Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16446009	5671	5461	0.0124	NA	NA	NA	6.38703984393839e-18	16427191	16453588
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16447148	16481149	19	18	-0.3281	6.38703984393839e-18	16427191	16453588	5.30202455868027e-17	16470790	16502503
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16483024	67371273	20269	19549	-0.0201	5.30202455868027e-17	16470790	16502503	3.95729896091725e-20	67368520	67371273
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	67372626	67377744	4	4	-0.6995	3.95729896091725e-20	67368520	67371273	1.66132404161135e-06	67377744	67381466
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	67379610	72537426	1931	1860	0.01	1.66132404161135e-06	67377744	67381466	6.75309780380732e-260	72537426	72537426
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	8	-3.0907	6.75309780380732e-260	72537426	72537426	4.85503034111351e-267	72574479	72574479
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	4.85503034111351e-267	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10760	-0.019	NA	NA	NA	1.23109994108898e-06	108529665	108535814
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	0.6589	1.23109994108898e-06	108529665	108535814	6.89358227401309e-06	108537259	108541074
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109987341	557	541	-0.0897	6.89358227401309e-06	108537259	108541074	1.58527658587883e-18	109987341	109987341
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.5029	1.58527658587883e-18	109987341	109987341	1.3185330876257e-15	109989998	109989998
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	143659690	3929	3780	-0.0346	1.3185330876257e-15	109989998	109989998	4.97052055327987e-34	143653780	143702972
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143697723	1	0	NA	4.97052055327987e-34	143653780	143702972	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143791143	46	44	-0.5159	NA	NA	NA	2.78648979390843e-31	143787504	143799153
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143793179	146297175	595	570	-0.0653	2.78648979390843e-31	143787504	143799153	3.78212918477913e-11	146274661	147308557
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147471665	31	30	0.2589	3.78212918477913e-11	146274661	147308557	1.31528231451190e-11	147446584	147644831
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147475854	150819879	1264	1212	-0.0875	1.3152823145119e-11	147446584	147644831	5.87306181298602e-82	150819879	150823073
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.4252	5.87306181298602e-82	150819879	150823073	1.30807897185932e-77	150848509	150851439
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2659	-0.0572	1.30807897185932e-77	150848509	150851439	2.43226469981404e-25	157133150	157133150
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.9273	2.43226469981404e-25	157133150	157133150	6.55020280680396e-25	157136342	157136342
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167680699	4186	4040	-0.034	6.55020280680396e-25	157136342	157136342	3.88948898674655e-30	167680504	167680699
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167687229	167704506	8	8	-1.111	3.88948898674655e-30	167680504	167680699	7.10356872242372e-32	167704506	167706707
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167706707	189975382	7934	7643	-0.0218	7.10356872242372e-32	167704506	167706707	6.15144571468144e-07	189966496	189975382
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	189983875	189989483	2	2	-1.0634	6.15144571468144e-07	189966496	189975382	2.07685657779647e-06	189989483	189998360
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	189998360	192715640	688	664	-0.0559	2.07685657779647e-06	189989483	189998360	3.15266339782071e-37	192715640	192715640
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-2.4385	3.15266339782071e-37	192715640	192715640	1.21919711334103e-36	192719540	192719540
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	200602881	2645	2546	-0.0299	1.21919711334103e-36	192719540	192719540	6.52108693107864e-10	200567550	200638221
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200815351	48	47	-0.2965	6.52108693107864e-10	200567550	200638221	6.69334884882034e-22	200797743	200830629
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200816497	246674083	17255	16659	-0.0121	6.69334884882034e-22	200797743	200830629	3.71925979996425e-18	246648963	246676931
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246676851	246702361	9	9	0.5614	3.71925979996425e-18	246648963	246676931	0.000143850764539325	246696599	246750352
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246713340	246769018	8	8	-0.0353	0.000143850764539325	246696599	246750352	1.55178562817747e-09	246755225	246805521
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	26	-0.7421	1.55178562817747e-09	246755225	246805521	5.48612615142503e-48	246858820	246863179
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	96	0.0509	5.48612615142503e-48	246858820	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35552710	11920	11471	0.0126	NA	NA	NA	2.56425634283374e-37	35552710	35552710
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35553983	35553983	1	0	NA	2.56425634283374e-37	35552710	35552710	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.3141	NA	NA	NA	1.96535666193364e-10	35562007	35562007
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	37828267	995	965	-0.035	1.96535666193364e-10	35562007	35562007	2.59621520774783e-05	37803744	37837974
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37829444	37854350	12	12	0.3008	2.59621520774783e-05	37803744	37837974	8.7222890529576e-11	37843380	37876992
