Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	17102601	5800	5642	0.0048	NA	NA	NA	5.06464710934036e-06	17094475	17102601
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17104345	17112697	3	3	0.8537	5.06464710934036e-06	17094475	17102601	4.64927007616635e-07	17112697	17114337
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17114337	27857226	4486	4357	-0.0149	4.64927007616635e-07	17112697	17114337	1.20674055800961e-08	27857226	27857226
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27859402	27860520	2	2	1.1545	1.20674055800961e-08	27857226	27857226	1.56637962945981e-07	27860520	27862523
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27862523	30248583	887	866	0.0227	1.56637962945981e-07	27860520	27862523	2.95751610987766e-08	30235271	30248583
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	30254313	30261199	3	3	-0.9425	2.95751610987766e-08	30235271	30248583	1.02460299909112e-08	30261199	30269731
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	30269731	34869589	1713	1665	0.0067	1.02460299909112e-08	30261199	30269731	1.98809307358411e-10	34859068	34869589
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.8896	1.98809307358411e-10	34859068	34869589	3.65877661789599e-10	34883375	34884849
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	61680750	10690	10390	8e-04	3.65877661789599e-10	34883375	34884849	7.28330953813555e-279	61676139	61689404
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61683038	62512556	345	330	0.5035	7.28330953813555e-279	61676139	61689404	6.47071368390842e-247	62509271	62518362
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62513801	72537426	3961	3852	0.0249	6.47071368390842e-247	62509271	62518362	6.71375687065794e-258	72537426	72537426
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	8	-3.0177	6.71375687065794e-258	72537426	72537426	4.53566790432322e-262	72574479	72574479
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	4.53566790432322e-262	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	76015693	914	887	0.0112	NA	NA	NA	5.84814700896679e-38	76015277	76027648
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76024296	76119148	38	38	0.5443	5.84814700896679e-38	76015277	76027648	1.26219391800074e-35	76114480	76123386
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76120412	76120412	1	0	NA	1.26219391800074e-35	76114480	76123386	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76121971	110023268	10750	10441	0.0242	NA	NA	NA	4.72413791931376e-08	110015739	110023268
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.8844	4.72413791931376e-08	110015739	110023268	4.40577321310262e-08	110039388	110041712
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2146	0.0357	4.40577321310262e-08	110039388	110041712	2.98949670137302e-26	116029725	116029725
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.9827	2.98949670137302e-26	116029725	116029725	1.82774413163579e-28	116033402	116033402
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	147306304	2333	2270	0.0589	1.82774413163579e-28	116033402	116033402	7.7531452854438e-28	146294654	147313991
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	32	-0.4425	7.7531452854438e-28	146294654	147313991	2.52284919300922e-28	147490608	147847659
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1221	0.0741	2.52284919300922e-28	147490608	147847659	9.0403525559099e-15	150818222	150819879
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-0.9764	9.0403525559099e-15	150818222	150819879	1.65148503961544e-05	150839754	150841957
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	-3.2807	1.65148503961544e-05	150839754	150841957	0.0125108599011099	150844444	150846148
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	0.0125108599011099	150844444	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	150851439	2	2	-1.1536	NA	NA	NA	1.65406827127404e-11	150851439	150851439
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.0313	1.65406827127404e-11	150851439	150851439	1.21690856965274e-10	151026228	151026228
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	1.1694	1.21690856965274e-10	151026228	151026228	0	151032967	151032967
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	151036435	2	2	0.7783	0	151032967	151032967	0.00796673543372883	151036435	151044659
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	152402570	585	571	0.0717	0.00796673543372883	151036435	151044659	3.77313089556173e-10	152397692	152403840
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152403840	152419198	15	14	0.5664	3.77313089556173e-10	152397692	152403840	3.52137135282301e-10	152418537	152423668
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152420053	156619512	1851	1805	0.0674	3.52137135282301e-10	152418537	152423668	1.80871911297210e-07	156605238	156627707
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	156621698	156621698	1	0	NA	1.8087191129721e-07	156605238	156627707	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	156627707	156648051	10	10	-0.4419	NA	NA	NA	3.43322104128999e-07	156643780	156655750
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	156651302	157100726	206	200	0.0648	3.43322104128999e-07	156643780	156655750	1.13415612929236e-05	157098433	157100726
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157107844	157113795	4	4	-0.6369	1.13415612929236e-05	157098433	157100726	2.78268678308787e-06	157113795	157118007
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157115848	161099582	1631	1584	0.0523	2.78268678308787e-06	157113795	157118007	7.61754773077057e-15	161099582	161099582
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.4185	7.61754773077057e-15	161099582	161099582	9.91164336480268e-15	161104791	161104791
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	247186514	31286	30409	0.0764	9.91164336480268e-15	161104791	161104791	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	10655512	3335	3227	0.4886	NA	NA	NA	0	10645603	10662248
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	10656775	33076512	7541	7323	0.0748	0	10645603	10662248	1.61513088758229e-95	33076512	33076512
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-3.6257	1.61513088758229e-95	33076512	33076512	2.20385975024062e-101	33080437	33080437
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	628	0.09	2.20385975024062e-101	33080437	33080437	1.73856793959925e-38	34542224	34551222
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.8648	1.73856793959925e-38	34542224	34551222	7.41373578396933e-36	34583814	34591681
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35818921	483	473	0.0863	7.41373578396933e-36	34583814	34591681	5.01466983000949e-06	35810125	35844884
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35853977	5	5	0.7038	5.01466983000949e-06	35810125	35844884	2.97107749729318e-06	35841255	35857926
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35855273	37810001	881	858	0.073	2.97107749729318e-06	35841255	35857926	5.14994709087551e-20	37792669	37813211
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	-0.4689	5.14994709087551e-20	37792669	37813211	1.11964825676937e-21	37852371	37859985
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5631	0.0727	1.11964825676937e-21	37852371	37859985	3.5113421710307e-08	52588009	52600588
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	3.5113421710307e-08	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8511	NA	NA	NA	4.77105848351443e-08	52635695	52642716
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	70898216	6139	5976	0.0701	4.77105848351443e-08	52635695	52642716	2.05838888569133e-13	70896872	70898216
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	70899988	70910369	6	6	-0.7415	2.05838888569133e-13	70896872	70898216	2.98579647056589e-12	70910369	70913822
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	70912422	146571330	20192	19650	0.0518	2.98579647056589e-12	70910369	70913822	2.90104028659650e-254	146571330	146571330
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.2358	2.9010402865965e-254	146571330	146571330	6.0966306377496e-262	146592775	146592775
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	178021038	10432	10137	0.0632	6.0966306377496e-262	146592775	146592775	1.84813740048846e-09	178011138	178034585
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178028661	178059417	14	14	0.5157	1.84813740048846e-09	178011138	178034585	0.000114572394937282	178037778	178075160
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178061929	178484894	192	186	0.8502	0.000114572394937282	178037778	178075160	6.51417451583357e-20	178478196	178495995
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178486433	178593013	47	47	0.4434	6.51417451583357e-20	178478196	178495995	8.90294712948277e-24	178577448	178605232
