Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26760	0.0055	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	2.4192	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10945	-0.0047	0	72579311	72579311	9.78269865556271e-12	109373255	109373255
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.9864	9.78269865556271e-12	109373255	109373255	2.66549500154727e-11	109376249	109376249
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110023268	295	290	0.0059	2.66549500154727e-11	109376249	109376249	5.97904370802768e-13	110015739	110023268
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.8648	5.97904370802768e-13	110015739	110023268	1.98013698897871e-13	110039388	110041712
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147329819	4563	4380	0.0038	1.98013698897871e-13	110039388	110041712	2.61524123642587e-13	147308557	147369818
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147510532	29	28	0.2878	2.61524123642587e-13	147308557	147369818	3.99279835029428e-15	147471665	148084402
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1214	0.0058	3.99279835029428e-15	147471665	148084402	9.37495712557496e-12	150818222	150823073
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-0.6463	9.37495712557496e-12	150818222	150823073	2.77787973214329e-06	150839754	150839754
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	2.77787973214329e-06	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150851439	5	4	-1.5778	NA	NA	NA	3.36001874745567e-61	150851439	150851439
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	196570662	16640	15951	-0.0012	3.36001874745567e-61	150851439	150851439	5.67929003310509e-11	196570662	196570662
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	2	-0.9736	5.67929003310509e-11	196570662	196570662	7.28413768365962e-11	196576204	196576204
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	200596027	1582	1507	0.0072	7.28413768365962e-11	196576204	196576204	8.37382955121328e-13	200584100	200625002
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200787319	39	37	-0.2447	8.37382955121328e-13	200584100	200625002	1.30642027067090e-12	200673525	200808717
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	246769018	17284	16628	-0.004	1.3064202706709e-12	200673525	200808717	2.96081533350913e-96	246769018	246805521
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	25	-0.7906	2.96081533350913e-96	246769018	246805521	6.15135681673687e-56	246858820	246862029
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	96	-0.0159	6.15135681673687e-56	246858820	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	17074335	5088	4888	-0.0051	NA	NA	NA	1.60664942036979e-30	17074335	17074335
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17082016	17082016	1	0	NA	1.60664942036979e-30	17074335	17074335	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17087488	17102047	4	4	-1.109	NA	NA	NA	1.77439122362770e-29	17102047	17102047
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17105804	34543992	6429	6186	-0.001	1.7743912236277e-29	17102047	17102047	0	34543992	34543992
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-4.2539	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	462	-0.0123	0	34589997	34589997	2.26288380695559e-15	35821494	35821494
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.1996	2.26288380695559e-15	35821494	35821494	1.54986273743486e-17	35844884	35844884
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6419	0.0015	1.54986273743486e-17	35844884	35844884	1.92299793284705e-12	52588009	52600588
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.92299793284705e-12	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7209	NA	NA	NA	4.19857483812518e-12	52635695	52639605
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	212890878	48398	46437	-0.0028	4.19857483812518e-12	52635695	52639605	1.38037606882038e-20	212889077	212892884
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.9294	1.38037606882038e-20	212889077	212892884	4.76701493258129e-21	212896080	212898875
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	227949124	5141	4926	-0.01	4.76701493258129e-21	212896080	212898875	4.22940024085319e-14	227943049	227954583
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227981126	12	11	0.4475	4.22940024085319e-14	227943049	227954583	2.27280095738963e-12	227968956	227990692
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227986221	242689978	5535	5328	0.0016	2.27280095738963e-12	227968956	227990692	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	1756179	588	561	-0.0304	NA	NA	NA	2.90315494394709e-13	1756179	1756179
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1757559	1762182	2	2	-1.0431	2.90315494394709e-13	1756179	1756179	1.10599989286811e-12	1762182	1762182
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1765193	32074432	10206	9760	-0.0066	1.10599989286811e-12	1762182	1762182	1.36364639566576e-221	32074432	32074432
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.225	1.36364639566576e-221	32074432	32074432	4.33155790354259e-223	32080848	32080848
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	53001678	7864	7543	0.006	4.33155790354259e-223	32080848	32080848	2.11407446690868e-13	52999601	53001678
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.6659	2.11407446690868e-13	52999601	53001678	2.84464884606850e-13	53011885	53014254
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	99882435	13515	12947	-0.0059	2.8446488460685e-13	53011885	53014254	1.53609608599240e-09	99882435	99882435
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99891210	99891210	1	0	NA	1.5360960859924e-09	99882435	99882435	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	0.8885	NA	NA	NA	8.34017582789822e-09	99897201	99897201
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	150748947	17036	16362	-0.0042	8.34017582789822e-09	99897201	99897201	2.36804184485516e-52	150748947	150748947
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-2.1108	2.36804184485516e-52	150748947	150748947	1.84345778819084e-53	150752600	150752600
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	164001657	4267	4107	-0.0043	1.84345778819084e-53	150752600	150752600	2.79578218676393e-21	164001657	164001657
