Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	8912661	2865	2741	0.0155	NA	NA	NA	3.86231977500888e-44	8912661	8920460
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8920460	8941673	9	9	-0.8565	3.86231977500888e-44	8912661	8920460	9.77738834783036e-48	8938487	8941673
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8944371	12761998	1639	1576	0.0301	9.77738834783036e-48	8938487	8941673	2.06883518034741e-17	12761998	12761998
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12762774	12762774	1	0	NA	2.06883518034741e-17	12761998	12761998	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12831942	5	4	-0.774	NA	NA	NA	1.66474753074323e-16	12831942	12835156
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12835156	34869589	8375	8000	0.023	1.66474753074323e-16	12831942	12835156	1.38425412187622e-297	34869589	34869589
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	3	-3.8281	1.38425412187622e-297	34869589	34869589	2.87622813360007e-309	34883375	34883375
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	61884298	10733	10299	0.0084	2.87622813360007e-309	34883375	34883375	0	61884298	61884298
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-6.1932	0	61884298	61884298	0	61890388	61890388
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72537426	4260	4080	-0.0049	0	61890388	61890388	0	72537426	72537426
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	7	-2.9414	0	72537426	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	147326097	16268	15617	-0.0025	NA	NA	NA	1.42049946764591e-13	147203277	147352661
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147329819	147510532	30	29	0.2568	1.42049946764591e-13	147203277	147352661	8.94009601319343e-13	147490553	148088285
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1198	0.015	8.94009601319343e-13	147490553	148088285	0	150819879	150819879
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150823073	1	0	NA	0	150819879	150819879	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.3324	NA	NA	NA	2.76659300029843e-184	150851439	150851439
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	73	0.0197	2.76659300029843e-184	150851439	150851439	7.07679715129438e-11	151024118	151028700
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7254	7.07679715129438e-11	151024118	151028700	2.90447140567781e-13	151033188	151038091
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	161099582	4303	4129	0.0118	2.90447140567781e-13	151033188	151038091	1.89469588121179e-08	161099067	161099582
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.8022	1.89469588121179e-08	161099067	161099582	2.14861341020901e-09	161104791	161104791
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167479184	2482	2379	-0.0038	2.14861341020901e-09	161104791	161104791	7.26972924647202e-12	167473499	167493768
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167523140	12	12	-0.3694	7.26972924647202e-12	167473499	167493768	3.19496111339782e-11	167507882	167530480
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	200613454	11350	10876	-0.002	3.19496111339782e-11	167507882	167530480	1.16125530579606e-12	200598243	200620756
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200668993	20	18	-0.3195	1.16125530579606e-12	200598243	200620756	2.21915833260018e-12	200659076	200673525
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	218354986	6533	6282	-0.0018	2.21915833260018e-12	200659076	200673525	2.41366104912116e-30	218354986	218354986
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	218356581	218359775	6	6	-0.8496	2.41366104912116e-30	218354986	218354986	3.40810632910197e-30	218359775	218359775
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	218361366	246794552	10759	10344	-0.0028	3.40810632910197e-30	218359775	218359775	1.18690796504502e-154	246794552	246805521
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246860551	25	25	-0.9339	1.18690796504502e-154	246794552	246805521	1.67757966481645e-75	246858820	246860551
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247186514	99	98	-0.0405	1.67757966481645e-75	246858820	246860551	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11062	-0.0058	NA	NA	NA	5.02549476277589e-58	34543992	34551222
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	0.6981	5.02549476277589e-58	34543992	34551222	5.50236310284813e-52	34583814	34589997
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	459	-0.0071	5.50236310284813e-52	34583814	34589997	2.02223208790719e-32	35821494	35821494
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.673	2.02223208790719e-32	35821494	35821494	1.61600897545323e-40	35844884	35844884
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	66357387	11268	10800	-0.0024	1.61600897545323e-40	35844884	35844884	7.70631792283152e-13	66357387	66357387
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	0.9538	7.70631792283152e-13	66357387	66357387	2.48744154746581e-12	66360747	66360747
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	242501239	54464	52288	-0.0045	2.48744154746581e-12	66360747	66360747	0	242501239	242506262
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242505261	1	0	NA	0	242501239	242506262	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242686945	65	62	-0.8873	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12154	-0.0086	NA	NA	NA	1.81827067697671e-38	37953375	37953375
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.9529	1.81827067697671e-38	37953375	37953375	5.31831113266349e-41	37961110	37961110
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	45608481	2825	2689	0.0038	5.31831113266349e-41	37961110	37961110	4.53425321102106e-07	45606401	45608481
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	45609681	45610996	2	2	0.7122	4.53425321102106e-07	45606401	45608481	5.70962848408019e-06	45610996	45612874
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	45612874	53001678	3148	3013	0.0255	5.70962848408019e-06	45610996	45612874	9.8568910650772e-16	52999601	53001678
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.6626	9.8568910650772e-16	52999601	53001678	2.74465496572723e-15	53011885	53014254
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	65160634	4843	4633	-0.0119	2.74465496572723e-15	53011885	53014254	1.15110853511097e-08	65155469	65160634
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-0.7968	1.15110853511097e-08	65155469	65160634	7.26679374647757e-09	65184180	65184180