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37855837	52600588	5802	5602	-0.0161	8.7222890529576e-11	37843380	37876992	2.42453607697569e-12	52588009	52600588
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.777	2.42453607697569e-12	52588009	52600588	2.22223215100168e-10	52635695	52639605
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4399	-0.0216	2.22223215100168e-10	52635695	52639605	3.39873563019061e-08	66357387	66357387
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.108	3.39873563019061e-08	66357387	66357387	1.12496904910770e-22	66360747	66360747
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	70292616	1329	1275	-0.0715	1.1249690491077e-22	66360747	66360747	1.60947753070615e-21	70290168	70292616
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	70293728	70297466	3	3	-0.9336	1.60947753070615e-21	70290168	70292616	2.01211937501170e-08	70297466	70298513
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	70298513	77499891	2572	2497	-0.0031	2.0121193750117e-08	70297466	70298513	1.03023570341575e-10	77499891	77499891
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	77501210	77502970	2	2	-1.2824	1.03023570341575e-10	77499891	77499891	1.42493824513159e-44	77502970	77502970
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	77505186	222068708	43242	41722	-0.0091	1.42493824513159e-44	77502970	77502970	3.18910950095391e-45	222068708	222068708
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222071209	222073481	2	2	-1.2777	3.18910950095391e-45	222068708	222068708	1.34249829932436e-10	222073481	222073481
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222075260	241017516	6798	6575	0.0016	1.34249829932436e-10	222073481	222073481	4.08939934778785e-11	240998518	241034587
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241019062	241019062	1	0	NA	4.08939934778785e-11	240998518	241034587	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241020067	241058684	27	27	0.317	NA	NA	NA	7.33639656020832e-06	241048786	241095241
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241059571	242689978	555	538	0.0297	7.33639656020832e-06	241048786	241095241	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12240	0.004	NA	NA	NA	9.86926788576504e-22	37953375	37953375
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	5	-1.1274	9.86926788576504e-22	37953375	37953375	3.63844472210976e-20	37961110	37963014
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	133189686	31022	29974	-0.0066	3.63844472210976e-20	37961110	37963014	4.42796192343455e-14	133189686	133189686
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.2575	4.42796192343455e-14	133189686	133189686	1.02656934100725e-12	133194685	133194685
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.02656934100725e-12	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9465	-0.0138	NA	NA	NA	4.10088391413772e-27	164005577	164005577
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2693	4.10088391413772e-27	164005577	164005577	1.99211640672975e-28	164027724	164027724
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	192546280	9568	9217	-0.0212	1.99211640672975e-28	164027724	164027724	1.03741748866646e-08	192542511	192546280
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.8417	1.03741748866646e-08	192542511	192546280	5.99793356357172e-09	192552734	192557162
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	560	0.0331	5.99793356357172e-09	192552734	192557162	1.84052548380063e-06	194347806	194360242
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194368145	7	7	0.5997	1.84052548380063e-06	194347806	194360242	1.13233097380063e-08	194365648	194375211
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	196835413	996	961	-0.013	1.13233097380063e-08	194365648	194375211	1.47008574717936e-81	196835413	196904349
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	20	-1.1161	1.47008574717936e-81	196835413	196904349	0.000108529088365545	196925203	196942158
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196961238	10	9	-0.5236	0.000108529088365545	196925203	196942158	4.97875016395687e-06	196950095	196970927
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	918	-0.0574	4.97875016395687e-06	196950095	196970927	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3272	0.0587	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.2199	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	88752705	21635	20910	-0.0017	0	9842644	9842644	2.70367867754866e-14	88751091	88752705
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.1257	2.70367867754866e-14	88751091	88752705	1.03366550211341e-07	88756721	88757953
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	173224400	24606	23772	-0.0048	1.03366550211341e-07	88756721	88757953	3.38081233534242e-101	173224400	173224400
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.8541	3.38081233534242e-101	173224400	173224400	1.05206344651681e-106	173228860	173228860
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4090	0.0103	1.05206344651681e-106	173228860	173228860	3.83388376965103e-07	187329037	187330240
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.0484	3.83388376965103e-07	187329037	187330240	5.71957877430778e-07	187333619	187335827
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1193	0.0748	5.71957877430778e-07	187333619	187335827	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180187846	53642	51775	0.001	NA	NA	NA	2.00083378600932e-107	180182580	180192214
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180189516	180362342	13	13	-0.5193	2.00083378600932e-107	180182580	180192214	1.11150461299968e-11	180357210	180378586
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	101	0.0561	1.11150461299968e-11	180357210	180378586	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10191	-0.0212	NA	NA	NA	1.03065159613774e-39	29922876	29992946