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178595469	183838972	1854	1804	0.055	8.90294712948277e-24	178577448	178605232	1.14802292283178e-23	183834655	183848222
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	183843209	183949024	20	20	0.6444	1.14802292283178e-23	183834655	183848222	1.80462950384618e-21	183929516	183957250
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	183952906	242689978	20190	19661	0.0782	1.80462950384618e-21	183929516	183957250	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	31800447	10672	10377	0.2811	NA	NA	NA	5.51399673068909e-113	31793570	31802269
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	31802269	32022889	107	100	-0.2854	5.51399673068909e-113	31793570	31802269	5.26076343106982e-114	32021338	32033194
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32026357	43274663	3835	3750	0.3013	5.26076343106982e-114	32021338	32033194	0	43266915	43280553
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43276554	58321691	6293	6098	-0.2304	0	43266915	43280553	6.30755564698417e-224	58300339	58346990
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	58326560	61693957	1233	1194	0.0259	6.30755564698417e-224	58300339	58346990	2.9163682638333e-53	61686826	61695474
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	61695474	61789237	45	45	0.6051	2.9163682638333e-53	61686826	61695474	6.9880183736348e-48	61788078	61792388
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	61791190	99891210	9998	9715	0.053	6.9880183736348e-48	61788078	61792388	2.40618579162664e-34	99891210	99891210
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.1774	2.40618579162664e-34	99891210	99891210	1.99528874997137e-35	99897201	99897201
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	116338400	5135	4980	0.0738	1.99528874997137e-35	99897201	99897201	4.75998874484964e-146	116332764	116342660
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116339595	117079830	229	225	0.5075	4.75998874484964e-146	116332764	116342660	8.7216303477066e-104	117074969	117084240
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117081058	117999462	366	351	0.0407	8.7216303477066e-104	117074969	117084240	1.65451331710627e-184	117984300	118002751
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118002751	118885679	165	159	-0.6283	1.65451331710627e-184	117984300	118002751	7.50462008171903e-258	118880374	118890633
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118890633	129209283	3984	3878	0.0679	7.50462008171903e-258	118880374	118890633	3.24633776907188e-10	129189900	129230010
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129212969	129266753	24	24	0.4308	3.24633776907188e-10	129189900	129230010	2.59533533980188e-08	129256998	129279795
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129268850	129861428	313	307	0.1013	2.59533533980188e-08	129256998	129279795	2.82685997581024e-26	129860301	129861428
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129885779	7	7	-0.9399	2.82685997581024e-26	129860301	129861428	7.52724881145876e-26	129885779	129885779
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129887890	163992903	11080	10800	0.1141	7.52724881145876e-26	129885779	129885779	1.53914961918455e-236	163992903	164009321
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	-2.8888	1.53914961918455e-236	163992903	164009321	0.0368984174547727	164001657	164036648
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-4.3642	0.0368984174547727	164001657	164036648	0	164107951	164107951
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	167220691	733	707	0.1082	0	164107951	164107951	4.60640577904107e-122	167191101	167251711
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	167230713	167230713	1	0	NA	4.60640577904107e-122	167191101	167251711	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	167237294	168692331	326	312	0.5241	NA	NA	NA	3.99350109768659e-171	168681615	168697409
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	168694360	178239938	3466	3362	0.1163	3.99350109768659e-171	168681615	168697409	7.79918545232583e-176	178233187	178247789
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178243011	179406564	279	276	0.5516	7.79918545232583e-176	178233187	178247789	1.14836719823272e-166	179381631	179433922
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	179416831	190008922	3845	3730	0.1165	1.14836719823272e-166	179381631	179433922	1.07064514165568e-34	189996211	190017624
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190011665	190145055	57	57	0.5463	1.07064514165568e-34	189996211	190017624	6.31685833848452e-33	190135846	190155603
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190147468	193785530	1226	1195	0.1315	6.31685833848452e-33	190135846	190155603	1.17575585233873e-16	193784209	193785530
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-0.9673	1.17575585233873e-16	193784209	193785530	1.21306153235295e-16	193794411	193794411
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	194354505	193	192	0.15	1.21306153235295e-16	193794411	193794411	6.12069432632577e-07	194344660	194354505
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	0.7384	6.12069432632577e-07	194344660	194354505	2.56480794193045e-08	194366950	194371608
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	960	0.1283	2.56480794193045e-08	194366950	194371608	1.40228864035075e-26	196820428	196904349
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196942158	22	21	-0.4482	1.40228864035075e-26	196820428	196904349	2.80132141480806e-21	196940125	196945209
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	199329592	961	934	0.1239	2.80132141480806e-21	196940125	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3293	-0.5409	NA	NA	NA	1.10443686074613e-236	9815760	9815760
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.0418	1.10443686074613e-236	9815760	9815760	1.95879750089196e-258	9842644	9842644
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	26563737	4811	4674	-0.589	1.95879750089196e-258	9842644	9842644	1.54212791804384e-20	26563737	26563737
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-2.3825	1.54212791804384e-20	26563737	26563737	6.82796689465614e-23	26566345	26566345
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	28015679	251	242	-0.6058	6.82796689465614e-23	26566345	26566345	6.79350385303715e-08	28011281	28015679
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	28031004	28035970	2	2	0.4486	6.79350385303715e-08	28011281	28015679	7.9330393900558e-07	28035970	28048531
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	28048531	32311439	788	771	-0.6003	7.9330393900558e-07	28035970	28048531	0	32304583	32318054
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	32318054	34439897	312	301	0.08	0	32304583	32318054	1.63675472424367e-10	34418775	34457648
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34445002	34519267	10	10	-0.4803	1.63675472424367e-10	34418775	34457648	7.27395794231908e-10	34506297	34541332
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34525462	34525462	1	0	NA	7.27395794231908e-10	34506297	34541332	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34531739	36361499	429	418	0.067	NA	NA	NA	2.04466759514857e-258	36347350	36388404
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	36375764	44181066	2786	2704	0.5131	2.04466759514857e-258	36347350	36388404	0	44167334	44207084
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	44187199	57932873	3428	3341	0.061	0	44167334	44207084	4.78479496103890e-09	57914847	57932873
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57944055	57989071	7	7	0.682	4.7847949610389e-09	57914847	57932873	2.95074183860448e-11	57989071	57992275
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57992275	60077261	282	275	0.0364	2.95074183860448e-11	57989071	57992275	1.83399294509106e-11	60074749	60077261
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	60081805	60085634	3	3	-0.9565	1.83399294509106e-11	60074749	60077261	3.45741756451164e-10	60085634	60088366
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	60088366	68897538	1921	1864	0.0685	3.45741756451164e-10	60085634	60088366	9.36294646132731e-14	68892434	69069651
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68899247	69165814	17	17	0.5695	9.36294646132731e-14	68892434	69069651	0.0340919487770672	69088563	69684769
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	69700130	8	8	0.1796	0.0340919487770672	69088563	69684769	4.09759737182917e-07	69687545	69700130
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69720805	69742449	6	6	-0.5415	4.09759737182917e-07	69687545	69700130	3.24159212375801e-07	69742449	69750957