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	101817141	9319	8951	-0.0072	7.26679374647757e-09	65184180	65184180	3.22392277520216e-298	101817141	101817141
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101818659	101928096	43	43	0.9451	3.22392277520216e-298	101817141	101817141	3.50702029289611e-275	101928096	101928096
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101930007	164005577	20617	19787	-0.0031	3.50702029289611e-275	101928096	101928096	2.31481662009463e-46	164005577	164005577
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-1.8227	2.31481662009463e-46	164005577	164005577	2.67543445852978e-05	164012645	164012645
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164061418	11	11	-0.3907	2.67543445852978e-05	164012645	164012645	6.71780346149538e-11	164052484	164077288
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164063626	199329592	12128	11640	-0.0041	6.71780346149538e-11	164052484	164077288	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3257	0.0041	NA	NA	NA	1.3875322836741e-10	9800777	9815760
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	0.7641	1.3875322836741e-10	9800777	9815760	1.60509419071428e-13	9842644	9842644
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5915	-0.0096	1.60509419071428e-13	9842644	9842644	9.41112120728963e-18	34439897	34445002
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6331	9.41112120728963e-18	34439897	34445002	8.28113079455565e-17	34491115	34506297
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8505	-0.0044	8.28113079455565e-17	34491115	34506297	1.17133044190133e-32	68901210	69069651
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.5642	1.17133044190133e-32	68901210	69069651	2.10854095824805e-36	69163312	69643272
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	112	-0.004	2.10854095824805e-36	69163312	69643272	1.63853947642529e-27	70150576	70150576
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.8554	1.63853947642529e-27	70150576	70150576	4.53856097378774e-21	70216707	70216707
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	107275274	12584	12059	-0.0044	4.53856097378774e-21	70216707	70216707	1.48656148978687e-09	107274138	107275274
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.5809	1.48656148978687e-09	107274138	107275274	6.53375709682286e-11	107281410	107283257
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	108281452	262	253	-0.0066	6.53375709682286e-11	107281410	107283257	1.78864804087947e-20	108281452	108281452
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108283417	108290095	3	3	-0.9397	1.78864804087947e-20	108281452	108281452	9.31903809666033e-19	108290095	108290095
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108296216	116357165	2778	2670	-0.0053	9.31903809666033e-19	108290095	108290095	5.14535399862043e-09	116351479	116364735
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116364735	116392122	4	4	-0.5748	5.14535399862043e-09	116351479	116364735	8.81090143978994e-09	116387109	116402527
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116396677	116396677	1	0	NA	8.81090143978994e-09	116387109	116402527	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116402527	173660684	15631	14975	-0.008	NA	NA	NA	3.25086969978456e-111	173660684	173660684
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.7448	3.25086969978456e-111	173660684	173660684	4.44712974156709e-113	173666072	173666072
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3918	-0.0093	4.44712974156709e-113	173666072	173666072	3.81211565866485e-27	187330240	187330240
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.371	3.81211565866485e-27	187330240	187330240	6.18781028863815e-23	187333619	187333619
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1188	-0.018	6.18781028863815e-23	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	210	-0.0103	NA	NA	NA	1.99105162477844e-08	730853	776194
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	829954	5	5	-0.6016	1.99105162477844e-08	730853	776194	1.1441211092227e-11	829954	870657
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3599	-0.0128	1.1441211092227e-11	829954	870657	7.36807508627739e-318	12857302	12857302
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.75	7.36807508627739e-318	12857302	12857302	0	12873052	12873052
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	17647063	1531	1463	-0.0151	0	12873052	12873052	1.67867313340369e-11	17647063	17647063
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17653599	17671944	2	2	-0.8831	1.67867313340369e-11	17647063	17647063	5.84990766043606e-11	17671944	17671944
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17680945	42662906	6699	6403	-0.0043	5.84990766043606e-11	17671944	17671944	6.16182769827123e-10	42662906	42662906
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42664919	42666538	2	2	-0.8436	6.16182769827123e-10	42662906	42662906	8.0393780162352e-10	42666538	42667950
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42667950	68885350	6839	6585	-0.0042	8.0393780162352e-10	42666538	42667950	2.80223340871869e-09	68885350	68885350
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70343857	70345552	2	2	0.8126	2.80223340871869e-09	68885350	68885350	1.31872398657535e-09	70345552	70345552
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70405656	97060205	8419	8065	-0.0027	1.31872398657535e-09	70345552	70345552	1.71501107475027e-39	97060205	97060205
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.8636	1.71501107475027e-39	97060205	97060205	8.72194038267127e-38	97119376	97119376
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	180194323	26167	25045	-0.0013	8.72194038267127e-38	97119376	97119376	1.35295727051359e-15	180189516	180344964
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	10	-0.4728	1.35295727051359e-15	180189516	180344964	3.43597899141248e-11	180357210	180365950
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	108	0.0022	3.43597899141248e-11	180357210	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.0344	NA	NA	NA	5.13338191232614e-12	186875	204881
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	-0.4387	5.13338191232614e-12	186875	204881	2.28834517985418e-87	240119	240119
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	44	0.4249	2.28834517985418e-87	240119	240119	1.56702409840091e-61	323898	329100