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	2.79578218676393e-21	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164019640	3	3	-1.0773	NA	NA	NA	2.52331753401978e-21	164019640	164019640
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164023502	192546280	9570	9183	-0.0015	2.52331753401978e-21	164019640	164019640	1.38595707956247e-18	192546280	192546280
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.8735	1.38595707956247e-18	192546280	192546280	5.39117404329676e-17	192552734	192552734
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199329592	2564	2469	-1e-04	5.39117404329676e-17	192552734	192552734	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9143	-0.0028	NA	NA	NA	3.47594320393009e-17	34439897	34445002
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6895	3.47594320393009e-17	34439897	34445002	7.75423480759125e-17	34491115	34506297
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8491	-0.0066	7.75423480759125e-17	34491115	34506297	7.16538883853484e-08	68896316	69088563
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69163312	13	12	-0.3444	7.16538883853484e-08	68896316	69088563	9.60589826025893e-08	69142044	69677857
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69165814	69165814	1	0	NA	9.60589826025893e-08	69142044	69677857	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	115	0.0084	NA	NA	NA	1.52708815558936e-12	70130975	70190682
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70294312	5	5	-0.6689	1.52708815558936e-12	70130975	70190682	2.60730719878786e-13	70216707	70336467
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	88752705	6463	6188	-0.007	2.60730719878786e-13	70216707	70336467	3.77193410682994e-11	88752705	88752705
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-0.9685	3.77193410682994e-11	88752705	88752705	5.79237980823327e-11	88756721	88756721
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	173660684	24801	23824	-0.0097	5.79237980823327e-11	88756721	88756721	1.28203196815012e-47	173660684	173660684
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.9271	1.28203196815012e-47	173660684	173660684	2.23752906723717e-47	173666072	173666072
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186875633	3872	3727	-0.0065	2.23752906723717e-47	173666072	173666072	8.81323341707072e-17	186875633	186875633
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186876783	186882219	3	2	-1.1713	8.81323341707072e-17	186875633	186875633	5.1957289275346e-16	186882219	186882219
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186883431	187330240	206	200	0.0188	5.1957289275346e-16	186882219	186882219	2.12360278711077e-24	187330240	187330240
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.7486	2.12360278711077e-24	187330240	187330240	2.28536253049498e-33	187333619	187333619
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1176	-0.0142	2.28536253049498e-33	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	217	0.0096	NA	NA	NA	2.38989102294730e-16	737829	737829
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.7749	2.3898910229473e-16	737829	737829	6.49675425638099e-23	829954	829954
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	21480789	6124	5884	-0.0054	6.49675425638099e-23	829954	829954	1.33055834577708e-24	21480789	21480789
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.4092	1.33055834577708e-24	21480789	21480789	2.08657141608286e-24	21487474	21487474
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	112546984	24974	24046	-0.0044	2.08657141608286e-24	21487474	21487474	3.98676253585844e-48	112546984	112546984
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112548319	112556405	6	6	-1.1323	3.98676253585844e-48	112546984	112546984	6.6708723553289e-48	112556405	112556405
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112558360	179429409	22008	21166	-1e-04	6.6708723553289e-48	112556405	112556405	6.77220783608455e-18	179429409	179429409
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.2168	6.77220783608455e-18	179429409	179429409	2.18591404405882e-15	179431937	179431937
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180342860	302	286	0.0198	2.18591404405882e-15	179431937	179431937	0	180342860	180342860
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180346557	2	0	NA	0	180342860	180342860	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-4.8458	NA	NA	NA	0	180358977	180358977
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	0.0103	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	234115	53	52	0.0214	NA	NA	NA	1.71008127419806e-11	219639	244363
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	326323	48	48	-0.2522	1.71008127419806e-11	219639	244363	6.47049394832208e-18	313153	335212
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10065	-0.0031	6.47049394832208e-18	313153	335212	3.24024785317378e-13	29941766	29950805
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29981912	6	5	0.6629	3.24024785317378e-13	29941766	29950805	4.37184548700109e-12	29981912	29985620
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29985620	32558677	1084	1038	0.0058	4.37184548700109e-12	29981912	29985620	8.63402511592031e-77	32558677	32558677
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	1.1754	8.63402511592031e-77	32558677	32558677	4.09623120961763e-08	32597877	32626619
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32756637	53	53	0.3161	4.09623120961763e-08	32597877	32626619	2.38421219430951e-29	32709263	32762061
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32758904	54035000	8249	7927	0.0054	2.38421219430951e-29	32709263	32762061	5.02972987513965e-213	54035000	54035000
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54037199	1	0	NA	5.02972987513965e-213	54035000	54035000	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54039814	54042734	2	2	-4.1916	NA	NA	NA	8.59213430054857e-215	54042734	54042734
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6173	-0.0049	8.59213430054857e-215	54042734	54042734	6.35592675781744e-56	79015901	79018959
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.8478	6.35592675781744e-56	79015901	79018959	6.33036006385612e-60	79091850	79091850
