Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16963812	5795	5421	0.0026	NA	NA	NA	7.85919571850464e-12	16923767	17080364
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17148592	13	13	-0.5304	7.85919571850464e-12	16923767	17080364	1.17229261037652e-12	17127039	17157415
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	34734522	7067	6567	0.0184	1.17229261037652e-12	17127039	17157415	2.79766927522337e-07	34726946	34734522
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34739490	34758017	3	3	0.8992	2.79766927522337e-07	34726946	34734522	1.65475977900541e-07	34758017	34761645
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	72536231	15015	13991	4e-04	1.65475977900541e-07	34758017	34761645	1.38726998765201e-119	72536231	72536231
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	1.38726998765201e-119	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.5852	NA	NA	NA	1.25443400789401e-123	72579311	72579311
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	147311437	16265	15169	-0.0042	1.25443400789401e-123	72579311	72579311	0	147311437	147329819
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147313991	147313991	1	0	NA	0	147311437	147329819	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147446584	22	22	-2.2392	NA	NA	NA	0.0386920257472453	147346371	147446584
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147458669	147497268	8	7	-0.7726	0.0386920257472453	147346371	147446584	1.51033859102457e-15	147497268	147508217
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150839754	1264	1187	0.0249	1.51033859102457e-15	147497268	147508217	1.03147838510581e-234	150839754	150839754
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150847304	5	5	-3.6392	1.03147838510581e-234	150839754	150839754	6.53578805591837e-225	150847304	150847304
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	247186514	35675	33376	-0.0027	6.53578805591837e-225	150847304	150847304	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10120	-0.0155	NA	NA	NA	1.31910005710741e-113	33076512	33076512
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.0803	1.31910005710741e-113	33076512	33076512	1.23666480100521e-107	33080437	33080437
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34551222	645	604	-0.01	1.23666480100521e-107	33080437	33080437	3.53231933670584e-33	34543992	34551222
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34580533	14	14	0.8568	3.53231933670584e-33	34543992	34551222	9.65952051725244e-36	34580533	34582272
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	146571330	33537	31255	-0.007	9.65952051725244e-36	34580533	34582272	4.77850674116985e-26	146571330	146571330
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.3792	4.77850674116985e-26	146571330	146571330	2.88318483671415e-25	146592775	146592775
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	30554	-0.0042	2.88318483671415e-25	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	53001678	18662	17392	-0.0059	NA	NA	NA	1.01500567514257e-12	52999601	53001678
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53010535	4	4	-0.9033	1.01500567514257e-12	52999601	53001678	3.89278715663854e-10	53010535	53011885
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53011885	133189686	25043	23377	-0.009	3.89278715663854e-10	53010535	53011885	9.78104541701479e-92	133189686	133189686
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-3.6682	9.78104541701479e-92	133189686	133189686	1.83867126129153e-91	133194685	133194685
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.83867126129153e-91	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9119	0.0018	NA	NA	NA	2.01191229528937e-24	164001657	164005577
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2154	2.01191229528937e-24	164001657	164005577	5.6881287857962e-24	164027724	164027724
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9465	0.0063	5.6881287857962e-24	164027724	164027724	0	194354505	194354505
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.7333	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1833	0.0103	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17221	-0.0072	NA	NA	NA	4.01499780671725e-21	68899247	68905670
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.6627	4.01499780671725e-21	68899247	68905670	1.54280683950066e-20	69165814	69656183
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119334954	16298	15208	-8e-04	1.54280683950066e-20	69165814	69656183	9.34529669684882e-10	119333701	119334954
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-1.0095	9.34529669684882e-10	119333701	119334954	9.6652329943646e-10	119348829	119350354
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	164827563	12424	11618	-0.0041	9.6652329943646e-10	119348829	119350354	2.97501145724080e-10	164826377	164827563
