Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1640562	211	196	0.0166	NA	NA	NA	1.80756689115508e-06	1637771	1640562
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	1654026	2	2	-0.8765	1.80756689115508e-06	1637771	1640562	1.32755544475569e-09	1654026	1654026
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	72525842	27675	26678	0.0057	1.32755544475569e-09	1654026	1654026	8.1645607391021e-15	72524413	72533804
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.6165	8.1645607391021e-15	72524413	72533804	2.95937825242187e-43	72537426	72537426
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.8295	2.95937825242187e-43	72537426	72537426	1.00202963610932e-301	72579311	72579311
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103904723	10105	9777	-8e-04	1.00202963610932e-301	72579311	72579311	2.37980235597372e-32	103901454	103906464
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	104012520	16	15	0.5621	2.37980235597372e-32	103901454	103906464	6.07024723760974e-32	103962495	104108153
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	111177741	2067	2007	-0.0038	6.07024723760974e-32	103962495	104108153	5.67192737314446e-08	111173447	111177741
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111180807	1	0	NA	5.67192737314446e-08	111173447	111177741	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111187825	111188857	2	2	-0.7927	NA	NA	NA	3.31590301015723e-08	111188857	111190763
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	146297175	4070	3927	-0.0037	3.31590301015723e-08	111188857	111190763	3.17468439416781e-57	146294654	147308557
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147203277	1	0	NA	3.17468439416781e-57	146294654	147308557	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147510532	36	33	0.4977	NA	NA	NA	2.61456701070349e-53	147497268	147644831
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150818222	1257	1195	0.0108	2.61456701070349e-53	147497268	147644831	5.94984238988415e-125	150818222	150823073
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150819879	1	0	NA	5.94984238988415e-125	150818222	150823073	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.2421	NA	NA	NA	6.16056867510556e-67	150851439	150852858
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	150960673	47	47	0.0067	6.16056867510556e-67	150851439	150852858	0.000158849392725634	150951500	150960673
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150962185	150972295	5	5	-0.3218	0.000158849392725634	150951500	150960673	0.000154861223546812	150972295	150981162
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150974809	151026228	25	24	-0.006	0.000154861223546812	150972295	150981162	8.1119321798898e-16	151024118	151026228
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7128	8.1119321798898e-16	151024118	151026228	2.21960159134467e-13	151036435	151038091
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	161099582	4303	4142	0.0042	2.21960159134467e-13	151036435	151038091	2.92228649483512e-15	161099582	161099582
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.0626	2.92228649483512e-15	161099582	161099582	1.49041648989956e-15	161104791	161104791
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167481271	2483	2413	-0.0066	1.49041648989956e-15	161104791	161104791	1.32094451248076e-14	167479184	167481271
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167483267	167483267	1	0	NA	1.32094451248076e-14	167479184	167481271	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5063	NA	NA	NA	8.2039395693077e-14	167507898	167520743
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6965	0.0014	8.2039395693077e-14	167507898	167520743	2.21309474592540e-58	185979586	185979586
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.0563	2.2130947459254e-58	185979586	185979586	1.80442501509817e-53	185988138	185988138
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1440	0.0062	1.80442501509817e-53	185988138	185988138	2.73928743749275e-15	192715640	192715640
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.0749	2.73928743749275e-15	192715640	192715640	1.07304133909801e-15	192719540	192719540
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	458	0.0134	1.07304133909801e-15	192719540	192719540	3.46090992555426e-33	194978218	194978218
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195046932	6	6	-0.8721	3.46090992555426e-33	194978218	194978218	9.50925694533037e-31	195046932	195046932
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195048208	200625002	2171	2103	0.0086	9.50925694533037e-31	195046932	195046932	8.2694458729731e-15	200616638	200629099
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200629099	200665389	13	12	-0.428	8.2694458729731e-15	200616638	200629099	1.84236428793705e-14	200661094	200667381
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	227875096	9940	9587	-9e-04	1.84236428793705e-14	200661094	200667381	2.29148839241056e-10	227872808	227875096
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.6328	2.29148839241056e-10	227872808	227875096	2.25328774030985e-10	227882805	227889619
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246769018	7355	7083	-0.0045	2.25328774030985e-10	227882805	227889619	3.99153409767442e-126	246769018	246794552
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	29	-0.7986	3.99153409767442e-126	246769018	246794552	6.97881340454703e-72	246864725	246875016
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	91	-7e-04	6.97881340454703e-72	246864725	246875016	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	7019	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20341	35821494	12023	11625	-6e-04	NA	NA	NA	3.32792670940644e-16	35821494	35821494
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.0887	3.32792670940644e-16	35821494	35821494	2.51188810095034e-16	35844884	35844884
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	859	-0.0257	2.51188810095034e-16	35844884	35844884	2.68190496395024e-49	37803744	37818455
