Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12762774	4514	4387	-0.0017	NA	NA	NA	7.64422912132058e-40	12762774	12762774
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12839991	7	7	-0.9028	7.64422912132058e-40	12762774	12762774	9.96550636233625e-41	12839991	12839991
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13101056	16816180	1264	1239	0.0049	9.96550636233625e-41	12839991	12839991	3.69536932249099e-09	16713074	16817525
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16817525	16963812	10	10	-0.3609	3.69536932249099e-09	16713074	16817525	1.85800800043140e-08	16961001	17094326
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	65140906	19193	18688	-0.0071	1.8580080004314e-08	16961001	17094326	3.9381665004438e-08	65138522	65140906
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	65142202	65146090	3	3	-0.6417	3.9381665004438e-08	65138522	65140906	2.62294016574772e-08	65146090	65149489
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	65149489	72537426	2903	2823	-0.002	2.62294016574772e-08	65146090	65149489	0	72537426	72537426
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	7	-3.0572	0	72537426	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	11110	-0.0022	NA	NA	NA	9.97136512220537e-12	109373255	109373255
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.9078	9.97136512220537e-12	109373255	109373255	6.11418821498558e-19	109376249	109376249
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109587768	58	57	-0.0185	6.11418821498558e-19	109376249	109376249	2.03583302698858e-06	109574982	109598075
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109589629	109640971	26	24	0.1571	2.03583302698858e-06	109574982	109598075	8.62625123619849e-07	109629738	109650655
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109642403	109739852	49	47	-0.0264	8.6262512361985e-07	109629738	109650655	1.23881062420783e-21	109739852	109739852
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109741426	109743299	2	2	-1.0036	1.23881062420783e-21	109739852	109739852	1.31822024494311e-14	109743299	109743299
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109745398	110023268	160	152	0.0269	1.31822024494311e-14	109743299	109743299	1.13430702317367e-07	110015739	110023268
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.5112	1.13430702317367e-07	110015739	110023268	1.23811720686572e-07	110039388	110060587
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150819879	5849	5669	1e-04	1.23811720686572e-07	110039388	110060587	1.14359914688935e-151	150819879	150819879
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.3323	1.14359914688935e-151	150819879	150819879	4.43819743545646e-146	150851439	150851439
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	161099582	4385	4254	-0.0066	4.43819743545646e-146	150851439	150851439	1.97019838965287e-16	161099582	161099582
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.074	1.97019838965287e-16	161099582	161099582	3.74654930773935e-17	161104791	161104791
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	192715640	11194	10892	-0.0017	3.74654930773935e-17	161104791	161104791	3.79046284337000e-21	192715640	192715640
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-1.1887	3.79046284337e-21	192715640	192715640	6.60676917587125e-21	192719540	192719540
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	200613454	2648	2580	0.0051	6.60676917587125e-21	192719540	192719540	5.51494735705695e-10	200598243	200625002
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200667381	19	19	-0.2665	5.51494735705695e-10	200598243	200625002	4.2990025838059e-09	200652799	200676505
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	247034455	17362	16902	-0.003	4.2990025838059e-09	200652799	200676505	3.99531105093463e-14	246941904	247065436
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247041513	247186514	61	60	0.179	3.99531105093463e-14	246941904	247065436	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	29584051	9434	9188	0.0017	NA	NA	NA	4.66351155617316e-12	29584051	29584051
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29585831	29587044	2	2	-0.9016	4.66351155617316e-12	29584051	29584051	2.23436680794249e-11	29587044	29587044
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29590856	37812045	3474	3383	8e-04	2.23436680794249e-11	29587044	29587044	6.14895981382658e-07	37785655	37819785
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37813211	37847519	17	17	-0.2449	6.14895981382658e-07	37785655	37819785	2.83418439782008e-07	37837974	37858379
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37848754	52600588	5805	5654	-2e-04	2.83418439782008e-07	37837974	37858379	2.90229798045082e-18	52600588	52600588
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	2.90229798045082e-18	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7787	NA	NA	NA	1.32113605174976e-18	52635695	52635695
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	60773726	2490	2431	-0.0066	1.32113605174976e-18	52635695	52635695	2.02389677803930e-25	60773726	60773726
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	60777457	60781420	3	3	-1.0631	2.0238967780393e-25	60773726	60773726	3.89545539133595e-25	60781420	60781420
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	60783685	146571330	23844	23190	-2e-04	3.89545539133595e-25	60781420	60781420	4.18444943530692e-48	146571330	146571330
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.2628	4.18444943530692e-48	146571330	146571330	1.53069896423899e-52	146592775	146592775
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2130	-0.0101	1.53069896423899e-52	146592775	146592775	0	154601442	154601442
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-4.9976	0	154601442	154601442	0	154606943	154606943
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179767214	8999	8756	-0.001	0	154606943	154606943	7.65082916517974e-205	179767214	179767214
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-3.0311	7.65082916517974e-205	179767214	179767214	1.08809043586681e-211	179778919	179778919
