Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1586915	201	189	0.0508	NA	NA	NA	1.47019224676282e-05	1542528	1591444
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1590466	1654026	12	11	0.4855	1.47019224676282e-05	1542528	1591444	1.73781439012472e-08	1637771	1679144
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	16838573	5575	5284	0.0202	1.73781439012472e-08	1637771	1679144	2.84089023958754e-12	16814050	16961001
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17148592	20	20	-0.3915	2.84089023958754e-12	16814050	16961001	2.59098927249220e-12	17107476	17158730
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	24391166	3026	2903	0.0134	2.5909892724922e-12	17107476	17158730	1.61662122865673e-08	24389046	24391166
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-1.0545	1.61662122865673e-08	24389046	24391166	1.32647779134860e-08	24395691	24395691
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	34869589	4058	3838	0.031	1.3264777913486e-08	24395691	24395691	0	34869589	34869589
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-5.5383	0	34869589	34869589	0	34883375	34883375
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14260	0.004	0	34883375	34883375	1.60949718212299e-100	72537426	72537426
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	1.4322	1.60949718212299e-100	72537426	72537426	8.87892824691172e-106	72579311	72579311
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103899771	10103	9604	-0.0013	8.87892824691172e-106	72579311	72579311	1.31078116684044e-12	103895306	103901454
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103901454	103962495	17	15	0.4526	1.31078116684044e-12	103895306	103901454	8.80473639033896e-13	103956767	104112034
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110023268	1583	1511	-0.0017	8.80473639033896e-13	103956767	104112034	2.72317075013301e-14	110015739	110023268
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.9294	2.72317075013301e-14	110015739	110023268	2.75126090906664e-13	110041712	110058441
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147352661	4565	4340	-0.0086	2.75126090906664e-13	110041712	110058441	1.06672491702355e-08	147308557	147414355
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147357754	147510532	26	25	0.2933	1.06672491702355e-08	147308557	147414355	1.54757448018719e-07	147460661	148119298
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150818222	1257	1203	0.0223	1.54757448018719e-07	147460661	148119298	3.10047771231582e-15	150816180	150818222
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.8238	3.10047771231582e-15	150816180	150818222	2.37937650947015e-27	150839754	150839754
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	2.37937650947015e-27	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150851439	5	4	-3.6138	NA	NA	NA	1.29243957506090e-248	150851439	150851439
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	74	-0.0221	1.2924395750609e-248	150851439	150851439	8.72260840018694e-13	151024118	151026228
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.757	8.72260840018694e-13	151024118	151026228	1.27222326927918e-08	151036435	151038091
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	167483267	6789	6488	0.0094	1.27222326927918e-08	151036435	151038091	4.32921018735696e-12	167479184	167493768
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.6295	4.32921018735696e-12	167479184	167493768	1.14526337268997e-12	167507882	167525669
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	167520743	1	0	NA	1.14526337268997e-12	167507882	167525669	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	200616638	11352	10815	0.0054	NA	NA	NA	1.14965093864526e-11	200596027	200623556
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200618814	200787319	32	29	-0.31	1.14965093864526e-11	200596027	200623556	8.22181162461882e-11	200696309	200806319
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16550	-0.0024	8.22181162461882e-11	200696309	200806319	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34551222	11523	10951	0.002	NA	NA	NA	3.10178698938881e-41	34543992	34552935
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34591681	18	18	0.7452	3.10178698938881e-41	34543992	34552935	1.18834395132935e-43	34589997	34595734
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37810001	1368	1308	-0.009	1.18834395132935e-43	34589997	34595734	1.01470739127966e-37	37803744	37815049
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	-0.6642	1.01470739127966e-37	37803744	37815049	1.16256748838568e-37	37848754	37858379
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5540	-0.0051	1.16256748838568e-37	37848754	37858379	6.67042273302695e-12	52588009	52600588
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	6.67042273302695e-12	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8559	NA	NA	NA	2.94707789269073e-12	52635695	52639605
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4335	1e-04	2.94707789269073e-12	52635695	52639605	7.93595332385816e-10	66357387	66357387
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.0895	7.93595332385816e-10	66357387	66357387	2.27896390238559e-09	66360747	66360747
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	20709	-5e-04	2.27896390238559e-09	66360747	66360747	1.05419492840401e-14	146562545	146571330
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	0.9491	1.05419492840401e-14	146562545	146571330	1.78178434616791e-15	146592775	146597405
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2090	0.002	1.78178434616791e-15	146592775	146597405	1.93646622065287e-51	154601442	154601442
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-2.4677	1.93646622065287e-51	154601442	154601442	2.28677082373932e-51	154606943	154606943
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	29112	-0.0056	2.28677082373932e-51	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	65160634	23510	22413	-0.0031	NA	NA	NA	4.22388718506989e-13	65155469	65160634
