Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	24391166	8834	8360	2e-04	NA	NA	NA	1.96179897715898e-10	24391166	24391166
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-1.3579	1.96179897715898e-10	24391166	24391166	9.75510442515804e-12	24395691	24395691
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	72536231	19057	18078	0.0014	9.75510442515804e-12	24395691	24395691	0	72536231	72536231
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	0	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.3421	NA	NA	NA	0	72579311	72579311
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11075	0.0027	0	72579311	72579311	1.89849970898245e-48	110023268	110023268
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-2.1687	1.89849970898245e-48	110023268	110023268	1.45192462828144e-49	110039388	110039388
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2098	0.0068	1.45192462828144e-49	110039388	110039388	2.53253303817990e-219	116029725	116029725
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-5.5575	2.5325330381799e-219	116029725	116029725	4.79759604356007e-221	116033402	116033402
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	143700072	1691	1599	0.0098	4.79759604356007e-221	116033402	116033402	4.4533877590324e-16	143651396	143708689
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	143789484	44	40	-0.3337	4.4533877590324e-16	143651396	143708689	4.73493864754371e-14	143784932	143805209
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	150839754	1895	1793	9e-04	4.73493864754371e-14	143784932	143805209	0	150839754	150839754
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-4.0921	0	150839754	150839754	1.09163804448623e-319	150851439	150851439
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2622	6e-04	1.09163804448623e-319	150851439	150851439	7.86846471047034e-13	157133150	157133150
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.4481	7.86846471047034e-13	157133150	157133150	1.66246909869074e-14	157136342	157136342
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12587	7e-04	1.66246909869074e-14	157136342	157136342	0	194978218	194978218
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	8	-5.4881	0	194978218	194978218	0	195065867	195065867
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	222887891	10229	9660	-0.0015	0	195065867	195065867	4.69448206116628e-11	222887891	222887891
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	222889768	222890916	2	2	1.3077	4.69448206116628e-11	222887891	222887891	1.70595401050299e-11	222890916	222890916
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	222893111	247186514	9374	8927	-0.0086	1.70595401050299e-11	222890916	222890916	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1290	-0.0257	NA	NA	NA	1.48914595501355e-10	3708749	3708749
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3713664	1	0	NA	1.48914595501355e-10	3708749	3708749	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3714142	3714236	2	2	-1.2779	NA	NA	NA	1.50730317354582e-10	3714236	3714236
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	87149187	28502	26941	0	1.50730317354582e-10	3714236	3714236	1.34635604636438e-13	86964156	87256833
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	87968898	17	17	0.4929	1.34635604636438e-13	86964156	87256833	1.03751676985785e-11	87721951	88038874
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88003830	89057273	378	356	0.0223	1.03751676985785e-11	87721951	88038874	2.04606213128717e-20	89036539	89263354
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89093646	89093646	1	0	NA	2.04606213128717e-20	89036539	89263354	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89208480	94892170	83	79	0.3329	NA	NA	NA	6.22734774576388e-30	91155301	94946461
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94892766	146571330	14702	13917	-0.002	6.22734774576388e-30	91155301	94946461	2.06917349594163e-28	146571330	146571330
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.4452	2.06917349594163e-28	146571330	146571330	4.46084055113418e-29	146592775	146592775
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	205821508	19410	18410	-0.0027	4.46084055113418e-29	146592775	146592775	5.75275443721437e-18	205821508	205821508
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205822822	205829162	4	4	-1.1507	5.75275443721437e-18	205821508	205821508	2.51994080866587e-17	205829162	205834447
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205832678	205832678	1	0	NA	2.51994080866587e-17	205829162	205834447	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205834447	242689978	13334	12626	7e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	163989367	53487	50672	0.0019	NA	NA	NA	6.25010052918178e-75	163987457	163997228
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163992903	163992903	1	0	NA	6.25010052918178e-75	163987457	163997228	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	0.9148	NA	NA	NA	5.1302170365199e-75	164100804	164112873
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	187887798	7835	7405	0.0069	5.1302170365199e-75	164100804	164112873	2.94872861305552e-26	187886295	187887798
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187890040	187890040	1	0	NA	2.94872861305552e-26	187886295	187887798	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187891716	187903422	7	7	-1.0348	NA	NA	NA	1.75451520641323e-26	187903422	187906691