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	208057199	9107	8865	-0.0022	1.08809043586681e-211	179778919	179778919	3.05017439003506e-125	208057199	208057199
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-2.9122	3.05017439003506e-125	208057199	208057199	3.1749239797038e-125	208066245	208066245
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	242689978	12433	12081	0.004	3.1749239797038e-125	208066245	208066245	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	163992903	53487	52059	-7e-04	NA	NA	NA	9.95792530555783e-148	163992903	164001657
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.5214	9.95792530555783e-148	163992903	164001657	0.00125311565740708	164001657	164027724
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.8576	0.00125311565740708	164001657	164027724	2.72043123318177e-113	164107951	164107951
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9294	0.0031	2.72043123318177e-113	164107951	164107951	1.29277999837707e-25	192546280	192546280
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-1.0576	1.29277999837707e-25	192546280	192546280	9.05595518831265e-27	192550989	192550989
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	194354505	579	567	-0.0089	9.05595518831265e-27	192550989	192550989	0	194354505	194354505
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-4.2495	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	972	-0.0078	0	194366950	194366950	4.93841109815728e-155	196822133	196822133
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196942158	23	23	-0.9806	4.93841109815728e-155	196822133	196822133	0.000249994941370611	196929805	196952514
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196961238	8	8	-0.5039	0.000249994941370611	196929805	196952514	5.06469285350267e-13	196950095	196964180
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	925	-0.0192	5.06469285350267e-13	196950095	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	646459	200	198	0.0366	NA	NA	NA	9.93182349324005e-09	646459	646459
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	647898	649222	2	2	-0.7787	9.93182349324005e-09	646459	646459	3.70354311111952e-08	649222	652014
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	652014	9815760	3191	3106	0.0163	3.70354311111952e-08	649222	652014	3.04095143733416e-14	9815760	9815760
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9821327	1	0	NA	3.04095143733416e-14	9815760	9815760	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9827233	9842644	3	3	0.8628	NA	NA	NA	3.89271443162646e-17	9842644	9842644
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	48757999	10869	10581	-0.0103	3.89271443162646e-17	9842644	9842644	6.90576144537603e-10	48738470	48777988
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48759760	52432257	30	30	-0.2234	6.90576144537603e-10	48738470	48777988	1.91568213762502e-09	52422899	52454813
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52435304	52435304	1	0	NA	1.91568213762502e-09	52422899	52454813	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52438712	57735261	1890	1829	-0.0121	NA	NA	NA	1.50365826736273e-21	57733348	57745127
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57739809	57789510	13	12	0.4838	1.50365826736273e-21	57733348	57745127	6.94918711055944e-22	57783444	57795601
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57795601	63808626	1084	1053	0.006	6.94918711055944e-22	57783444	57795601	5.38626169710485e-14	63803025	63808626
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63817412	63842706	4	4	-0.6564	5.38626169710485e-14	63803025	63808626	8.533167392953e-12	63842706	63850157
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63850157	68905670	1145	1118	-0.004	8.533167392953e-12	63842706	63850157	2.69741327810284e-47	68905670	68905670
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.6882	2.69741327810284e-47	68905670	68905670	4.64188842072868e-49	69165814	69165814
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	191153613	36714	35767	-0.0024	4.64188842072868e-49	69165814	69165814	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	213	0.0148	NA	NA	NA	1.12168416586835e-12	729262	737829
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.6092	1.12168416586835e-12	729262	737829	1.98941694750718e-16	829954	870657
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	21480789	6124	5954	0.0012	1.98941694750718e-16	829954	870657	1.03773504476393e-34	21480789	21480789
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.5263	1.03773504476393e-34	21480789	21480789	6.90676626019306e-35	21487474	21487474
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	21488938	1	0	NA	6.90676626019306e-35	21487474	21487474	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21490654	32505619	2570	2489	-0.0033	NA	NA	NA	1.81681039702022e-09	32501483	32505619
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32509903	32512921	2	2	-0.804	1.81681039702022e-09	32501483	32505619	5.33991356373185e-09	32512921	32512921
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32516862	106249939	20324	19764	-0.0038	5.33991356373185e-09	32512921	32512921	2.77658013646735e-12	106249939	106249939
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106257356	106260946	2	2	-0.927	2.77658013646735e-12	106249939	106249939	1.65960852587235e-12	106260946	106260946
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106272412	110443406	1329	1297	-0.0037	1.65960852587235e-12	106260946	106260946	4.88747508179853e-33	110442151	110443406
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	110445097	110474023	14	14	0.5579	4.88747508179853e-33	110442151	110443406	8.33133854329288e-34	110474023	110475768
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	110475768	140201609	9483	9204	-0.0036	8.33133854329288e-34	110474023	110475768	7.51799744047199e-15	140200229	140201609
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	0.4951	7.51799744047199e-15	140200229	140201609	3.44382164888837e-14	140216524	140219465
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	178026788	12646	12311	0.0029	3.44382164888837e-14	140216524	140219465	2.31938638126764e-07	178017588	178044111