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	164829294	164831985	3	3	-1.0337	2.9750114572408e-10	164826377	164827563	2.94410140998345e-10	164831985	164835634
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	164835634	173660684	2660	2473	0	2.94410140998345e-10	164831985	164835634	1.54263360777297e-113	173660684	173660684
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-4.1129	1.54263360777297e-113	173660684	173660684	1.66707800820484e-121	173666072	173666072
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3493	-0.0047	1.66707800820484e-121	173666072	173666072	8.56908116771118e-81	186676034	186676034
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-3.3581	8.56908116771118e-81	186676034	186676034	9.41324042180883e-77	186680176	186680176
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	189655744	1129	1040	-0.0313	9.41324042180883e-77	186680176	186680176	1.74137995169049e-10	189655744	189655744
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	189661014	189665762	2	2	-1.2834	1.74137995169049e-10	189655744	189655744	1.27003022738262e-09	189665762	189665762
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	189669535	190725579	310	298	-0.0163	1.27003022738262e-09	189665762	189665762	7.23980988504356e-22	190692881	190752920
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190730982	190917729	62	60	-0.3851	7.23980988504356e-22	190692881	190752920	2.60597491221737e-09	190907760	190945773
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190921041	191153613	46	39	-0.0656	2.60597491221737e-09	190907760	190945773	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	150181399	43854	40912	-0.005	NA	NA	NA	3.65643675688975e-214	150181399	150181399
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	6	-3.2121	3.65643675688975e-214	150181399	150181399	6.8345865638483e-215	150202601	150202601
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9265	-0.0052	6.8345865638483e-215	150202601	150202601	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	53	0.0068	NA	NA	NA	7.9455816489269e-30	236535	244363
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	43	0.4643	7.9455816489269e-30	236535	244363	4.87171366064791e-33	323898	332608
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32558677	11576	10769	-0.0065	4.87171366064791e-33	323898	332608	4.72835850675524e-209	32558677	32567462
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.9535	4.72835850675524e-209	32558677	32567462	6.75096007444199e-06	32588005	32595402
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	0.4288	6.75096007444199e-06	32588005	32595402	0.00457556319432993	32613538	32673823
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32762061	52	49	-0.535	0.00457556319432993	32613538	32673823	3.81118280731099e-38	32713363	32771725
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	32766023	1	0	NA	3.81118280731099e-38	32713363	32771725	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	35862270	1331	1253	0.0091	NA	NA	NA	6.35389715678503e-12	35856922	35862270
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35862502	35873335	7	7	-0.7088	6.35389715678503e-12	35856922	35862270	8.88900944696161e-12	35873335	35875112
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6407	-0.007	8.88900944696161e-12	35873335	35875112	1.52093898614035e-257	54035000	54035000
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.8866	1.52093898614035e-257	54035000	54035000	7.2849273889823e-246	54042734	54042734
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	32011	-0.002	7.2849273889823e-246	54042734	54042734	5.36234704742773e-221	165643653	165643653
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-4.6361	5.36234704742773e-221	165643653	165643653	7.17900049779343e-203	165649379	165649379
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1693	-0.0341	7.17900049779343e-203	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	16135701	5387	5033	0.0041	NA	NA	NA	8.57108210004838e-150	16135701	16135701
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.5839	8.57108210004838e-150	16135701	16135701	3.48545667874887e-146	16140018	16140018
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	28030497	4261	3981	-0.006	3.48545667874887e-146	16140018	16140018	1.81139662546355e-14	28030497	28030497
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	28031824	28035642	3	3	-1.2053	1.81139662546355e-14	28030497	28030497	9.9698676158393e-14	28035642	28035642
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	28039382	126754076	33218	30975	-0.0017	9.9698676158393e-14	28035642	28035642	5.73357795763294e-16	126754076	126754076
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126756966	126758540	2	2	1.5804	5.73357795763294e-16	126754076	126754076	5.03314637692678e-16	126758540	126758540