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30030032	19	19	0.2967	1.03065159613774e-39	29922876	29992946	5.21958143036945e-10	30005338	30046181
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30031367	31385778	576	551	-0.1342	5.21958143036945e-10	30005338	30046181	1.42706054105579e-06	31381060	31389372
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.75	1.42706054105579e-06	31381060	31389372	1.00161622030982e-08	31390982	31425144
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32519935	481	470	-0.0958	1.00161622030982e-08	31390982	31425144	0.00202627946292545	32459270	32538115
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32521417	32558677	8	8	0.1703	0.00202627946292545	32459270	32538115	4.17619153075869e-10	32558677	32567462
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.207	4.17619153075869e-10	32558677	32567462	3.33419465519742e-274	32629848	32633691
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	8004	-0.0265	3.33419465519742e-274	32629848	32633691	8.94831519418032e-169	54035000	54035000
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0382	8.94831519418032e-169	54035000	54035000	7.45207840585161e-162	54042734	54042734
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	80612782	6894	6635	0.0099	7.45207840585161e-162	54042734	54042734	4.31629623698282e-15	80609979	80612782
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	80614365	80626734	4	4	-1.0829	4.31629623698282e-15	80609979	80612782	5.11816809155364e-16	80626734	80628319
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	80628319	81769923	337	324	-0.0022	5.11816809155364e-16	80626734	80628319	1.14296497332661e-09	81742633	81804246
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81777831	81933660	17	15	0.4423	1.14296497332661e-09	81742633	81804246	1.51617370779245e-10	81900929	81955126
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81939990	134629897	16439	15892	-0.0193	1.51617370779245e-10	81900929	81955126	0	134629897	134629897
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-4.7921	0	134629897	134629897	3.34054290133527e-312	134635779	134635779
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10276	-0.0202	3.34054290133527e-312	134635779	134635779	1.88318290335681e-34	165642393	165643653
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.8766	1.88318290335681e-34	165642393	165643653	1.37545936794186e-10	165650610	165653315
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1746	0.0597	1.37545936794186e-10	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	243	0.0828	NA	NA	NA	4.12733450559009e-13	1036135	1036135
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.3112	4.12733450559009e-13	1036135	1036135	9.29432851167943e-22	1038517	1047636
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	103863630	32283	31157	0.0084	9.29432851167943e-22	1038517	1047636	2.74293997983485e-21	103862413	103863630
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-1.0307	2.74293997983485e-21	103862413	103863630	2.23979095407101e-17	103868375	103870016
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	118611324	6720	6475	-0.019	2.23979095407101e-17	103868375	103870016	2.88844337098550e-184	118611324	118611324
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.3542	2.8884433709855e-184	118611324	118611324	2.13981746580969e-201	118620875	118620875
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	118622742	1	0	NA	2.13981746580969e-201	118620875	118620875	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118629597	125831554	3169	3041	0.0126	NA	NA	NA	8.5017110997044e-162	125831554	125831554
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.9025	8.5017110997044e-162	125831554	125831554	4.39630913655356e-154	125837524	125837524
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133418420	3649	3504	-0.0111	4.39630913655356e-154	125837524	125837524	7.88184789974687e-18	133410158	133432281
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133419940	133448277	13	12	0.4388	7.88184789974687e-18	133410158	133432281	3.97084706762709e-08	133441122	133458252
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3706	-0.0116	3.97084706762709e-08	133441122	133458252	1.04246456174117e-42	141690753	141690753
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.0885	1.04246456174117e-42	141690753	141690753	2.19050644142930e-42	141714168	141714168
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720324	2	0	NA	2.1905064414293e-42	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141721894	142526341	321	312	-0.0257	NA	NA	NA	7.19118487420466e-96	142526254	142535936
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142535936	142602080	33	32	-0.9965	7.19118487420466e-96	142526254	142535936	2.00836423045636e-95	142600731	142605735
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142605735	151726377	3787	3672	-0.0112	2.00836423045636e-95	142600731	142605735	2.06875888412545e-10	151691287	151726377
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151728811	151740878	8	8	0.4747	2.06875888412545e-10	151691287	151726377	2.80527461242719e-11	151740878	151755714
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151743145	158821263	2601	2513	0.0687	2.80527461242719e-11	151740878	151755714	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	51191560	15312	14792	0.0226	NA	NA	NA	5.09745550251317e-27	51191560	51191560
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	5.09745550251317e-27	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51198463	2	2	-1.2045	NA	NA	NA	3.24147200928e-13	51198463	51198463
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51200291	67116436	4623	4456	0.0026	3.24147200928e-13	51198463	51198463	2.34980800637094e-14	67114768	67116436