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187905544	187905544	1	0	NA	1.75451520641323e-26	187903422	187906691	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187906691	194354505	2286	2173	-0.0011	NA	NA	NA	1.52782072462157e-30	194354505	194354505
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	1.1975	1.52782072462157e-30	194354505	194354505	1.41432040300155e-28	194366950	194366950
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	947	-0.0073	1.41432040300155e-28	194366950	194366950	7.27577947017334e-60	196820428	196835413
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	25	-0.8674	7.27577947017334e-60	196820428	196835413	3.74307361610037e-51	196952514	196961238
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	196958467	1	0	NA	3.74307361610037e-51	196952514	196961238	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	909	-0.0257	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1726422	566	539	-0.027	NA	NA	NA	1.14535222582990e-14	1726422	1726422
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1732474	1732706	2	2	1.6331	1.1453522258299e-14	1726422	1726422	5.35506202697381e-15	1732706	1732706
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1734030	9815760	2825	2673	0.0179	5.35506202697381e-15	1732706	1732706	0	9815760	9815760
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.7878	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	108281452	28021	26541	-0.0028	0	9842644	9842644	2.32768199902419e-13	108281452	108281452
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108283417	108290095	3	3	-1.136	2.32768199902419e-13	108281452	108281452	8.18085716345463e-14	108290095	108290095
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108296216	116326024	2774	2614	-0.008	8.18085716345463e-14	108290095	108290095	8.26761535481463e-09	116326024	116326024
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116333504	116333504	1	0	NA	8.26761535481463e-09	116326024	116326024	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116344714	116351479	2	2	1.1063	NA	NA	NA	2.13031400970786e-08	116351479	116357165
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116357165	119334954	547	511	0.0133	2.13031400970786e-08	116351479	116357165	5.88460053280737e-14	119333701	119334954
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-1.1319	5.88460053280737e-14	119333701	119334954	3.26370547025181e-13	119348829	119348829
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173660684	15087	14335	0.0051	3.26370547025181e-13	119348829	119348829	1.71090089725599e-138	173660684	173660684
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-4.3829	1.71090089725599e-138	173660684	173660684	2.61985508881130e-141	173666072	173666072
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3850	0.001	2.6198550888113e-141	173666072	173666072	2.45336352057561e-22	187330240	187330240
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.7706	2.45336352057561e-22	187330240	187330240	6.78974858907249e-21	187333619	187333619
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1161	-0.02	6.78974858907249e-21	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3762	-0.0112	NA	NA	NA	1.57008901180099e-11	12857302	12857302
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.3257	1.57008901180099e-11	12857302	12857302	2.64494865837646e-11	12873052	12873052
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	172500918	47069	44552	0.0023	2.64494865837646e-11	12873052	12873052	1.12754769190672e-16	172495341	172505336
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172502377	172502377	1	0	NA	1.12754769190672e-16	172495341	172505336	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172503484	172528955	14	14	0.6006	NA	NA	NA	7.1796342831383e-15	172525968	172533808
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172531965	180644810	2705	2558	0.0028	7.1796342831383e-15	172525968	172533808	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0684	NA	NA	NA	1.39278241384710e-07	183349	211079
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	-0.4517	1.3927824138471e-07	183349	211079	7.27041701127795e-11	236535	249566
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	241674	1	0	NA	7.27041701127795e-11	236535	249566	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	26811016	9309	8804	-0.0061	NA	NA	NA	7.64985511302653e-13	26801068	26811016
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.97	7.64985511302653e-13	26801068	26811016	1.16230090462511e-13	26861184	26863540
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1147	0.0097	1.16230090462511e-13	26861184	26863540	7.74093948513755e-10	29937319	29962849
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29995247	10	9	0.568	7.74093948513755e-10	29937319	29962849	4.21030503852265e-08	29992946	30004636
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	32548736	1079	1026	0.0078	4.21030503852265e-08	29992946	30004636	4.84574940807526e-80	32548736	32631315
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32762061	67	65	-1.066	4.84574940807526e-80	32548736	32631315	8.89542648667905e-210	32716255	32762061
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	65823778	10666	10107	-0.0031	8.89542648667905e-210	32716255	32762061	5.90431651037399e-16	65823778	65823778