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69748111	87193253	5906	5738	0.0648	3.24159212375801e-07	69742449	69750957	9.5146586567476e-09	87193253	87193253
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87196350	87198840	2	2	-1.0833	9.5146586567476e-09	87193253	87193253	1.55808341023072e-08	87198840	87198840
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87201443	88752705	663	647	0.0545	1.55808341023072e-08	87198840	87198840	1.31004317218456e-09	88752705	88752705
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.15	1.31004317218456e-09	88752705	88752705	9.29510951829652e-10	88756721	88756721
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	90498613	730	712	0.054	9.29510951829652e-10	88756721	88756721	2.63195259831197e-134	90475625	90517488
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	90504827	91273558	208	201	0.537	2.63195259831197e-134	90475625	90517488	1.90320469108837e-54	91259759	91289071
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	91279108	91616905	143	141	0.1068	1.90320469108837e-54	91259759	91289071	2.89455983648271e-10	91613600	91616905
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	91618135	91629603	6	6	-0.6888	2.89455983648271e-10	91613600	91616905	2.35994303780446e-10	91629603	91634702
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	91634702	102410140	3510	3417	0.0351	2.35994303780446e-10	91629603	91634702	6.69071875965572e-09	102408990	102410140
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	102411760	102413142	2	2	-1.1315	6.69071875965572e-09	102408990	102410140	1.63062900262344e-37	102413142	102413142
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	102415677	134067582	8616	8382	0.0306	1.63062900262344e-37	102413142	102413142	8.85347808842549e-55	134067582	134067582
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	134072796	134158427	13	13	-1.0643	8.85347808842549e-55	134067582	134067582	2.28551554008072e-40	134158427	134171051
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	134171051	142066819	1905	1861	-0.1296	2.28551554008072e-40	134158427	134171051	1.90926601491619e-27	142064756	142068690
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	142068690	142124800	24	23	0.4541	1.90926601491619e-27	142064756	142068690	6.51205026004003e-23	142118676	142127015
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	142125854	147177436	1514	1472	-0.0917	6.51205026004003e-23	142118676	142127015	0	147164709	147192129
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	147182519	173559731	8081	7885	-0.5561	0	147164709	147192129	2.71050892679110e-35	173559731	173559731
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173561572	173564788	3	3	-2.4523	2.7105089267911e-35	173559731	173559731	0.00808740348465437	173564788	173572472
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173567515	173592904	14	14	-1.8263	0.00808740348465437	173564788	173572472	5.91239632232249e-44	173590864	173592904
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173594068	173620645	13	13	-0.4015	5.91239632232249e-44	173590864	173592904	0.00294510065871776	173605494	173637619
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173622783	173660684	19	18	-0.6829	0.00294510065871776	173605494	173637619	1.53524943266322e-89	173660684	173660684
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.6359	1.53524943266322e-89	173660684	173660684	1.49639611932838e-68	173666072	173666072
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175857109	742	724	-0.5512	1.49639611932838e-68	173666072	173666072	6.91308066277466e-08	175855359	175860235
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175860235	175863396	3	3	0.3568	6.91308066277466e-08	175855359	175860235	2.66089920011887e-08	175862084	175866055
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3229	-0.5697	2.66089920011887e-08	175862084	175866055	7.19199818760762e-18	187330240	187330240
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.0651	7.19199818760762e-18	187330240	187330240	1.05337419888978e-17	187333619	187333619
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190725579	1133	1104	-0.5892	1.05337419888978e-17	187333619	187333619	5.12991278574273e-38	190708316	190752920
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190730982	190930709	66	63	-0.1489	5.12991278574273e-38	190708316	190752920	9.18171319529646e-13	190915643	190945773
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190936155	191153613	42	40	-0.542	9.18171319529646e-13	190915643	190945773	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	51134096	13474	13091	0.0807	NA	NA	NA	0	51127853	51148679
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	51140135	90384307	11860	11534	-0.5867	0	51127853	51148679	2.60946205082188e-51	90381331	90389033
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90385738	90466983	39	39	0.0474	2.60946205082188e-51	90381331	90389033	1.76269962939969e-52	90465576	90470721
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90468865	138940794	14174	13769	-0.5879	1.76269962939969e-52	90465576	90470721	1.12708456184632e-133	138937907	138940794
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138944228	139005532	31	31	0.543	1.12708456184632e-133	138937907	138940794	2.11709739448858e-13	139005532	139005532
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	139007125	139008931	2	2	-0.8272	2.11709739448858e-13	139005532	139005532	3.77878127800203e-11	139008931	139008931
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	139010596	139649449	274	269	0.4766	3.77878127800203e-11	139008931	139008931	1.70578133134067e-16	139634395	139660393
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	139650590	139770113	58	56	0.8021	1.70578133134067e-16	139634395	139660393	8.54834816633657e-15	139754795	139793714
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	139772835	155411053	5572	5406	0.517	8.54834816633657e-15	139754795	139793714	1.18541722749999e-08	155405839	155411053
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	1.3402	1.18541722749999e-08	155405839	155411053	1.35968680377115e-08	155421443	155427589
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180342860	8158	7913	0.513	1.35968680377115e-08	155421443	155427589	4.26264485030276e-179	180342860	180342860
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	8	-2.0682	4.26264485030276e-179	180342860	180342860	2.10455433168901e-100	180362342	180362342
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	108	0.4758	2.10455433168901e-100	180362342	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10294	-0.576	NA	NA	NA	4.72529325864913e-66	29950805	29972382
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-1.7251	4.72529325864913e-66	29950805	29972382	1.23750240480383e-49	30000990	30010234
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	561	-0.573	1.23750240480383e-49	30000990	30010234	3.11122505695255e-23	31385778	31385778
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-1.7948	3.11122505695255e-23	31385778	31385778	3.71501251222921e-27	31418006	31418006
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	478	-0.5416	3.71501251222921e-27	31418006	31418006	3.11003197087277e-25	32558677	32564884
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	6	-1.7937	3.11003197087277e-25	32558677	32564884	0.0184425667318127	32564884	32634977
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32756637	56	53	-0.851	0.0184425667318127	32564884	32634977	2.27073896135047e-12	32654861	32772859
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32758904	43090782	4347	4213	-0.5666	2.27073896135047e-12	32654861	32772859	8.12335337762453e-72	43085973	43093012
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43093012	43198971	48	45	0.1405	8.12335337762453e-72	43085973	43093012	4.77369330246763e-77	43197501	43201327
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43201327	54035000	3854	3750	-0.5826	4.77369330246763e-77	43197501	43201327	1.30504636990155e-19	54035000	54035000
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54039814	2	2	1.1608	1.30504636990155e-19	54035000	54035000	8.52012926312804e-19	54039814	54039814
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54042734	54042734	1	0	NA	8.52012926312804e-19	54039814	54039814	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	64246507	2001	1952	-0.5899	NA	NA	NA	1.20499127710865e-23	64243409	64248275
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	64248275	64304275	20	20	0.0304	1.20499127710865e-23	64243409	64248275	1.34838434776667e-24	64302237	64309015
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	64305794	103841482	11186	10888	-0.5854	1.34838434776667e-24	64302237	64309015	1.65228575733142e-17	103841482	103841482
