Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	47008256	17819	17385	0.0127	NA	NA	NA	8.98518430701778e-16	46994533	47038254
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	47028245	47165123	30	29	0.4603	8.98518430701778e-16	46994533	47038254	2.95351643659536e-19	47099066	47176663
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	47169984	72537426	10045	9812	-0.0011	2.95351643659536e-19	47099066	47176663	2.12558880298652e-242	72537426	72537426
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	6	-3.5305	2.12558880298652e-242	72537426	72537426	4.88782269729474e-247	72574479	72574479
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	4.88782269729474e-247	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110014625	11701	11428	0.0035	NA	NA	NA	3.89963930538212e-09	110010176	110014625
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.7029	3.89963930538212e-09	110010176	110014625	1.05179330597404e-08	110041712	110060587
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147308557	4557	4427	-0.0067	1.05179330597404e-08	110041712	110060587	6.35307378404479e-34	146297175	147313991
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147311437	147510532	34	34	0.5585	6.35307378404479e-34	146297175	147313991	4.29105869444385e-10	147510532	147510532
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	148081741	3	3	-0.4698	4.29105869444385e-10	147510532	147510532	0.053127862924664	148081741	148145932
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150818222	1254	1223	0.0133	0.053127862924664	148081741	148145932	2.88304810454101e-08	150813419	150818222
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.711	2.88304810454101e-08	150813419	150818222	1.50645502864244e-35	150839754	150839754
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-3.9166	1.50645502864244e-35	150839754	150839754	1.53575035116173e-144	150846148	150846148
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.53575035116173e-144	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	74	-0.073	NA	NA	NA	9.64783222875615e-09	151024118	151026228
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8539	9.64783222875615e-09	151024118	151026228	6.28545125657134e-09	151033188	151038091
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	167483267	6789	6623	-0.0016	6.28545125657134e-09	151033188	151038091	7.1203980462747e-08	167477428	167493768
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5692	7.1203980462747e-08	167477428	167493768	9.81433624305793e-08	167507882	167523140
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200613454	11352	11076	0.0013	9.81433624305793e-08	167507882	167523140	2.06976537710913e-10	200589108	200634858
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200803726	37	37	-0.302	2.06976537710913e-10	200589108	200634858	6.75429124735451e-10	200693672	200816497
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	243700961	16004	15668	-0.0017	6.75429124735451e-10	200693672	200816497	9.16257849405719e-16	243699611	243700961
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243702540	243702540	1	0	NA	9.16257849405719e-16	243699611	243700961	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243714007	7	7	-0.8593	NA	NA	NA	6.08692857464696e-15	243714007	243715818
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243715818	247186514	1393	1358	-0.0156	6.08692857464696e-15	243714007	243715818	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11239	-0.0023	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	14	-4.6015	0	34543992	34543992	8.3671670056887e-05	34571897	34579933
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	4	-2.7672	8.3671670056887e-05	34571897	34579933	1.30109649904632e-104	34589997	34589997
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	66357387	11754	11486	0.0013	1.30109649904632e-104	34589997	34589997	1.04169798540562e-11	66357387	66357387
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.3481	1.04169798540562e-11	66357387	66357387	1.99738004746946e-11	66360747	66360747
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	82054900	5222	5100	-0.0015	1.99738004746946e-11	66360747	66360747	1.54895251989452e-11	82044740	82058168
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	82058168	82164538	16	15	0.4939	1.54895251989452e-11	82044740	82058168	3.04288390504712e-11	82159133	82191836
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	82171872	146571330	16540	16164	-0.0028	3.04288390504712e-11	82159133	82191836	3.92921468053285e-20	146571330	146571330
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	1.2641	3.92921468053285e-20	146571330	146571330	3.65172936000756e-22	146592775	146592775
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154102006	2089	2045	-0.0034	3.65172936000756e-22	146592775	146592775	1.37261336486865e-171	154083797	154108483
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154108483	154470916	59	58	-0.9352	1.37261336486865e-171	154083797	154108483	1.33712553581963e-165	154469423	154479398