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6484	-0.0016	6.33036006385612e-60	79091850	79091850	0	103841482	103841482
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.8056	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10065	-0.0035	0	103868154	103868154	3.91830975189941e-15	134629897	134629897
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	3.91830975189941e-15	134629897	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.9201	NA	NA	NA	4.10220431540513e-15	134635779	134639397
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	151546355	5797	5571	-0.0053	4.10220431540513e-15	134635779	134639397	2.14273293907175e-13	151546355	151546355
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151552684	3	3	-0.8687	2.14273293907175e-13	151546355	151546355	1.48981456404387e-19	151552684	151552684
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	151797541	112	107	0.0071	1.48981456404387e-19	151552684	151552684	6.34729544218493e-10	151793270	151807245
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151799135	151822731	13	13	-0.3389	6.34729544218493e-10	151793270	151807245	3.12433294569672e-08	151810134	151832543
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151824665	165643653	4697	4517	-0.007	3.12433294569672e-08	151810134	151832543	9.54740598136828e-15	165643653	165643653
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.7804	9.54740598136828e-15	165643653	165643653	2.65495179794536e-14	165650610	165653315
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	168075043	898	863	-0.0153	2.65495179794536e-14	165650610	165653315	1.37502525368527e-187	168073309	168076928
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168076928	168342734	106	103	0.5734	1.37502525368527e-187	168073309	168076928	1.19950455994577e-179	168340275	168349663
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168349663	170753106	800	770	-0.0044	1.19950455994577e-179	168340275	168349663	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	246	0.0099	NA	NA	NA	5.46242675180754e-09	1033418	1036135
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-0.8974	5.46242675180754e-09	1033418	1036135	3.05096453841458e-09	1038517	1047636
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	45444609	15911	15300	-0.0032	3.05096453841458e-09	1038517	1047636	2.60540817169540e-11	45444609	45444609
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45449329	45453517	2	2	-0.9847	2.6054081716954e-11	45444609	45444609	2.19780342890090e-11	45453517	45453517
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45462921	45462921	1	0	NA	2.1978034289009e-11	45453517	45453517	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45488118	71894353	5613	5411	-0.0027	NA	NA	NA	3.9387130500355e-84	71894353	71894353
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.6089	3.9387130500355e-84	71894353	71894353	1.52641013590161e-74	71912065	71912065
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	76147819	985	946	0.0091	1.52641013590161e-74	71912065	71912065	1.31875957596891e-07	76051954	76305940
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76271458	76271458	1	0	NA	1.31875957596891e-07	76051954	76305940	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76305940	76421843	8	7	0.4679	NA	NA	NA	5.3645339711471e-09	76365382	76551428
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76539954	109217320	12178	11638	-0.0054	5.3645339711471e-09	76365382	76551428	1.62139100357179e-306	109217320	109217320
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-4.0642	1.62139100357179e-306	109217320	109217320	0.000131746291993348	109233214	109233214
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.5024	0.000131746291993348	109233214	109233214	1.32215412007739e-26	109240210	109240210
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	141410894	14837	14229	-0.0061	1.32215412007739e-26	109240210	109240210	4.41384238125268e-20	141408013	141419692
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141443577	16	15	-0.4832	4.41384238125268e-20	141408013	141419692	7.57847216134131e-23	141438504	141446728
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141446728	143500499	782	751	-0.0095	7.57847216134131e-23	141438504	141446728	3.43075385348022e-23	143500499	143582864
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143503317	143706194	6	6	-0.759	3.43075385348022e-23	143500499	143582864	8.13965641387041e-19	143584350	143709272
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143709272	156483966	5031	4822	-0.012	8.13965641387041e-19	143584350	143709272	3.30572107755501e-09	156480019	156492262
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156495904	6	5	0.5697	3.30572107755501e-09	156480019	156492262	3.48752036915799e-08	156490484	156497496
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156497496	158821263	1051	1010	0.0044	3.48752036915799e-08	156490484	156497496	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25022606	8129	7809	-0.0081	NA	NA	NA	1.47134534756191e-222	25022606	25022606
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.5843	1.47134534756191e-222	25022606	25022606	2.67733234174999e-235	25039370	25039370
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	51191560	7180	6880	-0.007	2.67733234174999e-235	25039370	25039370	0	51191560	51191560
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-5.0861	0	51191560	51191560	0	51200291	51200291
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	0	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	115701209	19554	18796	-0.0062	NA	NA	NA	1.74903533613016e-12	115701209	115701209
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-1.0215	1.74903533613016e-12	115701209	115701209	3.19114055165474e-12	115711730	115711730
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	134649056	6139	5897	-0.005	3.19114055165474e-12	115711730	115711730	1.13863157338136e-08	134647821	134650771
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	134650771	134661290	5	3	-0.7112	1.13863157338136e-08	134647821	134650771	4.80991724571904e-08	134652274	134663529