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126760658	141410894	6929	6422	0.004	5.03314637692678e-16	126758540	126758540	9.94123321406364e-13	141406414	141419692
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.5305	9.94123321406364e-13	141406414	141419692	4.16202953609384e-11	141432778	141449014
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	158821263	6878	6391	-0.0144	4.16202953609384e-11	141432778	141449014	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	0.0063	NA	NA	NA	9.53971572860679e-42	581533	581533
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	2.5223	9.53971572860679e-42	581533	581533	6.53977310978934e-45	588865	588865
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	5574577	1889	1774	-0.0461	6.53977310978934e-45	588865	588865	1.43220570089992e-13	5574577	5574577
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-1.4784	1.43220570089992e-13	5574577	5574577	1.56352677815556e-14	5591702	5591702
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	22039954	5043	4698	-0.0149	1.56352677815556e-14	5591702	5591702	6.08721750596006e-12	22039954	22039954
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	22041260	22043311	2	2	1.3168	6.08721750596006e-12	22039954	22039954	3.6017352754389e-11	22043311	22043311
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	22045415	39350798	6017	5612	-0.0033	3.6017352754389e-11	22043311	22043311	0	39350798	39350798
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	-4.2723	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	415	-0.014	0	39505256	39505256	1.72936044708696e-190	40892587	40892587
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.3948	1.72936044708696e-190	40892587	40892587	1.18441405265206e-186	40897469	40897469
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1630	0.0069	1.18441405265206e-186	40897469	40897469	1.62921970195593e-09	51189068	51191560
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	1.62921970195593e-09	51189068	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-1.0149	NA	NA	NA	9.86106716674517e-10	51200291	51202490
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	146264846	29250	27343	-0.0122	9.86106716674517e-10	51200291	51202490	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7466	-0.0104	NA	NA	NA	1.80330581026754e-251	23343915	23343915
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.785	1.80330581026754e-251	23343915	23343915	6.57150824331543e-235	23365926	23365926
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	140145683	29941	27835	-9e-04	6.57150824331543e-235	23365926	23365926	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	56115736	17031	15902	-0.008	NA	NA	NA	2.27078170789751e-10	56107694	56122417
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56154328	15	14	0.4727	2.27078170789751e-10	56107694	56122417	3.80990736618639e-10	56138767	56168097
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56156122	132797428	26826	25052	-0.0039	3.80990736618639e-10	56138767	56168097	6.64501766716962e-254	132797428	132797428
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-6.0452	6.64501766716962e-254	132797428	132797428	3.76616267140593e-202	132801463	132801463
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	877	-0.0309	3.76616267140593e-202	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	15733	-0.0036	NA	NA	NA	1.90148806183711e-63	55114405	55124730
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	34	-0.7567	1.90148806183711e-63	55114405	55124730	5.83176274456026e-67	55205278	55217189
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	85986286	11766	10987	0.0066	5.83176274456026e-67	55205278	55217189	7.76725290654201e-12	85985197	85986286
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85993141	85998834	5	5	-0.8501	7.76725290654201e-12	85985197	85986286	2.57209506845102e-11	85998834	86003077
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	86003077	134450318	16589	15478	-0.012	2.57209506845102e-11	85998834	86003077	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	9456107	3739	3495	0.0042	NA	NA	NA	5.50544787604681e-07	9407500	9554149
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9516067	9633884	24	23	-0.3073	5.50544787604681e-07	9407500	9554149	7.66349924228516e-08	9626623	9647636
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9635763	9635763	1	0	NA	7.66349924228516e-08	9626623	9647636	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9637635	10464018	320	303	0.0113	NA	NA	NA	3.82053743963839e-12	10459455	10465787
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10485848	9	8	-0.6398	3.82053743963839e-12	10459455	10465787	2.33642107309935e-10	10484956	10493984
