Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	63073032	24150	23304	0.0023	NA	NA	NA	1.43020106159791e-08	63067406	63073032
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63074345	63084274	6	6	-0.8709	1.43020106159791e-08	63067406	63073032	1.18819467121486e-09	63084274	63085866
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63085866	72537426	3738	3602	0.0018	1.18819467121486e-09	63084274	63085866	1.34091435829783e-124	72537426	72541443
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-2.1086	1.34091435829783e-124	72537426	72541443	3.09414609584484e-127	72568009	72579311
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11318	0.0104	3.09414609584484e-127	72568009	72579311	3.42469939355227e-14	110023268	110023268
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	3	-1.4889	3.42469939355227e-14	110023268	110023268	8.95629963904543e-14	110041712	110041712
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	146297175	4554	4395	-0.0078	8.95629963904543e-14	110041712	110041712	6.34163973470496e-25	146283719	147308557
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	148081741	40	36	-0.5793	6.34163973470496e-25	146283719	147308557	3.41621135737033e-25	147508217	148088434
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150823073	1256	1210	0.0062	3.41621135737033e-25	147508217	148088434	4.5660594133933e-97	150823073	150836481
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	-2.1752	4.5660594133933e-97	150823073	150836481	4.55450894162457e-99	150848509	150851439
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2664	-0.0021	4.55450894162457e-99	150848509	150851439	1.83986579493983e-21	157133150	157133150
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.263	1.83986579493983e-21	157133150	157133150	2.77695729519719e-21	157136342	157136342
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	157278016	54	52	-0.0308	2.77695729519719e-21	157136342	157136342	2.57845334099034e-08	157275381	157278016
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157280738	157286510	3	3	-1.1406	2.57845334099034e-08	157275381	157278016	4.81549846142934e-08	157286510	157287924
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157287924	167483267	4051	3898	-0.0101	4.81549846142934e-08	157286510	157287924	0	167483267	167483267
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.593	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6952	0.003	0	167507898	167507898	2.53882297220071e-21	185979586	185979586
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.2661	2.53882297220071e-21	185979586	185979586	2.54665306756122e-22	185988138	185988138
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1452	0.0358	2.54665306756122e-22	185988138	185988138	6.78578070994951e-30	192715640	192715640
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-2.5974	6.78578070994951e-30	192715640	192715640	5.59572678756974e-29	192719540	192719540
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	247186514	20090	19403	-0.0014	5.59572678756974e-29	192719540	192719540	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	89377705	30309	29314	-0.0043	NA	NA	NA	1.21666420622318e-29	89315203	89387596
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89379689	89750144	33	32	-0.6569	1.21666420622318e-29	89315203	89387596	0.000200776140339903	89742890	89755931
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89750929	89877995	10	9	-1.218	0.000200776140339903	89742890	89755931	1.43688326073602e-07	89872767	89877995
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89879264	91151411	12	12	-0.6306	1.43688326073602e-07	89872767	89877995	1.40653122635710e-09	91151411	91168837
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91155301	146571330	14710	14216	-0.0023	1.4065312263571e-09	91151411	91168837	1.07526980348412e-09	146562545	146571330
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.092	1.07526980348412e-09	146562545	146571330	8.93612496542006e-10	146592775	146597405
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	167878095	6625	6360	0.0059	8.93612496542006e-10	146592775	146597405	1.04336777752907e-08	167878095	167878095
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167882675	167888640	2	2	-1.4488	1.04336777752907e-08	167878095	167878095	1.04567241590558e-08	167888640	167888640
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167899155	203889616	12098	11673	0.0058	1.04567241590558e-08	167888640	167888640	6.8560058492329e-11	203886922	203889616
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203892886	203898334	4	4	-1.1351	6.8560058492329e-11	203886922	203889616	2.60743552930641e-10	203898334	203900226
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	203900226	242689978	14020	13558	-5e-04	2.60743552930641e-10	203898334	203900226	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	120210665	38363	37090	0.0052	NA	NA	NA	8.40898424538806e-34	120201491	120212509