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	134663529	146264846	3549	3378	-1e-04	4.80991724571904e-08	134652274	134663529	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7542	-0.0085	NA	NA	NA	5.71761514116256e-13	22477358	22477358
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.0236	5.71761514116256e-13	22477358	22477358	2.76953511072591e-12	22492603	22492603
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	152	-0.0195	2.76953511072591e-12	22492603	22492603	0	23343915	23343915
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.6946	0	23343915	23343915	0	23365926	23365926
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4847	-0.001	0	23365926	23365926	2.74292558780892e-11	70926188	70926188
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	0.9937	2.74292558780892e-11	70926188	70926188	5.65895740247944e-11	70930528	70930528
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23849	-0.0027	5.65895740247944e-11	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	24642656	8791	8452	-0.0042	NA	NA	NA	1.50272318631123e-13	24642656	24642656
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	24644710	24646448	2	2	-1.0873	1.50272318631123e-13	24642656	24642656	1.15797870986838e-13	24646448	24646448
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	24648714	27038538	936	900	-0.016	1.15797870986838e-13	24646448	24646448	1.61470074218663e-57	27038538	27038538
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.442	1.61470074218663e-57	27038538	27038538	1.73288686859873e-71	27041812	27041812
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46384985	4727	4521	-0.003	1.73288686859873e-71	27041812	27041812	2.02689440488403e-152	45489823	46389734
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47021415	73	68	0.5971	2.02689440488403e-152	45489823	46389734	2.02253448111381e-07	46545343	47068616
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	47172534	46	43	0.8602	2.02253448111381e-07	46545343	47068616	1.26370398376943e-194	47167144	47172534
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	53683740	1725	1658	-0.0045	1.26370398376943e-194	47167144	47172534	1.82320254430979e-51	53683740	53683740
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-2.1166	1.82320254430979e-51	53683740	53683740	8.67025218734552e-53	53687880	53687880
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	70949263	5371	5165	-0.0054	8.67025218734552e-53	53687880	53687880	3.52328257514173e-12	70945853	70949263
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	3	-0.8395	3.52328257514173e-12	70945853	70949263	1.04545964969082e-12	70960187	70960187
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	70964344	1	0	NA	1.04545964969082e-12	70960187	70960187	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70966034	77917893	2912	2788	0.0049	NA	NA	NA	8.5934104171354e-62	77917893	77917893
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.8346	8.5934104171354e-62	77917893	77917893	2.46940503800129e-61	77928738	77928738
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7460	-0.0052	2.46940503800129e-61	77928738	77928738	5.4425224912581e-14	100672415	100676022
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-0.9005	5.4425224912581e-14	100672415	100676022	1.2061912657739e-13	100686753	100693036
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	100686787	1	0	NA	1.2061912657739e-13	100686753	100693036	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135285645	12447	11954	-0.0016	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	3191670	1222	1187	0.0278	NA	NA	NA	1.18877932868885e-08	3191396	3191670
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3194235	3194235	1	0	NA	1.18877932868885e-08	3191396	3191670	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3196874	3200134	2	2	-0.8853	NA	NA	NA	7.5273440449921e-09	3200134	3202804
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3202804	5744034	915	883	-8e-04	7.5273440449921e-09	3200134	3202804	8.20394271421684e-09	5734978	5749258
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5745329	5765438	13	13	0.3479	8.20394271421684e-09	5734978	5749258	5.40890306677416e-09	5760117	5775970
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	20799632	5993	5734	0.0018	5.40890306677416e-09	5760117	5775970	7.01145911964236e-16	20799632	20799632
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-0.9408	7.01145911964236e-16	20799632	20799632	3.29101003457642e-15	20806094	20806094
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	134450318	37155	35603	-0.0013	3.29101003457642e-15	20806094	20806094	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10466791	4087	3913	0	NA	NA	NA	5.9741940310047e-12	10465787	10474825
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10470425	10485848	7	7	-0.5495	5.9741940310047e-12	10465787	10474825	1.25289492698557e-11	10482217	10493984
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	226	0.0087	1.25289492698557e-11	10482217	10493984	1.85437588938938e-44	11116883	11116883
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.0755	1.85437588938938e-44	11116883	11116883	1.41274274729778e-49	11140421	11140421
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	28486517	6120	5880	-0.0034	1.41274274729778e-49	11140421	11140421	3.84216633710651e-10	28483247	28489394
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28489394	28492064	3	3	-0.7695	3.84216633710651e-10	28483247	28489394	6.70212443242868e-10	28490565	28493347
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28493347	41303729	3204	3054	-0.0095	6.70212443242868e-10	28490565	28493347	4.72758735919622e-18	41303729	41303729
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-1.0174	4.72758735919622e-18	41303729	41303729	1.46165133699163e-18	41312478	41312478
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	129611181	30445	29221	-0.001	1.46165133699163e-18	41312478	41312478	3.91619968588206e-12	129609393	129611181
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129612492	129616048	3	3	-0.834	3.91619968588206e-12	129609393	129611181	1.70703284819797e-12	129616048	129617826
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129617826	130694393	401	393	0.0025	1.70703284819797e-12	129616048	129617826	4.6546052940054e-22	130694393	130694393