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10063	-0.0053	1.56702409840091e-61	323898	329100	1.41137113785109e-13	29941766	29950805
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29981912	6	6	0.5527	1.41137113785109e-13	29941766	29950805	4.06380633377296e-10	29980445	29985620
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29985620	32558677	1084	1044	0.0347	4.06380633377296e-10	29980445	29985620	3.15391159015268e-85	32558677	32558677
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	1.181	3.15391159015268e-85	32558677	32558677	1.27882754139824e-99	32605300	32605300
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	54035000	8302	7967	0.0064	1.27882754139824e-99	32605300	32605300	0	54035000	54035000
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.5961	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2306	-0.0058	0	54042734	54042734	2.52063047245349e-50	65767409	65767409
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.9307	2.52063047245349e-50	65767409	65767409	5.21585816809287e-50	65771532	65771532
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	72919733	2135	2062	-0.0013	5.21585816809287e-50	65771532	65771532	6.22087244204946e-14	72919733	72919733
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72920894	1	0	NA	6.22087244204946e-14	72919733	72919733	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72923399	72924440	2	2	-0.9976	NA	NA	NA	7.41679927231268e-14	72924440	72924440
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	139643729	21053	20210	-0.005	7.41679927231268e-14	72924440	72924440	8.45784570864537e-15	139643729	139643729
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.8409	8.45784570864537e-15	139643729	139643729	3.81389936877422e-14	139648318	139651247
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	162502077	7760	7472	-0.0069	3.81389936877422e-14	139648318	139651247	7.05651575139536e-15	162502077	162502077
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-1.0531	7.05651575139536e-15	162502077	162502077	2.40400552320188e-14	162505819	162505819
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	163150755	311	297	-0.0195	2.40400552320188e-14	162505819	162505819	1.82008812141048e-14	163150755	163150755
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	163153944	163158320	3	3	-0.8669	1.82008812141048e-14	163150755	163150755	3.10207136608571e-13	163158320	163158320
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	163160974	165643653	647	620	-0.0289	3.10207136608571e-13	163158320	163158320	1.29655354973139e-14	165642393	165643653
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.7328	1.29655354973139e-14	165642393	165643653	5.71369882327041e-15	165650610	165650610
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1725	-0.0275	5.71369882327041e-15	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	36	-0.008	NA	NA	NA	9.09716882812377e-28	244720	244720
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-1.0482	9.09716882812377e-28	244720	244720	1.49075900547424e-38	254342	254342
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	109967918	35222	33756	0.0018	1.49075900547424e-38	254342	254342	4.85667273382798e-10	109967918	109967918
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-0.8767	4.85667273382798e-10	109967918	109967918	4.11639831639356e-10	109974402	109974402
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	141410894	14534	13946	-0.004	4.11639831639356e-10	109974402	109974402	5.08422433882685e-13	141408013	141425306
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141414719	2	0	NA	5.08422433882685e-13	141408013	141425306	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141417702	141438504	11	10	0.4354	NA	NA	NA	4.32301334347856e-10	141432778	141442231
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142152205	294	284	0.0367	4.32301334347856e-10	141432778	141442231	2.7753797862504e-13	142141101	142152205
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142176074	7	7	0.5691	2.7753797862504e-13	142141101	142152205	5.61255391053436e-12	142176074	142187073
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187073	142217406	14	13	0.1445	5.61255391053436e-12	142176074	142187073	0.0917655020652256	142205830	142308600
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142218998	147702365	2324	2223	-0.0076	0.0917655020652256	142205830	142308600	4.32821953290011e-23	147702365	147702365
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.2898	4.32821953290011e-23	147702365	147702365	1.96102720411333e-22	147707161	147707161
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	152201682	1776	1705	0.0045	1.96102720411333e-22	147707161	147707161	7.8051460760374e-11	152198148	152201682
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	152205765	152210404	2	2	-0.9007	7.8051460760374e-11	152198148	152201682	3.06019732385007e-10	152210404	152210404
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	152213966	156483966	1403	1335	-0.0251	3.06019732385007e-10	152210404	152210404	2.73496337785676e-10	156480019	156485711
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156495904	6	5	0.5309	2.73496337785676e-10	156480019	156485711	7.71501124086434e-09	156494044	156498994
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156497496	158821263	1051	1002	-0.0147	7.71501124086434e-09	156494044	156498994	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.0291	NA	NA	NA	4.07456966530314e-16	581533	581533
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3166	4.07456966530314e-16	581533	581533	2.47567242595247e-17	588865	588865
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	589	-0.0219	2.47567242595247e-17	588865	588865	2.78215339031508e-13	2234351	2234351
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2242849	1	0	NA	2.78215339031508e-13	2234351	2234351	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2243659	2251011	3	3	-0.9344	NA	NA	NA	3.84601234169819e-17	2251011	2251011
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	6926661	1650	1588	-0.0275	3.84601234169819e-17	2251011	2251011	1.40369438982757e-19	6909487	6926661
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	-0.5592	1.40369438982757e-19	6909487	6926661	2.82425047214629e-22	7824059	8137794
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	15444819	2662	2552	-0.0089	2.82425047214629e-22	7824059	8137794	5.441417556975e-29	15444819	15444819
