Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2188149	426	411	0.0185	NA	NA	NA	2.01909738464450e-06	2176630	2188149
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2192552	2201776	6	6	-0.7126	2.0190973846445e-06	2176630	2188149	6.19632866653405e-07	2201776	2210121
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2204507	16698906	5348	5158	0.023	6.19632866653405e-07	2201776	2210121	3.96891579016462e-15	16654798	16836160
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17171985	37	35	-0.4187	3.96891579016462e-15	16654798	16836160	5.15269877772399e-14	17157415	17195733
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17175973	72537426	22077	21334	0.0104	5.15269877772399e-14	17157415	17195733	7.7090158890978e-66	72537426	72537426
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.4994	7.7090158890978e-66	72537426	72537426	5.5928560377314e-70	72579311	72579311
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	16945	-0.0015	5.5928560377314e-70	72579311	72579311	1.70685895037764e-49	150819879	150819879
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.3155	1.70685895037764e-49	150819879	150819879	3.12511028514321e-43	150852858	150852858
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	74	0.0625	3.12511028514321e-43	150852858	150852858	1.97389890700207e-08	151024118	151026228
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9037	1.97389890700207e-08	151024118	151026228	6.78508020787686e-07	151036435	151038091
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2590	0.0074	6.78508020787686e-07	151036435	151038091	3.21945375089920e-21	157133150	157133150
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.178	3.2194537508992e-21	157133150	157133150	1.90231210008354e-22	157136342	157136342
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1559	0.0082	1.90231210008354e-22	157136342	157136342	3.00070787621488e-10	161099582	161099582
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.4762	3.00070787621488e-10	161099582	161099582	2.88255240865038e-10	161104791	161104791
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	192712721	11193	10816	-3e-04	2.88255240865038e-10	161104791	161104791	6.60733598708239e-13	192710566	192712721
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192715640	192719540	3	3	-1.3427	6.60733598708239e-13	192710566	192712721	2.66066910479925e-12	192719540	192719540
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	466	-0.0069	2.66066910479925e-12	192719540	192719540	0	194978218	194978218
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-4.1613	0	194978218	194978218	0	195065867	195065867
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	246769018	19480	18806	7e-04	0	195065867	195065867	1.26252740292484e-52	246755298	246794552
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	30	-0.8529	1.26252740292484e-52	246755298	246794552	2.05480766058816e-42	246864725	246878405
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	91	0.0051	2.05480766058816e-42	246864725	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20231737	5876	5663	0.0149	NA	NA	NA	1.70496690813717e-13	20231737	20231737
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.6949	1.70496690813717e-13	20231737	20231737	5.25047817022815e-13	20236210	20236210
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	189696849	53316	51484	-0.0011	5.25047817022815e-13	20236210	20236210	4.84220877632504e-30	189696849	189696849
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189698078	189698078	1	0	NA	4.84220877632504e-30	189696849	189696849	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189701934	189715820	9	8	-1.2575	NA	NA	NA	8.28229889328025e-30	189715820	189717889
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189717889	242686945	18622	17989	-2e-04	8.28229889328025e-30	189715820	189717889	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10445	8e-04	NA	NA	NA	3.14593616046681e-60	32074432	32074432
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.4778	3.14593616046681e-60	32074432	32074432	4.6497289800153e-55	32080848	32080848
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	52999601	7863	7585	0.0093	4.6497289800153e-55	32080848	32080848	4.46789338760445e-07	52993253	52999601
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53001678	53011885	6	6	-0.742	4.46789338760445e-07	52993253	52999601	1.23880265262995e-07	53011885	53016261
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	58767266	2422	2332	0.0063	1.23880265262995e-07	53011885	53016261	2.18675120082581e-09	58765745	58767266
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	58773503	58783419	4	4	-1.0043	2.18675120082581e-09	58765745	58767266	2.8787834596942e-09	58783419	58785285
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	58785285	99891210	11090	10731	-0.008	2.8787834596942e-09	58783419	58785285	1.06388961652027e-116	99891210	99891210
