Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26516	0.0044	NA	NA	NA	2.83359438807743e-224	72537426	72537426
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	3.215	2.83359438807743e-224	72537426	72537426	1.3978254222792e-133	72579311	72579311
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72786560	24	22	-0.1593	1.3978254222792e-133	72579311	72579311	4.05002372016632e-10	72765559	72795060
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72795060	72866395	11	10	-0.8918	4.05002372016632e-10	72765559	72795060	4.55123815627376e-15	72866395	72883006
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72874462	150839754	17525	16673	-3e-04	4.55123815627376e-15	72866395	72883006	5.58773125401307e-82	150839754	150839754
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-3.2173	5.58773125401307e-82	150839754	150839754	1.78044698999446e-67	150846148	150846148
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.78044698999446e-67	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	78	-0.0411	NA	NA	NA	1.15351811119915e-140	151026228	151026228
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.5457	1.15351811119915e-140	151026228	151026228	1.65224005119593e-154	151036435	151036435
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2553	0.0068	1.65224005119593e-154	151036435	151036435	1.17743183040991e-26	157133150	157133150
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.6901	1.17743183040991e-26	157133150	157133150	9.7141390173381e-30	157136342	157136342
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1553	-0.008	9.7141390173381e-30	157136342	157136342	3.17326372687372e-14	161099582	161099582
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.8844	3.17326372687372e-14	161099582	161099582	1.56781559815038e-13	161104791	161104791
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	185979586	9701	9235	-0.0028	1.56781559815038e-13	161104791	161104791	2.73786706583052e-61	185979586	185979586
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-3.9255	2.73786706583052e-61	185979586	185979586	1.88803667228637e-60	185988138	185988138
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200609726	4139	3938	0.007	1.88803667228637e-60	185988138	185988138	3.22381929234185e-08	200582647	200642828
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200803726	39	38	-0.3377	3.22381929234185e-08	200582647	200642828	3.58846531724431e-07	200678532	200827476
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	247186514	17405	16586	-0.0085	3.58846531724431e-07	200678532	200827476	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	10709394	3362	3181	0.0098	NA	NA	NA	2.8592146345812e-31	10692969	10728624
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	10711536	10935732	98	93	0.4283	2.8592146345812e-31	10692969	10728624	1.29075527983884e-25	10914125	10957128
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	10938799	13113316	702	665	0.0082	1.29075527983884e-25	10914125	10957128	1.6074042649912e-07	13070705	13119002
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.5668	1.6074042649912e-07	13070705	13119002	2.42859280227450e-08	13196226	13211200
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	34543992	7346	7021	-0.0059	2.4285928022745e-08	13196226	13211200	0	34543992	34551222
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	16	-4.1346	0	34543992	34551222	0	34580533	34589997
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	66357387	11754	11165	-0.0082	0	34580533	34589997	7.53067768188958e-09	66357387	66357387
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.5145	7.53067768188958e-09	66357387	66357387	2.15804396624295e-08	66360747	66360747
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	106240400	10613	10081	-0.0043	2.15804396624295e-08	66360747	66360747	2.9775132891389e-14	106204159	106240400
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106244482	106244482	1	0	NA	2.9775132891389e-14	106204159	106240400	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106256521	4	4	-1.381	NA	NA	NA	3.87393233749825e-14	106256521	106261767
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106261767	242689978	43913	41732	-8e-04	3.87393233749825e-14	106256521	106261767	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10279	0.0053	NA	NA	NA	5.9325456725126e-10	32074432	32074432
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.6116	5.9325456725126e-10	32074432	32074432	3.06796089703377e-10	32080848	32080848
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1792	-0.007	3.06796089703377e-10	32080848	32080848	8.16300851347775e-07	37948655	37954819
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7775	8.16300851347775e-07	37948655	37954819	1.35176973883350e-06	37960019	37966827
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3343	0.0048	1.3517697388335e-06	37960019	37966827	3.14027265677197e-78	47460892	47460892
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.4883	3.14027265677197e-78	47460892	47460892	2.66187360874192e-80	47466921	47466921
