Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27082	0.0148	NA	NA	NA	4.88744283862773e-70	72537426	72539143
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.4912	4.88744283862773e-70	72537426	72539143	2.66500847410601e-73	72574479	72579311
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	146294654	16260	15862	-0.0025	2.66500847410601e-73	72574479	72579311	2.72992734888261e-10	146253271	147346371
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147847659	40	39	-0.3495	2.72992734888261e-10	146253271	147346371	2.31649210718614e-11	147460661	148125527
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150818222	1255	1216	0.0084	2.31649210718614e-11	147460661	148125527	2.00281523858816e-05	150811736	150819879
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.6803	2.00281523858816e-05	150811736	150819879	1.69320152854426e-12	150839754	150839754
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150848509	6	4	-3.1958	1.69320152854426e-12	150839754	150839754	1.68330899405043e-97	150848509	150848509
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	200613454	18232	17762	4e-04	1.68330899405043e-97	150848509	150848509	9.74499786369136e-08	200585836	200634858
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200787319	33	32	-0.334	9.74499786369136e-08	200585836	200634858	9.75449287771169e-08	200676505	200810641
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	246794552	17285	16821	0	9.75449287771169e-08	200676505	200810641	1.08173674570536e-45	246769018	246811355
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246805521	1	0	NA	1.08173674570536e-45	246769018	246811355	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246806669	246864725	27	27	-0.8461	NA	NA	NA	3.40481593920339e-36	246862029	246875016
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246875016	247186514	96	93	0.0422	3.40481593920339e-36	246862029	246875016	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10591	0.0018	NA	NA	NA	7.55963873914212e-105	33076512	33076512
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.606	7.55963873914212e-105	33076512	33076512	1.06659668500747e-103	33080437	33080437
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	146571330	34196	33244	-0.0028	1.06659668500747e-103	33080437	33080437	3.01911500589416e-250	146571330	146571330
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.0469	3.01911500589416e-250	146571330	146571330	2.32092017042789e-249	146592775	146592775
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242501239	32682	31810	-0.0038	2.32092017042789e-249	146592775	146592775	5.33072834229991e-92	242493814	242506262
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242682950	65	62	-0.7849	5.33072834229991e-92	242493814	242506262	0.00785394911368587	242665255	242682950
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242686945	242689978	2	2	0.0187	0.00785394911368587	242665255	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	32074432	10795	10521	-0.0065	NA	NA	NA	1.63064614791117e-67	32074432	32074432
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.6747	1.63064614791117e-67	32074432	32074432	2.21577445016235e-64	32080848	32080848
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99891210	21385	20797	3e-04	2.21577445016235e-64	32080848	32080848	7.95792804537391e-113	99891210	99891210
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.8505	7.95792804537391e-113	99891210	99891210	6.90801135769673e-114	99897201	99897201
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	150748947	17036	16619	-0.0027	6.90801135769673e-114	99897201	99897201	4.40743914777667e-107	150748947	150748947
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-4.7048	4.40743914777667e-107	150748947	150748947	1.39007655406823e-113	150752600	150752600
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	163992903	4265	4150	-0.0076	1.39007655406823e-113	150752600	150752600	5.95079002398972e-53	163989367	164001657
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164112873	29	28	0.8587	5.95079002398972e-53	163989367	164001657	1.18936057794879e-49	164105613	164121847
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	164115417	1	0	NA	1.18936057794879e-49	164105613	164121847	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164121847	199329592	12114	11797	-0.0044	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17944	-1e-04	NA	NA	NA	3.1838063199637e-13	68897538	69075140
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69163312	13	13	0.661	3.1838063199637e-13	68897538	69075140	1.21549620979182e-13	69144974	69665979
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69165814	69165814	1	0	NA	1.21549620979182e-13	69144974	69665979	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	190772330	36616	35660	-0.0053	NA	NA	NA	9.24590695797372e-22	190754887	190799265
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190921041	53	52	-0.4207	9.24590695797372e-22	190754887	190799265	3.42243104354531e-06	190887201	190953947