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.8302	1.06388961652027e-116	99891210	99891210	1.81062170196144e-114	99897201	99897201
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20641	5e-04	1.81062170196144e-114	99897201	99897201	1.62036631036009e-43	164005577	164009321
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-2.1214	1.62036631036009e-43	164005577	164009321	7.21659965528828e-44	164019640	164027724
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9788	-0.01	7.21659965528828e-44	164019640	164027724	6.28362535978382e-224	194354505	194354505
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.868	6.28362535978382e-224	194354505	194354505	2.69852720466308e-229	194366950	194366950
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	956	0.0084	2.69852720466308e-229	194366950	194366950	1.65850552830627e-56	196820428	196835413
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-1.0335	1.65850552830627e-56	196820428	196835413	2.8744357870507e-49	196929805	196940125
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	931	-0.0256	2.8744357870507e-49	196929805	196940125	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3287	0.0418	NA	NA	NA	1.28733437255432e-179	9815760	9815760
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.3529	1.28733437255432e-179	9815760	9815760	2.09102213880881e-183	9842644	9842644
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14509	-0.0145	2.09102213880881e-183	9842644	9842644	6.37919042647022e-15	68899247	69069651
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.663	6.37919042647022e-15	68899247	69069651	5.76766203612259e-15	69163312	69656183
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	186634563	35145	33980	-0.0101	5.76766203612259e-15	69163312	69656183	5.03885149170164e-19	186632913	186636888
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186636888	186656428	9	9	-0.95	5.03885149170164e-19	186632913	186636888	7.24791185100906e-18	186654935	186659696
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186659696	187445017	370	357	6e-04	7.24791185100906e-18	186654935	186659696	8.71792290413194e-08	187442033	187445017
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187446875	187452796	4	4	-0.9415	8.71792290413194e-08	187442033	187445017	9.71181769349526e-08	187452796	187454266
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187454266	191153613	1186	1148	-0.0199	9.71181769349526e-08	187452796	187454266	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21466144	6347	6139	0.0123	NA	NA	NA	1.93422073890163e-11	21461137	21468587
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21468587	21493505	10	9	-0.729	1.93422073890163e-11	21461137	21468587	6.95561052858384e-12	21488938	21563319
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21559709	180644810	47409	45786	-5e-04	6.95561052858384e-12	21488938	21563319	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10219	0.0034	NA	NA	NA	3.19862995575602e-14	29937319	29980445
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30040917	23	23	0.5186	3.19862995575602e-14	29937319	29980445	1.57089428957722e-13	30026699	30053354
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30046181	32558677	1067	1029	-0.0017	1.57089428957722e-13	30026699	30053354	2.46043434959169e-89	32558677	32563252
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.4222	2.46043434959169e-89	32558677	32563252	1.15463806730372e-97	32590568	32595402
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	72919733	12843	12428	-0.0013	1.15463806730372e-97	32590568	32595402	2.31617929152943e-90	72919733	72919733
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-3.5536	2.31617929152943e-90	72919733	72919733	8.38065436048738e-92	72924440	72924440
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1843	-0.0161	8.38065436048738e-92	72924440	72924440	1.58106230685694e-20	79015901	79018959
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.8577	1.58106230685694e-20	79015901	79018959	1.22401684120729e-20	79091850	79095415
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26980	-0.0076	1.22401684120729e-20	79091850	79095415	6.04586059926566e-35	165643653	165643653
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.8914	6.04586059926566e-35	165643653	165643653	1.21436612811152e-32	165650610	165650610
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1745	0.0307	1.21436612811152e-32	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	37889	-0.0048	NA	NA	NA	8.34389715866745e-10	118609124	118611324
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.2179	8.34389715866745e-10	118609124	118611324	8.53642715030837e-10	118620875	118622742
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141690753	10665	10293	0.0012	8.53642715030837e-10	118620875	118622742	2.43668596664773e-31	141689547	141698634
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.1648	2.43668596664773e-31	141689547	141698634	2.74501149011412e-31	141712786	141720324
