Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26803	-0.0091	NA	NA	NA	2.68636176286128e-178	72537426	72537426
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	2.3992	2.68636176286128e-178	72537426	72537426	5.52097095467706e-177	72579311	72579311
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103904723	10105	9721	0.0101	5.52097095467706e-177	72579311	72579311	1.86168297952943e-29	103901454	103907903
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.8918	1.86168297952943e-29	103901454	103907903	1.82211153588574e-30	103932025	104012520
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	116029725	3808	3647	-0.0059	1.82211153588574e-30	103932025	104012520	3.96507295445554e-08	116028595	116029725
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.3041	3.96507295445554e-08	116028595	116029725	3.33212379467665e-08	116033402	116035435
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	143702972	1692	1622	-0.0081	3.33212379467665e-08	116033402	116035435	3.83075361774493e-09	143640540	143719710
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143706304	143789484	43	43	-0.3063	3.83075361774493e-09	143640540	143719710	1.56248590066133e-09	143772542	143818958
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	150819879	1891	1815	-0.0059	1.56248590066133e-09	143772542	143818958	1.98678977914478e-121	150819879	150819879
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.0553	1.98678977914478e-121	150819879	150819879	5.28134875624816e-82	150851439	150851439
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	-0.0343	5.28134875624816e-82	150851439	150851439	1.40224396775432e-08	151024118	151026228
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9184	1.40224396775432e-08	151024118	151026228	3.38400974910694e-08	151036435	151038091
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2580	-0.014	3.38400974910694e-08	151036435	151038091	3.2567629032441e-49	157133150	157133150
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	3.1306	3.2567629032441e-49	157133150	157133150	4.10702196410981e-49	157136342	157136342
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	195048208	13303	12773	0.0041	4.10702196410981e-49	157136342	157136342	5.44495427281185e-50	195022854	195062793
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195062793	195158448	29	29	-0.825	5.44495427281185e-50	195022854	195062793	3.18446970424923e-49	195149990	195188683
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195187023	195187023	1	0	NA	3.18446970424923e-49	195149990	195188683	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195188683	246769018	19452	18688	-0.0058	NA	NA	NA	1.22752816925096e-13	246755298	246769018
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246806669	3	3	-1.3753	1.22752816925096e-13	246755298	246769018	9.87148702317189e-18	246806669	246811355
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246811355	247186514	122	116	0.0865	9.87148702317189e-18	246806669	246811355	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20231737	5876	5641	-0.012	NA	NA	NA	8.1990859528361e-10	20231737	20231737
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.4117	8.1990859528361e-10	20231737	20231737	1.87483025705048e-09	20236210	20236210
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	34543992	5644	5435	-0.0081	1.87483025705048e-09	20236210	20236210	3.48790177502401e-31	34542224	34552935
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.8246	3.48790177502401e-31	34542224	34552935	8.42910836093274e-31	34582272	34591681
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	86958705	18348	17569	-0.003	8.42910836093274e-31	34582272	34591681	1.99758231947760e-10	86912047	87136601
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	86964156	88038874	26	24	0.4249	1.9975823194776e-10	86912047	87136601	5.97474949218057e-12	88008343	88084056
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	99714752	1947	1863	-0.0249	5.97474949218057e-12	88008343	88084056	2.09059717587111e-08	99713225	99714752
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99715903	99715903	1	0	NA	2.09059717587111e-08	99713225	99714752	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99721070	99722194	3	3	-1.0958	NA	NA	NA	3.07976342681766e-08	99722194	99726452
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99726452	184952878	25953	24940	0.0031	3.07976342681766e-08	99722194	99726452	1.45511530407179e-11	184942469	184952878
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184958006	184970076	4	4	-1.1067	1.45511530407179e-11	184942469	184952878	8.72875988987738e-12	184970076	184973008
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184973008	239953217	19020	18285	0.0048	8.72875988987738e-12	184970076	184973008	3.35851871761506e-10	239939327	239964578
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239956086	239987581	15	15	-0.5077	3.35851871761506e-10	239939327	239964578	7.96908028354944e-08	239972897	240004023
