Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26726	-0.0018	NA	NA	NA	6.15630205803437e-94	72537426	72537426
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.744	6.15630205803437e-94	72537426	72537426	1.71161270889775e-95	72579311	72579311
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11203	0.002	1.71161270889775e-95	72579311	72579311	3.82932399177006e-12	110023268	110023268
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110033018	1	0	NA	3.82932399177006e-12	110023268	110023268	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	-1.375	NA	NA	NA	5.00753693000017e-12	110041712	110058441
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150823073	5850	5602	-0.0083	5.00753693000017e-12	110041712	110058441	7.13559265476023e-116	150823073	150836484
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	-2.4195	7.13559265476023e-116	150823073	150836484	1.55136418448612e-52	150846148	150851439
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0616	1.55136418448612e-52	150846148	150851439	1.06090056902749e-09	151024118	151026228
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9182	1.06090056902749e-09	151024118	151026228	9.35030121477902e-07	151036435	151038091
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2567	-6e-04	9.35030121477902e-07	151036435	151038091	1.96322362963882e-27	157133150	157133150
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.5461	1.96322362963882e-27	157133150	157133150	5.48981057532359e-28	157136342	157136342
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31618	-0.0018	5.48981057532359e-28	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11061	-0.0036	NA	NA	NA	4.48756424712235e-29	34542224	34552935
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	4.48756424712235e-29	34542224	34552935	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	17	0.8733	NA	NA	NA	1.63462421939126e-29	34582272	34591681
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	66357387	11754	11251	-0.0028	1.63462421939126e-29	34582272	34591681	5.7573742859463e-09	66357387	66357387
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.4441	5.7573742859463e-09	66357387	66357387	1.86570846042634e-08	66360747	66360747
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	20885	-0.0016	1.86570846042634e-08	66360747	66360747	6.08267945068152e-11	146562545	146571330
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.148	6.08267945068152e-11	146562545	146571330	2.96809375534491e-12	146592775	146592775
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	150320076	999	953	-0.0048	2.96809375534491e-12	146592775	146592775	3.70902879223022e-39	150312704	150329008
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150329008	150380057	22	22	-0.877	3.70902879223022e-39	150312704	150329008	4.84107927901382e-37	150377710	150383423
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150381848	242689978	31728	30422	-4e-04	4.84107927901382e-37	150377710	150383423	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10367	-0.0014	NA	NA	NA	5.74069423813984e-13	32074432	32074432
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.7274	5.74069423813984e-13	32074432	32074432	2.58331903097814e-12	32080848	32080848
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1810	0.0096	2.58331903097814e-12	32080848	32080848	3.35671468928284e-11	37951628	37953375
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37954819	1	0	NA	3.35671468928284e-11	37951628	37953375	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37955930	37961110	5	5	-1.0322	NA	NA	NA	5.71166619067077e-11	37961110	37963014
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	133189686	31022	29711	-0.0025	5.71166619067077e-11	37961110	37963014	3.08390688595218e-66	133189686	133189686
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-3.8619	3.08390688595218e-66	133189686	133189686	3.24775314485143e-68	133194685	133194685
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	143301676	3496	3367	-0.0063	3.24775314485143e-68	133194685	133194685	5.99374184699981e-70	143294587	143305280
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143303337	143570148	99	97	0.5597	5.99374184699981e-70	143294587	143305280	1.81016691618496e-65	143566547	143578018
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143572741	164005577	6185	5959	-0.0034	1.81016691618496e-65	143566547	143578018	2.39586889592385e-17	164005577	164005577
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2841	2.39586889592385e-17	164005577	164005577	1.61410935264708e-17	164027724	164027724
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11620	-0.0033	1.61410935264708e-17	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3251	0.0189	NA	NA	NA	3.62061529680765e-288	9815760	9815760
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.5595	3.62061529680765e-288	9815760	9815760	1.35167889522712e-275	9842644	9842644
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68897538	15033	14416	-0.0042	1.35167889522712e-275	9842644	9842644	2.63525910716566e-16	68893816	68905670
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68899247	69165814	17	17	0.6665	2.63525910716566e-16	68893816	68905670	4.08278167167755e-16	69153675	69656183
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	88752705	6585	6312	0.0012	4.08278167167755e-16	69153675	69656183	2.93485479085955e-17	88752705	88752705
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-2.0014	2.93485479085955e-17	88752705	88752705	3.28756692310906e-17	88756721	88756721
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	173224400	24606	23642	0.0054	3.28756692310906e-17	88756721	88756721	1.7641426543784e-74	173224400	173224400