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.5826	1.65228575733142e-17	103841482	103841482	1.93392548430909e-17	103868154	103868154
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	122041294	5836	5676	-0.5809	1.93392548430909e-17	103868154	103868154	4.4682709772163e-16	122041294	122041294
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122043742	122046731	3	3	-1.873	4.4682709772163e-16	122041294	122041294	9.50712086056581e-16	122046731	122046731
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	122047851	131292913	3378	3291	-0.5896	9.50712086056581e-16	122046731	122046731	2.83156560545124e-18	131289415	131294217
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131294217	131317644	12	12	0.101	2.83156560545124e-18	131289415	131294217	6.29584337711499e-18	131316033	131322467
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131319895	139643729	3151	3074	-0.5766	6.29584337711499e-18	131316033	131322467	8.62153343242044e-146	139643729	139643729
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-4.3814	8.62153343242044e-146	139643729	139643729	3.43341185162222e-146	139648318	139648318
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	144118304	1189	1168	-0.5958	3.43341185162222e-146	139648318	139648318	1.51850230405403e-22	144116578	144118304
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	144121328	144142526	11	11	0.186	1.51850230405403e-22	144116578	144118304	1.08390202745296e-19	144142526	144144172
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	144144172	165643653	7523	7313	-0.5755	1.08390202745296e-19	144142526	144144172	1.29958911637932e-38	165643653	165643653
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1777	1.29958911637932e-38	165643653	165643653	8.7338803567027e-37	165650610	165650610
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1752	-0.5777	8.7338803567027e-37	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26097755	8798	8523	0.0679	NA	NA	NA	1.93798064265649e-113	26097755	26097755
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.0527	1.93798064265649e-113	26097755	26097755	2.01693406626449e-114	26108369	26108369
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	49781650	8469	8242	0.0437	2.01693406626449e-114	26108369	26108369	0	49773127	49787999
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	49783321	57597627	1862	1804	0.4897	0	49773127	49787999	0	57569956	62090591
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57610060	75982631	3633	3534	0.0774	0	57569956	62090591	1.52563195819633e-26	75974242	76036855
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76026227	76421843	19	19	-0.5868	1.52563195819633e-26	75974242	76036855	1.05554553602097e-27	76349713	76539954
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76539954	132866795	23035	22381	0.0739	1.05554553602097e-27	76349713	76539954	1.62468286953219e-07	132860287	132872927
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	132868605	132894167	14	13	0.508	1.62468286953219e-07	132860287	132872927	1.8197258312937e-07	132887150	132906242
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	132896108	142011785	4235	4107	0.0818	1.8197258312937e-07	132887150	132906242	5.31135755201721e-47	142005505	142025460
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142018368	142152205	43	43	0.6539	5.31135755201721e-47	142005505	142025460	1.03063300133470e-12	142152205	142156165
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.5893	1.0306330013347e-12	142152205	142156165	1.34821502076666e-12	142166710	142166710
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.6662	1.34821502076666e-12	142166710	142166710	3.92941496946011e-109	142167908	142167908
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	468	0.5131	3.92941496946011e-109	142167908	142167908	2.63874725626195e-25	143503317	143503317
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.143	2.63874725626195e-25	143503317	143503317	4.64621323630118e-29	143584350	143584350
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	143974006	122	119	0.5186	4.64621323630118e-29	143584350	143584350	7.89081291333352e-60	143968449	143983363
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143976844	145582497	687	678	0.0865	7.89081291333352e-60	143968449	143983363	2.20991816855384e-10	145578828	145582497
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145584969	145584969	1	0	NA	2.20991816855384e-10	145578828	145582497	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145586712	145599175	7	7	-0.6178	NA	NA	NA	1.51287743051327e-09	145599175	145603744
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145601952	158821263	5273	5120	0.0674	1.51287743051327e-09	145599175	145603744	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	1327660	350	341	-1.0831	NA	NA	NA	1.92747102357884e-09	1325747	1327660
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1333330	1338729	2	2	0.4102	1.92747102357884e-09	1325747	1327660	2.60440376657721e-14	1338729	1338729
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1344196	6117293	1742	1704	-1.1274	2.60440376657721e-14	1338729	1338729	0	6103173	6122524
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	6122524	25022606	6035	5884	-0.2542	0	6103173	6122524	3.40241050770152e-12	25013753	25022606
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	0.4848	3.40241050770152e-12	25013753	25022606	2.36956744654846e-19	25047250	25047250
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	25120552	26	24	-0.3564	2.36956744654846e-19	25047250	25047250	1.71200707188058e-95	25120552	25120552
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.2483	1.71200707188058e-95	25120552	25120552	1.60571268046722e-63	25125700	25125700
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4765	-0.2631	1.60571268046722e-63	25125700	25125700	0	39350798	39352361
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-3.9722	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40462162	260	256	-0.2379	0	39504332	39505256	6.7237683791136e-28	40380497	40508728
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40475057	40892587	181	172	0.0369	6.7237683791136e-28	40380497	40508728	1.70202776847706e-14	40892587	40892587
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.4955	1.70202776847706e-14	40892587	40892587	3.60532562147703e-13	40897469	40897469
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	55253513	2996	2908	0.0583	3.60532562147703e-13	40897469	40897469	6.67390719842082e-70	55245375	55289713
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	55257727	55676338	108	104	0.5185	6.67390719842082e-70	55245375	55289713	9.17536693106523e-65	55663847	55688293
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	55683554	57210373	529	511	0.0632	9.17536693106523e-65	55663847	55688293	1.91826007238428e-19	57206001	57212447
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57212447	57260828	20	19	0.591	1.91826007238428e-19	57206001	57212447	2.05512842473529e-18	57258609	57266597
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57262363	61832813	1191	1161	0.039	2.05512842473529e-18	57258609	57266597	2.22329540628561e-322	61819070	61845642
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	61834801	76589786	4781	4651	0.3529	2.22329540628561e-322	61819070	61845642	0	76577759	76607290
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	76595094	81908166	1274	1226	0.6901	0	76577759	76607290	7.00398880427192e-07	81887998	81918208
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	81910509	81981344	30	30	0.9607	7.00398880427192e-07	81887998	81918208	3.05166257023761e-08	81969150	82022631
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	81983017	87255865	1315	1277	0.6706	3.05166257023761e-08	81969150	82022631	1.17481805438468e-07	87249754	87255865
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-0.21	1.17481805438468e-07	87249754	87255865	1.981946031692e-07	87262662	87265435
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	116039353	9104	8849	0.6771	1.981946031692e-07	87262662	87265435	4.91884589018716e-251	115969306	116078975
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	116042692	119265519	940	912	0.9718	4.91884589018716e-251	115969306	116078975	2.26625729728681e-128	119261239	119271961
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	119268390	119475412	107	103	1.5596	2.26625729728681e-128	119261239	119271961	6.24947273687107e-113	119469711	119484179
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	119477449	119478997	2	0	NA	6.24947273687107e-113	119469711	119484179	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	119482234	128508066	2935	2861	0.98	NA	NA	NA	4.85468106968742e-17	128502987	128523393