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	-0.6166	2.68190496395024e-49	37803744	37818455	5.33617289315828e-55	37847519	37858379
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66038336	10290	9910	-0.0014	5.33617289315828e-55	37847519	37858379	7.94050289297811e-19	66038336	66038336
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.9613	7.94050289297811e-19	66038336	66038336	1.77144800319094e-23	66049853	66049853
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	66357387	70	68	-0.0077	1.77144800319094e-23	66049853	66049853	6.74343032177963e-21	66357387	66357387
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	1.0825	6.74343032177963e-21	66357387	66357387	1.82867506211187e-15	66360747	66360747
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	231309394	50179	48313	-0.0017	1.82867506211187e-15	66360747	66360747	5.10167706097885e-18	231309394	231309394
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	231311020	231312347	2	2	-1.1662	5.10167706097885e-18	231309394	231309394	3.85226422788571e-17	231312347	231312347
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	231314315	242501239	4283	4148	0.0013	3.85226422788571e-17	231312347	231312347	8.49444474071256e-306	242501239	242501239
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242682950	65	62	-0.8748	8.49444474071256e-306	242501239	242501239	3.88112488712759e-05	242677220	242682950
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242686945	242689978	2	2	-0.2557	3.88112488712759e-05	242677220	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	152993150	50026	48292	-0.0026	NA	NA	NA	4.82525057038832e-92	152993150	152993150
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	152996121	153032375	17	17	-0.8883	4.82525057038832e-92	152993150	152993150	2.28167647789997e-89	153032375	153032375
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153035523	163992903	3445	3342	0.0069	2.28167647789997e-89	153032375	153032375	2.13768464350817e-56	163992903	163992903
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.044	2.13768464350817e-56	163992903	163992903	0.000185301363936834	164005577	164036648
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	16	0.7864	0.000185301363936834	164005577	164036648	6.17743579846505e-72	164107951	164107951
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	171068283	1881	1811	-0.0031	6.17743579846505e-72	164107951	164107951	6.86445416583589e-16	171068283	171068283
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	171070305	171072697	2	2	-1.0658	6.86445416583589e-16	171068283	171068283	1.37861937566318e-15	171072697	171072697
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	171077235	194358882	8248	7976	0.0082	1.37861937566318e-15	171072697	171072697	9.9398272035406e-13	194354505	194358882
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	0.6251	9.9398272035406e-13	194354505	194358882	4.38183623971401e-13	194366950	194368145
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	969	-0.0025	4.38183623971401e-13	194366950	194368145	3.17997457239789e-29	196820428	196907040
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196940125	21	20	-0.471	3.17997457239789e-29	196820428	196907040	4.03437908008398e-26	196929805	196943380
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196942158	199329592	962	925	-0.0017	4.03437908008398e-26	196929805	196943380	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3268	0.0104	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.711	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14507	-0.0066	0	9842644	9842644	0	68905670	68905670
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.4129	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	138307863	20515	19779	-5e-04	0	69165814	69165814	7.20966801965522e-16	138307863	138307863
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.09	7.20966801965522e-16	138307863	138307863	6.67102390702646e-16	138319409	138319409
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173224400	10676	10293	-0.0063	6.67102390702646e-16	138319409	138319409	1.49466642581356e-08	173224400	173224400
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.8034	1.49466642581356e-08	173224400	173224400	3.75263379244161e-10	173228860	173228860
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173229983	1	0	NA	3.75263379244161e-10	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173231156	173660684	192	185	0.0028	NA	NA	NA	2.68010029276511e-101	173660684	173660684
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.5056	2.68010029276511e-101	173660684	173660684	1.36518215514761e-93	173666072	173666072
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	190866667	5257	5058	-0.0071	1.36518215514761e-93	173666072	173666072	2.11442691063398e-18	190862108	190871220
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190869801	190921041	22	21	-0.328	2.11442691063398e-18	190862108	190871220	1.01459350834925e-10	190915643	190930709
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	42	-0.03	1.01459350834925e-10	190915643	190930709	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	6562846	1972	1915	0.0049	NA	NA	NA	2.54116724011464e-10	6562846	6562846
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	6565395	6567764	2	2	-0.8683	2.54116724011464e-10	6562846	6562846	1.04979066248008e-09	6567764	6567764
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	6570468	59314941	14171	13648	-0.0027	1.04979066248008e-09	6567764	6567764	8.41162201736835e-10	59313784	59314941
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59316268	59325340	5	5	-0.5528	8.41162201736835e-10	59313784	59314941	9.7362257357416e-10	59325340	59327219
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59327219	155411053	29334	28297	-0.0012	9.7362257357416e-10	59325340	59327219	1.70896520340725e-10	155405839	155411053
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	0.6368	1.70896520340725e-10	155405839	155411053	5.96252024165524e-11	155421443	155427589
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	177319638	6962	6713	8e-04	5.96252024165524e-11	155421443	155427589	5.09584519448709e-38	177319638	177319638