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.0876	1.7641426543784e-74	173224400	173224400	3.16594403871457e-78	173228860	173228860
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4102	0.0051	3.16594403871457e-78	173228860	173228860	6.42668779450989e-61	187330240	187330240
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.6114	6.42668779450989e-61	187330240	187330240	2.70044091722204e-59	187333619	187333619
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1192	-0.0093	2.70044091722204e-59	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	51608	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11213	0.0035	NA	NA	NA	3.6955512903482e-213	32558677	32588005
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.3799	3.6955512903482e-213	32558677	32588005	4.58684382190015e-210	32626619	32633691
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	79018959	14730	14107	0.0023	4.58684382190015e-210	32626619	32633691	1.83690128996357e-19	79011979	79018959
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	11	-0.9048	1.83690128996357e-19	79011979	79018959	1.88266702532679e-19	79091850	79101978
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26740	-6e-04	1.88266702532679e-19	79091850	79101978	5.42216153995574e-11	165643653	165643653
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165645537	1	0	NA	5.42216153995574e-11	165643653	165643653	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165648188	165650610	3	3	1.325	NA	NA	NA	5.57543983924339e-12	165650610	165650610
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1745	-0.0119	5.57543983924339e-12	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	93162991	28448	27321	0.0019	NA	NA	NA	1.44109016021980e-124	93162991	93162991
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-5.2956	1.4410901602198e-124	93162991	93162991	2.49253514628223e-126	93168978	93168978
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109217320	6511	6244	0.0134	2.49253514628223e-126	93168978	93168978	1.09664582628141e-190	109217320	109217320
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.311	1.09664582628141e-190	109217320	109217320	1.76908337771136e-08	109233214	109233214
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-2.1579	1.76908337771136e-08	109233214	109233214	6.04922166854607e-21	109240210	109240210
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	111727311	1137	1095	-0.0094	6.04922166854607e-21	109240210	109240210	4.05680888131107e-24	111725705	111727311
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111729122	111746764	11	10	-1.0432	4.05680888131107e-24	111725705	111727311	2.11577718596204e-22	111746764	111751162
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111751162	118611324	3151	3020	0.0061	2.11577718596204e-22	111746764	111751162	4.43167208974577e-130	118611324	118611324
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.5503	4.43167208974577e-130	118611324	118611324	1.96239163494239e-140	118620875	118620875
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141690753	10665	10195	0.004	1.96239163494239e-140	118620875	118620875	1.24968652125627e-30	141690753	141690753
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.1807	1.24968652125627e-30	141690753	141690753	1.42588406783656e-28	141714168	141714168
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2402	0.0059	1.42588406783656e-28	141714168	141714168	2.60908508918067e-33	147702365	147702365
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.8251	2.60908508918067e-33	147702365	147702365	8.98482024453567e-33	147707161	147707161
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158815157	4237	4063	-0.0173	8.98482024453567e-33	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158821263	158821263	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7850	4e-04	NA	NA	NA	2.03242837596938e-25	25120552	25120552
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.9556	2.03242837596938e-25	25120552	25120552	2.07563830204819e-24	25125700	25125700
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	31810293	2550	2454	-0.0132	2.07563830204819e-24	25125700	25125700	7.4185221667238e-08	31806677	31810293
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31811829	31815721	3	3	-1.1522	7.4185221667238e-08	31806677	31810293	1.61156014624309e-08	31815721	31817573
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31817573	58076960	6719	6430	0.0048	1.61156014624309e-08	31815721	31817573	9.77375562509427e-16	58075337	58081956
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58081956	58090155	5	5	-1.1943	9.77375562509427e-16	58075337	58081956	3.42947721182793e-15	58088123	58092483
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58092483	144968840	26674	25558	-6e-04	3.42947721182793e-15	58088123	58092483	7.61505044287978e-11	144968840	144968840
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.6133	7.61505044287978e-11	144968840	144968840	2.00304122712769e-08	144970777	144970777
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	430	0.0213	2.00304122712769e-08	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12511	0.0036	NA	NA	NA	7.29631641958754e-10	70926188	70926188
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.5149	7.29631641958754e-10	70926188	70926188	1.9867891137381e-09	70930528	70930528
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	138250679	24122	23104	-0.009	1.9867891137381e-09	70930528	70930528	1.42359663550570e-08	138246907	138250679
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138252639	138253816	2	2	-1.469	1.4235966355057e-08	138246907	138250679	6.93108594361809e-08	138253816	138255962
