Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16963812	5795	5506	0.0075	NA	NA	NA	8.33448701165727e-09	16923767	16963812
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17127039	12	11	0.4301	8.33448701165727e-09	16923767	16963812	7.953295705893e-10	17127039	17155989
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	20939	0.004	7.953295705893e-10	17127039	17155989	1.97677550580827e-275	72537426	72537426
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.9959	1.97677550580827e-275	72537426	72537426	2.63284114165667e-286	72579311	72579311
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	86171390	4220	3993	0.0024	2.63284114165667e-286	72579311	72579311	4.42378202463482e-12	86171390	86171390
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86173546	86175273	2	2	-1.0591	4.42378202463482e-12	86171390	86171390	8.14725478913199e-12	86175273	86175273
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	110023268	7481	7135	-0.0024	8.14725478913199e-12	86175273	86175273	1.17176758772871e-23	110023268	110023268
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-1.0457	1.17176758772871e-23	110023268	110023268	1.69035284805500e-24	110041712	110041712
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147346371	4563	4331	0.0013	1.690352848055e-24	110041712	110041712	7.87880624685429e-11	147311437	147352661
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346399	147460661	20	19	0.3256	7.87880624685429e-11	147311437	147352661	3.69518653161866e-10	147446204	147497268
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147467273	150818222	1265	1199	0.0158	3.69518653161866e-10	147446204	147497268	1.13775870775106e-13	150816180	150823073
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.6822	1.13775870775106e-13	150816180	150823073	1.19439923852042e-06	150839754	150844444
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150841957	1	0	NA	1.19439923852042e-06	150839754	150844444	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150843192	150851439	6	5	-2.5944	NA	NA	NA	1.28565257417889e-178	150851439	150851439
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	167483267	6871	6519	-0.0034	1.28565257417889e-178	150851439	150851439	0	167483267	167483267
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.5034	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	246769018	28669	27313	-0.0033	0	167507898	167507898	6.14760070130102e-134	246769018	246794552
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	26	-0.9722	6.14760070130102e-134	246769018	246794552	7.26816276687053e-76	246858820	246863179
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	92	-0.0143	7.26816276687053e-76	246858820	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13113316	4162	3959	-0.0172	NA	NA	NA	4.36966856895489e-30	13108673	13113316
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.6024	4.36966856895489e-30	13108673	13113316	1.90846362033802e-27	13199426	13200787
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	34543992	7346	6978	-0.0046	1.90846362033802e-27	13199426	13200787	9.35396257868351e-74	34543992	34551222
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	0.8923	9.35396257868351e-74	34543992	34551222	2.03460274808498e-78	34582272	34589997
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6854	-0.0076	2.03460274808498e-78	34582272	34589997	6.55848486332188e-14	52588009	52600588
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	6.55848486332188e-14	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.788	NA	NA	NA	3.82926163457558e-14	52635695	52639605
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4333	0.0014	3.82926163457558e-14	52635695	52639605	1.55835528713027e-12	66357387	66357387
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.0512	1.55835528713027e-12	66357387	66357387	1.18869856308416e-11	66360747	66360747
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	20671	-0.0043	1.18869856308416e-11	66360747	66360747	9.58677080829438e-38	146571330	146571330
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.3055	9.58677080829438e-38	146571330	146571330	1.16397939540359e-37	146592775	146592775
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	227949124	27202	25853	-0.0024	1.16397939540359e-37	146592775	146592775	1.9112331518387e-11	227946001	227950459
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227964962	7	7	0.558	1.9112331518387e-11	227946001	227950459	7.2911414815272e-09	227960553	227968956
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227967126	228260165	114	108	0.0434	7.2911414815272e-09	227960553	227968956	5.68833643693151e-09	228255063	228260165
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	228261277	228267267	2	2	-0.905	5.68833643693151e-09	228255063	228260165	8.23899325199785e-08	228267267	228269048
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	228269048	242689978	5424	5165	-0.0082	8.23899325199785e-08	228267267	228269048	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	3136017	1195	1143	0.0025	NA	NA	NA	1.29848841513656e-05	3124202	3142078
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	3137867	3153076	8	7	0.3991	1.29848841513656e-05	3124202	3142078	7.41823593328695e-06	3147158	3160818
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	3156142	11383299	2884	2733	-0.0032	7.41823593328695e-06	3147158	3160818	2.10877458003709e-19	11383299	11383299
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.0887	2.10877458003709e-19	11383299	11383299	2.83518933646536e-19	11389624	11389624
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	46685057	11792	11181	-0.0045	2.83518933646536e-19	11389624	11389624	6.75952596975785e-10	46685057	46685057
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46687043	46688279	2	2	-0.9731	6.75952596975785e-10	46685057	46685057	2.0575206452357e-11	46688279	46688279
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46690457	89475107	14757	14069	-0.0039	2.0575206452357e-11	46688279	46688279	3.86308433996544e-69	89475107	89475107
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.9827	3.86308433996544e-69	89475107	89475107	6.39543894507666e-69	89500935	89500935
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	164001657	22836	21660	-0.0022	6.39543894507666e-69	89500935	89500935	2.43848157237854e-55	164001657	164001657
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	2.43848157237854e-55	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.4215	NA	NA	NA	4.51439530789921e-57	164027724	164027724