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	128874699	39705	37116	0.0011	2.33642107309935e-10	10484956	10493984	3.42584992983558e-11	128874699	128874699
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128877382	128878823	2	2	1.3284	3.42584992983558e-11	128874699	128874699	7.2803484023917e-13	128878823	128878823
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128880277	132289090	1360	1256	-0.0244	7.2803484023917e-13	128878823	128878823	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6883	-0.0017	NA	NA	NA	5.77621253913955e-216	37953582	37953582
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-5.6551	5.77621253913955e-216	37953582	37953582	4.66141727277762e-221	37957844	37957844
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4537	-0.0068	4.66141727277762e-221	37957844	37957844	1.10140028993533e-30	49964838	49964838
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.1331	1.10140028993533e-30	49964838	49964838	8.58967567977474e-29	49971732	49971732
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56660235	1807	1691	-0.0116	8.58967567977474e-29	49971732	49971732	4.51237363539069e-21	56658479	56660235
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56662112	56681665	11	11	0.7688	4.51237363539069e-21	56658479	56660235	8.81356762808225e-23	56681665	56685341
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	114123340	17605	16441	-0.0094	8.81356762808225e-23	56681665	56685341	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105597555	31642	29434	0.0035	NA	NA	NA	9.65614088227907e-10	105587020	105602602
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	0.5329	9.65614088227907e-10	105587020	105602602	1.04531572631133e-08	105632168	105703388
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	-0.0596	1.04531572631133e-08	105632168	105703388	1.26571478037444e-10	105776293	105787390
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.9264	1.26571478037444e-10	105776293	105787390	4.28705185174311e-12	105798116	105800545
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105799261	1	0	NA	4.28705185174311e-12	105798116	105800545	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105800545	105850033	20	20	-0.0715	NA	NA	NA	8.00663723384882e-08	105843086	105850033
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.6702	8.00663723384882e-08	105843086	105850033	1.33683726908570e-08	105881893	105898108
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	111	-0.0535	1.3368372690857e-08	105881893	105898108	3.56006027214501e-25	106216726	106218059
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	0.6588	3.56006027214501e-25	106216726	106218059	4.2109211341629e-14	106253648	106255190
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	33	-0.1133	4.2109211341629e-14	106253648	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	94	0.3899	NA	NA	NA	0.000477776861536857	19401331	19822150
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19882711	15	15	0.6518	0.000477776861536857	19401331	19822150	1.82934294074708e-05	19839695	19932166
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20308014	44	41	0.3048	1.82934294074708e-05	19839695	19932166	3.98477518810409e-12	20053008	20385551
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	75115806	21728	20266	0.0032	3.98477518810409e-12	20053008	20385551	4.32632117847180e-135	75115806	75115806
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-4.4515	4.3263211784718e-135	75115806	75115806	6.65235030035113e-137	75119713	75119713
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	8783	-0.0081	6.65235030035113e-137	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296506	472	445	0.0206	NA	NA	NA	1.89112214289901e-09	1290167	1296506
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1296767	1299180	2	2	1.3218	1.89112214289901e-09	1290167	1296506	8.53304300780745e-12	1299180	1299180
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1300341	10695487	3504	3286	-0.0023	8.53304300780745e-12	1299180	1299180	8.7521723735693e-11	10694027	10695487
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	10698456	10700064	3	3	-0.887	8.7521723735693e-11	10694027	10695487	6.45005489173554e-08	10700064	10719606
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	10719606	33395114	6616	6196	0.0162	6.45005489173554e-08	10700064	10719606	1.28297742913961e-11	33293241	33445329
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33396966	33396966	1	0	NA	1.28297742913961e-11	33293241	33445329	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33445329	33538171	19	18	-0.4254	NA	NA	NA	6.37042990790046e-13	33536526	33842125
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	68732367	7685	7162	0.0104	6.37042990790046e-13	33536526	33842125	8.6969100907771e-14	68693086	68732367
