	157133150	6.61080200801021e-66	157136342	157136342
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10961	0.0013	6.61080200801021e-66	157136342	157136342	1.66967189421503e-27	185979586	185979586
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.232	1.66967189421503e-27	185979586	185979586	2.59103552456917e-28	185988138	185988138
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	195009358	1970	1913	0.0087	2.59103552456917e-28	185988138	185988138	3.10322077766651e-14	194978218	195015837
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.7909	3.10322077766651e-14	194978218	195015837	5.53467225500139e-13	195046932	195091758
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200596027	2157	2097	0.015	5.53467225500139e-13	195046932	195091758	4.79611111465397e-10	200576669	200620756
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200787319	39	38	-0.3135	4.79611111465397e-10	200576669	200620756	2.06184313926235e-09	200676505	200813827
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16924	-7e-04	2.06184313926235e-09	200676505	200813827	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	137609899	42190	40902	0.0063	NA	NA	NA	2.34957013158394e-56	137608353	137613053
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	137613053	137671503	28	26	-0.8716	2.34957013158394e-56	137608353	137613053	6.30580856946491e-65	137667857	137673209
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	137673209	146571330	2856	2767	0.021	6.30580856946491e-65	137667857	137673209	2.64412780164066e-12	146562545	146571330
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.0254	2.64412780164066e-12	146562545	146571330	6.36931165531648e-11	146592775	146597405
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242686945	32748	31744	0.0066	6.36931165531648e-11	146592775	146597405	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164005577	53491	51813	0.0097	NA	NA	NA	4.35934844503162e-89	164005577	164009321
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-2.7891	4.35934844503162e-89	164005577	164009321	7.38989272239984e-87	164019640	164027724
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11778	-0.005	7.38989272239984e-87	164019640	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17846	0.0046	NA	NA	NA	0	68905670	68905670
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.2808	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	30462	0.0028	0	69165814	69165814	1.15970306209525e-29	173660684	173660684
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.2867	1.15970306209525e-29	173660684	173660684	5.86658087350232e-31	173666072	173666072
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5157	-0.0011	5.86658087350232e-31	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	150156233	43848	42494	0.0064	NA	NA	NA	1.44656336658352e-21	150155049	150162435
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150202601	13	13	-0.7645	1.44656336658352e-21	150155049	150162435	1.14249607107179e-24	150197673	150204134
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155411053	1623	1580	0.0336	1.14249607107179e-24	150197673	150204134	6.94796061848022e-07	155404062	155411053
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	0.8036	6.94796061848022e-07	155404062	155411053	1.05405669337355e-06	155421443	155427637
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	177319638	6962	6752	0.0028	1.05405669337355e-06	155421443	155427637	4.18203555402187e-19	177319638	177319638
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177322431	177333426	5	5	-1.1715	4.18203555402187e-19	177319638	177319638	2.09915784808236e-17	177333426	177340297
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177340297	180644810	1311	1277	0.0198	2.09915784808236e-17	177333426	177340297	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	204881	42	40	0.1278	NA	NA	NA	5.99960068018965e-45	204881	210326
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	210326	326323	59	56	-0.6884	5.99960068018965e-45	204881	210326	2.01677502164832e-77	320854	329100
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32548736	11575	11237	0.0013	2.01677502164832e-77	320854	329100	6.71888197810931e-284	32548736	32563252
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	17	-2.4028	6.71888197810931e-284	32548736	32563252	9.72006420713536e-27	32628420	32633691
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.1094	9.72006420713536e-27	32628420	32633691	3.14277280195487e-12	32713363	32721872
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.7607	3.14277280195487e-12	32713363	32721872	0.0117724753657653	32718991	32734957
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32739800	6	6	-0.5827	0.0117724753657653	32718991	32734957	2.92141642312010e-05	32732764	32745036
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	54035000	8253	8001	0.0076	2.9214164231201e-05	32732764	32745036	5.86306737655392e-160	54035000	54035000
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.3186	5.86306737655392e-160	54035000	54035000	6.7753003248024e-162	54042734	54042734
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6250	2e-04	6.7753003248024e-162	54042734	54042734	2.0473596177101e-27	79015901	79018959
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8628	2.0473596177101e-27	79015901	79018959	4.35173020533578e-27	79091850	79095415
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	708	0.0172	4.35173020533578e-27	79091850	79095415	5.05187783402301e-11	81332468	81334248