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	67118281	67121919	3	3	-0.9694	2.34980800637094e-14	67114768	67116436	4.00547695960397e-10	67121919	67123427
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	67123427	87255865	5879	5684	0.0017	4.00547695960397e-10	67121919	67123427	4.13060958034248e-205	87255865	87255865
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	2	-5.3476	4.13060958034248e-205	87255865	87255865	1.82733521128844e-196	87262662	87262662
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18071	-0.0019	1.82733521128844e-196	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7567	0.0162	NA	NA	NA	6.57966670080083e-97	22477358	22477358
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-3.7192	6.57966670080083e-97	22477358	22477358	1.54796955780131e-98	22492603	22492603
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5064	-0.0105	1.54796955780131e-98	22492603	22492603	5.53702837170388e-121	70926188	70926188
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.1157	5.53702837170388e-121	70926188	70926188	5.41431945539103e-117	70930528	70930528
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14947	0.003	5.41431945539103e-117	70930528	70930528	2.41485560038875e-08	116122595	116124007
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.146	2.41485560038875e-08	116122595	116124007	4.39037294841376e-18	116130333	116132839
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7965	-0.0056	4.39037294841376e-18	116130333	116132839	4.2957141964873e-80	137352394	137352394
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-3.4717	4.2957141964873e-80	137352394	137352394	1.41954021621278e-73	137356880	137356880
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1068	0.0352	1.41954021621278e-73	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	22237505	7887	7634	-0.0013	NA	NA	NA	2.38919928714459e-26	22232262	22242770
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	22240255	22250092	6	6	-0.6519	2.38919928714459e-26	22232262	22242770	2.73978431278249e-15	22242770	22255331
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	22251658	45489823	6564	6316	-5e-04	2.73978431278249e-15	22242770	22255331	1.10837431857763e-24	45468679	46399272
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47017598	73	70	0.3289	1.10837431857763e-24	45468679	46399272	2.98019229889751e-25	46549806	47066466
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47021415	118667877	24325	23452	-0.0029	2.98019229889751e-25	46549806	47066466	1.32724628582927e-13	118631648	118678024
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	118670907	118670907	1	0	NA	1.32724628582927e-13	118631648	118678024	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	118673426	118694545	11	11	-0.2982	NA	NA	NA	6.24028039682113e-07	118691114	118723226
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	118698374	123957735	1891	1822	0.0222	6.24028039682113e-07	118691114	118723226	7.13661347375849e-07	123955023	123957735
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	5	-0.6045	7.13661347375849e-07	123955023	123957735	5.3190348458033e-11	123969584	123974228
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	135285645	4045	3897	0.0652	5.3190348458033e-11	123969584	123974228	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1103180	363	353	0.0274	NA	NA	NA	7.04464224920505e-08	1101451	1103180
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1104014	1105351	3	3	-0.9632	7.04464224920505e-08	1101451	1103180	2.35018365273044e-08	1105351	1106234
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1106234	2017188	374	361	0.0187	2.35018365273044e-08	1105351	1106234	6.99233565312912e-07	2002328	2017188
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2020604	2043108	8	8	-0.5258	6.99233565312912e-07	2002328	2017188	3.16171016357215e-06	2043108	2070199
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2048826	4923300	1024	987	-5e-04	3.16171016357215e-06	2043108	2070199	2.05434049438109e-268	4923300	4923300
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.2604	2.05434049438109e-268	4923300	4923300	4.58890641663927e-258	4932214	4932214
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	347	-0.0097	4.58890641663927e-258	4932214	4932214	1.02471061418279e-25	5734978	5741031
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7812	1.02471061418279e-25	5734978	5741031	5.75748052569928e-30	5765438	5769776
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	49671267	14566	14054	0.0047	5.75748052569928e-30	5765438	5769776	1.29601949770708e-11	49627359	49694659
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	8	-0.3997	1.29601949770708e-11	49627359	49694659	4.39984446867565e-25	49694659	49760127
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	72335263	6929	6699	-0.0138	4.39984446867565e-25	49694659	49760127	1.09898309357276e-28	72291161	72355170
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	72337076	72515967	73	71	-0.2542	1.09898309357276e-28	72291161	72355170	2.77510909439224e-49	72495645	72544132
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	72519154	134450318	21575	20777	0.0096	2.77510909439224e-49	72495645	72544132	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4191	-0.0179	NA	NA	NA	1.17964413512819e-196	11116883	11116883
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	-3.2464	1.17964413512819e-196	11116883	11116883	1.65542138973347e-213	11140421	11140421
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	51371075	13093	12626	-0.0207	1.65542138973347e-213	11140421	11140421	1.3387144568909e-15	51367197	51371075
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51372679	51374583	2	2	-0.9222	1.3387144568909e-15	51367197	51371075	5.19096392097076e-11	51374583	51378358
