Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27094	0.009	NA	NA	NA	3.77936798449528e-207	72537426	72537426
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	2.5634	3.77936798449528e-207	72537426	72537426	1.04477524165592e-211	72579311	72579311
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17086	-0.0055	1.04477524165592e-211	72579311	72579311	5.50162953279307e-57	150819879	150819879
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.5052	5.50162953279307e-57	150819879	150819879	3.9087163106388e-55	150851439	150851439
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151933142	449	438	-0.0023	3.9087163106388e-55	150851439	150851439	3.5560518402729e-07	151916511	151938534
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151936219	151966172	14	14	0.4886	3.5560518402729e-07	151916511	151938534	4.11215980378113e-07	151962651	151980583
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151968128	157133150	2298	2234	0.0059	4.11215980378113e-07	151962651	151980583	3.16680864215133e-31	157133150	157133150
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.5961	3.16680864215133e-31	157133150	157133150	2.15756437377656e-30	157136342	157136342
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	180728859	9324	9057	-0.009	2.15756437377656e-30	157136342	157136342	1.48317445712555e-09	180728859	180728859
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	180733132	180733178	2	2	-1.4955	1.48317445712555e-09	180728859	180728859	1.58467325517757e-09	180733178	180733178
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	180742042	247186514	23584	22956	6e-04	1.58467325517757e-09	180733178	180733178	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	52600588	18732	18223	-0.002	NA	NA	NA	4.36423461043603e-08	52583578	52612881
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8711	4.36423461043603e-08	52583578	52612881	7.86346401748862e-08	52617781	52642716
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	178552260	37006	35935	-0.0052	7.86346401748862e-08	52617781	52642716	1.26277658097287e-102	178552260	178552260
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178553602	178555242	2	2	-4.7333	1.26277658097287e-102	178552260	178552260	1.37230535894787e-103	178555242	178555242
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178556781	212890878	11390	11109	0.0027	1.37230535894787e-103	178555242	178555242	1.68766990644983e-09	212889077	212890878
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.0476	1.68766990644983e-09	212889077	212890878	2.16616442590700e-09	212898875	212900857
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10394	0.0028	2.166164425907e-09	212898875	212900857	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10513	9e-04	NA	NA	NA	7.38363572271792e-21	32074432	32074432
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.1417	7.38363572271792e-21	32074432	32074432	1.81813068569331e-19	32080848	32080848
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1828	0.0049	1.81813068569331e-19	32080848	32080848	9.81935982829868e-13	37951628	37954819
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-1.0016	9.81935982829868e-13	37951628	37954819	1.33044218749079e-12	37960019	37963014
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	163992903	40801	39707	-0.0021	1.33044218749079e-12	37960019	37963014	4.50690265257749e-54	163989367	163997228
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	28	0.9273	4.50690265257749e-54	163989367	163997228	2.27841300050128e-55	164105613	164112873
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10792	-0.0038	2.27841300050128e-55	164105613	164112873	1.11331615964812e-13	196806091	196907040
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196942158	23	23	-0.5242	1.11331615964812e-13	196806091	196907040	6.67667106146173e-13	196928503	196952514
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	199329592	961	931	-0.0106	6.67667106146173e-13	196928503	196952514	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3299	0.0274	NA	NA	NA	1.62698714748641e-191	9815760	9815760
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9832823	3	3	-5.2248	1.62698714748641e-191	9815760	9815760	9.08881622028717e-190	9832823	9832823
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	9.08881622028717e-190	9832823	9832823	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	173224400	46243	44934	-0.0027	NA	NA	NA	1.04515149444765e-67	173224400	173224400
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.8407	1.04515149444765e-67	173224400	173224400	2.66269366911847e-66	173228860	173228860
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4146	0.0059	2.66269366911847e-66	173228860	173228860	7.8427587999677e-26	187330240	187330240
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.4136	7.8427587999677e-26	187330240	187330240	5.96154294936839e-26	187333619	187333619
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1211	-0.0139	5.96154294936839e-26	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	17395391	5466	5316	-0.0015	NA	NA	NA	2.94410929321975e-15	17394016	17395391
