Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26757	0.0096	NA	NA	NA	1.76380062670569e-214	72537426	72539143
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	7	-3.828	1.76380062670569e-214	72537426	72539143	3.04594606449841e-231	72571158	72574479
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	3.04594606449841e-231	72571158	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	146294654	16260	15590	9e-04	NA	NA	NA	5.06607565756203e-16	146273223	147315217
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147847659	40	37	-0.4478	5.06607565756203e-16	146273223	147315217	8.4475086153016e-16	147460661	148119298
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150819879	1256	1193	0.0069	8.4475086153016e-16	147460661	148119298	6.21708457435271e-46	150819879	150819879
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.3324	6.21708457435271e-46	150819879	150819879	1.13816448158644e-48	150852858	150852858
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151020826	74	71	-0.0501	1.13816448158644e-48	150852858	150852858	2.62562444869398e-08	151017439	151020826
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151022179	151036435	7	7	0.6435	2.62562444869398e-08	151017439	151020826	2.08392325654872e-05	151036435	151045965
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2562	0.0169	2.08392325654872e-05	151036435	151045965	6.8161165318343e-60	157133150	157133150
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.7236	6.8161165318343e-60	157133150	157133150	4.02932666475153e-64	157136342	157136342
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10876	-0.0067	4.02932666475153e-64	157136342	157136342	6.60081952348956e-21	185979586	185979586
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.1577	6.60081952348956e-21	185979586	185979586	1.45529957573093e-20	185988138	185988138
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200596027	4135	3978	0.0066	1.45529957573093e-20	185988138	185988138	1.54232526046532e-09	200582647	200616638
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200672373	28	27	-0.4008	1.54232526046532e-09	200582647	200616638	7.62980873147134e-09	200654700	200696309
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	234961557	12742	12275	8e-04	7.62980873147134e-09	200654700	200696309	8.90204496884816e-09	234959775	234961557
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	234964701	234969561	4	4	-1.0379	8.90204496884816e-09	234959775	234961557	2.48422425170033e-09	234969561	234973127
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	234973127	247186514	4674	4513	-0.0068	2.48422425170033e-09	234969561	234973127	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	52600588	18732	18010	1e-04	NA	NA	NA	1.68627494983278e-246	52600588	52600588
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.68627494983278e-246	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-5.2193	NA	NA	NA	1.46304866430006e-251	52635695	52635695
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25249	7e-04	1.46304866430006e-251	52635695	52635695	1.54944496039125e-269	146571330	146571330
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.4013	1.54944496039125e-269	146571330	146571330	1.22556135927075e-268	146592775	146592775
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31486	-0.0031	1.22556135927075e-268	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	89475107	30641	29411	4e-04	NA	NA	NA	3.98319119488576e-27	89473678	89475107
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89502757	14	14	-0.9303	3.98319119488576e-27	89473678	89475107	4.5700583240003e-27	89502757	89504141
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	164005577	22836	21964	-0.001	4.5700583240003e-27	89502757	89504141	1.80488901280521e-24	164005577	164005577
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.4798	1.80488901280521e-24	164005577	164005577	3.24760012354559e-25	164027724	164027724
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	196822133	11152	10722	-0.0016	3.24760012354559e-25	164027724	164027724	5.48460785693584e-20	196809098	196911010
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	28	-0.562	5.48460785693584e-20	196809098	196911010	5.18715510344998e-17	196946355	196969782
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	908	0.006	5.18715510344998e-17	196946355	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	682752	213	204	-0.0342	NA	NA	NA	3.73724648671519e-10	682752	682752
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	3.73724648671519e-10	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.4131	NA	NA	NA	1.8103008531564e-08	691065	691065
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	68899247	18214	17449	0	1.8103008531564e-08	691065	691065	1.38467875845816e-11	68893816	69069651
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68901210	69165814	16	16	0.5771	1.38467875845816e-11	68893816	69069651	5.70299618518644e-12	69144974	69677857
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	30180	-0.0032	5.70299618518644e-12	69144974	69677857	2.16815508172152e-30	173660684	173660684
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.5552	2.16815508172152e-30	173660684	173660684	2.63324709299142e-31	173666072	173666072