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51375789	60554987	3149	3045	-0.0363	5.19096392097076e-11	51374583	51378358	1.67779924262985e-15	60553780	60554987
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60556426	60564507	5	5	-1.0001	1.67779924262985e-15	60553780	60554987	5.5095320305939e-16	60564507	60565736
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60565736	73617334	4407	4261	-0.018	5.5095320305939e-16	60564507	60565736	2.03242400913841e-13	73613862	73617334
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73619474	73631927	6	6	-0.8428	2.03242400913841e-13	73613862	73617334	1.92852896722240e-14	73631927	73634376
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73634376	78668041	1554	1495	-0.0171	1.9285289672224e-14	73631927	73634376	3.97595533503323e-08	78663063	78679297
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78675711	78686371	6	6	-0.6454	3.97595533503323e-08	78663063	78679297	3.78950936727299e-67	78679297	78690106
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	132289090	18603	17929	-3e-04	3.78950936727299e-67	78679297	78690106	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31428172	4884	4716	-0.0019	NA	NA	NA	1.30487312802608e-13	31426287	31428172
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-1.0796	1.30487312802608e-13	31426287	31428172	3.23959346175708e-08	31436314	31441218
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	33028007	708	676	-0.0154	3.23959346175708e-08	31436314	31441218	2.99514136846052e-14	33026172	33028007
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33030946	33042557	4	4	-1.0008	2.99514136846052e-14	33026172	33028007	7.36288871009629e-13	33042557	33049401
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	33046417	1	0	NA	7.36288871009629e-13	33042557	33049401	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33049401	37953582	1739	1679	0.0294	NA	NA	NA	1.46901018889773e-130	37953582	37953582
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.5249	1.46901018889773e-130	37953582	37953582	4.96251034993296e-143	37957844	37957844
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49958475	4878	4706	-0.0505	4.96251034993296e-143	37957844	37957844	6.77609423909565e-48	49958475	49958475
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	6.77609423909565e-48	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.6534	NA	NA	NA	7.46671849383602e-41	49971732	49971732
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	50819012	360	356	-0.0712	7.46671849383602e-41	49971732	49971732	1.29622616103730e-05	50817754	50819012
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50820905	50822114	2	2	-1.043	1.2962261610373e-05	50817754	50819012	1.67857644681484e-13	50822114	50826116
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50826116	56650373	1442	1393	0.0053	1.67857644681484e-13	50822114	50826116	1.3531602398754e-14	56610886	56650373
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.5633	1.3531602398754e-14	56610886	56650373	2.41263356096378e-14	56685341	56691355
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	63209551	1477	1419	0.0148	2.41263356096378e-14	56685341	56691355	4.92833389966203e-10	63208221	63209551
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63230997	63280389	5	5	0.8137	4.92833389966203e-10	63208221	63209551	4.58489801471591e-11	63280389	63322571
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63322571	68142120	1212	1175	0.0199	4.58489801471591e-11	63280389	63322571	5.63727038589474e-18	68138912	68144264
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.7299	5.63727038589474e-18	68138912	68144264	3.24458491282219e-16	68161714	68167758
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	99414403	9762	9426	0.0079	3.24458491282219e-16	68161714	68167758	2.97419480565901e-16	99414403	99414403
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99417382	99417382	1	0	NA	2.97419480565901e-16	99414403	99414403	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99419235	99421920	2	2	-1.5587	NA	NA	NA	5.465662047038e-17	99421920	99421920
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99423114	114123340	5135	4970	0.0209	5.465662047038e-17	99421920	99421920	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34498340	5661	5459	-0.0115	NA	NA	NA	6.02667384499706e-84	34498340	34498340
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34499884	34501839	2	2	-3.5641	6.02667384499706e-84	34498340	34498340	1.43787913351628e-86	34501839	34501839
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34505234	69086125	11965	11531	-0.0202	1.43787913351628e-86	34501839	34501839	1.72385280097128e-22	69084841	69086125
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.8452	1.72385280097128e-22	69084841	69086125	6.84054709095965e-17	69092211	69093444
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	79174722	4710	4544	-0.01	6.84054709095965e-17	69092211	69093444	4.55719386469511e-196	79174722	79174722
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.8512	4.55719386469511e-196	79174722	79174722	2.95762925736716e-201	79183154	79183154
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105595302	9296	8974	-0.0044	2.95762925736716e-201	79183154	79183154	0	105595302	105595302
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105597555	1	0	NA	0	105595302	105595302	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.3607	NA	NA	NA	1.87568191254709e-251	105632168	105632168
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	227	0.0552	1.87568191254709e-251	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.1325	NA	NA	NA	6.77222397423178e-09	18692865	18749895