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177322431	177331382	4	4	-1.1598	5.09584519448709e-38	177319638	177319638	1.95628349497035e-32	177331382	177331382
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177333426	180644810	1312	1257	0.012	1.95628349497035e-32	177331382	177331382	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0598	NA	NA	NA	2.31848590438513e-19	191387	202063
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	237952	15	15	-0.5273	2.31848590438513e-19	191387	202063	4.20818292756464e-08	232366	246974
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	327962	47	47	-0.2865	4.20818292756464e-08	232366	246974	9.3046746131752e-29	323898	334423
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	17482872	6024	5833	0.0037	9.3046746131752e-29	323898	334423	9.94781341689302e-11	17482872	17482872
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-0.8692	9.94781341689302e-11	17482872	17482872	2.96323123238328e-10	17488010	17488010
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	29950805	4459	4322	0.0052	2.96323123238328e-10	17488010	17488010	1.82887235654344e-16	29939288	29966336
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	14	0.4204	1.82887235654344e-16	29939288	29966336	1.76749109921626e-14	30000990	30021908
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31385778	581	564	0.0169	1.76749109921626e-14	30000990	30021908	3.94767973859705e-12	31383925	31385778
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31395330	5	5	-0.5969	3.94767973859705e-12	31383925	31385778	2.40120219455473e-15	31395330	31418006
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31418006	32558677	490	474	0.0208	2.40120219455473e-15	31395330	31418006	8.94647078505864e-114	32558677	32558677
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	1.4376	8.94647078505864e-114	32558677	32558677	3.53176377632059e-83	32595402	32595402
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	35862502	1392	1353	0.0135	3.53176377632059e-83	32595402	32595402	5.54268197338036e-18	35862270	35862502
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.7088	5.54268197338036e-18	35862270	35862502	5.1638569717837e-22	35873335	35873335
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	36515424	292	285	1e-04	5.1638569717837e-22	35873335	35873335	5.99629390182541e-07	36514036	36518498
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36518498	36521308	3	3	0.5687	5.99629390182541e-07	36514036	36518498	2.71022897412585e-06	36520159	36522639
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36522639	38591052	923	883	0.0104	2.71022897412585e-06	36520159	36522639	3.83514926083547e-10	38591052	38591052
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	38592403	38594550	2	2	-0.847	3.83514926083547e-10	38591052	38591052	3.17836912981012e-09	38594550	38594550
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	38597731	139643729	31281	30162	-0.0037	3.17836912981012e-09	38594550	38594550	9.31791556730666e-16	139643729	139643729
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.8843	9.31791556730666e-16	139643729	139643729	1.45681250740233e-15	139648318	139648318
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	162926519	7960	7678	-3e-04	1.45681250740233e-15	139648318	139648318	8.62555366504559e-10	162926519	162926519
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162927695	162930169	2	2	-0.8695	8.62555366504559e-10	162926519	162926519	7.28982648846457e-08	162930169	162931397
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162931397	165643653	761	736	-0.022	7.28982648846457e-08	162930169	162931397	8.85519308775472e-65	165643653	165643653
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	1.9233	8.85519308775472e-65	165643653	165643653	1.74021150842791e-71	165650610	165650610
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1742	-0.0182	1.74021150842791e-71	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	248	-0.0117	NA	NA	NA	1.9835811179293e-12	1038517	1038517
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.0243	1.9835811179293e-12	1038517	1038517	6.65394759324170e-14	1047707	1047707
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	69832676	20740	19968	-0.0037	6.6539475932417e-14	1047707	1047707	3.63223069859852e-37	69832676	69832676
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69834174	69839924	5	5	-1.0467	3.63223069859852e-37	69832676	69832676	1.14376355307300e-36	69839924	69839924
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69841070	92522688	7152	6892	0.005	1.143763553073e-36	69839924	69839924	3.41273130044817e-08	92513169	92522688
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92530156	92562146	2	2	-0.8051	3.41273130044817e-08	92513169	92522688	3.37989172112276e-08	92562146	92562146
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92563715	109967918	7106	6851	0.0093	3.37989172112276e-08	92562146	92562146	3.46554379148523e-09	109967918	109967918
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-0.8492	3.46554379148523e-09	109967918	109967918	2.13126668722397e-09	109974402	109974402
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3839	-0.0016	2.13126668722397e-09	109974402	109974402	5.83764150959472e-18	118611324	118611324
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.9424	5.83764150959472e-18	118611324	118611324	1.04925050419656e-17	118620875	118620875
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6572	-0.001	1.04925050419656e-17	118620875	118620875	3.6469848937244e-24	133432281	133433384
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6708	3.6469848937244e-24	133432281	133433384	3.72240293790847e-25	133448277	133453811
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3585	0.0052	3.72240293790847e-25	133448277	133453811	9.43264093408882e-11	141406414	141425306
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.3402	9.43264093408882e-11	141406414	141425306	3.61077005969443e-08	141431668	141449014