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178031127	178057089	9	9	-0.3396	2.31938638126764e-07	178017588	178044111	5.2965474907168e-08	178047480	178061809
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178058520	180644810	1024	991	0.0275	5.2965474907168e-08	178047480	178061809	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	37	0.1458	NA	NA	NA	1.19127037700880e-25	191387	202063
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	60	-0.2532	1.1912703770088e-25	191387	202063	5.5321469656986e-30	318496	334423
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	17482872	6025	5856	0.0032	5.5321469656986e-30	318496	334423	5.20042300972784e-11	17482872	17482872
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-0.8581	5.20042300972784e-11	17482872	17482872	7.06752663491701e-11	17488010	17488010
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	26811016	3238	3149	-0.0094	7.06752663491701e-11	17488010	17488010	1.25716826157984e-07	26797255	26811016
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26863540	5	5	0.4445	1.25716826157984e-07	26797255	26811016	9.01533245763802e-07	26863540	26868404
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26865624	29950805	1216	1183	0.0058	9.01533245763802e-07	26863540	26868404	1.28706649582562e-10	29939288	29966336
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29985620	7	7	0.4676	1.28706649582562e-10	29939288	29966336	1.13772485894634e-08	29980445	29995247
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29986370	32558677	1083	1059	0.0152	1.13772485894634e-08	29980445	29995247	2.79579757302741e-192	32558677	32558677
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	2.79579757302741e-192	32558677	32558677	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32593151	5	3	-3.1761	NA	NA	NA	1.29480710302645e-10	32593151	32593151
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32600962	3	3	-0.9374	1.29480710302645e-10	32593151	32593151	7.80123678240544e-19	32600962	32600962
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	67060622	11077	10769	-0.0047	7.80123678240544e-19	32600962	32600962	5.97426902610984e-16	67055837	67060622
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.6138	5.97426902610984e-16	67055837	67060622	8.58699717805232e-16	67105238	67111812
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	67109079	1	0	NA	8.58699717805232e-16	67105238	67111812	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67111812	79018959	3654	3543	-0.0011	NA	NA	NA	1.25107528743361e-79	79018959	79018959
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.9216	1.25107528743361e-79	79018959	79018959	8.9215234613739e-75	79091850	79091850
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	713	-0.0083	8.9215234613739e-75	79091850	79091850	2.06847016508989e-20	81334248	81334248
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-1.0063	2.06847016508989e-20	81334248	81334248	3.64457999694700e-22	81348170	81348170
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	103841482	6031	5881	-2e-04	3.644579996947e-22	81348170	81348170	1.53744216773367e-26	103841482	103841482
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9511	1.53744216773367e-26	103841482	103841482	2.87199721779309e-27	103868154	103868154
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	162502077	20143	19612	-6e-04	2.87199721779309e-27	103868154	103868154	1.01630405957156e-15	162502077	162502077
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-1.0341	1.01630405957156e-15	162502077	162502077	4.1544815832174e-17	162505819	162505819
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	930	0.0035	4.1544815832174e-17	162505819	162505819	3.11886802925070e-38	165643653	165643653
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.0951	3.1188680292507e-38	165643653	165643653	2.85803746605593e-31	165650610	165650610
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	168613068	1101	1078	0.0161	2.85803746605593e-31	165650610	165650610	1.33344801509852e-24	168613068	168613068
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168616766	168619774	3	3	-1.0919	1.33344801509852e-24	168613068	168613068	6.97671469312965e-26	168619774	168619774
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168622847	170753106	700	684	0.0072	6.97671469312965e-26	168619774	168619774	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	38257171	13599	13211	0.002	NA	NA	NA	4.47920752668345e-10	38229583	38284077
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38258332	38349033	46	44	-0.1775	4.47920752668345e-10	38229583	38284077	1.91882081191551e-10	38320617	38401723
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38360187	75186980	8841	8601	-0.0073	1.91882081191551e-10	38320617	38401723	1.42060409580177e-10	75185783	75192598
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75188956	75207560	8	7	0.4471	1.42060409580177e-10	75185783	75192598	7.27410238053412e-10	75201030	75212042
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	109217320	12467	12139	-0.0066	7.27410238053412e-10	75201030	75212042	0	109217320	109217320
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	-4.0353	0	109217320	109217320	0	109240210	109240210
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	125831554	7472	7290	-3e-04	0	109240210	109240210	7.11471283939761e-10	125831554	125831554
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125833251	1	0	NA	7.11471283939761e-10	125831554	125831554	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125836353	125837524	2	2	0.8515	NA	NA	NA	1.16797035548036e-10	125837524	125837524
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3541	0.0016	1.16797035548036e-10	125837524	125837524	8.91664590076551e-27	133433384	133433384
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6653	8.91664590076551e-27	133433384	133433384	3.11167157284141e-26	133448277	133453811
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141409512	3699	3576	-0.0063	3.11167157284141e-26	133448277	133453811	1.13586185886454e-18	141406414	141413352