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20008227	135	129	-0.7152	6.77222397423178e-09	18692865	18749895	6.76188659264922e-07	19982333	20011950
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20009685	20316992	18	18	-0.3135	6.76188659264922e-07	19982333	20011950	2.64636473075322e-09	20079935	20364680
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	22968209	553	526	0.0946	2.64636473075322e-09	20079935	20364680	2.36605360079651e-09	22965959	22968209
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22974630	22981628	4	4	-0.7658	2.36605360079651e-09	22965959	22968209	2.64913612029038e-49	22978400	22991648
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22986324	100298352	30606	29595	-0.0129	2.64913612029038e-49	22978400	22991648	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2449777	969	926	0.0134	NA	NA	NA	0.0049581319286606	2431863	2449777
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2451892	2463465	6	6	0.4293	0.0049581319286606	2431863	2449777	4.88704824139608e-24	2463465	2482470
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2467056	28108584	8540	8242	0.0218	4.88704824139608e-24	2463465	2482470	1.72913040713103e-25	28104372	28119195
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28110613	28131049	11	9	-0.6617	1.72913040713103e-25	28104372	28119195	4.42160561772445e-15	28121036	28133442
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28133442	75093957	10997	10627	0.0159	4.42160561772445e-15	28121036	28133442	2.36431312522842e-31	75093957	75093957
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.7587	2.36431312522842e-31	75093957	75093957	3.24999309532300e-35	75100865	75100865
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	583	0.0373	3.249993095323e-35	75100865	75100865	1.61283523932073e-24	76923844	76929598
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9255	1.61283523932073e-24	76923844	76929598	3.43703270893495e-21	76940218	76942679
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4366	0.0272	3.43703270893495e-21	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	47546	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	48858	36673853	13870	13387	-0.0158	NA	NA	NA	8.96816030844147e-50	36673853	36673853
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	4	-1.9795	8.96816030844147e-50	36673853	36673853	3.00896577008420e-52	36684619	36684619
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41564408	2031	1959	-0.0401	3.0089657700842e-52	36684619	36684619	1.73833620539823e-19	41552048	41572001
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	42151941	52	52	-0.3746	1.73833620539823e-19	41552048	41572001	1.53534355413227e-17	42142363	42168548
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	42153189	1	0	NA	1.53534355413227e-17	42142363	42168548	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42155643	44725704	1180	1136	-0.0482	NA	NA	NA	7.43887275100563e-05	44699157	44736067
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	44727627	44748464	10	10	-0.4466	7.43887275100563e-05	44699157	44736067	1.17027644959270e-06	44740310	44761807
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	44750371	78653545	12483	12019	-0.0179	1.1702764495927e-06	44740310	44761807	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	172	0.0803	NA	NA	NA	7.58732395359588e-11	500897	500897
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	-1.0764	7.58732395359588e-11	500897	500897	9.36322903257876e-08	505456	506827
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	40226609	11617	11201	0.0254	9.36322903257876e-08	505456	506827	2.6640288788233e-11	40223036	40226609
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-1.0458	2.6640288788233e-11	40223036	40226609	2.42707238079944e-13	40235901	40244566
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	76116026	11167	10771	0.0181	2.42707238079944e-13	40235901	40244566	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	58196296	20460	19732	-0.0267	NA	NA	NA	4.25947488273037e-18	58159977	58213220
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58197961	58197961	1	0	NA	4.25947488273037e-18	58159977	58213220	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58198955	58249435	23	23	-0.2851	NA	NA	NA	0.00120101127980353	58223991	58292503
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58252109	63788698	2575	2491	-0.0514	0.00120101127980353	58223991	58292503	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	563	-0.0254	NA	NA	NA	3.05318915982397e-08	1499421	1506379
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.9866	3.05318915982397e-08	1499421	1506379	0.00823975184123959	1516966	1525300
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	5	-2.7176	0.00823975184123959	1516966	1525300	4.06431928742447e-127	1531162	1531162
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20251	0.0148	4.06431928742447e-127	1531162	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43645627	11898	11483	0.0031	NA	NA	NA	5.39615429816809e-08	43639857	43648176
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43661998	9	9	0.5228	5.39615429816809e-08	43639857	43648176	3.72477145447112e-07	43659103	43666311
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43663166	46922972	1534	1475	-0.0163	3.72477145447112e-07	43659103	43666311	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2882	0.0034	NA	NA	NA	4.89354719238021e-35	22644243	22677959
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22714979	17	17	0.804	4.89354719238021e-35	22644243	22677959	0.000485060546400928	22710302	22714979
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22715919	22715919	1	0	NA	0.000485060546400928	22710302	22714979	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22718614	22725305	4	4	0.3977	NA	NA	NA	2.19267465691764e-12	22725305	22795485