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5099	0.0038	2.63324709299142e-31	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2493	0.0068	NA	NA	NA	1.90135001268095e-11	8734494	8750027
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.9306	1.90135001268095e-11	8734494	8750027	1.16607516118722e-11	8800001	8809384
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	112290534	28602	27492	-0.0035	1.16607516118722e-11	8800001	8809384	1.09976920598642e-10	112286235	112290534
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112292424	112304734	5	5	-0.9793	1.09976920598642e-10	112286235	112290534	2.54930949811488e-10	112304734	112312110
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112312110	150181399	12638	12103	-1e-04	2.54930949811488e-10	112304734	112312110	6.80416548218817e-15	150171154	150181399
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.9836	6.80416548218817e-15	150171154	150181399	1.30011578405877e-14	150202601	150207307
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	150204134	1	0	NA	1.30011578405877e-14	150202601	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	180644810	9904	9545	0.0046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29995247	10597	10175	0.0052	NA	NA	NA	5.1769519175476e-11	29992946	29995247
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	30005338	4	4	-1.1105	5.1769519175476e-11	29992946	29995247	9.92428387304337e-10	30005338	30010234
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	32558677	1076	1042	0.022	9.92428387304337e-10	30005338	30010234	2.21594569417628e-117	32558677	32595402
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	2.21594569417628e-117	32558677	32595402	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32633691	16	14	-2.273	NA	NA	NA	2.79581026939956e-12	32613538	32633691
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.1045	2.79581026939956e-12	32613538	32633691	1.47200943135788e-10	32711957	32720656
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-1.7686	1.47200943135788e-10	32711957	32720656	1.87989925687692e-54	32723366	32728487
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7922	0.0059	1.87989925687692e-54	32723366	32728487	4.06168807354125e-131	54035000	54035000
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.4527	4.06168807354125e-131	54035000	54035000	1.17754364523936e-142	54042734	54042734
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	100582030	12280	11824	-6e-04	1.17754364523936e-142	54042734	54042734	5.53250443564753e-09	100580274	100582030
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100587654	100587654	1	0	NA	5.53250443564753e-09	100580274	100582030	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100590623	100599668	3	3	-1.1613	NA	NA	NA	5.44095175590864e-11	100599668	100601391
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100601391	102036719	432	410	0.0147	5.44095175590864e-11	100599668	100601391	3.72530786782266e-13	102036719	102036719
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102039635	102039635	1	0	NA	3.72530786782266e-13	102036719	102036719	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.268	NA	NA	NA	1.00375773896264e-12	102044331	102044331
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	102046884	1	0	NA	1.00375773896264e-12	102044331	102044331	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102048787	103841482	486	469	0.0063	NA	NA	NA	1.87174476670033e-205	103841482	103841482
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.4295	1.87174476670033e-205	103841482	103841482	2.85484207018327e-190	103868154	103868154
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	122286154	5891	5662	-0.0017	2.85484207018327e-190	103868154	103868154	9.79870406863478e-08	122281226	122286154
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122289187	122315252	5	5	-0.8306	9.79870406863478e-08	122281226	122286154	3.34324179796253e-07	122315252	122321176
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122321176	165643653	15210	14645	-0.0061	3.34324179796253e-07	122315252	122321176	1.16209156723187e-117	165643653	165643653
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-4.0953	1.16209156723187e-117	165643653	165643653	9.6662431412769e-106	165649379	165649379
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	9.6662431412769e-106	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1743	-0.0153	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109217320	34961	33629	0.0017	NA	NA	NA	7.86010673169137e-193	109217320	109217320
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.3259	7.86010673169137e-193	109217320	109217320	8.3282092493627e-196	109233214	109233214
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	125831554	7474	7189	-0.0075	8.3282092493627e-196	109233214	109233214	4.53349095292426e-106	125831554	125831554
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.917	4.53349095292426e-106	125831554	125831554	2.29626515910771e-101	125837524	125837524
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7046	0.007	2.29626515910771e-101	125837524	125837524	6.57501794815983e-08	141402937	141419692
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5542	6.57501794815983e-08	141402937	141419692	2.47918420798949e-06	141431668	141452085