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239989018	242689978	970	924	-0.0297	7.96908028354944e-08	239972897	240004023	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	4143898	1549	1486	0.0272	NA	NA	NA	7.86302668191478e-34	4141380	4156423
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4156423	4184445	14	14	-0.9457	7.86302668191478e-34	4141380	4156423	2.72219658141021e-31	4180144	4188134
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4188134	32074432	9233	8877	-0.0053	2.72219658141021e-31	4180144	4188134	2.45194716980628e-16	32074432	32074432
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8095	2.45194716980628e-16	32074432	32074432	4.12803297172403e-16	32080848	32080848
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46769081	5127	4924	8e-04	4.12803297172403e-16	32080848	32080848	3.80032910184129e-08	46761824	46769081
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	7	-0.6988	3.80032910184129e-08	46761824	46769081	9.8199425507618e-08	46825048	46841869
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	163992903	37555	36101	2e-04	9.8199425507618e-08	46825048	46841869	2.50706157188609e-45	163992903	163992903
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.5006	2.50706157188609e-45	163992903	163992903	0.000134615439849251	164001657	164036648
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.7897	0.000134615439849251	164001657	164036648	1.75746583584708e-29	164105613	164112873
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9719	-2e-04	1.75746583584708e-29	164105613	164112873	7.59854907107218e-26	194354505	194354505
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	1.3199	7.59854907107218e-26	194354505	194354505	1.06606379173940e-25	194366950	194366950
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196942158	1019	986	-0.0195	1.0660637917394e-25	194366950	194366950	3.41114829866003e-08	196929805	196945209
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196961238	8	8	0.6468	3.41114829866003e-08	196929805	196945209	6.26782821759013e-08	196957322	196968244
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	918	-0.0099	6.26782821759013e-08	196957322	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3260	-0.0061	NA	NA	NA	3.47566768926038e-185	9815760	9815760
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.1892	3.47566768926038e-185	9815760	9815760	4.23181638163319e-181	9842644	9842644
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	88752705	21635	20799	0.0081	4.23181638163319e-181	9842644	9842644	3.85521517348531e-09	88751091	88752705
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.386	3.85521517348531e-09	88751091	88752705	2.98678904664372e-09	88756721	88756721
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	121736888	10385	9973	0.0139	2.98678904664372e-09	88756721	88756721	1.38435841792561e-08	121730207	121736888
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	121743013	121759053	4	4	-0.9424	1.38435841792561e-08	121730207	121736888	1.75656337956639e-08	121759053	121764996
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	121764996	191153613	19738	18917	0.0125	1.75656337956639e-08	121759053	121764996	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3812	-0.0102	NA	NA	NA	1.51492788194943e-09	12857302	12857302
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.3552	1.51492788194943e-09	12857302	12857302	2.59148934542133e-08	12873052	12873052
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	140200229	36101	34667	0.0049	2.59148934542133e-08	12873052	12873052	1.21385857768761e-08	140195260	140201609
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.6427	1.21385857768761e-08	140195260	140201609	1.56429947778323e-08	140215187	140226256
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150181399	3767	3612	-0.0045	1.56429947778323e-08	140215187	140226256	3.02800718472402e-174	150181399	150181399
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-3.1874	3.02800718472402e-174	150181399	150181399	1.01934145606658e-183	150202601	150202601
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9507	-0.0034	1.01934145606658e-183	150202601	150202601	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	40	0.064	NA	NA	NA	6.32576851941154e-13	198124	202063
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	228968	10	10	0.8007	6.32576851941154e-13	198124	202063	4.46462019059111e-05	224667	240119
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	230588	326323	51	51	0.3503	4.46462019059111e-05	224667	240119	7.51707440993678e-16	313153	342633
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10045	0.0026	7.51707440993678e-16	313153	342633	1.06492695782257e-08	29927310	29972382
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30031367	20	20	0.4206	1.06492695782257e-08	29927310	29972382	9.16503918556984e-10	30026699	30053354
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	32558677	1070	1036	-0.0122	9.16503918556984e-10	30026699	30053354	2.90616198712005e-148	32558677	32567462