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138255962	140145683	746	719	-0.0083	6.93108594361809e-08	138253816	138255962	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27036630	9728	9366	-0.0096	NA	NA	NA	1.96337713442240e-93	27036630	27036630
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27038538	27038538	1	0	NA	1.9633771344224e-93	27036630	27036630	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.5364	NA	NA	NA	3.08931886803250e-94	27041812	27041812
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	44513931	4393	4231	-0.0023	3.0893188680325e-94	27041812	27041812	6.99276114911001e-29	44489704	44538786
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44521469	44521469	1	0	NA	6.99276114911001e-29	44489704	44538786	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44529037	44679038	39	38	0.5803	NA	NA	NA	5.69513972595795e-28	44673209	44690319
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44684091	135285645	30644	29401	-0.0039	5.69513972595795e-28	44673209	44690319	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	66463477	21582	20644	0.0015	NA	NA	NA	9.02682266846255e-21	66463477	66463477
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.233	9.02682266846255e-21	66463477	66463477	9.44298324856821e-22	66469412	66469412
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	76670396	3916	3755	-0.006	9.44298324856821e-22	66469412	66469412	3.67081228964623e-08	76665706	76674789
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76671691	76680361	5	5	-0.8893	3.67081228964623e-08	76665706	76674789	3.95892250108004e-08	76673428	76680802
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76680802	134450318	19799	18981	-0.0036	3.95892250108004e-08	76673428	76680802	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	4538227	1918	1850	0.007	NA	NA	NA	6.82725790332225e-08	4536434	4538227
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4539938	4542324	2	2	-1.3947	6.82725790332225e-08	4536434	4538227	5.29398613888341e-08	4542324	4544254
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4544254	9523923	1822	1738	-0.0061	5.29398613888341e-08	4542324	4544254	2.59032388522621e-234	9523923	9523923
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.6206	2.59032388522621e-234	9523923	9523923	3.95923947091432e-33	9554149	9554149
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9626623	12	11	-0.8862	3.95923947091432e-33	9554149	9554149	8.95414155289712e-16	9599999	9628897
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11116883	570	545	-0.0207	8.95414155289712e-16	9599999	9628897	7.77080759528487e-163	11116883	11116883
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-3.4284	7.77080759528487e-163	11116883	11116883	4.40138727557999e-182	11140421	11140421
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	123370406	37781	36229	7e-04	4.40138727557999e-182	11140421	11140421	1.94664157534609e-08	123370406	123370406
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123373377	123374891	2	2	-1.46	1.94664157534609e-08	123370406	123370406	5.18209983997147e-09	123374891	123374891
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123378252	123378252	1	0	NA	5.18209983997147e-09	123374891	123374891	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123379617	130694393	2395	2300	-0.0065	NA	NA	NA	1.30846080317017e-13	130694393	130694393
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.7639	1.30846080317017e-13	130694393	130694393	7.49217197160435e-12	130701040	130701040
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	616	-0.015	7.49217197160435e-12	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13439	-0.0032	NA	NA	NA	3.82204433294483e-15	56610886	56657371
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.6877	3.82204433294483e-15	56610886	56657371	2.59676522058637e-14	56685341	56691355
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	71375082	3622	3476	-3e-04	2.59676522058637e-14	56685341	56691355	2.15788698117331e-79	71375082	71375082
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.3547	2.15788698117331e-79	71375082	71375082	2.60885078371134e-84	71377671	71377671
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13422	-7e-04	2.60885078371134e-84	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	106358491	31885	30500	-0.0075	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.1328	NA	NA	NA	0.00260430070028072	18432558	19382527
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19465359	92	90	0.4511	0.00260430070028072	18432558	19382527	9.53167164449038e-16	19421704	19822150
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	56	0.8989	9.53167164449038e-16	19421704	19822150	2.31277413820181e-87	20060061	20308014
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	21961343	321	310	-0.0104	2.31277413820181e-87	20060061	20308014	1.53374806373604e-12	21961343	21961343
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21982746	21996787	2	2	-1.9135	1.53374806373604e-12	21961343	21961343	4.50481227701728e-15	21996787	21996787
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22021181	74113558	20985	20142	-0.0114	4.50481227701728e-15	21996787	21996787	1.38583554994078e-10	74111325	74115754
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74115754	74133391	5	5	-1.0297	1.38583554994078e-10	74111325	74115754	7.214998497551e-08	74131752	74140287
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	74669752	242	229	-0.0426	7.214998497551e-08	74131752	74140287	3.6957912013329e-07	74665386	74669752