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154479398	242689978	30601	29913	-9e-04	1.33712553581963e-165	154469423	154479398	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	8794447	2987	2909	-0.0016	NA	NA	NA	1.86449476196052e-08	8786545	8797012
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8797012	8835272	10	10	0.4937	1.86449476196052e-08	8786545	8797012	5.46637796830293e-07	8828722	8856364
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8838332	17514137	3491	3402	-0.002	5.46637796830293e-07	8828722	8856364	3.34835755279662e-09	17511765	17514137
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17516200	17519829	3	3	-1.0311	3.34835755279662e-09	17511765	17514137	1.85520234025351e-10	17519829	17521317
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17521317	32074432	4305	4213	-0.011	1.85520234025351e-10	17519829	17521317	4.55724718229812e-121	32074432	32074432
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.1505	4.55724718229812e-121	32074432	32074432	9.35144873126874e-112	32080848	32080848
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	164005577	42693	41735	-0.002	9.35144873126874e-112	32080848	32080848	1.75156465095974e-15	164001657	164012645
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.007	1.75156465095974e-15	164001657	164012645	5.24186667541583e-16	164019640	164036648
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	190844369	8933	8701	0.0014	5.24186667541583e-16	164019640	164036648	5.71148703055646e-09	190841946	190844369
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-0.9882	5.71148703055646e-09	190841946	190844369	2.92950628550530e-09	190850562	190854164
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	194354505	1214	1184	-0.0076	2.9295062855053e-09	190850562	190854164	6.68089535980142e-297	194354505	194354505
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.8698	6.68089535980142e-297	194354505	194354505	7.13794675023768e-267	194366950	194366950
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1928	-0.0077	7.13794675023768e-267	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3315	0.0155	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.4698	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68377894	14827	14453	-0.0029	0	9842644	9842644	2.62042907910802e-53	68357263	68392464
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68380378	68698110	133	128	0.3499	2.62042907910802e-53	68357263	68392464	1.85122505379274e-49	68677364	68723570
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68699351	88752705	6675	6515	0.0053	1.85122505379274e-49	68677364	68723570	2.27048903488523e-10	88752705	88752705
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.2766	2.27048903488523e-10	88752705	88752705	2.75365252758454e-10	88756721	88756721
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	88757953	1	0	NA	2.75365252758454e-10	88756721	88756721	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88759763	173660684	24800	24242	-0.0012	NA	NA	NA	1.14377634718401e-10	173660684	173660684
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.298	1.14377634718401e-10	173660684	173660684	3.50266517615689e-11	173666072	173666072
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191041481	5317	5185	-0.0032	3.50266517615689e-11	173666072	173666072	3.59510259360141e-09	190899523	191133609
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.2316	3.59510259360141e-09	190899523	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12837736	3972	3901	-0.0016	NA	NA	NA	1.15561109374639e-11	12835355	12853151
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12840501	12873052	5	5	0.8736	1.15561109374639e-11	12835355	12853151	4.81437842331047e-12	12857302	13263185
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	140200229	36101	35245	-0.0031	4.81437842331047e-12	12857302	13263185	1.08873690323057e-09	140196482	140203440
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.5951	1.08873690323057e-09	140196482	140203440	1.76320795080955e-09	140213216	140221835
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	178040439	12649	12353	-0.0026	1.76320795080955e-09	140213216	140221835	1.02229935702763e-07	178037603	178040439
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-1.1463	1.02229935702763e-07	178037603	178040439	1.13381363095152e-06	178045608	178047480
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180644810	1028	1008	0.015	1.13381363095152e-06	178045608	178047480	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10322	-5e-04	NA	NA	NA	1.10799138049386e-07	29935438	29972382
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30000990	12	12	0.449	1.10799138049386e-07	29935438	29972382	7.40237053506593e-06	29992946	30026699
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	32548736	1077	1053	0.0238	7.40237053506593e-06	29992946	30026699	8.45367860961165e-154	32548736	32548736