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17409796	8	8	-0.9021	2.94410929321975e-15	17394016	17395391	4.27926743741517e-14	17409796	17411379
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17411379	177319638	46976	45579	-0.0011	4.27926743741517e-14	17409796	17411379	2.862941159187e-11	177317688	177322431
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177322431	177333426	5	5	-1.0301	2.862941159187e-11	177317688	177322431	4.28063892574457e-13	177331382	177340297
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177340297	178040439	281	274	0.0755	4.28063892574457e-13	177331382	177340297	1.79835235617899e-145	178040439	178040439
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-5.6289	1.79835235617899e-145	178040439	178040439	8.48357976903904e-143	178045608	178045608
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180342860	908	872	0.0152	8.48357976903904e-143	178045608	178045608	5.59717805425748e-14	180342860	180342860
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180346557	2	2	-1.7768	5.59717805425748e-14	180342860	180342860	2.8711586395376e-15	180346557	180346557
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	5	-5.1252	2.8711586395376e-15	180346557	180346557	2.76730537659699e-265	180358977	180358977
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	111	-2e-04	2.76730537659699e-265	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	9114	-4e-04	NA	NA	NA	9.70096817672715e-29	26811016	26811016
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-1.7508	9.70096817672715e-29	26811016	26811016	1.80788595043167e-26	26861184	26861184
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1177	0.0032	1.80788595043167e-26	26861184	26861184	2.32305137990639e-09	29925302	29980445
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30040917	23	23	0.448	2.32305137990639e-09	29925302	29980445	1.80004560116170e-08	30025480	30065034
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30046181	32548736	1066	1032	0.0329	1.8000456011617e-08	30025480	30065034	6.37878131509876e-92	32548736	32558677
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	-2.2361	6.37878131509876e-92	32548736	32558677	6.22934227000108e-91	32593151	32595402
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	54035000	8305	8057	6e-04	6.22934227000108e-91	32593151	32595402	2.95850578505481e-98	54035000	54035000
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.7889	2.95850578505481e-98	54035000	54035000	2.09158547384674e-98	54042734	54042734
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12848	-0.0063	2.09158547384674e-98	54042734	54042734	2.49443773156194e-14	103827105	103841482
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103873584	5	5	1.1377	2.49443773156194e-14	103827105	103841482	3.24088799770796e-14	103873584	103882598
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103882598	165643653	21105	20530	-0.0039	3.24088799770796e-14	103873584	103882598	1.29294656382200e-08	165640218	165643653
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.0092	1.292946563822e-08	165640218	165643653	5.11987143170975e-09	165650610	165653315
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1754	-7e-04	5.11987143170975e-09	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5232	0.0068	NA	NA	NA	2.70190923679161e-58	16135701	16135701
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.5499	2.70190923679161e-58	16135701	16135701	7.66106471321176e-57	16140018	16140018
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	121520289	35159	34151	0.001	7.66106471321176e-57	16140018	16140018	4.7779815585669e-67	121518929	121522158
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	121522158	121589557	34	34	-0.9338	4.7779815585669e-67	121518929	121522158	1.05765442386344e-67	121587852	121591148
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	121591148	141410894	9220	8949	-0.0026	1.05765442386344e-67	121587852	121591148	1.88837911869322e-07	141408013	141413352
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141422860	5	5	0.8344	1.88837911869322e-07	141408013	141413352	7.29049032791547e-07	141419692	141426846
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	158821263	6887	6736	3e-04	7.29049032791547e-07	141419692	141426846	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12720	-0.0031	NA	NA	NA	0	39350798	39350798
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39378051	12	11	-4.3556	0	39350798	39350798	0.00304886756153789	39368509	39394527
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39379539	39427807	15	15	-3.1356	0.00304886756153789	39368509	39394527	4.20260121577754e-05	39418695	39441842
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39428746	39505256	32	31	-4.2456	4.20260121577754e-05	39418695	39441842	0	39505256	39505256
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	430	0.0187	0	39505256	39505256	5.28570566378813e-09	40888127	40892587
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.441	5.28570566378813e-09	40888127	40892587	1.15713296341932e-08	40897469	40897469