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15446571	15453544	5	5	-0.8925	5.441417556975e-29	15444819	15444819	2.25065434961551e-28	15453544	15453544
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15457778	51191560	10244	9818	-0.0019	2.25065434961551e-28	15453544	15453544	2.59006010570089e-26	51191560	51191560
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.9617	2.59006010570089e-26	51191560	51191560	1.01274766335661e-26	51200291	51200291
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	1.01274766335661e-26	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	87255865	10503	10081	-0.0094	NA	NA	NA	3.50668598566532e-24	87255865	87255865
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-1.0569	3.50668598566532e-24	87255865	87255865	4.15161659147524e-23	87262662	87262662
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18003	-0.0042	4.15161659147524e-23	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7693	-0.0119	NA	NA	NA	0	23343915	23343915
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.1885	0	23343915	23343915	0	23365926	23365926
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	24491341	255	238	-0.0155	0	23365926	23365926	1.74427775760874e-09	24485796	24491341
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24495765	24506914	3	3	-0.6714	1.74427775760874e-09	24485796	24491341	3.24688619114275e-09	24506914	24509107
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24509107	70926188	4811	4588	0.009	3.24688619114275e-09	24506914	24509107	4.33341642944171e-19	70926188	70926188
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.1892	4.33341642944171e-19	70926188	70926188	4.72220610493776e-20	70930528	70930528
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14883	-0.0028	4.72220610493776e-20	70930528	70930528	2.55717094694438e-13	116124007	116124007
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-0.9839	2.55717094694438e-13	116124007	116124007	1.02890965363999e-12	116130333	116130333
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7944	0.0037	1.02890965363999e-12	116130333	116130333	1.75179253708683e-21	137352394	137352394
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.274	1.75179253708683e-21	137352394	137352394	6.02211404558173e-18	137356880	137356880
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1058	0.0096	6.02211404558173e-18	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	56115736	17031	16378	-0.004	NA	NA	NA	4.01607712482214e-16	56109520	56115736
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	10	0.4797	4.01607712482214e-16	56109520	56115736	1.14202844775847e-16	56138767	56142414
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	60720119	1071	1031	0.0016	1.14202844775847e-16	56138767	56142414	8.0935114521504e-09	60718409	60721921
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	60721921	60726142	3	3	-0.6403	8.0935114521504e-09	60718409	60721921	2.37979692520846e-08	60723890	60728428
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	60728428	77917893	6477	6198	0.0035	2.37979692520846e-08	60723890	60728428	1.38004985782526e-77	77917893	77917893
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.8996	1.38004985782526e-77	77917893	77917893	2.26236048571552e-77	77928738	77928738
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100672415	7761	7442	-2e-04	2.26236048571552e-77	77928738	77928738	7.66090914034626e-14	100670683	100672415
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100676022	100676022	1	0	NA	7.66090914034626e-14	100670683	100672415	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.7105	NA	NA	NA	8.92114840452193e-14	100686787	100693036
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	126454160	9332	8968	0.0021	8.92114840452193e-14	100686787	100693036	7.81878608227759e-10	126454160	126454160
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126457441	126465431	2	2	0.8617	7.81878608227759e-10	126454160	126454160	5.80638224799922e-10	126465431	126465431
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126466575	135285645	3113	2981	-0.0217	5.80638224799922e-10	126465431	126465431	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1705	0.0079	NA	NA	NA	6.76307980635811e-17	4920907	4923300
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4931000	4	4	-0.8154	6.76307980635811e-17	4920907	4923300	6.59187405809123e-18	4931000	4932214
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4932214	5741031	362	351	-0.008	6.59187405809123e-18	4931000	4932214	3.14886864205725e-48	5738494	5741031
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.7297	3.14886864205725e-48	5738494	5741031	1.28445982587188e-52	5763749	5763749
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	55118214	14753	14138	-7e-04	1.28445982587188e-52	5763749	5763749	3.99970158598386e-132	55118214	55124730
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	-0.6995	3.99970158598386e-132	55118214	55124730	4.61961345462799e-134	55207305	55209626
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4460	0.0181	4.61961345462799e-134	55207305	55209626	2.09525650512815e-19	66463477	66463477
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0072	2.09525650512815e-19	66463477	66463477	3.51973785892705e-13	66469412	66469412
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81177333	5234	4996	0.0094	3.51973785892705e-13	66469412	66469412	3.88540131800053e-11	81171544	81177333
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81202118	3	3	-0.7425	3.88540131800053e-11	81171544	81177333	3.65740073598768e-11	81202118	81208351
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81208351	134450318	18483	17733	-0.006	3.65740073598768e-11	81202118	81208351	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11104973	4325	4156	-8e-04	NA	NA	NA	1.05635896163459e-07	11093358	11110735
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.3279	1.05635896163459e-07	11093358	11110735	7.69225445055977e-06	11128557	11166629
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	67	-0.0183	7.69225445055977e-06	11128557	11166629	2.61758409399957e-16	11393473	11395862
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	0.8064	2.61758409399957e-16	11393473	11395862	5.10537335799374e-24	11435643	11435643
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	33270966	7524	7192	-0.0052	5.10537335799374e-24	11435643	11435643	8.16474535604508e-10	33270966	33270966