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	-1.3483	4.6546052940054e-22	130694393	130694393	1.00192351357991e-19	130701040	130701040
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	612	0.002	1.00192351357991e-19	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49958475	12218	11695	-0.0057	NA	NA	NA	6.45211175759321e-116	49958475	49958475
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	6.45211175759321e-116	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.059	NA	NA	NA	3.3202656779508e-117	49971732	49971732
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	50819012	360	350	-0.0075	3.3202656779508e-117	49971732	49971732	8.86069579775257e-08	50817754	50819012
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50820905	50822114	2	2	-0.809	8.86069579775257e-08	50817754	50819012	5.59508917896229e-08	50822114	50826116
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50826116	56650373	1442	1385	0.0017	5.59508917896229e-08	50822114	50826116	1.83634806046908e-32	56610886	56658479
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.5904	1.83634806046908e-32	56610886	56658479	4.807590961024e-34	56681665	56693033
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	56691355	2	0	NA	4.807590961024e-34	56681665	56693033	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56693033	63118944	1457	1389	-0.0077	NA	NA	NA	2.17826803389099e-14	63118944	63118944
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-1.0757	2.17826803389099e-14	63118944	63118944	4.03957682816826e-14	63130828	63130828
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	100690991	11578	11115	-0.0027	4.03957682816826e-14	63130828	63130828	3.22983201464034e-25	100690991	100690991
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.4151	3.22983201464034e-25	100690991	100690991	4.11396368742163e-24	100693892	100693892
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114115707	4560	4366	-0.007	4.11396368742163e-24	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114118270	114123340	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	4	-0.1494	NA	NA	NA	0.00162525994051495	18537177	19287128
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	18544772	1	0	NA	0.00162525994051495	18537177	19287128	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	54	-0.6744	NA	NA	NA	1.86886799628779e-147	19490630	19497023
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5468	-0.002	1.86886799628779e-147	19490630	19497023	7.51675683650806e-11	34666996	34674458
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-0.7901	7.51675683650806e-11	34666996	34674458	3.51162447415279e-11	34683810	34685308
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	38786750	1544	1484	-0.0022	3.51162447415279e-11	34683810	34685308	6.5548600980264e-08	38786750	38786750
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	38788034	38789071	2	2	0.8153	6.5548600980264e-08	38786750	38786750	3.20492928481229e-08	38789071	38791571
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	38791571	40676611	349	338	0.0237	3.20492928481229e-08	38789071	38791571	2.89147907570511e-17	40670538	40680589
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.5913	2.89147907570511e-17	40670538	40680589	4.59729069147835e-15	40712006	40726930
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	44242718	661	628	0.0032	4.59729069147835e-15	40712006	40726930	1.67903960013863e-44	44242718	44242718
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	44251821	44292300	7	7	-1.0053	1.67903960013863e-44	44242718	44242718	2.98197902516633e-45	44292300	44292300
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	44296502	69086125	9305	8893	0.0018	2.98197902516633e-45	44292300	44292300	1.79122133788987e-08	69084841	69086125
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.6895	1.79122133788987e-08	69084841	69086125	4.72683434526183e-08	69092211	69093444
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1719	-0.0024	4.72683434526183e-08	69092211	69093444	2.82513358024237e-46	73061942	73061942
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-1.0652	2.82513358024237e-46	73061942	73061942	4.47653363951192e-48	73092112	73092112
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	85351640	4552	4365	-5e-04	4.47653363951192e-48	73092112	73092112	1.78958790011169e-37	85351640	85351640
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85356918	85381909	7	7	-0.9418	1.78958790011169e-37	85351640	85351640	3.58068900209814e-37	85381909	85381909
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85390548	106358491	7899	7579	0.0054	3.58068900209814e-37	85381909	85381909	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18837737	15	15	0.0161	NA	NA	NA	6.03592397315913e-08	18837737	18837737
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.653	6.03592397315913e-08	18837737	18837737	1.96576669689304e-12	18848213	18851513
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20088256	137	132	0.2281	1.96576669689304e-12	18848213	18851513	2.05296893638723e-43	20014107	20339495
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32456500	3671	3519	-0.0113	2.05296893638723e-43	20014107	20339495	3.82504553408034e-87	32454294	32514939
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.7714	3.82504553408034e-87	32454294	32514939	1.04391073062013e-35	32583146	32594200
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.04391073062013e-35	32583146	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	32714483	18	18	0.0601	NA	NA	NA	5.78786535919156e-51	32714483	32714483
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32721469	32762005	8	7	-0.9771	5.78786535919156e-51	32714483	32714483	2.29616285069161e-39	32762005	32762005
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32772265	52517110	8121	7826	5e-04	2.29616285069161e-39	32762005	32762005	1.9694104975097e-16	52517110	52517110
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.1949	1.9694104975097e-16	52517110	52517110	1.11049668319394e-16	52533227	52533227
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	59468560	2979	2865	-0.0012	1.11049668319394e-16	52533227	52533227	1.32572549715522e-15	59468560	59468560