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65825343	65826936	2	2	-1.5538	5.90431651037399e-16	65823778	65823778	2.68392352901194e-17	65826936	65826936
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65828418	79018959	4013	3777	0.0044	2.68392352901194e-17	65826936	65826936	0	79018959	79018959
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-6.4749	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	162631847	26971	25569	7e-04	0	79091850	79091850	1.27751951497931e-22	162631847	162631847
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162634374	162641350	5	5	-1.146	1.27751951497931e-22	162631847	162631847	5.69674557753196e-22	162641350	162641350
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162644245	165643653	896	845	-0.0122	5.69674557753196e-22	162641350	162641350	7.90387431276883e-32	165643653	165643653
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	1.7444	7.90387431276883e-32	165643653	165643653	3.06622504517008e-28	165649379	165649379
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1708	-0.0061	3.06622504517008e-28	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5104	0	NA	NA	NA	5.68120007265919e-131	16135701	16135701
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.5077	5.68120007265919e-131	16135701	16135701	5.1296316508918e-145	16140018	16140018
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	30703013	5432	5144	-0.0012	5.1296316508918e-145	16140018	16140018	6.58018290899408e-11	30703013	30703013
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	30704582	30705718	2	2	1.2684	6.58018290899408e-11	30703013	30703013	5.54969816440025e-10	30705718	30705718
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	30708772	118611324	28441	26895	0.0025	5.54969816440025e-10	30705718	30705718	1.76150102148615e-237	118611324	118611324
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.8219	1.76150102148615e-237	118611324	118611324	3.5783927735738e-237	118620875	118620875
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	129377280	4835	4573	-0.0018	3.5783927735738e-237	118620875	118620875	2.35881280947616e-09	129377280	129377280
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129379053	129380261	2	2	1.2067	2.35881280947616e-09	129377280	129377280	3.07949974316269e-10	129380261	129380261
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129383186	133433384	1990	1854	0	3.07949974316269e-10	129380261	129380261	9.36749072732373e-14	133426996	133433384
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6955	9.36749072732373e-14	133426996	133433384	1.54307710641388e-13	133448277	133455682
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3520	-0.0048	1.54307710641388e-13	133448277	133455682	8.13076878163979e-10	141406414	141422860
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.4682	8.13076878163979e-10	141406414	141422860	1.05273915376669e-07	141426846	141449014
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	144685132	1218	1144	0.0158	1.05273915376669e-07	141426846	141449014	2.28953090375420e-13	144685132	144687117
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144687117	144694670	3	3	-1.2221	2.2895309037542e-13	144685132	144687117	4.37517543990128e-15	144692943	144694670
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144695832	147702365	1418	1348	-0.0043	4.37517543990128e-15	144692943	144694670	9.01590545229905e-77	147702365	147702365
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.2911	9.01590545229905e-77	147702365	147702365	3.75253304656854e-68	147707161	147707161
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	3999	-0.0158	3.75253304656854e-68	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	3771559	1367	1295	-0.0184	NA	NA	NA	3.62058894403794e-14	3771559	3771559
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3773975	3776617	2	2	-1.4647	3.62058894403794e-14	3771559	3771559	4.62576448188788e-15	3776617	3776617
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3779135	15444819	3694	3505	-0.0059	4.62576448188788e-15	3776617	3776617	4.85873254757517e-12	15441143	15444819
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15446571	15457778	6	5	-0.8348	4.85873254757517e-12	15441143	15444819	1.92547465666868e-11	15457778	15464010
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15464010	25119007	3089	2937	-0.0042	1.92547465666868e-11	15457778	15464010	3.40629547500498e-75	25119007	25119007
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25120552	1	0	NA	3.40629547500498e-75	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25124428	2	2	-3.2963	NA	NA	NA	4.02430050454487e-74	25124428	25124428
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25125700	25125700	1	0	NA	4.02430050454487e-74	25124428	25124428	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	26934767	768	727	0.0017	NA	NA	NA	1.59369487028272e-09	26934767	26934767
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26935578	26936405	2	2	-1.2037	1.59369487028272e-09	26934767	26934767	1.19563624391710e-09	26936405	26936405
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26937497	39350798	4142	3918	-0.0024	1.1956362439171e-09	26936405	26936405	0	39350798	39350798