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	10	-2.3696	8.45367860961165e-154	32548736	32548736	4.57658039239065e-42	32600962	32600962
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	0.0094	4.57658039239065e-42	32600962	32600962	1.58020154210988e-05	32703109	32723722
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	0.5674	1.58020154210988e-05	32703109	32723722	1.05921140579267e-13	32728487	32745036
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	54035000	8253	8079	0.001	1.05921140579267e-13	32728487	32745036	2.54260835114842e-152	54035000	54035000
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9777	2.54260835114842e-152	54035000	54035000	2.60664297189767e-161	54042734	54042734
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	102039635	12717	12435	-1e-04	2.60664297189767e-161	54042734	54042734	1.27616443682097e-294	102039635	102039635
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-5.3678	1.27616443682097e-294	102039635	102039635	2.81706646118018e-299	102044331	102044331
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	481	0.0111	2.81706646118018e-299	102044331	102044331	1.77108124864572e-14	103827105	103841482
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0454	1.77108124864572e-14	103827105	103841482	7.63416078633344e-15	103868154	103873584
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	119083631	5014	4912	-1e-04	7.63416078633344e-15	103868154	103873584	6.19804651749698e-82	119081502	119085624
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	119085624	119141559	29	29	-0.8991	6.19804651749698e-82	119081502	119085624	4.21821579366053e-84	119139398	119143655
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	119143655	126224141	2229	2178	0.002	4.21821579366053e-84	119139398	119143655	3.45986654917626e-10	126224141	126224141
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	126226097	126228177	2	2	-1.2124	3.45986654917626e-10	126224141	126224141	1.66181239846824e-09	126228177	126228177
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	126231585	134629897	3206	3150	0.0097	1.66181239846824e-09	126228177	126228177	8.65723400242753e-314	134629897	134629897
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-4.8688	8.65723400242753e-314	134629897	134629897	1.23516411460312e-320	134635779	134635779
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10367	-0.0064	1.23516411460312e-320	134635779	134635779	2.01831199113019e-164	165643653	165643653
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	2	-4.9203	2.01831199113019e-164	165643653	165643653	2.88015662637969e-147	165649379	165649379
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	2.88015662637969e-147	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1755	-0.0232	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	64523575	19562	19107	-0.002	NA	NA	NA	5.03812259126125e-09	64523575	64523575
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.2321	5.03812259126125e-09	64523575	64523575	3.78310319301555e-09	64532949	64532949
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	86771217	6576	6434	0.0065	3.78310319301555e-09	64532949	64532949	1.15364592648704e-10	86769476	86771217
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86785324	4	4	-0.935	1.15364592648704e-10	86769476	86771217	1.62512967493841e-10	86785324	86789967
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	141405145	23655	23112	0.0022	1.62512967493841e-10	86785324	86789967	3.36932029810101e-10	141398471	141408013
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141406414	141431668	13	13	-0.5106	3.36932029810101e-10	141398471	141408013	2.94970384100279e-09	141426846	141435643
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141432778	141690753	121	117	0.0185	2.94970384100279e-09	141426846	141435643	1.71248028942276e-241	141690753	141690753
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-3.7979	1.71248028942276e-241	141690753	141690753	8.51937847701596e-209	141711513	141711513
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141720303	3	0	NA	8.51937847701596e-209	141711513	141711513	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142166710	170	165	0.0887	NA	NA	NA	2.06182900734319e-26	142166710	142166710
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.6897	2.06182900734319e-26	142166710	142166710	7.9677163386263e-47	142167908	142167908
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147702365	2339	2288	1e-04	7.9677163386263e-47	142167908	142167908	5.66902471909549e-13	147702365	147702365
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.4223	5.66902471909549e-13	147702365	147702365	6.67557324409569e-11	147707161	147707161
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4135	-0.0126	6.67557324409569e-11	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	4462929	1699	1668	-2e-04	NA	NA	NA	3.79713727154925e-13	4461589	4462929