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.0025	3.6957912013329e-07	74665386	74669752	2.99146945032708e-08	74680439	74696702
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	74696127	1	0	NA	2.99146945032708e-08	74680439	74696702	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696702	98232932	8692	8329	-0.0067	NA	NA	NA	1.37568962262189e-08	98228743	98232932
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1807	1.37568962262189e-08	98228743	98232932	5.11022364581707e-09	98239454	98243586
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	873	-0.0261	5.11022364581707e-09	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19701	-0.0013	NA	NA	NA	5.71900615514617e-22	75093957	75093957
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.8434	5.71900615514617e-22	75093957	75093957	4.66773656002491e-23	75100865	75100865
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	589	-0.0431	4.66773656002491e-23	75100865	75100865	4.2066390654452e-61	76925748	76925748
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.8355	4.2066390654452e-61	76925748	76925748	8.34465660958323e-58	76940218	76940218
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4321	-0.0043	8.34465660958323e-58	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	24195451	8969	8575	0.0037	NA	NA	NA	6.17505663122895e-08	24193085	24195451
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	5	-0.8855	6.17505663122895e-08	24193085	24195451	5.43807849342719e-08	24201924	24205913
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	32828797	3447	3313	-0.0129	5.43807849342719e-08	24201924	24205913	2.09191386403147e-101	32828797	32828797
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.7764	2.09191386403147e-101	32828797	32828797	2.00848666396506e-104	32832642	32832642
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1393	-0.0065	2.00848666396506e-104	32832642	32832642	2.83850752545768e-32	36673853	36673853
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36675987	1	0	NA	2.83850752545768e-32	36673853	36673853	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36684619	5	4	-1.8912	NA	NA	NA	1.73731722544986e-31	36684619	36684619
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1920	0.0089	1.73731722544986e-31	36684619	36684619	2.29097655654781e-08	41504832	41526558
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	22	0.4366	2.29097655654781e-08	41504832	41526558	2.93055517165350e-08	41562786	41581624
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	78653545	13724	13125	0.0031	2.9305551716535e-08	41562786	41581624	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15546	-0.0058	NA	NA	NA	3.79429055357784e-67	53092949	53092949
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.8471	3.79429055357784e-67	53092949	53092949	2.51407839403857e-66	53099601	53099601
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6474	-0.0131	2.51407839403857e-66	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	462	0.0122	NA	NA	NA	1.09390974667038e-09	1398325	1398325
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.6283	1.09390974667038e-09	1398325	1398325	4.66227180140433e-09	1400840	1400840
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1006	0.0035	4.66227180140433e-09	1400840	1400840	5.89708228958832e-08	3588389	3591120
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.5207	5.89708228958832e-08	3588389	3591120	3.68762905364958e-09	3593646	3596968
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	63788698	21521	20613	0.007	3.68762905364958e-09	3593646	3596968	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	568	-0.0174	NA	NA	NA	2.02444737490955e-30	1506379	1506379
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	1.2433	2.02444737490955e-30	1506379	1506379	1.83928210315005e-30	1532433	1532433
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20147	-0.0088	1.83928210315005e-30	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12894	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18088300	1113	1072	-0.0125	NA	NA	NA	2.10809494830036e-08	18087057	18088300
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18092255	18093176	2	2	-1.402	2.10809494830036e-08	18087057	18088300	5.47322362471029e-08	18093176	18095689
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18095689	35472378	8437	8087	-0.0046	5.47322362471029e-08	18093176	18095689	4.60108847591628e-39	35472378	35472378
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.995	4.60108847591628e-39	35472378	35472378	4.21088479842989e-39	35476942	35476942
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1136	0.013	4.21088479842989e-39	35476942	35476942	4.13520736450297e-24	37621766	37621766
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.4018	4.13520736450297e-24	37621766	37621766	1.43051698847231e-22	37626069	37626069
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	46105616	4307	4119	-0.0083	1.43051698847231e-22	37626069	37626069	6.41879345602866e-85	46098955	46107446
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	46107446	46244544	59	57	-0.8693	6.41879345602866e-85	46098955	46107446	6.70338420169071e-91	46243510	46247805
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	46247805	49571068	1447	1386	0.004	6.70338420169071e-91	46243510	46247805	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	0.1187	NA	NA	NA	1.09618799125172e-05	122273	127113
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-0.9953	1.09618799125172e-05	122273	127113	6.93617084411491e-09	129104	132689
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	720	-0.0146	6.93617084411491e-09	129104	132689	1.60616632701210e-19	1427392	1431240