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-0.9449	1.32572549715522e-15	59468560	59468560	5.82130269237933e-16	59483715	59483715
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	59488251	1	0	NA	5.82130269237933e-16	59483715	59483715	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59491310	100298352	16337	15689	0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	979	0.0256	NA	NA	NA	3.1473649834965e-12	2600740	2638581
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	0.9258	3.1473649834965e-12	2600740	2638581	1.08671361804192e-14	2638643	2639798
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	28523145	8600	8250	8e-04	1.08671361804192e-14	2638643	2639798	3.47662529516298e-10	28512937	28523145
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28525086	28529948	3	3	-0.7767	3.47662529516298e-10	28512937	28523145	3.60729754889254e-11	28529948	28536745
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	34317157	1088	1043	0.0223	3.60729754889254e-11	28529948	28536745	3.18924589634901e-46	34306513	34329518
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	50	0.4204	3.18924589634901e-46	34306513	34329518	4.30541851353994e-51	34588639	34619028
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	54352394	2937	2814	0.0103	4.30541851353994e-51	34588639	34619028	5.46594861901705e-10	54343465	54366535
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.4054	5.46594861901705e-10	54343465	54366535	0.000371351721811996	54368717	54399890
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.4431	0.000371351721811996	54368717	54399890	3.42042601255372e-06	54399890	54424734
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1149	0.0074	3.42042601255372e-06	54399890	54424734	5.02584506197588e-156	57203733	57203733
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.6204	5.02584506197588e-156	57203733	57203733	1.52218651884275e-158	57206772	57206772
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3248	0.0025	1.52218651884275e-158	57206772	57206772	1.61505694625436e-26	68693014	68693086
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.6683	1.61505694625436e-26	68693014	68693086	3.55713237920489e-32	68753209	68838384
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1387	0.0114	3.55713237920489e-32	68753209	68838384	8.830980308247e-14	72917554	72941901
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.5265	8.830980308247e-14	72917554	72941901	1.99958054320429e-11	72955519	73025340
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75092501	753	719	-0.0021	1.99958054320429e-11	72955519	73025340	3.11602984008565e-20	75092501	75092501
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75100865	4	4	0.9076	3.11602984008565e-20	75092501	75092501	3.27117521754433e-19	75100865	75100865
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76922411	608	573	-0.0052	3.27117521754433e-19	75100865	75100865	1.28778338822400e-30	76922411	76923844
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76923844	76940218	10	9	0.7669	1.287783388224e-30	76922411	76923844	5.07559165549869e-32	76938723	76942679
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	83858867	2690	2583	-0.0085	5.07559165549869e-32	76938723	76942679	9.01414679546559e-09	83858867	83858867
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83860254	83861596	2	2	-0.8851	9.01414679546559e-09	83858867	83858867	3.66642098641521e-08	83861596	83864368
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83864368	88690571	1821	1742	0.0031	3.66642098641521e-08	83861596	83864368	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	404	0.0115	NA	NA	NA	1.03940714026972e-19	1028979	1028979
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4459	1.03940714026972e-19	1028979	1028979	9.3261738755652e-24	1030766	1030766
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	12869	0.0102	9.3261738755652e-24	1030766	1030766	2.44787645896351e-110	36673853	36673853
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.775	2.44787645896351e-110	36673853	36673853	3.99080039647533e-103	36684619	36684619
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	38479844	866	832	0.0286	3.99080039647533e-103	36684619	36684619	5.42384199616342e-06	38469331	38479844
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38481896	38489291	5	5	0.5001	5.42384199616342e-06	38469331	38479844	6.2468543933317e-07	38489291	38492218
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38490713	40866844	934	880	0.0097	6.2468543933317e-07	38489291	38492218	1.37148126413920e-07	40847517	40866844
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40869151	41026062	7	7	-0.4245	1.3714812641392e-07	40847517	40866844	3.32925255224444e-08	41026062	41066163
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41031191	41519702	199	184	0.0318	3.32925255224444e-08	41026062	41066163	3.79269351385882e-125	41518222	41519702
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	64	-0.6258	3.79269351385882e-125	41518222	41519702	4.03334507226056e-154	41710400	42142363
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	56471985	5218	4991	0.0092	4.03334507226056e-154	41710400	42142363	2.34662508253781e-27	56471985	56471985
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56473793	56480300	6	5	-0.9519	2.34662508253781e-27	56471985	56471985	9.25259504703015e-27	56480300	56480300
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56484552	78653545	8455	8137	0.0073	9.25259504703015e-27	56480300	56480300	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1890337	640	614	-9e-04	NA	NA	NA	9.86152589173283e-136	1890337	1890337
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1896337	1975578	22	22	-0.9639	9.86152589173283e-136	1890337	1890337	1.38943028135871e-124	1975578	1975578
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1978605	53092949	15537	14920	-0.0043	1.38943028135871e-124	1975578	1975578	6.83644721923820e-20	53092949	53092949
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.2978	6.8364472192382e-20	53092949	53092949	2.59770310285053e-20	53099601	53099601
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6487	-0.0013	2.59770310285053e-20	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	4169227	1811	1734	0.0076	NA	NA	NA	3.19769730157404e-11	4167968	4169227