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	192546280	9568	9026	0.0023	4.51439530789921e-57	164027724	164027724	0	192546280	192546280
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.4722	0	192546280	192546280	0	192550989	192550989
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	194354505	579	550	-0.015	0	192550989	192550989	0	194354505	194354505
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.6688	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	945	-0.0233	0	194366950	194366950	8.21353233359432e-105	196822133	196835413
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-1.0031	8.21353233359432e-105	196822133	196835413	3.36145429682295e-05	196925203	196929826
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196961238	10	8	-0.5332	3.36145429682295e-05	196925203	196929826	1.08063009117235e-09	196957322	196969782
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	908	0.0033	1.08063009117235e-09	196957322	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3223	0.0016	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9832823	3	3	-5.5503	0	9815760	9815760	0	9832823	9832823
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	0	9832823	9832823	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	64367819	13953	13235	-0.0084	NA	NA	NA	1.85023925649345e-290	64367819	64367819
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64376590	64376590	1	0	NA	1.85023925649345e-290	64367819	64367819	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.0502	NA	NA	NA	1.41332295542065e-285	64390333	64390333
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1030	-0.005	1.41332295542065e-285	64390333	64390333	3.69705426976564e-31	68901210	69075140
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.6375	3.69705426976564e-31	68901210	69075140	5.85082710148697e-27	69153675	69643272
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	72503256	863	832	0.0096	5.85082710148697e-27	69153675	69643272	2.39345800555862e-09	72502918	72503256
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	72509667	72514071	3	3	-0.7916	2.39345800555862e-09	72502918	72503256	2.83412310098072e-10	72514071	72516607
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	72516607	88752705	5719	5435	2e-04	2.83412310098072e-10	72514071	72516607	8.2204905457072e-13	88752705	88752705
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.0762	8.2204905457072e-13	88752705	88752705	3.03608893595922e-12	88756721	88756721
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	94073863	1861	1779	0.0087	3.03608893595922e-12	88756721	88756721	7.39400772983904e-11	94073863	94073863
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-1.0152	7.39400772983904e-11	94073863	94073863	3.06939987575201e-11	94078581	94078581
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	138304055	12064	11504	-0.0023	3.06939987575201e-11	94078581	94078581	3.14943160710862e-08	138304055	138304055
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138307863	138307863	1	0	NA	3.14943160710862e-08	138304055	138304055	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-0.8791	NA	NA	NA	4.85658097353407e-08	138319409	138319409
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173660684	10871	10271	-0.002	4.85658097353407e-08	138319409	138319409	6.43674035726821e-49	173660684	173660684
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.0835	6.43674035726821e-49	173660684	173660684	8.3751558565782e-50	173666072	173666072
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3872	2e-04	8.3751558565782e-50	173666072	173666072	2.33991431708049e-07	187329037	187330240
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.5853	2.33991431708049e-07	187329037	187330240	1.61746004893851e-07	187338465	187346097
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	190706272	1127	1075	-0.0042	1.61746004893851e-07	187338465	187346097	2.9240371894235e-38	190678203	190717801
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190708316	190921041	67	66	-0.3307	2.9240371894235e-38	190678203	190717801	7.1743414259114e-18	190910126	190930709
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	41	-0.0394	7.1743414259114e-18	190910126	190930709	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	79142	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90722	12857302	3974	3755	-0.0209	NA	NA	NA	2.8547609384485e-18	12857302	12857302
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.3073	2.8547609384485e-18	12857302	12857302	3.08151011659121e-18	12873052	12873052
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	71653875	15369	14535	-0.0041	3.08151011659121e-18	12873052	12873052	6.07411675800896e-10	71653875	71653875
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	71655850	71655850	1	0	NA	6.07411675800896e-10	71653875	71653875	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	71657645	71659614	2	2	-0.9897	NA	NA	NA	4.00100675551768e-10	71659614	71659614
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	71661902	180342860	34297	32592	-0.0012	4.00100675551768e-10	71659614	71659614	2.77624646546322e-20	180194323	180342860
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	9	-0.6449	2.77624646546322e-20	180194323	180342860	3.93666950795886e-16	180362342	180364670
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	105	0.0126	3.93666950795886e-16	180362342	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	17477799	6125	5799	-0.0056	NA	NA	NA	5.37397042158606e-56	17477799	17477799
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17482872	17482872	1	0	NA	5.37397042158606e-56	17477799	17477799	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-2.2167	NA	NA	NA	3.16411772891535e-54	17488010	17488010
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	29950805	4459	4249	0.0043	3.16411772891535e-54	17488010	17488010	6.02270463188771e-24	29939288	29980445
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30031367	20	20	0.4702	6.02270463188771e-24	29939288	29980445	8.68569361434264e-19	30005338	30040901
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	31385778	575	546	0.0108	8.68569361434264e-19	30005338	30040901	1.05533026552964e-09	31383925	31390982
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.5736	1.05533026552964e-09	31383925	31390982	8.02290841001414e-11	31390982	31425113
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	470	0.003	8.02290841001414e-11	31390982	31425113	2.2791920270151e-88	32548736	32595402
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	17	-1.5444	2.2791920270151e-88	32548736	32595402	2.36548240942793e-06	32597877	32633691