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-1.1571	5.05187783402301e-11	81332468	81334248	4.62236749184247e-11	81348170	81350502
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	103841482	6031	5862	0.0026	4.62236749184247e-11	81348170	81350502	1.53786541002427e-12	103827105	103841482
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0686	1.53786541002427e-12	103827105	103841482	1.45956338826566e-12	103868154	103873584
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	163838664	20766	20150	1e-04	1.45956338826566e-12	103868154	103873584	4.48431077978821e-18	163837143	163845944
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	163840286	163863779	12	11	-0.7652	4.48431077978821e-18	163837143	163845944	1.97633976431778e-15	163856715	163867063
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	163864986	165643653	328	317	-0.0374	1.97633976431778e-15	163856715	163867063	8.45266612459704e-49	165643653	165643653
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.0486	8.45266612459704e-49	165643653	165643653	4.66356983356852e-44	165650610	165650610
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1755	0.0279	4.66356983356852e-44	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	38052	0.0013	NA	NA	NA	2.77488590537257e-08	118607355	118619693
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118630829	6	6	0.7452	2.77488590537257e-08	118607355	118619693	1.10943401037706e-08	118622742	118645208
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118631916	118631916	1	0	NA	1.10943401037706e-08	118622742	118645208	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118633999	125831554	3166	3078	0.0049	NA	NA	NA	4.940542273562e-188	125831554	125831554
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.715	4.940542273562e-188	125831554	125831554	5.15115723213547e-179	125837524	125837524
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3531	0.0052	5.15115723213547e-179	125837524	125837524	0	133433384	133433384
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-4.1345	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3708	-0.0015	0	133448277	133448277	0	141690753	141690753
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-4.3549	0	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	0	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2437	0.0083	NA	NA	NA	6.20997799687135e-13	147702365	147702365
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.5995	6.20997799687135e-13	147702365	147702365	3.09232901711273e-13	147707161	147707161
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4108	0.0042	3.09232901711273e-13	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	0.1586	NA	NA	NA	1.13682793562999e-49	581533	581533
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.0262	1.13682793562999e-49	581533	581533	3.43680231780868e-52	588865	588865
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25022606	8008	7766	0.0061	3.43680231780868e-52	588865	588865	3.77544208868978e-10	25017905	25022606
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.1272	3.77544208868978e-10	25017905	25022606	3.79977205388662e-10	25039370	25047250
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25119007	26	25	-0.051	3.79977205388662e-10	25039370	25047250	5.42904809413384e-17	25119007	25119007
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25125700	4	4	1.4676	5.42904809413384e-17	25119007	25119007	6.0913063461411e-25	25125700	25125700
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4748	-0.0064	6.0913063461411e-25	25125700	25125700	4.15280004225472e-135	39345557	39350798
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.8802	4.15280004225472e-135	39345557	39350798	1.62125774098545e-127	39505256	39508035
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30422	0.0089	1.62125774098545e-127	39505256	39508035	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	15802255	5457	5289	0.0047	NA	NA	NA	9.79753129199827e-16	15802255	15802255
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.6728	9.79753129199827e-16	15802255	15802255	6.82888983944619e-16	15807123	15807123
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7362	4e-04	6.82888983944619e-16	15807123	15807123	1.92493361649286e-08	70923005	70926188
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.2396	1.92493361649286e-08	70923005	70926188	2.18624843815868e-08	70930528	70935055
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	15009	-0.0091	2.18624843815868e-08	70930528	70935055	9.40855173509786e-06	116122595	116124007
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0649	9.40855173509786e-06	116122595	116124007	1.52956112716032e-05	116130333	116132839
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9076	-0.0045	1.52956112716032e-05	116130333	116132839	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9447	-0.0091	NA	NA	NA	1.88196467458644e-123	27038538	27038538
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.6387	1.88196467458644e-123	27038538	27038538	1.40228032337547e-118	27041812	27041812
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14363	-0.0064	1.40228032337547e-118	27041812	27041812	5.7034973330808e-11	77916218	77917893
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.8688	5.7034973330808e-11	77916218	77917893	1.83679127379583e-07	77928738	77940201
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19590	0.0102	1.83679127379583e-07	77928738	77940201	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	108174029	35591	34457	0.0058	NA	NA	NA	1.11253800799990e-16	108168949	108177827