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	2.74501149011412e-31	141712786	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2434	0.0028	NA	NA	NA	1.21989785577843e-13	147702365	147702365
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7289	1.21989785577843e-13	147702365	147702365	2.43921552900222e-13	147707161	147707161
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4075	0.01	2.43921552900222e-13	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	0.0634	NA	NA	NA	3.42102034661146e-10	579405	581533
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.6076	3.42102034661146e-10	579405	581533	1.05419895913818e-11	588865	588865
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25022606	8008	7733	0.0056	1.05419895913818e-11	588865	588865	8.12404263381568e-09	25017905	25022606
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.1509	8.12404263381568e-09	25017905	25022606	1.44213126145602e-13	25039370	25039370
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	26	-0.0122	1.44213126145602e-13	25039370	25039370	3.44080646530815e-18	25120552	25120552
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.44080646530815e-18	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.6936	NA	NA	NA	6.1916634150866e-14	25125700	25125700
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	102688379	22771	21988	-0.0081	6.1916634150866e-14	25125700	25125700	4.89454896656987e-16	102686166	102690502
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102690502	102695889	4	4	-1.2938	4.89454896656987e-16	102686166	102690502	3.98704184476974e-15	102693995	102695889
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102697333	146264846	13629	13137	0.0056	3.98704184476974e-15	102693995	102695889	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7560	-0.0117	NA	NA	NA	2.17665505959992e-13	22477358	22477358
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.6493	2.17665505959992e-13	22477358	22477358	5.81154327174436e-12	22492603	22492603
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	140145683	30105	29090	-0.0018	5.81154327174436e-12	22492603	22492603	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	13950	-0.0084	NA	NA	NA	1.693106557121e-29	45464831	46410048
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47943524	122	116	0.321	1.693106557121e-29	45464831	46410048	3.55857602489770e-26	47148030	47975485
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47946216	135285645	30229	29266	0.0058	3.5585760248977e-26	47148030	47975485	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16332	0.0061	NA	NA	NA	1.56343748985555e-35	55112618	55129329
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.6228	1.56343748985555e-35	55112618	55129329	2.73706244836098e-36	55203706	55229096
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27414	0.0063	2.73706244836098e-36	55203706	55229096	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	69138621	23673	22882	0.0023	NA	NA	NA	9.74259245822263e-17	69138621	69138621
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-1.9069	9.74259245822263e-17	69138621	69138621	8.24920441370852e-17	69164231	69164231
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	130694393	20840	20137	-0.0038	8.24920441370852e-17	69164231	69164231	3.78546221429606e-11	130694393	130694393
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5651	3.78546221429606e-11	130694393	130694393	1.24908606447477e-10	130701040	130701040
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	620	-0.0056	1.24908606447477e-10	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11789	-0.005	NA	NA	NA	4.54785855402457e-67	49964838	49964838
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.6703	4.54785855402457e-67	49964838	49964838	3.39511302418904e-65	49971732	49971732
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56646284	1803	1752	0.0164	3.39511302418904e-65	49971732	49971732	1.25282194353088e-18	56607869	56650373
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56650373	56686863	17	16	0.722	1.25282194353088e-18	56607869	56650373	1.02586723550086e-20	56686863	56691355
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	114123340	17603	17014	-0.001	1.02586723550086e-20	56686863	56691355	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5558	0.004	NA	NA	NA	3.71178214370863e-246	34674458	34674458
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-5.8796	3.71178214370863e-246	34674458	34674458	2.27950289844463e-250	34683810	34683810
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	105597555	25889	25003	0.0054	2.27950289844463e-250	34683810	34683810	8.75462707823519e-314	105597555	105602602
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.2959	8.75462707823519e-314	105597555	105602602	5.34122358899303e-79	105630089	105632168