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	120212509	120302339	29	27	0.7678	8.40898424538806e-34	120201491	120212509	3.1143221552707e-34	120300137	120306710
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	120305244	164005577	15099	14587	-1e-04	3.1143221552707e-34	120300137	120306710	2.37716588499786e-16	164001657	164005577
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2479	2.37716588499786e-16	164001657	164005577	1.85406318571294e-16	164027724	164036648
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11706	0.0017	1.85406318571294e-16	164027724	164036648	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3271	0.0028	NA	NA	NA	6.62375041598083e-227	9815760	9815760
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.2515	6.62375041598083e-227	9815760	9815760	1.09575756170739e-248	9842644	9842644
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	41879393	8768	8446	0.0025	1.09575756170739e-248	9842644	9842644	2.58496166485321e-13	41871162	41879393
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	41883459	41915977	5	5	-1.1123	2.58496166485321e-13	41871162	41879393	4.23061529053875e-13	41915977	41922220
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	41922220	173224400	37470	36181	0.0098	4.23061529053875e-13	41915977	41922220	1.36116052091579e-68	173224400	173224400
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.9269	1.36116052091579e-68	173224400	173224400	4.37851602742269e-66	173228860	173228860
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	185	0.0172	4.37851602742269e-66	173228860	173228860	1.47015172655542e-17	173660684	173660684
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.0336	1.47015172655542e-17	173660684	173660684	2.84692145751819e-18	173666072	173666072
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5145	0.0056	2.84692145751819e-18	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	97060205	27471	26537	0.0012	NA	NA	NA	1.22693912522976e-16	97057534	97096177
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97155429	12	12	-0.8041	1.22693912522976e-16	97057534	97096177	1.79665532180279e-16	97119376	97161142
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97161142	140200229	12595	12152	0.0017	1.79665532180279e-16	97119376	97161142	1.69724446210241e-09	140195260	140204823
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140219465	10	10	-0.6789	1.69724446210241e-09	140195260	140204823	2.89913184465059e-09	140213216	140226256
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	180644810	13678	13198	-0.0016	2.89913184465059e-09	140213216	140226256	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	186875	37	36	-0.0108	NA	NA	NA	5.84626421795602e-07	176670	202063
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	191387	241674	20	19	-0.452	5.84626421795602e-07	176670	202063	4.56354214524513e-08	234115	252939
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	32558677	11620	11240	0.0017	4.56354214524513e-08	234115	252939	1.98657554151047e-28	32548736	32558677
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	1.3601	1.98657554151047e-28	32548736	32558677	1.22945115200381e-08	32595402	32597877
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	0.0315	1.22945115200381e-08	32595402	32597877	0.00056854177790846	32613538	32628420
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32634977	4	4	1.055	0.00056854177790846	32613538	32628420	5.23585789528664e-09	32634977	32650672
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	65767409	10695	10322	0.0021	5.23585789528664e-09	32634977	32650672	2.85169591609649e-08	65767409	65767409
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.4293	2.85169591609649e-08	65767409	65767409	1.45550760827584e-08	65771532	65771532
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	65778663	1	0	NA	1.45550760827584e-08	65771532	65771532	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65780036	103841482	10806	10436	0.01	NA	NA	NA	1.55788544244749e-11	103810611	103841482
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103860573	3	3	1.3598	1.55788544244749e-11	103810611	103841482	2.42293395211865e-11	103860573	103868154
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103868154	165643653	21107	20374	0.0046	2.42293395211865e-11	103860573	103868154	2.14909757238755e-31	165643653	165643653
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.911	2.14909757238755e-31	165643653	165643653	2.42038087161505e-31	165650610	165650610
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1737	-0.0173	2.42038087161505e-31	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	141687978	49931	48235	0.0068	NA	NA	NA	5.02093047117261e-29	141686875	141690753
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141689547	141714168	12	12	1.0769	5.02093047117261e-29	141686875	141690753	1.14460510764214e-28	141711513	141720303