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	128511937	128599651	19	19	1.5048	4.85468106968742e-17	128502987	128523393	8.87484073147256e-16	128586267	128618441
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	128605483	143888195	4833	4717	0.9824	8.87484073147256e-16	128586267	128618441	6.47753788339715e-161	143866007	143925238
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143889160	146264846	803	780	0.6992	6.47753788339715e-161	143866007	143925238	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	227146	16	15	-0.2589	NA	NA	NA	1.458124028006e-14	219198	232269
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	229426	400059	82	80	0.2994	1.458124028006e-14	219198	232269	1.20979595495339e-74	392724	407928
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	404728	13473482	4511	4387	-0.2166	1.20979595495339e-74	392724	407928	7.62508558453047e-309	13444659	13516090
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	13483482	15802255	849	825	-0.5698	7.62508558453047e-309	13444659	13516090	5.06245145635879e-11	15802255	15802255
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	0.7249	5.06245145635879e-11	15802255	15802255	1.04240980347479e-10	15807123	15807123
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2304	-0.5854	1.04240980347479e-10	15807123	15807123	7.43163335271949e-12	22477358	22477358
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.7905	7.43163335271949e-12	22477358	22477358	4.25825842865624e-11	22492603	22499541
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	156	-0.5949	4.25825842865624e-11	22492603	22499541	6.04708546836915e-71	23343915	23343915
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.5822	6.04708546836915e-71	23343915	23343915	1.50635462145149e-86	23365926	23365926
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	38273587	4613	4467	-0.5793	1.50635462145149e-86	23365926	23365926	0	38252476	38299183
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	38286695	70926188	456	437	-0.0114	0	38252476	38299183	1.17055452827004e-23	70926188	70926188
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.0583	1.17055452827004e-23	70926188	70926188	1.41353207374206e-52	70930528	70930528
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	78112965	2641	2565	0.127	1.41353207374206e-52	70930528	70930528	0	78107748	78117617
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78115227	80394707	896	874	0.7201	0	78107748	78117617	0	80376445	80409781
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	80403931	116124007	11931	11611	0.1566	0	80376445	80409781	4.02488900325319e-23	116122595	116124007
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116132839	3	3	-0.908	4.02488900325319e-23	116122595	116124007	6.2282048794212e-11	116132839	116132839
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	124007710	2697	2620	0.1408	6.2282048794212e-11	116132839	116132839	3.91736080487914e-15	124003282	124020080
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	124009705	124049812	20	19	0.6296	3.91736080487914e-15	124003282	124020080	9.6364938473704e-15	124042254	124058305
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	124051124	130012982	2602	2508	0.142	9.6364938473704e-15	124042254	124058305	1.06016526305708e-24	129995409	130022732
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130014017	130091808	48	48	0.5398	1.06016526305708e-24	129995409	130022732	2.23209437556363e-18	130079034	130102160
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130095415	140145683	4032	3928	0.1652	2.23209437556363e-18	130079034	130102160	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	11968341	4006	3896	-0.5965	NA	NA	NA	0	11964944	11972212
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	11972212	13034376	459	442	0.0838	0	11964944	11972212	2.97757885247317e-08	13030580	13034376
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13037146	13044787	5	5	-0.6484	2.97757885247317e-08	13030580	13034376	3.45425363788301e-08	13044787	13048825
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13047431	24646448	4323	4215	0.0578	3.45425363788301e-08	13044787	13048825	1.62337691662663e-56	24638911	24652653
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	24648714	24849399	101	95	0.4755	1.62337691662663e-56	24638911	24652653	4.28753687601602e-53	24844384	24855885
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	24851009	53679935	7407	7211	0.0644	4.28753687601602e-53	24844384	24855885	2.54983421969626e-21	53679935	53679935
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53683740	53683740	1	0	NA	2.54983421969626e-21	53679935	53679935	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-1.7434	NA	NA	NA	2.02212776671358e-21	53687880	53687880
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	77917893	8288	8051	0.0762	2.02212776671358e-21	53687880	53687880	6.46101622417211e-51	77917893	77917893
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.694	6.46101622417211e-51	77917893	77917893	1.08978237279696e-52	77928669	77928669
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	83607970	1589	1549	0.0694	1.08978237279696e-52	77928669	77928669	2.39044046454175e-28	83596162	83616972
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	83613470	83695145	40	38	0.5418	2.39044046454175e-28	83596162	83616972	5.34817455125211e-27	83690589	83700633
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	83696402	100530398	6075	5936	0.0875	5.34817455125211e-27	83690589	83700633	0	100529553	100539005
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100539005	119404248	6815	6612	-0.5709	0	100529553	100539005	2.15384388724702e-25	119395876	119404248
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	119419552	119546551	18	18	0.0793	2.15384388724702e-25	119395876	119404248	8.94415193881445e-24	119546551	119557672
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	119551169	121858220	887	866	-0.5743	8.94415193881445e-24	119546551	119557672	0	121850791	121864924
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	121861367	135285645	4790	4666	0.0706	0	121850791	121864924	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	3177919	1215	1183	-0.5233	NA	NA	NA	0	3168871	3180580
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3179201	4923300	557	547	0.0708	0	3168871	3180580	5.64805592025312e-262	4923300	4923300
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.0957	5.64805592025312e-262	4923300	4923300	2.13399316255582e-281	4932214	4932214
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	10735012	2519	2450	0.0681	2.13399316255582e-281	4932214	4932214	2.49846403164496e-08	10728931	10741917
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10738130	10753255	9	9	0.6173	2.49846403164496e-08	10728931	10741917	9.72794327976707e-09	10747863	10759016
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10755625	34183552	7878	7672	0.0676	9.72794327976707e-09	10747863	10759016	3.18574739143698e-27	34179764	34186698
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34185539	34250079	35	35	0.5479	3.18574739143698e-27	34179764	34186698	9.31602635300066e-26	34247292	34255395
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34251397	55118214	4687	4566	0.0776	9.31602635300066e-26	34247292	34255395	0	55118214	55118214
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	-4.3801	0	55118214	55118214	0	55209626	55209626
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	89631262	12831	12471	0.0737	0	55209626	55209626	5.53079227513698e-12	89629000	89631262
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89633359	89638013	4	4	-0.914	5.53079227513698e-12	89629000	89631262	4.38341113333366e-13	89638013	89644740
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89644740	104250920	4414	4286	0.0683	4.38341113333366e-13	89638013	89644740	1.38124029994488e-25	104223960	104257524
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	104253045	104361396	44	42	0.4893	1.38124029994488e-25	104223960	104257524	3.65154015905678e-28	104355784	104370100
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	104366655	134450318	11067	10750	0.053	3.65154015905678e-28	104355784	104370100	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	6853395	2868	2800	0.0518	NA	NA	NA	3.92995914832171e-45	6845343	6863099
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6854649	6978066	84	80	0.4732	3.92995914832171e-45	6845343	6863099	1.73954400855161e-37	6968183	6989409
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6980020	6980020	1	0	NA	1.73954400855161e-37	6968183	6989409	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6981096	9523923	789	760	0.0728	NA	NA	NA	1.98983581531203e-35	9516067	9528590