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	49	-0.0018	5.34122358899303e-79	105630089	105632168	0.000411222686998505	105846004	105856972
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	4	-0.7238	0.000411222686998505	105846004	105856972	5.98841735264523e-05	105881893	105900253
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	171	0.0977	5.98841735264523e-05	105881893	105900253	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18432558	3	3	-0.0443	NA	NA	NA	7.81806070784062e-32	18432558	18432558
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18450562	18452491	2	2	0.4192	7.81806070784062e-32	18432558	18432558	0.0039277327962377	18452491	18818949
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19844217	104	103	-0.4013	0.0039277327962377	18452491	18818949	3.46477127099584e-39	19819961	19910696
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	74669752	21602	20838	0.0049	3.46477127099584e-39	19819961	19910696	2.42731254101996e-194	74669752	74669752
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.541	2.42731254101996e-194	74669752	74669752	2.87001308563275e-142	74680439	74680439
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	163	0.0137	2.87001308563275e-142	74680439	74680439	1.86688901799606e-13	75115806	75115806
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.696	1.86688901799606e-13	75115806	75115806	7.95655647373365e-14	75119713	75119713
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98232932	8521	8230	0.0108	7.95655647373365e-14	75119713	75119713	2.33625228388815e-09	98228743	98234519
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1702	2.33625228388815e-09	98228743	98234519	3.4663274115406e-09	98237721	98243586
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	879	0.0156	3.4663274115406e-09	98237721	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19862	-0.0034	NA	NA	NA	2.05044980725902e-24	75093957	75093957
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.3465	2.05044980725902e-24	75093957	75093957	2.09899767273033e-26	75100865	75100865
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76922411	608	588	-0.0141	2.09899767273033e-26	75100865	75100865	1.90322481540065e-56	76922411	76922411
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76923844	76940218	10	9	1.6024	1.90322481540065e-56	76922411	76922411	6.50480806011926e-48	76940218	76940218
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4369	0.0114	6.50480806011926e-48	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	0.0175	NA	NA	NA	1.21744714520158e-09	1028979	1028979
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5026	1.21744714520158e-09	1028979	1028979	9.22998992651766e-10	1030766	1030766
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	16512456	6219	5995	0.0024	9.22998992651766e-10	1030766	1030766	9.03822456725541e-09	16509227	16512456
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16515847	16523708	5	5	-0.9001	9.03822456725541e-09	16509227	16512456	5.93838972415494e-09	16523708	16525075
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16525075	36673853	7228	6975	0.0045	5.93838972415494e-09	16523708	16525075	8.71595559975487e-47	36673853	36673853
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.8383	8.71595559975487e-47	36673853	36673853	1.54197813901784e-44	36684619	36684619
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15205	0.0025	1.54197813901784e-44	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22176	0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	466	0.0096	NA	NA	NA	1.72835485562884e-09	1398325	1398325
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5616	1.72835485562884e-09	1398325	1398325	2.78223586829642e-10	1400840	1400840
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	46944089	15015	14526	-0.0163	2.78223586829642e-10	1400840	1400840	5.17521306975057e-32	46941921	46947599
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46947599	46980811	15	15	0.9753	5.17521306975057e-32	46941921	46947599	1.02417782055232e-32	46978313	46982334
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46982334	63788698	7535	7255	-0.0231	1.02417782055232e-32	46978313	46982334	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	568	0.0132	NA	NA	NA	9.09264842740006e-20	1499421	1511632
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.0146	9.09264842740006e-20	1499421	1511632	1.36255702903457e-22	1531162	1544485
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20262	0.0116	1.36255702903457e-22	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12975	0.0077	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	15913	0.0181	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2324	NA	NA	NA	9.0671638722383e-25	94062	94062
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.5885	9.0671638722383e-25	94062	94062	2.38702326108352e-33	104732	106242
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427392	774	747	-0.083	2.38702326108352e-33	104732	106242	3.27382204269915e-08	1425580	1431411