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	-2.0176	2.90616198712005e-148	32558677	32567462	1.89254744296362e-19	32628420	32633691
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.0028	1.89254744296362e-19	32628420	32633691	1.16236705083078e-24	32713363	32716255
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-2.0258	1.16236705083078e-24	32713363	32716255	2.17078697666181e-73	32728285	32728487
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	79018959	14694	14144	0.0044	2.17078697666181e-73	32728285	32728487	8.96561424661048e-17	79011979	79024557
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.7202	8.96561424661048e-17	79011979	79024557	1.31204674627300e-16	79085247	79101978
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6510	0.0049	1.312046746273e-16	79085247	79101978	1.55456890613238e-13	103841482	103841482
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.1892	1.55456890613238e-13	103841482	103841482	1.77333014430820e-13	103868154	103868154
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20253	0.0029	1.7733301443082e-13	103868154	103868154	9.42154865415522e-14	165643653	165643653
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2005	9.42154865415522e-14	165643653	165643653	1.63307476248311e-14	165650610	165650610
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1737	-0.0217	1.63307476248311e-14	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	6088075	2162	2081	-0.0112	NA	NA	NA	1.10658621890245e-15	6084937	6088075
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6090526	6108887	7	7	-0.964	1.10658621890245e-15	6084937	6088075	8.28503006442532e-16	6108887	6112398
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6112398	125252843	40022	38460	0.0064	8.28503006442532e-16	6108887	6112398	4.55734763404347e-09	125250188	125252843
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125259721	125263980	3	3	-1.1438	4.55734763404347e-09	125250188	125252843	1.31631806469631e-09	125263980	125266534
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125266534	125456729	85	77	0.012	1.31631806469631e-09	125263980	125266534	0.000680857446068869	125443994	125465351
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125458744	125472138	7	7	-0.4969	0.000680857446068869	125443994	125465351	8.95058712206476e-06	125465351	125481264
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125473251	125831554	152	147	0.0845	8.95058712206476e-06	125465351	125481264	1.47219497381281e-138	125831554	125831554
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.0879	1.47219497381281e-138	125831554	125831554	5.58267506457684e-136	125837524	125837524
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131037873	2485	2374	0.0018	5.58267506457684e-136	125837524	125837524	1.62678316557637e-07	131035990	131037873
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131045086	131051168	3	3	-0.9917	1.62678316557637e-07	131035990	131037873	5.1007881265124e-07	131051168	131053699
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131053699	141690753	5004	4805	-0.0053	5.1007881265124e-07	131051168	131053699	5.20084135933498e-27	141687978	141690753
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	1.0796	5.20084135933498e-27	141687978	141690753	1.88262178125004e-25	141714168	141720324
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.88262178125004e-25	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158191657	6537	6285	-0.0161	NA	NA	NA	6.75972677807156e-21	158191657	158191657
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-2.1326	6.75972677807156e-21	158191657	158191657	1.5593955709842e-19	158195947	158195947
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	203	0.0399	1.5593955709842e-19	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.009	NA	NA	NA	2.34916983793322e-12	581533	581533
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.5309	2.34916983793322e-12	581533	581533	2.06290713036382e-10	588865	588865
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	595	-0.0222	2.06290713036382e-10	588865	588865	1.81015681999153e-08	2223705	2245838
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2284123	11	11	-0.6106	1.81015681999153e-08	2223705	2245838	7.61946131126705e-10	2269984	2293536
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2288231	25022606	7381	7096	-0.0038	7.61946131126705e-10	2269984	2293536	1.43738906903233e-07	25017905	25022606
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.0237	1.43738906903233e-07	25017905	25022606	9.03512074054619e-07	25039370	25047250
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	26	-0.0442	9.03512074054619e-07	25039370	25047250	3.65318057099918e-20	25120552	25120552
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.65318057099918e-20	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.2997	NA	NA	NA	2.66923474031058e-25	25125700	25125700