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	164001657	37270	35478	5e-04	2.66187360874192e-80	47466921	47466921	5.65710934872452e-18	163997228	164001657
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	5.65710934872452e-18	163997228	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.3724	NA	NA	NA	2.04458805873386e-18	164027724	164036648
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	193785530	9953	9485	-0.0013	2.04458805873386e-18	164027724	164036648	2.64524404927355e-08	193780664	193785530
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193797190	5	5	-0.9449	2.64524404927355e-08	193780664	193785530	4.03840049401171e-09	193797190	193798883
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193798883	194354505	192	184	0.0103	4.03840049401171e-09	193797190	193798883	6.02286740561041e-109	194354505	194354505
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-3.4598	6.02286740561041e-109	194354505	194354505	1.10480437673946e-108	194366950	194366950
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	946	-0.0021	1.10480437673946e-108	194366950	194366950	4.52618264654276e-14	196806091	196907040
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	27	-0.5454	4.52618264654276e-14	196806091	196907040	9.68080394157688e-12	196945209	196970927
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	196958467	1	0	NA	9.68080394157688e-12	196945209	196970927	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	901	-0.0332	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17562	0.0022	NA	NA	NA	0	68905670	69069651
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-3.9383	0	68905670	69069651	0	69163312	69165814
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	29895	-0.0034	0	69163312	69165814	1.68321812952519e-35	173660684	173660684
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.9542	1.68321812952519e-35	173660684	173660684	1.54049014038009e-37	173666072	173666072
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3892	2e-04	1.54049014038009e-37	173666072	173666072	6.69020438644246e-09	187327270	187330240
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	1.0427	6.69020438644246e-09	187327270	187330240	2.70189607348861e-09	187338465	187346058
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	190706272	1127	1074	-0.0108	2.70189607348861e-09	187338465	187346058	2.01424604080527e-28	190678203	190749363
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190708316	190921041	67	65	-0.4743	2.01424604080527e-28	190678203	190749363	1.03607674801541e-11	190907865	190930709
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191041481	38	31	0.0193	1.03607674801541e-11	190907865	190930709	0.137389322526625	191000504	191133609
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191111451	1	0	NA	0.137389322526625	191000504	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191116001	191153613	6	6	-0.3506	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	59745401	16273	15510	-8e-04	NA	NA	NA	9.4440128519291e-09	59725767	59760622
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59749078	59813250	27	26	0.4211	9.4440128519291e-09	59725767	59760622	1.87267836818847e-08	59805491	59829316
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59815778	178037603	36435	34682	-0.003	1.87267836818847e-08	59805491	59829316	1.4058996663181e-08	178037603	178037603
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178040439	178044111	2	2	-1.5415	1.4058996663181e-08	178037603	178037603	5.58853327688027e-08	178044111	178053491
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178045608	178047480	2	0	NA	5.58853327688027e-08	178044111	178053491	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178053491	180644810	1027	969	-0.0013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29966336	10589	10086	0.004	NA	NA	NA	1.07529795347406e-07	29941766	29972382
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	29995247	8	8	0.7211	1.07529795347406e-07	29941766	29972382	1.42160744973046e-06	29992946	30005338
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	32548736	1079	1030	0.0274	1.42160744973046e-06	29992946	30005338	1.52738532839396e-52	32543054	32590568
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32650672	20	20	-1.2662	1.52738532839396e-52	32543054	32590568	1.40261842417537e-07	32613538	32653710
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32653710	32713363	26	26	-0.0495	1.40261842417537e-07	32613538	32653710	1.69676850416314e-06	32709263	32721872
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-0.9429	1.69676850416314e-06	32709263	32721872	1.33036448683292e-09	32723722	32732764
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862502	1346	1298	-0.0126	1.33036448683292e-09	32723722	32732764	4.19358894034697e-07	35853209	35868512
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35885238	11	11	-0.6554	4.19358894034697e-07	35853209	35868512	5.63662266874206e-09	35878656	35892165
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35887585	54035000	6902	6573	0.004	5.63662266874206e-09	35878656	35892165	3.97599730081823e-100	54035000	54035000