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141440184	15	15	0.4106	1.13586185886454e-18	141406414	141413352	6.59169553541473e-17	141435643	141443577
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	158821263	6878	6691	-0.0032	6.59169553541473e-17	141435643	141443577	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0735	NA	NA	NA	2.72772987246677e-80	581533	581533
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.5985	2.72772987246677e-80	581533	581533	1.21027627551976e-90	588865	588865
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	599	-0.0031	1.21027627551976e-90	588865	588865	4.00911122140535e-16	2234351	2234351
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.7871	4.00911122140535e-16	2234351	2234351	3.00993384359926e-15	2251011	2257255
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	3771559	626	607	-0.0177	3.00993384359926e-15	2251011	2257255	2.34037155115993e-13	3771559	3771559
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3773975	3776617	2	2	-1.0391	2.34037155115993e-13	3771559	3771559	4.72981739385864e-16	3776617	3776617
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3779135	25022606	6760	6582	0.0032	4.72981739385864e-16	3776617	3776617	2.77048396578872e-24	25022606	25022606
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.0428	2.77048396578872e-24	25022606	25022606	8.96999783556532e-25	25039370	25039370
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	40892587	5442	5280	-0.0083	8.96999783556532e-25	25039370	25039370	9.1542592678284e-308	40892587	40892587
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.4887	9.1542592678284e-308	40892587	40892587	2.01378698950075e-309	40897469	40897469
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30172	-0.0046	2.01378698950075e-309	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36876	-0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	1919941	767	747	0.0065	NA	NA	NA	6.86759744958234e-22	1914929	1919941
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	1922319	1954702	9	9	0.6404	6.86759744958234e-22	1914929	1919941	0.000523299680253303	1949650	1971778
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	1957678	1978309	6	6	0.3885	0.000523299680253303	1949650	1971778	1.60800654962027e-06	1975245	1982656
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	1980637	27038538	8947	8721	-0.0104	1.60800654962027e-06	1975245	1982656	2.60765860279155e-38	27038538	27038538
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.6207	2.60765860279155e-38	27038538	27038538	1.02235441749884e-36	27041812	27041812
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	70949263	11944	11632	-0.0083	1.02235441749884e-36	27041812	27041812	1.46192575090619e-12	70947915	70949263
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.6865	1.46192575090619e-12	70947915	70949263	1.35563463592342e-13	70960187	70964344
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2835	7e-04	1.35563463592342e-13	70960187	70964344	3.51759172176887e-28	77917893	77917893
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.1322	3.51759172176887e-28	77917893	77917893	1.56070649212252e-28	77928738	77928738
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7578	-0.0018	1.56070649212252e-28	77928738	77928738	3.50146844173789e-16	100676022	100676022
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.7481	3.50146844173789e-16	100676022	100676022	3.36760178213954e-16	100686787	100686787
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135085997	12393	12061	0.0036	3.36760178213954e-16	100686787	100686787	4.62386037376788e-48	135082051	135122727
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135102317	135285645	54	50	0.3663	4.62386037376788e-48	135082051	135122727	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	43852610	14762	14345	-0.0014	NA	NA	NA	0.000316995624101483	43791733	43857323
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	43857323	43861274	3	3	0.3154	0.000316995624101483	43791733	43857323	3.0044193755131e-07	43859140	43900790
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	43864680	81536990	12135	11784	0.0036	3.0044193755131e-07	43859140	43900790	6.0234906801136e-15	81536990	81536990
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81538067	81540765	2	2	-1.0452	6.0234906801136e-15	81536990	81536990	2.88086504298268e-16	81540765	81540765
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	84939432	1362	1329	-0.009	2.88086504298268e-16	81540765	81540765	6.81428980828427e-41	84939432	84939432
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84939605	84939605	1	0	NA	6.81428980828427e-41	84939432	84939432	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84951675	6	6	-0.9502	NA	NA	NA	5.00941050638081e-41	84951675	84951675
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	134405096	17021	16573	1e-04	5.00941050638081e-41	84951675	84951675	5.50823342288036e-10	134382470	134409214
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134407050	134450318	12	12	0.2696	5.50823342288036e-10	134382470	134409214	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	246072	91	90	0.1424	NA	NA	NA	1.34021833951535e-08	205188	286554
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	247298	736988	205	199	-0.0072	1.34021833951535e-08	205188	286554	4.08808352790763e-07	731485	736988
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	0.5312	4.08808352790763e-07	731485	736988	1.00032841282537e-07	743223	745410
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3345	0.0068	1.00032841282537e-07	743223	745410	0	9523923	9523923
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.676	0	9523923	9523923	1.93882728851037e-43	9554149	9554149
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	11	-1.345	1.93882728851037e-43	9554149	9554149	1.90789259380759e-144	9610054	9610054
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10462211	326	315	-0.0111	1.90789259380759e-144	9610054	9610054	6.49616062319002e-11	10457163	10470425
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	10	-0.3628	6.49616062319002e-11	10457163	10470425	1.11492373787187e-08	10477903	10497371