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4464488	4472501	5	5	-0.9053	3.79713727154925e-13	4461589	4462929	9.2358854900413e-14	4472501	4474907
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4474907	7226901	689	674	-0.0103	9.2358854900413e-14	4472501	4474907	2.43463399368872e-09	6926661	7260442
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.5978	2.43463399368872e-09	6926661	7260442	1.2063821096574e-08	7790934	8143301
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	16833305	2982	2925	0.0049	1.2063821096574e-08	7790934	8143301	1.46747563439403e-10	16828137	16833305
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16856956	16869117	4	3	-1.0765	1.46747563439403e-10	16828137	16833305	1.54672511188785e-10	16869117	16874181
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16874181	25022606	2742	2678	-0.0063	1.54672511188785e-10	16869117	16874181	2.28637758052664e-13	25022606	25022606
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	1.1929	2.28637758052664e-13	25022606	25022606	2.97454710260222e-13	25039370	25039370
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	146264846	36434	35506	-6e-04	2.97454710260222e-13	25039370	25039370	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	70926188	13071	12737	-0.0014	NA	NA	NA	4.73094765953666e-26	70926188	70926188
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.9746	4.73094765953666e-26	70926188	70926188	8.24571646185591e-24	70930528	70930528
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23217	-0.0074	8.24571646185591e-24	70930528	70930528	1.10024460659763e-13	137352394	137352394
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5036	1.10024460659763e-13	137352394	137352394	7.21710486230408e-10	137356880	137356880
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1071	3e-04	7.21710486230408e-10	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	46384985	14458	14140	-0.0072	NA	NA	NA	7.66310958239548e-30	45466698	46410048
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47943524	121	117	0.2762	7.66310958239548e-30	45466698	46410048	7.92744930435633e-28	47148030	47982521
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47946216	47946216	1	0	NA	7.92744930435633e-28	47148030	47982521	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47948906	127566573	27511	26852	-0.0015	NA	NA	NA	4.28507148275875e-13	127559479	127566573
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127598425	13	13	-0.582	4.28507148275875e-13	127559479	127566573	1.57035643257187e-12	127598425	127608087
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127599309	133734059	2079	2028	-0.0214	1.57035643257187e-12	127598425	127608087	1.55090097021057e-10	133734059	133734059
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	133740643	133742185	2	2	-1.3346	1.55090097021057e-10	133734059	133734059	5.77461389029015e-07	133742185	133760059
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	133760059	135285645	623	608	-0.0297	5.77461389029015e-07	133742185	133760059	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1717	-0.0022	NA	NA	NA	3.34754459284731e-312	4923300	4923300
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.8868	3.34754459284731e-312	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	46096588	13774	13450	-0.0012	0	4932214	4932214	3.26815130023686e-08	46095353	46099212
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46099212	46103800	4	4	0.8396	3.26815130023686e-08	46095353	46099212	6.23982059902827e-08	46102470	46105220
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	66463477	6027	5887	0.0083	6.23982059902827e-08	46102470	46105220	2.02519568840091e-33	66463477	66463477
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.3342	2.02519568840091e-33	66463477	66463477	5.12447789962079e-35	66469412	66469412
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23137	-0.0034	5.12447789962079e-35	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3651	0.0046	NA	NA	NA	0	9523923	9523923
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-5.3548	0	9523923	9523923	4.50589207832595e-121	9554149	9554149
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9555181	1	0	NA	4.50589207832595e-121	9554149	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9563866	9607363	9	9	-0.5662	NA	NA	NA	9.5627771018308e-10	9589725	9626623
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	10465787	329	319	-0.0156	9.5627771018308e-10	9589725	9626623	2.75290568431987e-09	10462211	10470425
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10466791	10485848	8	8	0.5658	2.75290568431987e-09	10462211	10470425	1.19496307138497e-08	10482217	10493984
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	230	-0.0319	1.19496307138497e-08	10482217	10493984	1.78381499806529e-170	11116883	11116883
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.3701	1.78381499806529e-170	11116883	11116883	6.22999132242019e-220	11130871	11130871