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0734	3.97599730081823e-100	54035000	54035000	1.01493548228840e-103	54042734	54042734
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12605	-2e-04	1.0149354822884e-103	54042734	54042734	5.08339068731255e-100	103841482	103841482
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.4688	5.08339068731255e-100	103841482	103841482	2.31324022384942e-98	103868154	103868154
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20050	-0.0056	2.31324022384942e-98	103868154	103868154	2.5221079325241e-50	165643653	165643653
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	2.4805	2.5221079325241e-50	165643653	165643653	5.24704601933112e-45	165650610	165650610
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1718	-0.0041	5.24704601933112e-45	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	49885022	17321	16457	-7e-04	NA	NA	NA	2.63630969182661e-12	49882700	49885022
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	49887071	49893842	5	5	-1.1487	2.63630969182661e-12	49882700	49885022	5.62790004315466e-12	49893842	49895804
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	49895804	141690753	32607	31061	5e-04	5.62790004315466e-12	49893842	49895804	1.57925332325102e-34	141689547	141690753
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.3448	1.57925332325102e-34	141689547	141690753	1.09467860534084e-32	141714168	141720303
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	156483966	5695	5403	0.0035	1.09467860534084e-32	141714168	141720303	3.15735852042445e-11	156483966	156483966
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	1.792	3.15735852042445e-11	156483966	156483966	1.33461911446659e-10	156490484	156490484
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1004	-0.0087	1.33461911446659e-10	156490484	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	110	0.0067	NA	NA	NA	4.42176709389064e-19	581533	581533
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.1938	4.42176709389064e-19	581533	581533	2.41808924565626e-18	588865	588865
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	38055507	12438	11861	-0.0037	2.41808924565626e-18	588865	588865	2.87768451911035e-08	38050129	38055507
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38055657	38056982	2	2	-1.51	2.87768451911035e-08	38050129	38055507	2.93935152103762e-09	38056982	38056982
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38069703	39350798	513	494	0.0195	2.93935152103762e-09	38056982	38056982	0	39350798	39352361
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	-3.7117	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	419	0.0248	0	39504332	39505256	1.06846023047891e-09	40888127	40892587
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.5094	1.06846023047891e-09	40888127	40892587	4.56558666333823e-08	40897469	40904488
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29460	0.0031	4.56558666333823e-08	40897469	40904488	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12374	0.0027	NA	NA	NA	2.86343035063208e-76	70926188	70926188
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.281	2.86343035063208e-76	70926188	70926188	5.54222645998912e-74	70930528	70930528
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116116077	15465	14748	-0.0116	5.54222645998912e-74	70930528	70930528	1.03164663303722e-07	116111715	116118907
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116118907	116130333	5	5	-0.9239	1.03164663303722e-07	116111715	116118907	1.10204497755573e-08	116126105	116137111
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	123291027	2364	2234	0.0107	1.10204497755573e-08	116126105	116137111	1.10146257320451e-08	123291027	123291027
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123292352	123294313	2	2	-1.4655	1.10146257320451e-08	123291027	123291027	2.71280339183885e-06	123294313	123296556
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123296556	140145683	7034	6704	-0.0072	2.71280339183885e-06	123294313	123296556	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23381	-0.0078	NA	NA	NA	2.53093453354094e-34	77917893	77917893
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.9864	2.53093453354094e-34	77917893	77917893	5.75638806072268e-33	77928669	77928669
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19245	-0.0011	5.75638806072268e-33	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16087	5e-04	NA	NA	NA	3.2461071860756e-23	55095200	55127355
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.566	3.2461071860756e-23	55095200	55127355	4.45949394832428e-22	55205278	55229096
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	73969862	7428	7085	0.0079	4.45949394832428e-22	55205278	55229096	1.47435712695569e-07	73968518	73969862
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73971970	73971970	1	0	NA	1.47435712695569e-07	73968518	73969862	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73973459	73974735	2	2	1.5289	NA	NA	NA	1.02653042044834e-08	73974735	73974735