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	31810293	2550	2431	-0.0227	2.66923474031058e-25	25125700	25125700	8.95174350033129e-08	31806677	31810293
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31811829	31815721	3	3	-1.0973	8.95174350033129e-08	31806677	31810293	9.19154953144406e-09	31815721	31817573
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31817573	39350798	2359	2275	0.0066	9.19154953144406e-09	31815721	31817573	1.62083786173866e-119	39345557	39352361
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.9276	1.62083786173866e-119	39345557	39352361	2.9305543860145e-103	39504332	39508035
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	424	0.0329	2.9305543860145e-103	39504332	39508035	1.49031442490250e-11	40892587	40892587
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.5467	1.4903144249025e-11	40892587	40892587	1.15847989467647e-11	40897469	40897469
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	68708619	7030	6757	-3e-04	1.15847989467647e-11	40897469	40897469	2.10901585089567e-08	68707484	68708619
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68710028	68716099	4	4	-0.9383	2.10901585089567e-08	68707484	68708619	2.12852021126992e-08	68716099	68718709
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68718709	137872269	21127	20327	0.006	2.12852021126992e-08	68716099	68718709	1.23880942428030e-11	137858816	137886277
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137876780	137936202	11	11	0.6671	1.2388094242803e-11	137858816	137886277	1.86863612363089e-12	137919308	137945952
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137940544	144968840	2365	2273	-0.0301	1.86863612363089e-12	137919308	137945952	1.21381346647955e-09	144968840	144968840
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.412	1.21381346647955e-09	144968840	144968840	3.54895574080647e-08	144970777	144970777
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	438	0.0255	3.54895574080647e-08	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7530	0.0131	NA	NA	NA	3.72295280812212e-12	22477358	22477358
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.5948	3.72295280812212e-12	22477358	22477358	3.12221543062823e-12	22492603	22492603
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	140145683	30105	28871	-0.0102	3.12221543062823e-12	22492603	22492603	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	2670223	995	961	0.0063	NA	NA	NA	1.77232600306666e-65	2651264	2685392
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	2676386	3127496	147	140	0.4613	1.77232600306666e-65	2651264	2685392	8.97700931861879e-61	3115497	3137781
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3131403	5690847	854	816	0.01	8.97700931861879e-61	3115497	3137781	5.44386302105653e-09	5603394	5705771
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5693127	5757153	30	30	0.3698	5.44386302105653e-09	5603394	5705771	5.66032140255548e-10	5743767	5774291
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5760826	77917893	22566	21667	-0.0058	5.66032140255548e-10	5743767	5774291	4.50116520168305e-21	77917893	77917893
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.6805	4.50116520168305e-21	77917893	77917893	1.40593491613738e-21	77928738	77928738
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	123957735	16163	15479	-0.0061	1.40593491613738e-21	77928738	77928738	9.00414541166312e-12	123956449	123959854
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	5	-0.9862	9.00414541166312e-12	123956449	123959854	2.68333278944264e-11	123968017	123971172
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	135284109	4044	3887	-0.0269	2.68333278944264e-11	123968017	123971172	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5828251	2180	2092	-0.0058	NA	NA	NA	2.23344421017684e-304	5828251	5828251
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5832681	5839924	6	6	-4.7513	2.23344421017684e-304	5828251	5828251	0	5839924	5839924
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5848930	25561757	7244	6974	-0.0026	0	5839924	5839924	2.11775686269546e-17	25556811	25565913
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25565913	25579086	7	7	-1.032	2.11775686269546e-17	25556811	25565913	1.61719183426930e-18	25577345	25582814
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25582814	55190146	7496	7191	9e-04	1.6171918342693e-18	25577345	25582814	2.20875551437159e-126	55187282	55191277
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55191277	55357866	76	74	-0.8208	2.20875551437159e-126	55187282	55191277	5.37696979052664e-127	55356537	55360801
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55360801	134450318	28295	27142	-0.0054	5.37696979052664e-127	55356537	55360801	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3586	-0.0027	NA	NA	NA	8.14997696820677e-177	9523923	9523923
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	-4.183	8.14997696820677e-177	9523923	9523923	5.42222225562286e-160	9550789	9550789