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-0.8415	8.16474535604508e-10	33270966	33270966	1.36290940962087e-09	33283825	33290235
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	40738837	1466	1408	-0.0094	1.36290940962087e-09	33283825	33290235	1.26113882455028e-07	40733911	40738837
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	40742599	40749223	2	2	-0.7551	1.26113882455028e-07	40733911	40738837	1.27658906348812e-13	40749223	40749223
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	40749301	80662066	13935	13335	0.0033	1.27658906348812e-13	40749223	40749223	3.23301126147535e-14	80662066	80662066
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-0.9159	3.23301126147535e-14	80662066	80662066	1.83946409517803e-11	80666751	80666751
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130694393	17172	16487	0.0026	1.83946409517803e-11	80666751	80666751	3.37368842761638e-18	130694393	130694393
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.145	3.37368842761638e-18	130694393	130694393	1.17594472355842e-21	130701040	130701040
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	85	-0.0397	1.17594472355842e-21	130701040	130701040	2.97314141948083e-45	130943064	130943064
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6369	2.97314141948083e-45	130943064	130943064	6.41993207054189e-37	130946248	130946248
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	526	-0.0141	6.41993207054189e-37	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5363	-0.0032	NA	NA	NA	1.84971198647364e-17	33030946	33030946
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.9374	1.84971198647364e-17	33030946	33030946	1.72942503403095e-19	33042557	33042557
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	49964838	6621	6347	-0.0066	1.72942503403095e-19	33042557	33042557	1.26823973667080e-206	49964838	49964838
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.6589	1.2682397366708e-206	49964838	49964838	1.59685680289233e-190	49971732	49971732
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1740	-0.0063	1.59685680289233e-190	49971732	49971732	4.07096669286901e-38	56646284	56657371
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	0.6176	4.07096669286901e-38	56646284	56657371	3.03197444345604e-38	56681665	56686863
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	63118944	1460	1404	-0.0117	3.03197444345604e-38	56681665	56686863	5.79534087250132e-13	63118944	63118944
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-0.9887	5.79534087250132e-13	63118944	63118944	4.12475564810274e-14	63130828	63130828
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	82082406	5325	5124	-0.0055	4.12475564810274e-14	63130828	63130828	7.84944112893566e-10	82082406	82082406
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	82097242	82102355	2	2	0.8225	7.84944112893566e-10	82082406	82082406	3.25455354252125e-09	82102355	82102355
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	82108383	100690991	6251	5982	-0.0058	3.25455354252125e-09	82102355	82102355	1.50848436345712e-32	100690991	100690991
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.5143	1.50848436345712e-32	100690991	100690991	6.3619750685965e-34	100693892	100693892
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4377	-0.0192	6.3619750685965e-34	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.2096	NA	NA	NA	4.63682659068205e-07	18537177	19271102
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	54	-0.6925	4.63682659068205e-07	18537177	19271102	2.73560769483273e-189	19492531	19494416
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18521	0.0054	2.73560769483273e-189	19492531	19494416	1.61802219063184e-44	73061942	73061942
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.9509	1.61802219063184e-44	73061942	73061942	8.50987665225186e-43	73092112	73092112
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11742	0.0021	8.50987665225186e-43	73092112	73092112	2.63198663787474e-21	105595302	105602602
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	0.5411	2.63198663787474e-21	105595302	105602602	2.44514725981316e-19	105630089	105673157
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	44	-0.1308	2.44514725981316e-19	105630089	105673157	4.80388316869889e-17	105846004	105856591
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-1.0004	4.80388316869889e-17	105846004	105856591	1.66509777038868e-23	105881677	105897061
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	117	-0.0422	1.66509777038868e-23	105881677	105897061	1.64478808829259e-22	106214372	106219784
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	15	0.5772	1.64478808829259e-22	106214372	106219784	5.97665569644568e-23	106252126	106255190
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	-0.0866	5.97665569644568e-23	106252126	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	97	0.1724	NA	NA	NA	1.37845275337475e-20	19397326	19844217
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	25813207	1634	1563	-0.0134	1.37845275337475e-20	19397326	19844217	4.63522603070765e-09	25813154	25813207
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	25818201	25821037	3	3	-0.7081	4.63522603070765e-09	25813154	25813207	1.05057235910555e-09	25821037	25822754
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	25822754	32456500	2092	2001	-0.002	1.05057235910555e-09	25821037	25822754	9.0097332097246e-98	32456500	32514939
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	22	-0.8189	9.0097332097246e-98	32456500	32514939	4.28913777950603e-108	32583146	32594200
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	4.28913777950603e-108	32583146	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74669752	17858	17133	0.0055	NA	NA	NA	0	74669752	74669752
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.3923	0	74669752	74669752	0	74680439	74680439
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	85614382	4033	3873	0.0031	0	74680439	74680439	1.88020706301019e-64	85614382	85614382
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85634537	85671158	8	8	-1.0419	1.88020706301019e-64	85614382	85614382	6.40054249617896e-62	85671158	85671158
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85678387	99632987	5292	5068	-0.0087	6.40054249617896e-62	85671158	85671158	6.54391573978661e-23	99632987	99632987