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4170514	4173678	3	3	0.8469	3.19769730157404e-11	4167968	4169227	4.61450179344892e-11	4173678	4173678
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4187616	10664034	2949	2799	0.016	4.61450179344892e-11	4173678	4173678	3.77053910022555e-15	10663385	10664034
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10666591	10675109	7	7	0.6495	3.77053910022555e-15	10663385	10664034	7.08806790901878e-17	10675109	10679370
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10679370	13980416	1517	1465	0.0031	7.08806790901878e-17	10675109	10679370	3.62858096519650e-17	13978275	13983527
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13983527	14014612	11	11	0.5228	3.6285809651965e-17	13978275	13983527	3.4595481962246e-17	14011649	14020752
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14016365	14016365	1	0	NA	3.4595481962246e-17	14011649	14020752	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14017904	63788698	16760	16070	0.0033	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	561	0.0038	NA	NA	NA	4.7280897171571e-203	1506379	1506379
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.0177	4.7280897171571e-203	1506379	1506379	4.19489377397366e-220	1531162	1531162
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	14729413	4595	4413	-0.0059	4.19489377397366e-220	1531162	1531162	3.03618212098175e-122	14729413	14729413
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14731554	14773957	22	21	-0.9818	3.03618212098175e-122	14729413	14729413	3.98808595398996e-123	14773957	14773957
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14775971	62419534	16367	15728	0.0018	3.98808595398996e-123	14773957	14773957	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12899	-0.0031	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9178	0.0099	NA	NA	NA	4.08426518960784e-33	35472378	35472378
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.7121	4.08426518960784e-33	35472378	35472378	6.11581203264251e-33	35476942	35476942
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	38921192	1821	1756	0.0126	6.11581203264251e-33	35476942	35476942	2.01598595285536e-17	38921192	38921192
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	38923041	38929566	4	4	-0.8667	2.01598595285536e-17	38921192	38921192	3.53023498054772e-17	38929566	38929566
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	38930545	49571068	5178	4952	0.0141	3.53023498054772e-17	38929566	38929566	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	751	0.0159	NA	NA	NA	9.0695432871127e-12	1427338	1431240
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.7003	9.0695432871127e-12	1427338	1431240	2.93500086366183e-11	1432891	1434970
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2672401	975	931	-0.0016	2.93500086366183e-11	1432891	1434970	6.05383223042672e-10	2668419	2693493
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.2664	6.05383223042672e-10	2668419	2693493	1.79693651747547e-165	2708291	2708291
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154038318	45001	43177	0.9068	1.79693651747547e-165	2708291	2708291	2.24568062321838e-28	154037006	154038318
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.6322	2.24568062321838e-28	154037006	154038318	1.92781315734518e-24	154078819	154079002
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	86	0.8946	1.92781315734518e-24	154078819	154079002	8.47742210917412e-176	154442377	154442377
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-2.8811	8.47742210917412e-176	154442377	154442377	2.48245593364906e-119	154450309	154450309
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.8794	2.48245593364906e-119	154450309	154450309	3.6318121143077e-109	154578922	154582414
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.014	3.6318121143077e-109	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2746781	16	15	-5.0539	NA	NA	NA	1.44703099057905e-13	2746125	2746781
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2751482	2760469	6	6	-3.2082	1.44703099057905e-13	2746125	2746781	3.60091894705890e-26	2760469	2760469
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2766355	2773629	4	4	-5.1311	3.6009189470589e-26	2760469	2760469	1.65859482723140e-09	2773629	2773629
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2774598	2774598	1	0	NA	1.6585948272314e-09	2773629	2773629	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2775895	2784560	8	8	-2.7513	NA	NA	NA	0.000230076684273088	2782280	2799341
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3223585	88	83	-4.2877	0.000230076684273088	2782280	2799341	1.68358570540965e-32	3219200	3223585
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.68358570540965e-32	3219200	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	10	-0.6345	NA	NA	NA	0.0066369809600377	4431527	5422507
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	5593746	6	6	-2.0264	0.0066369809600377	4431527	5422507	0.0262579306808335	4846477	6765103
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	165	-3.7327	0.0262579306808335	4846477	6765103	5.88111319680151e-08	7021965	7200061
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	122	-2.7643	5.88111319680151e-08	7021965	7200061	0.000353896940715298	7418921	7485594
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7606496	14	11	-4.6906	0.000353896940715298	7418921	7485594	7.08287063595953e-06	7606496	7619476
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	19	-2.7705	7.08287063595953e-06	7606496	7619476	1.58574284598510e-07	7645258	7659535
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	34	-4.5293	1.5857428459851e-07	7645258	7659535	6.26757493506247e-07	7701303	7733351
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	85	-3.184	6.26757493506247e-07	7701303	7733351	5.31955405950523e-07	7938700	8057124
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8245608	57	48	-4.3477	5.31955405950523e-07	7938700	8057124	2.28464717705834e-06	8199414	8313045
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8689019	118	114	-3.4518	2.28464717705834e-06	8199414	8313045	0.0375339910708439	8347344	8773734