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	112	0.0205	2.47918420798949e-06	141431668	141452085	5.00345501561316e-24	141689547	141690753
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.171	5.00345501561316e-24	141689547	141690753	1.94916092078703e-28	141714168	141720303
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6481	-0.0043	1.94916092078703e-28	141714168	141720303	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	0.0247	NA	NA	NA	6.01570499060249e-08	579405	581533
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.4159	6.01570499060249e-08	579405	581533	2.97288255960429e-07	588865	591112
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	591	0.0125	2.97288255960429e-07	588865	591112	2.4934091611203e-06	2231804	2234351
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	3	-1.0601	2.4934091611203e-06	2231804	2234351	6.95325800575032e-07	2251011	2257255
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25017905	7387	7110	-0.0016	6.95325800575032e-07	2251011	2257255	8.25272234681351e-08	25013753	25017905
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25022606	25022606	1	0	NA	8.25272234681351e-08	25013753	25017905	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.12	NA	NA	NA	3.07827198572545e-08	25039370	25047250
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39341524	4940	4736	0.0011	3.07827198572545e-08	25039370	25047250	2.46974274493225e-112	39339800	39345557
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39505256	61	61	0.8921	2.46974274493225e-112	39339800	39345557	1.24529560348271e-111	39504332	39508035
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30149	0.0014	1.24529560348271e-111	39504332	39508035	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5231	-0.0042	NA	NA	NA	1.24442547236396e-10	15802255	15802255
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.5108	1.24442547236396e-10	15802255	15802255	3.61223591742129e-10	15807123	15813356
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2286	-0.0017	3.61223591742129e-10	15807123	15813356	1.31645666155166e-21	22477358	22477358
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.1962	1.31645666155166e-21	22477358	22477358	2.372257299736e-22	22492603	22492603
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5003	0.0044	2.372257299736e-22	22492603	22492603	5.07850732567902e-98	70926188	70926188
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.5351	5.07850732567902e-98	70926188	70926188	4.04533089642757e-93	70930528	70930528
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9549	-0.0093	4.04533089642757e-93	70930528	70930528	5.13536611327752e-20	100348045	100348045
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.14	5.13536611327752e-20	100348045	100348045	2.28379421054986e-18	100350814	100350814
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	140145683	14949	14337	-0.0052	2.28379421054986e-18	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	67898770	20316	19545	-0.0019	NA	NA	NA	9.43272976696566e-92	67894066	67902637
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67902637	68029441	57	55	-0.8653	9.43272976696566e-92	67894066	67902637	3.55562739478591e-93	68028901	68032304
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68032304	69834520	769	735	0.0119	3.55562739478591e-93	68028901	68032304	5.74454389891726e-07	69831673	69837432
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69835856	69841183	4	4	0.8922	5.74454389891726e-07	69831673	69837432	2.81893172768605e-06	69837432	69843195
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	77917893	3446	3290	0.002	2.81893172768605e-06	69837432	69843195	2.0232831773961e-67	77917893	77917893
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.9629	2.0232831773961e-67	77917893	77917893	1.98322330029175e-68	77928669	77928669
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	100676022	7763	7464	0.0052	1.98322330029175e-68	77928669	77928669	4.33079278332413e-76	100676022	100676022
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-3.4127	4.33079278332413e-76	100676022	100676022	3.16103051199635e-75	100686753	100686753
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	114100979	4627	4464	0.0102	3.16103051199635e-75	100686753	100686753	8.94489906813955e-12	114100979	114100979
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-1.6851	8.94489906813955e-12	114100979	114100979	2.60405701531067e-11	114106460	114106460
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7531	-0.0124	2.60405701531067e-11	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4536833	1597	1527	7e-04	NA	NA	NA	1.02801886113538e-06	4528133	4536833
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4543246	4547977	4	4	-0.9955	1.02801886113538e-06	4528133	4536833	4.06844656792828e-07	4547977	4549687
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4549687	5741031	537	524	-0.0127	4.06844656792828e-07	4547977	4549687	4.80581259793098e-13	5732077	5741031
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.7193	4.80581259793098e-13	5732077	5741031	2.03279747687484e-15	5763749	5766615
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	66463477	19430	18680	0.0054	2.03279747687484e-15	5763749	5766615	1.46928585452930e-24	66463477	66463477