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	44	-0.0449	3.42243104354531e-06	190887201	190953947	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180194323	53645	52305	-0.0032	NA	NA	NA	1.66512340178608e-09	180194323	180194323
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180346557	3	3	-1.1984	1.66512340178608e-09	180194323	180194323	5.72919746701829e-29	180346557	180346557
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-5.2655	5.72919746701829e-29	180346557	180346557	1.58217485027417e-264	180358977	180358977
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	0.0092	1.58217485027417e-264	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29966336	10589	10273	-0.0012	NA	NA	NA	2.46036242261978e-09	29931329	29981912
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	30049982	23	23	0.4168	2.46036242261978e-09	29931329	29981912	3.9811208232349e-07	30030032	30067650
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30052053	32558677	1065	1041	0.0448	3.9811208232349e-07	30030032	30067650	1.61891105277895e-65	32558677	32588005
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	1.4331	1.61891105277895e-65	32558677	32588005	4.3447418824344e-10	32609525	32634977
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	0.1603	4.3447418824344e-10	32609525	32634977	0.000138948640455212	32703109	32728285
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	12	0.7475	0.000138948640455212	32703109	32728285	1.73559875591956e-15	32732764	32745036
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	74647491	13544	13151	7e-04	1.73559875591956e-15	32732764	32745036	6.01431870672379e-53	74647491	74647491
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-2.7126	6.01431870672379e-53	74647491	74647491	1.69071131506831e-52	74655219	74655219
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	103841482	7916	7714	-0.0066	1.69071131506831e-52	74655219	74655219	2.38958860571912e-09	103827105	103841482
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0103	2.38958860571912e-09	103827105	103841482	1.51076960966150e-09	103868154	103873584
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20557	-0.0086	1.5107696096615e-09	103868154	103873584	3.73590683832935e-09	165642393	165643653
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.9911	3.73590683832935e-09	165642393	165643653	9.25607508927235e-09	165650610	165653315
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1766	-0.0131	9.25607508927235e-09	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	5842988	2112	2056	0.0372	NA	NA	NA	4.80057777305496e-07	5836803	5842988
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5848555	5851216	2	2	-1.1808	4.80057777305496e-07	5836803	5842988	1.01534983917011e-05	5851216	5856032
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5856032	118611324	37151	36124	-0.0015	1.01534983917011e-05	5851216	5856032	1.24839944292967e-07	118605955	118620875
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118645208	9	8	0.6651	1.24839944292967e-07	118605955	118620875	7.4820323983267e-08	118629597	118653907
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118649408	125831554	3164	3091	-0.0115	7.4820323983267e-08	118629597	118653907	1.53520955382591e-134	125831554	125831554
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.4346	1.53520955382591e-134	125831554	125831554	2.37227747925597e-133	125837524	125837524
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3542	0.0037	2.37227747925597e-133	125837524	125837524	1.77569629823605e-07	133419940	133436265
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	10	0.5998	1.77569629823605e-07	133419940	133436265	7.56906853854828e-08	133453811	133463680
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141409512	3697	3603	0.0068	7.56906853854828e-08	133453811	133463680	3.80323552434292e-09	141402937	141419692
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141410894	1	0	NA	3.80323552434292e-09	141402937	141419692	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5668	NA	NA	NA	5.25171537356566e-08	141431668	141443577
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	114	-0.0022	5.25171537356566e-08	141431668	141443577	5.33528906917916e-157	141690753	141690753
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-3.8235	5.33528906917916e-157	141690753	141690753	0.00994043661049047	141703062	141711513
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141714168	2	2	-1.7112	0.00994043661049047	141703062	141711513	7.13401901400485e-13	141714168	141714168
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	7.13401901400485e-13	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2457	0	NA	NA	NA	1.71667585155913e-10	147699576	147702365
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147708382	3	3	-1.2674	1.71667585155913e-10	147699576	147702365	2.98674991662900e-10	147708382	147708382