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65195223	3	3	-0.8817	4.22388718506989e-13	65155469	65160634	1.31363023241827e-10	65195223	65203788
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65203788	99891210	8670	8223	-0.0096	1.31363023241827e-10	65195223	65203788	4.29224620002545e-43	99891210	99891210
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.2547	4.29224620002545e-43	99891210	99891210	1.80851820658326e-41	99897201	99897201
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	129861428	10216	9692	-0.0049	1.80851820658326e-41	99897201	99897201	2.60952921291232e-33	129861428	129861428
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129885779	7	7	-1.0773	2.60952921291232e-33	129861428	129861428	2.90783518735602e-36	129885779	129885779
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129887890	133189686	1301	1235	0.0026	2.90783518735602e-36	129885779	129885779	2.00302159809880e-11	133189686	133189686
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.1463	2.0030215980988e-11	133189686	133189686	1.15911825492043e-10	133194685	133194685
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9326	0.0015	1.15911825492043e-10	133194685	133194685	2.05610479694789e-18	164005577	164012645
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	0.9411	2.05610479694789e-18	164005577	164012645	7.84870302952719e-19	164019640	164027724
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	192546280	9568	9101	-0.0056	7.84870302952719e-19	164019640	164027724	8.83038733785448e-09	192544305	192546280
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.7427	8.83038733785448e-09	192544305	192546280	9.71672455272915e-09	192552734	192554451
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199329592	2564	2444	0.0012	9.71672455272915e-09	192552734	192554451	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17497	-0.0024	NA	NA	NA	1.56389005531199e-20	68899247	69075140
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.5929	1.56389005531199e-20	68899247	69075140	3.31596947396539e-21	69163312	69656183
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	88752705	6585	6254	7e-04	3.31596947396539e-21	69163312	69656183	7.18119135978286e-10	88752705	88752705
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.0851	7.18119135978286e-10	88752705	88752705	7.15295526060823e-10	88756721	88756721
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	108281452	6384	6095	-5e-04	7.15295526060823e-10	88756721	88756721	4.28628547941106e-10	108279455	108281452
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108283417	108290095	3	3	-0.8956	4.28628547941106e-10	108279455	108281452	6.01628980418252e-10	108290095	108296216
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108296216	152093694	11981	11379	-0.0049	6.01628980418252e-10	108290095	108296216	1.72186731854964e-09	152092912	152093694
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152101303	152103171	3	3	-0.8763	1.72186731854964e-09	152092912	152093694	2.71265822137908e-09	152103171	152106790
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152106790	173660684	6430	6116	-0.0056	2.71265822137908e-09	152103171	152106790	1.56060823307021e-23	173660684	173660684
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.6585	1.56060823307021e-23	173660684	173660684	1.10638072735205e-24	173666072	173666072
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5046	-0.0101	1.10638072735205e-24	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2477	0.0028	NA	NA	NA	1.30301948634906e-20	8750027	8758735
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.91	1.30301948634906e-20	8750027	8758735	1.43388061565623e-20	8793975	8809384
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	36217605	7573	7215	-0.0116	1.43388061565623e-20	8793975	8809384	1.38283799174897e-09	36217605	36217605
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36220056	36226270	2	2	1.069	1.38283799174897e-09	36217605	36217605	4.24722265039041e-09	36226270	36226270
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36227691	140201609	29895	28465	-0.0016	4.24722265039041e-09	36226270	36226270	1.44691518932054e-13	140200229	140203440
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-0.6442	1.44691518932054e-13	140200229	140203440	1.08153960140824e-12	140215187	140221835
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150181399	3767	3583	-0.0109	1.08153960140824e-12	140215187	140221835	4.62981733123783e-24	150171154	150181399
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.906	4.62981733123783e-24	150171154	150181399	1.4605117973686e-23	150202601	150207307
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	150204134	1	0	NA	1.4605117973686e-23	150202601	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	180644810	9904	9400	0.0018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	204881	42	40	-0.0413	NA	NA	NA	2.15270425434112e-16	202063	211079
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	210326	240119	14	14	-0.5489	2.15270425434112e-16	202063	211079	0.000151177105893466	230588	252939
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	43	-0.8556	0.000151177105893466	230588	252939	2.55093987059255e-139	323898	327962
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29925302	10478	9984	-2e-04	2.55093987059255e-139	323898	327962	7.7093347197061e-11	29925302	29925302
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29927310	29930018	2	2	-1.1388	7.7093347197061e-11	29925302	29925302	1.16416336748090e-10	29930018	29930018
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29931329	31385778	601	567	0.0389	1.1641633674809e-10	29930018	29930018	4.72986390734792e-07	31383925	31385778
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31387708	1	0	NA	4.72986390734792e-07	31383925	31385778	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31389372	31390982	2	2	-0.9239	NA	NA	NA	3.40983163392856e-07	31390982	31393624