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11395862	312	305	0.0121	1.11492373787187e-08	10477903	10497371	3.96874280750757e-10	11393473	11395862
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11440927	7	7	0.4863	3.96874280750757e-10	11393473	11395862	3.45181973688833e-12	11440927	11452868
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	31132762	6742	6572	-0.0074	3.45181973688833e-12	11440927	11452868	2.77054920588398e-44	31132716	31171313
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	-0.601	2.77054920588398e-44	31132716	31171313	1.97819285337106e-43	31233136	31242528
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	130694393	33343	32426	-0.0078	1.97819285337106e-43	31233136	31242528	3.02343599786832e-23	130694393	130694393
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.269	3.02343599786832e-23	130694393	130694393	2.17633046438163e-20	130701040	130701040
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	628	0.0059	2.17633046438163e-20	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13667	9e-04	NA	NA	NA	4.83229685336914e-64	56650373	56650373
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	16	0.7309	4.83229685336914e-64	56650373	56650373	2.27315290932251e-65	56686863	56686863
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	71703277	3729	3615	0.0049	2.27315290932251e-65	56686863	56686863	2.18968433403570e-19	71703277	71703277
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-1.1234	2.1896843340357e-19	71703277	71703277	5.09402043821356e-19	71708737	71708737
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	99417382	8735	8512	9e-04	5.09402043821356e-19	71708737	71708737	1.45523362151726e-18	99417382	99417382
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99419235	99421920	2	2	-1.1103	1.45523362151726e-18	99417382	99417382	1.25323952945740e-20	99421920	99421920
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99423114	100690991	571	550	0.0095	1.2532395294574e-20	99421920	99421920	0	100690991	100690991
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.9078	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4431	0.0055	0	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.2963	NA	NA	NA	1.11730567751737e-05	18505611	19271102
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.729	1.11730567751737e-05	18505611	19271102	8.267166983772e-201	19492531	19494416
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	37202507	6755	6571	-0.0116	8.267166983772e-201	19492531	19494416	4.20796634332284e-08	37196728	37202507
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	37207126	37209113	2	2	-0.7782	4.20796634332284e-08	37196728	37202507	2.64597013866732e-09	37209113	37211599
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	37211599	40680589	832	813	0.0122	2.64597013866732e-09	37209113	37211599	3.85717146422543e-14	40676611	40680589
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.5463	3.85717146422543e-14	40676611	40680589	1.42433171972908e-12	40722360	40726930
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	105595302	23986	23328	-4e-04	1.42433171972908e-12	40722360	40726930	4.00429611362145e-11	105587020	105606424
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105681007	15	15	-0.3268	4.00429611362145e-11	105587020	105606424	0.00221599632135158	105622008	105739770
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105787390	19	18	-0.0675	0.00221599632135158	105622008	105739770	1.01061003978207e-13	105783533	105787390
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105795807	5	5	-0.7678	1.01061003978207e-13	105783533	105787390	1.20409974179078e-22	105795807	105798116
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105850033	22	21	0.0867	1.20409974179078e-22	105795807	105798116	3.29241499463916e-18	105848335	105850033
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-0.6956	3.29241499463916e-18	105848335	105850033	5.17249822059594e-12	105875924	105881677
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105948347	19	19	0.0725	5.17249822059594e-12	105875924	105881677	1.22877729314847e-26	105946993	105951399
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	106002179	17	16	-0.7684	1.22877729314847e-26	105946993	105951399	7.26273429950917e-58	105998412	106013552
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	89	0.0671	7.26273429950917e-58	105998412	106013552	9.09405858820406e-35	106216726	106219784
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	15	0.7198	9.09405858820406e-35	106216726	106219784	1.19472122499902e-23	106252126	106253648
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.1387	1.19472122499902e-23	106252126	106253648	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18837737	15	15	-0.0329	NA	NA	NA	3.7545640372087e-08	18835660	18837737
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	3	-0.831	3.7545640372087e-08	18835660	18837737	6.999627792231e-18	18848213	18848213
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19465359	79	78	0.1307	6.999627792231e-18	18848213	18848213	4.44960301308326e-17	19415360	19805960
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20308014	59	58	0.4021	4.44960301308326e-17	19415360	19805960	1.06269160638650e-67	20088256	20316992
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	30249934	2727	2646	-0.0058	1.0626916063865e-67	20088256	20316992	1.43383095169544e-17	30249934	30249934
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	30298096	30302213	2	2	-1.127	1.43383095169544e-17	30249934	30249934	8.06114632455545e-18	30302213	30302213
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	30326899	53441637	9415	9171	-0.0087	8.06114632455545e-18	30302213	30302213	3.47990562070374e-51	53441637	53441637
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53442883	53443742	2	2	-1.8841	3.47990562070374e-51	53441637	53441637	1.69066850504020e-52	53443742	53443742
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53444740	82332155	12206	11871	9e-04	1.6906685050402e-52	53443742	53443742	1.16704140811821e-11	82332155	82332155