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6312	0.0197	2.19267465691764e-12	22725305	22795485	2.27527607202797e-90	35472378	35472378
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.5886	2.27527607202797e-90	35472378	35472378	6.29865860653405e-83	35476942	35476942
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6726	0.0101	6.29865860653405e-83	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	27	0.1064	NA	NA	NA	6.61288857912981e-14	124528	127113
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.1154	6.61288857912981e-14	124528	127113	9.43077012509236e-27	129544	130528
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	731	0.1204	9.43077012509236e-27	129544	130528	4.40391940972029e-07	1427338	1427392
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	3	-0.7052	4.40391940972029e-07	1427338	1427392	4.02493337471463e-09	1432953	1434970
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1518914	55	52	0.1049	4.02493337471463e-09	1432953	1434970	7.21117616522598e-05	1512143	1519743
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1519743	1526804	6	5	-0.3554	7.21117616522598e-05	1512143	1519743	1.40936249760064e-05	1522391	1529356
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1528179	1571340	38	37	0.0856	1.40936249760064e-05	1522391	1529356	2.70530204815872e-07	1571340	1571340
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1572418	1572553	2	2	0.8704	2.70530204815872e-07	1571340	1571340	5.00774464700057e-06	1572553	1573461
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1573461	1894973	248	243	0.001	5.00774464700057e-06	1572553	1573461	2.02215249273008e-06	1888202	1894973
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1907678	5	5	-0.5686	2.02215249273008e-06	1888202	1894973	2.77289187222109e-07	1907678	1910354
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1907912	2708291	648	623	0.0358	2.77289187222109e-07	1907678	1910354	0	2708291	2711273
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	52909690	17882	17264	1.0093	0	2708291	2711273	7.08929253290317e-12	52909690	52909690
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52921839	52921841	2	2	-0.3749	7.08929253290317e-12	52909690	52909690	2.33564336416812e-09	52921841	52968251
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52968251	76998610	5055	4876	1.0055	2.33564336416812e-09	52921841	52968251	2.58413172796259e-94	76998610	76998610
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-3.2502	2.58413172796259e-94	76998610	76998610	1.28850705791884e-102	77010018	77010018
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21296	1.0213	1.28850705791884e-102	77010018	77010018	4.9545900521987e-12	154031239	154044828
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	10	1.6966	4.9545900521987e-12	154031239	154044828	8.74761034460924e-09	154078819	154086636
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	88	0.9973	8.74761034460924e-09	154078819	154086636	1.94285849720068e-58	154442377	154442377
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.0769	1.94285849720068e-58	154442377	154442377	1.66602540580600e-59	154450309	154450309
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0703	1.666025405806e-59	154450309	154450309	5.42663802409774e-89	154578922	154582414
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.042	5.42663802409774e-89	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2779873	31	29	-4.0471	NA	NA	NA	0.00151041018769285	2771455	2779873
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2780704	2784560	4	4	-1.8131	0.00151041018769285	2771455	2779873	6.93330416150627e-06	2784560	2791440
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3223585	88	87	-4.0433	6.93330416150627e-06	2784560	2791440	4.82522330843183e-27	3219200	3773948
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	4.82522330843183e-27	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.3013	NA	NA	NA	2.47270720909435e-13	4948824	6688691
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	164	-3.682	2.47270720909435e-13	4948824	6688691	4.45409157516023e-09	7027599	7197846
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	119	-2.6881	4.45409157516023e-09	7027599	7197846	1.04541575902435e-05	7342985	7600570
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7709619	73	72	-3.7133	1.04541575902435e-05	7342985	7600570	0.0197003465596949	7645258	7835361
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7997485	86	82	-3.0851	0.0197003465596949	7645258	7835361	2.02818991010191e-07	7938700	8016395
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8178487	39	36	-4.2559	2.02818991010191e-07	7938700	8016395	0.000261937512724146	8149413	8186463
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8212681	12	12	-3.1297	0.000261937512724146	8149413	8186463	2.70616062029832e-05	8201959	8219845
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8214803	8280065	14	13	-4.3496	2.70616062029832e-05	8201959	8219845	3.25307169467813e-08	8259766	8293425
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8458018	40	36	-3.1034	3.25307169467813e-08	8259766	8293425	3.42615778019159e-05	8414160	8547778
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8463583	10513747	265	258	-3.8854	3.42615778019159e-05	8414160	8547778	2.29662831111818e-39	10512616	10513747
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	2.29662831111818e-39	10512616	10513747	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.1872	NA	NA	NA	2.08062091220561e-06	10645500	11698871
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	72	-2.6189	2.08062091220561e-06	10645500	11698871	0.00033205480420099	12605673	12700767