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	468	0.0515	3.40983163392856e-07	31390982	31393624	2.00727601350738e-89	32558677	32564884
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	7	-1.913	2.00727601350738e-89	32558677	32564884	8.1988216286331e-05	32595402	32600962
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32628420	5	5	-0.0561	8.1988216286331e-05	32595402	32600962	7.13202025483045e-19	32628420	32628420
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-2.439	7.13202025483045e-19	32628420	32628420	1.86591707494221e-24	32633691	32633691
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.1635	1.86591707494221e-24	32633691	32633691	1.46469459909489e-11	32713363	32721872
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.8515	1.46469459909489e-11	32713363	32721872	0.000233142902986038	32718991	32731072
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32762061	13	12	-0.3709	0.000233142902986038	32718991	32731072	1.75646639896484e-06	32734957	32778933
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	32766023	1	0	NA	1.75646639896484e-06	32734957	32778933	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	77490500	14398	13692	0.0055	NA	NA	NA	8.29075088023135e-233	77490500	77490500
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-4.2583	8.29075088023135e-233	77490500	77490500	1.28324769657597e-235	77509983	77509983
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	103841482	7054	6705	0.0024	1.28324769657597e-235	77509983	77509983	3.59317876396195e-19	103841482	103841482
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0725	3.59317876396195e-19	103841482	103841482	5.90201583642325e-20	103868154	103868154
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20100	-0.0063	5.90201583642325e-20	103868154	103868154	1.58869312879255e-16	165642393	165643653
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.9798	1.58869312879255e-16	165642393	165643653	2.59242308257834e-15	165650610	165650610
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1723	6e-04	2.59242308257834e-15	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	29635722	10379	9867	0.0013	NA	NA	NA	1.15802051434194e-15	29635722	29635722
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29641884	29652543	2	2	-1.0448	1.15802051434194e-15	29635722	29635722	2.58950428159680e-08	29652543	29652543
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29656586	64523575	9181	8724	-0.0032	2.5895042815968e-08	29652543	29652543	9.38718646473407e-09	64523575	64523575
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.0699	9.38718646473407e-09	64523575	64523575	4.28243812183871e-09	64532949	64532949
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	86771217	6576	6249	0.0068	4.28243812183871e-09	64532949	64532949	1.50271594066243e-15	86769476	86771217
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86785324	4	4	-0.9751	1.50271594066243e-15	86769476	86771217	3.65041717775415e-16	86785324	86785324
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	86789967	1	0	NA	3.65041717775415e-16	86785324	86785324	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86790013	94571538	2807	2659	-0.0029	NA	NA	NA	1.89671287810162e-06	94557048	94583472
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	94572680	94594679	14	14	0.3338	1.89671287810162e-06	94557048	94583472	3.2909010542553e-11	94581889	94619114
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	94600815	118611324	10299	9795	0.0045	3.2909010542553e-11	94581889	94619114	1.13484105545012e-15	118611324	118611324
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.1558	1.13484105545012e-15	118611324	118611324	7.29132333612626e-16	118620875	118620875
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6474	-0.0043	7.29132333612626e-16	118620875	118620875	5.63428501981022e-15	133426996	133436265
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	9	0.6475	5.63428501981022e-15	133426996	133436265	1.19403157170410e-14	133453811	133458252
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141410894	3698	3527	0.0107	1.1940315717041e-14	133453811	133458252	1.35243653596669e-08	141405145	141414719
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.4385	1.35243653596669e-08	141405145	141414719	9.71767104327857e-10	141435643	141449014
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142152205	294	278	-0.0305	9.71767104327857e-10	141435643	141449014	1.46948603230565e-06	142136345	142152205
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142167908	6	6	0.5115	1.46948603230565e-06	142136345	142152205	1.05443852794625e-05	142167908	142188727
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	144537923	864	819	0.0023	1.05443852794625e-05	142167908	142188727	1.81212221606716e-05	144499343	144546976
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144539303	144602038	24	22	0.2647	1.81212221606716e-05	144499343	144546976	8.00039436626061e-07	144592876	144632522
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144613896	147702365	1451	1386	-0.0105	8.00039436626061e-07	144592876	144632522	6.30636254525507e-18	147702365	147702365
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.4608	6.30636254525507e-18	147702365	147702365	3.53436447202374e-16	147707161	147707161
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4044	0.0038	3.53436447202374e-16	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	40892587	13574	12919	-0.0058	NA	NA	NA	1.14077215101615e-14	40892587	40892587
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.3429	1.14077215101615e-14	40892587	40892587	1.37324903100592e-14	40897469	40897469
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29473	-0.0017	1.37324903100592e-14	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5213	-0.0035	NA	NA	NA	5.15110695495476e-18	15802255	15802255