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	108177827	108209583	17	16	0.6408	1.1125380079999e-16	108168949	108177827	4.20232100949381e-17	108208285	108212980
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	108210890	134349586	9670	9363	0.0195	4.20232100949381e-17	108208285	108212980	1.28064949437287e-15	134314433	134372904
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134353931	134450318	26	26	0.3885	1.28064949437287e-15	134314433	134372904	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3634	0.0107	NA	NA	NA	1.60232877180507e-12	9432943	9543817
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	0.5814	1.60232877180507e-12	9432943	9543817	1.31671506281715e-15	9599999	9626736
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11395862	648	630	-0.0451	1.31671506281715e-15	9599999	9626736	6.14376149042599e-14	11393473	11395862
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.0582	6.14376149042599e-14	11393473	11395862	6.96564107701484e-13	11435643	11440927
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	12422129	390	376	-0.0279	6.96564107701484e-13	11435643	11440927	2.78813227197580e-07	12416974	12422129
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	5	-0.8057	2.7881322719758e-07	12416974	12422129	1.30475406720734e-08	12433043	12435301
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	33178741	7114	6897	-0.0056	1.30475406720734e-08	12433043	12435301	1.49565104059192e-36	33178741	33178741
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	1.49565104059192e-36	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-2.5556	NA	NA	NA	6.79848624188936e-36	33198331	33198331
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	130694393	32591	31590	-0.0046	6.79848624188936e-36	33198331	33198331	1.85929088798521e-10	130694393	130694393
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.4163	1.85929088798521e-10	130694393	130694393	5.86028332350653e-11	130701040	130701040
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	131583763	341	328	0.0137	5.86028332350653e-11	130701040	130701040	6.2989528553853e-06	131564375	131586145
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131586145	131611241	13	13	0.4247	6.2989528553853e-06	131564375	131586145	0.000223014720483393	131609544	131649535
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131612689	132289090	290	283	0.062	0.000223014720483393	131609544	131649535	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7125	-0.0112	NA	NA	NA	3.49223985891650e-25	37953582	37953582
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.1404	3.4922398589165e-25	37953582	37953582	7.24866247985218e-26	37957844	37957844
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4746	-0.0051	7.24866247985218e-26	37957844	37957844	5.5312287641299e-70	49964838	49964838
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.4644	5.5312287641299e-70	49964838	49964838	5.11884766743501e-65	49971732	49971732
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1757	0.0137	5.11884766743501e-65	49971732	49971732	1.36417398922909e-21	56610886	56650373
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.73	1.36417398922909e-21	56610886	56650373	3.53385642214881e-24	56686863	56691355
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	63118944	1459	1413	0.0037	3.53385642214881e-24	56686863	56691355	2.18117496127891e-188	63118944	63118944
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-5.6496	2.18117496127891e-188	63118944	63118944	2.25311518174728e-186	63130828	63130828
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	114123340	16142	15667	0.0132	2.25311518174728e-186	63130828	63130828	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.189	NA	NA	NA	0.000506468823805912	18527871	19287128
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	54	-0.7532	0.000506468823805912	18527871	19287128	8.56113529588887e-84	19490630	19497023
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	106358491	31825	30762	-4e-04	8.56113529588887e-84	19490630	19497023	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19835471	107	105	-0.2806	NA	NA	NA	6.13447043112466e-96	19835471	19835471
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-4.7835	6.13447043112466e-96	19835471	19835471	1.42262483540827e-124	19844217	19844217
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	98232932	30299	29384	-0.0056	1.42262483540827e-124	19844217	19844217	2.13925267577020e-10	98228743	98232932
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1691	2.1392526757702e-10	98228743	98232932	2.42453572506827e-09	98239454	98243586
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	885	0.0533	2.42453572506827e-09	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	987	0.0399	NA	NA	NA	1.57845696185677e-70	2600740	2638581
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-3.567	1.57845696185677e-70	2600740	2638581	5.64800297304768e-102	2638643	2639798
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	31862577	9556	9279	-0.0211	5.64800297304768e-102	2638643	2639798	8.38425187915696e-21	31837203	32521360
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	34059589	56	55	-0.3979	8.38425187915696e-21	31837203	32521360	1.37603318066344e-22	33846647	34067812
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34061029	57203733	4281	4140	0.0019	1.37603318066344e-22	33846647	34067812	1.2213634605667e-74	57203733	57203733