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	110	-0.0191	3.61077005969443e-08	141431668	141449014	6.08500537922825e-210	141690753	141698634
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.2633	6.08500537922825e-210	141690753	141698634	0	141712786	141714168
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6511	0.0032	0	141712786	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0055	NA	NA	NA	1.13539550255274e-40	581533	581533
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	1.7011	1.13539550255274e-40	581533	581533	9.36877060674047e-43	588865	588865
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2204	-0.0177	9.36877060674047e-43	588865	588865	6.82431155814969e-16	7156900	7322035
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.5494	6.82431155814969e-16	7156900	7322035	4.5336691434985e-16	7729311	8137794
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	10330645	866	841	-0.0099	4.5336691434985e-16	7729311	8137794	4.33648408909516e-10	10330645	10330645
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10332803	10332839	2	2	-0.8651	4.33648408909516e-10	10330645	10330645	2.63062872510075e-09	10332839	10332839
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339001	10339001	1	0	NA	2.63062872510075e-09	10332839	10332839	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339780	18894239	2914	2809	-0.008	NA	NA	NA	1.82626280279680e-48	18894239	18894239
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18896032	18908287	7	7	-1.031	1.8262628027968e-48	18894239	18894239	1.88282475026844e-50	18908287	18908287
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18910176	31810293	4521	4342	-0.0087	1.88282475026844e-50	18908287	18908287	1.04149443726930e-07	31806677	31810293
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31811829	31817573	4	4	-0.5537	1.0414944372693e-07	31806677	31810293	1.41984534746537e-08	31817573	31820662
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31818925	31818925	1	0	NA	1.41984534746537e-08	31817573	31820662	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31820662	40892587	2857	2764	0.0013	NA	NA	NA	1.85590745569151e-31	40892587	40892587
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.4699	1.85590745569151e-31	40892587	40892587	9.87647007426578e-29	40897469	40897469
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29839	0.0075	9.87647007426578e-29	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	36604	-0.0067	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9377	-0.0074	NA	NA	NA	8.3526053384447e-67	27038538	27038538
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.2147	8.3526053384447e-67	27038538	27038538	4.80999028314607e-65	27041812	27041812
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	53683740	6571	6368	-0.0072	4.80999028314607e-65	27041812	27041812	1.07094598758101e-08	53679935	53683740
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	0.8162	1.07094598758101e-08	53679935	53683740	7.66651434100215e-09	53687880	53687880
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	67953543	4035	3905	-0.0105	7.66651434100215e-09	53687880	53687880	1.27410566218425e-275	67953543	67958466
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67954980	68084993	54	54	-0.8836	1.27410566218425e-275	67953543	67958466	2.15467975324711e-287	68077752	68084993
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68085596	77917893	4199	4064	0.0081	2.15467975324711e-287	68077752	68084993	3.76990219139162e-91	77917893	77917893
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.1015	3.76990219139162e-91	77917893	77917893	9.03095120725412e-90	77928738	77928738
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19510	-0.0065	9.03095120725412e-90	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	187649	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	190215	4923300	1771	1701	0.0023	NA	NA	NA	8.02236717427157e-07	4919011	4926583
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.4951	8.02236717427157e-07	4919011	4926583	5.49130248685604e-07	4931000	4937118
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	346	-0.0017	5.49130248685604e-07	4931000	4937118	9.1925798849012e-46	5738494	5741031
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7381	9.1925798849012e-46	5738494	5741031	1.19295708274430e-53	5765438	5766615
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	20799632	5993	5775	-0.0064	1.1929570827443e-53	5765438	5766615	1.33815998304248e-10	20797855	20799632
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-0.7493	1.33815998304248e-10	20797855	20799632	6.0734050790945e-11	20806094	20809631
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	55118214	8756	8447	-9e-04	6.0734050790945e-11	20806094	20809631	1.54878674856448e-124	55118214	55124730
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55207305	38	38	-0.6925	1.54878674856448e-124	55118214	55124730	1.09896644727644e-124	55203706	55207305
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	55209626	1	0	NA	1.09896644727644e-124	55203706	55207305	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4467	0.0111	NA	NA	NA	3.654334023576e-13	66463477	66463477
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.0015	3.654334023576e-13	66463477	66463477	2.28761418029527e-13	66469412	66469412
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	85567562	6948	6714	-0.0022	2.28761418029527e-13	66469412	66469412	6.27397609067088e-12	85567562	85567562
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85570500	85576174	2	2	-0.9482	6.27397609067088e-12	85567562	85567562	6.14136185686238e-12	85576174	85576174
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85580062	107157031	6637	6392	-0.0025	6.14136185686238e-12	85576174	85576174	1.65329924647484e-17	107155002	107157031
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107160270	107177546	9	9	0.5332	1.65329924647484e-17	107155002	107157031	2.02210780757826e-18	107177546	107178916