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30157	6e-04	1.15713296341932e-08	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	22477358	7836	7619	-0.0026	NA	NA	NA	1.20948254048293e-07	22473542	22477358
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.3331	1.20948254048293e-07	22473542	22477358	8.08529428047165e-08	22492603	22499541
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5083	-0.0023	8.08529428047165e-08	22492603	22499541	1.59902995712883e-54	70926188	70926188
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.4162	1.59902995712883e-54	70926188	70926188	8.73087981978182e-55	70930528	70930528
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	15054	-0.0095	8.73087981978182e-55	70930528	70930528	8.26411710923017e-09	116124007	116124007
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.4274	8.26411710923017e-09	116124007	116124007	1.58852335956966e-08	116130333	116130333
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9138	0.0084	1.58852335956966e-08	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23908	-0.0065	NA	NA	NA	3.05533483722309e-44	77917893	77917893
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.5517	3.05533483722309e-44	77917893	77917893	4.77113252112728e-44	77928738	77928738
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19690	-0.0019	4.77113252112728e-44	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1601041	557	542	0.0194	NA	NA	NA	3.08801416259487e-09	1598261	1604214
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1604214	1608676	4	4	-1.0035	3.08801416259487e-09	1598261	1604214	2.22396222040383e-08	1607412	1610476
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1610476	55118214	16344	15836	3e-04	2.22396222040383e-08	1607412	1610476	4.3480364058385e-33	55097806	55127355
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-0.6337	4.3480364058385e-33	55097806	55127355	5.05935401154777e-34	55203706	55219985
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27581	0.0033	5.05935401154777e-34	55203706	55219985	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3629	0.0169	NA	NA	NA	1.15708924576767e-19	9516067	9531133
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	11	0.9161	1.15708924576767e-19	9516067	9531133	5.38608143999862e-20	9582696	9599999
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	132289090	41407	40271	0.0028	5.38608143999862e-20	9582696	9599999	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36604695	6963	6759	-0.004	NA	NA	NA	2.05287850134829e-06	36604695	36604695
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36606314	36608193	2	2	-1.2559	2.05287850134829e-06	36604695	36604695	1.81615333112823e-06	36608193	36611461
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36611461	36969571	74	73	0.0021	1.81615333112823e-06	36608193	36611461	1.42964066096099e-82	36969571	36969571
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.5184	1.42964066096099e-82	36969571	36969571	4.00970029348819e-102	36982877	36982877
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	285	-0.0092	4.00970029348819e-102	36982877	36982877	4.37793326557275e-100	37953582	37953582
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.4666	4.37793326557275e-100	37953582	37953582	7.89128120324228e-95	37957844	37957844
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49958475	4878	4739	-0.0097	7.89128120324228e-95	37957844	37957844	5.01485003686038e-12	49958475	49958475
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	5.01485003686038e-12	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.6341	NA	NA	NA	7.10062436274579e-11	49971732	49971732
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1755	-0.0094	7.10062436274579e-11	49971732	49971732	1.95866184910588e-11	56610886	56658479
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56681665	13	13	0.6447	1.95866184910588e-11	56610886	56658479	2.11050024255253e-11	56680346	56688605
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	100690991	13041	12670	0.0036	2.11050024255253e-11	56680346	56688605	2.00706177068564e-89	100690991	100690991
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.4414	2.00706177068564e-89	100690991	100690991	3.85639681837671e-90	100693892	100693892
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4442	-0.0036	3.85639681837671e-90	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.7353	NA	NA	NA	2.12543506151856e-69	19489920	19497023
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73071404	19360	18830	-0.0034	2.12543506151856e-69	19489920	19497023	2.51590997905706e-19	73061942	73071404
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	2.51590997905706e-19	73061942	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.2034	NA	NA	NA	7.2663827364326e-19	73092112	73101327
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11857	0.0026	7.2663827364326e-19	73092112	73101327	0	105597555	105597555
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.8105	0	105597555	105597555	5.10490796700625e-127	105632168	105632168