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68734100	68753209	7	7	0.6908	8.6969100907771e-14	68693086	68732367	2.27927133791049e-12	68753209	68838384
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2043	0.0051	2.27927133791049e-12	68753209	68838384	1.06007832522231e-17	75093957	75093957
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2503	1.06007832522231e-17	75093957	75093957	9.0878943070416e-17	75100865	75100865
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76929598	611	562	-0.0294	9.0878943070416e-17	75100865	75100865	1.95002868747742e-13	76925748	76934755
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76940218	7	7	0.7419	1.95002868747742e-13	76925748	76934755	2.79795507696014e-13	76935880	76942679
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4174	-0.0111	2.79795507696014e-13	76935880	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	5888	0.0109	NA	NA	NA	1.65440036351854e-157	15727076	15727076
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-4.7144	1.65440036351854e-157	15727076	15727076	2.97111803870105e-151	15733964	15733964
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	36678537	7569	7061	0.0151	2.97111803870105e-151	15733964	15733964	3.29909934468009e-122	36678537	36678537
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36680557	36683509	3	3	-3.4633	3.29909934468009e-122	36678537	36678537	3.30476215384382e-116	36683509	36683509
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1874	0.0249	3.30476215384382e-116	36683509	36683509	9.67101611372758e-20	41514481	41521544
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	19	-0.5522	9.67101611372758e-20	41514481	41521544	6.95422545895067e-05	41553226	41577520
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41704093	44	43	-0.2859	6.95422545895067e-05	41553226	41577520	9.2920159934129e-13	41648545	42153189
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	78653545	13682	12805	0.0161	9.2920159934129e-13	41648545	42153189	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21448	-0.0114	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	11448975	5171	4823	0.0347	NA	NA	NA	4.5488878351469e-17	11448975	11448975
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.7001	4.5488878351469e-17	11448975	11448975	7.25062973490413e-18	11452390	11452390
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3582	0.0292	7.25062973490413e-18	11452390	11452390	4.46853895666112e-191	19694025	19694025
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.3623	4.46853895666112e-191	19694025	19694025	6.41960660500113e-196	19700620	19700620
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	57635282	11280	10528	0.0151	6.41960660500113e-196	19700620	19700620	2.61903964660306e-05	57622608	57648767
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57637699	57637699	1	0	NA	2.61903964660306e-05	57622608	57648767	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57641139	57653345	7	7	0.482	NA	NA	NA	3.75718459309836e-07	57648767	57663128
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57654139	57654139	1	0	NA	3.75718459309836e-07	57648767	57663128	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57661644	58208527	148	140	-0.008	NA	NA	NA	1.42578125582438e-28	58206232	58208527
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	15	0.6393	1.42578125582438e-28	58206232	58208527	1.35539175907253e-21	58244012	58249435
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59246409	484	458	0.0112	1.35539175907253e-21	58244012	58249435	3.34551849852841e-167	59246409	59246409
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-3.9966	3.34551849852841e-167	59246409	59246409	3.43170380052741e-171	59251831	59251831
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	1949	0.0098	3.43170380052741e-171	59251831	59251831	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	551	-0.0045	NA	NA	NA	2.21598291284847e-108	1506379	1506379
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.9822	2.21598291284847e-108	1506379	1506379	5.72849840335143e-118	1531162	1531162
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	2348507	302	276	-7e-04	5.72849840335143e-118	1531162	1531162	2.51564155303734e-09	2343842	2356948
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2356948	2365824	5	5	0.7262	2.51564155303734e-09	2343842	2356948	2.57742199768108e-08	2363772	2369525
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2368258	14573174	4210	3924	0.0014	2.57742199768108e-08	2363772	2369525	0	14569192	14574538
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14574538	15027518	217	198	-0.9405	0	14569192	14574538	0	15025781	15031684