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	11116883	583	559	-0.0122	5.42222225562286e-160	9550789	9550789	5.39777765848749e-25	11116883	11116883
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.2364	5.39777765848749e-25	11116883	11116883	3.04686508490727e-26	11140421	11140421
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31223465	6831	6567	0.0104	3.04686508490727e-26	11140421	11140421	3.34409980014439e-14	31192445	31237505
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31225941	31298659	31	30	0.4514	3.34409980014439e-14	31192445	31237505	1.47700744265409e-14	31289039	31305068
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	130694393	33317	32011	8e-04	1.47700744265409e-14	31289039	31305068	6.17513247696443e-10	130694393	130694393
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.3515	6.17513247696443e-10	130694393	130694393	5.12451617330982e-09	130701040	130701040
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	626	-0.0128	5.12451617330982e-09	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13489	4e-04	NA	NA	NA	8.523205680956e-12	56607869	56660235
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.5521	8.523205680956e-12	56607869	56660235	3.63276187869979e-07	56679017	56688605
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	56761790	14	14	0.0347	3.63276187869979e-07	56679017	56688605	2.36950067275397e-19	56761790	56766462
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56766462	56788042	11	11	-0.8826	2.36950067275397e-19	56761790	56766462	9.27044081485845e-22	56786692	56790898
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56790898	100690991	13014	12468	0.0159	9.27044081485845e-22	56786692	56790898	6.23648473434203e-09	100690991	100690991
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.3987	6.23648473434203e-09	100690991	100690991	1.71047887697468e-09	100693892	100693892
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4375	-0.0118	1.71047887697468e-09	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	20426824	517	498	-0.0071	NA	NA	NA	5.86065265879417e-30	20411202	20432419
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20430810	20494025	26	26	-0.7207	5.86065265879417e-30	20411202	20432419	6.67717036688858e-33	20488177	20501524
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20495523	105856591	31160	29860	-0.0057	6.67717036688858e-33	20488177	20501524	3.42636899824434e-21	105850033	105856591
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	-1.2091	3.42636899824434e-21	105850033	105856591	1.85031729311491e-15	105881893	105897061
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	169	0.021	1.85031729311491e-15	105881893	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	30084	-0.0086	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10182	-0.0112	NA	NA	NA	6.96055525635705e-53	31854794	32518665
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33536526	43	42	0.6938	6.96055525635705e-53	31854794	32518665	6.58821287967636e-54	33525500	33538171
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	57203733	4293	4116	-0.0163	6.58821287967636e-54	33525500	33538171	1.31903613844406e-07	57203733	57203733
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.234	1.31903613844406e-07	57203733	57203733	1.43282291019215e-07	57206772	57206772
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5405	-0.0023	1.43282291019215e-07	57206772	57206772	1.45138947391985e-46	75093957	75093957
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.4205	1.45138947391985e-46	75093957	75093957	2.89503635948439e-47	75100865	75100865
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	582	-0.0276	2.89503635948439e-47	75100865	75100865	7.22660921019816e-43	76925748	76931247
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.4258	7.22660921019816e-43	76925748	76931247	4.69079971519242e-41	76938723	76940218
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4291	-0.0185	4.69079971519242e-41	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	-0.0121	NA	NA	NA	1.78035530264336e-16	1028979	1028979
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.8789	1.78035530264336e-16	1028979	1028979	3.50474146609460e-18	1030766	1030766
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	12920	-0.0113	3.5047414660946e-18	1030766	1030766	6.23993972094175e-129	36673853	36673853
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.843	6.23993972094175e-129	36673853	36673853	1.56610933236325e-128	36684619	36684619
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41514481	2008	1927	-0.0167	1.56610933236325e-128	36684619	36684619	9.88375049608573e-14	41501967	41518222
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41515622	41568539	25	25	-0.4791	9.88375049608573e-14	41501967	41518222	2.17133813999560e-07	41561017	41579322
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41710400	45	45	-0.8182	2.1713381399956e-07	41561017	41579322	4.18040663577119e-75	41708551	42143048