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	151728811	4144	4003	4e-04	1.14460510764214e-28	141711513	141720303	1.53013296077244e-08	151724590	151732266
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.7351	1.53013296077244e-08	151724590	151732266	6.75002084654967e-08	151739173	151747905
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2522	-0.0211	6.75002084654967e-08	151739173	151747905	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	109	-0.0232	NA	NA	NA	1.95513199816899e-08	579405	581533
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.3553	1.95513199816899e-08	579405	581533	2.35931276516465e-07	588865	591112
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12498	-0.0039	2.35931276516465e-07	588865	591112	1.28576359087973e-108	39345557	39352361
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.9321	1.28576359087973e-108	39345557	39352361	6.20211573645488e-92	39504332	39508035
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	428	0.0311	6.20211573645488e-92	39504332	39508035	6.1850835479502e-88	40892587	40892587
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.2983	6.1850835479502e-88	40892587	40892587	9.7363026150075e-81	40897469	40897469
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29907	0.0069	9.7363026150075e-81	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7553	0.0067	NA	NA	NA	1.89002485496428e-11	22477358	22477358
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.6413	1.89002485496428e-11	22477358	22477358	2.15478656175915e-14	22492603	22492603
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	154	0.0162	2.15478656175915e-14	22492603	22492603	5.43014965802789e-171	23343915	23343915
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.589	5.43014965802789e-171	23343915	23343915	2.62647358214179e-169	23365926	23365926
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	24491341	255	245	0.0287	2.62647358214179e-169	23365926	23365926	1.10546464083246e-207	24491341	24491341
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24495765	24506914	3	3	-5.0887	1.10546464083246e-207	24491341	24491341	3.21127934682887e-175	24506914	24506914
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24509107	70926188	4811	4646	0.0027	3.21127934682887e-175	24506914	24506914	2.35517324055495e-25	70926188	70926188
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.4023	2.35517324055495e-25	70926188	70926188	3.19378875081041e-24	70930528	70930528
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22958	-0.0048	3.19378875081041e-24	70930528	70930528	5.33502297448445e-09	137347945	137352394
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5085	5.33502297448445e-09	137347945	137352394	3.89708621157659e-08	137356880	137359947
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1067	-0.0177	3.89708621157659e-08	137356880	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	70949263	21675	20935	-0.0065	NA	NA	NA	2.12446667857831e-09	70947915	70949263
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-1.0841	2.12446667857831e-09	70947915	70949263	1.05115982280974e-09	70960187	70966034
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	70964344	1	0	NA	1.05115982280974e-09	70960187	70966034	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70966034	77917870	2911	2810	0.0092	NA	NA	NA	3.35335825504616e-41	77917870	77917870
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77917893	1	0	NA	3.35335825504616e-41	77917870	77917870	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.5398	NA	NA	NA	4.05761661421838e-42	77928738	77928738
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	77936034	1	0	NA	4.05761661421838e-42	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77940201	123957735	16162	15615	-0.0016	NA	NA	NA	7.24136466574764e-08	123955023	123957735
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123971172	6	6	-0.8097	7.24136466574764e-08	123955023	123957735	6.7204257660984e-07	123971172	123976281
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123974228	135285645	4044	3902	-0.0298	6.7204257660984e-07	123971172	123976281	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2059	0.0066	NA	NA	NA	1.87602205659726e-10	5732077	5742476
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-0.6371	1.87602205659726e-10	5732077	5742476	1.66671695676935e-11	5762182	5775970
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14246	2e-04	1.66671695676935e-11	5762182	5775970	1.19165112994161e-07	55065849	55140052
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55196550	32	31	0.3556	1.19165112994161e-07	55065849	55140052	1.13098982432204e-07	55181806	55223056
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55197848	134450318	28367	27389	-0.0014	1.13098982432204e-07	55181806	55223056	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3607	0.0014	NA	NA	NA	1.05223840628367e-135	9523923	9523923