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.2587	6.54391573978661e-23	99632987	99632987	2.46203207850526e-20	99635701	99635701
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	258	-0.0358	2.46203207850526e-20	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5271	0.0095	NA	NA	NA	4.01011108161592e-08	14672496	14876356
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.2936	4.01011108161592e-08	14672496	14876356	7.18554665738558e-09	15029941	15042407
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	31862577	5090	4875	0.024	7.18554665738558e-09	15029941	15042407	1.29127625048384e-13	31842335	31862577
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	32558526	17	17	-0.3293	1.29127625048384e-13	31842335	31862577	2.61869538530727e-21	32558526	32558526
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32809658	33348511	5	5	0.2604	2.61869538530727e-21	32558526	32558526	2.04015194781484e-09	33348511	33370459
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33370459	33647856	25	24	-0.3977	2.04015194781484e-09	33348511	33370459	1.53782245052267e-26	33538171	33841331
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	33830585	1	0	NA	1.53782245052267e-26	33538171	33841331	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	54348362	3075	2943	0.0056	NA	NA	NA	6.18901735051987e-24	54343465	54365385
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.5642	6.18901735051987e-24	54343465	54365385	4.86175060811141e-05	54368717	54390060
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	5	0.4539	4.86175060811141e-05	54368717	54390060	3.34528733105998e-06	54400475	54424734
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	75093957	6811	6534	0.013	3.34528733105998e-06	54400475	54424734	4.74566967655863e-41	75093957	75093957
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.4169	4.74566967655863e-41	75093957	75093957	8.56718516228609e-44	75100865	75100865
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	578	-0.0138	8.56718516228609e-44	75100865	75100865	2.97494138978739e-39	76925748	76931247
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76929598	1	0	NA	2.97494138978739e-39	76925748	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	7	0.8738	NA	NA	NA	7.84408072090484e-36	76938723	76940218
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4333	-0.0043	7.84408072090484e-36	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	402	0.0085	NA	NA	NA	1.33626277571051e-32	1028979	1028979
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5611	1.33626277571051e-32	1028979	1028979	4.16598556480332e-33	1030766	1030766
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31468896	11622	11137	0.0183	4.16598556480332e-33	1030766	1030766	1.33945357670261e-13	31461588	31471890
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31470227	31889566	16	16	0.3737	1.33945357670261e-13	31461588	31471890	1.26941848084911e-18	31499568	31893451
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	32828797	364	348	-0.0047	1.26941848084911e-18	31499568	31893451	4.05512734830213e-10	32828797	32828797
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.7721	4.05512734830213e-10	32828797	32828797	3.08264697117608e-07	32832642	32833765
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1395	0.026	3.08264697117608e-07	32832642	32833765	3.34808715969915e-42	36673853	36673853
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36675987	1	0	NA	3.34808715969915e-42	36673853	36673853	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36684619	5	3	-1.4184	NA	NA	NA	6.28061938928947e-41	36684619	36684619
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1737	0.0397	6.28061938928947e-41	36684619	36684619	3.01552989421487e-09	40863808	41015177
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41026062	6	6	-0.4598	3.01552989421487e-09	40863808	41015177	2.54617204144403e-09	41007660	41066163
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41031191	41031191	1	0	NA	2.54617204144403e-09	41007660	41066163	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41521544	199	194	0.044	NA	NA	NA	1.31207190880825e-167	41519702	41522429
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	66	-0.67	1.31207190880825e-167	41519702	41522429	4.8671945984836e-217	41708551	41710400
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3331	0.0151	4.8671945984836e-217	41708551	41710400	3.24662435842260e-07	52435609	52440878
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	0.5275	3.2466243584226e-07	52435609	52440878	4.57208562443282e-05	52447064	52455229
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	54035441	725	684	0.0149	4.57208562443282e-05	52447064	52455229	2.23726992540016e-14	54035441	54035441
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54037281	54039435	2	2	-1.0212	2.23726992540016e-14	54035441	54035441	1.51872829803051e-13	54039435	54039435
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54041906	78653545	9469	9101	0.0113	1.51872829803051e-13	54039435	54039435	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15576	-0.0053	NA	NA	NA	1.80156509409614e-16	53092949	53092949
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.0767	1.80156509409614e-16	53092949	53092949	1.70333657922686e-15	53099601	53099601
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6487	-0.0083	1.70333657922686e-15	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1470	0.024	NA	NA	NA	4.1501298354516e-08	3591120	3591120
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-0.8215	4.1501298354516e-08	3591120	3591120	7.61704588442236e-09	3593646	3596968
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	21533555	7997	7670	0.0345	7.61704588442236e-09	3593646	3596968	6.38337269996851e-10	21532505	21533555
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21537835	21549627	5	5	0.6057	6.38337269996851e-10	21532505	21533555	3.16139432977344e-10	21549627	21553424
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21553424	32985741	634	603	0.0174	3.16139432977344e-10	21549627	21553424	3.64387029843979e-22	32985741	32985741
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32989636	33007139	3	3	-1.093	3.64387029843979e-22	32985741	32985741	4.5611911140045e-26	33007139	33007139
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33010138	55769042	9178	8792	0.0262	4.5611911140045e-26	33007139	33007139	6.66699129756702e-11	55769042	55769042