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.3901	1.4692858545293e-24	66463477	66463477	2.26274445866659e-25	66469412	66469412
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22847	-2e-04	2.26274445866659e-25	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	31171313	11157	10693	0.0037	NA	NA	NA	6.6030028453688e-11	31074520	31205252
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31173065	31298659	41	38	0.3701	6.6030028453688e-11	31074520	31205252	1.79188341566853e-10	31279843	31316202
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	130694393	33317	31949	0.0048	1.79188341566853e-10	31279843	31316202	5.42473751328711e-08	130690343	130694393
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.4153	5.42473751328711e-08	130690343	130694393	1.02060505870035e-11	130701040	130701040
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	85	-0.0868	1.02060505870035e-11	130701040	130701040	8.07369592724576e-17	130943064	130943064
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.7717	8.07369592724576e-17	130943064	130943064	1.50511113545069e-11	130946248	130946248
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	525	0.0028	1.50511113545069e-11	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7038	-0.0058	NA	NA	NA	7.79468157126506e-106	37953582	37953582
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.8551	7.79468157126506e-106	37953582	37953582	1.67245489403222e-114	37957844	37957844
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	51294959	5467	5241	-0.001	1.67245489403222e-114	37957844	37957844	3.45587680008469e-09	51293672	51294959
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51296396	51296396	1	0	NA	3.45587680008469e-09	51293672	51294959	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.1596	NA	NA	NA	1.67459184003785e-08	51300398	51301682
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56650373	1214	1160	0.0059	1.67459184003785e-08	51300398	51301682	1.46289416935298e-20	56610886	56650373
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.8073	1.46289416935298e-20	56610886	56650373	1.01448625450156e-23	56686863	56693033
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	89659397	8252	7928	-0.0033	1.01448625450156e-23	56686863	56693033	2.31157847161305e-110	89659397	89659397
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.7321	2.31157847161305e-110	89659397	89659397	8.86252496413524e-104	89662326	89662326
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	8962	-0.0073	8.86252496413524e-104	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7342	0.0061	NA	NA	NA	6.96853756032911e-10	40663660	40676611
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.7924	6.96853756032911e-10	40663660	40676611	7.54711189178327e-09	40722360	40741934
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	105856972	24049	23038	0.0018	7.54711189178327e-09	40722360	40741934	7.76717333068247e-12	105856972	105856972
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.3837	7.76717333068247e-12	105856972	105856972	1.44297724879557e-10	105875924	105881677
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	175	0.0037	1.44297724879557e-10	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18818949	10	10	0.1673	NA	NA	NA	0.00616981552848279	18692865	19153319
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18824622	19537035	89	86	0.5052	0.00616981552848279	18692865	19153319	2.22297535934694e-30	19421704	19819961
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20742444	204	196	0.0062	2.22297535934694e-30	19421704	19819961	5.89536854467015e-07	20731330	20742444
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20760283	21218234	5	5	-0.8505	5.89536854467015e-07	20731330	20742444	3.61210403763036e-07	21218234	21240867
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21236096	43411504	7960	7635	-0.0014	3.61210403763036e-07	21218234	21240867	1.45397309048143e-08	43411504	43411504
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43412692	43412692	1	0	NA	1.45397309048143e-08	43411504	43411504	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43414130	43416144	2	2	-1.4581	NA	NA	NA	9.03785846199963e-09	43416144	43416144
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43417842	63311952	8464	8173	-0.0061	9.03785846199963e-09	43416144	43416144	9.06890247857756e-21	63309082	63313397
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63313397	63335588	11	11	-0.9393	9.06890247857756e-21	63309082	63313397	6.22417662167507e-20	63334135	63338114
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63338114	74669752	4965	4764	0.0087	6.22417662167507e-20	63334135	63338114	2.91371401171038e-111	74669752	74669752
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.665	2.91371401171038e-111	74669752	74669752	3.18791134742211e-116	74680439	74680439
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	98232932	8693	8342	2e-04	3.18791134742211e-116	74680439	74680439	5.18044915058274e-08	98228743	98232932
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1535	5.18044915058274e-08	98228743	98232932	1.12991623818682e-08	98239454	98243586
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	615	-0.0304	1.12991623818682e-08	98239454	98243586	1.38244607017349e-11	99632987	99632987
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.6377	1.38244607017349e-11	99632987	99632987	3.07058896719629e-10	99635701	99635701