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.4315	5.15110695495476e-18	15802255	15802255	5.20612467933133e-17	15807123	15807123
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	39146895	7271	6903	0.0034	5.20612467933133e-17	15807123	15807123	2.71322861137086e-107	39146895	43445839
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	-2.9018	2.71322861137086e-107	39146895	43445839	1.83620217735761e-75	43530076	43599449
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	70926188	338	317	-0.0391	1.83620217735761e-75	43530076	43599449	5.8298177918967e-24	70926188	70926188
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.9058	5.8298177918967e-24	70926188	70926188	1.07123763676305e-31	70930528	70930528
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	85391432	4782	4554	-0.0112	1.07123763676305e-31	70930528	70930528	1.40480114767923e-09	85391432	85391432
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85393201	85394970	2	2	-1.0654	1.40480114767923e-09	85391432	85391432	5.84825404377494e-09	85394970	85394970
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85396763	85396763	1	0	NA	5.84825404377494e-09	85394970	85394970	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85398154	116124007	10683	10187	-0.0021	NA	NA	NA	1.14565098268848e-09	116124007	116124007
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1035	1.14565098268848e-09	116124007	116124007	5.50879518362967e-09	116130333	116130333
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7890	0.0031	5.50879518362967e-09	116130333	116130333	3.8454374068858e-13	137352394	137352394
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3265	3.8454374068858e-13	137352394	137352394	1.34432605009670e-10	137356880	137356880
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1040	0.0161	1.3443260500967e-10	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23352	-0.0038	NA	NA	NA	8.16795455601046e-35	77917893	77917893
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.6688	8.16795455601046e-35	77917893	77917893	3.37620146271552e-35	77928738	77928738
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7384	0.0036	3.37620146271552e-35	77928738	77928738	2.68472140482996e-09	100672415	100676022
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-0.8741	2.68472140482996e-09	100672415	100676022	2.1497137403471e-08	100686753	100686787
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	135285645	12448	11874	-0.0067	2.1497137403471e-08	100686753	100686787	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2045	0.0276	NA	NA	NA	6.98414128197578e-27	5738494	5741031
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6977	6.98414128197578e-27	5738494	5741031	3.68925971611239e-30	5765438	5766615
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	47478181	14019	13299	-0.0023	3.68925971611239e-30	5765438	5766615	5.83755955556694e-09	47478181	47478181
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47479580	47481502	2	2	-1.071	5.83755955556694e-09	47478181	47478181	2.13841909215526e-09	47481502	47481502
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47483358	55118214	731	697	0.0057	2.13841909215526e-09	47481502	47481502	1.74396312814922e-62	55114405	55127355
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	38	-0.6514	1.74396312814922e-62	55114405	55127355	4.46906781204516e-69	55205278	55219985
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4404	0.0218	4.46906781204516e-69	55205278	55219985	1.86330842703357e-62	66463477	66463477
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.7483	1.86330842703357e-62	66463477	66463477	1.79565883242667e-63	66469412	66469412
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	118342306	17620	16741	4e-04	1.79565883242667e-63	66469412	66469412	7.39745509815428e-12	118342306	118342306
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118347279	118348410	2	2	-1.221	7.39745509815428e-12	118342306	118342306	6.25991277798288e-12	118348410	118348410
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118350101	118350101	1	0	NA	6.25991277798288e-12	118348410	118348410	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118353262	134450318	6097	5796	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	873	0.0345	NA	NA	NA	1.19496187762516e-14	2106791	2109441
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2115933	1	0	NA	1.19496187762516e-14	2106791	2109441	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2117164	2127537	6	6	-0.7595	NA	NA	NA	4.86890582228406e-13	2127537	2128807
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	7894681	2322	2211	0.0057	4.86890582228406e-13	2127537	2128807	3.15467239521502e-07	7859302	7932799
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7896259	8015452	47	42	0.2259	3.15467239521502e-07	7859302	7932799	1.07454144223240e-07	7979868	8064657
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8018443	9523923	446	421	0.0022	1.0745414422324e-07	7979868	8064657	1.08590058966855e-17	9516067	9531133
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	10	0.6689	1.08590058966855e-17	9516067	9531133	1.05229313114186e-20	9573313	9590351
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	10404746	308	292	-0.0029	1.05229313114186e-20	9573313	9590351	5.14763574202011e-06	10402857	10404746
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10412559	10412579	2	2	0.7894	5.14763574202011e-06	10402857	10404746	1.14911763065796e-05	10412579	10417053
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10417053	10462211	21	19	0.0164	1.14911763065796e-05	10412579	10417053	1.00298371694014e-07	10459455	10462211
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10470425	4	4	-0.6728	1.00298371694014e-07	10459455	10462211	1.3363079693097e-98	10470425	10470425
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10477903	2	2	-3.8732	1.3363079693097e-98	10470425	10470425	7.17940521489369e-07	10477903	10477903