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	158821263	4237	4127	4e-04	2.986749916629e-10	147708382	147708382	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.017	NA	NA	NA	1.75764867851278e-08	579405	581533
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3402	1.75764867851278e-08	579405	581533	3.49138647968762e-09	588865	588865
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2217	-0.0067	3.49138647968762e-09	588865	588865	6.13086400639259e-39	7226901	7260442
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-1.3587	6.13086400639259e-39	7226901	7260442	3.55040728092572e-34	7790934	7824059
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5583	-0.0074	3.55040728092572e-34	7790934	7824059	5.95530828043383e-123	25022606	25022606
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-4.1711	5.95530828043383e-123	25022606	25022606	1.92044240716820e-129	25039370	25039370
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	40892587	5442	5306	-0.0037	1.9204424071682e-129	25039370	25039370	3.14919258735620e-117	40892587	40892587
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.8404	3.1491925873562e-117	40892587	40892587	4.8637427940166e-113	40897469	40897469
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30134	2e-04	4.8637427940166e-113	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7643	-0.0081	NA	NA	NA	2.99847636971747e-09	22473542	22477358
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.3946	2.99847636971747e-09	22473542	22477358	3.46703238366335e-11	22492603	22492603
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	159	0.002	3.46703238366335e-11	22492603	22492603	7.37250471020986e-115	23343915	23343915
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.7165	7.37250471020986e-115	23343915	23343915	8.58445389349538e-102	23365926	23365926
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	23377660	1	0	NA	8.58445389349538e-102	23365926	23365926	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23395558	70926188	5068	4911	-0.0035	NA	NA	NA	6.17572535835453e-30	70926188	70926188
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4888	6.17572535835453e-30	70926188	70926188	2.10224314106691e-29	70930528	70930528
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9659	-0.0096	2.10224314106691e-29	70930528	70930528	2.78183820062954e-14	100348045	100348045
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.7602	2.78183820062954e-14	100348045	100348045	7.43502123253572e-14	100350814	100350814
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	137352394	13844	13496	8e-04	7.43502123253572e-14	100350814	100350814	2.65978242005111e-16	137352394	137352394
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.9022	2.65978242005111e-16	137352394	137352394	6.20319458890053e-14	137356880	137356880
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1070	0.0137	6.20319458890053e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9469	-0.0091	NA	NA	NA	1.35909196906315e-90	27038538	27038538
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.2528	1.35909196906315e-90	27038538	27038538	8.03148620688364e-86	27041812	27041812
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14462	-0.0027	8.03148620688364e-86	27041812	27041812	1.45151632863438e-46	77917893	77917893
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.1462	1.45151632863438e-46	77917893	77917893	1.17503377128645e-45	77928669	77928669
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19685	-0.0017	1.17503377128645e-45	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	84939605	28265	27501	0.0052	NA	NA	NA	2.95868810711237e-07	84931602	84945450
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84942392	1	0	NA	2.95868810711237e-07	84931602	84945450	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84944002	84951675	5	5	-0.8312	NA	NA	NA	1.29314087336584e-07	84948577	84961098
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	134450318	17033	16612	-0.0025	1.29314087336584e-07	84948577	84961098	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11395862	4406	4300	0.0031	NA	NA	NA	1.31174886696764e-12	11393473	11419189
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.0542	1.31174886696764e-12	11393473	11419189	1.92332590045623e-12	11433210	11440927
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	132289090	40749	39674	0.0024	1.92332590045623e-12	11433210	11440927	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7144	-0.0112	NA	NA	NA	1.24563694695786e-132	37953582	37953582
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-5.2208	1.24563694695786e-132	37953582	37953582	1.05899005961608e-135	37957844	37957844
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4741	-0.0047	1.05899005961608e-135	37957844	37957844	2.23297828295064e-18	49964838	49964838
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9585	2.23297828295064e-18	49964838	49964838	7.69545984050113e-17	49971732	49971732