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-0.9082	1.16704140811821e-11	82332155	82332155	8.127783976935e-12	82334704	82334704
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	98232932	5897	5739	0.0039	8.127783976935e-12	82334704	82334704	4.2976500383668e-17	98232932	98232932
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	0.8921	4.2976500383668e-17	98232932	98232932	2.00059434758229e-17	98239454	98239454
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	888	0.0232	2.00059434758229e-17	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	37560	1296506	471	458	0.0441	NA	NA	NA	3.79314858225865e-06	1289711	1296506
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1296767	1300341	3	3	0.7056	3.79314858225865e-06	1289711	1296506	3.75325450113608e-15	1300341	1302875
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	32379126	10098	9828	-0.0109	3.75325450113608e-15	1300341	1302875	3.52437059193992e-38	31845232	32515876
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	44	-0.3574	3.52437059193992e-38	31845232	32515876	2.80286201700606e-40	33533440	33842125
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	54390060	3089	3004	-0.0044	2.80286201700606e-40	33533440	33842125	5.41303741040523e-14	54379839	54399890
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54408446	5	5	0.6175	5.41303741040523e-14	54379839	54399890	1.13983241359532e-14	54405667	54410800
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	74091505	6508	6340	-0.0095	1.13983241359532e-14	54405667	54410800	6.21997959258558e-11	74083479	74097511
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74092696	74134999	19	19	-0.2894	6.21997959258558e-11	74083479	74097511	6.39266162464415e-12	74127552	74141966
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74137609	75093957	284	279	-0.0095	6.39266162464415e-12	74127552	74141966	4.04679864166528e-84	75093957	75093957
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.2089	4.04679864166528e-84	75093957	75093957	4.44207649350729e-70	75100865	75100865
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	598	-0.0035	4.44207649350729e-70	75100865	75100865	1.88564888602821e-126	76925748	76933534
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76929598	1	0	NA	1.88564888602821e-126	76925748	76933534	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	7	-1.7918	NA	NA	NA	5.05358630081211e-70	76937156	76940218
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	77219139	136	131	0.0122	5.05358630081211e-70	76937156	76940218	1.22255053885613e-09	77208343	77223360
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77220324	77249621	16	16	0.3227	1.22255053885613e-09	77208343	77223360	4.61534347366318e-11	77246991	77258422
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77251138	88690571	4361	4238	0.0086	4.61534347366318e-11	77246991	77258422	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	10686151	4696	4574	-0.0163	NA	NA	NA	4.61001762290166e-11	10684854	10686151
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10688220	10695815	5	5	0.5583	4.61001762290166e-11	10684854	10686151	8.32038403710571e-11	10695815	10697884
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10697884	31470227	7341	7131	8e-04	8.32038403710571e-11	10695815	10697884	1.19727108751416e-08	31462463	31473186
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31471890	31499568	13	12	-0.3236	1.19727108751416e-08	31462463	31473186	7.41696018245224e-08	31492553	31893451
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1771	-0.0145	7.41696018245224e-08	31492553	31893451	2.26118885575771e-194	36673853	36673853
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.1112	2.26118885575771e-194	36673853	36673853	3.57437645445388e-193	36684619	36684619
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1758	-0.0085	3.57437645445388e-193	36684619	36684619	2.77820195557588e-16	40874079	40874079
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41011530	2	2	-1.0817	2.77820195557588e-16	40874079	40874079	7.24980387330587e-14	41011530	41015177
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41015177	41519702	202	197	-0.0054	7.24980387330587e-14	41011530	41015177	1.47418433935464e-47	41518222	41521544
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	-0.6292	1.47418433935464e-47	41518222	41521544	1.57466806257888e-28	41564408	41570512
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41648545	38	36	-0.03	1.57466806257888e-28	41564408	41570512	0.000583314105235369	41635536	41700762
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	41710400	8	7	0.3598	0.000583314105235369	41635536	41700762	2.50756353346864e-06	41700762	42147225
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3383	-0.006	2.50756353346864e-06	41700762	42147225	1.99830813412168e-06	52438207	52440878
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.5677	1.99830813412168e-06	52438207	52440878	2.96940376393892e-14	52447064	52455229
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9922	-0.0039	2.96940376393892e-14	52447064	52455229	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	54078204	16579	16130	-0.0058	NA	NA	NA	9.27910180523897e-30	54078204	54078204
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-1.0064	9.27910180523897e-30	54078204	54078204	1.34592102426026e-30	54087468	54087468
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	75904995	6296	6147	0.0026	1.34592102426026e-30	54087468	54087468	7.01004745410458e-19	75845192	75935969
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75907351	76116026	85	84	0.1779	7.01004745410458e-19	75845192	75935969	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	58201323	20463	19916	-0.0198	NA	NA	NA	3.35895220599115e-08	58191244	58203159
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58203159	58247367	20	20	-0.2784	3.35895220599115e-08	58191244	58203159	4.65534572007359e-09	58244012	58262497
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58249435	59414898	572	555	-0.015	4.65534572007359e-09	58244012	58262497	7.40650241439092e-12	59412581	59421197