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-0.8762	6.66699129756702e-11	55769042	55769042	2.19956460046489e-11	55772729	55772729
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56823430	516	493	0.0232	2.19956460046489e-11	55772729	55772729	1.44766904168441e-55	56823430	56823430
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.962	1.44766904168441e-55	56823430	56823430	8.17723547730908e-49	56840346	56840346
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3054	0.0096	8.17723547730908e-49	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	562	-0.0173	NA	NA	NA	3.43390030592915e-39	1506379	1511632
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7623	3.43390030592915e-39	1506379	1511632	5.62296122787692e-40	1531162	1532433
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20134	0.0019	5.62296122787692e-40	1531162	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12890	-8e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	32110063	8046	7669	0.0183	NA	NA	NA	3.99913480731352e-10	32110063	32110063
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-0.8817	3.99913480731352e-10	32110063	32110063	1.18972128960252e-11	32112051	32112051
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	35472378	1503	1441	0.0159	1.18972128960252e-11	32112051	32112051	1.20213629676679e-35	35472378	35472378
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.5813	1.20213629676679e-35	35472378	35472378	1.11581020232361e-31	35476942	35476942
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6720	0.0182	1.11581020232361e-31	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	109064	16	16	-0.1948	NA	NA	NA	0.000787005404517091	4893	127113
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	1427392	771	741	0.0307	0.000787005404517091	4893	127113	6.12152322844497e-10	1427338	1431240
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.6543	6.12152322844497e-10	1427338	1431240	5.26684967755712e-11	1432891	1434970
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2673365	977	939	0.0181	5.26684967755712e-11	1432891	1434970	3.34245205743213e-08	2668473	2692498
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	24	-0.223	3.34245205743213e-08	2668473	2692498	4.84060015315632e-122	2708291	2711273
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1726	0.8801	4.84060015315632e-122	2708291	2711273	3.20498428843115e-11	8447855	8461739
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.3819	3.20498428843115e-11	8447855	8461739	4.02688005929627e-11	8459880	8481280
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8475091	2	0	NA	4.02688005929627e-11	8459880	8481280	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	55775967	17025	16337	0.9308	NA	NA	NA	4.56917184679275e-16	55775967	55775967
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55782983	55783009	2	2	-0.2887	4.56917184679275e-16	55775967	55775967	1.11696483510567e-15	55783009	55783009
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55793888	154038318	26174	25115	0.9274	1.11696483510567e-15	55783009	55783009	3.94218834208628e-36	154038318	154038318
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.7022	3.94218834208628e-36	154038318	154038318	2.0560369861419e-30	154078819	154079002
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	86	0.9165	2.0560369861419e-30	154078819	154079002	2.69821713273234e-171	154442377	154442377
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.5038	2.69821713273234e-171	154442377	154442377	2.13170845922228e-102	154450309	154450309
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	24	0.8645	2.13170845922228e-102	154450309	154450309	7.63595135346508e-123	154582414	154582414
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	-0.0174	7.63595135346508e-123	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-4.2974	NA	NA	NA	1.02176877143705e-30	3219200	3773948
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.02176877143705e-30	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4846477	12	12	-0.999	NA	NA	NA	2.53965440365778e-15	4431527	5422507
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	7054924	179	167	-3.8803	2.53965440365778e-15	4431527	5422507	2.52142731893427e-05	7040494	7057026
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7096083	6	6	-1.5745	2.52142731893427e-05	7040494	7057026	0.0515845285455857	7078300	7233066
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7117476	7273713	55	53	-3.271	0.0515845285455857	7078300	7233066	0.00281987293264978	7249762	7287810
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7274653	7304209	16	16	-1.7647	0.00281987293264978	7249762	7287810	2.62414954812984e-05	7292494	7320755
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7653082	82	78	-3.4737	2.62414954812984e-05	7292494	7320755	0.000123087706959913	7598374	7660965
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.5243	0.000123087706959913	7598374	7660965	2.86558895735148e-07	7702787	7729757
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	83	-3.3769	2.86558895735148e-07	7702787	7729757	3.88210399231138e-09	7970340	8043008
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8178487	36	34	-4.6619	3.88210399231138e-09	7970340	8043008	8.28851361061347e-06	8161536	8178487
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8199414	7	7	-3.2589	8.28851361061347e-06	8161536	8178487	9.58505602548307e-17	8199414	8199414
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8201959	8245608	14	11	-4.9079	9.58505602548307e-17	8199414	8199414	0.00284281804934656	8241630	8313045
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8949553	196	185	-3.9063	0.00284281804934656	8241630	8313045	0.00034462869459268	8933640	8949553
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.7587	0.00034462869459268	8933640	8949553	1.76205504327762e-12	8956787	8956787
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	34	-4.5581	1.76205504327762e-12	8956787	8956787	0.00224352764922403	9098780	10368218
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10515697	76	70	-3.9707	0.00224352764922403	9098780	10368218	2.0168097215799e-51	10515697	10515697
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.4232	2.0168097215799e-51	10515697	10515697	1.96422933303597e-32	10645500	10645500
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	10655750	2	2	-5.0632	1.96422933303597e-32	10645500	10645500	2.5798248382695e-15	10655750	10655750