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.6155	1.05223840628367e-135	9523923	9523923	1.00061355883975e-11	9550789	9554149
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	11	-1.1015	1.00061355883975e-11	9550789	9554149	2.84748024450873e-29	9604633	9626623
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	31079618	7392	7154	0.0057	2.84748024450873e-29	9604633	9626623	5.09032078368586e-08	31052948	31169263
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31081498	31248212	26	25	-0.3898	5.09032078368586e-08	31052948	31169263	1.62010771909485e-07	31237505	31265652
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	132289090	33985	32834	0.0062	1.62010771909485e-07	31237505	31265652	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7081	0.0049	NA	NA	NA	1.30771236611894e-92	37953582	37953582
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.6029	1.30771236611894e-92	37953582	37953582	4.11332219523590e-93	37957844	37957844
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56657371	6686	6448	-0.0026	4.1133221952359e-93	37957844	37957844	5.37187323757531e-16	56646284	56660235
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	0.7068	5.37187323757531e-16	56646284	56660235	1.61451165322357e-15	56681665	56693033
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	114123340	17603	16996	0.0035	1.61451165322357e-15	56681665	56693033	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.7302	NA	NA	NA	1.00873728613447e-69	19489920	19535787
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73071404	19360	18675	0.0061	1.00873728613447e-69	19489920	19535787	1.29859610648036e-22	73061942	73072457
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	1.2366	1.29859610648036e-22	73061942	73072457	7.79692054046e-22	73092018	73101327
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105946993	12298	11859	-0.0045	7.79692054046e-22	73092018	73101327	0.00332208913803562	105897061	105946993
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	105964382	5	5	-0.5054	0.00332208913803562	105897061	105946993	3.10253837730204e-08	105964382	105964382
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105966378	105977946	6	6	-0.9903	3.10253837730204e-08	105964382	105964382	2.38337698979697e-05	105973615	105985458
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105985422	106002179	7	7	-0.6091	2.38337698979697e-05	105973615	105985458	2.33774048069131e-05	106002179	106019719
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106221696	92	90	-0.0287	2.33774048069131e-05	106002179	106019719	1.61351948292087e-11	106216726	106223137
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106255190	15	14	0.5789	1.61351948292087e-11	106216726	106223137	3.45651416872976e-07	106253648	106279632
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	35	0.0808	3.45651416872976e-07	106253648	106279632	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.231	NA	NA	NA	0.00183175571110314	18450562	18826924
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19394203	82	79	-0.2585	0.00183175571110314	18450562	18826924	0.0162318092030465	19353472	19401331
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19397326	19407585	4	4	0.2173	0.0162318092030465	19353472	19401331	0.000223853047191707	19407585	19421704
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19412049	20308014	66	63	-0.6523	0.000223853047191707	19407585	19421704	7.81119483443425e-42	20053008	20316992
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	21982746	321	311	-0.0128	7.81119483443425e-42	20053008	20316992	1.29575801700304e-34	21982746	21996787
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21996787	22038880	3	3	-2.9439	1.29575801700304e-34	21982746	21996787	4.31987158420577e-55	22021181	22038880
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22138119	95609756	28849	27851	-0.0037	4.31987158420577e-55	22021181	22038880	1.00281786506477e-08	95606006	95609756
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.8665	1.00281786506477e-08	95606006	95609756	4.80054876942609e-09	95632390	95658438
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	98232932	1072	1024	0.0126	4.80054876942609e-09	95632390	95658438	1.44008852592515e-07	98228743	98232932
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.1535	1.44008852592515e-07	98228743	98232932	1.53365512587133e-08	98239454	98243586
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	884	-0.0346	1.53365512587133e-08	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2593067	1012	971	0.0279	NA	NA	NA	6.31707485901858e-07	2587173	2593067
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2600740	2639798	4	4	1.0505	6.31707485901858e-07	2587173	2593067	1.31144367383490e-08	2639798	2649851
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	32379126	9557	9219	0.0028	1.3114436738349e-08	2639798	2649851	2.94120481548864e-14	31835555	32529486