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	-0.0876	5.10490796700625e-127	105632168	105632168	2.34463819623779e-08	105783533	105787390
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.847	2.34463819623779e-08	105783533	105787390	3.37476639790365e-09	105798116	105800545
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	106358491	204	200	0.0558	3.37476639790365e-09	105798116	105800545	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	74669752	21711	21059	-0.0048	NA	NA	NA	5.1442765080777e-145	74669752	74669752
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.0279	5.1442765080777e-145	74669752	74669752	3.45774433968411e-148	74680439	74680439
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	91933764	6601	6390	-0.0036	3.45774433968411e-148	74680439	74680439	1.08456912920287e-13	91928232	91937335
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91937335	91965744	8	8	-0.886	1.08456912920287e-13	91928232	91937335	6.79713491515494e-14	91962960	91968739
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91968739	98232932	2084	2026	0.0062	6.79713491515494e-14	91962960	91968739	5.65011080619708e-11	98228743	98232932
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.3044	5.65011080619708e-11	98228743	98232932	4.25357615496787e-11	98239454	98243586
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	883	-0.0082	4.25357615496787e-11	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19994	0.0076	NA	NA	NA	8.33985877110111e-22	75093957	75093957
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.816	8.3398587711011e-22	75093957	75093957	3.03928462016979e-24	75100865	75100865
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	594	-0.0153	3.03928462016979e-24	75100865	75100865	4.58782109360418e-22	76923844	76925748
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0606	4.58782109360418e-22	76923844	76925748	3.05753950795848e-19	76940218	76942679
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4398	0.0085	3.05753950795848e-19	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	405	0.0271	NA	NA	NA	2.35601926211911e-07	1025525	1027248
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	0.9826	2.35601926211911e-07	1025525	1027248	6.00126477558221e-08	1030766	1032051
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	15727076	5883	5715	0.0099	6.00126477558221e-08	1030766	1032051	3.11507094838645e-102	15727076	15727076
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-4.7476	3.11507094838645e-102	15727076	15727076	7.53178510591948e-105	15733964	15733964
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	36673853	7567	7330	0.0056	7.53178510591948e-105	15733964	15733964	2.45948666805799e-54	36673853	36673853
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.9889	2.45948666805799e-54	36673853	36673853	4.08768813647197e-54	36684619	36684619
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41515622	2009	1945	0.0192	4.08768813647197e-54	36684619	36684619	5.20721206439986e-13	41501967	41519702
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	41566540	23	22	-0.4936	5.20721206439986e-13	41501967	41519702	7.65046497077071e-10	41561017	41573295
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	43	-0.9028	7.65046497077071e-10	41561017	41573295	6.7302225662488e-82	41710400	42142363
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13281	0.0097	6.7302225662488e-82	41710400	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1712500	568	553	0.0266	NA	NA	NA	8.9814241612104e-109	1707962	1715225
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1715225	1828882	56	56	-0.9534	8.9814241612104e-109	1707962	1715225	4.26833325668156e-118	1822927	1832477
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1832477	53092949	15575	15142	-0.0099	4.26833325668156e-118	1822927	1832477	3.62426400673978e-88	53092949	53092949
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-4.3224	3.62426400673978e-88	53092949	53092949	5.33887360585559e-86	53099601	53099601
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6578	-0.0119	5.33887360585559e-86	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8775	0.0335	NA	NA	NA	1.49172867416260e-140	19694025	19694025
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.4789	1.4917286741626e-140	19694025	19694025	1.16282676475758e-139	19700620	19700620
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	50524864	7868	7643	0.0143	1.16282676475758e-139	19700620	19700620	5.91203854983218e-16	50514635	50535006
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50527732	50592345	30	30	0.5047	5.91203854983218e-16	50514635	50535006	5.92198092281868e-14	50584299	50610081
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50594382	56825794	2946	2865	0.0373	5.92198092281868e-14	50584299	50610081	6.46598791207749e-08	56822197	56828073
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.6982	6.46598791207749e-08	56822197	56828073	1.58423863758203e-07	56837593	56844304
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	62690917	2643	2561	0.0117	1.58423863758203e-07	56837593	56844304	4.79261019462307e-12	62688767	62690917