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73976782	106733851	10606	10077	-0.0023	1.02653042044834e-08	73974735	73974735	2.51120415554043e-147	106733851	106733851
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	3	-4.9502	2.51120415554043e-147	106733851	106733851	5.71632292089808e-148	106747920	106747920
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9787	0.0032	5.71632292089808e-148	106747920	106747920	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4117	0.0063	NA	NA	NA	9.23495825380295e-86	11116883	11116883
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-3.0099	9.23495825380295e-86	11116883	11116883	9.6690699934536e-88	11128557	11128557
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	9.6690699934536e-88	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	130694393	40180	38280	-0.001	NA	NA	NA	5.35695015537092e-09	130690343	130694393
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.6011	5.35695015537092e-09	130690343	130694393	1.60831554179654e-08	130701040	130701040
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	605	-0.0109	1.60831554179654e-08	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11591	-0.0079	NA	NA	NA	7.51316102906402e-44	49964838	49964838
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.3328	7.51316102906402e-44	49964838	49964838	2.58254523102141e-44	49971732	49971732
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51296396	587	559	0.0087	2.58254523102141e-44	49971732	49971732	7.73172328797482e-09	51294959	51296396
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.2251	7.73172328797482e-09	51294959	51296396	7.85239652571278e-08	51300398	51301682
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56650373	1214	1150	0.0022	7.85239652571278e-08	51300398	51301682	5.31848241150699e-24	56646284	56650373
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.9504	5.31848241150699e-24	56646284	56650373	2.04968161393351e-26	56685341	56686863
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	16713	0.0011	2.04968161393351e-26	56685341	56686863	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34666996	5749	5442	0.0099	NA	NA	NA	1.23819515754152e-152	34666996	34666996
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34674458	34674458	1	0	NA	1.23819515754152e-152	34666996	34666996	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-5.0986	NA	NA	NA	4.75623721070124e-160	34683810	34683810
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	49785082	4107	3919	-0.0072	4.75623721070124e-160	34683810	34683810	1.77548590670455e-08	49783387	49785082
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	49790812	49796327	4	4	-1.0551	1.77548590670455e-08	49783387	49785082	8.22028013109689e-08	49796327	49797755
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	49797755	73075500	9558	9023	-0.0104	8.22028013109689e-08	49796327	49797755	2.72509432763844e-08	73061942	73082262
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	0.9502	2.72509432763844e-08	73061942	73082262	3.9568182962638e-08	73092018	73104540
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	74152538	524	502	-0.0121	3.9568182962638e-08	73092018	73104540	5.837808749837e-08	74150749	74152538
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.5087	5.837808749837e-08	74150749	74152538	1.65876249104923e-07	74155334	74157425
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	105856972	11751	11139	-0.0025	1.65876249104923e-07	74155334	74157425	4.42151645783747e-31	105856972	105856972
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-2.4167	4.42151645783747e-31	105856972	105856972	1.25130165656354e-22	105875924	105875924
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	173	9e-04	1.25130165656354e-22	105875924	105875924	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	98232932	30408	28887	-0.0069	NA	NA	NA	1.36745899129158e-08	98228743	98232932
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	1.2879	1.36745899129158e-08	98228743	98232932	1.51503162267794e-08	98239454	98243586
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	871	-0.0134	1.51503162267794e-08	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19550	-0.0054	NA	NA	NA	1.51441243036315e-33	75093957	75093957
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.0561	1.51441243036315e-33	75093957	75093957	3.27883315360512e-36	75100865	75100865
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76929598	611	577	-0.0125	3.27883315360512e-36	75100865	75100865	6.1656404739502e-21	76923844	76934755
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76931247	1	0	NA	6.1656404739502e-21	76923844	76934755	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76933534	76940218	6	6	1.3454	NA	NA	NA	7.58700138935136e-18	76937156	76942679
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4284	-1e-04	7.58700138935136e-18	76937156	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1903358	853	813	0.0079	NA	NA	NA	7.2505753087253e-11	1902148	1906319