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	117419967	3576	3448	1e-04	2.02210780757826e-18	107177546	107178916	1.33892920618796e-33	117419967	117419967
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	117422097	117425728	5	5	-0.9593	1.33892920618796e-33	117419967	117419967	2.93008905662052e-32	117425728	117425728
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	117426883	134450318	6543	6292	0.0043	2.93008905662052e-32	117425728	117425728	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	132289090	45161	43493	0.0018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6796	-0.008	NA	NA	NA	1.51429003125753e-10	36969571	36969571
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.9042	1.51429003125753e-10	36969571	36969571	3.10645167893728e-12	36982877	36982877
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	285	-0.0012	3.10645167893728e-12	36982877	36982877	6.92638539807516e-28	37953582	37953582
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.3562	6.92638539807516e-28	37953582	37953582	9.09963584314082e-27	37957844	37957844
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4710	-0.0099	9.09963584314082e-27	37957844	37957844	1.40386764750259e-32	49964838	49964838
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.494	1.40386764750259e-32	49964838	49964838	1.19156176999235e-29	49971732	49971732
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1740	-0.0092	1.19156176999235e-29	49971732	49971732	2.42727784818623e-53	56650373	56650373
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	0.7533	2.42727784818623e-53	56650373	56650373	2.66187785788939e-55	56685341	56685341
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	71375082	3623	3500	-0.0112	2.66187785788939e-55	56685341	56685341	4.34572365286116e-09	71375082	71375082
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	0.8283	4.34572365286116e-09	71375082	71375082	1.78419821586207e-09	71377671	71377671
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	100690991	9415	9100	-0.0055	1.78419821586207e-09	71377671	71377671	3.32475281137997e-29	100690991	100690991
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.4232	3.32475281137997e-29	100690991	100690991	5.28919846214505e-27	100693892	100693892
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113078863	4157	4000	-0.0172	5.28919846214505e-27	100693892	100693892	1.09470193976134e-09	113078863	113078863
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113080379	113082111	2	2	-0.8963	1.09470193976134e-09	113078863	113078863	3.64127414548625e-07	113082111	113094285
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113094285	114123340	403	391	-0.0246	3.64127414548625e-07	113082111	113094285	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	0.2123	NA	NA	NA	2.07648163615487e-08	18508651	19271102
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	51	-0.2014	2.07648163615487e-08	18508651	19271102	4.38003473475624e-14	19478367	19551043
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	64773298	15682	15152	0.0029	4.38003473475624e-14	19478367	19551043	4.38483519121341e-09	64773298	64773298
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64779054	64782414	2	2	-0.8371	4.38483519121341e-09	64773298	64773298	1.67112311171187e-09	64782414	64782414
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64788025	69086125	1884	1819	0.0038	1.67112311171187e-09	64782414	64782414	2.76703809542711e-17	69086125	69086125
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	0.9202	2.76703809542711e-17	69086125	69086125	7.28236722881106e-17	69092211	69092211
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1722	-0.0076	7.28236722881106e-17	69092211	69092211	5.74070817062755e-50	73071404	73071404
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	5.74070817062755e-50	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.1121	NA	NA	NA	2.89290932869931e-48	73092112	73092112
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105595302	12214	11797	0.0011	2.89290932869931e-48	73092112	73092112	1.91704309096057e-13	105592583	105595302
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105623070	10	10	-0.4622	1.91704309096057e-13	105592583	105595302	0.000535166007677773	105622008	105739770
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105625010	105856972	53	51	-0.0677	0.000535166007677773	105622008	105739770	1.17184560611489e-31	105856972	105856972
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-2.2707	1.17184560611489e-31	105856972	105856972	1.43014567217892e-29	105875924	105875924
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105946993	18	18	-0.1275	1.43014567217892e-29	105875924	105875924	0.00824923184189052	105881893	105946993
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105948347	105951399	2	2	-0.4893	0.00824923184189052	105881893	105946993	0.0107291508267902	105951399	105966378
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105961558	105989160	12	12	-0.8426	0.0107291508267902	105951399	105966378	4.15201821419794e-05	105977946	105989160
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106002179	4	4	-0.458	4.15201821419794e-05	105977946	105989160	0.00114880252162301	106002179	106028936
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	138	-0.0411	0.00114880252162301	106002179	106028936	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0921	NA	NA	NA	6.48482184292652e-15	18452491	18692865
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	90	-0.7083	6.48482184292652e-15	18452491	18692865	2.22112363040316e-291	19465359	19803092
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	2.22112363040316e-291	19465359	19803092	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	37364804	5255	5057	-0.0177	NA	NA	NA	4.40750207307215e-32	37364804	37364804
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	37366722	37388550	7	6	-0.9046	4.40750207307215e-32	37364804	37364804	7.73430010693679e-32	37388550	37388550
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	37393527	75115806	16523	15913	-0.0071	7.73430010693679e-32	37388550	37388550	1.22632397030028e-26	75115806	75115806