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	259	0.017	3.07058896719629e-10	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	450	0.0347	NA	NA	NA	3.8957528752088e-07	1296506	1296767
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.5139	3.8957528752088e-07	1296506	1296767	1.52483621310933e-07	1300341	1302875
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	5286122	1601	1544	0.0116	1.52483621310933e-07	1300341	1302875	8.9733519057027e-06	5241884	5286122
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5288723	5299409	3	3	1.0924	8.9733519057027e-06	5241884	5286122	9.76100502500382e-07	5299409	5302102
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5302102	68710277	16221	15598	0.0085	9.76100502500382e-07	5299409	5302102	1.56864663151833e-09	68687301	68710277
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-0.7235	1.56864663151833e-09	68687301	68710277	1.27102028537573e-09	68751390	68844016
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2127	-0.0041	1.27102028537573e-09	68751390	68844016	1.82722123439401e-20	75093957	75093957
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.786	1.82722123439401e-20	75093957	75093957	4.52020145573394e-22	75100865	75100865
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	580	-0.0084	4.52020145573394e-22	75100865	75100865	1.46235164764653e-19	76923844	76925748
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0336	1.46235164764653e-19	76923844	76925748	1.72977929456659e-15	76940218	76942679
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4334	-0.0047	1.72977929456659e-15	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	404	0.0219	NA	NA	NA	2.60098053889708e-19	1028979	1028979
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.1486	2.60098053889708e-19	1028979	1028979	3.38480488933523e-18	1030766	1030766
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	12916	0.0105	3.38480488933523e-18	1030766	1030766	6.1488938026058e-55	36673853	36673853
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	4	-2.5826	6.1488938026058e-55	36673853	36673853	1.79663339933896e-56	36684619	36684619
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1914	0.024	1.79663339933896e-56	36684619	36684619	1.84615792866738e-73	41518222	41526558
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41706870	64	61	-0.7429	1.84615792866738e-73	41518222	41526558	6.37730829951045e-71	41700762	41710400
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41708551	78653545	13681	13114	0.012	6.37730829951045e-71	41700762	41710400	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22098	-0.0045	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	469	0.0281	NA	NA	NA	5.61916576485351e-15	1398325	1398325
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.1101	5.61916576485351e-15	1398325	1398325	5.09393139299783e-15	1400840	1400840
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1797537	185	178	-0.0234	5.09393139299783e-15	1400840	1400840	1.57430412468432e-08	1797537	1797537
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1798246	1799778	2	2	1.5928	1.57430412468432e-08	1797537	1797537	5.00398219638487e-08	1799778	1799778
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1801091	11448975	4491	4297	0.0268	5.00398219638487e-08	1799778	1799778	4.19708924504597e-14	11448975	11448975
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.0727	4.19708924504597e-14	11448975	11448975	5.83317250520236e-16	11452390	11452390
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	56825794	14700	14107	0.0158	5.83317250520236e-16	11452390	11452390	2.35489068457307e-07	56822197	56825794
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56837593	6	6	-0.8131	2.35489068457307e-07	56822197	56825794	4.06539337484539e-07	56837593	56850433
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56840346	56840346	1	0	NA	4.06539337484539e-07	56837593	56850433	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3061	0.0092	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	557	0.007	NA	NA	NA	3.50430625316846e-18	1499421	1506379
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	1.0207	3.50430625316846e-18	1499421	1506379	4.99932525088637e-19	1532433	1544485
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20175	-0.0015	4.99932525088637e-19	1532433	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12926	-0.0044	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14866086	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15448186	35472378	9550	9182	0.0131	NA	NA	NA	5.44553998511657e-57	35472378	35472378
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.8092	5.44553998511657e-57	35472378	35472378	4.45320820656954e-52	35476942	35476942
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36868339	788	759	0.0335	4.45320820656954e-52	35476942	35476942	3.84809953182e-05	36865292	36868339
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36869386	36873883	3	3	-0.9845	3.84809953182e-05	36865292	36868339	1.20968260606450e-05	36873883	36876540
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36876540	37621766	397	382	0.0351	1.2096826060645e-05	36873883	36876540	1.82742021253901e-18	37621766	37621766