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1911059	8	7	1.0128	7.2505753087253e-11	1902148	1906319	1.78084489014456e-12	1909371	1912424
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1912424	36673853	13010	12376	-0.0058	1.78084489014456e-12	1909371	1912424	2.67160778006124e-36	36673853	36673853
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-2.2595	2.67160778006124e-36	36673853	36673853	2.61521110421550e-36	36683509	36683509
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41506317	2006	1905	0.0097	2.6152111042155e-36	36683509	36683509	4.93113834909333e-16	41486550	41522429
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41508943	41508943	1	0	NA	4.93113834909333e-16	41486550	41522429	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41512318	42155643	79	72	-0.3538	NA	NA	NA	6.97500826147386e-16	41710400	42184753
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42158650	45311306	1436	1354	0.0047	6.97500826147386e-16	41710400	42184753	1.62558943855923e-06	45305765	45311306
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45318341	45328657	3	3	1.1261	1.62558943855923e-06	45305765	45311306	5.4540600714859e-07	45328657	45332210
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45332210	52440878	2034	1927	0.0018	5.4540600714859e-07	45328657	45332210	1.37348325704937e-86	52440878	52440878
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-3.8501	1.37348325704937e-86	52440878	52440878	8.57771028953691e-77	52447064	52447064
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	74884216	8729	8288	-0.0036	8.57771028953691e-77	52447064	52447064	1.40786926266029e-09	74880525	74886101
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74886101	74904114	11	10	0.7632	1.40786926266029e-09	74880525	74886101	1.58960349027974e-08	74902356	74909010
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1388	-0.0088	1.58960349027974e-08	74902356	74909010	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21861	-0.007	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	471	-0.0059	NA	NA	NA	4.32214844069889e-18	1398325	1398325
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.4923	4.32214844069889e-18	1398325	1398325	1.09324997399474e-18	1400840	1400840
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	19694025	8533	8077	-0.001	1.09324997399474e-18	1400840	1400840	1.01394326814514e-72	19694025	19694025
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.9645	1.01394326814514e-72	19694025	19694025	4.78677319235484e-86	19700620	19700620
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	20436482	193	180	-0.046	4.78677319235484e-86	19700620	19700620	1.61068478658104e-08	20436482	20438321
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20438321	20463727	4	3	-1.303	1.61068478658104e-08	20436482	20438321	6.719647952734e-08	20439961	20464356
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20464356	63788698	13832	13164	-0.011	6.719647952734e-08	20439961	20464356	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	556	-0.0022	NA	NA	NA	2.98020357746538e-75	1506379	1511632
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.223	2.98020357746538e-75	1506379	1511632	6.11789173790404e-99	1528899	1532433
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3496	0.006	6.11789173790404e-99	1528899	1532433	4.82369945862906e-09	12095485	12095485
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.5392	4.82369945862906e-09	12095485	12095485	6.60623298605076e-08	12113855	12127349
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16443	-0.0023	6.60623298605076e-08	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12763	-0.0033	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2853	0.0054	NA	NA	NA	8.39924709139067e-27	22643742	22686690
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	19	0.9649	8.39924709139067e-27	22643742	22686690	5.95985238517103e-31	22713972	22721042
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6211	0.0038	5.95985238517103e-31	22713972	22721042	8.45746843599138e-30	35472378	35472378
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.8938	8.45746843599138e-30	35472378	35472378	6.67448979048527e-26	35476942	35476942
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6667	0.0033	6.67448979048527e-26	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.3194	NA	NA	NA	1.57775878206602e-18	94062	94062
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-2.0288	1.57775878206602e-18	94062	94062	3.71832385468709e-46	104732	104732
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427338	773	743	-0.0408	3.71832385468709e-46	104732	104732	6.77898497473473e-11	1425580	1431411
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1427392	1427392	1	0	NA	6.77898497473473e-11	1425580	1431411	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1434970	5	5	-1.2046	NA	NA	NA	2.35765628751194e-09	1432891	1435082
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2708291	1001	959	-0.0785	2.35765628751194e-09	1432891	1435082	0	2708113	2711273