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.4342	1.22632397030028e-26	75115806	75115806	1.22985497688917e-28	75119713	75119713
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	83529798	3030	2933	-0.0027	1.22985497688917e-28	75119713	75119713	7.54955081682289e-312	83525424	83616606
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	83616606	83945563	150	146	0.5522	7.54955081682289e-312	83525424	83616606	3.10286979580020e-303	83943546	83947911
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	83947911	100298352	6255	6024	-0.0125	3.1028697958002e-303	83943546	83947911	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	3642498	1433	1367	0.0043	NA	NA	NA	2.11348802407010e-33	3642498	3642498
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3644964	3656037	7	7	-0.9338	2.1134880240701e-33	3642498	3642498	2.93574138999449e-43	3656037	3656037
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3659399	4918568	554	537	-0.0073	2.93574138999449e-43	3656037	3656037	1.78356548070942e-138	4918568	4918568
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4919994	4999999	36	36	-0.7731	1.78356548070942e-138	4918568	4918568	4.34034775429613e-147	4999999	4999999
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	5001609	22561536	5522	5329	-0.0032	4.34034775429613e-147	4999999	4999999	1.26100650301490e-07	22541389	22567551
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	22617217	7	7	-0.4141	1.2610065030149e-07	22541389	22567551	1.18482503760526e-08	22609825	22636249
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	31854794	3012	2908	0.0154	1.18482503760526e-08	22609825	22636249	1.07171863421752e-42	31842335	32379126
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	33559207	47	45	-0.3537	1.07171863421752e-42	31842335	32379126	1.05612040243844e-35	33536526	33842125
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	33647856	1	0	NA	1.05612040243844e-35	33536526	33842125	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	55439853	3485	3370	-0.0076	NA	NA	NA	1.92626643683529e-06	55438190	55439853
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55441361	55444091	5	5	0.4463	1.92626643683529e-06	55438190	55439853	2.42762562297344e-06	55444091	55445192
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55444681	57203733	800	763	0.0046	2.42762562297344e-06	55444091	55445192	4.70019849981651e-20	57203733	57203733
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.223	4.70019849981651e-20	57203733	57203733	2.42094699122048e-20	57206772	57206772
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5417	8e-04	2.42094699122048e-20	57206772	57206772	7.18602049576331e-19	75093957	75093957
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.1808	7.18602049576331e-19	75093957	75093957	2.24796466099053e-17	75100865	75100865
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	583	-0.0236	2.24796466099053e-17	75100865	75100865	4.36351611620312e-72	76925748	76925748
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	1.2135	4.36351611620312e-72	76925748	76925748	1.35491443968720e-62	76940218	76940218
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	77212654	134	128	1e-04	1.3549144396872e-62	76940218	76940218	5.6188213239518e-07	77190684	77220324
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77215726	77259799	23	23	0.2192	5.6188213239518e-07	77190684	77220324	2.69928168629384e-07	77253744	77279866
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77261102	88690571	4356	4223	-0.0116	2.69928168629384e-07	77253744	77279866	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	-0.0017	NA	NA	NA	4.5241522398262e-16	1028979	1028979
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.1664	4.5241522398262e-16	1028979	1028979	9.73216770285543e-18	1030766	1030766
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11542	0.0028	9.73216770285543e-18	1030766	1030766	0	32828797	32828797
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.9236	0	32828797	32828797	0	32832642	32832642
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1398	0.0259	0	32832642	32832642	1.66218757918242e-201	36673853	36673853
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	2.2689	1.66218757918242e-201	36673853	36673853	4.77618804041949e-204	36684619	36684619
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1757	0.0247	4.77618804041949e-204	36684619	36684619	1.65923317406679e-07	40866844	40874079
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	6	-0.417	1.65923317406679e-07	40866844	40874079	9.22783576535618e-08	41031191	41066163
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41519702	198	193	0.0184	9.22783576535618e-08	41031191	41066163	1.15915125830615e-54	41518222	41519702
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	21	-0.5907	1.15915125830615e-54	41518222	41519702	1.30314088045787e-10	41564408	41574775
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41710400	45	43	-0.8526	1.30314088045787e-10	41564408	41574775	2.83016702898038e-216	41710400	41710400
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	63345067	7984	7719	0.0081	2.83016702898038e-216	41710400	41710400	6.5156388436948e-08	63340660	63345067
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	63346452	63348143	2	2	0.8015	6.5156388436948e-08	63340660	63345067	1.16089701647248e-07	63348143	63349378
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	63349378	78653545	5693	5504	0.0115	1.16089701647248e-07	63348143	63349378	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22191	-0.0091	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	472	-0.0029	NA	NA	NA	5.82790736165524e-16	1398325	1398325
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1878	5.82790736165524e-16	1398325	1398325	4.70760323254891e-16	1400840	1400840
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4496	0.0156	4.70760323254891e-16	1400840	1400840	4.17965009911623e-40	11448975	11448975
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.8474	4.17965009911623e-40	11448975	11448975	1.96019228116236e-40	11452390	11452390