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.0007	1.98983581531203e-35	9516067	9528590	2.42741521653241e-39	9590351	9604633
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	31132762	7400	7173	0.0555	2.42741521653241e-39	9590351	9604633	5.62894951928359e-09	31079618	31177645
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31233136	16	16	0.4739	5.62894951928359e-09	31079618	31177645	1.93084916621085e-08	31205337	31248212
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31237505	41303729	2492	2429	0.0648	1.93084916621085e-08	31205337	31248212	1.47674354974310e-08	41293470	41303729
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41315922	4	4	-0.7559	1.4767435497431e-08	41293470	41303729	1.69358546571711e-08	41315922	41317323
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41317323	52671077	4309	4176	0.0628	1.69358546571711e-08	41315922	41317323	1.65493211113124e-63	52667969	52672223
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52671584	52763146	94	92	0.5201	1.65493211113124e-63	52667969	52672223	2.57571019017971e-39	52755878	52822207
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52808865	53064158	135	129	0.0658	2.57571019017971e-39	52755878	52822207	9.13641024303014e-16	53057656	53069325
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53067247	53106335	22	22	0.5634	9.13641024303014e-16	53057656	53069325	3.89645538662526e-19	53102529	53110414
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53108681	53602350	184	181	0.0757	3.89645538662526e-19	53102529	53110414	8.35514305475444e-05	53569196	53629239
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53604579	53654805	21	20	-0.1861	8.35514305475444e-05	53569196	53629239	0.000317787258510742	53636360	53696594
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53656348	54233281	209	204	0.0801	0.000317787258510742	53636360	53696594	5.38504027409309e-95	54218558	54251784
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54236945	55605425	587	565	0.5251	5.38504027409309e-95	54218558	54251784	1.04134961937213e-263	55597871	55610806
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55606972	60233231	1255	1231	0.0685	1.04134961937213e-263	55597871	55610806	0	60224714	60244565
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60238092	95818405	11164	10852	-0.5824	0	60224714	60244565	7.20617699733486e-13	95816963	95818405
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	95820328	95820328	1	0	NA	7.20617699733486e-13	95816963	95818405	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	95823428	95828983	4	4	0.4358	NA	NA	NA	1.63237936099349e-12	95828983	95830604
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	95830604	130943064	12957	12576	-0.5732	1.63237936099349e-12	95828983	95830604	3.82024590218235e-28	130943064	130943064
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.5313	3.82024590218235e-28	130943064	130943064	8.12653637770411e-22	130946248	130946248
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	131856462	376	364	-0.5608	8.12653637770411e-22	130946248	130946248	7.22335891190126e-110	131851436	131861276
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131858802	132289090	174	169	0.0328	7.22335891190126e-110	131851436	131861276	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11879	-0.0318	NA	NA	NA	3.07527702756358e-188	49964838	49964838
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.2912	3.07527702756358e-188	49964838	49964838	1.74767147959057e-29	49971732	49971732
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1758	-0.1831	1.74767147959057e-29	49971732	49971732	3.43331574371928e-18	56607869	56657371
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.4071	3.43331574371928e-18	56607869	56657371	2.05931512730787e-17	56685341	56691355
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	71375082	3622	3514	-0.1786	2.05931512730787e-17	56685341	56691355	4.90838243766646e-113	71375082	71375082
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.33	4.90838243766646e-113	71375082	71375082	2.16470025722741e-126	71377671	71377671
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4510	-0.1678	2.16470025722741e-126	71377671	71377671	2.99134170041408e-41	89659397	89659397
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.5754	2.99134170041408e-41	89659397	89659397	3.55674034115427e-39	89662326	89662326
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9065	-0.164	3.55674034115427e-39	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	55302130	12009	11659	0.0848	NA	NA	NA	0	55297045	55305777
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55305777	79176037	10333	10033	-0.5736	0	55297045	55305777	3.22791660044498e-102	79176037	79176037
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-3.8425	3.22791660044498e-102	79176037	79176037	7.39140097693416e-108	79183154	79183154
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	98947962	6428	6251	-0.5879	7.39140097693416e-108	79183154	79183154	0	98945888	98951611
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	98949512	98949512	1	0	NA	0	98945888	98951611	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	98950514	105597555	2868	2779	0.0723	NA	NA	NA	9.9610223140577e-269	105597555	105597555
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.6978	9.9610223140577e-269	105597555	105597555	8.5817978131851e-69	105632168	105632168
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	0.1569	8.5817978131851e-69	105632168	105632168	1.63375114385810e-13	105787390	105787390
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.7348	1.6337511438581e-13	105787390	105787390	1.66358631811328e-08	105798116	105800545
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	106358491	204	201	0.0618	1.66358631811328e-08	105798116	105800545	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19109124	31	29	0.1819	NA	NA	NA	0.000238495940815863	18848213	19156057
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	19835471	76	73	0.4101	0.000238495940815863	18848213	19156057	3.64092239180657e-30	19805960	19882711
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	29388322	2507	2433	0.0498	3.64092239180657e-30	19805960	19882711	6.25584349258963e-18	29376179	29395619
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29392283	29441647	25	23	0.5467	6.25584349258963e-18	29376179	29395619	4.66769930058768e-17	29431545	29446484
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29443708	43258333	5558	5399	0.0703	4.66769930058768e-17	29431545	29446484	0	43250438	43265860
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43259584	54932989	4750	4629	0.5166	0	43250438	43265860	0.0356191082683367	54797847	54935432
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	54935432	54939009	3	3	0.1379	0.0356191082683367	54797847	54935432	1.23581489935215e-05	54939009	54945674
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	54945674	55038397	39	36	-0.5686	1.23581489935215e-05	54939009	54945674	5.5673670846232e-05	55012895	55043241
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	55039807	55079494	18	18	-0.2661	5.5673670846232e-05	55012895	55043241	1.11413415393803e-05	55069211	55101112
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	55082066	56270894	533	518	-0.5913	1.11413415393803e-05	55069211	55101112	0	56267019	56271519
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56271519	69460268	5851	5686	0.06	0	56267019	56271519	2.22604063426054e-170	69457308	69470035
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69465272	69919847	239	235	0.5241	2.22604063426054e-170	69457308	69470035	1.02744373813833e-167	69910911	69926547
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69921341	73697891	1672	1628	0.0226	1.02744373813833e-167	69910911	69926547	1.97855587754795e-27	73688885	73711683
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73700444	73880421	57	57	0.4218	1.97855587754795e-27	73688885	73711683	1.6604828046161e-31	73825834	73895200
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73887983	89215207	5941	5784	0.0101	1.6604828046161e-31	73825834	73895200	1.44121628215565e-13	89195179	89227634
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	89216778	89314505	53	51	0.2978	1.44121628215565e-13	89195179	89227634	2.51865215878016e-14	89302058	89336878
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	89317076	91733993	894	876	0.0035	2.51865215878016e-14	89302058	89336878	0	91721154	91749724
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91740806	98232932	2161	2109	0.4589	0	91721154	91749724	2.74575289615291e-09	98228743	98232932
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.4183	2.74575289615291e-09	98228743	98232932	2.26794365632794e-09	98239454	98243586