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	-5.0459	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	79227044	10579	9987	-0.007	0	39505256	39505256	5.80298463210887e-09	79221894	79227044
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	79237840	79247936	2	2	-1.1686	5.80298463210887e-09	79221894	79227044	2.72982727790644e-09	79247936	79252742
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	79252742	87258019	2107	1979	-0.0025	2.72982727790644e-09	79247936	79252742	3.67520665657653e-11	87258019	87258019
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87259940	87262662	2	2	-1.2762	3.67520665657653e-11	87258019	87258019	6.24404719704419e-11	87262662	87262662
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	144354037	18047	17150	0.003	6.24404719704419e-11	87262662	87262662	5.7378454535018e-13	144354037	144360602
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144355892	144355892	1	0	NA	5.7378454535018e-13	144354037	144360602	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144360602	144365211	3	3	1.1348	NA	NA	NA	9.13692815620341e-09	144363771	144369629
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144369629	146264846	692	656	-0.0109	9.13692815620341e-09	144363771	144369629	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	35873	-0.0037	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23255	-0.0053	NA	NA	NA	4.15878131790171e-121	77917893	77917893
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.4283	4.15878131790171e-121	77917893	77917893	3.36094267833558e-119	77928738	77928738
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19087	-6e-04	3.36094267833558e-119	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1667	-0.0039	NA	NA	NA	2.58187030574803e-276	4923300	4923300
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.6591	2.58187030574803e-276	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	343	-0.0223	0	4932214	4932214	3.65959384081815e-30	5738494	5741031
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.8502	3.65959384081815e-30	5738494	5741031	4.8196255599021e-32	5763749	5765438
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	7762277	864	810	4e-04	4.8196255599021e-32	5763749	5765438	3.22944856141971e-18	7758275	7762277
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7771593	7783492	8	7	-0.9066	3.22944856141971e-18	7758275	7762277	2.14872247878358e-18	7783492	7803570
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7800021	2	0	NA	2.14872247878358e-18	7783492	7803570	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7803570	134450318	42278	40026	0.0021	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	132289090	45160	42729	-0.0027	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56662112	14029	13275	8e-04	NA	NA	NA	2.65338733875831e-20	56660235	56664197
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56663137	56686863	12	12	0.7208	2.65338733875831e-20	56660235	56664197	6.17905199864014e-21	56681665	56688605
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	114123340	17603	16606	-0.002	6.17905199864014e-21	56681665	56688605	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.7343	NA	NA	NA	1.24272542665218e-17	18544772	18798641
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19612233	91	83	-0.0902	1.24272542665218e-17	18544772	18798641	3.04715469174207e-16	19612233	19612233
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19624086	19627092	2	2	1.1366	3.04715469174207e-16	19612233	19612233	5.77860447568526e-08	19627092	19627092
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19628277	40676611	7549	7155	0.0068	5.77860447568526e-08	19627092	19627092	0	40676611	40676611
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	7	-5.3166	0	40676611	40676611	0	40726930	40726930
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	105681007	24000	22654	-9e-04	0	40726930	40726930	3.32889310202679e-33	105623070	105736164
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105881893	53	50	0.4519	3.32889310202679e-33	105623070	105736164	0.00011987957580705	105839439	105900253
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105946993	16	16	0.0496	0.00011987957580705	105839439	105900253	2.85068775016361e-13	105946993	105951399
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	106002179	18	16	-0.8265	2.85068775016361e-13	105946993	105951399	2.44382860692195e-25	105996176	106013552
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	135	0.0152	2.44382860692195e-25	105996176	106013552	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	27994706	2357	2227	0.0043	NA	NA	NA	2.99817454220556e-17	27992874	27994706
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	27999735	28005587	3	2	1.0935	2.99817454220556e-17	27992874	27994706	7.25281113552393e-08	28005587	28008523
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28008523	35724178	2493	2337	-0.0049	7.25281113552393e-08	28005587	28008523	4.96667836471662e-09	35712154	35724178
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35729215	35747203	3	3	0.9531	4.96667836471662e-09	35712154	35724178	5.07482529831905e-08	35747203	35751198
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35751198	40629969	2116	1985	0.0046	5.07482529831905e-08	35747203	35751198	6.33218380972036e-13	40628717	40629969
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	40631160	40637687	5	4	-1.0266	6.33218380972036e-13	40628717	40629969	2.11371220865111e-13	40637687	40638953