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	39886	0.0032	6.22999132242019e-220	11130871	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7168	-0.0041	NA	NA	NA	1.17663539972934e-185	37953582	37953582
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-5.3252	1.17663539972934e-185	37953582	37953582	2.85771830382753e-195	37957844	37957844
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4763	-0.0051	2.85771830382753e-195	37957844	37957844	6.74952777235623e-52	49964838	49964838
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.7633	6.74952777235623e-52	49964838	49964838	1.69742564303212e-50	49971732	49971732
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	114123340	19423	18954	-0.001	1.69742564303212e-50	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.0888	NA	NA	NA	8.02555520001899e-09	18537177	18798641
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	52	-0.7287	8.02555520001899e-09	18537177	18798641	3.84594285939463e-92	19492531	19535787
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	69086125	17568	17140	0.0046	3.84594285939463e-92	19492531	19535787	4.3568592313752e-10	69084841	69086125
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	1.0504	4.3568592313752e-10	69084841	69086125	2.38579424890309e-09	69092211	69093444
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105673157	14024	13689	-0.0017	2.38579424890309e-09	69092211	69093444	4.51736307122858e-47	105632168	105681007
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105681007	105787390	20	19	-0.9086	4.51736307122858e-47	105632168	105681007	7.54039650746043e-08	105776293	105789767
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-1.5191	7.54039650746043e-08	105776293	105789767	0.000302031816951862	105794161	105804040
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105839439	17	16	-0.9341	0.000302031816951862	105794161	105804040	4.99782144322213e-26	105839439	105846004
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105843086	106358491	187	183	-0.0497	4.99782144322213e-26	105839439	105846004	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19421704	94	93	-0.1884	NA	NA	NA	4.54940417144176e-10	19391934	19819961
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	20088256	62	60	-0.5029	4.54940417144176e-10	19391934	19819961	6.01042867120777e-46	20045859	20316992
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	30434	-0.004	6.01042867120777e-46	20045859	20316992	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14567	0.0053	NA	NA	NA	1.01968522887879e-05	57201427	57203733
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.0556	1.01968522887879e-05	57201427	57203733	1.72155124945394e-06	57206772	57208375
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	73800145	5179	5067	0.0075	1.72155124945394e-06	57206772	57208375	3.79131564847559e-06	73783225	73815706
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73803521	73829736	13	12	-0.4106	3.79131564847559e-06	73783225	73815706	4.87794937133844e-06	73815706	73841825
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73830712	75093957	420	413	0.0056	4.87794937133844e-06	73815706	73841825	3.24257427127366e-25	75093957	75093957
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.6403	3.24257427127366e-25	75093957	75093957	3.19189448433499e-29	75100865	75100865
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	594	-0.0155	3.19189448433499e-29	75100865	75100865	5.23962926975483e-42	76925748	76929598
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.2129	5.23962926975483e-42	76925748	76929598	1.18738143812319e-31	76938723	76940218
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4417	-0.0053	1.18738143812319e-31	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	834	0.0194	NA	NA	NA	3.07216282873487e-08	1903358	1904451
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.0764	3.07216282873487e-08	1903358	1904451	1.46988027184229e-09	1906391	1909371
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12695	0.0103	1.46988027184229e-09	1906391	1909371	3.64406310153339e-92	36673853	36673853
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.2694	3.64406310153339e-92	36673853	36673853	2.17106736415943e-85	36684619	36684619
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1772	0.0267	2.17106736415943e-85	36684619	36684619	1.72569807854701e-09	40863808	40869151
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41026062	6	6	-0.7386	1.72569807854701e-09	40863808	40869151	7.08003375587815e-10	41026062	41031191
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41031191	41519702	199	195	0.0256	7.08003375587815e-10	41026062	41031191	2.34338292942757e-96	41518222	41522429
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41521544	1	0	NA	2.34338292942757e-96	41518222	41522429	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	66	-0.7819	NA	NA	NA	2.6432901853527e-121	41708551	42142363