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15029315	15029315	1	0	NA	0	15025781	15031684	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15031684	62419534	16249	15178	-0.0111	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12473	-0.004	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15835523	104	94	0.5087	NA	NA	NA	8.89676820912635e-79	15826450	15850105
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15846486	35472378	9448	8810	0.007	8.89676820912635e-79	15826450	15850105	3.51105213729043e-27	35472378	35472378
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.0218	3.51105213729043e-27	35472378	35472378	1.64854974494969e-27	35476942	35476942
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	1.64854974494969e-27	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	49571068	7002	6515	0.0147	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1501	NA	NA	NA	5.27487469997394e-13	94062	98390
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	5.27487469997394e-13	94062	98390	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-1.597	NA	NA	NA	1.10200673454758e-49	104486	104732
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1662	0.017	1.10200673454758e-49	104486	104732	0	2708113	2711273
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	111589499	31716	29582	0.9093	0	2708113	2711273	4.66891541283535e-16	111583341	111589499
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111591635	111610467	7	7	-0.0028	4.66891541283535e-16	111583341	111589499	2.75779585393719e-11	111610467	111613676
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111613676	121733686	2983	2778	0.9182	2.75779585393719e-11	111610467	111613676	1.13509098437422e-08	121709589	121733686
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	121739102	121744555	2	2	2.4372	1.13509098437422e-08	121709589	121733686	4.65106650673072e-09	121744555	121751878
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	121751878	154038318	10293	9622	0.9061	4.65106650673072e-09	121744555	121751878	5.183696585699e-12	154028488	154038318
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.6875	5.183696585699e-12	154028488	154038318	1.65266858332628e-15	154078819	154085354
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	85	0.8695	1.65266858332628e-15	154078819	154085354	2.77129812067642e-72	154442377	154442377
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-2.1087	2.77129812067642e-72	154442377	154442377	5.76282451322479e-46	154450309	154450309
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.8801	5.76282451322479e-46	154450309	154450309	9.56761396956882e-47	154570196	154586690
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	189	4e-04	9.56761396956882e-47	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	120	-4.2429	NA	NA	NA	1.11767921551090e-15	3777766	4413507
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.4209	1.1176792155109e-15	3777766	4413507	8.7733426393809e-07	5422507	6720552
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	111	-3.9209	8.7733426393809e-07	5422507	6720552	0.00540325295959558	6876161	7039999
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7266323	115	106	-3.1868	0.00540325295959558	6876161	7039999	5.87188369142479e-05	7250951	7280349
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7267235	7304209	19	16	-1.3646	5.87188369142479e-05	7250951	7280349	0.000118446342774228	7295562	7330779
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7495687	51	47	-3.2448	0.000118446342774228	7295562	7330779	0.00426141389107506	7372772	7640681
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7713973	69	67	-4.2257	0.00426141389107506	7372772	7640681	1.72397020154891e-05	7685425	7751430
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7714929	8010446	86	77	-3.1226	1.72397020154891e-05	7685425	7751430	1.67110679837194e-09	7905553	8090502
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	9160624	292	268	-4.0966	1.67110679837194e-09	7905553	8090502	0.000156007252089882	9129443	9186935
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10012024	11	11	-2.566	0.000156007252089882	9129443	9186935	1.34742766904037e-10	10001056	10025706
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10014777	1	0	NA	1.34742766904037e-10	10001056	10025706	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10429196	40	38	-4.4458	NA	NA	NA	5.66926984881784e-05	10402290	10429196
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10433178	10448819	5	4	-2.6236	5.66926984881784e-05	10402290	10429196	2.42980648143912e-07	10448819	10452906
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10451527	10513747	18	14	-4.4157	2.42980648143912e-07	10448819	10452906	4.01435647184461e-23	10513747	10537808
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	4.01435647184461e-23	10513747	10537808	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	15	-0.868	NA	NA	NA	3.95193194797807e-15	11249952	11698871