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.4624	1.6061663270121e-19	1427392	1431240	2.67175133097052e-17	1432891	1432953
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	950	-0.0444	2.67175133097052e-17	1432891	1432953	0	2708113	2711273
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	56800429	18994	18188	1.0108	0	2708113	2711273	8.22746898939198e-09	56787627	56824123
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56802632	56848661	19	19	0.499	8.22746898939198e-09	56787627	56824123	7.89082755975002e-08	56836621	56867362
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56855445	76998610	3926	3756	0.9975	7.89082755975002e-08	56836621	56867362	3.79956973595461e-71	76998610	76998610
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-3.4728	3.79956973595461e-71	76998610	76998610	3.76402309844701e-75	77010018	77010018
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	111597886	8777	8400	1.0078	3.76402309844701e-75	77010018	77010018	3.27177669341775e-10	111587586	111597886
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111598647	111621331	7	7	0.0988	3.27177669341775e-10	111587586	111597886	4.34651836902198e-11	111621331	111651358
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111641549	134575130	7296	7002	1.0097	4.34651836902198e-11	111621331	111651358	2.15227756689694e-23	134558998	134593094
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134584985	134732880	30	30	1.6405	2.15227756689694e-23	134558998	134593094	1.2640896592331e-22	134661587	134805580
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134801361	154038318	5950	5717	0.9999	1.2640896592331e-22	134661587	134805580	2.38087714563880e-08	154028488	154044828
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	1.6557	2.3808771456388e-08	154028488	154044828	5.17881282211795e-08	154078819	154088378
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	86	0.9845	5.17881282211795e-08	154078819	154088378	3.8712060348534e-52	154442377	154442377
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-2.2716	3.8712060348534e-52	154442377	154442377	8.91430681916917e-90	154450309	154450309
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0426	8.91430681916917e-90	154450309	154450309	7.21174765017837e-54	154578922	154586690
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0532	7.21174765017837e-54	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-4.211	NA	NA	NA	5.98128188182853e-30	3219200	3772482
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5672441	18	18	-1.3483	5.98128188182853e-30	3219200	3772482	7.24768806304175e-19	5531459	6688691
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7051884	172	165	-3.9172	7.24768806304175e-19	5531459	6688691	0.000504179333028532	6971636	7287810
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7997485	282	272	-3.3882	0.000504179333028532	6971636	7287810	8.12476689357435e-12	7827650	8093653
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10515697	371	349	-4.0422	8.12476689357435e-12	7827650	8093653	4.11422544343832e-37	10513747	10515697
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.4257	4.11422544343832e-37	10513747	10515697	4.88416090667938e-09	10645500	11660512
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12999095	154	148	-3.2824	4.88416090667938e-09	10645500	11660512	0.000288509140415976	12953078	13008662
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-1.6913	0.000288509140415976	12953078	13008662	0.000159512629952135	13026029	13054694
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13119344	33	32	-3.1215	0.000159512629952135	13026029	13054694	0.00302730190482327	13111594	13119344
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.2734	0.00302730190482327	13111594	13119344	1.00729500803917e-05	13128515	13129843
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13264329	47	46	-3.6258	1.00729500803917e-05	13128515	13129843	0.0673202361198862	13147329	13402284
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13271228	13649497	162	156	-4.0419	0.0673202361198862	13147329	13402284	4.89631544417226e-06	13606316	13649497
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13699223	7	6	-2.332	4.89631544417226e-06	13606316	13649497	1.60168181698073e-06	13699223	13716000
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14358464	200	189	-4.264	1.60168181698073e-06	13699223	13716000	1.33287046905981e-07	14322984	14411113
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	88	-3.5278	1.33287046905981e-07	14322984	14411113	1.14872953556053e-05	14494397	14549297
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.14872953556053e-05	14494397	14549297	NA	NA	NA
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-2.0468	NA	NA	NA	2.68314175308857e-18	14557473	14587291
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	22139807	1517	1460	-3.9818	2.68314175308857e-18	14557473	14587291	5.30471103500433e-06	22044579	22157319
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1647	5.30471103500433e-06	22044579	22157319	3.22029711229932e-09	22176501	22181855
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	87	-4.177	3.22029711229932e-09	22176501	22181855	1.24716354610089e-55	23283689	26870361
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.2406	1.24716354610089e-55	23283689	26870361	0.000302559538623296	26941769	27006628
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.6679	0.000302559538623296	26941769	27006628	2.16914289304011e-05	27006628	27068911
MSK_252152915508_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.8087	2.16914289304011e-05	27006628	27068911	NA	NA	NA