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1764	0	7.69545984050113e-17	49971732	49971732	2.74451906247916e-17	56610886	56657371
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.7227	2.74451906247916e-17	56610886	56657371	2.14405311853061e-20	56681665	56688605
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68142120	2694	2613	-0.0119	2.14405311853061e-20	56681665	56688605	1.19059745513338e-17	68138912	68146755
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	10	-0.8502	1.19059745513338e-17	68138912	68146755	1.00257975220512e-16	68160625	68167758
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	892	-0.0078	1.00257975220512e-16	68160625	68167758	2.49321127654063e-79	71375082	71375082
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.0506	2.49321127654063e-79	71375082	71375082	6.71010722756534e-81	71377671	71377671
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13603	-0.0073	6.71010722756534e-81	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.169	NA	NA	NA	0.0457537505554394	18537177	19442895
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.6973	0.0457537505554394	18537177	19442895	1.541056895821e-60	19484013	19497023
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	69086125	17568	17108	-0.0049	1.541056895821e-60	19484013	19497023	2.8384506725667e-07	69083716	69088190
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69097052	6	6	0.7424	2.8384506725667e-07	69083716	69088190	3.16012563461696e-07	69095909	69100795
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69098569	70215258	508	498	-0.007	3.16012563461696e-07	69095909	69100795	6.70022457633981e-10	70212780	70215258
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	70218394	70232826	7	7	-0.8142	6.70022457633981e-10	70212780	70215258	6.57533821274454e-10	70232826	70237785
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	70234828	105850033	13553	13192	0.0034	6.57533821274454e-10	70232826	70237785	0.00562233631719677	105838104	105850033
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105874293	4	3	0.746	0.00562233631719677	105838104	105850033	2.34027022720014e-18	105874293	105874293
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105875924	105881893	3	3	1.1451	2.34027022720014e-18	105874293	105874293	4.42565336789733e-08	105881893	105897061
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105945006	15	14	-0.0292	4.42565336789733e-08	105881893	105897061	0.000146102733775964	105919618	105961558
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	18	-0.5683	0.000146102733775964	105919618	105961558	2.35544535639333e-08	105989160	106028863
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106221696	92	90	-0.0132	2.35544535639333e-08	105989160	106028863	1.59176178807587e-06	106209063	106223137
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106255190	15	15	0.4927	1.59176178807587e-06	106209063	106223137	3.96123650166658e-06	106251081	106269748
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	34	0.0677	3.96123650166658e-06	106251081	106269748	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19421704	94	90	-0.1793	NA	NA	NA	2.94127169235687e-07	19401331	19430207
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	19835471	13	13	-0.7097	2.94127169235687e-07	19401331	19430207	1.03670390422300e-27	19835471	19835471
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-3.1641	1.036703904223e-27	19835471	19835471	1.30560687509007e-18	19844217	19844217
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20088256	47	45	-0.6917	1.30560687509007e-18	19844217	19844217	1.34606221229065e-49	20060061	20308014
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	21004	-0.002	1.34606221229065e-49	20060061	20308014	1.90207502908190e-155	74669752	74669752
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.0712	1.9020750290819e-155	74669752	74669752	6.26640021129628e-93	74680439	74680439
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	160	7e-04	6.26640021129628e-93	74680439	74680439	2.52773267459675e-08	75115806	75115806
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.6133	2.52773267459675e-08	75115806	75115806	1.92243554457253e-11	75119713	75119713
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9185	-0.0045	1.92243554457253e-11	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14519	0.0127	NA	NA	NA	3.74058123246321e-35	57203733	57203733
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.7784	3.74058123246321e-35	57203733	57203733	3.02581404545053e-36	57206772	57206772
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5448	0.0057	3.02581404545053e-36	57206772	57206772	1.03377691039969e-28	75093957	75093957
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.0342	1.03377691039969e-28	75093957	75093957	3.30219424661123e-32	75100865	75100865
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.0273	3.30219424661123e-32	75100865	75100865	1.24394629566438e-16	76923844	76931247