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	152652738	44460	42298	1.0286	0	2708113	2711273	2.97368216529168e-09	152651085	152652738
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152655026	152657445	3	3	-0.4097	2.97368216529168e-09	152651085	152652738	2.63500554116592e-06	152657445	152669503
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154038318	538	513	0.9927	2.63500554116592e-06	152657445	152669503	2.56471077479745e-13	154031239	154038318
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	2.0465	2.56471077479745e-13	154031239	154038318	4.80180261026352e-14	154079002	154086636
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154446801	90	85	0.9738	4.80180261026352e-14	154079002	154086636	1.90932897473279e-44	154446801	154446801
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154447839	154450309	3	3	-2.8984	1.90932897473279e-44	154446801	154446801	3.73617246675196e-55	154450309	154450309
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	1.1006	3.73617246675196e-55	154450309	154450309	7.79492208843062e-53	154582414	154586690
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0367	7.79492208843062e-53	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3219200	121	117	-3.9596	NA	NA	NA	1.22442816145486e-34	3034907	3772482
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3223585	5593746	18	17	-0.8581	1.22442816145486e-34	3034907	3772482	3.89331501921507e-14	4948824	6688691
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	162	-3.4535	3.89331501921507e-14	4948824	6688691	5.61846440401698e-07	7019523	7218364
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7054924	2	0	NA	5.61846440401698e-07	7019523	7218364	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-2.5083	NA	NA	NA	0.000235033462932667	7311948	7649771
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	8036254	157	152	-3.2679	0.000235033462932667	7311948	7649771	0.000455732980883589	7756907	8221620
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	10515697	366	350	-3.746	0.000455732980883589	7756907	8221620	5.9602572817087e-20	10512616	10515697
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10622062	10	10	-0.5807	5.9602572817087e-20	10512616	10515697	0.00187913980207772	10622062	12532441
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10631941	10645500	2	0	NA	0.00187913980207772	10622062	12532441	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13129843	208	199	-2.472	NA	NA	NA	0.00704405804668341	12994193	13153117
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13133803	1	0	NA	0.00704405804668341	12994193	13153117	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13261173	43	41	-3.365	NA	NA	NA	0.146738263191983	13147329	13421917
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	13633041	162	155	-3.7881	0.146738263191983	13147329	13421917	6.27251054005699e-05	13584982	13670791
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13644667	13705594	12	10	-2.4426	6.27251054005699e-05	13584982	13670791	2.43300430283914e-07	13692518	13729067
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14358464	197	187	-3.9597	2.43300430283914e-07	13692518	13729067	2.87546287751393e-09	14335755	14407293
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14506319	88	83	-3.1343	2.87546287751393e-09	14335755	14407293	2.54329752917348e-08	14494397	14536962
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508021	14508894	2	0	NA	2.54329752917348e-08	14494397	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.3646	NA	NA	NA	1.87173267734936e-16	14563486	14596156
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	400	-3.4862	1.87173267734936e-16	14563486	14596156	2.65885660288316e-06	15687088	16006096
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16182565	108	102	-2.7599	2.65885660288316e-06	15687088	16006096	3.95558595280084e-15	16146953	16203872
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	21041164	726	687	-3.7158	3.95558595280084e-15	16146953	16203872	9.3927222116266e-07	21035621	21041164
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21042490	21054519	5	4	-0.7548	9.3927222116266e-07	21035621	21041164	1.29020141958414e-07	21054519	21057446
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21443476	130	126	-3.8232	1.29020141958414e-07	21054519	21057446	0.000261396403064667	21401605	21477616
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21444509	21559551	14	14	-2.5271	0.000261396403064667	21401605	21477616	6.11280692497503e-06	21490998	21634923
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22139807	117	112	-3.8537	6.11280692497503e-06	21490998	21634923	2.12814870996115e-05	22051284	22165808
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.3573	2.12814870996115e-05	22051284	22165808	7.24672197799987e-06	22175425	22192409
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	89	-4.1026	7.24672197799987e-06	22175425	22192409	2.07634087646711e-53	23283689	26872527
MSK_252152915821_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	82	-1.377	2.07634087646711e-53	23283689	26872527	NA	NA	NA