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13342	0.0098	2.6432901853527e-121	41708551	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22459	-0.0071	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	478	0.0327	NA	NA	NA	7.98019936147169e-25	1398325	1398325
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.4071	7.98019936147169e-25	1398325	1398325	5.73078167338328e-25	1400840	1400840
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1014	0.0083	5.73078167338328e-25	1400840	1400840	1.03623044036208e-07	3588389	3591120
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3596968	3	3	-1.1032	1.03623044036208e-07	3588389	3591120	2.43655072391164e-09	3596968	3599322
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3599322	11448975	3633	3512	0.0411	2.43655072391164e-09	3596968	3599322	1.8650867493997e-10	11448975	11448975
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5196	1.8650867493997e-10	11448975	11448975	2.55781858935035e-11	11452390	11452390
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3760	0.0235	2.55781858935035e-11	11452390	11452390	7.33827519387785e-187	19694025	19694025
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.8159	7.33827519387785e-187	19694025	19694025	3.22555049400491e-198	19700620	19700620
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	63788698	14029	13703	0.0133	3.22555049400491e-198	19700620	19700620	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	-0.0037	NA	NA	NA	1.85430566523043e-182	1506379	1511632
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.8166	1.85430566523043e-182	1506379	1511632	1.09691752780879e-215	1528899	1531162
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20521	-0.0045	1.09691752780879e-215	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10152384	19	19	-0.5078	NA	NA	NA	1.05784065451342e-14	10136303	13562263
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	46922972	13422	13117	-0.0041	1.05784065451342e-14	10136303	13562263	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21995037	2733	2673	0.0099	NA	NA	NA	7.0330129617064e-160	21978742	22026302
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21996818	22696162	257	252	0.5229	7.0330129617064e-160	21978742	22026302	1.31008414493844e-08	22682428	22702398
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22720195	13	12	1.0736	1.31008414493844e-08	22682428	22702398	3.94443240921351e-08	22713972	22736990
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	23410438	298	294	0.5052	3.94443240921351e-08	22713972	22736990	1.05504210356161e-197	23315412	23417766
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23411635	49571068	13256	12917	0.0083	1.05504210356161e-197	23315412	23417766	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2725	NA	NA	NA	1.04844352891955e-24	94062	94062
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.7671	1.04844352891955e-24	94062	94062	2.51830970727795e-42	104732	104732
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	524788	310	302	-0.0298	2.51830970727795e-42	104732	104732	1.38219372994736e-59	521830	529404
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	525670	769191	191	185	0.4671	1.38219372994736e-59	521830	529404	8.93199567053238e-12	765191	773688
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	771824	797536	20	20	-0.08	8.93199567053238e-12	765191	773688	8.47022845353925e-12	793677	806941
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800669	1274736	157	154	0.4551	8.47022845353925e-12	793677	806941	3.13631161301700e-29	1176629	1297204
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1282772	1427392	96	92	0.0075	3.136311613017e-29	1176629	1297204	3.54874276420126e-14	1427392	1431240
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1589	3.54874276420126e-14	1427392	1431240	1.28804793245684e-11	1432891	1434970
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1894973	349	339	-0.0468	1.28804793245684e-11	1432891	1434970	1.27727789988098e-09	1892736	1894973
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1898078	2	2	-1.4571	1.27727789988098e-09	1892736	1894973	6.51456250581223e-11	1898078	1898078
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1901223	2708291	651	638	-0.0115	6.51456250581223e-11	1898078	1898078	0	2708113	2711273
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76992219	22938	22383	0.9857	0	2708113	2711273	2.59545733295678e-17	76992219	76992219
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76998610	76998610	1	0	NA	2.59545733295678e-17	76992219	76992219	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-0.8734	NA	NA	NA	8.94569732425188e-19	77010018	77010018
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	103129950	5505	5369	0.9937	8.94569732425188e-19	77010018	77010018	1.7005805561427e-14	103109027	103146444
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103145335	103191693	20	19	1.5283	1.7005805561427e-14	103109027	103146444	2.99143692809113e-14	103189107	103228308