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	0.4094	7.40650241439092e-12	59412581	59421197	2.71892486701401e-11	59434159	59441741
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1944	-0.0019	2.71892486701401e-11	59434159	59441741	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	573	0.0204	NA	NA	NA	1.95678984549144e-64	1506379	1506379
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9376	1.95678984549144e-64	1506379	1506379	5.62207854138816e-66	1532433	1532433
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20426	-0.001	5.62207854138816e-66	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2969	0.003	NA	NA	NA	7.29206459277325e-16	22573420	22573420
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-0.857	7.29206459277325e-16	22573420	22573420	7.30025873447416e-16	22585040	22585040
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	46702134	10280	10023	9e-04	7.30025873447416e-16	22585040	22585040	1.01355475411740e-23	46682413	46719690
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46704545	46922972	95	93	0.1888	1.0135547541174e-23	46682413	46719690	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21571489	2521	2466	0.0064	NA	NA	NA	8.30759774800327e-10	21570227	21571489
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.731	8.30759774800327e-10	21570227	21571489	1.76736935033143e-09	21576859	21579649
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	23997055	1085	1054	0.02	1.76736935033143e-09	21576859	21579649	5.78248202967805e-128	23991961	23999908
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23999908	24239149	87	86	0.5129	5.78248202967805e-128	23991961	23999908	4.68390094823895e-170	24237964	24241592
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24241592	35472378	5856	5692	-0.004	4.68390094823895e-170	24237964	24241592	2.8029146309113e-08	35469770	35472378
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	0.7655	2.8029146309113e-08	35469770	35472378	1.48194672007132e-07	35476942	35478503
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1182	0.0107	1.48194672007132e-07	35476942	35478503	2.14724257741695e-67	37685496	37689058
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-0.7984	2.14724257741695e-67	37685496	37689058	9.35916656687333e-66	37715370	37715385
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5606	0.0054	9.35916656687333e-66	37715370	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	-0.0039	NA	NA	NA	0.00269752568377462	1529	94062
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-0.4967	0.00269752568377462	1529	94062	1.48909992189779e-06	104732	111851
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	742385	483	472	-0.0499	1.48909992189779e-06	104732	111851	2.70047558107512e-13	739660	742385
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	747220	3	3	-1.011	2.70047558107512e-13	739660	742385	1.58837533085936e-10	747220	747837
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747837	2708291	1294	1263	-0.0972	1.58837533085936e-10	747220	747837	0	2708291	2711273
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8437023	1782	1734	0.8589	0	2708291	2711273	3.02325512776332e-09	8411159	8458058
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8439398	8473482	17	17	0.5314	3.02325512776332e-09	8411159	8458058	1.49017636892355e-17	8450789	8477126
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	55775967	17026	16567	0.9083	1.49017636892355e-17	8450789	8477126	7.63428084448409e-19	55775967	55775967
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55782983	55783009	2	2	-0.2074	7.63428084448409e-19	55775967	55775967	4.21438857284384e-12	55783009	55783009
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55793888	76998610	4112	4003	0.8824	4.21438857284384e-12	55783009	55783009	3.46773757006039e-224	76998610	76998610
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-3.6948	3.46773757006039e-224	76998610	76998610	3.82921857733583e-243	77010018	77010018
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21487	0.9017	3.82921857733583e-243	77010018	77010018	4.90406435442042e-56	154038318	154038318
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.8951	4.90406435442042e-56	154038318	154038318	1.56193774083889e-53	154078819	154078819
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154582414	122	121	0.8946	1.56193774083889e-53	154078819	154078819	0	154582414	154582414
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154806872	137	135	-0.0039	0	154582414	154582414	4.07216757709203e-10	154782970	154823144
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154806929	154888224	64	61	0.173	4.07216757709203e-10	154782970	154823144	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-4.8024	NA	NA	NA	0.00381508226701528	2717644	2773629
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2865081	59	57	-3.6196	0.00381508226701528	2717644	2773629	2.00618482618280e-06	2827298	2876787
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2865932	3733715	55	52	-4.4964	2.0061848261828e-06	2827298	2876787	7.42788163735717e-47	3733715	3773948
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.7709	7.42788163735717e-47	3733715	3773948	3.68619801621435e-23	5422507	6652845
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	166	-3.7855	3.68619801621435e-23	5422507	6652845	1.82170450772040e-06	7009137	7205930
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	127	-2.9901	1.8217045077204e-06	7009137	7205930	1.21299915670096e-15	7352452	7606496
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	10513747	522	503	-3.8626	1.21299915670096e-15	7352452	7606496	3.74351946167639e-29	10512616	10515697
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10631941	12	11	-0.6767	3.74351946167639e-29	10512616	10515697	4.72014661129437e-06	10620136	11698871
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	10645500	1	0	NA	4.72014661129437e-06	10620136	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	70	-2.8554	NA	NA	NA	9.9554941144098e-06	12619162	12696242
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.3793	9.9554941144098e-06	12619162	12696242	1.24097166709631e-06	12809152	12857197