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.7444	1.2213634605667e-74	57203733	57203733	1.78886122246619e-78	57206772	57206772
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5451	-0.0109	1.78886122246619e-78	57206772	57206772	1.96581929717384e-60	75093957	75093957
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.6691	1.96581929717384e-60	75093957	75093957	5.26875844265694e-65	75100865	75100865
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	5.26875844265694e-65	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	76925748	609	584	-0.004	NA	NA	NA	2.25957829907901e-44	76925748	76931247
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76929598	1	0	NA	2.25957829907901e-44	76925748	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76938723	6	5	1.7256	NA	NA	NA	2.61674931714538e-36	76937156	76938723
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76940218	76940218	1	0	NA	2.61674931714538e-36	76937156	76938723	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4376	0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	0.0635	NA	NA	NA	5.85449632556293e-09	1027736	1028979
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.3489	5.85449632556293e-09	1027736	1028979	3.36764746436648e-09	1030766	1030766
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	13039	-0.0145	3.36764746436648e-09	1030766	1030766	1.13648339960743e-59	36673853	36673853
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.9222	1.13648339960743e-59	36673853	36673853	5.58558224986024e-59	36684619	36684619
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1957	-0.0179	5.58558224986024e-59	36684619	36684619	5.72860677567691e-21	41515622	41522429
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41570512	22	21	-0.6431	5.72860677567691e-21	41515622	41522429	1.56059374787163e-06	41558893	41576147
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41572001	41625390	26	25	-0.9901	1.56059374787163e-06	41558893	41576147	0.0148466506519789	41592453	41647135
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41627814	41710400	18	18	-0.7718	0.0148466506519789	41592453	41647135	4.59630180676424e-26	41710400	42143048
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13245	-0.0093	4.59630180676424e-26	41710400	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	33200245	10322	10041	-0.0043	NA	NA	NA	5.90230350066111e-09	33167379	33219468
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	33202085	33299225	49	49	0.2558	5.90230350066111e-09	33167379	33219468	6.78337509504604e-11	33276285	33338778
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	33301649	76116026	12593	12207	0.0123	6.78337509504604e-11	33276285	33338778	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8732	-0.0381	NA	NA	NA	2.70580854473128e-159	19694025	19694025
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.8195	2.70580854473128e-159	19694025	19694025	1.73923997309824e-173	19700620	19700620
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	19702214	1	0	NA	1.73923997309824e-173	19700620	19700620	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19703888	63788698	14028	13612	-0.0313	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	561	0.0533	NA	NA	NA	6.35629742278698e-92	1506379	1506379
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.8901	6.35629742278698e-92	1506379	1506379	1.18235743578924e-96	1532433	1532433
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62283957	20935	20287	-2e-04	1.18235743578924e-96	1532433	1532433	2.46346022111837e-11	62269580	62294478
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62286972	62286972	1	0	NA	2.46346022111837e-11	62269580	62294478	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62288226	62326754	20	20	0.4418	NA	NA	NA	0.00131658605934257	62310393	62339464
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62328448	62419534	27	26	0.1221	0.00131658605934257	62310393	62339464	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13032	-0.0063	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2889	-2e-04	NA	NA	NA	7.51986103607911e-32	22642519	22679305
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.8127	7.51986103607911e-32	22642519	22679305	1.41336705550294e-36	22718614	22735036
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6333	-0.0083	1.41336705550294e-36	22718614	22735036	6.17793201470825e-15	35472378	35472378
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.7085	6.17793201470825e-15	35472378	35472378	4.16284296770454e-13	35476942	35476942
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36861482	785	762	0.0176	4.16284296770454e-13	35476942	35476942	1.21417495702998e-06	36854684	36871366
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36865292	36893322	11	11	-0.5094	1.21417495702998e-06	36854684	36871366	4.99800180640004e-06	36871366	36900431
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36894239	37621766	392	380	0.0044	4.99800180640004e-06	36871366	36900431	3.36781452984758e-20	37621766	37621766
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.2265	3.36781452984758e-20	37621766	37621766	4.71155079817046e-23	37626069	37626069
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5631	0.0038	4.71155079817046e-23	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.3418	NA	NA	NA	2.84529813224834e-12	94062	95819
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.3574	2.84529813224834e-12	94062	95819	2.15928814742764e-33	104486	104732
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427392	774	748	-0.0099	2.15928814742764e-33	104486	104732	7.25656254162908e-09	1427338	1431240