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	34054713	52	49	-0.3774	2.94120481548864e-14	31835555	32529486	1.06201644774921e-13	33538171	34067256
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	54348362	3070	2952	-0.0091	1.06201644774921e-13	33538171	34067256	1.91547775623192e-06	54333712	54363713
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54390060	12	12	-0.5266	1.91547775623192e-06	54333712	54363713	1.32919804743575e-12	54390060	54390060
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54402057	3	3	1.3881	1.32919804743575e-12	54390060	54390060	5.33757188146238e-12	54402057	54405667
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	75093957	6813	6581	0	5.33757188146238e-12	54402057	54405667	5.73669841247521e-18	75093957	75093957
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.6837	5.73669841247521e-18	75093957	75093957	1.71010446672295e-20	75100865	75100865
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	598	-0.0207	1.71010446672295e-20	75100865	75100865	2.09423533567263e-19	76923844	76925748
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0003	2.09423533567263e-19	76923844	76925748	5.33468181715412e-16	76940218	76942679
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4351	-0.016	5.33468181715412e-16	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	8147124	3542	3416	0.0059	NA	NA	NA	4.32513311887092e-08	8144634	8147124
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.4733	4.32513311887092e-08	8144634	8147124	1.03109842950562e-08	8149084	8154339
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	36673853	10327	9974	0.0025	1.03109842950562e-08	8149084	8154339	1.96514894111636e-60	36673853	36673853
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.1654	1.96514894111636e-60	36673853	36673853	4.15478528900808e-59	36684619	36684619
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1972	0.0115	4.15478528900808e-59	36684619	36684619	4.42705384455382e-13	41546807	41572001
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	48	-0.3525	4.42705384455382e-13	41546807	41572001	6.28693535140125e-12	42143048	42175438
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13175	0.0052	6.28693535140125e-12	42143048	42175438	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1890337	640	615	0.0248	NA	NA	NA	3.60658163466304e-47	1888264	1890337
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1896337	1968531	19	19	-1.0277	3.60658163466304e-47	1888264	1890337	1.03144533283338e-43	1968531	1970787
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1970787	76116026	22305	21549	-0.0061	1.03144533283338e-43	1968531	1970787	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20841320	9322	8972	0.0234	NA	NA	NA	4.48842424753994e-08	20810051	20847760
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20897098	15	15	-0.523	4.48842424753994e-08	20810051	20847760	4.49998701046678e-08	20890025	20909791
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	63788698	13722	13220	0.0109	4.49998701046678e-08	20890025	20909791	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	565	-0.0283	NA	NA	NA	1.50746826245682e-14	1499034	1511632
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	0.8703	1.50746826245682e-14	1499034	1511632	4.68181352798102e-14	1531162	1546858
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20282	-0.0062	4.68181352798102e-14	1531162	1546858	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12987	0.001	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	17274339	733	707	-0.0049	NA	NA	NA	5.68354774147639e-13	17011485	17295409
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17274835	17424977	46	42	0.4094	5.68354774147639e-13	17011485	17295409	2.05671057083073e-12	17406093	17441511
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17426045	22667608	2204	2127	0.0069	2.05671057083073e-12	17406093	17441511	5.00791272755911e-84	22667608	22682428
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22677959	1	0	NA	5.00791272755911e-84	22667608	22682428	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22701123	7	7	-2.5404	NA	NA	NA	0.0422948742047361	22682428	22708012
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701205	22721042	13	13	-3.8819	0.0422948742047361	22682428	22708012	0	22721042	22721042
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	28313183	3058	2936	-0.0097	0	22721042	22721042	2.50976617454769e-08	28304592	28313183
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28314964	28344172	13	13	0.5519	2.50976617454769e-08	28304592	28313183	1.31252594641817e-07	28344172	28352844
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28347050	37685496	4690	4523	0.0029	1.31252594641817e-07	28344172	28352844	5.93856933300082e-27	37683516	37689058
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-0.9345	5.93856933300082e-27	37683516	37689058	5.3091539054324e-25	37715370	37718669