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32711957	27	27	-0.1182	2.36548240942793e-06	32597877	32633691	1.61330161496727e-09	32709263	32718991
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	8	-1.1354	1.61330161496727e-09	32709263	32718991	0.0879186125411409	32716255	32734957
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32739800	6	5	-0.4317	0.0879186125411409	32716255	32734957	0.000292825712954792	32732764	32745693
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	52644721	7697	7312	-0.0025	0.000292825712954792	32732764	32745693	1.32695615748852e-08	52644721	52644721
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	52647039	52648372	2	2	-0.9326	1.32695615748852e-08	52644721	52644721	7.22912519800814e-11	52648372	52648372
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	52650151	54035000	554	531	0.0066	7.22912519800814e-11	52648372	52648372	1.93411213859179e-314	54035000	54035000
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0956	1.93411213859179e-314	54035000	54035000	1.53968009857708e-278	54042734	54042734
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12538	-0.0016	1.53968009857708e-278	54042734	54042734	0	103841482	103841482
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.171	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	162502077	20143	19151	0.001	0	103868154	103868154	5.4021755697046e-09	162502077	162502077
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-0.9325	5.4021755697046e-09	162502077	162502077	4.43749756185443e-08	162505819	162508430
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	918	-0.0314	4.43749756185443e-08	162505819	162508430	2.44919069096197e-29	165643653	165643653
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.171	2.44919069096197e-29	165643653	165643653	6.17112068205543e-28	165650610	165650610
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1731	-0.0224	6.17112068205543e-28	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	38	0.009	NA	NA	NA	4.80789619285847e-25	244720	244720
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-1.0743	4.80789619285847e-25	244720	244720	9.09022362430697e-22	254342	256802
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	1038517	215	205	-0.024	9.09022362430697e-22	254342	256802	2.39130498221707e-07	1037402	1038517
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.9279	2.39130498221707e-07	1037402	1038517	3.22869422113615e-08	1047707	1047707
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	16135701	5126	4869	0.0035	3.22869422113615e-08	1047707	1047707	4.18211799959787e-150	16135701	16135701
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.8129	4.18211799959787e-150	16135701	16135701	2.75164440235725e-160	16140018	16140018
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	52249503	12616	12032	-0.0076	2.75164440235725e-160	16140018	16140018	1.30195783294981e-10	52238541	52279938
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52255880	52287180	8	7	0.5341	1.30195783294981e-10	52238541	52279938	1.14166264558340e-10	52269347	52289210
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52289210	57257346	1052	997	0.0045	1.1416626455834e-10	52269347	52289210	4.65222211733389e-09	57257346	57257346
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57261745	57263039	2	2	-0.8971	4.65222211733389e-09	57257346	57257346	2.90438944879622e-08	57263039	57264819
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57264819	86771217	7072	6720	0.0034	2.90438944879622e-08	57263039	57264819	1.82517563082637e-22	86771217	86771217
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86785324	4	4	-1.0222	1.82517563082637e-22	86771217	86771217	2.1410636937256e-22	86785324	86785324
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	86789967	1	0	NA	2.1410636937256e-22	86785324	86785324	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86790013	103863630	6398	6101	0.0102	NA	NA	NA	9.39412146771704e-07	103862413	103863630
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-0.8161	9.39412146771704e-07	103862413	103863630	1.59520586294883e-06	103868375	103870016
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	115482070	5258	5024	-0.002	1.59520586294883e-06	103868375	103870016	1.65941240140111e-07	115480645	115482070
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	115483170	115493030	2	2	-0.8706	1.65941240140111e-07	115480645	115482070	1.76258658168304e-08	115493030	115493030
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	115495017	118611324	1460	1383	0.0066	1.76258658168304e-08	115493030	115493030	3.17044675627377e-14	118609124	118611324
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.9257	3.17044675627377e-14	118609124	118611324	4.18333806679882e-13	118620875	118622742
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3001	-0.0024	4.18333806679882e-13	118620875	118622742	3.60637916857438e-316	125831554	125831554
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.4712	3.60637916857438e-316	125831554	125831554	3.2218721256521e-313	125837524	125837524
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125839386	1	0	NA	3.2218721256521e-313	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125840585	131692947	2798	2654	0.0089	NA	NA	NA	5.54958056993381e-05	131688823	131692947
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131694974	131702614	4	4	-0.5042	5.54958056993381e-05	131688823	131692947	1.90106004525385e-05	131702614	131707599
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131704992	133433384	851	815	-0.0133	1.90106004525385e-05	131702614	131707599	8.49941133292569e-21	133432281	133433384
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.649	8.49941133292569e-21	133432281	133433384	7.74491349223381e-19	133448277	133453811
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	139677052	2898	2768	-0.0045	7.74491349223381e-19	133448277	133453811	1.14180135037702e-196	139677052	139682089
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139680093	139680093	1	0	NA	1.14180135037702e-196	139677052	139682089	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139682089	139757224	39	36	-0.9963	NA	NA	NA	4.28557352734556e-186	139757224	139757224
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139758307	141410894	762	723	-0.0014	4.28557352734556e-186	139757224	139757224	4.8772525643767e-21	141409512	141417702
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.5308	4.8772525643767e-21	141409512	141417702	8.10078035168329e-19	141434131	141442231