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	40638953	100217283	24341	23024	-0.0031	2.11371220865111e-13	40637687	40638953	5.43222515026024e-06	100212401	100282819
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	0.7096	5.43222515026024e-06	100212401	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	88690571	25657	24327	-0.0014	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	817	-0.0445	NA	NA	NA	3.4995896884957e-38	1903358	1903358
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	1.7466	3.4995896884957e-38	1903358	1903358	3.33892925739755e-39	1906391	1906391
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12283	-7e-04	3.33892925739755e-39	1906391	1906391	8.17400513776263e-145	36673853	36678537
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-2.7388	8.17400513776263e-145	36673853	36678537	6.9763934356571e-127	36682031	36684619
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1926	-0.0026	6.9763934356571e-127	36682031	36684619	2.90711083644607e-13	41544224	41572001
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42147225	49	48	-0.3108	2.90711083644607e-13	41544224	41572001	5.45778760022516e-14	41708551	42168548
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	42148637	1	0	NA	5.45778760022516e-14	41708551	42168548	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42151941	78653545	13675	12920	-7e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	169	-0.0231	NA	NA	NA	5.94603714817689e-10	497125	500897
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	-1.3492	5.94603714817689e-10	497125	500897	3.77853510095861e-12	505456	505456
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	76116026	22787	21591	-0.0048	3.77853510095861e-12	505456	505456	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	11448975	5172	4877	-0.0069	NA	NA	NA	1.0067534516158e-37	11448975	11448975
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.7549	1.0067534516158e-37	11448975	11448975	1.852871703752e-45	11452390	11452390
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	21686126	4394	4163	-0.0146	1.852871703752e-45	11452390	11452390	1.51376187603800e-09	21686126	21686126
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21687935	21687971	2	2	-1.3152	1.513761876038e-09	21686126	21686126	9.47398271366677e-10	21687971	21687971
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21694278	57511740	10686	10110	6e-04	9.47398271366677e-10	21687971	21687971	1.89445225183916e-188	57510831	57516311
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57516311	57744490	81	78	-0.8982	1.89445225183916e-188	57510831	57516311	3.30135388260403e-168	57736729	57752817
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57752817	63788698	2722	2552	-0.0167	3.30135388260403e-168	57736729	57752817	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	558	-0.0267	NA	NA	NA	3.67842794254657e-314	1506379	1506379
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-3.9011	3.67842794254657e-314	1506379	1506379	0	1531162	1531162
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	60787245	20244	19182	-0.0023	0	1531162	1531162	9.18673627577008e-27	60783367	60790657
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60790657	60837745	22	22	0.6027	9.18673627577008e-27	60783367	60790657	1.1446322503502e-20	60834886	60843836
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60840784	62419534	718	674	-0.0388	1.1446322503502e-20	60834886	60843836	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12715	-0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2407	0.0046	NA	NA	NA	6.1279274202803e-21	21571489	21571489
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.616	6.1279274202803e-21	21571489	21571489	1.26584789512676e-23	21576859	21576859
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	35472378	7028	6636	0.0089	1.26584789512676e-23	21576859	21576859	4.60977292917692e-74	35472378	35472378
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4405	4.60977292917692e-74	35472378	35472378	6.47431133749538e-67	35476942	35476942
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	48448446	6501	6179	0.0106	6.47431133749538e-67	35476942	35476942	2.94710242498912e-09	48446915	48448446
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	-1.3114	2.94710242498912e-09	48446915	48448446	5.41481531430564e-08	48452959	48452959
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	48455492	1	0	NA	5.41481531430564e-08	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	49571068	499	472	-0.0252	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.139	NA	NA	NA	2.34957752196261e-09	94062	94062
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6697	2.34957752196261e-09	94062	94062	1.47982902759520e-31	104732	104732
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	214780	62	57	0.0245	1.4798290275952e-31	104732	104732	8.21983680513654e-06	214594	214780
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	216366	216381	2	2	1.2523	8.21983680513654e-06	214594	214780	2.24102968976473e-07	216381	217178
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	217178	1427392	710	672	-0.0062	2.24102968976473e-07	216381	217178	2.18115307915123e-07	1427338	1431240
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9017	2.18115307915123e-07	1427338	1431240	2.38435350076879e-07	1432891	1434970