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10480460	10485848	4	4	-1.3193	7.17940521489369e-07	10477903	10477903	8.24133381171135e-24	10484956	10485848
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	226	0.0065	8.24133381171135e-24	10484956	10485848	2.17264001388775e-37	11116883	11116883
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.2075	2.17264001388775e-37	11116883	11116883	1.49659411375460e-42	11140421	11140421
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	96535653	27566	26139	0.0028	1.4965941137546e-42	11140421	11140421	8.5384393679744e-35	96535653	96535653
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	96541845	96586441	8	8	-1.0186	8.5384393679744e-35	96535653	96535653	4.63649084898353e-34	96586441	96586441
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	96590434	130694393	12605	11991	0.0056	4.63649084898353e-34	96586441	96586441	3.20766296347720e-14	130694393	130694393
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.349	3.2076629634772e-14	130694393	130694393	1.33891426361805e-13	130701040	130701040
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	609	0.0263	1.33891426361805e-13	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11605	-0.0061	NA	NA	NA	1.23417198439013e-22	49964838	49964838
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.6738	1.23417198439013e-22	49964838	49964838	8.24136790843517e-23	49971732	49971732
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1714	-0.0013	8.24136790843517e-23	49971732	49971732	3.63250012718933e-35	56646284	56650373
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	0.7746	3.63250012718933e-35	56646284	56650373	8.18949059263517e-39	56685341	56686863
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	71375082	3623	3433	-0.0079	8.18949059263517e-39	56685341	56686863	1.04408852723209e-47	71375082	71375082
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.3251	1.04408852723209e-47	71375082	71375082	5.80635386748524e-46	71377671	71377671
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	100690991	9415	8962	-0.0056	5.80635386748524e-46	71377671	71377671	3.18328044398435e-241	100690991	100690991
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.2591	3.18328044398435e-241	100690991	100690991	2.04923601167739e-232	100693892	100693892
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4355	-0.0244	2.04923601167739e-232	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.0111	NA	NA	NA	1.07822548007281e-05	18544772	19271102
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	52	-0.6514	1.07822548007281e-05	18544772	19271102	1.26912844612691e-94	19490630	19497023
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	69086125	17568	16707	0	1.26912844612691e-94	19490630	19497023	1.46287666205449e-10	69084841	69090571
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69097052	6	6	0.6614	1.46287666205449e-10	69084841	69090571	1.05663731163634e-10	69093444	69098569
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69098569	73071404	1786	1705	0.0028	1.05663731163634e-10	69093444	69098569	2.48605943754319e-12	73061942	73071404
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	2.48605943754319e-12	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73083141	3	3	0.9977	NA	NA	NA	4.20041060824081e-19	73083141	73083141
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73091980	73092112	3	3	0.1088	4.20041060824081e-19	73083141	73083141	4.69564495847396e-14	73092112	73092112
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73107419	4	4	-0.9401	4.69564495847396e-14	73092112	73092112	1.27810897311665e-13	73107419	73112029
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73112029	105597555	12211	11597	-4e-04	1.27810897311665e-13	73107419	73112029	0	105597555	105597555
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	10	-4.2823	0	105597555	105597555	2.69220369680475e-77	105630089	105632168
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105875924	53	50	-0.9162	2.69220369680475e-77	105630089	105632168	1.84354336344000e-109	105874293	105875924
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	167	-0.009	1.84354336344e-109	105874293	105875924	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	91	0.2484	NA	NA	NA	6.77714446704918e-10	19394203	19822150
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	57	0.5662	6.77714446704918e-10	19394203	19822150	9.51822199028083e-72	20065525	20310916
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32456500	3671	3469	0.0047	9.51822199028083e-72	20065525	20310916	5.27551962117154e-68	32454294	32514939
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.816	5.27551962117154e-68	32454294	32514939	3.50342067064644e-68	32583146	32664506
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	3.50342067064644e-68	32583146	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74115754	17612	16760	0.0013	NA	NA	NA	1.41351715182561e-15	74113558	74115754
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74127210	74133391	4	4	-0.9941	1.41351715182561e-15	74113558	74115754	6.20037224395857e-16	74133391	74133391
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	98232932	8939	8491	-0.0017	6.20037224395857e-16	74133391	74133391	9.46798842642092e-14	98228743	98232932
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.0664	9.46798842642092e-14	98228743	98232932	4.35225401249028e-14	98239454	98239454
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	606	0.0056	4.35225401249028e-14	98239454	98239454	1.49811941914997e-10	99632987	99632987
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.1327	1.49811941914997e-10	99632987	99632987	3.7150533087729e-11	99635701	99635701
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	263	4e-04	3.7150533087729e-11	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	955	0.0102	NA	NA	NA	1.82135532746712e-62	2600740	2638581
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-2.7792	1.82135532746712e-62	2600740	2638581	7.22938495555427e-90	2638643	2639798