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	623	0.437	2.26794365632794e-09	98239454	98243586	2.85727639101908e-21	99632987	99632987
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.2246	2.85727639101908e-21	99632987	99632987	3.00529021515764e-21	99635701	99635701
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	256	0.4525	3.00529021515764e-21	99635701	99635701	0.103559060200078	100154687	100278665
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	0.1212	0.103559060200078	100154687	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2757874	1064	1031	-0.5008	NA	NA	NA	0	2749114	2763441
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2761375	4835800	890	873	0.0624	0	2749114	2763441	0	4833002	4840984
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4838664	10429624	1914	1874	-0.5862	0	4833002	4840984	0	10394701	10431683
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	10431683	17014897	2069	2007	0.0712	0	10394701	10431683	2.73743083815237e-20	17002306	17021170
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	17021170	17067740	9	9	-0.7245	2.73743083815237e-20	17002306	17021170	3.20117577823574e-232	17065058	17072194
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	17072194	57203733	8963	8702	0.1256	3.20117577823574e-232	17065058	17072194	7.66048118388403e-233	57203733	57203733
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.7001	7.66048118388403e-233	57203733	57203733	3.08862638000772e-12	57206772	57206772
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	57847260	171	169	0.3291	3.08862638000772e-12	57206772	57206772	0	57835290	57854445
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57854445	69397102	3480	3393	-0.5642	0	57835290	57854445	1.21553682255308e-33	69374507	69417987
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69398720	69761372	164	161	-0.3001	1.21553682255308e-33	69374507	69417987	6.97911076149853e-43	69745272	69778140
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69763173	72556230	956	930	-0.5981	6.97911076149853e-43	69745272	69778140	0	72552574	72561713
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72561713	73491582	279	268	0.0666	0	72552574	72561713	4.78539137901388e-228	73490335	73495548
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73494108	75093957	562	547	-0.5566	4.78539137901388e-228	73490335	73495548	4.08034841167743e-64	75093957	75093957
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.1151	4.08034841167743e-64	75093957	75093957	1.27288244743819e-70	75100865	75100865
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	588	-0.6027	1.27288244743819e-70	75100865	75100865	2.77444441539023e-53	76925748	76929598
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8745	2.77444441539023e-53	76925748	76929598	1.57143252204234e-50	76938723	76940218
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4387	-0.5639	1.57143252204234e-50	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	0.0568	NA	NA	NA	5.57267242706841e-19	1028979	1028979
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.8536	5.57267242706841e-19	1028979	1028979	2.9115395847229e-18	1030766	1030766
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	3484734	1131	1104	0.0705	2.9115395847229e-18	1030766	1030766	0	3480915	3490213
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	3488581	32828797	10871	10569	-0.5668	0	3480915	3490213	1.66963234237792e-24	32828797	32828797
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.5598	1.66963234237792e-24	32828797	32828797	5.90531429588e-25	32832642	32832642
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	41519702	3465	3368	-0.5329	5.90531429588e-25	32832642	32832642	1.29280454636545e-08	41506317	41526558
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	22	-0.1686	1.29280454636545e-08	41506317	41526558	3.63839637233845e-09	41564408	41581624
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	56386742	5228	5080	-0.5419	3.63839637233845e-09	41564408	41581624	9.7600665483407e-89	56380613	56389138
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56389138	56531280	64	63	0.1274	9.7600665483407e-89	56380613	56389138	4.45704879326481e-76	56527915	56535466
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56533351	58738693	792	772	-0.4946	4.45704879326481e-76	56527915	56535466	0	58726926	58742570
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58740374	78653545	7640	7411	0.1303	0	58726926	58742570	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	18611884	5644	5477	-0.5768	NA	NA	NA	0	18608570	18611884
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18619508	19603118	400	393	0.524	0	18608570	18611884	2.07063248556706e-273	19594185	19611595
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19606732	41589833	6238	6089	0.0673	2.07063248556706e-273	19594185	19611595	0	41586588	41594953
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	41590740	72351408	9372	9103	-0.5813	0	41586588	41594953	6.35629448873202e-73	72351408	72351408
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	72356115	72389873	14	13	-1.8821	6.35629448873202e-73	72351408	72351408	4.10908963630432e-68	72389873	72389873
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	72391942	76116026	1296	1260	-0.58	4.10908963630432e-68	72389873	72389873	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	481	-0.496	NA	NA	NA	1.40564873175201e-07	1395246	1398325
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1405308	3	3	0.5824	1.40564873175201e-07	1395246	1398325	3.71414465121858e-09	1405308	1409386
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1409386	2961881	749	730	-0.5139	3.71414465121858e-09	1405308	1409386	3.34041753740128e-50	2958549	2966075
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2964456	3063749	49	48	0.1333	3.34041753740128e-50	2958549	2966075	2.58678460171460e-29	3060351	3068122
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3066404	3221007	70	69	-0.4866	2.5867846017146e-29	3060351	3068122	1.29484551932446e-169	3219588	3221987
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3221987	11448975	3809	3680	0.4593	1.29484551932446e-169	3219588	3221987	1.15205333220964e-11	11448975	11448975
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.9377	1.15205333220964e-11	11448975	11448975	3.80604527311430e-13	11452390	11452390
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	11453579	1	0	NA	3.8060452731143e-13	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11455241	13386391	842	824	0.4755	NA	NA	NA	0	13377776	13397024
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13388758	34650990	4585	4453	0.0715	0	13377776	13397024	2.88138520160926e-231	34633399	34664257
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	34655169	36435822	528	513	0.48	2.88138520160926e-231	34633399	34664257	0	36432966	36438991
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36438991	52311755	6620	6416	-0.5556	0	36432966	36438991	1.57751041085132e-67	52311755	52311755
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52315524	52339852	11	11	0.894	1.57751041085132e-67	52311755	52311755	5.24450558112233e-58	52339852	52339852
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52340820	55769042	1594	1542	-0.5228	5.24450558112233e-58	52339852	52339852	7.72057091655446e-26	55769042	55769042
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-2.7335	7.72057091655446e-26	55769042	55769042	1.34758726021078e-24	55772729	55772729
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56823430	516	505	-0.5774	1.34758726021078e-24	55772729	55772729	1.36106693338356e-67	56823430	56823430
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-2.3914	1.36106693338356e-67	56823430	56823430	2.25641035867038e-88	56840346	56840346
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	570	-0.5875	2.25641035867038e-88	56840346	56840346	3.14747370457437e-11	58201323	58212113
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	15	-0.1186	3.14747370457437e-11	58201323	58212113	4.12229591376943e-08	58239871	58259101
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2499	-0.5615	4.12229591376943e-08	58239871	58259101	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	0.0394	NA	NA	NA	1.29395982618957e-32	1499421	1506379
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.094	1.29395982618957e-32	1499421	1506379	1.87830171599817e-37	1532433	1544485
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	21231072	7125	6931	0.0512	1.87830171599817e-37	1532433	1544485	5.28517982503107e-07	21228879	21231072
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21233374	21242143	3	3	-0.8013	5.28517982503107e-07	21228879	21231072	1.16940987178671e-06	21242143	21242154