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	144058853	951	904	-8e-04	8.10078035168329e-19	141434131	141442231	2.80122855412556e-07	144057533	144058853
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144061908	144063347	2	2	-0.8743	2.80122855412556e-07	144057533	144058853	5.92882016041152e-08	144063347	144064921
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144064921	147702365	1685	1604	0.0021	5.92882016041152e-08	144063347	144064921	3.11106482285144e-16	147702365	147702365
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.2392	3.11106482285144e-16	147702365	147702365	2.34942300570424e-14	147707161	147707161
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	156483966	3181	3029	-0.0155	2.34942300570424e-14	147707161	147707161	3.49094304197368e-08	156477783	156490484
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156495904	6	6	0.5247	3.49094304197368e-08	156477783	156490484	2.96126783607856e-08	156490484	156498994
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156497496	158815157	1050	992	-0.0298	2.96126783607856e-08	156490484	156498994	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158821263	158821263	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	704	-0.0054	NA	NA	NA	2.28296478788503e-13	2231804	2234351
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.8431	2.28296478788503e-13	2231804	2234351	9.53045866884242e-15	2251011	2257255
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	6926661	1650	1566	-0.0334	9.53045866884242e-15	2251011	2257255	3.94767756654547e-10	6909487	6926661
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7327293	5	5	0.5724	3.94767756654547e-10	6909487	6926661	4.39426473773419e-09	7327293	7709141
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7697025	9092336	331	315	-0.0156	4.39426473773419e-09	7327293	7709141	7.91706634519637e-08	9089377	9092336
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9094419	9098712	2	2	-0.87	7.91706634519637e-08	9089377	9092336	1.13290565603447e-07	9098712	9100830
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9100830	25022606	5400	5138	-0.0085	1.13290565603447e-07	9098712	9100830	7.93496031813623e-20	25022606	25022606
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.0971	7.93496031813623e-20	25022606	25022606	2.23015050024522e-22	25039370	25039370
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	26	0.0091	2.23015050024522e-22	25039370	25039370	8.82174428921642e-38	25120552	25120552
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.4876	8.82174428921642e-38	25120552	25120552	7.98736121535945e-38	25125700	25125700
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	27469587	1008	955	-0.0196	7.98736121535945e-38	25125700	25125700	1.41704581608378e-21	27469587	27469587
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27470520	27473312	2	2	1.3783	1.41704581608378e-21	27469587	27469587	1.04530312097991e-21	27473312	27473312
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27476212	39350798	3902	3713	-0.0026	1.04530312097991e-21	27473312	27473312	2.52276013122589e-261	39350798	39352361
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39504332	58	57	0.8913	2.52276013122589e-261	39350798	39352361	1.30790925619217e-251	39500219	39504332
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39505256	39505256	1	0	NA	1.30790925619217e-251	39500219	39504332	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	29824	-0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	39146895	12731	12106	-0.0055	NA	NA	NA	1.39182416270217e-10	39130211	39146895
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43626920	4	4	0.7068	1.39182416270217e-10	39130211	39146895	1.08191612702318e-09	43626920	43644906
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43644906	70926188	337	323	-0.0044	1.08191612702318e-09	43626920	43644906	1.34697771494923e-42	70926188	70926188
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0486	1.34697771494923e-42	70926188	70926188	3.27219847018207e-48	70930528	70930528
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	73133242	948	902	0.0043	3.27219847018207e-48	70930528	70930528	1.6010186315021e-15	73133242	73133242
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73135012	73139210	3	3	-0.9528	1.6010186315021e-15	73133242	73133242	2.24553362157184e-14	73139210	73139210
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73140836	116118907	14515	13819	-0.0067	2.24553362157184e-14	73139210	73139210	1.25483966861858e-35	116118907	116122595
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116130333	4	4	-1.2776	1.25483966861858e-35	116118907	116122595	4.90989933236795e-31	116126105	116130333
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	8926	-9e-04	4.90989933236795e-31	116126105	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	126361	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128878	27038538	9728	9213	-0.0101	NA	NA	NA	2.08877870150594e-135	27038538	27038538
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.5303	2.08877870150594e-135	27038538	27038538	2.12828415476366e-134	27041812	27041812
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	76032955	14004	13309	-0.0047	2.12828415476366e-134	27041812	27041812	8.84747943292883e-12	76030108	76032955
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76039511	76044118	3	3	-0.8828	8.84747943292883e-12	76030108	76032955	4.48837694811144e-13	76044118	76044118
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76051456	77917893	854	806	0.0102	4.48837694811144e-13	76044118	76044118	3.02512075267972e-49	77917893	77917893
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.7287	3.02512075267972e-49	77917893	77917893	9.72851307714008e-51	77928738	77928738
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	82866553	1494	1413	-0.0148	9.72851307714008e-51	77928738	77928738	3.59436384266225e-27	82866553	82866553
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82881204	6	6	-0.92	3.59436384266225e-27	82866553	82866553	1.99233362578492e-26	82881204	82881204
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	135285645	18713	17745	-0.0051	1.99233362578492e-26	82881204	82881204	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	49671267	16719	15863	-1e-04	NA	NA	NA	5.99689172593477e-12	49666382	49683052
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	7	-0.5802	5.99689172593477e-12	49666382	49683052	1.25360012713321e-10	49699428	49725462
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55118214	178	170	-0.031	1.25360012713321e-10	49699428	49725462	9.664645846779e-71	55114405	55124730