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	31862577	9556	9073	0.015	7.22938495555427e-90	2638643	2639798	1.02087980256126e-19	31841022	32521360
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33647856	47	43	-0.3329	1.02087980256126e-19	31841022	32521360	3.45512430627588e-18	33525500	34058222
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	57201427	4289	4035	-0.0023	3.45512430627588e-18	33525500	34058222	1.92162998357116e-35	57201427	57201427
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57203733	57203733	1	0	NA	1.92162998357116e-35	57201427	57201427	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.1437	NA	NA	NA	3.27044729792245e-38	57206772	57206772
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3256	0.01	3.27044729792245e-38	57206772	57206772	3.38959299255366e-20	68693014	68693086
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68710277	1	0	NA	3.38959299255366e-20	68693014	68693086	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-0.7194	NA	NA	NA	5.63492463001764e-19	68753209	68838384
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2112	0.0066	5.63492463001764e-19	68753209	68838384	1.39101314742340e-25	75093957	75093957
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.7938	1.3910131474234e-25	75093957	75093957	6.43561826151395e-25	75100865	75100865
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	576	-0.0315	6.43561826151395e-25	75100865	75100865	8.39533720746083e-136	76925748	76933534
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76929598	1	0	NA	8.39533720746083e-136	76925748	76933534	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	6	-2.5945	NA	NA	NA	4.3247391198712e-148	76935880	76940218
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4299	-0.0097	4.3247391198712e-148	76935880	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	397	0.0494	NA	NA	NA	3.81642779664813e-16	1028979	1028979
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4928	3.81642779664813e-16	1028979	1028979	8.47543788166637e-17	1030766	1030766
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1031233	1	0	NA	8.47543788166637e-17	1030766	1030766	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1032051	36673853	13451	12737	0.0162	NA	NA	NA	7.39788391926301e-165	36673853	36673853
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.6332	7.39788391926301e-165	36673853	36673853	6.44167229632922e-164	36684619	36684619
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	74875257	14286	13559	0.0159	6.44167229632922e-164	36684619	36684619	2.83272397607328e-17	74870707	74880525
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74877854	74904114	15	15	0.5644	2.83272397607328e-17	74870707	74880525	6.85021098003573e-17	74900777	74907326
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1391	0.0026	6.85021098003573e-17	74900777	74907326	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10458	-0.0039	NA	NA	NA	8.54119684699854e-196	36509250	36509250
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-4.7235	8.54119684699854e-196	36509250	36509250	3.7729767131144e-189	36519728	36519728
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	54078204	5595	5302	-0.0121	3.7729767131144e-189	36519728	36519728	3.53940491818972e-12	54075623	54078204
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-0.8788	3.53940491818972e-12	54075623	54078204	7.32439909350936e-12	54087468	54089357
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	74431985	5752	5480	-0.0114	7.32439909350936e-12	54087468	54089357	3.23625145807389e-19	74424644	74437328
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74434101	74480375	17	14	0.5736	3.23625145807389e-19	74424644	74437328	3.91701320891491e-14	74471998	74487923
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74485730	76116026	612	588	-0.0024	3.91701320891491e-14	74471998	74487923	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1446	0.04	NA	NA	NA	7.33729898397841e-06	3588389	3591120
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-0.9529	7.33729898397841e-06	3588389	3591120	9.26624246124394e-07	3593646	3599322
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	3596968	1	0	NA	9.26624246124394e-07	3593646	3599322	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3599322	5582564	922	880	0.063	NA	NA	NA	2.55903336730821e-09	5582564	5582564
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	5585152	5586328	2	2	-1.1221	2.55903336730821e-09	5582564	5582564	1.62373636987756e-09	5586328	5586328
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	5589641	58208527	18004	17136	0.0422	1.62373636987756e-09	5586328	5586328	1.00838325503393e-07	58196296	58214720
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.3734	1.00838325503393e-07	58196296	58214720	5.64944824780692e-07	58232649	58254174
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	63788698	2579	2448	0.0369	5.64944824780692e-07	58232649	58254174	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	552	0.0095	NA	NA	NA	1.50025018286353e-205	1506379	1511632
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-3.0074	1.50025018286353e-205	1506379	1511632	8.53919032182948e-293	1528899	1531162
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62382266	20983	19990	6e-04	8.53919032182948e-293	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62419534	62419534	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12808	-0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	37621766	10742	10216	0.0151	NA	NA	NA	1.18931982686847e-37	37621766	37621766
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.2393	1.18931982686847e-37	37621766	37621766	2.15655771492237e-36	37626069	37626069
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5529	0.0213	2.15655771492237e-36	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	159991	54	48	-0.1557	NA	NA	NA	5.1790820353751e-20	158967	163792