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13139	-0.0093	4.18040663577119e-75	41708551	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22029	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	15637575	7047	6743	-0.0039	NA	NA	NA	4.89442709744213e-15	15627509	15643585
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15640597	15693617	24	23	0.5145	4.89442709744213e-15	15627509	15643585	1.68627898587203e-15	15688653	15703821
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15697981	56823430	12802	12274	-0.0077	1.68627898587203e-15	15688653	15703821	6.55910047575752e-10	56819531	56823430
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.7249	6.55910047575752e-10	56819531	56823430	8.81608668944266e-10	56840346	56844304
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1136	-0.0097	8.81608668944266e-10	56840346	56844304	1.62238163774283e-19	59414645	59421197
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	0.9342	1.62238163774283e-19	59414645	59421197	7.58086577566611e-20	59434159	59440262
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1910	-0.0066	7.58086577566611e-20	59434159	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	558	-0.0013	NA	NA	NA	1.17297087706523e-118	1506379	1515948
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.4507	1.17297087706523e-118	1506379	1515948	2.73639003887732e-136	1525300	1531162
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20180	-0.0148	2.73639003887732e-136	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12896	-0.0034	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	23975676	3606	3472	-0.0232	NA	NA	NA	8.9042346190458e-50	23962239	23994618
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23991961	24258091	96	91	0.4462	8.9042346190458e-50	23962239	23994618	5.0474436596115e-54	24253162	24268562
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24259822	35472378	5850	5591	-0.023	5.0474436596115e-54	24253162	24268562	1.38762737346334e-15	35472378	35472378
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.6922	1.38762737346334e-15	35472378	35472378	1.11312990859496e-14	35476942	35476942
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	1.11312990859496e-14	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	47767302	6213	6013	-0.0186	NA	NA	NA	4.26475597603472e-07	47764755	47767302
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47774814	47777763	3	3	-1.0108	4.26475597603472e-07	47764755	47767302	5.27108903176247e-07	47777763	47782744
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47782744	49571068	786	757	-0.0094	5.27108903176247e-07	47777763	47782744	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.1854	NA	NA	NA	6.08878147134639e-19	94062	94062
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.8304	6.08878147134639e-19	94062	94062	4.71777738323697e-36	104732	104732
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	16	-0.0253	4.71777738323697e-36	104732	104732	1.06756500247462e-05	122273	127113
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.082	1.06756500247462e-05	122273	127113	2.61807656748654e-12	129104	132689
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	735	0.0399	2.61807656748654e-12	129104	132689	1.7093244587529e-09	1427338	1431240
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9537	1.7093244587529e-09	1427338	1431240	1.77374391092986e-09	1431411	1434970
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	959	-0.008	1.77374391092986e-09	1431411	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22000	0.9648	0	2708113	2711273	3.71226222692497e-13	76998610	76998610
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.5644	3.71226222692497e-13	76998610	76998610	8.18145831647786e-10	77010018	77010018
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	102739100	5351	5128	0.9869	8.18145831647786e-10	77010018	77010018	8.156017861153e-13	102739100	102739100
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	102743700	102744458	2	2	-0.8057	8.156017861153e-13	102739100	102739100	2.27715922679486e-12	102744458	102744458
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	102745673	118917875	5778	5554	0.9716	2.27715922679486e-12	102744458	102744458	1.23319847633240e-13	118914061	118923294
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118918876	118941322	12	12	1.7324	1.2331984763324e-13	118914061	118923294	2.12302363676236e-15	118936862	118942995
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118942995	148437616	8791	8444	0.9717	2.12302363676236e-15	118936862	118942995	4.30078131227666e-07	148428469	148437616
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148452844	148461889	4	4	0.0564	4.30078131227666e-07	148428469	148437616	1.07867572254544e-08	148461889	148461889
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148491866	148653616	47	45	0.9615	1.07867572254544e-08	148461889	148461889	1.86525781492647e-17	148650011	148694272