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	33779154	5185	4998	0.0114	1.96019228116236e-40	11452390	11452390	1.16311705542612e-08	33776119	33779154
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33781057	33782121	2	2	-0.8619	1.16311705542612e-08	33776119	33779154	6.56042230944093e-10	33782121	33782121
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33783524	57594702	9933	9566	0.0112	6.56042230944093e-10	33782121	33782121	7.35595117540018e-05	57583253	57597767
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57596748	57613576	8	7	0.3145	7.35595117540018e-05	57583253	57597767	1.18744562265775e-06	57604714	57622608
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57617131	58208527	165	159	-0.0305	1.18744562265775e-06	57604714	57622608	1.5733540767915e-11	58203159	58213220
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	15	-0.3439	1.5733540767915e-11	58203159	58213220	3.0070545284936e-11	58239871	58254174
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59414898	573	553	0.0079	3.0070545284936e-11	58239871	58254174	4.74967740923885e-11	59411618	59421197
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	0.4334	4.74967740923885e-11	59411618	59421197	5.11910313311667e-16	59434159	59434202
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	22	0.0151	5.11910313311667e-16	59434159	59434202	2.04675619526820e-16	59491509	59491509
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.8296	2.0467561952682e-16	59491509	59491509	4.08831595071591e-08	59497049	59500575
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1885	-0.0058	4.08831595071591e-08	59497049	59500575	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	562	-0.0173	NA	NA	NA	2.05644221645835e-245	1511632	1515948
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	8	-2.5802	2.05644221645835e-245	1511632	1515948	0	1528899	1531162
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20225	-0.001	0	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2949	-0.0017	NA	NA	NA	1.25103457854764e-20	22573420	22573420
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-1.0152	1.25103457854764e-20	22573420	22573420	7.11591790319015e-21	22585040	22585040
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	43645627	8832	8507	-0.0033	7.11591790319015e-21	22585040	22585040	1.16306670179482e-22	43644038	43645627
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43661998	9	9	0.6047	1.16306670179482e-22	43644038	43645627	1.02818542662587e-20	43661998	43663166
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43663166	46922972	1534	1483	0	1.02818542662587e-20	43661998	43663166	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	388	0.0047	NA	NA	NA	5.1973741269967e-09	16518586	16521073
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-0.8053	5.1973741269967e-09	16518586	16521073	5.8301589273693e-08	16524408	16525922
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	21571489	2113	2056	0.0078	5.8301589273693e-08	16524408	16525922	1.39688432725079e-21	21571489	21571489
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.0807	1.39688432725079e-21	21571489	21571489	1.57216692168391e-21	21576859	21576859
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	442	0.0251	1.57216692168391e-21	21576859	21576859	0	22667608	22679305
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	-3.182	0	22667608	22679305	0.0588223233082487	22682428	22720195
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	22725305	2	2	-1.1164	0.0588223233082487	22682428	22720195	4.17084664935274e-16	22725305	22725305
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6291	0.0053	4.17084664935274e-16	22725305	22725305	2.52109435752016e-186	35472378	35472378
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.7355	2.52109435752016e-186	35472378	35472378	1.16608458056666e-165	35476942	35476942
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1136	0.0166	1.16608458056666e-165	35476942	35476942	2.57964012245397e-52	37621766	37621766
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.2164	2.57964012245397e-52	37621766	37621766	2.29611926493463e-08	37626069	37626069
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	21	-0.0204	2.29611926493463e-08	37626069	37626069	4.89237191907967e-33	37685496	37689058
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-0.8282	4.89237191907967e-33	37685496	37689058	8.71178075121883e-66	37715370	37715385
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	37718669	1	0	NA	8.71178075121883e-66	37715370	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37721849	49571068	5775	5550	0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	-0.0491	NA	NA	NA	8.9550930709327e-06	122273	127113
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.7461	8.9550930709327e-06	122273	127113	1.32060378274336e-10	129544	132689
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	90	-0.0313	1.32060378274336e-10	129544	132689	3.80614544794557e-06	264886	266212
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.7808	3.80614544794557e-06	264886	266212	1.22809831376538e-06	267079	268402
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	849437	440	421	0.0126	1.22809831376538e-06	267079	268402	2.49283909764656e-07	845758	853672
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	859452	7	7	-0.4262	2.49283909764656e-07	845758	853672	5.13779827937982e-08	853836	860688
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1431411	213	205	0.0129	5.13779827937982e-08	853836	860688	3.71735311873621e-13	1431411	1431411
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-0.9905	3.71735311873621e-13	1431411	1431411	1.11494676083250e-10	1432953	1432953
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2303192	610	594	0.0059	1.1149467608325e-10	1432953	1432953	4.97917041251399e-165	2303192	2303192
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-3.1404	4.97917041251399e-165	2303192	2303192	3.30240473412619e-205	2304398	2304398