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.3088	1.82742021253901e-18	37621766	37621766	1.09171206083437e-20	37626069	37626069
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	41226643	1862	1792	0.0086	1.09171206083437e-20	37626069	37626069	8.51912697554243e-13	41213175	41248173
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41237593	41295673	15	15	-0.6575	8.51912697554243e-13	41213175	41248173	5.05880842162854e-11	41286119	41317438
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41310667	49571068	3936	3768	0.0097	5.05880842162854e-11	41286119	41317438	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2907	NA	NA	NA	2.36911364192193e-07	4926	95819
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.5399	2.36911364192193e-07	4926	95819	1.02143009414292e-05	108902	114905
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	1427392	771	739	0.0192	1.02143009414292e-05	108902	114905	1.09180139790563e-09	1427338	1431240
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1229	1.09180139790563e-09	1427338	1431240	6.31981278254223e-09	1432891	1434970
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	958	-0.0094	6.31981278254223e-09	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154023900	44996	43236	1.0041	0	2708113	2711273	7.00808262785216e-09	153950274	154025967
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154025967	154050185	9	9	1.3745	7.00808262785216e-09	153950274	154025967	3.99970857619325e-07	154050185	154054530
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154051619	154079002	8	7	1.8675	3.99970857619325e-07	154050185	154054530	9.36111488072641e-11	154079002	154086636
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	115	1.0157	9.36111488072641e-11	154079002	154086636	2.23794299255862e-152	154578922	154586690
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.0197	2.23794299255862e-152	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-4.3836	NA	NA	NA	1.21077985124712e-24	3034907	3772482
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.21077985124712e-24	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.1663	NA	NA	NA	7.31777619388476e-14	5531459	6688691
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	167	-4.0157	7.31777619388476e-14	5531459	6688691	7.09912210012703e-07	7009137	7205930
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	123	-3.0246	7.09912210012703e-07	7009137	7205930	1.24906236124415e-06	7352452	7605311
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7723783	77	74	-4.2258	1.24906236124415e-06	7352452	7605311	9.12525030475644e-06	7709619	7731490
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-2.4343	9.12525030475644e-06	7709619	7731490	5.5523064686724e-06	7756907	7806091
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-4.021	5.5523064686724e-06	7756907	7806091	4.11889093323705e-06	7895945	7905286
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.8915	4.11889093323705e-06	7895945	7905286	3.75138358911234e-06	7914104	7919636
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	368	-4.2112	3.75138358911234e-06	7914104	7919636	2.53125750392272e-33	10512616	10515697
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	13	-0.5994	2.53125750392272e-33	10512616	10515697	2.63069569764205e-09	10622062	12511461
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12999095	149	141	-3.2747	2.63069569764205e-09	10622062	12511461	4.50658803435594e-05	12970269	13008662
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	16	-1.4496	4.50658803435594e-05	12970269	13008662	0.0054681133427949	13024023	13066543
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13129843	36	34	-2.7608	0.0054681133427949	13024023	13066543	0.0143509060548921	13077621	13164641
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13259414	43	43	-3.6923	0.0143509060548921	13077621	13164641	0.000269006480313312	13159901	13329968
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13261173	14358464	372	349	-4.3656	0.000269006480313312	13159901	13329968	1.72340771743556e-09	14320016	14413754
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	88	-3.5835	1.72340771743556e-09	14320016	14413754	5.30174221514895e-06	14492454	14536962
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.30174221514895e-06	14492454	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-2.0347	NA	NA	NA	6.06525326768628e-14	14566592	14596156
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15523178	328	317	-4.0686	6.06525326768628e-14	14566592	14596156	0.00241764563888556	15434486	15548828
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15583573	33	31	-3.1477	0.00241764563888556	15434486	15548828	0.000441253472885179	15557173	15650200
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	54	-4.2899	0.000441253472885179	15557173	15650200	0.00147438030247803	15761232	15998663
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16194420	116	111	-3.4568	0.00147438030247803	15761232	15998663	7.69126142961829e-11	16158338	16279279
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	22930737	1086	1035	-4.2647	7.69126142961829e-11	16158338	16279279	7.36425059666064e-101	22924754	26870361
MSK_252152915469_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.4545	7.36425059666064e-101	22924754	26870361	NA	NA	NA