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1726100	243	233	0.0076	2.38435350076879e-07	1432891	1434970	7.74677740283668e-43	1722523	1736541
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1730348	1894973	106	99	0.5126	7.74677740283668e-43	1722523	1736541	2.78502673075498e-56	1888202	1901223
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	2708291	653	616	-0.0069	2.78502673075498e-56	1888202	1901223	0	2708113	2711273
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	21733	0.9051	0	2708113	2711273	2.82575556434358e-108	76998610	76998610
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-4.4805	2.82575556434358e-108	76998610	76998610	7.45671902575666e-107	77010018	77010018
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	140518817	18001	17057	0.9044	7.45671902575666e-107	77010018	77010018	2.8248686623741e-10	140383353	140526536
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140520973	140591773	21	20	1.4521	2.8248686623741e-10	140383353	140526536	6.11132035017306e-09	140577526	140634474
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140616903	140616903	1	0	NA	6.11132035017306e-09	140577526	140634474	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	140617007	154047749	4040	3817	0.9158	NA	NA	NA	2.18147498698908e-16	154046681	154050185
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154050185	154079002	9	8	2.0484	2.18147498698908e-16	154046681	154050185	2.03347537280089e-20	154079002	154085354
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154578922	120	116	0.8273	2.03347537280089e-20	154079002	154085354	1.23060135300053e-133	154570177	154582414
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154888224	202	189	-0.0504	1.23060135300053e-133	154570177	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3219200	122	117	-4.9297	NA	NA	NA	1.51780892090829e-36	3034907	3773948
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3223585	5593746	18	17	-1.6826	1.51780892090829e-36	3034907	3773948	3.76716992271043e-27	4948824	5672441
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7053223	174	167	-4.6832	3.76716992271043e-27	4948824	5672441	5.55215977003111e-08	7025866	7201478
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7054924	7054924	1	0	NA	5.55215977003111e-08	7025866	7201478	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7332632	88	86	-3.7489	NA	NA	NA	2.33609828630477e-14	7286087	7349064
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7333934	10513747	562	543	-4.712	2.33609828630477e-14	7286087	7349064	7.26744056868145e-38	10512616	10515697
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10622062	11	11	-0.9769	7.26744056868145e-38	10512616	10515697	1.15025917300984e-08	10617908	11249952
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10631941	10645500	2	0	NA	1.15025917300984e-08	10617908	11249952	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13114969	204	192	-3.9299	NA	NA	NA	0.0116624559661162	13058512	13114969
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13119344	13119344	1	0	NA	0.0116624559661162	13058512	13114969	NA	NA	NA
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.5071	NA	NA	NA	9.66835982697658e-13	13128515	13128515
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14359748	417	394	-4.8795	9.66835982697658e-13	13128515	13128515	1.15397744243004e-10	14354682	14368151
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14380301	11	11	-3.1349	1.15397744243004e-10	14354682	14368151	6.81309479246983e-05	14375855	14388689
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14524829	79	75	-4.5985	6.81309479246983e-05	14375855	14388689	1.72559846303537e-11	14506319	14539230
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	23	-2.5203	1.72559846303537e-11	14506319	14539230	4.7142233724855e-18	14557473	14585542
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15122414	108	106	-4.8065	4.7142233724855e-18	14557473	14585542	0.189319350870601	14734647	15299931
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15124246	16184484	419	397	-4.5157	0.189319350870601	14734647	15299931	1.35324130447455e-07	16015301	16325391
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16186896	19610243	429	410	-4.8969	1.35324130447455e-07	16015301	16325391	9.56653101440521e-14	19610243	19610243
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3853	9.56653101440521e-14	19610243	19610243	1.56930711838097e-11	19613864	19613864
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	533	-4.8349	1.56930711838097e-11	19613864	19613864	5.53539347781372e-08	22052726	22158616
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-3.0611	5.53539347781372e-08	22052726	22158616	3.03969821468543e-08	22171771	22182080
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	84	-4.8999	3.03969821468543e-08	22171771	22182080	2.53248532896186e-69	22930737	23283689
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-1.5863	2.53248532896186e-69	22930737	23283689	8.15351732009222e-06	26941769	26995399
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-3.5259	8.15351732009222e-06	26941769	26995399	6.87851629836894e-07	27007874	27067889
MSK_252152915605_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-1.1824	6.87851629836894e-07	27007874	27067889	NA	NA	NA