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21242154	40038203	5450	5302	0.0611	1.16940987178671e-06	21242143	21242154	4.81861325104106e-27	40026603	40052114
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	40040073	40155391	46	45	0.4976	4.81861325104106e-27	40026603	40052114	8.29959364991e-30	40147369	40162368
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	40158188	48054772	3182	3114	0.0488	8.29959364991e-30	40147369	40162368	1.69496116217815e-12	48049638	48054772
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48057167	48067777	4	4	1.0288	1.69496116217815e-12	48049638	48054772	5.0093610254886e-12	48067777	48070532
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48070532	62419534	5173	5020	0.0526	5.0093610254886e-12	48067777	48070532	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9975302	6	6	0.0617	NA	NA	NA	0.00789451271414954	9975302	10079654
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9994686	10167413	16	16	-0.34	0.00789451271414954	9975302	10079654	1.20742700819721e-07	10146866	13615502
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	1.20742700819721e-07	10146866	13615502	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	44517213	12307	11945	0.0541	NA	NA	NA	0	44505095	44539925
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44518466	46922972	1111	1078	0.4525	0	44505095	44539925	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2906	-0.5434	NA	NA	NA	2.71325037129995e-47	22644243	22686731
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	19	-1.5107	2.71325037129995e-47	22644243	22686731	3.33035494629917e-52	22714979	22725305
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	48979665	13303	12922	-0.5583	3.33035494629917e-52	22714979	22725305	1.21284650391743e-53	48976444	48987001
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48983225	49056694	40	40	0.1065	1.21284650391743e-53	48976444	48987001	6.18121021580174e-24	49050046	49064695
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49057875	49571068	210	202	-0.4727	6.18121021580174e-24	49050046	49064695	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1870412	1121	1090	-0.4435	NA	NA	NA	4.79768584883511e-12	1870412	1870855
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1870855	1873302	3	3	-1.8935	4.79768584883511e-12	1870412	1870855	1.25904063693821e-12	1872109	1873302
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1873761	2708291	669	652	-0.5242	1.25904063693821e-12	1872109	1873302	0	2708113	2711273
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	16349623	5113	4983	0.3977	0	2708113	2711273	0	16335018	16367265
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	16360457	18221622	818	801	1.0635	0	16335018	16367265	0	18218837	18230634
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	18228456	37699655	7132	6931	0.4115	0	18218837	18230634	3.03420590568568e-07	37698330	37699655
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37700374	37706063	2	2	-0.7917	3.03420590568568e-07	37698330	37699655	1.57208084040519e-06	37706063	37718969
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37718969	56800429	5929	5765	0.3915	1.57208084040519e-06	37706063	37718969	1.3391875092526e-08	56779121	56824123
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56802632	56855445	20	20	-0.0346	1.3391875092526e-08	56779121	56824123	4.91916453269333e-10	56840603	56861669
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56857262	154038318	25987	25247	0.4183	4.91916453269333e-10	56840603	56861669	7.6386842986543e-21	154037006	154038318
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.2777	7.6386842986543e-21	154037006	154038318	3.47212719238749e-19	154078819	154085354
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	87	0.4125	3.47212719238749e-19	154078819	154085354	1.59732005773220e-11	154441943	154442377
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-0.6513	1.5973200577322e-11	154441943	154442377	3.23810205927413e-12	154450309	154450309
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.4417	3.23810205927413e-12	154450309	154450309	2.44400446240013e-62	154582414	154582414
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154667352	54	52	-0.6029	2.44400446240013e-62	154582414	154582414	1.45823672597582e-57	154667352	154668774
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154668774	154689387	15	15	-2.2828	1.45823672597582e-57	154667352	154668774	2.87198430546035e-75	154688917	154689387
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154698452	154888224	132	128	-0.5277	2.87198430546035e-75	154688917	154689387	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-3.7269	NA	NA	NA	1.62776406131674e-20	3034907	3223585
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.62776406131674e-20	3034907	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	10	-0.5521	NA	NA	NA	1.88345374779421e-13	4431527	4846477
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7054924	181	175	-3.3951	1.88345374779421e-13	4431527	4846477	3.87733714495854e-06	7003768	7205930
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	123	-2.6557	3.87733714495854e-06	7003768	7205930	2.55141667433896e-06	7394617	7614571
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	66	-3.6461	2.55141667433896e-06	7394617	7614571	0.000622977377744712	7668917	7758635
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7996758	85	83	-2.8603	0.000622977377744712	7668917	7758635	4.24293781074004e-06	7852359	8149413
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10515697	372	351	-3.5199	4.24293781074004e-06	7852359	8149413	3.45215583547972e-20	10512616	10515697
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	10	-0.5032	3.45215583547972e-20	10512616	10515697	0.000146642397093410	10645500	11660512
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.6152	0.00014664239709341	10645500	11660512	0.00340954766411186	10655750	12502304
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.429	0.00340954766411186	10655750	12502304	4.20889525484945e-06	12541506	12559410
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12687167	55	53	-2.3723	4.20889525484945e-06	12541506	12559410	0.00133770790172852	12637987	12687167
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12733867	8	7	-4.3113	0.00133770790172852	12637987	12687167	0.00389627634966599	12721434	12776542
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12833424	14	13	-3.3523	0.00389627634966599	12721434	12776542	0.128063908620397	12804329	13045641
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13202163	140	140	-2.6209	0.128063908620397	12804329	13045641	1.37877153335549e-28	13159901	13233514
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13208776	14340202	380	362	-3.6898	1.37877153335549e-28	13159901	13233514	1.19002224953123e-07	14143748	14386474
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14508021	97	95	-3.0721	1.19002224953123e-07	14143748	14386474	6.20873932776452e-06	14502379	14530134
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	6.20873932776452e-06	14502379	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	10	-1.4564	NA	NA	NA	0.00405097845336003	14538156	14569287
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14700040	36	35	-2.7545	0.00405097845336003	14538156	14569287	0.000572971019806411	14681738	14836085
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15915466	394	379	-3.5843	0.000572971019806411	14681738	14836085	0.000983883799578927	15550511	16064208
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16224597	133	128	-3.1186	0.000983883799578927	15550511	16064208	7.14397607417414e-07	16165328	16492450
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16228031	22139807	967	939	-3.6531	7.14397607417414e-07	16165328	16492450	3.07337842031195e-06	22051284	22157319
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8565	3.07337842031195e-06	22051284	22157319	4.13500263186696e-07	22176501	22182080
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	89	-3.7948	4.13500263186696e-07	22176501	22182080	1.76450071272794e-54	23283689	25737663
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-0.8324	1.76450071272794e-54	23283689	25737663	6.0058118196009e-18	26945893	26950080
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.5529	6.0058118196009e-18	26945893	26950080	0.000560543194340416	26957814	26989053
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.2422	0.000560543194340416	26957814	26989053	7.26041266817448e-05	27007874	27019256
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.4993	7.26041266817448e-05	27007874	27019256	1.58992698563690e-07	27039222	27063070
MSK_252152915478_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.8119	1.5899269856369e-07	27039222	27063070	NA	NA	NA