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.0401	0.00033205480420099	12605673	12700767	4.2754955546675e-07	12809152	12861657
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13119344	110	105	-2.475	4.2754955546675e-07	12809152	12861657	0.0469496636571751	12872417	13119344
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.1992	0.0469496636571751	12872417	13119344	7.72661176446139e-25	13128515	13128515
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-4.4698	7.72661176446139e-25	13128515	13128515	5.23181179868377e-07	13151875	13161955
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13256555	30	30	-2.9397	5.23181179868377e-07	13151875	13161955	3.04166266039582e-07	13230706	13281871
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13526852	124	122	-3.8974	3.04166266039582e-07	13230706	13281871	0.000156875812810656	13522778	13526852
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13527753	13532107	4	3	-5.9852	0.000156875812810656	13522778	13526852	1.08923333969640e-05	13532107	13533864
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13533021	13606316	35	35	-3.8688	1.0892333396964e-05	13532107	13533864	6.93595734141313e-05	13584982	13649497
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13705594	13	12	-2.8284	6.93595734141313e-05	13584982	13649497	3.51476397902662e-05	13701755	13767434
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14359748	198	186	-4.0409	3.51476397902662e-05	13701755	13767434	4.02088031749203e-06	14326935	14383746
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14426934	37	37	-3.2133	4.02088031749203e-06	14326935	14383746	0.0776790391362263	14376942	14440701
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14434038	14434038	1	0	NA	0.0776790391362263	14376942	14440701	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14434065	14451317	12	12	-4.0721	NA	NA	NA	1.22171972629857e-05	14448198	14475687
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14454048	14644293	74	69	-2.4171	1.22171972629857e-05	14448198	14475687	1.08100599662146e-14	14581797	14691724
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15095427	89	85	-3.9739	1.08100599662146e-14	14581797	14691724	3.50296311626669e-05	14948350	15144239
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15284717	95	93	-3.254	3.50296311626669e-05	14948350	15144239	1.00289043968968e-05	15257187	15311814
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	90	-3.9819	1.00289043968968e-05	15257187	15311814	2.55322255562643e-05	15426319	15433122
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-2.088	2.55322255562643e-05	15426319	15433122	8.02778041469958e-05	15447091	15455932
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-4.1103	8.02778041469958e-05	15447091	15455932	0.00140241760482315	15479343	15547576
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15687088	52	51	-3.1173	0.00140241760482315	15479343	15547576	3.51846034020104e-08	15626220	15699459
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15690301	1	0	NA	3.51846034020104e-08	15626220	15699459	NA	NA	NA
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15915466	36	34	-4.3826	NA	NA	NA	1.07287868714225e-06	15898644	15969469
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	159	-3.3122	1.07287868714225e-06	15898644	15969469	5.45071685454719e-06	16282623	16453776
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	48	-4.2168	5.45071685454719e-06	16282623	16453776	3.71709306417859e-05	16677667	16679419
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	16688132	3	3	-1.7178	3.71709306417859e-05	16677667	16679419	1.13552605791587e-05	16688132	16691287
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16689244	17076673	51	51	-4.004	1.13552605791587e-05	16688132	16691287	2.91627595287714e-08	17067188	17076673
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17083649	17101969	5	5	-1.9034	2.91627595287714e-08	17067188	17076673	3.3986352519966e-05	17101969	17122340
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17107617	19610243	269	257	-3.9395	3.3986352519966e-05	17101969	17122340	3.05892043482955e-08	19608039	19610243
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	0.0839	3.05892043482955e-08	19608039	19610243	1.3122190101179e-09	19613864	19613864
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	20384639	215	208	-4.0107	1.3122190101179e-09	19613864	19613864	1.2194850152362e-05	20364200	20387629
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20428887	5	5	-1.9999	1.2194850152362e-05	20364200	20387629	3.36330798369584e-05	20400879	20483950
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20448276	21036503	72	69	-4.0067	3.36330798369584e-05	20400879	20483950	3.14430619280692e-05	21025500	21036503
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-2.1786	3.14430619280692e-05	21025500	21036503	8.18456278781268e-06	21054519	21060047
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21439923	127	122	-3.9407	8.18456278781268e-06	21054519	21060047	3.53421028024392e-06	21406812	21459388
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21441438	21559551	17	17	-2.7625	3.53421028024392e-06	21406812	21459388	5.0002107559535e-05	21477616	21651837
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22139807	117	114	-3.9401	5.0002107559535e-05	21477616	21651837	6.08189303139038e-07	22052726	22158616
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1335	6.08189303139038e-07	22052726	22158616	3.60233539930031e-09	22175425	22179794
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	87	-4.1194	3.60233539930031e-09	22175425	22179794	1.32031946598219e-67	22926726	26870361
MSK_252152915706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.3223	1.32031946598219e-67	22926726	26870361	NA	NA	NA