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8871	1.24394629566438e-16	76923844	76931247	3.30006458997397e-13	76937156	76944661
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4398	9e-04	3.30006458997397e-13	76937156	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	412	0.0532	NA	NA	NA	4.60790691627987e-09	1028979	1028979
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5014	4.60790691627987e-09	1028979	1028979	3.03981222893138e-09	1030766	1030766
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	13058	0.0152	3.03981222893138e-09	1030766	1030766	5.70114260662479e-55	36673853	36673853
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.0378	5.70114260662479e-55	36673853	36673853	3.39421649506910e-52	36684619	36684619
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1965	0.033	3.3942164950691e-52	36684619	36684619	4.88728573427321e-18	41515622	41522429
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41568539	21	21	-0.6057	4.88728573427321e-18	41515622	41522429	3.38073040821094e-05	41553226	41574775
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41621474	25	24	-0.9531	3.38073040821094e-05	41553226	41574775	8.82984943623233e-05	41604772	41632724
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41624013	41710400	20	20	-0.6446	8.82984943623233e-05	41604772	41632724	1.77818279343509e-19	41708551	42147225
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13280	0.0179	1.77818279343509e-19	41708551	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22380	-0.0091	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56825794	19874	19349	0.0333	NA	NA	NA	6.94007405611754e-10	56822197	56825794
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.8007	6.94007405611754e-10	56822197	56825794	1.00835922355097e-10	56840346	56842447
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	576	0.0305	1.00835922355097e-10	56840346	56842447	1.21458269452707e-05	58197961	58219286
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.4225	1.21458269452707e-05	58197961	58219286	2.09822361798989e-05	58231301	58259101
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	59414898	575	557	0.0284	2.09822361798989e-05	58231301	58259101	1.04128895200205e-27	59414645	59421197
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-1.1015	1.04128895200205e-27	59414645	59421197	5.04630719654085e-27	59434159	59440262
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1930	0.0162	5.04630719654085e-27	59434159	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	-1e-04	NA	NA	NA	9.47349299333247e-94	1506379	1516966
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1525300	7	6	-2.855	9.47349299333247e-94	1506379	1516966	2.00925294780525e-113	1521410	1525300
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	62419534	20986	20406	0.0018	2.00925294780525e-113	1521410	1525300	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13091	-0.0046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2913	0.0294	NA	NA	NA	8.3852947083586e-310	22667608	22679305
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	18	-3.0423	8.3852947083586e-310	22667608	22679305	0	22713972	22721042
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	35472378	6548	6336	0.0147	0	22713972	22721042	1.71182262128316e-60	35472378	35472378
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.6251	1.71182262128316e-60	35472378	35472378	1.64610199061198e-55	35476942	35476942
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6796	0.0209	1.64610199061198e-55	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	769	2e-04	NA	NA	NA	8.13721310463553e-08	1427338	1431240
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9133	8.13721310463553e-08	1427338	1431240	8.93152217348248e-07	1432891	1434970
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	979	-6e-04	8.93152217348248e-07	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154046681	45003	43753	0.9809	0	2708113	2711273	1.35010263895653e-15	154038318	154046681
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154047749	154079002	10	10	1.8771	1.35010263895653e-15	154038318	154046681	1.20496899867681e-13	154079002	154086636
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	87	0.9341	1.20496899867681e-13	154079002	154086636	2.27514544331217e-42	154442377	154442377
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	2	-2.5716	2.27514544331217e-42	154442377	154442377	1.76657539101379e-106	154450309	154450309
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0287	1.76657539101379e-106	154450309	154450309	5.49221920774655e-63	154582414	154586690
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0094	5.49221920774655e-63	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	117	-4.1647	NA	NA	NA	1.54671835108127e-29	2973379	3223585
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	18	-1.291	1.54671835108127e-29	2973379	3223585	2.86081409876585e-09	4948824	6711090