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8690572	8824539	49	48	-3.8764	0.0375339910708439	8347344	8773734	0.000820786855103642	8773734	8826900
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8826900	8888511	13	11	-5.0719	0.000820786855103642	8773734	8826900	1.66101572618933e-08	8882995	8894919
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8890417	8949553	16	14	-3.6628	1.66101572618933e-08	8882995	8894919	7.02018485924187e-08	8943871	8949553
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.3429	7.02018485924187e-08	8943871	8949553	3.08746209293431e-11	8956787	8958121
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	33	-4.4976	3.08746209293431e-11	8956787	8958121	3.9982697727656e-06	9133230	9208277
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10051663	18	16	-3.2949	3.9982697727656e-06	9133230	9208277	1.57266198205759e-10	10049346	10051663
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10054229	10251061	11	10	-5.1281	1.57266198205759e-10	10049346	10051663	2.03823901253377e-06	10068094	10257096
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10254943	10385325	15	15	-4.1064	2.03823901253377e-06	10068094	10257096	4.85269390973794e-06	10380302	10386626
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10386626	10429196	8	8	-5.051	4.85269390973794e-06	10380302	10386626	9.02259905877666e-12	10429196	10433178
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10433178	10448819	5	5	-3.0075	9.02259905877666e-12	10429196	10433178	3.24727990978525e-05	10443960	10451527
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10451527	10513747	18	17	-4.2042	3.24727990978525e-05	10443960	10451527	2.81069463836295e-52	10513747	10515697
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.547	2.81069463836295e-52	10513747	10515697	2.89034429880127e-05	10620136	12514978
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13128515	207	195	-2.5085	2.89034429880127e-05	10620136	12514978	5.51203446549257e-07	13112411	13129843
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13151875	12	11	-4.7976	5.51203446549257e-07	13112411	13129843	8.78150501203307e-05	13149825	13162723
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153117	13254711	30	28	-3.2012	8.78150501203307e-05	13149825	13162723	4.46298293409373e-05	13208776	13296819
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13603478	163	155	-4.116	4.46298293409373e-05	13208776	13296819	1.49543569451493e-05	13580493	13603478
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13705594	14	10	-2.6819	1.49543569451493e-05	13580493	13603478	8.78333425964986e-07	13705594	13749720
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14122129	159	153	-4.2936	8.78333425964986e-07	13705594	13749720	1.47238496575290e-05	14118164	14122129
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.6185	1.4723849657529e-05	14118164	14122129	1.81697046266905e-10	14143748	14143748
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14353244	32	29	-4.6155	1.81697046266905e-10	14143748	14143748	0.0445050179125600	14310145	14353244
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14358464	3	3	-3.4362	0.04450501791256	14310145	14353244	1.16789312797927e-10	14358464	14358464
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14375855	8	7	-1.4692	1.16789312797927e-10	14358464	14358464	4.8533384104517e-06	14375855	14382361
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14376942	14508021	81	77	-3.3525	4.8533384104517e-06	14375855	14382361	8.78413125021792e-18	14503927	14528771
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	8.78413125021792e-18	14503927	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	22	-1.3229	NA	NA	NA	5.19684424544357e-20	14566592	14587291
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14579298	1	0	NA	5.19684424544357e-20	14566592	14587291	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15139441	113	111	-3.9125	NA	NA	NA	0.00536084074091965	14909937	15201695
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15282186	79	74	-3.2516	0.00536084074091965	14909937	15201695	6.14613775460012e-08	15260075	15299931
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15283393	15433122	99	95	-4.2571	6.14613775460012e-08	15260075	15299931	2.4617976678543e-06	15410566	15473709
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15690301	90	86	-3.3848	2.4617976678543e-06	15410566	15473709	0.00340387505922259	15537260	15750379
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15915466	36	35	-4.2197	0.00340387505922259	15537260	15750379	1.72315449973559e-05	15862122	15977755
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16224597	133	127	-3.1797	1.72315449973559e-05	15862122	15977755	9.43712942171964e-16	16190541	16330184
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16228031	22139807	967	920	-4.0493	9.43712942171964e-16	16190541	16330184	2.07937004381810e-06	22049641	22139807
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0772	2.0793700438181e-06	22049641	22139807	7.79560408342756e-41	22177335	22177335
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22252446	25	24	-5.0171	7.79560408342756e-41	22177335	22177335	6.77030423639208e-05	22240294	22393417
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22252795	22252795	1	0	NA	6.77030423639208e-05	22240294	22393417	NA	NA	NA
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	22930737	67	62	-4.1692	NA	NA	NA	1.89342382224764e-64	22926726	25737663
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	27019256	50	49	-1.2838	1.89342382224764e-64	22926726	25737663	1.48581467407370e-08	27009433	27019256
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.3528	1.4858146740737e-08	27009433	27019256	9.1337118328116e-74	27039222	27039222
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.5263	9.1337118328116e-74	27039222	27039222	7.54807719253054e-10	27137064	27163598
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.4577	7.54807719253054e-10	27137064	27163598	2.59347208759373e-11	27172283	27176933
MSK_252152915467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-4e-04	2.59347208759373e-11	27172283	27176933	NA	NA	NA