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-0.7575	9.664645846779e-71	55114405	55124730	1.82157365979910e-112	55205278	55217189
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	84939605	11321	10769	0.004	1.8215736597991e-112	55205278	55217189	1.34571732969838e-27	84939605	84939605
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84951675	6	6	-0.9391	1.34571732969838e-27	84939605	84939605	9.65995893064074e-28	84951675	84951675
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	134450318	17033	16168	-0.0033	9.65995893064074e-28	84951675	84951675	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9531133	3744	3559	0.0071	NA	NA	NA	5.95548438506912e-08	9431548	9554149
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9543817	9607363	13	13	-0.3433	5.95548438506912e-08	9431548	9554149	1.30564225801518e-07	9589725	9630105
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	46992235	11726	11134	-0.0013	1.30564225801518e-07	9589725	9630105	2.09249106393929e-37	46992235	46992235
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.8681	2.09249106393929e-37	46992235	46992235	3.05268063698275e-38	46996769	46996769
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	78676440	11069	10516	0.0097	3.05268063698275e-38	46996769	46996769	1.91881798914532e-18	78676440	78676440
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78686371	4	4	0.938	1.91881798914532e-18	78676440	78676440	6.03692062441865e-21	78686371	78686371
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	80662066	783	745	0.002	6.03692062441865e-21	78686371	78686371	6.84940052058014e-13	80662066	80662066
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.0441	6.84940052058014e-13	80662066	80662066	5.13698345956126e-11	80666751	80666751
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130694393	17172	16349	-0.001	5.13698345956126e-11	80666751	80666751	4.72184980704921e-24	130694393	130694393
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5104	4.72184980704921e-24	130694393	130694393	5.80261410929746e-22	130701040	130701040
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	610	-0.0072	5.80261410929746e-22	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6952	0.0012	NA	NA	NA	2.80772729569534e-259	37953582	37953582
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.9382	2.80772729569534e-259	37953582	37953582	1.78421270168443e-289	37957844	37957844
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	47739062	3894	3689	-0.0081	1.78421270168443e-289	37957844	37957844	6.94447239587966e-15	47739062	47739062
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47741066	47742946	2	2	-1.1493	6.94447239587966e-15	47739062	47739062	1.89437644934638e-13	47742946	47742946
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47747097	49964838	983	923	0.0046	1.89437644934638e-13	47742946	47742946	5.66348307866125e-102	49964838	49964838
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.1218	5.66348307866125e-102	49964838	49964838	2.81472123391454e-111	49971732	49971732
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1718	-0.0048	2.81472123391454e-111	49971732	49971732	3.20521502354977e-54	56646284	56650373
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.7954	3.20521502354977e-54	56646284	56650373	8.41638899531088e-52	56686863	56686863
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	114123340	17603	16720	-0.0053	8.41638899531088e-52	56686863	56686863	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	0.2112	NA	NA	NA	0.000338911162046405	18505611	18864561
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19535787	56	49	0.5453	0.000338911162046405	18505611	18864561	2.79877019138101e-78	19494416	19540294
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19538610	40676611	7586	7216	0.0109	2.79877019138101e-78	19494416	19540294	1.09520702325713e-17	40670538	40676611
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.6698	1.09520702325713e-17	40670538	40676611	7.14465355745582e-17	40722360	40726930
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	69086125	9973	9446	0.0034	7.14465355745582e-17	40722360	40726930	5.1090272442772e-12	69084841	69086125
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.8787	5.1090272442772e-12	69084841	69086125	2.75011851800306e-11	69092211	69093444
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105597555	14011	13300	-0.0027	2.75011851800306e-11	69092211	69093444	7.66974171060736e-22	105595302	105597555
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.6006	7.66974171060736e-22	105595302	105597555	4.45649218019736e-12	105632168	105681007
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	-0.0091	4.45649218019736e-12	105632168	105681007	2.45587865748735e-14	105783533	105787390
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.9029	2.45587865748735e-14	105783533	105787390	4.22666129043878e-23	105798116	105798116
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105856591	22	18	-0.0303	4.22666129043878e-23	105798116	105798116	1.63367679101279e-26	105856591	105856591
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105875924	4	4	-0.9715	1.63367679101279e-26	105856591	105856591	2.42710481489532e-16	105875924	105875924
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105948347	19	19	-0.0975	2.42710481489532e-16	105875924	105875924	3.69733184127702e-15	105946993	105951399
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	106002179	17	16	-0.6894	3.69733184127702e-15	105946993	105951399	6.47035484378667e-27	105998412	106013552
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	85	-0.0285	6.47035484378667e-27	105998412	106013552	2.36319682824216e-06	106199156	106219784
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106251081	14	13	0.3051	2.36319682824216e-06	106199156	106219784	1.73545255140212e-08	106249962	106255190
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106252126	106311855	25	24	0.0209	1.73545255140212e-08	106249962	106255190	4.617096332738e-06	106306525	106331262
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106329780	106358491	13	12	-0.2699	4.617096332738e-06	106306525	106331262	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18837737	15	14	0.2213	NA	NA	NA	2.10556192475439e-28	18837737	18837737
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.8134	2.10556192475439e-28	18837737	18837737	7.78790483028204e-33	18848213	18848213
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19465359	79	75	0.3911	7.78790483028204e-33	18848213	18848213	2.53130556449608e-13	19427350	19800789