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2510846	208	205	-0.0193	3.30240473412619e-205	2304398	2304398	6.4734306469574e-21	2510846	2510846
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.2021	6.4734306469574e-21	2510846	2510846	4.18949960682204e-17	2512881	2512881
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	169	-0.0379	4.18949960682204e-17	2512881	2512881	0	2708291	2708291
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22139	0.9576	0	2708291	2708291	5.33357941123826e-24	76998610	76998610
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.1387	5.33357941123826e-24	76998610	76998610	1.15480350376817e-15	77010018	77010018
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21270	0.9567	1.15480350376817e-15	77010018	77010018	3.33193282035292e-51	154038318	154038318
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.9213	3.33193282035292e-51	154038318	154038318	4.55979206430922e-48	154078819	154078819
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	87	0.9553	4.55979206430922e-48	154078819	154078819	2.66240924719544e-307	154442377	154442377
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-3.7529	2.66240924719544e-307	154442377	154442377	1.28242729837808e-181	154450309	154450309
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9524	1.28242729837808e-181	154450309	154450309	4.0981406491927e-140	154582414	154582414
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0291	4.0981406491927e-140	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-4.2437	NA	NA	NA	7.71396143360187e-31	3223585	3773948
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.8524	7.71396143360187e-31	3223585	3773948	1.31506098333505e-16	5422507	6652845
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	172	-3.7931	1.31506098333505e-16	5422507	6652845	5.21318263481141e-05	6998513	7248437
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	123	-3.0204	5.21318263481141e-05	6998513	7248437	3.92804149251766e-05	7352452	7614417
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7722458	74	70	-4.0359	3.92804149251766e-05	7352452	7614417	0.000117778730121444	7686527	7781968
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7999759	79	75	-3.1564	0.000117778730121444	7686527	7781968	1.03662998918225e-10	7926989	8088838
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8005148	10515697	370	349	-4.0486	1.03662998918225e-10	7926989	8088838	7.86158480941496e-47	10513747	10515697
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	15	-0.3679	7.86158480941496e-47	10513747	10515697	9.57875887616448e-09	11673476	12518008
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12710000	71	69	-2.8226	9.57875887616448e-09	11673476	12518008	0.00406857021259429	12605673	12733867
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12715696	12833424	19	19	-4.1954	0.00406857021259429	12605673	12733867	1.40812072931937e-07	12809152	12859309
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13129843	113	108	-2.4173	1.40812072931937e-07	12809152	12859309	1.99634758303915e-09	13090026	13138841
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13301627	56	51	-3.6758	1.99634758303915e-09	13090026	13138841	0.000286832794877505	13236901	13375346
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13309879	14342834	352	329	-4.2345	0.000286832794877505	13236901	13375346	1.01154346699770e-13	14325320	14382361
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14500820	91	89	-3.3663	1.0115434669977e-13	14325320	14382361	3.79189560380890e-10	14489801	14506319
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14502379	14579298	31	27	-1.6579	3.7918956038089e-10	14489801	14506319	1.01296877341573e-09	14569287	14579298
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.5148	1.01296877341573e-09	14569287	14579298	2.02745276938353e-20	14598838	14598838
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.9935	2.02745276938353e-20	14598838	14598838	1.88529130703160e-05	14644293	14685149
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15915466	407	391	-3.9227	1.8852913070316e-05	14644293	14685149	0.000431270310724972	15690301	15965605
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	40	-3.0793	0.000431270310724972	15690301	15965605	0.000998220918581475	16016672	16035717
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.2562	0.000998220918581475	16016672	16035717	1.01756402962838e-05	16042966	16062961
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16195788	68	65	-3.4287	1.01756402962838e-05	16042966	16062961	0.000903148736664806	16166281	16220531
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16198927	16371504	42	40	-4.2543	0.000903148736664806	16166281	16220531	8.78169807357465e-07	16362978	16371504
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16377188	16387273	3	3	-1.2106	8.78169807357465e-07	16362978	16371504	8.1485782930959e-07	16387273	16399608
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17782139	225	214	-4.2274	8.1485782930959e-07	16387273	16399608	4.04113601933938e-06	17772524	17782139
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17785103	17792907	5	5	-2.0181	4.04113601933938e-06	17772524	17782139	2.50267849755699e-07	17792907	17797221
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17795392	19610243	147	138	-4.2157	2.50267849755699e-07	17792907	17797221	4.23022703536581e-09	19610243	19610243
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3646	4.23022703536581e-09	19610243	19610243	5.97357395687287e-07	19613864	19614809
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	525	-4.1212	5.97357395687287e-07	19613864	19614809	1.11102380825670e-08	22052726	22139807
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1473	1.1110238082567e-08	22052726	22139807	8.68356459610418e-16	22177335	22179794
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	85	-4.472	8.68356459610418e-16	22177335	22179794	3.92633981852769e-110	22930737	25737663
MSK_252152915822_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.1857	3.92633981852769e-110	22930737	25737663	NA	NA	NA