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9405	7.25656254162908e-09	1427338	1431240	4.70228930694523e-07	1432891	1434970
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	974	-0.0534	4.70228930694523e-07	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22277	0.987	0	2708113	2711273	4.17115631251816e-18	76998610	76998610
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-0.9743	4.17115631251816e-18	76998610	76998610	1.58653545995125e-18	77010018	77010018
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	103061281	5489	5326	0.9806	1.58653545995125e-18	77010018	77010018	9.36088810347531e-39	103059021	103062376
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103062376	103109696	13	13	2.0794	9.36088810347531e-39	103059021	103062376	0.000113597489203454	103109027	103109696
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103110259	103129734	2	0	NA	0.000113597489203454	103109027	103109696	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103129950	103146444	3	3	0.9401	NA	NA	NA	1.67650250080709e-11	103146444	103146444
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103148232	103191693	18	18	1.9417	1.67650250080709e-11	103146444	103146444	2.58370357873002e-39	103191693	103224094
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103224094	154038318	16535	16062	0.995	2.58370357873002e-39	103191693	103224094	2.01042596518175e-18	154031239	154046681
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	12	1.7981	2.01042596518175e-18	154031239	154046681	3.74267866857655e-17	154078401	154085354
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	117	1.0463	3.74267866857655e-17	154078401	154085354	7.82243669221368e-193	154578922	154586690
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	0.0999	7.82243669221368e-193	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	122	-4.4721	NA	NA	NA	1.62682486260846e-35	3219200	3773948
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.62682486260846e-35	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.1276	NA	NA	NA	1.28353838070344e-19	5422507	6652845
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-4.0879	1.28353838070344e-19	5422507	6652845	4.21656507639752e-06	7006750	7229089
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	118	-3.2666	4.21656507639752e-06	7006750	7229089	2.98514122963772e-05	7333934	7590569
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	80	-4.1449	2.98514122963772e-05	7333934	7590569	0.000329513102166910	7700496	7745143
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7789562	22	20	-3.0559	0.00032951310216691	7700496	7745143	2.80699406539964e-05	7756907	7831268
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7798534	10513747	425	409	-4.1565	2.80699406539964e-05	7756907	7831268	1.76420952177882e-32	10512616	10515697
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.8368	1.76420952177882e-32	10512616	10515697	1.55578424899708e-08	10622062	11698871
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12999095	154	150	-3.4398	1.55578424899708e-08	10622062	11698871	0.00119618639814297	12973899	12999095
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13014163	7	7	-1.2215	0.00119618639814297	12973899	12999095	0.00436028084582297	13014163	13040293
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13019119	13119344	44	41	-2.7181	0.00436028084582297	13014163	13040293	0.0401623442223298	13080405	13119344
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.4975	0.0401623442223298	13080405	13119344	1.59912222756035e-07	13128515	13129843
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14359748	417	403	-4.2635	1.59912222756035e-07	13128515	13129843	1.79215361704879e-15	14330251	14409975
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14700040	137	133	-3.4121	1.79215361704879e-15	14330251	14409975	2.84880002899583e-10	14572190	14742448
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15523178	305	297	-4.2209	2.84880002899583e-10	14572190	14742448	0.000149105897076667	15453525	15554463
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15630463	43	42	-3.4061	0.000149105897076667	15453525	15554463	8.35777363179797e-05	15564959	15661862
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15911389	45	44	-4.458	8.35777363179797e-05	15564959	15661862	0.00107100868717065	15826121	16004746
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	16182565	109	105	-3.6437	0.00107100868717065	15826121	16004746	1.89905703123741e-06	16078189	16282623
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	22139807	992	963	-4.2408	1.89905703123741e-06	16078189	16282623	2.33074887014487e-07	22049641	22157319
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.2065	2.33074887014487e-07	22049641	22157319	4.60456147215934e-08	22176501	22182080
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	86	-4.3879	4.60456147215934e-08	22176501	22182080	2.46096308589220e-53	22926726	22930737
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.2422	2.4609630858922e-53	22926726	22930737	1.53843648618095e-07	26943701	26989053
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-3.0647	1.53843648618095e-07	26943701	26989053	2.21863269344978e-07	27009433	27064654
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57437557	31	30	-0.9247	2.21863269344978e-07	27009433	27064654	NA	NA	NA
MSK_252152915465_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	57440809	57440809	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