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	162802	249646	52	50	0.4184	5.1790820353751e-20	158967	163792	2.04089467506284e-17	239304	253249
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	249955	1427392	681	650	0.0845	2.04089467506284e-17	239304	253249	2.08285752566828e-13	1427338	1431240
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9014	2.08285752566828e-13	1427338	1431240	1.80677967572033e-13	1432891	1432953
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2301365	608	576	0.0612	1.80677967572033e-13	1432891	1432953	1.88103777005423e-05	2299188	2301365
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.615	1.88103777005423e-05	2299188	2301365	9.26609269221106e-07	2304398	2307282
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	345	0.019	9.26609269221106e-07	2304398	2307282	4.32121864177154e-06	2667362	2673365
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2695630	13	13	-0.3322	4.32121864177154e-06	2667362	2673365	0.0195683062833682	2693493	2705374
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695951	2708291	14	13	-0.0109	0.0195683062833682	2693493	2705374	7.27747087408991e-41	2708113	2711273
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	29254995	9914	9462	0.9308	7.27747087408991e-41	2708113	2711273	3.81129829741790e-10	29254995	29254995
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29256321	29258329	2	2	2.0755	3.8112982974179e-10	29254995	29254995	5.95227855509917e-08	29258329	29258329
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29259654	148437616	32959	31336	0.9546	5.95227855509917e-08	29258329	29258329	6.25476378767225e-11	148431291	148437616
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148452844	148461889	4	4	0.0407	6.25476378767225e-11	148431291	148437616	8.78469747093277e-14	148461889	148491866
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148491866	148653616	47	44	0.9237	8.78469747093277e-14	148461889	148491866	1.37361123225698e-22	148653435	148694272
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148694251	148835531	25	25	1.5341	1.37361123225698e-22	148653435	148694272	2.9643790035924e-26	148775065	148856194
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148850158	154038318	2050	1943	0.9273	2.9643790035924e-26	148775065	148856194	1.49418248095258e-18	154037006	154044828
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.6965	1.49418248095258e-18	154037006	154044828	3.11164525629897e-20	154078401	154079002
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	113	0.9838	3.11164525629897e-20	154078401	154079002	9.27182156415704e-289	154582414	154582414
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0149	9.27182156415704e-289	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	115	-4.5483	NA	NA	NA	6.1881188455861e-53	3223585	3772482
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	6.1881188455861e-53	3223585	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.1742	NA	NA	NA	3.02279577852576e-22	5422507	6652845
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	163	-4.0465	3.02279577852576e-22	5422507	6652845	3.69115875819794e-05	7016814	7221322
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7313003	83	78	-3.2571	3.69115875819794e-05	7016814	7221322	0.0367175126234526	7210018	7320755
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7320048	7344413	12	12	-4.4672	0.0367175126234526	7210018	7320755	0.00368718154218367	7338262	7368837
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7346510	7485594	31	30	-3.4662	0.00368718154218367	7338262	7368837	0.000161849411925378	7418921	7568006
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7606496	14	12	-4.6645	0.000161849411925378	7418921	7568006	7.14441412151743e-06	7606496	7614571
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7645258	14	14	-2.8593	7.14441412151743e-06	7606496	7614571	7.44104546448905e-12	7631265	7647060
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7707621	38	34	-4.6038	7.44104546448905e-12	7631265	7647060	1.14714788209836e-07	7703962	7726921
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7708716	7914104	69	64	-3.4635	1.14714788209836e-07	7703962	7726921	5.93528941117794e-05	7821580	8096693
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	359	-4.0882	5.93528941117794e-05	7821580	8096693	1.10919730498077e-39	10512616	10515697
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	14	-0.7638	1.10919730498077e-39	10512616	10515697	3.13795811467101e-13	11660512	12502304
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12960717	131	122	-3.5733	3.13795811467101e-13	11660512	12502304	2.14522221327394e-06	12905395	12970269
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12963078	13040293	36	36	-2.2846	2.14522221327394e-06	12905395	12970269	0.000109709431189369	13026029	13048283
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13066849	13	11	-3.7501	0.000109709431189369	13026029	13048283	1.99154475323258e-07	13061201	13066849
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13080405	4	4	-1.4669	1.99154475323258e-07	13061201	13066849	0.000304540763729467	13080405	13089124
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13081856	13104920	9	9	-3.6629	0.000304540763729467	13080405	13089124	0.000167683871426161	13090512	13109337
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.6784	0.000167683871426161	13090512	13109337	2.10388125524903e-12	13119344	13133803
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13129843	1	0	NA	2.10388125524903e-12	13119344	13133803	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13256555	42	42	-3.8217	NA	NA	NA	0.000561635398224555	13167862	13339008
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13573345	154	150	-4.3681	0.000561635398224555	13167862	13339008	2.35099988188017e-05	13553112	13594931
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13580493	13716000	23	19	-3.5032	2.35099988188017e-05	13553112	13594931	2.21233593626643e-05	13691319	13773971