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19845942	12	12	0.8966	2.53130556449608e-13	19427350	19800789	6.42953671631964e-21	19845942	19845942
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-0.8242	6.42953671631964e-21	19845942	19845942	7.29542764106685e-28	19882711	19882711
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	40	0.6294	7.29542764106685e-28	19882711	19882711	5.66387123068923e-87	20079935	20310916
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20308014	1	0	NA	5.66387123068923e-87	20079935	20310916	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32456500	3670	3479	-0.0134	NA	NA	NA	5.92662116924118e-90	32454294	32456500
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.8378	5.92662116924118e-90	32454294	32456500	8.1759675385103e-96	32594200	32594200
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	100298352	27470	26120	3e-04	8.1759675385103e-96	32594200	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1426486	527	494	0.0324	NA	NA	NA	1.67663506652188e-08	1425158	1426486
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1439992	1440004	2	2	1.1642	1.67663506652188e-08	1425158	1426486	5.81530635609073e-13	1440004	1440004
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1442432	19848079	6218	5911	0.0031	5.81530635609073e-13	1440004	1440004	7.87816496762007e-07	19841388	19848079
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	19853559	19864456	2	2	-0.8566	7.87816496762007e-07	19841388	19848079	1.09622949907276e-07	19864456	19881575
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	19881575	24052042	1397	1327	0.0019	1.09622949907276e-07	19864456	19881575	8.26554215485703e-257	24049824	24054062
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	24054062	24500235	179	175	0.5452	8.26554215485703e-257	24049824	24054062	2.94232251215297e-250	24497593	24504635
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	24504635	28512937	1290	1236	-0.0058	2.94232251215297e-250	24497593	24504635	3.41942491500703e-19	28512937	28512937
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.964	3.41942491500703e-19	28512937	28512937	1.80762784894993e-19	28529948	28529948
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	54368717	4084	3890	0.0056	1.80762784894993e-19	28529948	28529948	3.478749382079e-263	54368717	54368717
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54376805	54379839	3	3	-4.0406	3.478749382079e-263	54368717	54368717	1.55165797660957e-15	54379839	54379839
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.9518	1.55165797660957e-15	54379839	54379839	9.45224373600848e-28	54400475	54408446
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	68693086	4587	4363	0.0152	9.45224373600848e-28	54400475	54408446	1.69158356038368e-15	68693014	68693086
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	8	-0.5917	1.69158356038368e-15	68693014	68693086	3.30419580153118e-17	68753209	68838384
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	71134506	936	896	0.0074	3.30419580153118e-17	68753209	68838384	2.84205292067236e-55	71134506	71134506
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	71147858	71170838	10	9	-0.996	2.84205292067236e-55	71134506	71134506	7.06219823661167e-52	71170838	71170838
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	71178538	72918129	507	489	-0.0286	7.06219823661167e-52	71170838	71170838	6.51605994289399e-08	72917554	72918129
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72955519	4	3	-0.6937	6.51605994289399e-08	72917554	72918129	1.05871191995429e-07	72955519	72956298
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72956298	74097511	457	432	6e-04	1.05871191995429e-07	72955519	72956298	0.000205092518008375	74074779	74116017
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74099704	74134999	16	15	-0.2412	0.000205092518008375	74074779	74116017	1.47198886117765e-05	74119480	74160427
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74137609	75092501	283	264	0.0066	1.47198886117765e-05	74119480	74160427	2.6234187758133e-15	75092501	75092501
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	2.6234187758133e-15	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75099083	2	2	-1.0688	NA	NA	NA	7.56927907599036e-12	75099083	75099083
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75100865	75100865	1	0	NA	7.56927907599036e-12	75099083	75099083	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	579	-0.0135	NA	NA	NA	4.68396409952184e-39	76923844	76923844
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	4.68396409952184e-39	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9348	NA	NA	NA	2.76485892471985e-36	76940218	76940218
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	87308012	3921	3717	-0.0062	2.76485892471985e-36	76940218	76940218	3.58632041241973e-07	87301577	87317585
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87313483	87330963	9	9	-0.4136	3.58632041241973e-07	87301577	87317585	1.6373034961171e-05	87321844	87340712
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87333773	88690571	583	550	-0.0153	1.6373034961171e-05	87321844	87340712	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	399	-0.0013	NA	NA	NA	2.50732818943574e-08	1027736	1028979
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.9994	2.50732818943574e-08	1027736	1028979	3.59878602876816e-09	1030766	1030766
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1906319	436	416	0.0271	3.59878602876816e-09	1030766	1030766	1.42005679363121e-11	1906319	1906319
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906352	1906391	2	2	1.116	1.42005679363121e-11	1906319	1906319	2.92999646533617e-12	1906391	1906391
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12321	0.0079	2.92999646533617e-12	1906391	1906391	3.11500040619224e-126	36673853	36673853
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	2.1958	3.11500040619224e-126	36673853	36673853	3.12451032737087e-119	36683509	36683509
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	36684619	1	0	NA	3.12451032737087e-119	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1723	0.0187	NA	NA	NA	6.28189377636128e-09	40869151	40874079
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41015177	3	3	-0.7695	6.28189377636128e-09	40869151	40874079	6.72498663059781e-11	41015177	41017338
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41017338	41519702	201	190	-0.002	6.72498663059781e-11	41015177	41017338	6.5320069246316e-39	41518222	41519702
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	19	-0.583	6.5320069246316e-39	41518222	41519702	2.62613303782308e-05	41561017	41583286