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.5686	2.86081409876585e-09	4948824	6711090	8.9873711903965e-05	6995017	7229089
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	118	-2.7317	8.9873711903965e-05	6995017	7229089	0.206436561484307	7244216	7630477
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7653082	38	37	-3.4658	0.206436561484307	7244216	7630477	0.124687799661357	7481187	7668917
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.2416	0.124687799661357	7481187	7668917	6.62349967357253e-07	7702787	7731490
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8043008	92	90	-3.0453	6.62349967357253e-07	7702787	7731490	9.29568846969232e-07	7905286	8186463
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8047462	8047462	1	0	NA	9.29568846969232e-07	7905286	8186463	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8048263	10513747	363	352	-3.7769	NA	NA	NA	2.33346563477453e-30	10512616	10515697
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	18	-0.7342	2.33346563477453e-30	10512616	10515697	2.13310251319188e-07	11660512	12532441
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12999095	148	145	-2.8982	2.13310251319188e-07	11660512	12532441	9.98790556681378e-05	12965878	13008662
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13045641	20	20	-1.2348	9.98790556681378e-05	12965878	13008662	0.00122305479365083	13032760	13077621
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13048283	13129843	34	32	-2.5786	0.00122305479365083	13032760	13077621	0.0295508981017089	13080405	13175367
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13272362	48	47	-3.4862	0.0295508981017089	13080405	13175367	0.00376020283532123	13153117	13342125
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	14122129	329	312	-4.0662	0.00376020283532123	13153117	13342125	1.14591411217478e-09	14091543	14338189
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14508021	127	122	-3.3506	1.14591411217478e-09	14091543	14338189	2.61617993824802e-09	14498784	14530328
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.61617993824802e-09	14498784	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.5956	NA	NA	NA	4.22192848758702e-06	14563486	14579298
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.3286	4.22192848758702e-06	14563486	14579298	1.08405706758273e-19	14598838	14598838
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-1.0126	1.08405706758273e-19	14598838	14598838	1.02660681200640e-05	14644293	14684159
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14708015	20	20	-3.294	1.0266068120064e-05	14644293	14684159	0.000374249768156582	14700040	14727064
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14709446	14883615	36	36	-4.3338	0.000374249768156582	14700040	14727064	0.000120886513970026	14836085	15032971
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15299931	138	137	-3.3431	0.000120886513970026	14836085	15032971	9.39901939157548e-08	15273305	15311814
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15301380	1	0	NA	9.39901939157548e-08	15273305	15311814	NA	NA	NA
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15303557	15396500	58	56	-4.3693	NA	NA	NA	0.000471434732186572	15379192	15447091
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15396880	15915466	154	148	-3.6244	0.000471434732186572	15379192	15447091	0.0151788309792000	15566377	16067790
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16182565	108	104	-3.0854	0.0151788309792	15566377	16067790	3.5415369025057e-09	16143653	16218742
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	17487972	228	219	-3.9706	3.5415369025057e-09	16143653	16218742	1.30045871169705e-05	17445037	17513494
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17566412	13	13	-2.3743	1.30045871169705e-05	17445037	17513494	6.89021925650503e-06	17530333	17618503
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17583495	21036503	484	470	-3.95	6.89021925650503e-06	17530333	17618503	1.12974972832130e-07	21035621	21042490
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.333	1.1297497283213e-07	21035621	21042490	3.68986739744848e-08	21047798	21054605
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21497583	140	138	-3.9034	3.68986739744848e-08	21047798	21054605	5.45849735699011e-05	21478199	21497583
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-1.5111	5.45849735699011e-05	21478199	21497583	3.78543191028768e-05	21559551	21601101
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22139807	117	112	-3.9003	3.78543191028768e-05	21559551	21601101	1.32090070093540e-06	22051284	22157319
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0738	1.3209007009354e-06	22051284	22157319	2.61760628558443e-08	22177335	22181855
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-4.1567	2.61760628558443e-08	22177335	22181855	5.4334471764973e-60	22926726	26870361
MSK_252152915562_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.2789	5.4334471764973e-60	22926726	26870361	NA	NA	NA