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13716331	1	0	NA	2.21233593626643e-05	13691319	13773971	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	14122129	157	150	-4.4294	NA	NA	NA	2.29375254659206e-07	14122036	14122129
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.8079	2.29375254659206e-07	14122036	14122129	7.51217723804365e-08	14143748	14169526
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14318786	14	14	-4.2478	7.51217723804365e-08	14143748	14169526	0.000158815248773145	14244120	14320016
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14320016	14342834	14	14	-5.1041	0.000158815248773145	14244120	14320016	5.9460800907694e-06	14342834	14359748
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	94	-3.7183	5.9460800907694e-06	14342834	14359748	5.01976265205194e-08	14503927	14530328
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-1.7304	5.01976265205194e-08	14503927	14530328	0.00099536083106198	14538156	14555872
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14598838	19	19	-3.6565	0.00099536083106198	14538156	14555872	0.00296354860929955	14579298	14598838
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-1.3718	0.00296354860929955	14579298	14598838	1.27488734549621e-06	14644293	14685149
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15208612	143	137	-4.2029	1.27488734549621e-06	14644293	14685149	1.8324497676148e-06	15203221	15220050
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	9	-2.3093	1.8324497676148e-06	15203221	15220050	4.59650807204458e-12	15228303	15245772
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	118	-4.4517	4.59650807204458e-12	15228303	15245772	3.50171890924876e-08	15427777	15433122
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	5	-2.1419	3.50171890924876e-08	15427777	15433122	4.86605554912043e-06	15447091	15452656
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-4.2402	4.86605554912043e-06	15447091	15452656	3.73258851193265e-08	15518749	15525955
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15541293	10	9	-2.2612	3.73258851193265e-08	15518749	15525955	4.19720627224829e-05	15538983	15547576
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15542314	15564959	17	16	-4.0013	4.19720627224829e-05	15538983	15547576	0.00333450614434437	15553682	15564959
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15566377	15583573	6	6	-2.5264	0.00333450614434437	15553682	15564959	1.98587531277753e-10	15583573	15585797
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15761232	31	28	-4.5565	1.98587531277753e-10	15583573	15585797	0.00443699596316494	15690301	15798021
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15765251	15838612	14	14	-3.7	0.00443699596316494	15690301	15798021	1.22830857325923e-08	15821860	15838612
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15843146	15843146	1	0	NA	1.22830857325923e-08	15821860	15838612	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15848986	15915466	10	10	-5.2852	NA	NA	NA	1.25485241911827e-16	15915466	15928904
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15953710	10	10	-2.6533	1.25485241911827e-16	15915466	15928904	0.00819921779713672	15943877	15977755
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15955821	16033774	32	31	-3.7223	0.00819921779713672	15943877	15977755	0.268745157722255	15958396	16033774
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16035717	16035717	1	0	NA	0.268745157722255	15958396	16033774	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16040789	4	4	-2.8084	NA	NA	NA	9.41699127068572e-19	16040789	16040789
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16042014	16042966	2	2	-0.8039	9.41699127068572e-19	16040789	16040789	1.34817692454406e-05	16042966	16043782
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	19610243	490	457	-4.2458	1.34817692454406e-05	16042966	16043782	1.36522727860540e-06	19608039	19610243
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.5236	1.3652272786054e-06	19608039	19610243	9.37704526606253e-07	19613864	19614809
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036411	291	273	-4.2138	9.37704526606253e-07	19613864	19614809	2.20467268154874e-06	21025500	21043581
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.2511	2.20467268154874e-06	21025500	21043581	4.97095705212207e-05	21041164	21057446
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	4.97095705212207e-05	21041164	21057446	NA	NA	NA
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	21082654	13	12	-4.2523	NA	NA	NA	5.22760260122358e-07	21080223	21082654
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21086044	21089645	4	4	-2.3987	5.22760260122358e-07	21080223	21082654	2.93417001599293e-05	21089645	21095508
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21091160	21432593	105	100	-4.3582	2.93417001599293e-05	21089645	21095508	2.7474070381093e-07	21401605	21444509
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21433459	21559551	21	19	-3.1847	2.7474070381093e-07	21401605	21444509	1.89287443058515e-05	21477616	21657525
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22139807	117	104	-4.1913	1.89287443058515e-05	21477616	21657525	7.79753982907598e-18	22058759	22139807
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.7946	7.79753982907598e-18	22058759	22139807	9.20246846064916e-16	22177335	22178964
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	86	-4.2699	9.20246846064916e-16	22177335	22178964	6.05871393917693e-70	23283689	26870361
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-1.1651	6.05871393917693e-70	23283689	26870361	4.08138756444891e-07	26945084	26995399
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-3.0063	4.08138756444891e-07	26945084	26995399	5.49022863025569e-08	27009433	27064654
MSK_252152915468_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.7604	5.49022863025569e-08	27009433	27064654	NA	NA	NA