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41706870	43	43	-0.3372	2.62613303782308e-05	41561017	41583286	1.35536602709228e-26	41697532	42147225
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41708551	72315590	11136	10586	0.0084	1.35536602709228e-26	41697532	42147225	2.24490448174844e-09	72308365	72315590
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72318711	72337524	6	6	0.5704	2.24490448174844e-09	72308365	72315590	6.99998099811274e-09	72337524	72344931
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72342453	72342453	1	0	NA	6.99998099811274e-09	72337524	72344931	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72344931	77997066	2246	2143	0.0029	NA	NA	NA	7.19231731229182e-11	77994197	78002158
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78000100	78006585	4	4	0.7712	7.19231731229182e-11	77994197	78002158	8.58787281454043e-11	78002158	78009084
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78009084	78653545	288	265	-0.0035	8.58787281454043e-11	78002158	78009084	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15355	-0.0059	NA	NA	NA	4.40318179816385e-10	53092949	53092949
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-0.9861	4.40318179816385e-10	53092949	53092949	3.49373917636439e-10	53099601	53099601
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	65357415	3565	3397	-0.0012	3.49373917636439e-10	53099601	53099601	4.48067221843348e-14	65356061	65357415
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.8134	4.48067221843348e-14	65356061	65357415	1.18711482754906e-12	65367911	65369843
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	3034	-0.0197	1.18711482754906e-12	65367911	65369843	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	468	0.0411	NA	NA	NA	1.36240939878038e-12	1398325	1398325
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3549	1.36240939878038e-12	1398325	1398325	3.59619432812393e-13	1400840	1400840
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	994	0.006	3.59619432812393e-13	1400840	1400840	2.20754803989634e-07	3588389	3591120
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.0144	2.20754803989634e-07	3588389	3591120	4.45874030779357e-09	3593646	3593646
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	11448975	3634	3450	0.0186	4.45874030779357e-09	3593646	3593646	5.94865416039336e-15	11448975	11448975
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.3301	5.94865416039336e-15	11448975	11448975	3.25822361591883e-16	11452390	11452390
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	56823430	14699	13970	0.0118	3.25822361591883e-16	11452390	11452390	6.1114025051994e-29	56822197	56823430
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56837593	7	7	-0.9199	6.1114025051994e-29	56822197	56823430	1.84776123631824e-29	56837593	56842447
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56840346	56840346	1	0	NA	1.84776123631824e-29	56837593	56842447	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	558	-0.0098	NA	NA	NA	2.56524189652342e-30	58206232	58208527
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	15	0.624	2.56524189652342e-30	58206232	58208527	2.64090777397771e-25	58244012	58247367
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2450	0.009	2.64090777397771e-25	58244012	58247367	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	561	-0.0153	NA	NA	NA	1.54794543735824e-54	1506379	1506379
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.0479	1.54794543735824e-54	1506379	1506379	7.41250653442923e-60	1532433	1532433
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	53690093	17611	16735	-0.0015	7.41250653442923e-60	1532433	1532433	2.32271004370224e-14	53690093	53690093
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	53697767	53705433	2	2	-1.175	2.32271004370224e-14	53690093	53690093	1.83159072971977e-12	53705433	53705433
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	53721314	53721314	1	0	NA	1.83159072971977e-12	53705433	53705433	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	53731920	62419534	3369	3217	-0.0072	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12737	-0.0071	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22644243	2982	2832	0.0073	NA	NA	NA	3.0720043571886e-70	22643742	22682428
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22667608	1	0	NA	3.0720043571886e-70	22643742	22682428	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	0.8839	NA	NA	NA	7.57115993973537e-79	22720195	22725305
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	36074159	6888	6530	0.0069	7.57115993973537e-79	22720195	22725305	0	36074159	36074159
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36075796	36079268	3	3	-5.2624	0	36074159	36074159	0	36079268	36079268
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36080448	37621766	846	805	0.0308	0	36079268	36079268	1.33600421026231e-30	37621766	37621766
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-1.8086	1.33600421026231e-30	37621766	37621766	2.20482946635111e-30	37626069	37626069
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5521	0.0076	2.20482946635111e-30	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1097	NA	NA	NA	4.95490917492381e-11	94062	94062
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.7385	4.95490917492381e-11	94062	94062	0.000660909584361745	103089	104732
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	109064	3	3	-0.7072	0.000660909584361745	103089	104732	1.80749551542999e-08	109064	109064
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	11	0.0489	1.80749551542999e-08	109064	109064	4.31575682832327e-05	122159	129104
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	134946	9	8	-0.3962	4.31575682832327e-05	122159	129104	5.47753031004182e-05	132721	145625
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	138278	225722	48	46	0.0884	5.47753031004182e-05	132721	145625	0.000214234494332953	222004	230932
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	228129	234511	8	8	-0.3864	0.000214234494332953	222004	230932	1.31144995825037e-05	232907	240442
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	236344	1427392	693	659	0.0459	1.31144995825037e-05	232907	240442	1.79712942804856e-16	1427392	1431240
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9887	1.79712942804856e-16	1427392	1431240	3.01839774100229e-11	1432891	1434970
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1882819	342	320	0.0039	3.01839774100229e-11	1432891	1434970	4.60848635354078e-08	1878618	1891108