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5543	-0.0015	5.3091539054324e-25	37715370	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.5044	NA	NA	NA	1.03388851173588e-23	94062	94062
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.7863	1.03388851173588e-23	94062	94062	1.05382153151217e-41	104732	104732
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1431411	776	745	-0.0197	1.05382153151217e-41	104732	104732	6.73600758496863e-10	1431411	1431411
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.6475	6.73600758496863e-10	1431411	1431411	7.64419089833041e-11	1432953	1432953
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708113	1001	973	-0.0327	7.64419089833041e-11	1432953	1432953	0	2706218	2708291
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	76998610	22940	22162	0.9749	0	2706218	2708291	4.26927387458245e-39	76998610	76998610
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.2244	4.26927387458245e-39	76998610	76998610	6.05621631974208e-39	77010018	77010018
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	134438361	16029	15509	0.9789	6.05621631974208e-39	77010018	77010018	4.22940727677546e-60	134422430	134460572
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134446029	134446029	1	0	NA	4.22940727677546e-60	134422430	134460572	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134451457	134669952	79	77	1.6198	NA	NA	NA	6.46804219948584e-61	134655177	134804661
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134732880	154025967	5947	5742	0.9702	6.46804219948584e-61	134655177	134804661	7.53199153798048e-10	154017980	154037006
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154028488	154079002	16	15	1.5741	7.53199153798048e-10	154017980	154037006	1.94298790477896e-09	154070179	154088378
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	84	0.9714	1.94298790477896e-09	154070179	154088378	2.36752094871775e-94	154442377	154442377
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.7863	2.36752094871775e-94	154442377	154442377	1.19923871573478e-79	154450309	154450309
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.061	1.19923871573478e-79	154450309	154450309	1.33133903102996e-66	154582414	154586690
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0482	1.33133903102996e-66	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	127	-3.9996	NA	NA	NA	5.31159086179995e-13	3777766	4425391
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.8609	5.31159086179995e-13	3777766	4425391	1.53747007983958e-08	4597974	6688691
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	171	-3.8419	1.53747007983958e-08	4597974	6688691	1.11126548188209e-06	7013903	7231063
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	156	-3.1515	1.11126548188209e-06	7013903	7231063	7.71105819672859e-15	7572591	7670119
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	10515697	492	472	-3.8856	7.71105819672859e-15	7572591	7670119	4.18381134015672e-37	10513747	10537808
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-1.0308	4.18381134015672e-37	10513747	10537808	1.11536095676188e-12	11249952	11673476
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12536761	11	10	-4.4403	1.11536095676188e-12	11249952	11673476	0.00659051348684629	12533900	12575215
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12625208	43	43	-2.7387	0.00659051348684629	12533900	12575215	0.000141799096812666	12579534	12658135
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12627138	12928074	70	66	-3.7839	0.000141799096812666	12579534	12658135	5.16261149060338e-06	12899653	12981244
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13129843	79	78	-2.8076	5.16261149060338e-06	12899653	12981244	3.23558164380864e-11	13076862	13149825
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13718946	222	212	-3.6947	3.23558164380864e-11	13076862	13149825	0.000166910098482386	13524481	13903405
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13729067	14359748	194	183	-4.0704	0.000166910098482386	13524481	13903405	0.004306595365383	14102074	14438363
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14508021	88	87	-3.6479	0.004306595365383	14102074	14438363	3.17445700140753e-12	14503927	14528771
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.17445700140753e-12	14503927	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-1.5117	NA	NA	NA	6.63542167261427e-16	14545228	14550971
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	25737663	1634	1584	-3.8484	6.63542167261427e-16	14545228	14550971	1.67266831557026e-47	22930737	26870361
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.3179	1.67266831557026e-47	22930737	26870361	2.13974024027861e-05	26941769	26995399
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.8059	2.13974024027861e-05	26941769	26995399	5.84277397835339e-08	27011035	27064654
MSK_252152915626_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.8159	5.84277397835339e-08	27011035	27064654	NA	NA	NA