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	13	-4.208	3.95193194797807e-15	11249952	11698871	1.67243534111087e-11	12537944	12541506
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12557151	7	6	-1.0922	1.67243534111087e-11	12537944	12541506	2.38921855156513e-11	12557151	12557151
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12558585	12574148	7	6	-3.1483	2.38921855156513e-11	12557151	12557151	1.75738453554422e-07	12574148	12574148
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12575215	12575215	1	0	NA	1.75738453554422e-07	12574148	12574148	NA	NA	NA
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12576110	12590969	9	7	-0.9848	NA	NA	NA	7.4679950845991e-09	12590969	12590969
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	11	-3.5813	7.4679950845991e-09	12590969	12590969	9.73762934641567e-08	12611624	12611624
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12625208	6	4	-0.804	9.73762934641567e-08	12611624	12611624	0.0501591359512336	12618263	12651786
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12627138	12682301	13	13	-2.3583	0.0501591359512336	12618263	12651786	0.119138359545449	12638022	12875039
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12926941	56	53	-3.3997	0.119138359545449	12638022	12875039	5.74794456639891e-08	12901857	12959689
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13040293	44	43	-1.8534	5.74794456639891e-08	12901857	12959689	8.29128386324726e-06	13026029	13048283
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13076862	14	13	-3.7285	8.29128386324726e-06	13026029	13048283	2.41945414811041e-08	13061201	13078432
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13077621	13128515	21	19	-1.6392	2.41945414811041e-08	13061201	13078432	6.49195300400935e-17	13121152	13129843
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13158272	16	16	-4.3014	6.49195300400935e-17	13121152	13129843	0.00564606599036574	13153117	13165652
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13173328	9	9	-2.6152	0.00564606599036574	13153117	13165652	8.95665040248437e-05	13164641	13215006
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13175367	14342834	384	367	-4.212	8.95665040248437e-05	13164641	13215006	1.32528434571664e-12	14322984	14383746
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	87	-3.2695	1.32528434571664e-12	14322984	14383746	3.97518042224987e-05	14496442	14530134
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14547168	13	12	-1.3897	3.97518042224987e-05	14496442	14530134	0.0284223068705167	14536962	14569287
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14644293	23	22	-3.0803	0.0284223068705167	14536962	14569287	0.0289186494977091	14553021	14713609
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15124246	99	94	-4.0223	0.0289186494977091	14553021	14713609	0.00234149948830713	14969835	15205160
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15126227	15284717	85	79	-3.3229	0.00234149948830713	14969835	15205160	3.56401811580372e-06	15255162	15311814
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15432050	96	90	-4.2951	3.56401811580372e-06	15255162	15311814	5.39888541711944e-06	15423625	15432050
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15433122	15447091	7	7	-2.0726	5.39888541711944e-06	15423625	15432050	2.28587597574907e-09	15447091	15450495
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-4.1665	2.28587597574907e-09	15447091	15450495	8.90731284613449e-11	15519963	15525955
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	11	-2.0737	8.90731284613449e-11	15519963	15525955	8.50130306533498e-05	15542314	15558235
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15915466	76	72	-4.0633	8.50130306533498e-05	15542314	15558235	0.0279945793518252	15687088	16083793
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	150	-3.4004	0.0279945793518252	15687088	16083793	9.74481471370139e-10	16214032	16647090
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036503	671	633	-4.1334	9.74481471370139e-10	16214032	16647090	2.76043375197036e-08	21035621	21036503
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	5	-0.6968	2.76043375197036e-08	21035621	21036503	4.91267540339291e-09	21054519	21057446
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	25737663	365	341	-4.1115	4.91267540339291e-09	21054519	21057446	2.64668358949165e-41	22930737	26873861
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	27019256	48	43	-1.5159	2.64668358949165e-41	22930737	26873861	5.29766470962239e-06	27007874	27019256
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.52	5.29766470962239e-06	27007874	27019256	7.61898784509566e-11	27039222	27053237
MSK_252152915583_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	28	-0.8751	7.61898784509566e-11	27039222	27053237	NA	NA	NA