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148694251	148789720	24	23	1.5936	1.86525781492647e-17	148650011	148694272	1.25793074654370e-18	148775065	148850158
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148835531	154044828	2052	1981	0.922	1.2579307465437e-18	148775065	148850158	9.92109676080465e-17	154038318	154046681
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154046681	154078819	10	9	1.9399	9.92109676080465e-17	154038318	154046681	1.54829108202410e-15	154070179	154079002
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	85	0.9571	1.5482910820241e-15	154070179	154079002	6.6045995101771e-66	154442377	154442377
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.3392	6.6045995101771e-66	154442377	154442377	2.75439948270527e-55	154450309	154450309
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.076	2.75439948270527e-55	154450309	154450309	4.34241735132304e-71	154578922	154586690
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.0042	4.34241735132304e-71	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-3.6256	NA	NA	NA	2.17313204481839e-24	3219200	3772482
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	2.17313204481839e-24	3219200	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.6764	NA	NA	NA	2.04679460251756e-15	5422507	6688691
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	164	-3.2756	2.04679460251756e-15	5422507	6688691	3.28561038997732e-07	7007724	7210018
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	127	-2.4335	3.28561038997732e-07	7007724	7210018	0.402755103895773	7240385	7640681
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7653082	31	30	-3.0049	0.402755103895773	7240385	7640681	0.00239957945359271	7598374	7663037
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.0043	0.00239957945359271	7598374	7663037	2.55472858864343e-07	7705876	7729757
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7914104	67	64	-2.7423	2.55472858864343e-07	7705876	7729757	0.000136865603345210	7828009	8088838
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	368	-3.4207	0.00013686560334521	7828009	8088838	4.59634300247942e-23	10512616	10535786
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-0.6974	4.59634300247942e-23	10512616	10535786	3.93252410010908e-08	11249952	12527445
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	3.93252410010908e-08	11249952	12527445	NA	NA	NA
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12973899	138	132	-2.6988	NA	NA	NA	7.97159315596494e-05	12922667	12982236
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13041812	29	28	-1.5016	7.97159315596494e-05	12922667	12982236	0.0285599107508864	13019119	13100625
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13045641	13129843	35	34	-2.3565	0.0285599107508864	13019119	13100625	2.68122511195977e-12	13106723	13147329
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14358464	415	402	-3.5878	2.68122511195977e-12	13106723	13147329	1.47221265785389e-06	14342834	14361297
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14380301	12	12	-2.144	1.47221265785389e-06	14342834	14361297	4.5427420290613e-10	14379418	14381372
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14404979	11	11	-4.2414	4.5427420290613e-10	14379418	14381372	1.69475145109915e-05	14391767	14411113
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14407293	14436374	19	18	-2.7454	1.69475145109915e-05	14391767	14411113	0.0429629761809697	14415559	14438363
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14438363	14451317	9	8	-3.6773	0.0429629761809697	14415559	14438363	0.0567930284714494	14451317	14554415
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14454048	14585542	66	63	-2.4139	0.0567930284714494	14451317	14554415	3.57210214113469e-06	14538156	14697315
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14587291	15189646	140	135	-3.3949	3.57210214113469e-06	14538156	14697315	5.51315305776201e-05	15169415	15205160
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15191780	15241527	21	21	-2.1121	5.51315305776201e-05	15169415	15205160	2.02280990541898e-05	15221212	15258525
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15915466	254	247	-3.3955	2.02280990541898e-05	15221212	15258525	0.00519055566471217	15573579	16037646
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	98	-2.8962	0.00519055566471217	15573579	16037646	8.5476926153018e-06	16096672	16282623
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	22930737	1098	1055	-3.4866	8.5476926153018e-06	16096672	16282623	1.7520608129643e-38	22924754	23283689
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.0388	1.7520608129643e-38	22924754	23283689	6.8617791063934e-05	26943701	27000085
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.2603	6.8617791063934e-05	26943701	27000085	5.91360512594714e-05	27009433	27069765
MSK_252152915506_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.7036	5.91360512594714e-05	27009433	27069765	NA	NA	NA