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62692483	62702441	9	9	-0.7709	4.79261019462307e-12	62688767	62690917	4.33227001653854e-13	62702441	62705620
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62704893	63788698	526	513	0.0426	4.33227001653854e-13	62702441	62705620	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	0.0052	NA	NA	NA	8.09773125706015e-121	1506379	1516966
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.7397	8.09773125706015e-121	1506379	1516966	6.25981634352095e-138	1525300	1531162
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20336	0.0037	6.25981634352095e-138	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13058	6e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	16062	0.0157	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708113	1792	1736	0.0048	NA	NA	NA	0	2706218	2708291
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	76998610	22940	22281	0.9906	0	2706218	2708291	1.64115499096207e-62	76998610	76998610
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.971	1.64115499096207e-62	76998610	76998610	1.90676565698741e-62	77010018	77010018
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154044828	22061	21482	0.9899	1.90676565698741e-62	77010018	77010018	4.58446741032885e-09	154031239	154044828
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154046681	154079002	11	11	1.6602	4.58446741032885e-09	154031239	154044828	6.43425000792254e-09	154079002	154088378
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	116	1.0129	6.43425000792254e-09	154079002	154088378	1.70344513665074e-185	154578922	154586690
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0286	1.70344513665074e-185	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3733715	123	119	-3.9757	NA	NA	NA	3.41443041080965e-32	3223585	3773948
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.0774	3.41443041080965e-32	3223585	3773948	2.35862356391999e-15	4948824	6688691
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7266323	233	227	-3.5591	2.35862356391999e-15	4948824	6688691	2.97159341631258e-08	7256919	7286087
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7267235	7304209	19	17	-1.7846	2.97159341631258e-08	7256919	7286087	2.18963604545256e-08	7289497	7310052
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7729757	128	124	-3.5586	2.18963604545256e-08	7289497	7310052	0.00104276901623667	7702787	7740117
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7731490	7782532	16	16	-2.4702	0.00104276901623667	7702787	7740117	8.45238802621693e-08	7774773	7789562
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-3.6259	8.45238802621693e-08	7774773	7789562	1.00641828429066e-09	7897073	7905286
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.1331	1.00641828429066e-09	7897073	7905286	4.28290398809111e-06	7914104	7919636
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	376	-3.7508	4.28290398809111e-06	7914104	7919636	1.20132497005471e-48	10513747	10515697
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	15	-0.4934	1.20132497005471e-48	10513747	10515697	5.01176726019665e-09	11660512	12514978
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12682301	67	66	-2.8944	5.01176726019665e-09	11660512	12514978	0.0982745733271844	12532441	12865349
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12687167	1	0	NA	0.0982745733271844	12532441	12865349	NA	NA	NA
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12973899	71	69	-3.5244	NA	NA	NA	1.49471868866560e-06	12942170	13007725
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13128515	63	63	-2.4347	1.4947186886656e-06	12942170	13007725	2.49763032326595e-24	13106723	13138841
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14524829	507	490	-3.706	2.49763032326595e-24	13106723	13138841	7.20047338291113e-17	14506319	14540351
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	24	-2.043	7.20047338291113e-17	14506319	14540351	1.38314286364414e-13	14557473	14596156
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	406	-3.7731	1.38314286364414e-13	14557473	14596156	8.14626448170728e-05	15727116	15979526
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16062961	54	53	-3.0601	8.14626448170728e-05	15727116	15979526	9.54675627173196e-08	16015301	16091622
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16064208	22139807	1046	1017	-3.845	9.54675627173196e-08	16015301	16091622	4.25142029216681e-07	22052726	22139807
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0789	4.25142029216681e-07	22052726	22139807	2.42961452448852e-06	22177335	22202315
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	90	-3.8857	2.42961452448852e-06	22177335	22202315	1.37186845811159e-42	23283689	26870361
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.204	1.37186845811159e-42	23283689	26870361	4.91833923733748e-05	26943701	26998633
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.6418	4.91833923733748e-05	26943701	26998633	1.53990647185729e-05	27009433	27068911
MSK_252152915627_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.8683	1.53990647185729e-05	27009433	27068911	NA	NA	NA