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11249952	11698871	4	4	-1.1685	2.5798248382695e-15	10655750	10655750	1.33958678971467e-09	11698871	11698871
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.434	1.33958678971467e-09	11698871	11698871	2.48136160394428e-08	12537944	12546917
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12590969	24	22	-1.9541	2.48136160394428e-08	12537944	12546917	6.63198173993553e-05	12580737	12591908
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	9	-4.0635	6.63198173993553e-05	12580737	12591908	0.000390640173275465	12607539	12627138
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	17	-2.2042	0.000390640173275465	12607539	12627138	8.29934836338712e-11	12668435	12687167
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	8	-5.1999	8.29934836338712e-11	12668435	12687167	6.14075783632575e-06	12730281	12772155
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12928074	48	43	-3.4996	6.14075783632575e-06	12730281	12772155	1.29436795530449e-07	12921790	12972283
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	73	-2.239	1.29436795530449e-07	12921790	12972283	5.56393021685815e-11	13106723	13136828
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13259414	44	42	-3.784	5.56393021685815e-11	13106723	13136828	0.0300106635432339	13147329	13381379
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13261173	13823928	203	191	-4.2261	0.0300106635432339	13147329	13381379	3.13477898632790e-05	13782396	13828384
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.9029	3.1347789863279e-05	13782396	13828384	7.11070400054242e-07	13863616	13870089
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14352278	157	149	-4.4442	7.11070400054242e-07	13863616	13870089	1.29729880703468e-11	14338189	14358464
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14383746	19	18	-3.0133	1.29729880703468e-11	14338189	14358464	9.1206953971153e-08	14380301	14383746
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14384653	14407293	9	9	-4.9573	9.1206953971153e-08	14380301	14383746	0.000570982972598058	14407293	14422395
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14508021	65	63	-3.545	0.000570982972598058	14407293	14422395	0.00297207496748969	14489801	14572190
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	0.00297207496748969	14489801	14572190	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	34	-2.4717	NA	NA	NA	2.13393573368163e-09	14566592	14691724
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15206674	141	135	-4.1159	2.13393573368163e-09	14566592	14691724	5.79512712747875e-06	15199550	15220050
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	11	-2.2152	5.79512712747875e-06	15199550	15220050	0.000126327195879078	15223545	15245772
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15284717	31	30	-3.7404	0.000126327195879078	15223545	15245772	1.28022651168357e-06	15275313	15298885
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	75	-4.69	1.28022651168357e-06	15275313	15298885	2.39633121916611e-09	15407219	15409110
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15412637	4	4	-2.1069	2.39633121916611e-09	15407219	15409110	7.09593337159386e-08	15411509	15413514
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15413514	15433122	14	14	-4.739	7.09593337159386e-08	15411509	15413514	3.79247847871689e-13	15432050	15433122
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15446156	5	5	-2.1179	3.79247847871689e-13	15432050	15433122	9.14620029390827e-07	15446156	15448670
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15447091	15523178	32	30	-4.0268	9.14620029390827e-07	15446156	15448670	2.55895725450143e-13	15521958	15523178
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-1.3355	2.55895725450143e-13	15521958	15523178	1.66525670957485e-05	15531144	15538983
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15583573	28	28	-3.3836	1.66525670957485e-05	15531144	15538983	0.00165414771888739	15557173	15682936
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-4.2106	0.00165414771888739	15557173	15682936	9.355192142756e-05	15829553	15990153
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16194420	116	113	-3.4242	9.355192142756e-05	15829553	15990153	4.29089873722644e-10	16162358	16260833
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	19610243	423	408	-4.1682	4.29089873722644e-10	16162358	16260833	2.01827554382434e-06	19608039	19610243
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2599	2.01827554382434e-06	19608039	19610243	3.98829052632888e-08	19613864	19615891
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	19614809	1	0	NA	3.98829052632888e-08	19613864	19615891	NA	NA	NA
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19615891	21497583	437	415	-4.1478	NA	NA	NA	1.12096283986092e-05	21490803	21497583
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	3	-1.4749	1.12096283986092e-05	21490803	21497583	1.29891035158243e-06	21559551	21574425
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22157319	118	113	-4.1924	1.29891035158243e-06	21559551	21574425	1.45008403273291e-12	22058759	22158616
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-1.8426	1.45008403273291e-12	22058759	22158616	4.97526352692613e-06	22176501	22177335
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.9912	4.97526352692613e-06	22176501	22177335	0.00418954960252293	22181855	22209119
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22252795	21	19	-5.0432	0.00418954960252293	22181855	22209119	6.38037442440194e-05	22241781	22400925
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	22930737	67	63	-4.113	6.38037442440194e-05	22241781	22400925	1.12765881737908e-71	22926726	22930737
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1913	1.12765881737908e-71	22926726	22930737	0.000127896727713717	26943701	27006628
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.6285	0.000127896727713717	26943701	27006628	2.30010130553726e-05	27003308	27053237
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.5282	2.30010130553726e-05	27003308	27053237	6.77051687153258e-08	27137064	27163598
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.3721	6.77051687153258e-08	27137064	27163598	2.05407169767442e-10	27172283	27176933
MSK_252152915466_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.1349	2.05407169767442e-10	27172283	27176933	NA	NA	NA