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103224094	154038318	16535	16146	0.9852	2.99143692809113e-14	103189107	103228308	2.61688872272808e-17	154037006	154044828
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	10	1.806	2.61688872272808e-17	154037006	154044828	7.024889744067e-18	154078819	154085354
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	86	0.9707	7.024889744067e-18	154078819	154085354	1.21110770730352e-187	154442377	154442377
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.5974	1.21110770730352e-187	154442377	154442377	4.52777765387829e-172	154450309	154450309
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0868	4.52777765387829e-172	154450309	154450309	6.03165501682566e-102	154578922	154582414
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0157	6.03165501682566e-102	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3780462	128	124	-4.2904	NA	NA	NA	6.25724103202682e-20	3773948	4174561
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4174561	5593746	12	12	-1.4272	6.25724103202682e-20	3773948	4174561	2.26425167772948e-05	5422507	6735310
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7259689	229	224	-3.5654	2.26425167772948e-05	5422507	6735310	1.77291969412218e-05	7237274	7274653
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	23	-1.9428	1.77291969412218e-05	7237274	7274653	0.000572172113138918	7284775	7333934
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7653082	82	79	-3.3095	0.000572172113138918	7284775	7333934	0.00113117765411367	7578636	7664085
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.3062	0.00113117765411367	7578636	7664085	4.50838792077489e-06	7701303	7731490
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	87	-3.1403	4.50838792077489e-06	7701303	7731490	1.54953229924437e-08	7964586	8036254
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8178487	36	35	-4.4717	1.54953229924437e-08	7964586	8036254	1.267003489564e-07	8167434	8179883
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8199414	7	7	-2.851	1.267003489564e-07	8167434	8179883	0.000153939684330767	8195174	8211300
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8201959	8280065	19	18	-4.1899	0.000153939684330767	8195174	8211300	5.41621133344926e-10	8259766	8289709
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8324291	13	12	-2.2195	5.41621133344926e-10	8259766	8289709	9.36800818967665e-08	8316416	8334196
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10513747	292	283	-4.0038	9.36800818967665e-08	8316416	8334196	2.93182764051908e-30	10512616	10515697
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.6077	2.93182764051908e-30	10512616	10515697	0.000788212429694011	10620136	12527445
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	68	-2.6459	0.000788212429694011	10620136	12527445	0.000338771321819519	12611624	12700767
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.2366	0.000338771321819519	12611624	12700767	7.50343777369884e-08	12809152	12859309
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	107	-2.461	7.50343777369884e-08	12809152	12859309	3.36868525643295e-51	13109337	13136828
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	396	-4.1355	3.36868525643295e-51	13109337	13136828	2.38727714201551e-13	14321882	14376942
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	94	-3.2863	2.38727714201551e-13	14321882	14376942	1.73578754093217e-10	14500820	14530328
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.73578754093217e-10	14500820	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.4889	NA	NA	NA	4.08933406162114e-17	14566592	14587291
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	399	-3.7612	4.08933406162114e-17	14566592	14587291	8.6656265940539e-07	15765251	15969469
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16071977	60	57	-2.7766	8.6656265940539e-07	15765251	15969469	0.0163742961217435	15975479	16133263
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	16217583	67	67	-3.4748	0.0163742961217435	15975479	16133263	0.00127207928023917	16162358	16562268
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	21036503	706	681	-4.0624	0.00127207928023917	16162358	16562268	3.09716725365303e-07	21034708	21042490
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.4488	3.09716725365303e-07	21034708	21042490	2.09216139383642e-08	21047798	21057446
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	249	-3.9734	2.09216139383642e-08	21047798	21057446	1.54314945815262e-06	22052726	22157319
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-2.0623	1.54314945815262e-06	22052726	22157319	1.44922189510271e-10	22176501	22181855
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	90	-4.4557	1.44922189510271e-10	22176501	22181855	7.35680216873834e-75	22926726	25737663
MSK_252152915715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.3461	7.35680216873834e-75	22926726	25737663	NA	NA	NA