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12982236	54	52	-3.0106	1.24097166709631e-06	12809152	12857197	1.61749103591966e-06	12965378	12996552
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12992839	13045641	25	23	-1.7249	1.61749103591966e-06	12965378	12996552	0.000189728293909033	13034069	13080405
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13048283	13119344	31	30	-2.8322	0.000189728293909033	13034069	13080405	0.00124148174965855	13104920	13119344
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.2758	0.00124148174965855	13104920	13119344	2.04326995393019e-15	13128515	13128515
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13159901	17	17	-4.1066	2.04326995393019e-15	13128515	13128515	0.00159622394017343	13151875	13202163
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13161955	13261173	28	28	-3.1482	0.00159622394017343	13151875	13202163	1.30914838984335e-07	13236901	13286708
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	14122129	333	319	-4.0833	1.30914838984335e-07	13236901	13286708	3.14975713016853e-06	14118164	14130722
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.6068	3.14975713016853e-06	14118164	14130722	1.06651713797897e-13	14143748	14143748
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	28	-4.3576	1.06651713797897e-13	14143748	14143748	1.58082491757372e-05	14338189	14377844
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	94	-3.3557	1.58082491757372e-05	14338189	14377844	0.00166361065566628	14489032	14555872
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14526446	1	0	NA	0.00166361065566628	14489032	14555872	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14528771	14579298	23	23	-2.2854	NA	NA	NA	1.37327975684957e-11	14555872	14596156
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15095427	99	99	-4.0958	1.37327975684957e-11	14555872	14596156	0.000401983713578689	14952770	15175926
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15284717	95	88	-3.438	0.000401983713578689	14952770	15175926	5.52589386084598e-06	15249591	15308025
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	93	-4.2392	5.52589386084598e-06	15249591	15308025	1.07856737647391e-06	15410566	15468160
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15707307	93	87	-3.4086	1.07856737647391e-06	15410566	15468160	0.000790625935771896	15626220	15707307
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15713288	15765251	9	9	-4.9278	0.000790625935771896	15626220	15707307	3.82178256992625e-06	15761232	15784249
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15774136	15854496	16	16	-3.9236	3.82178256992625e-06	15761232	15784249	3.14512772924979e-06	15838612	15854496
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15862122	15915466	8	8	-4.9268	3.14512772924979e-06	15838612	15854496	0.000512252827381212	15915466	15951430
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16217583	127	124	-3.3479	0.000512252827381212	15915466	15951430	7.57487705296693e-12	16191571	16253090
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	16218742	1	0	NA	7.57487705296693e-12	16191571	16253090	NA	NA	NA
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16219596	16743891	101	99	-4.3452	NA	NA	NA	0.000237678833993533	16614663	17073540
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16745171	17873030	192	180	-3.8496	0.000237678833993533	16614663	17073540	0.00429456132454452	17665718	19498614
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17880585	19610243	118	112	-4.2457	0.00429456132454452	17665718	19498614	5.21365185675003e-09	19608039	19610243
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2763	5.21365185675003e-09	19608039	19610243	6.92870634158477e-08	19613864	19614809
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21497583	438	421	-4.0072	6.92870634158477e-08	19613864	19614809	1.14875544886025e-05	21478199	21497583
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-1.7563	1.14875544886025e-05	21478199	21497583	2.62539594138025e-06	21559551	21574425
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	21666200	10	10	-3.5972	2.62539594138025e-06	21559551	21574425	9.7477888409238e-06	21634923	21666200
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21669178	21687813	9	9	-4.8649	9.7477888409238e-06	21634923	21666200	4.36876482467641e-06	21683523	21689031
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21689031	21693283	4	4	-3.7693	4.36876482467641e-06	21683523	21689031	0.00650144369595813	21693283	21705007
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21693809	21761022	9	9	-2.8174	0.00650144369595813	21693283	21705007	3.63788163512338e-12	21752451	21763911
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	21964994	46	45	-4.2652	3.63788163512338e-12	21752451	21763911	4.78398641472161e-11	21958812	21964994
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21969110	22002703	10	10	-3.0058	4.78398641472161e-11	21958812	21964994	0.00116893707397728	21995639	22026566
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22002762	22139807	29	27	-3.9236	0.00116893707397728	21995639	22026566	7.3928996836927e-16	22058759	22139807
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8412	7.3928996836927e-16	22058759	22139807	7.32343794000548e-21	22177335	22178964
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	88	-4.2165	7.32343794000548e-21	22177335	22178964	1.11482405228604e-91	22930737	23283689
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-1.2243	1.11482405228604e-91	22930737	23283689	9.60752541583473e-09	26943701	26950080
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.2307	9.60752541583473e-09	26943701	26950080	5.06203108344298e-06	26965406	26989053
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.3261	5.06203108344298e-06	26965406	26989053	1.41867191947499e-10	27019256	27019256
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.771	1.41867191947499e-10	27019256	27019256	8.70497959876556e-20	27039222	27053237
MSK_252152915582_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.6157	8.70497959876556e-20	27039222	27053237	NA	NA	NA