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1435082	6	6	-0.9081	3.27382204269915e-08	1425580	1431411	1.75402453553346e-07	1432953	1437694
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1437132	2708291	1000	968	-0.0825	1.75402453553346e-07	1432953	1437694	0	2708113	2712641
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3435667	290	278	0.8641	0	2708113	2712641	3.79204791999544e-05	3417180	3443149
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3437084	3453890	8	8	0.1928	3.79204791999544e-05	3417180	3443149	4.29976421840783e-09	3450750	3457521
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3455903	76998610	22641	21868	0.9605	4.29976421840783e-09	3450750	3457521	1.13971947070919e-12	76998610	76998610
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-0.8276	1.13971947070919e-12	76998610	76998610	9.34643626245281e-13	77010018	77010018
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21286	0.9593	9.34643626245281e-13	77010018	77010018	5.05544971691335e-12	154031239	154038318
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078401	10	10	1.7366	5.05544971691335e-12	154031239	154038318	6.2744162476373e-13	154078401	154079002
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078819	154442377	91	86	0.9438	6.2744162476373e-13	154078401	154079002	6.04314169729046e-130	154442377	154442377
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.1048	6.04314169729046e-130	154442377	154442377	2.55689214957614e-148	154450309	154450309
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0111	2.55689214957614e-148	154450309	154450309	1.72195078352394e-57	154578922	154586690
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0459	1.72195078352394e-57	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-4.1948	NA	NA	NA	3.74480016374745e-27	3034907	3773948
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	3.74480016374745e-27	3034907	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8995	NA	NA	NA	1.88283295500606e-16	5422507	6688691
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	168	-3.8523	1.88283295500606e-16	5422507	6688691	3.06398789175083e-06	7009137	7224954
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	155	-3.0302	3.06398789175083e-06	7009137	7224954	7.31606804154132e-08	7630477	7658121
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.5289	7.31606804154132e-08	7630477	7658121	1.02890403756350e-07	7702787	7723783
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7996758	85	82	-3.1701	1.0289040375635e-07	7702787	7723783	6.3074058040383e-08	7893056	8080093
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10513747	371	353	-3.9716	6.3074058040383e-08	7893056	8080093	2.64569602421789e-24	10512616	10515697
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	11	-0.7417	2.64569602421789e-24	10512616	10515697	2.52532110207299e-05	10620136	12502304
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13104920	198	191	-2.9455	2.52532110207299e-05	10620136	12502304	0.00380256026305242	13031576	13109337
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.4565	0.00380256026305242	13031576	13109337	2.56796615696277e-05	13128515	13148290
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13256555	42	40	-3.3773	2.56796615696277e-05	13128515	13148290	0.000941890312848127	13166582	13322865
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13633041	164	160	-4.1678	0.000941890312848127	13166582	13322865	4.42515596944433e-05	13580493	13644667
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13644667	13705594	12	10	-2.5933	4.42515596944433e-05	13580493	13644667	2.59011678026900e-06	13701755	13749720
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14352278	193	185	-4.2657	2.590116780269e-06	13701755	13749720	8.26082250206862e-12	14325320	14382361
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14524829	95	90	-3.2633	8.26082250206862e-12	14325320	14382361	3.58932735228192e-06	14503185	14528771
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	10	-1.1263	3.58932735228192e-06	14503185	14528771	0.0170568894155441	14539230	14572190
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14644293	23	22	-2.8878	0.0170568894155441	14539230	14572190	0.00420619222330821	14557473	14709446
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15928904	409	394	-3.8827	0.00420619222330821	14557473	14709446	5.92024380790141e-06	15642822	16016672
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15932535	16206224	121	117	-3.2472	5.92024380790141e-06	15642822	16016672	5.42416274766938e-12	16176562	16282623
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16212418	22930737	1079	1028	-4.0642	5.42416274766938e-12	16176562	16282623	6.13918162179435e-94	22924754	26870361
MSK_252152915561_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.39	6.13918162179435e-94	22924754	26870361	NA	NA	NA