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1886484	1898078	9	9	-0.5667	4.60848635354078e-08	1878618	1891108	4.82178946661516e-09	1891190	1902169
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1901223	2708291	651	606	0.0028	4.82178946661516e-09	1891190	1902169	0	2708113	2708291
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154038318	45001	42816	0.9492	0	2708113	2708291	1.79154132984997e-34	154037006	154038318
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	1.8191	1.79154132984997e-34	154037006	154038318	3.26098991737118e-26	154079002	154085354
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	84	0.9406	3.26098991737118e-26	154079002	154085354	6.15191137634607e-100	154442377	154442377
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-2.0669	6.15191137634607e-100	154442377	154442377	1.25912507609903e-169	154450309	154450309
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.928	1.25912507609903e-169	154450309	154450309	2.23805995039389e-100	154582414	154586690
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0091	2.23805995039389e-100	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-4.2471	NA	NA	NA	3.34008531101021e-40	3223585	3773948
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.3796	3.34008531101021e-40	3223585	3773948	2.54996679204269e-18	5422507	6688691
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	169	-4.0824	2.54996679204269e-18	5422507	6688691	8.52853082574244e-11	7030763	7189475
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7070931	1	0	NA	8.52853082574244e-11	7030763	7189475	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7073916	7394617	110	108	-3.0099	NA	NA	NA	1.40350540158054e-07	7338262	7465453
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7401540	7723783	91	89	-4.0318	1.40350540158054e-07	7338262	7465453	0.000486368098767857	7707621	7744396
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-2.8819	0.000486368098767857	7707621	7744396	9.84721748962536e-06	7749796	7807668
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	403	-4.0269	9.84721748962536e-06	7749796	7807668	3.13297982340509e-42	10512616	10515697
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.7792	3.13297982340509e-42	10512616	10515697	1.29541599783277e-09	10622062	11673476
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12973899	144	132	-3.3977	1.29541599783277e-09	10622062	11673476	6.30744616012434e-05	12926941	12992839
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13048283	31	28	-2.0529	6.30744616012434e-05	12926941	12992839	4.65654745590938e-07	13032760	13052633
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13104920	23	22	-3.6778	4.65654745590938e-07	13032760	13052633	1.62007377474672e-09	13101234	13104920
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	8	-1.3063	1.62007377474672e-09	13101234	13104920	1.36050323202359e-10	13128515	13133803
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13261173	45	42	-3.5977	1.36050323202359e-10	13128515	13133803	4.76484360172288e-06	13176983	13314244
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	14342834	364	349	-4.2274	4.76484360172288e-06	13176983	13314244	8.87095543709573e-12	14318786	14382361
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	95	-3.5667	8.87095543709573e-12	14318786	14382361	1.08910555497355e-11	14503185	14526446
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.08910555497355e-11	14503185	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-1.3789	NA	NA	NA	0.000112904927811142	14538156	14553021
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14563486	9	9	-3.2442	0.000112904927811142	14538156	14553021	1.15916265143076e-07	14559651	14563486
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14566592	14579298	4	4	-0.8749	1.15916265143076e-07	14559651	14563486	4.82715121268041e-08	14579298	14585542
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	396	-3.9266	4.82715121268041e-08	14579298	14585542	0.000107731263714842	15713288	15987432
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16087502	69	63	-3.2836	0.000107731263714842	15713288	15987432	4.07351134775032e-09	16060470	16139806
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16088722	19610243	470	452	-4.0882	4.07351134775032e-09	16060470	16139806	2.18124818786238e-07	19608039	19610243
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3398	2.18124818786238e-07	19608039	19610243	5.63908318750546e-09	19613864	19614809
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21439923	425	404	-4.1608	5.63908318750546e-09	19613864	19614809	0.0150446245654315	21339310	21441438
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21441438	21497583	13	12	-3.3383	0.0150446245654315	21339310	21441438	1.10092068698497e-11	21497583	21497583
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-1.9309	1.10092068698497e-11	21497583	21497583	0.00274226511836361	21559551	21634923
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	21569358	1	0	NA	0.00274226511836361	21559551	21634923	NA	NA	NA
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21574425	21657525	8	8	-4.039	NA	NA	NA	0.411016952541273	21601101	21678127
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21666200	21689031	11	11	-4.6197	0.411016952541273	21601101	21678127	3.91408623875492e-13	21687813	21691199
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21691199	21761022	12	12	-3.1527	3.91408623875492e-13	21687813	21691199	1.52453733410098e-05	21755980	21805848
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	77	-4.1833	1.52453733410098e-05	21755980	21805848	2.27141442774076e-10	22056953	22158616
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.4713	2.27141442774076e-10	22056953	22158616	1.39308697383239e-08	22175425	22179794
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	87	-4.11	1.39308697383239e-08	22175425	22179794	3.91750252963741e-75	25737663	26870361
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	28	-1.2085	3.91750252963741e-75	25737663	26870361	7.20388053493681e-14	26945084	26950080
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.8498	7.20388053493681e-14	26945084	26950080	0.000184762506647844	26965406	26995399
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	10	-1.3861	0.000184762506647844	26965406	26995399	1.27889742392094e-05	27009433	27019256
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.2211	1.27889742392094e-05	27009433	27019256	6.30474378898073e-07	27039222	27063070
MSK_252152915604_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.9173	6.30474378898073e-07	27039222	27063070	NA	NA	NA
